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文檔簡介

1、福建醫(yī)科大學生物化學考試經(jīng)典總結(jié)生物化學導入泛素化:泛素與選擇性被降解蛋白質(zhì)形成共價連接,并使其激活,即泛素化。自噬(autophagy):內(nèi)質(zhì)網(wǎng)雙層膜包裹細胞內(nèi)需降解的細胞器、蛋白質(zhì)等成分形成自噬體(autophagosome),并與溶酶體融合形成自噬溶酶體(autolysosome),降解其所包裹的內(nèi)容物的生物學過程。未折疊蛋白應答(unfolded protein response,UPR):分泌性蛋白和膜蛋白在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)腔內(nèi)未能形成正確折疊,未折疊蛋白的累積,則引發(fā)內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應激(endoplasmic reticulum stress,ERS)。細胞出現(xiàn)的一系列反應,以應對ERS,稱為未折疊

2、蛋白應答(unfolded protein response,UPR)蛋白質(zhì)二硫鍵異構(gòu)酶(折疊酶)(protein disulfide isomerase,PDI):蛋白質(zhì)二硫鍵的形成影響蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)和折疊,在細胞內(nèi)發(fā)現(xiàn)催化二硫鍵的酶也具有異構(gòu)作用,稱為二硫鍵異構(gòu)酶。脯氨酰順-反異構(gòu)酶(peptide prolyl-cis-trans isomerase, PPI):多肽鏈中肽酰-脯氨酸間形成的肽鍵有順反兩種異構(gòu)體,空間構(gòu)象差別明顯。脯氨酰順-反異構(gòu)酶可促進上述順反兩種異構(gòu)體之間的轉(zhuǎn)換。脯氨酰順-反異構(gòu)酶催化這種異構(gòu)化的過程,可加速蛋白質(zhì)的折疊。蛋白質(zhì)質(zhì)量調(diào)控的研究內(nèi)容及意義研究內(nèi)容:1.

3、合成正確蛋白質(zhì) 2.降解異常蛋白質(zhì) 3.選擇結(jié)構(gòu)、功能正確的蛋白蛋白質(zhì)質(zhì)量調(diào)控意義:1. 細胞維持自穩(wěn)狀態(tài)的一種選擇性代謝機制。2. 失效的蛋白質(zhì)質(zhì)量控制是許多疾病的分子病因。蛋白質(zhì)折疊模式有哪幾種1. 自組裝模式(空間結(jié)構(gòu)按等級進行、非極性殘基間疏水作用介導、牛胰RNAase恢復天然構(gòu)象和功能)2. 輔助性蛋白參與(輔助性蛋白、分子伴侶、蛋白質(zhì)二硫鍵異構(gòu)酶(折疊酶)、脯氨酰順-反異構(gòu)酶)輔助性蛋白的種類及功能種類:1)分子伴侶 (molecular chaperon) 2)蛋白質(zhì)二硫鍵異構(gòu)酶 (protein disulfide isomerase, PDI) 3) 肽-脯氨酰順反異構(gòu)酶(p

4、eptide prolyl-cis-trans isomerase, PPI) 。功能:1)封閉蛋白疏水區(qū)段,保護新生肽段;2)構(gòu)成隔離環(huán)境,蛋白質(zhì)互不干擾進行折疊;3)應激時,使已折疊的蛋白質(zhì)去折疊,再誘導其正確折疊。4)促進二硫鍵形成正確的配對。分子伴侶的定義、分類及作用定義為:能夠協(xié)助其它蛋白質(zhì)分子,使之折疊成具有天然構(gòu)象蛋白質(zhì)的分子。分類:熱休克蛋白、伴侶分子、核質(zhì)蛋白。生物學功能: 輔助蛋白質(zhì)折疊;直接參與炎癥反應、細胞凋亡等。自噬過程1.自噬體膜包裹降解物:在應激時,粗面內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜、高爾基膜識別并包裹降解物;2.自噬體形成:自噬體膜延伸、閉合形成自噬體;3.自噬溶酶體形成:自噬體與溶

5、酶體融合形成自噬溶酶體,降解內(nèi)容物。未折疊蛋白應答(UPR)作用1. 保護細胞存活通過上調(diào)細胞存活基因的表達,減少新生肽的合成,增加分子伴侶和折疊酶的產(chǎn)量,以促進蛋白質(zhì)的正確折疊。2. 激活泛素化,清除未折疊蛋白UPR通過泛素化蛋白途徑介導內(nèi)質(zhì)網(wǎng)相關(guān)蛋白質(zhì)降解(ER-associated degradation,ERAD),清除未折疊蛋白。3. 促進細胞凋亡UPR通過三種蛋白激酶作用,將持續(xù)激活線粒體依賴和線粒體非依賴細胞凋亡途徑,清除未折疊蛋白累積的細胞。蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與疾病超二級結(jié)構(gòu):在許多蛋白質(zhì)分子中,二個或三個具有二級結(jié)構(gòu)的肽段,在空間上相互接近,形成一個有規(guī)則的二級結(jié)構(gòu)組合,被稱為超二級

6、結(jié)構(gòu)。模體:在許多蛋白質(zhì)分子中,二個或三個具有二級結(jié)構(gòu)的肽段,在空間上相互接近,形成一個特殊的空間構(gòu)象,具有特殊功能,稱為模體。結(jié)構(gòu)域:大分子蛋白質(zhì)的三級結(jié)構(gòu)常可分割成一個或數(shù)個球狀或纖維狀的區(qū)域,折疊得較為緊密,各行使其功能,稱為結(jié)構(gòu)域。分子伴侶:是細胞內(nèi)一類通過提供一個保護環(huán)境,可識別肽鏈的非天然構(gòu)象、促進各功能域和整體蛋白質(zhì)的正確折疊的保守蛋白質(zhì)。熱休克蛋白HSP:熱休克蛋白屬于應激反應性蛋白質(zhì),高溫應激可誘導該蛋白質(zhì)合成。熱休克蛋白包括HSP70、HSP40和GrpE三族。變構(gòu)效應(allosteric effect):蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)的改變伴隨其功能的變化,稱為變構(gòu)效應。分子病:任何由

7、遺傳原因引起的蛋白質(zhì)功能異常所帶來的疾病都是分子病。朊蛋白:又名蛋白質(zhì)傳染因子, 是一種非常特殊的傳染病的病原體。蛋白質(zhì)在生命活動中的作用1. 酶的催化作用2.控制生長與分化3.轉(zhuǎn)化和儲存功能4.運動功能5.結(jié)構(gòu)支持作用6.免疫保護作用 7.代謝調(diào)節(jié)作用 8.接受和傳遞信息9.生物膜功能10.感染和毒性作用11.其它作用 常見的膜體結(jié)構(gòu)有哪些1. 鈣結(jié)合膜結(jié)構(gòu) 2.DNA結(jié)合膜結(jié)構(gòu)模體(鋅指結(jié)構(gòu))根據(jù)結(jié)構(gòu)域可將蛋白分為哪幾類1.反平行螺旋結(jié)構(gòu)域(全-結(jié)構(gòu))2.平行或混合型折疊片結(jié)構(gòu)域(,-結(jié)構(gòu))3.反平行折疊片結(jié)構(gòu)域(全-結(jié)構(gòu))4.富含金屬或二硫鍵結(jié)構(gòu)域(不規(guī)則小蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu))分子伴侶的定義及功

8、能分子伴侶是細胞內(nèi)一類通過提供一個保護環(huán)境,可識別肽鏈的非天然構(gòu)象、促進各功能域和整體蛋白質(zhì)的正確折疊的保守蛋白質(zhì)。主要作用:封閉待折疊蛋白質(zhì)的暴露的疏水區(qū)段;創(chuàng)建一個隔離的環(huán)境,可以使蛋白質(zhì)的折疊互不干擾;誘導錯誤聚集的肽段解聚誘導二硫鍵的形成。蛋白質(zhì)構(gòu)象改變導致疾病的機制蛋白質(zhì)錯誤折疊后相互聚集,聚集蛋白抵抗蛋白水解酶,產(chǎn)生淀粉樣纖維沉淀,而致病?!昂芸赡転锳D”的新診斷標準核心癥狀(早期、顯著的情景記憶障礙)+至少1項支持特征 存在內(nèi)側(cè)顳葉萎縮; 腦脊液生物標志物異常; (AD相關(guān)蛋白標志物:如淀粉樣蛋白42、總tau蛋白及磷酸化tau蛋白) 雙側(cè)顳葉糖代謝率降低或其他示蹤劑預見的AD病

9、理改變; 直系親屬中有被證實的常染色體顯性遺傳突變所致AD。新標準強調(diào)了早期場景記憶(3W:什么時間、什么地點和發(fā)生了什么事)障礙的重要性。脂蛋白與疾病血脂:血漿所含脂質(zhì)統(tǒng)稱血脂,包括:甘油三酯、磷脂、膽固醇及其酯以及游離脂肪酸。脂蛋白:血脂與血漿中的蛋白質(zhì)結(jié)合,以脂蛋白(lipoprotein)形式而運輸。脂蛋白受體:血液中脂蛋白可與細胞膜上存在的特異受體相結(jié)合,被攝取進入細胞內(nèi)進行代謝。脂蛋白受體在決定脂類代謝途徑、參與脂類代謝、調(diào)節(jié)血漿脂蛋白水平等方面起重要的作用。清道夫受體:是吞噬細胞表面的一組異質(zhì)性分子,至少以6種不同的分子形式存在??勺R別乙?;兔芏戎鞍准案裉m氏陰性菌LPS,格蘭

10、氏陽性菌的磷壁酸等陰離子聚合體,也可識別由細胞膜內(nèi)側(cè)翻轉(zhuǎn)到膜外的磷脂酰絲氨酸。它們參與對病原體的識別和清除,同時也對喪失唾液酸的陳舊紅細胞和某些凋亡細胞的清除。原發(fā)性高脂血癥:排除由于全身性疾病所致的繼發(fā)性高脂血癥后,所有的血脂升高均統(tǒng)稱為原發(fā)性高脂血癥。這是一類多因素引起的疾病, 是環(huán)境因素與遺傳基因異常相互作用的結(jié)果。繼發(fā)性高脂血癥:繼發(fā)性高脂血癥是指由于系統(tǒng)性疾病或藥物所引起的血脂異常。 常見疾病有:甲狀腺功能減退癥、糖尿病、腎病綜合征、腎功能衰竭、肝臟疾病、系統(tǒng)性紅斑狼瘡、糖原累積癥、骨髓瘤、脂肪萎縮癥、急性卟啉病等。此外, 某些藥物如利尿劑、受體阻滯劑、糖皮質(zhì)激素等也可引起繼發(fā)性血脂

11、升高。脂蛋白a /LP(a):主要是在肝臟合成,主要的功能是阻止血管內(nèi)血塊溶解,促進動脈粥樣硬化形成,脂蛋白水平持續(xù)升高與心絞痛、心肌梗死、腦溢血有密切關(guān)系,是冠心病的獨立危險因子。脂蛋白代謝的影響因素膳食、職業(yè)、營養(yǎng)、代謝、疾病、年齡糖尿病血脂異常的機制1、 胰島素作用下降2、血脂代謝紊亂3、糖化、氧化應激導致脂蛋白結(jié)構(gòu)異常小而密的LDL致動脈粥樣硬化的作用動脈粥樣硬化的發(fā)病機理引起AS的起始因子是什么?1.損害反應學說認為血小板凝集能力亢進,引起血管壁損害是其起始因子。2.起始因子是使血管內(nèi)皮細胞層下發(fā)生完整的剝脫,并以泡沫細胞為主,外加平滑肌細胞的浸入,使單核細胞在循環(huán)血液中發(fā)生。3.變

12、性LDL經(jīng)巨噬細胞清道夫受體結(jié)合形成AS,為AS早期起始因子。4.氧化LDL是早期AS的起始,即OXLDL學說;5.LDL的磷脂經(jīng)氧化產(chǎn)生溶血卵磷脂,成為循環(huán)中單核細胞的趨化物,起主要作用。蛋白組與蛋白組學蛋白質(zhì):是由許多氨基酸(amino acids)通過肽鍵(peptide bond)相連形成的高分子含氮化合物。蛋白質(zhì)組:一個細胞或一個組織基因組所表達的全部蛋白質(zhì)。蛋白質(zhì)組學:指應用各種技術(shù)手段來研究蛋白質(zhì)組的一門新興科學,其目的是從整體的角度分析細胞內(nèi)動態(tài)變化的蛋白質(zhì)組成成份、表達水平與修飾狀態(tài),了解蛋白質(zhì)之間的相互作用與聯(lián)系,揭示蛋白質(zhì)功能與細胞生命活動規(guī)律。雙向凝膠電泳:2DE,利用

13、蛋白質(zhì)的等電點和分子量大小,結(jié)合凝膠化學性質(zhì),分別在凝膠二維空間上對蛋白質(zhì)分子進行等電聚焦和電泳來分離與純化蛋白質(zhì)的方法。氨基酸組成分析:通過測定蛋白質(zhì)中各氨基酸所占摩爾百分數(shù)或各氨基酸的摩爾比率,然后與數(shù)據(jù)庫中已知蛋白質(zhì)的理論值進行比較。簡述雙向凝膠電泳的原理及其優(yōu)缺點原理:第一向在高壓電場下對蛋白質(zhì)進行等電聚焦,再在第一向垂直方向上進行第二向SDS聚丙烯酰胺凝膠電泳。優(yōu)點:1、可分離10-100kD分子量的蛋白質(zhì) 2.高靈敏度和分辨率 3.便于計算機進行圖像分析處理 4.與質(zhì)子譜分析匹配。缺點:1.極酸、極堿性蛋白質(zhì),疏水性蛋白質(zhì),極大蛋白質(zhì)、極小蛋白質(zhì)、以及低豐度蛋白質(zhì)用此種技術(shù)難于有效

14、分離;2.膠內(nèi)酶解過程費時、費力,難于與質(zhì)譜聯(lián)用實現(xiàn)自動化。試述蛋白質(zhì)組學常用的研究方法表達模式:1、雙向凝膠電泳 2.新型非凝膠技術(shù)(蛋白質(zhì)微量測序、氨基酸組成分析、質(zhì)譜法MS功能模式:1、酵母雙雜交系統(tǒng) 2.噬菌體表面展示技術(shù)3.基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)相互作用研究技術(shù)(親和層析偶聯(lián)質(zhì)譜技術(shù)、免疫共沉淀藕聯(lián)質(zhì)譜技術(shù)、生物傳感器耦聯(lián)質(zhì)譜技術(shù)、串聯(lián)親和純化耦聯(lián)質(zhì)譜技術(shù))蛋白芯片技術(shù)試舉2例敘述蛋白質(zhì)相互作用研究技術(shù)1、酵母雙雜交系統(tǒng);2、噬菌體表面展示技術(shù)糖蛋白與糖組學酶學一、名詞 酶:由生物活細胞產(chǎn)生的一類能對特定底物起高效催化作用,由蛋白質(zhì)和/或核酸組成的具有活性中心特定構(gòu)象的生物催化劑。 米氏常

15、數(shù)Km:Km = (K2+K3)/K1,它是ES的分解速度和ES的形成速度的比值,是速度常數(shù)K1、K2 、K3的函數(shù),對特定酶反應、特定反應條件(如PH、溫度、底物)來說,Km值是酶的特征性常數(shù)之一,只與酶的性質(zhì)有關(guān),和酶的濃度無關(guān)。 酶的鈍化作用:主要指在某些物理或化學因素作用下酶蛋白分子的次級鍵受破壞,酶蛋白的空間構(gòu)象改變,酶蛋白因變性而失去了酶活性,稱之酶的鈍化作用。 酶的抑制作用:由酶的必需基團或活性部位的化學性質(zhì)發(fā)生改變,引起的酶活性的降低或喪失的作用。這時酶蛋白一般并未變性,可用物理或化學方法使酶恢復活性。能引起這種抑制作用的物質(zhì)稱為抑制劑。 酶的活力單位:1961年國際酶學會統(tǒng)一

16、規(guī)定:在特定的條件下,1分鐘轉(zhuǎn)化1微摩爾底物的酶量,或轉(zhuǎn)化1微摩爾的底物有關(guān)基團的酶量為1個酶的活力單位(國際單位IU)。 酶的比活力:酶的活力與蛋白質(zhì)的量相聯(lián)系的1種活力單位。如每mg酶蛋白所具有的酶活力 (單位mg蛋白),每ml酶制劑含有的酶活力(單位m1),或每g酶制劑具有的活力單位(單位g)等。對同一種酶來講,比活力愈高則酶越純。 酶活力測定的空白試驗和對照試驗:空白試驗:是指雜質(zhì)反應和自發(fā)反應引起的變化量,它提供的是未知因素的影響??瞻字悼梢酝ㄟ^不加酶,或不加底物,或二者都加(酶預先經(jīng)過失效處理)。對照試驗:是指用純酶或標準酶制劑測得的結(jié)果,主要作為比較或標定的標準。二、問答試述酶的

17、催化作用的獨特特點。1. 酶催化反應的高效性 2. 酶催化作用對象的專一性(特異性) 3. 酶的不穩(wěn)定性(易變性)4. 酶活性的可調(diào)節(jié)性敘述雙底物反應的順序機制和乒乓機制的特征。順序機制:(Sequential Mechanism) 底物A和B順序結(jié)合在一個酶的活性部位,形成EAB三元復合物,反應才能進行,然后釋放產(chǎn)物。乒乓機制:(Ping Pong Mechanism)是指底物和產(chǎn)物交替進出的機制,兩底物不能同時與酶結(jié)合形成EAB復合物。酶E轉(zhuǎn)變?yōu)樾揎椥问紼。哪些激活劑會影響酶反應速度?1. 無機離子:包括金屬離子和非金屬離子,常見的有K+、Na+、Mg2+、Zn2+、Fe2+、 Ca2+、

18、Cl-、Br-和H+。葡糖-6-磷酸脫氫酶需要Mg2+,而-淀粉酶需要Cl-。有些離子可相互替代,如Mn2+可取代Mg2+,作為激酶的激活劑。有些離子間有拮抗作用,如Na+抑制K+的激活作用,Ca2+抑制Mg2+的激活作用等。2. 分子:一些有機化合物分子能使酶分子中發(fā)揮活性作用的基團保持本身狀態(tài),保證和提高酶活性。a、某些還原劑如:GSH,半胱氨酸b、 EDTA(乙二胺四乙酸)能除去酶中重金屬離子雜質(zhì),從而解除重金屬離子對酶的抑制作用。3. 蛋白質(zhì):主要指的是酶,能夠切斷酶原分子中特定肽鍵,使無活性的酶原轉(zhuǎn)變成有活性的酶。如胰蛋白酶原在腸激酶的作用下,切去酶原中的六肽,轉(zhuǎn)變成胰蛋白酶,腸激酶為胰蛋白酶原的激活

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