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文檔簡介
1、亞甲基四氫葉酸還原酶基因C677T和A1298C多態(tài)與胃癌的遺傳易感性 作者:李松, 祭美菊, 侯鵬, 何農(nóng)躍 摘要目的:探討代謝葉酸的亞甲基四氫葉酸還原酶(MTHF
2、R)基因單核苷酸多態(tài)與胃癌風險的關系。方法:以聚合酶鏈反應和限制性片段長度多態(tài)方法分析170例胃癌病人和性別、年齡配對的140例正常對照者的MTHFR基因C677T和A1298C基因型及其與胃癌風險的相關性。結果:在正常對照中,MTHFR基因677CC、CT、TT基因型頻率分別為47.9%、40%和12.1%,而在胃癌病人中分別為35.9%、45.9%和18.2%。在病例組中677(CT+TT)變異型基因者占64.1,顯著高于對照組中的52.1,差異具有顯著意義(2=4.54,P 0.05)。與677CC基因型者相比,變異型基因者和TT型基因者發(fā)生胃癌的危險性分別高1.67倍(OR為1.67,
3、95%CI為1.062.64)和2.67倍(OR為2.67,95%CI為1.3825.341)。A1298C基因型在病例和對照中的分布差異無顯著性意義。但進一步分析發(fā)現(xiàn),1298變異基因型與677變異基因型之間有協(xié)同作用。攜帶MTHFR 677TT/1298AC基因型個體發(fā)生胃癌的風險是攜帶MTHFR 677CC/1298AA基因型個體的3.684倍 (95%CI為 0.82925.776)。結論: MTHFR單核苷酸多態(tài)是胃癌的遺傳易感性因素。 關鍵詞胃癌;單核苷酸多態(tài)性;亞甲基四氫葉酸還原酶基因;疾病易感性
4、 DNA 甲基化是基因表達,DNA 的穩(wěn)定性、完整性和誘變的重要決定因素,染色體和DNA甲基化異常都是可遺傳的,是導致基因組不穩(wěn)定性而引發(fā)腫瘤的重要機制1。相關研究表明,細胞內(nèi)低甲基化是胃癌形成的一個重要原因,亞甲基四氫葉酸還原酶(5,10methylenetetrahydrofolate reductase,MTHFR)基因多態(tài)會影響葉酸在體內(nèi)的正常代謝,造成甲基不足,從而促進胃癌的產(chǎn)生,國內(nèi)外刊物報道了此方面進行的一些研究。MTHFR基因在總的人群中呈高度多態(tài)性,在其編碼區(qū)有2個常見的單核苷酸多態(tài),即C677T 和A1298C,前者位于催化區(qū)而后者位于活性調(diào)節(jié)區(qū) 2。作者對江蘇南京地區(qū)的1
5、70例胃癌病人和140例相匹配的正常對照者進行研究,分析MTHFR基因C677T 和A1298C多態(tài)性與胃癌發(fā)生的風險性的關系。 1 材料和方法 1.1 實驗材料 1.1.1 標本來源 標本取自170例胃癌病人和140例正常對照者。病人分別來自東南大學附屬中大醫(yī)院、南京市鼓樓醫(yī)院和江蘇省人民醫(yī)院,樣品為腫瘤組織和外周血;年齡、性別相匹配的正常對照者來自東南大學校醫(yī)院和東南大學附屬中大醫(yī)院,所取樣品均為健康人的外周血。所有的病例和正常對照者均
6、為江蘇省南京市及其周邊區(qū)域居住的漢族居民。病例組中男、女性分別為118例和52例,平均年齡為(52.05±10.67)歲;對照組男、女性分別為82例和58例,平均年齡為(50.87±7.69)歲。胃癌組和對照組性別、年齡分布差異無顯著意義(P值分別為0.129和0.28),基因組DNA的提取采用標準的苯酚/氯仿法。 1.1.2 主要試劑 蛋白酶K、EDTA、TrisCl和飽和酚均為上海生工生物工程技術服務有限公司產(chǎn)品,限制性內(nèi)切酶Hinf (10Ul-1)和Mbo (10Ul-1)為大連寶生物公司產(chǎn)品,所有的引物由
7、上海博亞生物工程公司合成。 1.1.3 儀器 PTC225熱循環(huán)儀(MJ Research, Watertown, MA),紫外分光光度計(島津公司),凝膠成像系統(tǒng)(Syngene,Gene Genius)。 1.2 實驗方法 1.2.1 MTHFR基因型分析 MTHFR基因分型按我們已報道的方法 3進行。擴增含C677TDNA片段的PCR引物序列為:F,5TGA AGG AGA AGG TGT CTG CGG GA3和R,5A
8、GG ACG GTG CGG TGA GAG TG3,擴增產(chǎn)物長度為198bp。 擴增含A1298CDNA片段的PCR引物序列為:F,5CTT TGG GGA GCT GAA GGA CTA CTA C3和R,5CAC TTT GTG ACC ATT CCG GTT TG3, 擴增產(chǎn)物長度為163bp。 30l反應體系包括:200gml-1DNA模板1l ,雙側引物各1l,10×緩沖液3l,25mmolL-1的Mg2+ 2l,10mmolL-1的dNTP 0.6l, 1.25U的TaqDNA聚合酶(5Ul-1)。反應條件:94預變性5min,94 30s,62 30s,72 30s,
9、35個循環(huán),72延伸7min;C677T基因型和A1298C基因型可以分別由限制性核酸內(nèi)切酶Hinf或Mbo鑒別,677突變后可被Hinf識別。純合變異基因型的產(chǎn)物經(jīng)酶切后產(chǎn)生175bp和23bp兩個片段,雜合子產(chǎn)生198、175和23bp3個片段 ,而野生型基因型只有198bp 1個片段。含1298AA的PCR產(chǎn)物有4個Mbo酶切位點 ,產(chǎn)生56、31、30、28和18bp5個片段 ;突變后失去1個酶切位點,因此,純合突變型產(chǎn)生84、31、30和18bp4個片段,雜合子則含84、56、31、30、28和18bp6個片段(圖 1)。取適量PCR 產(chǎn)物分別與足量的限制性內(nèi)切酶于37溫育過夜,酶切
10、產(chǎn)物于3%瓊脂糖凝膠電泳分離,溴化乙錠染色。M1. 100bp梯度DNA分子質(zhì)量標志;M2. DL2000型DNA分子質(zhì)量標志;1、4.AC基因型;2、3、5.AA基因型;6.CC基因型圖1 MTHFR基因A1298C多態(tài)擴增產(chǎn)物RFLP圖譜 1.2.2 數(shù)據(jù)處理 在分型結果的統(tǒng)計分析中,病例組和對照組MTHFR基因型的頻率差異以2檢驗確定,P0.05為差異有顯著意義。以比值比(odds ratio,OR)以及95可信度(95% onfidence interval,95%CI)表示各種基因型與胃癌風險的相關性。OR值以非
11、條件的Logistic回歸模型計算,并經(jīng)過年齡、性別等混雜因子校正。所有統(tǒng)計分析均用Statistical Analysis System 軟件(6.1版,SAS公司)計算。 2 結
12、0; 果表1為胃癌與健康對照者的MTHFR基因多態(tài)性分布及其與胃癌的風險關系。對表1中胃癌組和對照組的MTHFR基因C677T和A1298C的基因型頻率進行了遺傳平衡檢測,均符合HardyWeinberg平衡比例(均P0.05),樣本具有群體代表性。表1 MTHFR基因型頻率在病例組和對照組中的 分布及其與胃癌風險的關系注:OR經(jīng)過性別和年齡校對從表1中可以看到在140例正常對照組中,MTHFR基因677CC、CT 和TT 基因型頻率分別為47.9%、40.0%和12.1%。而在胃癌患者中這3 種基因型頻率分別為35.9%、45.9%和18.2%。比較病例組中變異基因型擁有者(CT
13、+TT)占64.1%,顯著高于對照組中的52.1,差異具有顯著意義(2 =4.54,P0.05)。與MTHFR基因677CC基因型者相比,變異型基因者發(fā)生胃癌的危險性為1.67倍(OR為1.67,95%CI為1.062.64)??梢酝茢郙THFR基因C677T多態(tài)是胃癌的危險因素。以胃癌677CC基因型的OR為1.00,CT基因型的OR為1.60(95%CI為0.9282.639),CT基因型的危險性是CC的1.60倍,經(jīng)統(tǒng)計學分析差異沒有顯著性意義(2 =2.92,P0.05)。TT基因型的OR為2.67(95%CI為1.3825.341),TT基因型的危險性是CC的2.67倍,經(jīng)統(tǒng)計學分析
14、差異有顯著性意義(2 =4.01,P0.05)。OR值的上升趨勢明顯,這提示MTHFR基因C677T的多態(tài)與胃癌風險呈等位基因計量效應關系。對照組中MTHFR第1 298 位基因型的頻率為AA 69.2%、AC 29.3%和CC 1.4%;病例組1298AA、AC 和CC 基因型頻率分別是74.1%、24.7%和1.2%。1298CC基因型頻率在病例組和對照組中都很低,分別只有1.2%和1.4%,與1298AA基因型比較對胃癌風險沒有明顯的影響(OR為1.61,95%CI為0.3091.834)。兩組的MTHFR基因1298AC基因型頻率差異也無顯著意義。因此,可以推斷MTHFR基因A1298
15、C多態(tài)不是胃癌發(fā)生的危險因素。我們進一步分析發(fā)現(xiàn),MTHFR基因677和1298多態(tài)可能存在著聯(lián)合作用。例如,攜帶677TT/1298AA基因型個體的OR為2.035 (95%CI為0.9574.425),而攜帶677TT/1298AC基因型個體的增高到3.684(95%CI為0.82925.776)。我們還發(fā)現(xiàn)在這些研究對象中,677TT/ 1298AC或677CT/1298CC變異基因型非常罕見,更沒有人攜帶677TT/1298CC基因型 (表2),可能兩位點均為突變型時可能有致死作用。這一結論與Song等4研究結果相一致。表2 MTHFR基因677和1298基因型聯(lián)合與胃癌風
16、險的關系 3 討 論MTHFR基因677CT和1298AC突變使控制葉酸代謝的MTHFR活性顯著下降,研究表明,MTHFR基因變異型純合子與血漿中同型半胱氨酸水平的升高和5甲基四氫葉酸水平的降低有關5。體外實驗也證實,MTHFR變異型純合子的DNA接受甲基能力顯著高于野生型純合子6。說明MTHFR基因變異導致了作為甲基供體的蛋氨酸合成障礙,進而導致了DNA的低甲基化。細胞基因組DNA的去甲基化可能與細胞的過度增殖有關,研究證明細胞DNA的甲基化水平,特別是有關基因表達控制點的甲基化水平對基因表達起調(diào)節(jié)作用,甲基
17、化水平降低,相關基因的轉(zhuǎn)錄水平就增高。提示MTHFR基因多態(tài)性可能與癌癥的發(fā)生有關。本實驗中我們研究了在葉酸代謝中起關鍵作用的MTHFR基因C677T和A1298C多態(tài)與胃癌遺傳易感性的關系,結果表明MTHFR基因單核苷酸多態(tài)是胃癌的遺傳易感因素。特別是C677T多態(tài),擁有變異型基因的人數(shù)在病例組中的比例顯著高于對照組,其變異型基因顯著增加了發(fā)生胃癌的危險性。A1298C多態(tài)雖然其基因型頻率與胃癌的發(fā)生沒有顯著意義,但其多態(tài)與MTHFR677多態(tài)可能存在聯(lián)合作用。這一結果不僅表明MTHFR基因多態(tài)性與胃癌的發(fā)生有關,同時也提示胃癌的發(fā)生可能與DNA的低甲基化有關。本研究證明MTHFR基因單核苷
18、酸多態(tài)與胃癌風險增高顯著相關,為葉酸攝入低和(或)葉酸代謝障礙可能在胃癌變中起重要作用的假說提供了遺傳學基礎。為了證實MTHFR基因多態(tài)在胃癌病因?qū)W中的作用,有必要進一步研究MTHFR基因多態(tài)與葉酸攝入量之間的基因營養(yǎng)素交互作用以及其他因素如飲酒、吸煙的影響,同時還要對MTHFR基因多態(tài)與不同部位胃癌的遺傳易感性進行研究。這需要在完善病例和對照資料,擴大樣本數(shù)量的基礎上進行。進一步進行這方面的研究對于經(jīng)濟有效地開展胃癌的預防工作具有重要意義。 參考文獻 1HOLLIDAY R, GRIGG G W. DNA methyla
19、tion and mutationJ. Mutation Research, 1993, 285:6167. 2van der PUT N M, GABREELS F, STEVENS E M, et al. A second common mutation in the methylenetetrahydrofolate reductase gene: an additional risk factor for neuraltube defectsJ. Am J Hum Genet, 1998 ,62:10441051.
20、 3FROSST P, BLOM H J, MILOS R, et al. A candidate genetic risk factor for vascular disease: a common mutation in methylenetetrahydrofolate reductaseJ.Nat Genet, 1995,10:111113. 4SONG C, XING D, TAN W,et al. Methylenetetrahydrofolate reductase polymorphisms increase risk of esophageal squamous cell carcinoma in a Chinese populationJ.Cancer Res, 2001,
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