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1、實時熒光定量反轉(zhuǎn)錄PCRReal-Time Reverse Transcription PCR(RT-PCR)1 材料 1. 1 儀器756型紫外分光光度計 國產(chǎn)上海ABI 7300 Real-Time PCR System美國ABI公司RS-28高速低溫離心機德國賀利氏公司超低溫冰箱 德國賀利氏公司UVP凝膠掃描系統(tǒng)美國UVP 公司微量移液器 德國Gilson公司DYZ-22A型雙恒定時電泳儀北京市六一儀器廠DYY-橋式電泳儀北京市六一儀器廠1. 2 試劑RNA提取試劑Trizol Reagent為Invitrogen公司產(chǎn)品;逆轉(zhuǎn)錄酶(M-MLV ),核糖核酸酶抑制劑(RNasin),dN
2、TP,Taq DNA聚合酶(Taq DNA polymerase),隨機引物(Random primers),瓊脂糖(agarose)均為美國Promega 公司產(chǎn)品;熒光定量試劑盒:Hot Start Fluorescent PCR Core Reagent Kits(SYBR Green I) , BBI公司RNA提取:取約100mg組織于冰浴勻漿器中,加入1ml Trizol (Invitrogen,USA),迅速研磨成勻漿液,加入200 ml氯仿,震蕩30S,冰上放置5 min。4,12000 rpm,離心10 min,取上層水相轉(zhuǎn)移至另一1.5ml離心管中,加入等體積的異丙醇,顛倒混
3、勻,-20靜置2h。然后4,12000 rpm,離心20 min,棄上清,加入1ml 75%乙醇,輕輕混勻,4,12000 rpm,離心10min,吸凈上清液,于室溫下晾干,加入20ml DEPC處理的去離子水溶解沉淀,-80保存?zhèn)溆?。反轉(zhuǎn)錄(RT):(試劑盒: Promega,USA)反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)液組成如下表:Table 1 Mixed components for synthesis of cDNA first chainComponentVolume(ml)Concentration5×R.T.buffer*51×dNTP2.510mM/ mlRNasin220U/ m
4、lRNA5.38mgRandom Primer10.1ug/ mlM-MLV65 U/ mlNucleasr-Free Water 3.2Total25 42反轉(zhuǎn)錄50min,95 5min滅活反轉(zhuǎn)錄酶。Syber Green 熒光定量PCR檢測:(Hot Start Fluorescent PCR Core Reagent Kits(SYBR Green I) , BBI) 儀器型號:ABI 7300 Real-Time PCR System,美國ABI公司PCR反應(yīng)液組成如下表:Table 2 Mixed components for polymerase chain reactionComponent Volume (ul)R.T.product12×Master Mix10Primer1+1H2O7Total20PCR熱循環(huán)參數(shù):96 4min,然后三步反應(yīng):94 30S,58 30s,72 30s,進行40個循環(huán),于每個循環(huán)的第三步即:72 30s收集熒光信號。實時熒光定量PCR結(jié)果分析: 擴增完畢后,進入結(jié)果分析界面,以GAPDH為內(nèi)參照基因,與對照組相比,得到目的基因表達的相對定量值(RQ值),將RQ值用于統(tǒng)計分析
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