GeneBank數(shù)據(jù)庫使用

1、NCBIGenBank數(shù)據(jù)庫結(jié)構(gòu)NCBIGenBank數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)注釋數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)注釋(/genbank/ )NCBIGenBank數(shù)據(jù)庫結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫結(jié)構(gòu)NCBIGenBank數(shù)據(jù)庫結(jié)構(gòu)(/genbank/NCBIGenbankNCBIGenbank 查找頁面NCBID31716描述部分NCBICDs are recurring units in polypeptide chains (sequence and structure motifs), the extents of which can be determin

2、ed by comparative analysis. Molecular evolution uses such domains as building blocks and these may be recombined in different arrangements to make different proteins with different functions. CD s編碼序列，含終止密碼子 polyA_signal 多聚A信號 NCBID31716特性表序列本身關(guān)鍵字CDs are recurring units in polypeptide chainsNCBID317

3、16序列本身NCBINCBI序列結(jié)束4859 bpNCBID31716NCBIGenBank數(shù)據(jù)記錄NCBIGenBank數(shù)據(jù)記錄NCBIGenBank數(shù)據(jù)庫結(jié)構(gòu)NCBIGenBank數(shù)據(jù)庫結(jié)構(gòu)NCBIGenBank數(shù)據(jù)庫NCBIGenBank數(shù)據(jù)庫NCBI注釋內(nèi)容NCBILOCUSNCBIACCESSIONNCBIKEYWORDSNCBISOURCENCBIREFERENCENCBIFEATURESNCBIORIGINNCBIGenBank數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)庫格式NCBIGenBank數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)庫格式數(shù)據(jù)庫格式(1)NCBIFASTA格式序列的提交NCBIGenBank數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)庫格式(1)N

4、CBIGenBank數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)庫格式(2)NCBIGBFF文件格式NCBI頭部中部尾部NCBIGBFF格式NCBIGBFF格式頭部Locus行NCBIGBFF格式頭部格式頭部Locus行行NCBIGBFF格式頭部Locus行NCBIGBFF格式頭部Locus行NCBIGBFF格式頭部Locus行NCBIGBFF格式頭部Locus行NCBIGenBank分類碼（GenBank Division）NCBIGBFF格式頭部Locus行NCBIGBFF格式頭部DEFINITION行NCBIGBFF格式頭部DEFINITION行NCBIGBFF格式頭部-ACCESSION行NCBIGBFF格式頭部-AC

5、CESSION行NCBIGBFF格式頭部VERSION行NCBIGBFF格式頭部VERSION行NCBIGBFF格式頭部KEYWORDS行NCBIGBFF格式頭部 SOURCE行NCBIGBFF格式頭部REFERENCE行NCBIGBFF格式頭部REFERENCE行NCBIGBFF格式中部 NCBIGBFF格式中部NCBIGBFF格式中部FEATURESNCBIGBFF格式中部FEATURESNCBIGBFF格式中部FEATURESNCBIGBFF格式中部特性表關(guān)鍵詞NCBIGBFF格式中部特性表關(guān)鍵詞NCBIGBFF格式中部特性表關(guān)鍵詞NCBIGBFF格式中部特性表關(guān)鍵詞NCBIGBFF格式

6、中部LocationNCBIGBFF格式中部LocationNCBIGBFF格式中部LocationNCBIGBFF格式中部LocationNCBIGBFF格式中部 Qualifiers易患痛風(fēng)的關(guān)節(jié)炎過氧化氫酶NCBI常見的特性表關(guān)鍵詞所使用的限定詞 NCBI常見的特性表關(guān)鍵詞所使用的限定詞(續(xù)) NCBIGBFF格式尾部ORIGINNCBI總結(jié)NCBI圖C2.2人類某一EST克隆的Genbank(dbEST)NCBINCBINCBIEMBLNCBIEMBL的研究內(nèi)容的研究內(nèi)容NCBIEMBL的研究內(nèi)容NCBIEMBL數(shù)據(jù)記錄NCBIEMBL數(shù)據(jù)庫結(jié)構(gòu)NCBIEMBL數(shù)據(jù)庫結(jié)構(gòu)NCBIEMB

7、L數(shù)據(jù)庫結(jié)構(gòu)NCBIEMBL數(shù)據(jù)庫記錄注釋代碼和內(nèi)容說明NCBINCBIhttp:/www.ebi.ac.uk/ena/NCBINCBINCBI相關(guān)文獻數(shù)據(jù)庫(DR) 的說明NCBIEMBL數(shù)據(jù)庫記錄相關(guān)文獻數(shù)相關(guān)文獻數(shù)據(jù)庫據(jù)庫NCBI相關(guān)文獻數(shù)據(jù)庫(DR) 的說明NCBI相關(guān)文獻數(shù)據(jù)庫(DR)的說明NCBIGeneral InformationNCBIAdditional InformationNCBIAdditional InformationNCBISequenceNCBIPrimary Accession頭部NCBIPrimary Accession中部NCBIPrimary Acce

8、ssion尾部NCBI序列文件格式NCBI序列文件格式例子（Fasta）NCBI序列文件格式例子(GenBank)NCBI 序列文件格式例子(GenBank)NCBI序列文件格式例子（GCG）NCBI序列文件格式例子（GCG）NCBI序列文件格式例子(ASN.1)ASN.1是NCBI用來存儲和維護所有數(shù)據(jù)的格式 NCBI基因組數(shù)據(jù)庫的注釋NCBI基因組注釋工具 NCBI基因組注釋工具NCBI基因組注釋工具NCBI微生物基因組序列合作注釋工具 NCBIWhat Is There(WIT)“What Is There”(WIT)，由Argonne國家實驗室的Ross Overbeek和密西根州 大

9、學(xué)的Niels Larsen合作研制，Web節(jié)點/WIT2/TIGR已經(jīng)使用WIT注釋各種基因組數(shù)據(jù)。WIT Web節(jié)點/WIT/HTML/curate.htmlNCBI/Genbank/index.htmlAuthorsSequinBankItSequence dataGenBankAccession number2 daysDraftrecord序列提交NCBI在線提交序列（BankIt）NCBI在線提交序列（BankIt）NCBINCBI填寫表單信息（1）填寫表單的內(nèi)容包括四個方面一些注意事項和介紹NCBI填寫表單信息（2）基本信息：提交的序列數(shù)目，聯(lián)系人的信息，公開序列發(fā)布日期等。NCBI填寫表單信息（3）參考信息：序列作者，相關(guān)文獻等信息NCBI填寫表單信息（4）來源信息