生物化學(xué)課件第六章核酸化學(xué)代謝DNA合成_第1頁
生物化學(xué)課件第六章核酸化學(xué)代謝DNA合成_第2頁
生物化學(xué)課件第六章核酸化學(xué)代謝DNA合成_第3頁
生物化學(xué)課件第六章核酸化學(xué)代謝DNA合成_第4頁
生物化學(xué)課件第六章核酸化學(xué)代謝DNA合成_第5頁
已閱讀5頁,還剩105頁未讀, 繼續(xù)免費(fèi)閱讀

下載本文檔

版權(quán)說明:本文檔由用戶提供并上傳,收益歸屬內(nèi)容提供方,若內(nèi)容存在侵權(quán),請進(jìn)行舉報(bào)或認(rèn)領(lǐng)

文檔簡介

第七節(jié)DNA的生物合成(復(fù)制)

DNAReplicationP361

第七節(jié)DNA的生物合成(復(fù)制)

DNAReplica1

DNA是絕大多數(shù)生物體遺傳信息的載體,繼1953年Watson&Crick提出DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)模型后,1958年Crick提出了“中心法則”(Centraldogma)揭示了遺傳信息的傳遞規(guī)律。DNARNA蛋白質(zhì)復(fù)制復(fù)制轉(zhuǎn)錄反轉(zhuǎn)錄翻譯遺傳信息傳遞的中心法則病毒

DNA是絕大多數(shù)生物體遺傳信息的載體,繼192DNA的生物合成:細(xì)胞內(nèi)合成DNA的過程1、復(fù)制:以DNA作為模板指導(dǎo)的DNA合成,即將DNA攜帶的信息傳至子代DNA。

四種核苷酸(dATP\dTTP\dCTP\dGTP)

2、反轉(zhuǎn)錄:DNA合成也可以RNA為模扳指導(dǎo)合成作用,見于RNA病毒。3、修復(fù)合成:當(dāng)各種因素引起DNA損傷時(shí),損傷DNA可修復(fù)合成,校正錯(cuò)誤,完成正確合成,以保持DNA結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性和遺傳信息的準(zhǔn)確性。DNA的生物合成:細(xì)胞內(nèi)合成DNA的過程31、DNA的半保留復(fù)制

DNA在復(fù)制時(shí),兩條鏈解開分別作為模板,在DNA聚合酶的催化下按堿基互補(bǔ)的原則合成兩條與模板鏈互補(bǔ)的新鏈,以組成新的DNA分子。這樣新形成的兩個(gè)DNA分子與親代DNA分子的堿基順序完全一樣。由于子代DNA分子中一條鏈來自親代,另一條鏈?zhǔn)切潞铣傻?,這種復(fù)制方式稱為半保留復(fù)制。一、DNA復(fù)制1、DNA的半保留復(fù)制

DNA在復(fù)制時(shí),兩條4DNA的半保留復(fù)制實(shí)驗(yàn)依據(jù)

1958年M.Meselson和F.W.Stahl用大腸桿菌為材料,在含15N和14N的NH4cl中培養(yǎng)證實(shí),用同位素示蹤標(biāo)記加密度梯度離心技術(shù)實(shí)驗(yàn),證明了DNA是采取半保留的方式進(jìn)行復(fù)制.[15N]DNA[14N-15N]DNA[14N]DNA[14N-15N]DNADNA在離心管中的沉降位置P361培養(yǎng)12代培養(yǎng)1代培養(yǎng)2代DNA的半保留復(fù)制實(shí)驗(yàn)依據(jù)1958年M.Mesels52、原核生物DNA聚合反應(yīng)有關(guān)的酶類

(1)DNA聚合酶(DNApolymetases)(2)引物酶(peimase)和引發(fā)體primosome

:啟動(dòng)RNA引物鏈的合成。

(3)DNA連接酶(DNAligas(4)DNA解鏈酶:ATP供能解開DNA雙鏈(5)單鏈結(jié)合蛋白(single-strandbindingprotein,SSB):結(jié)合在解開的DNA單鏈上,防止重新形成雙螺旋。

(6)拓?fù)洚悩?gòu)酶(topoisomerase):兼具內(nèi)切酶和連接酶活力,能迅速將DNA超螺旋或雙螺旋緊張狀態(tài)變成松馳狀態(tài),便于解鏈。能改變DNA空間構(gòu)型的酶,合成后再引向超螺旋。機(jī)制:切開環(huán)狀一條鏈解旋酶DNA聚合酶III解鏈酶RNA引物引物酶和引發(fā)體DNA聚合酶ISSB3′3′5′3′5′5′RNA引物2、原核生物DNA聚合反應(yīng)有關(guān)的酶類

(1)DNA聚合酶(D6(1)DNA聚合酶催化的鏈延長反應(yīng)5′RNA引物子鏈3′3′5′5′3′3′5′5′3′3′5′模板鏈只能加到已有核苷酸的游離3’羥基上,不能自身聚合,需引物p363(1)DNA聚合酶催化的鏈延長反應(yīng)5′RNA引物子鏈3′3′7大腸桿菌三種DNA聚合酶比較DNA聚合酶Ⅱ分子量每個(gè)細(xì)胞的酶分子統(tǒng)計(jì)數(shù)5′-3′聚合酶作用3′-5′核酸外切酶作用5′-3′核酸外切酶作用聚合速率(nt/s)DNA聚合酶Ⅰ109000單鏈多肽400+++16-20120000單鏈多肽100++-40400,000(10種亞基)10-20++-250-1000比較項(xiàng)目DNA聚合酶III切除引物,校對,修復(fù)修復(fù)復(fù)制功能

1999年發(fā)現(xiàn)聚合酶和,它們涉及DNA的錯(cuò)誤傾向修復(fù)(erroounerepair)P364大腸桿菌三種DNA聚合酶比較DNA分子量DNA109000單8DNA聚合酶的3′-5′外切酶水解位點(diǎn)(I、II、III)3′3′5′5′錯(cuò)配堿基3′-5′核酸外切酶水解位點(diǎn)DNA聚合酶的3′-5′外切酶水解位點(diǎn)(I、II、III)9DNA聚合酶5′-3′外切酶活力(I)

5′-3′核酸外切酶水解位點(diǎn)單鏈缺口5′切除引物,修復(fù)DNA聚合酶5′-3′外切酶活力(I)

5′-3′核酸外10大腸桿菌DNA聚合酶Ⅲ全酶的結(jié)構(gòu)和功能(10個(gè)亞基)延長因子DNA聚合酶Ⅲ兩個(gè)亞基夾住DNA核心酶校對引物的結(jié)合和識(shí)別促使核心酶二聚化組建核心酶P364大腸桿菌DNA聚合酶Ⅲ全酶的結(jié)構(gòu)和功能(10個(gè)亞基)11圖11-8DNAPolIII的二聚體作用生物化學(xué)課件第六章核酸化學(xué)代謝DNA合成12(2)連接酶連接切口Mg2+連接酶ATP(噬菌體和動(dòng)物)或NADH(細(xì)菌)AMP+PPiATCGPTTPPPAACCTGAPACPPPPOHTGGATCGPTTPPPAACCTGAPACPPPTGGP缺口3'3'5'5'5'5'3'3'模板鏈模板鏈DNA復(fù)制、損傷修復(fù)、重組P367(2)連接酶連接切口Mg2+連接酶ATP(噬菌體和動(dòng)物)AM133、原核細(xì)胞DNA的半不連續(xù)復(fù)制復(fù)制過程

semidiscontinuousreplication

P3683、原核細(xì)胞DNA的半不連續(xù)復(fù)制P36814(1)復(fù)制的起始點(diǎn)與方向

親代DNA開鏈,復(fù)制起始點(diǎn)呈叉型移動(dòng)?!褟?fù)制起始點(diǎn):DNA復(fù)制要從DNA分子的特定部位開始,此部位稱復(fù)制起始點(diǎn)。原核:僅含一個(gè),約245bp,特殊的重復(fù)序列。真核:多個(gè)起始點(diǎn)例:酵母17號(hào)染色體含400個(gè)?!褟?fù)制方向:含三種機(jī)制一個(gè)起點(diǎn)2個(gè)叉,不同方向合成兩條鏈,此為常見方式。2個(gè)起點(diǎn),2個(gè)叉,各合一條鏈(腺病毒)。一個(gè)起點(diǎn)一個(gè)叉,同方向合成兩條鏈(質(zhì)粒ColEI)--單向復(fù)制(1)復(fù)制的起始點(diǎn)與方向15DNA的雙向和單向復(fù)制----起始環(huán)狀

DNA復(fù)制時(shí)所形成的O結(jié)構(gòu)起始點(diǎn)復(fù)制叉的推進(jìn)復(fù)制叉起始點(diǎn)起始點(diǎn)起始點(diǎn)復(fù)制叉復(fù)制叉未復(fù)制DNA單向復(fù)制雙向復(fù)制DNA的雙向和單向復(fù)制----起始環(huán)狀DNA復(fù)制時(shí)所形成的16大腸桿菌復(fù)制起點(diǎn)成串排列的重復(fù)序列

GATCTNTTNTTT成串排列的三個(gè)13bp序列共有序列共有序列TTATCCACA

DnaA蛋白結(jié)合位點(diǎn)四個(gè)9bp序列DnaB(解螺旋酶)SSB大腸桿菌DNA復(fù)制起點(diǎn)在起始階段的結(jié)構(gòu)模型DnaA識(shí)別起始點(diǎn)在復(fù)制起點(diǎn)特異部位解開雙鏈DNAP368大腸桿菌復(fù)制起點(diǎn)成串排列的重復(fù)序列

GATCTNTTNTTT17(2)原核細(xì)胞DNA的半不連續(xù)復(fù)制復(fù)制過程

復(fù)制叉的移動(dòng)方向解旋酶解鏈酶RNA引物引物體DNA聚合酶ISSB3′3′5′前導(dǎo)鏈隨后鏈3′5′復(fù)制的起始DNA鏈的延長DNA鏈終止5′RNA引物3′3′P369,393,274DNA聚合酶III切除引物、缺口填補(bǔ)、校對(2)原核細(xì)胞DNA的半不連續(xù)復(fù)制復(fù)制過程

復(fù)制叉的移動(dòng)方向18聚合酶III核心酶大腸桿菌復(fù)制體結(jié)構(gòu)示意圖聚合酶I聚合酶III核心酶滯后鏈前導(dǎo)鏈解螺旋酶引物合成酶RNA引物引發(fā)體拓?fù)洚悩?gòu)酶II-夾子-聚體-夾子-復(fù)合物RNA引物單鏈結(jié)合蛋白(SSB)活化引物合成酶P370聚合酶III核心酶大腸桿菌復(fù)制體結(jié)構(gòu)示意圖聚合酶I聚合酶II19復(fù)制叉處前導(dǎo)鏈和隨后鏈同時(shí)合成的工作模型聚合酶III全酶引物聚合酶III全酶引物引物體引物體解旋酶解旋酶引物合成酶DnaG蛋白前導(dǎo)鏈和隨后鏈被同一個(gè)DNA聚合酶III不對稱二聚體合成復(fù)制叉處前導(dǎo)鏈和隨后鏈同時(shí)合成的工作模型聚合酶III全酶引物20(3)大腸桿菌染色體復(fù)制的終止oric復(fù)制叉2復(fù)制叉1終止復(fù)制叉2終止復(fù)制叉1復(fù)制叉1復(fù)制叉2完成復(fù)制DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶連鎖體終止子位點(diǎn)連鎖體在細(xì)胞分裂前必須解開,否則導(dǎo)致細(xì)胞分裂失敗,細(xì)胞死亡。兩個(gè)復(fù)制叉從起始反向移動(dòng)至約180O的對面終止區(qū)相遇(3)大腸桿菌染色體復(fù)制的終止oric復(fù)制叉2復(fù)制叉1終止21(4)復(fù)制的忠實(shí)性

DNA復(fù)制過程是一個(gè)高度精確的過程,據(jù)估計(jì),大腸桿菌DNA復(fù)制5X109堿基對僅出現(xiàn)一個(gè)誤差,保證復(fù)制忠實(shí)性的原因主要有以下三點(diǎn):

DNA聚合酶的高度專一性(嚴(yán)格遵循堿基配對原則,但錯(cuò)配率為7

X10-6

DNA聚合酶的校對功能(錯(cuò)配堿基被3’-5’

外切酶切除)起始時(shí)以RNA作為引物P374(4)復(fù)制的忠實(shí)性DNA復(fù)制過程是一個(gè)高度精22DNA聚合酶的校對功能聚合酶錯(cuò)配鹼基復(fù)制方向正確核苷酸5′5′5′3′3′3′切除錯(cuò)配核苷酸DNA聚合酶的校對功能聚合酶錯(cuò)配鹼基復(fù)制方向正確核苷酸5′23

起始時(shí)以RNA作為引物的作用

DNA復(fù)制為什么要合成一個(gè)RNA引物,而后又把這個(gè)引物消除呢?這是保證DNA聚合過程高度精確的又一措施。已知DNA聚合酶具有3’-5’外切酶功能校對復(fù)制過程中的核苷酸,也就是說聚合酶在開始形成一個(gè)新的磷酸二酯鍵前,總是檢查前一個(gè)堿基是否正確,這就決定了它不能從頭開始合成。因此先合成一條低忠實(shí)性的多核苷酸來開始DNA的合成,并以核糖核苷酸來表示是“暫時(shí)”的,當(dāng)DNA開始聚合以后再以5’-3’外切酶的功能切除,以高忠實(shí)性的脫氧核苷酸取而代之,確保復(fù)制的忠實(shí)性。(RNA聚合酶無校對功能,不需引物,可以從頭合成)

起始時(shí)以RNA作為引物的作用

DNA復(fù)制為244、真核生物復(fù)制的特點(diǎn)(1)復(fù)制速度:是原核的1/10,但復(fù)制起始點(diǎn)多。(2)引物和岡琦片段小于原核,引物為10個(gè),片段100~200;原核引物十幾~幾十,片段1000~2000。(3)復(fù)制需DNApol及多種因子參加,pol

pol在核內(nèi)起主要作用。(4)pol為線粒體復(fù)制酶。(5)DNA復(fù)制位于細(xì)胞周期的S期。4、真核生物復(fù)制的特點(diǎn)25真核細(xì)胞DNA復(fù)制的特點(diǎn)多個(gè)起點(diǎn)復(fù)制起點(diǎn)起點(diǎn)起點(diǎn)起點(diǎn)起點(diǎn)起點(diǎn)真核生物DNA聚合酶端粒(telemere)的復(fù)制真核細(xì)胞DNA復(fù)制的特點(diǎn)多個(gè)起點(diǎn)復(fù)制起點(diǎn)起點(diǎn)起點(diǎn)起點(diǎn)起點(diǎn)26真核生物的DNA聚合酶DNA聚合酶分子量亞基數(shù)細(xì)胞內(nèi)分布酶活力百分比外切酶活力DNA聚合酶110-23,000多個(gè)細(xì)胞核~80%無120,000二個(gè)細(xì)胞核和線粒體2~15%3-5外切酶400,000二個(gè)細(xì)胞核+10~25%3-5外切酶DNA聚合酶DNA聚合酶45,000一個(gè)細(xì)胞核10~15%無核DNA合成線粒體DNA合成引物合成

修復(fù)功能真核生物的DNA聚合酶DNA分子量DNA110-23,00027

真核生物DNA復(fù)制與核小體裝配同步進(jìn)行,復(fù)制完成后隨即組合成染色體并從G2期過渡到M期。染色體DNA是線性結(jié)構(gòu)。染色體兩端DNA子鏈上最后復(fù)制的RNA引物,去除后留下空隙。剩下的DNA單鏈母鏈如果不填補(bǔ)成雙鏈,就會(huì)被核內(nèi)Dnase酶解。某些低等生物染色體經(jīng)多次復(fù)制會(huì)越來越短。

真核生物DNA復(fù)制與核小體裝配同步進(jìn)行,復(fù)制完成后28端粒端粒:真核生物線性染色體的兩個(gè)末端具有特殊結(jié)構(gòu)稱為端粒。端粒由許多成串的短的重復(fù)序列組成。一條鏈上富含G,如人的端粒TTAGGG,原生動(dòng)物四膜蟲為TTGGGG,植物

TTTAGGG。端粒的功能:穩(wěn)定染色體末端結(jié)構(gòu),防止末端染色體降解;防止染色體間末端連接。(原核生物染色體是環(huán)狀的,5′末端岡奇片段的RNA引物被除去后可借助另半圈DNA鏈向前延伸填補(bǔ)。)端粒29端粒酶(telomerase)DNA復(fù)制需要引物,但在線形DNA分子末端不可能通過正常的機(jī)制在引物被降解后合成相應(yīng)的片段.如果沒有特殊的機(jī)制合成末端序列,染色體就會(huì)在細(xì)胞傳代中變得越來越短。這一難題是通過端粒酶的發(fā)現(xiàn)才得到了澄清。

端粒酶是一種含RNA的蛋白復(fù)合物,實(shí)質(zhì)上是一種逆轉(zhuǎn)錄酶,它以自身攜帶的RNA為模板,催化互補(bǔ)鏈DNA片段的合成,使復(fù)制以后的線形DNA分子的末端保持不變。

端粒酶含150個(gè)堿基RNA鏈。端粒酶結(jié)合到端粒的3′末端上,以RNA鏈5′末端識(shí)別DNA3′末端并合成互補(bǔ)鏈,端粒3′單鏈末端回折作為引物合成其互補(bǔ)鏈。端粒酶(telomerase)DNA復(fù)制需要引物30

缺乏端粒酶活性時(shí),細(xì)胞分裂將端粒不斷縮短,引起細(xì)胞生長停止甚至死亡。腫瘤細(xì)胞端?;钚愿?,設(shè)想端粒酶作為抗癌治療的靶位點(diǎn)。5′3′AAAACCCCAAAACCCCCCA端粒酶

初步研究表明,人體中生殖細(xì)胞的端粒長度保持不變,而體細(xì)胞的端粒長度則隨個(gè)體的老化而逐步縮短。對此的一個(gè)推論是:人的生殖細(xì)胞具端粒酶的活力,體細(xì)胞則否。這一問題的解決無疑會(huì)有助于對生命衰老的認(rèn)識(shí)。

缺乏端粒酶活性時(shí),細(xì)胞分裂將端粒不斷縮短,引起細(xì)胞生31

端粒和端粒酶的發(fā)現(xiàn)歷程——記諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)諾貝爾獎(jiǎng)主頁上介紹她/他們獲獎(jiǎng)的原因是揭示了“howchromosomesareprotectedbytelomeresandtheenzymetelomerase”(染色體是如何被端粒和端粒酶保護(hù)的)

端粒和端粒酶的發(fā)現(xiàn)歷程——記諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)諾貝爾獎(jiǎng)主32

p373

p37333

34真核和原核DNA細(xì)胞復(fù)制比較

拓?fù)涿窪NA復(fù)制后DNA超螺旋裝配成染色體真核和原核DNA細(xì)胞復(fù)制比較35小結(jié):一、半不連續(xù)合成在DNA復(fù)制過程中,一條鏈?zhǔn)沁B續(xù)合成的,而另一條鏈?zhǔn)遣贿B續(xù)合成。體內(nèi)僅含催化5’3’合成的DNA酶。60年代岡琦片段的發(fā)現(xiàn)解決了這個(gè)問題:合成5’3’前導(dǎo)鏈(leadingstrand)是連續(xù)的,方向與復(fù)制叉一致。合成3’

5’隨從鏈時(shí),方向與叉相反,合成不連續(xù),各片段連成一條鏈。小結(jié):在DNA復(fù)制過程中,一條鏈?zhǔn)沁B續(xù)合成的,而另36二、復(fù)制過程和參與酶及因子(一)復(fù)制的起始(分兩步)1、螺旋的松弛與解鏈(1)拓?fù)洚悩?gòu)酶---能改變DNA空間構(gòu)型的酶作用:DNA復(fù)制時(shí)松弛超螺旋,以利復(fù)制叉的行進(jìn)及DNA合成,合成后再引向超螺旋。功能:不清楚,可催化體外拓?fù)洚悩?gòu)化反應(yīng),分兩型。二、復(fù)制過程和參與酶及因子37拓?fù)洚悩?gòu)酶I

(topoisomerase--I)作用:松弛超螺旋,不需ATP,

機(jī)制:切開環(huán)狀一條鏈打結(jié)與解結(jié)環(huán)狀雙鏈DNA的合成環(huán)連與解環(huán)連原核:對負(fù)超螺旋正真核:對正、負(fù)均有作用。拓?fù)洚悩?gòu)酶II----旋轉(zhuǎn)酶(gyrase)作用:松弛超螺旋松+ATP

超(-)切開環(huán)狀兩條鏈打結(jié)與解結(jié)環(huán)連與解環(huán)連拓?fù)洚悩?gòu)酶I(topoisomerase--I)作38(2)解鏈酶(helicase)------復(fù)制蛋白rep作用:ATP供能時(shí),解開DNA雙鏈。原核:編碼解鏈酶的基因是dnaB,DnaB表示蛋白產(chǎn)物。前導(dǎo)鏈結(jié)合rep蛋白,隨從鏈結(jié)合解鏈酶IIⅢ。(3)單鏈結(jié)合蛋白-singlestrandbindingprotein-SSB作用:SSB與解開DNA單鏈結(jié)合,保護(hù)穩(wěn)定DNA。與新復(fù)制DNA單鏈結(jié)合,以防降解。超螺旋DNA拓?fù)涿杆沙诮怄溍附忾_雙鏈

SSB復(fù)制開始生物化學(xué)課件第六章核酸化學(xué)代謝DNA合成392、引發(fā)(需引發(fā)酶及引發(fā)前體參與)(1)引物酶(primase)作用:以DNA為模板,自5’3’合成RNA小片段,3’末端為-OH,長短:十幾到幾十個(gè)核苷酸。原核:dnaG基因編碼DnaG蛋白即引物酶。(2)引發(fā)前體(preprimosome)由多種蛋白因子組成復(fù)合物。作用:合成RNA引物,沿隨從鏈復(fù)制叉的行進(jìn)方向移動(dòng),在不同部位,合成RNA引物??偨Y(jié):合成RNA引物,在引物3’-OH末段進(jìn)行DNA片段合成。(二)DNA鏈的延長反應(yīng)體系:DNA模板,DNA聚合酶,

dNTP,引物,Mg2+離子

2、引發(fā)(需引發(fā)酶及引發(fā)前體參與)40過程:引物3’-OHdNTPppi引物-dNMP反應(yīng)式:DNA+dNTP(DNA)n+1+ppi反應(yīng)機(jī)理:磷親核攻擊。真核與原核中DNA聚合酶有幾種類型,作用方式相同,但各具特性及功能。1、大腸桿菌DNA聚合酶(3種)(1)pol:催化5’3’的聚合作用,合成20個(gè)核苷酸即離開模板,填充空隙。有3’5’外切酶活性,去除錯(cuò)誤堿基的校對作用。有5’3’外切酶活性,去除RNA引物及修正錯(cuò)誤堿基。(2)pol:5’3’DNA合成及3’5’外切酶活性,體內(nèi)功能不清楚。(3)polⅢ:DNA鏈延長起主要作用,細(xì)菌中1000個(gè)dNTP/秒加入。3’5’外切酶活性,校對作用,與pol配合錯(cuò)誤率降至10-6。(4)DNA復(fù)制的保真性:過程:引物3’-OHdNTPppi引物-41Pol:與引發(fā)酶配合,參與隨從鏈的合成。RFA(replicationfactorA):DNA延長中RFA與單鏈結(jié)合起到SSB的作用。(三)終止

連接酶:作用--使相鄰的DNA片段,以3’5’磷酸二酯鍵相連,需ATP。

前導(dǎo)鏈?zhǔn)沁B續(xù)合成的,隨從鏈在連接酶作用下連成一條鏈。

拓?fù)涿窪NA復(fù)制后DNA超螺旋裝配成染色體2、真核生物DNApol特性與大腸桿菌相似,共五種:pol:催化前導(dǎo)鏈及隨從連的合成,需增殖細(xì)胞核抗原蛋白PCNA(proliferatatingcellnucleusantigen-PCNA)的參與。Pol:與引發(fā)酶配合,參與隨從鏈的合成。42二、

逆轉(zhuǎn)錄作用1、概念2、逆轉(zhuǎn)錄酶3、逆轉(zhuǎn)錄的生物學(xué)意義擴(kuò)充了中心法則有助于對病毒致癌機(jī)制的了解與真核細(xì)胞分裂和胚胎發(fā)育有關(guān)逆轉(zhuǎn)錄酶是分子生物學(xué)重要工具酶三種功能依賴RNA的DNA聚合酶活力

以RNA為模板合成DNA,這與通常轉(zhuǎn)錄過程中遺傳信息從DNA到RNA的方向相反,故稱為逆轉(zhuǎn)錄作用。P276核糖核酸酶H活力:水解RNA-DNA分子中RNA;具有

3’--5’和5’--3’核酸外切酶作用依賴DNA指導(dǎo)下的DNA聚合酶活力二、逆轉(zhuǎn)錄作用1、概念2、逆轉(zhuǎn)錄酶3、逆轉(zhuǎn)錄的生物43逆轉(zhuǎn)錄過程中cDNA的合成

依賴RNA的DNA聚合酶核糖核酸酶H活力水解RNA依賴DNA的DNA聚合酶逆轉(zhuǎn)錄過程中cDNA的合成

依賴RNA的DNA聚合酶核糖核44

反轉(zhuǎn)錄酶病毒(retrovirus)

性質(zhì):一類RNA病毒,含反轉(zhuǎn)錄酶,因致癌又稱RNA腫瘤病毒。

組成:核心RNA,蛋白外殼。

病毒生活周期:早、晚兩期早期:進(jìn)入細(xì)胞后放出病毒RNADNA整合進(jìn)宿主染色體。晚期:轉(zhuǎn)錄和翻譯。HIV-人類免疫缺陷病毒:感染人T4淋巴細(xì)胞,使病人喪失免疫能力,死于感染。不與外界接觸的胸腺、骨髓、脾臟、扁桃腺及淋巴結(jié)等稱內(nèi)分泌淋巴系統(tǒng)。胸腺位于胸骨后,能生產(chǎn)淋巴細(xì)胞(T細(xì)胞),能誘導(dǎo)細(xì)胞免疫,調(diào)動(dòng)吞噬細(xì)胞等包圍、吞噬并將病原菌消滅。

反轉(zhuǎn)錄酶病毒(retrovirus)45逆逆轉(zhuǎn)錄病毒的生活周期生活周期RNA衣殼被膜逆轉(zhuǎn)錄酶轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)譯整合入宿主細(xì)胞染色體DNA進(jìn)入細(xì)胞丟失被膜丟失衣殼逆轉(zhuǎn)錄RNARNAcDNA衣殼蛋白被膜蛋白逆轉(zhuǎn)錄酶逆逆轉(zhuǎn)錄病毒的生活周期生活周期RNA衣殼被膜逆轉(zhuǎn)錄酶轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)譯46三、

DNA的損傷與修復(fù)

某些物理化學(xué)因子,如紫外線、電離輻射和化學(xué)誘變劑等,都有引起生物突變和致死的作用,其機(jī)理是作用于DNA,造成DNA結(jié)構(gòu)和功能的破壞,稱為DNA的損傷.DNA的修復(fù)主要有以下類型:暗修復(fù)1、光裂合酶修復(fù)2、切除修復(fù)3、重組修復(fù)三、DNA的損傷與修復(fù)某些物理化學(xué)因47DNA紫外線損傷的光裂合酶修復(fù)1、形成嘧啶二聚體2、光復(fù)合酶結(jié)合于損傷部位3、酶被可見光激活4、修復(fù)后酶被釋放DNA紫外線損傷的光裂合酶修復(fù)1、形成嘧啶二聚體2、光復(fù)合酶48DNA的損傷和切除修復(fù)堿基丟失堿基缺陷或錯(cuò)配結(jié)構(gòu)缺陷切開核酸內(nèi)切酶核酸外切酶切除DNA聚合酶DNA連接酶核酸內(nèi)切酶核酸外切酶切開切除修復(fù)連接糖苷酶插入酶堿基取代DNA的損傷和切除修復(fù)堿基丟失堿基缺陷或錯(cuò)配結(jié)構(gòu)缺陷切開核酸49DNA的重組修復(fù)胸腺嘧啶二聚體復(fù)制核酸酶及重組蛋白修復(fù)復(fù)制DNA聚合酶DNA連接酶重組DNA的重組修復(fù)胸腺嘧啶二聚體復(fù)制核酸酶及重組蛋白修復(fù)復(fù)制D50

四、DNA的突變

DNA分子中的核苷酸序列發(fā)生突然而穩(wěn)定的改變,從而導(dǎo)致DNA的復(fù)制以及后來的轉(zhuǎn)錄和翻譯產(chǎn)物隨之發(fā)生變化,表現(xiàn)出異常的遺傳特性,稱為DNA的突變。它包括由于DNA損傷和錯(cuò)配得不到修復(fù)而引起的突變,以及由于不同DNA分子之間的交換而引起的遺傳重組。(一)突變的類型

堿基對的置換(substitution)

移碼突變(framesshiftmutation)四、DNA的突變

DNA分子中的核苷酸序列51

DNA突變的類型

-T-C-T-G-C-T-G-T-A-C-G--A-G-A-C-G-A-C-A-T-G-C-轉(zhuǎn)換野生型基因

-T-C-G-A-C-T-G-T-A-C-G--A-G-C-T-G-A-C-A-T-G-C-

-T-C-T-T-C-T-G-T-A-C-G--A-G-A-A-G-A-C-A-T-G-C-顛換堿基對的置換(substitution)移碼突變(framesshiftmutation)

-T-C-T-C-G-C-T-G-T-A-C-G--A-G-A-G-C-G-A-C-A-T-G-C-插入

-T-C-G-C-T-G-T-A-C-G--A-G-C-G-A-C-A-T-G-C-缺失AT嘧啶間、嘌呤間嘧啶與嘌呤間DNA突變的類型

-T-C-T-G-C-T-G-T-A-52

(二)突變的意義1、進(jìn)化、分化的分子基礎(chǔ)。2、基因型改變。(表型不變)3、致死性的突變。(消滅病原體)4、某些疾病的發(fā)病基礎(chǔ)。(三)誘變劑堿基類似物(baseanalog)

堿基修飾劑(basemodifier)嵌入染料(intercalationdye)

紫外線(ultraviolet)和電離輻射(ionizingradiation)

(二)突變的意義(三)誘變劑53

54

55

第七節(jié)DNA的生物合成(復(fù)制)

DNAReplicationP361

第七節(jié)DNA的生物合成(復(fù)制)

DNAReplica56

DNA是絕大多數(shù)生物體遺傳信息的載體,繼1953年Watson&Crick提出DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)模型后,1958年Crick提出了“中心法則”(Centraldogma)揭示了遺傳信息的傳遞規(guī)律。DNARNA蛋白質(zhì)復(fù)制復(fù)制轉(zhuǎn)錄反轉(zhuǎn)錄翻譯遺傳信息傳遞的中心法則病毒

DNA是絕大多數(shù)生物體遺傳信息的載體,繼1957DNA的生物合成:細(xì)胞內(nèi)合成DNA的過程1、復(fù)制:以DNA作為模板指導(dǎo)的DNA合成,即將DNA攜帶的信息傳至子代DNA。

四種核苷酸(dATP\dTTP\dCTP\dGTP)

2、反轉(zhuǎn)錄:DNA合成也可以RNA為模扳指導(dǎo)合成作用,見于RNA病毒。3、修復(fù)合成:當(dāng)各種因素引起DNA損傷時(shí),損傷DNA可修復(fù)合成,校正錯(cuò)誤,完成正確合成,以保持DNA結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性和遺傳信息的準(zhǔn)確性。DNA的生物合成:細(xì)胞內(nèi)合成DNA的過程581、DNA的半保留復(fù)制

DNA在復(fù)制時(shí),兩條鏈解開分別作為模板,在DNA聚合酶的催化下按堿基互補(bǔ)的原則合成兩條與模板鏈互補(bǔ)的新鏈,以組成新的DNA分子。這樣新形成的兩個(gè)DNA分子與親代DNA分子的堿基順序完全一樣。由于子代DNA分子中一條鏈來自親代,另一條鏈?zhǔn)切潞铣傻模@種復(fù)制方式稱為半保留復(fù)制。一、DNA復(fù)制1、DNA的半保留復(fù)制

DNA在復(fù)制時(shí),兩條59DNA的半保留復(fù)制實(shí)驗(yàn)依據(jù)

1958年M.Meselson和F.W.Stahl用大腸桿菌為材料,在含15N和14N的NH4cl中培養(yǎng)證實(shí),用同位素示蹤標(biāo)記加密度梯度離心技術(shù)實(shí)驗(yàn),證明了DNA是采取半保留的方式進(jìn)行復(fù)制.[15N]DNA[14N-15N]DNA[14N]DNA[14N-15N]DNADNA在離心管中的沉降位置P361培養(yǎng)12代培養(yǎng)1代培養(yǎng)2代DNA的半保留復(fù)制實(shí)驗(yàn)依據(jù)1958年M.Mesels602、原核生物DNA聚合反應(yīng)有關(guān)的酶類

(1)DNA聚合酶(DNApolymetases)(2)引物酶(peimase)和引發(fā)體primosome

:啟動(dòng)RNA引物鏈的合成。

(3)DNA連接酶(DNAligas(4)DNA解鏈酶:ATP供能解開DNA雙鏈(5)單鏈結(jié)合蛋白(single-strandbindingprotein,SSB):結(jié)合在解開的DNA單鏈上,防止重新形成雙螺旋。

(6)拓?fù)洚悩?gòu)酶(topoisomerase):兼具內(nèi)切酶和連接酶活力,能迅速將DNA超螺旋或雙螺旋緊張狀態(tài)變成松馳狀態(tài),便于解鏈。能改變DNA空間構(gòu)型的酶,合成后再引向超螺旋。機(jī)制:切開環(huán)狀一條鏈解旋酶DNA聚合酶III解鏈酶RNA引物引物酶和引發(fā)體DNA聚合酶ISSB3′3′5′3′5′5′RNA引物2、原核生物DNA聚合反應(yīng)有關(guān)的酶類

(1)DNA聚合酶(D61(1)DNA聚合酶催化的鏈延長反應(yīng)5′RNA引物子鏈3′3′5′5′3′3′5′5′3′3′5′模板鏈只能加到已有核苷酸的游離3’羥基上,不能自身聚合,需引物p363(1)DNA聚合酶催化的鏈延長反應(yīng)5′RNA引物子鏈3′3′62大腸桿菌三種DNA聚合酶比較DNA聚合酶Ⅱ分子量每個(gè)細(xì)胞的酶分子統(tǒng)計(jì)數(shù)5′-3′聚合酶作用3′-5′核酸外切酶作用5′-3′核酸外切酶作用聚合速率(nt/s)DNA聚合酶Ⅰ109000單鏈多肽400+++16-20120000單鏈多肽100++-40400,000(10種亞基)10-20++-250-1000比較項(xiàng)目DNA聚合酶III切除引物,校對,修復(fù)修復(fù)復(fù)制功能

1999年發(fā)現(xiàn)聚合酶和,它們涉及DNA的錯(cuò)誤傾向修復(fù)(erroounerepair)P364大腸桿菌三種DNA聚合酶比較DNA分子量DNA109000單63DNA聚合酶的3′-5′外切酶水解位點(diǎn)(I、II、III)3′3′5′5′錯(cuò)配堿基3′-5′核酸外切酶水解位點(diǎn)DNA聚合酶的3′-5′外切酶水解位點(diǎn)(I、II、III)64DNA聚合酶5′-3′外切酶活力(I)

5′-3′核酸外切酶水解位點(diǎn)單鏈缺口5′切除引物,修復(fù)DNA聚合酶5′-3′外切酶活力(I)

5′-3′核酸外65大腸桿菌DNA聚合酶Ⅲ全酶的結(jié)構(gòu)和功能(10個(gè)亞基)延長因子DNA聚合酶Ⅲ兩個(gè)亞基夾住DNA核心酶校對引物的結(jié)合和識(shí)別促使核心酶二聚化組建核心酶P364大腸桿菌DNA聚合酶Ⅲ全酶的結(jié)構(gòu)和功能(10個(gè)亞基)66圖11-8DNAPolIII的二聚體作用生物化學(xué)課件第六章核酸化學(xué)代謝DNA合成67(2)連接酶連接切口Mg2+連接酶ATP(噬菌體和動(dòng)物)或NADH(細(xì)菌)AMP+PPiATCGPTTPPPAACCTGAPACPPPPOHTGGATCGPTTPPPAACCTGAPACPPPTGGP缺口3'3'5'5'5'5'3'3'模板鏈模板鏈DNA復(fù)制、損傷修復(fù)、重組P367(2)連接酶連接切口Mg2+連接酶ATP(噬菌體和動(dòng)物)AM683、原核細(xì)胞DNA的半不連續(xù)復(fù)制復(fù)制過程

semidiscontinuousreplication

P3683、原核細(xì)胞DNA的半不連續(xù)復(fù)制P36869(1)復(fù)制的起始點(diǎn)與方向

親代DNA開鏈,復(fù)制起始點(diǎn)呈叉型移動(dòng)?!褟?fù)制起始點(diǎn):DNA復(fù)制要從DNA分子的特定部位開始,此部位稱復(fù)制起始點(diǎn)。原核:僅含一個(gè),約245bp,特殊的重復(fù)序列。真核:多個(gè)起始點(diǎn)例:酵母17號(hào)染色體含400個(gè)。⊙復(fù)制方向:含三種機(jī)制一個(gè)起點(diǎn)2個(gè)叉,不同方向合成兩條鏈,此為常見方式。2個(gè)起點(diǎn),2個(gè)叉,各合一條鏈(腺病毒)。一個(gè)起點(diǎn)一個(gè)叉,同方向合成兩條鏈(質(zhì)粒ColEI)--單向復(fù)制(1)復(fù)制的起始點(diǎn)與方向70DNA的雙向和單向復(fù)制----起始環(huán)狀

DNA復(fù)制時(shí)所形成的O結(jié)構(gòu)起始點(diǎn)復(fù)制叉的推進(jìn)復(fù)制叉起始點(diǎn)起始點(diǎn)起始點(diǎn)復(fù)制叉復(fù)制叉未復(fù)制DNA單向復(fù)制雙向復(fù)制DNA的雙向和單向復(fù)制----起始環(huán)狀DNA復(fù)制時(shí)所形成的71大腸桿菌復(fù)制起點(diǎn)成串排列的重復(fù)序列

GATCTNTTNTTT成串排列的三個(gè)13bp序列共有序列共有序列TTATCCACA

DnaA蛋白結(jié)合位點(diǎn)四個(gè)9bp序列DnaB(解螺旋酶)SSB大腸桿菌DNA復(fù)制起點(diǎn)在起始階段的結(jié)構(gòu)模型DnaA識(shí)別起始點(diǎn)在復(fù)制起點(diǎn)特異部位解開雙鏈DNAP368大腸桿菌復(fù)制起點(diǎn)成串排列的重復(fù)序列

GATCTNTTNTTT72(2)原核細(xì)胞DNA的半不連續(xù)復(fù)制復(fù)制過程

復(fù)制叉的移動(dòng)方向解旋酶解鏈酶RNA引物引物體DNA聚合酶ISSB3′3′5′前導(dǎo)鏈隨后鏈3′5′復(fù)制的起始DNA鏈的延長DNA鏈終止5′RNA引物3′3′P369,393,274DNA聚合酶III切除引物、缺口填補(bǔ)、校對(2)原核細(xì)胞DNA的半不連續(xù)復(fù)制復(fù)制過程

復(fù)制叉的移動(dòng)方向73聚合酶III核心酶大腸桿菌復(fù)制體結(jié)構(gòu)示意圖聚合酶I聚合酶III核心酶滯后鏈前導(dǎo)鏈解螺旋酶引物合成酶RNA引物引發(fā)體拓?fù)洚悩?gòu)酶II-夾子-聚體-夾子-復(fù)合物RNA引物單鏈結(jié)合蛋白(SSB)活化引物合成酶P370聚合酶III核心酶大腸桿菌復(fù)制體結(jié)構(gòu)示意圖聚合酶I聚合酶II74復(fù)制叉處前導(dǎo)鏈和隨后鏈同時(shí)合成的工作模型聚合酶III全酶引物聚合酶III全酶引物引物體引物體解旋酶解旋酶引物合成酶DnaG蛋白前導(dǎo)鏈和隨后鏈被同一個(gè)DNA聚合酶III不對稱二聚體合成復(fù)制叉處前導(dǎo)鏈和隨后鏈同時(shí)合成的工作模型聚合酶III全酶引物75(3)大腸桿菌染色體復(fù)制的終止oric復(fù)制叉2復(fù)制叉1終止復(fù)制叉2終止復(fù)制叉1復(fù)制叉1復(fù)制叉2完成復(fù)制DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶連鎖體終止子位點(diǎn)連鎖體在細(xì)胞分裂前必須解開,否則導(dǎo)致細(xì)胞分裂失敗,細(xì)胞死亡。兩個(gè)復(fù)制叉從起始反向移動(dòng)至約180O的對面終止區(qū)相遇(3)大腸桿菌染色體復(fù)制的終止oric復(fù)制叉2復(fù)制叉1終止76(4)復(fù)制的忠實(shí)性

DNA復(fù)制過程是一個(gè)高度精確的過程,據(jù)估計(jì),大腸桿菌DNA復(fù)制5X109堿基對僅出現(xiàn)一個(gè)誤差,保證復(fù)制忠實(shí)性的原因主要有以下三點(diǎn):

DNA聚合酶的高度專一性(嚴(yán)格遵循堿基配對原則,但錯(cuò)配率為7

X10-6

DNA聚合酶的校對功能(錯(cuò)配堿基被3’-5’

外切酶切除)起始時(shí)以RNA作為引物P374(4)復(fù)制的忠實(shí)性DNA復(fù)制過程是一個(gè)高度精77DNA聚合酶的校對功能聚合酶錯(cuò)配鹼基復(fù)制方向正確核苷酸5′5′5′3′3′3′切除錯(cuò)配核苷酸DNA聚合酶的校對功能聚合酶錯(cuò)配鹼基復(fù)制方向正確核苷酸5′78

起始時(shí)以RNA作為引物的作用

DNA復(fù)制為什么要合成一個(gè)RNA引物,而后又把這個(gè)引物消除呢?這是保證DNA聚合過程高度精確的又一措施。已知DNA聚合酶具有3’-5’外切酶功能校對復(fù)制過程中的核苷酸,也就是說聚合酶在開始形成一個(gè)新的磷酸二酯鍵前,總是檢查前一個(gè)堿基是否正確,這就決定了它不能從頭開始合成。因此先合成一條低忠實(shí)性的多核苷酸來開始DNA的合成,并以核糖核苷酸來表示是“暫時(shí)”的,當(dāng)DNA開始聚合以后再以5’-3’外切酶的功能切除,以高忠實(shí)性的脫氧核苷酸取而代之,確保復(fù)制的忠實(shí)性。(RNA聚合酶無校對功能,不需引物,可以從頭合成)

起始時(shí)以RNA作為引物的作用

DNA復(fù)制為794、真核生物復(fù)制的特點(diǎn)(1)復(fù)制速度:是原核的1/10,但復(fù)制起始點(diǎn)多。(2)引物和岡琦片段小于原核,引物為10個(gè),片段100~200;原核引物十幾~幾十,片段1000~2000。(3)復(fù)制需DNApol及多種因子參加,pol

pol在核內(nèi)起主要作用。(4)pol為線粒體復(fù)制酶。(5)DNA復(fù)制位于細(xì)胞周期的S期。4、真核生物復(fù)制的特點(diǎn)80真核細(xì)胞DNA復(fù)制的特點(diǎn)多個(gè)起點(diǎn)復(fù)制起點(diǎn)起點(diǎn)起點(diǎn)起點(diǎn)起點(diǎn)起點(diǎn)真核生物DNA聚合酶端粒(telemere)的復(fù)制真核細(xì)胞DNA復(fù)制的特點(diǎn)多個(gè)起點(diǎn)復(fù)制起點(diǎn)起點(diǎn)起點(diǎn)起點(diǎn)起點(diǎn)81真核生物的DNA聚合酶DNA聚合酶分子量亞基數(shù)細(xì)胞內(nèi)分布酶活力百分比外切酶活力DNA聚合酶110-23,000多個(gè)細(xì)胞核~80%無120,000二個(gè)細(xì)胞核和線粒體2~15%3-5外切酶400,000二個(gè)細(xì)胞核+10~25%3-5外切酶DNA聚合酶DNA聚合酶45,000一個(gè)細(xì)胞核10~15%無核DNA合成線粒體DNA合成引物合成

修復(fù)功能真核生物的DNA聚合酶DNA分子量DNA110-23,00082

真核生物DNA復(fù)制與核小體裝配同步進(jìn)行,復(fù)制完成后隨即組合成染色體并從G2期過渡到M期。染色體DNA是線性結(jié)構(gòu)。染色體兩端DNA子鏈上最后復(fù)制的RNA引物,去除后留下空隙。剩下的DNA單鏈母鏈如果不填補(bǔ)成雙鏈,就會(huì)被核內(nèi)Dnase酶解。某些低等生物染色體經(jīng)多次復(fù)制會(huì)越來越短。

真核生物DNA復(fù)制與核小體裝配同步進(jìn)行,復(fù)制完成后83端粒端粒:真核生物線性染色體的兩個(gè)末端具有特殊結(jié)構(gòu)稱為端粒。端粒由許多成串的短的重復(fù)序列組成。一條鏈上富含G,如人的端粒TTAGGG,原生動(dòng)物四膜蟲為TTGGGG,植物

TTTAGGG。端粒的功能:穩(wěn)定染色體末端結(jié)構(gòu),防止末端染色體降解;防止染色體間末端連接。(原核生物染色體是環(huán)狀的,5′末端岡奇片段的RNA引物被除去后可借助另半圈DNA鏈向前延伸填補(bǔ)。)端粒84端粒酶(telomerase)DNA復(fù)制需要引物,但在線形DNA分子末端不可能通過正常的機(jī)制在引物被降解后合成相應(yīng)的片段.如果沒有特殊的機(jī)制合成末端序列,染色體就會(huì)在細(xì)胞傳代中變得越來越短。這一難題是通過端粒酶的發(fā)現(xiàn)才得到了澄清。

端粒酶是一種含RNA的蛋白復(fù)合物,實(shí)質(zhì)上是一種逆轉(zhuǎn)錄酶,它以自身攜帶的RNA為模板,催化互補(bǔ)鏈DNA片段的合成,使復(fù)制以后的線形DNA分子的末端保持不變。

端粒酶含150個(gè)堿基RNA鏈。端粒酶結(jié)合到端粒的3′末端上,以RNA鏈5′末端識(shí)別DNA3′末端并合成互補(bǔ)鏈,端粒3′單鏈末端回折作為引物合成其互補(bǔ)鏈。端粒酶(telomerase)DNA復(fù)制需要引物85

缺乏端粒酶活性時(shí),細(xì)胞分裂將端粒不斷縮短,引起細(xì)胞生長停止甚至死亡。腫瘤細(xì)胞端?;钚愿?,設(shè)想端粒酶作為抗癌治療的靶位點(diǎn)。5′3′AAAACCCCAAAACCCCCCA端粒酶

初步研究表明,人體中生殖細(xì)胞的端粒長度保持不變,而體細(xì)胞的端粒長度則隨個(gè)體的老化而逐步縮短。對此的一個(gè)推論是:人的生殖細(xì)胞具端粒酶的活力,體細(xì)胞則否。這一問題的解決無疑會(huì)有助于對生命衰老的認(rèn)識(shí)。

缺乏端粒酶活性時(shí),細(xì)胞分裂將端粒不斷縮短,引起細(xì)胞生86

端粒和端粒酶的發(fā)現(xiàn)歷程——記諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)諾貝爾獎(jiǎng)主頁上介紹她/他們獲獎(jiǎng)的原因是揭示了“howchromosomesareprotectedbytelomeresandtheenzymetelomerase”(染色體是如何被端粒和端粒酶保護(hù)的)

端粒和端粒酶的發(fā)現(xiàn)歷程——記諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)諾貝爾獎(jiǎng)主87

p373

p37388

89真核和原核DNA細(xì)胞復(fù)制比較

拓?fù)涿窪NA復(fù)制后DNA超螺旋裝配成染色體真核和原核DNA細(xì)胞復(fù)制比較90小結(jié):一、半不連續(xù)合成在DNA復(fù)制過程中,一條鏈?zhǔn)沁B續(xù)合成的,而另一條鏈?zhǔn)遣贿B續(xù)合成。體內(nèi)僅含催化5’3’合成的DNA酶。60年代岡琦片段的發(fā)現(xiàn)解決了這個(gè)問題:合成5’3’前導(dǎo)鏈(leadingstrand)是連續(xù)的,方向與復(fù)制叉一致。合成3’

5’隨從鏈時(shí),方向與叉相反,合成不連續(xù),各片段連成一條鏈。小結(jié):在DNA復(fù)制過程中,一條鏈?zhǔn)沁B續(xù)合成的,而另91二、復(fù)制過程和參與酶及因子(一)復(fù)制的起始(分兩步)1、螺旋的松弛與解鏈(1)拓?fù)洚悩?gòu)酶---能改變DNA空間構(gòu)型的酶作用:DNA復(fù)制時(shí)松弛超螺旋,以利復(fù)制叉的行進(jìn)及DNA合成,合成后再引向超螺旋。功能:不清楚,可催化體外拓?fù)洚悩?gòu)化反應(yīng),分兩型。二、復(fù)制過程和參與酶及因子92拓?fù)洚悩?gòu)酶I

(topoisomerase--I)作用:松弛超螺旋,不需ATP,

機(jī)制:切開環(huán)狀一條鏈打結(jié)與解結(jié)環(huán)狀雙鏈DNA的合成環(huán)連與解環(huán)連原核:對負(fù)超螺旋正真核:對正、負(fù)均有作用。拓?fù)洚悩?gòu)酶II----旋轉(zhuǎn)酶(gyrase)作用:松弛超螺旋松+ATP

超(-)切開環(huán)狀兩條鏈打結(jié)與解結(jié)環(huán)連與解環(huán)連拓?fù)洚悩?gòu)酶I(topoisomerase--I)作93(2)解鏈酶(helicase)------復(fù)制蛋白rep作用:ATP供能時(shí),解開DNA雙鏈。原核:編碼解鏈酶的基因是dnaB,DnaB表示蛋白產(chǎn)物。前導(dǎo)鏈結(jié)合rep蛋白,隨從鏈結(jié)合解鏈酶IIⅢ。(3)單鏈結(jié)合蛋白-singlestrandbindingprotein-SSB作用:SSB與解開DNA單鏈結(jié)合,保護(hù)穩(wěn)定DNA。與新復(fù)制DNA單鏈結(jié)合,以防降解。超螺旋DNA拓?fù)涿杆沙诮怄溍附忾_雙鏈

SSB復(fù)制開始生物化學(xué)課件第六章核酸化學(xué)代謝DNA合成942、引發(fā)(需引發(fā)酶及引發(fā)前體參與)(1)引物酶(primase)作用:以DNA為模板,自5’3’合成RNA小片段,3’末端為-OH,長短:十幾到幾十個(gè)核苷酸。原核:dnaG基因編碼DnaG蛋白即引物酶。(2)引發(fā)前體(preprimosome)由多種蛋白因子組成復(fù)合物。作用:合成RNA引物,沿隨從鏈復(fù)制叉的行進(jìn)方向移動(dòng),在不同部位,合成RNA引物??偨Y(jié):合成RNA引物,在引物3’-OH末段進(jìn)行DNA片段合成。(二)DNA鏈的延長反應(yīng)體系:DNA模板,DNA聚合酶,

dNTP,引物,Mg2+離子

2、引發(fā)(需引發(fā)酶及引發(fā)前體參與)95過程:引物3’-OHdNTPppi引物-dNMP反應(yīng)式:DNA+dNTP(DNA)n+1+ppi反應(yīng)機(jī)理:磷親核攻擊。真核與原核中DNA聚合酶有幾種類型,作用方式相同,但各具特性及功能。1、大腸桿菌DNA聚合酶(3種)(1)pol:催化5’3’的聚合作用,合成20個(gè)核苷酸即離開模板,填充空隙。有3’5’外切酶活性,去除錯(cuò)誤堿基的校對作用。有5’3’外切酶活性,去除RNA引物及修正錯(cuò)誤堿基。(2)pol:5’3’DNA合成及3’5’外切酶活性,體內(nèi)功能不清楚。(3)polⅢ:DNA鏈延長起主要作用,細(xì)菌中1000個(gè)dNTP/秒加入。3’5’外切酶活性,校對作用,與pol配合錯(cuò)誤率降至10-6。(4)DNA復(fù)制的保真性:過程:引物3’-OHdNTPppi引物-96Pol:與引發(fā)酶配合,參與隨從鏈的合成。RFA(replicationfactorA):DNA延長中RFA與單鏈結(jié)合起到SSB的作用。(三)終止

連接酶:作用--使相鄰的DNA片段,以3’5’磷酸二酯鍵相連,需ATP。

前導(dǎo)鏈?zhǔn)沁B續(xù)合成的,隨從鏈在連接酶作用下連成一條鏈。

拓?fù)涿窪NA復(fù)制后DNA超螺旋裝配成染色體2、真核生物DNApol特性與大腸桿菌相似,共五種:pol:催化前導(dǎo)鏈及隨從連的合成,需增殖細(xì)胞核抗原蛋白PCNA(proliferatatingcellnucleusantigen-PCNA)的參與。Pol:與引發(fā)酶配合,參與隨從鏈的合成。97二、

逆轉(zhuǎn)錄作用1、概念2、逆轉(zhuǎn)錄酶3、逆轉(zhuǎn)

溫馨提示

  • 1. 本站所有資源如無特殊說明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請下載最新的WinRAR軟件解壓。
  • 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請聯(lián)系上傳者。文件的所有權(quán)益歸上傳用戶所有。
  • 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網(wǎng)頁內(nèi)容里面會(huì)有圖紙預(yù)覽,若沒有圖紙預(yù)覽就沒有圖紙。
  • 4. 未經(jīng)權(quán)益所有人同意不得將文件中的內(nèi)容挪作商業(yè)或盈利用途。
  • 5. 人人文庫網(wǎng)僅提供信息存儲(chǔ)空間,僅對用戶上傳內(nèi)容的表現(xiàn)方式做保護(hù)處理,對用戶上傳分享的文檔內(nèi)容本身不做任何修改或編輯,并不能對任何下載內(nèi)容負(fù)責(zé)。
  • 6. 下載文件中如有侵權(quán)或不適當(dāng)內(nèi)容,請與我們聯(lián)系,我們立即糾正。
  • 7. 本站不保證下載資源的準(zhǔn)確性、安全性和完整性, 同時(shí)也不承擔(dān)用戶因使用這些下載資源對自己和他人造成任何形式的傷害或損失。

最新文檔

評論

0/150

提交評論