微生物之腸桿菌課件

腸桿菌種屬鑒定靶點的選擇江蘇嘉語生物醫(yī)藥技術(shù)股份有限公司陳穎曦腸桿菌種屬鑒定靶點的選擇1內(nèi)容簡介腸桿菌簡介腸桿菌檢測常用靶點比對種屬縮寫與比對菌株數(shù)特異性靶點的選擇及序列比對文獻內(nèi)容簡介2腸桿菌屬簡介腸桿菌屬拉丁學(xué)名(EnterobacterHormaecheandEdwards,1960)直桿狀,寬0.6~10μm×12~3.0μm,符合腸桿菌科的一般定義。革蘭氏陰性,周生鞭毛(通常4~6根)運動。兼性厭氧,容易在普通培養(yǎng)基上生長。發(fā)酵葡萄糖,產(chǎn)酸產(chǎn)氣(通常co2:H2=2:1)。在44.5℃時不能由葡萄糖產(chǎn)氣。大多數(shù)菌株vP試驗陽性,MR試驗陰性。一般可利用檸檬酸鹽和丙二酸鹽作為惟的碳源和能源。不從硫代硫酸鹽產(chǎn)生H2S。多數(shù)菌株可將明膠緩慢液化,不產(chǎn)生脫氧核糖核酸酶。最適生長溫度為30℃,多數(shù)臨床菌株在37℃生長,有些環(huán)境菌株37℃時生化反應(yīng)不穩(wěn)定。廣泛分布于自然界,普遍存在于人和動物中。DNA的G+Cmol%為5260(Bd)。種間和相近屬的鑒別見表3-11。模式種;陰溝腸桿菌(Enterobactercloacea),臨床致病種為阪崎腸桿菌,陰溝腸桿菌和產(chǎn)氣腸桿菌腸桿菌屬簡介3腸桿菌分類腸桿菌科溝腸桿菌(Enterobactercloacea埃希氏屬愛德華氏菌屬產(chǎn)氣腸桿菌檸檬酸桿菌屬Enterobacteraerogenes沙門氏菌屬志賀氏菌屬克雷伯氏菌屬腸桿茵屬腸桿菌屬阪崎腸桿菌Enterobactersakazakii)哈夫尼菌屬Cronobactersakazakii)沙雷氏菌屬變形桿菌屬耶爾森氏菌屬其他6個種歐文氏菌屬克羅諾桿菌屬其他種腸桿菌分類4腸桿菌科cloacae腸桿菌屬克羅諾桿菌屬其他屬aeroagglomeransasburlaecancerogenoussakazakiicowanmalonaticusgergoviaemuytjensIdublinensisintermediusuniversalisludwigiigenospeciesprints腸桿菌科5阪崎腸桿菌(ES)簡介阪崎腸桿菌(又稱阪崎氏腸桿菌)是腸桿菌科的一種,1980年由黃色陰溝腸桿菌更名為阪崎腸桿菌。阪崎腸桿菌能引起嚴(yán)重的新生兒腦膜炎、小腸結(jié)腸炎和菌血癥死亡率高達(dá)50%以上。目前,微生物學(xué)家尚不清楚阪崎腸杄菌的污染來源,但許多「病例報告表明嬰兒配方粉是目前發(fā)現(xiàn)的主要感染渠道阪崎腸桿菌(ES)簡介6陰溝腸桿菌(EC)簡介陰溝腸桿菌(Enterobactercloacae)廣泛存在于自然界中,在人和動物的糞便水、泥土、植物中均可檢出,它是腸道正常菌種之一,但可作為條件致病菌隨著頭孢菌素的廣泛使用陰溝腸桿菌已成為醫(yī)院感染越來越重要的病原菌,其引起的疾病,常累及多個器官系統(tǒng),包括皮膚軟組織感染、泌尿道感染、呼吸道感染以及敗血癥等,由于陰溝腸桿菌能產(chǎn)生超廣譜β內(nèi)酰胺酶(extended-spectrumβ-1actamases,ESBLS)和AmpC,耐藥情況嚴(yán)重,給臨床治療帶來了新的挑戰(zhàn)。陰溝腸桿菌(EC)簡介7產(chǎn)氣腸桿菌(EA)簡介產(chǎn)氣腸桿菌(Enterobacteraerogenes),屬于腸桿菌科(Enterobacteriaceae),腸產(chǎn)氣桿菌屬(Enterobacter)。革蘭氏陰性菌,兼性厭氧生物。曾在1963年和一些現(xiàn)屬于Enterobacter的菌類被歸類為Paracolobactrumaerogenoides。在希臘字中,aer代表“空氣”,gennin代表“產(chǎn)生”,所以其種名aerogenes代表著“產(chǎn)氣”的意,產(chǎn)氣腸桿菌呈棒狀菌體大小約為長1.2-3.0μm、寬0.6-1.0μm,為革氏陰性的兼性厭氧桿菌。不產(chǎn)孢子且具有小的莢膜。其有周鞭毛,可以活動。主要生存于人類和動物的腸道,為人體內(nèi)的正常菌相,只有在人體虛弱的特殊情況下才偶爾引起疾病。亦生存于水、土壤及腐敗物中產(chǎn)氣腸桿菌(EA)簡介8腸桿菌種屬鑒定常用靶點基因名生理擴增片段大靶微功能小(bp)生物特異性敏感性2.3cfu/assay16S[1-7,28核糖體RNA100.950100%100fg/assay[]ES\EC102to10ITS[8-12核糖體RNA500-600假陽性[9]22cfu/mLI8InpA[9,11,13100-50015,29外膜蛋白A假陽性[9]103CFU/mL[15guA[9,16,17,18]葡萄糖苷酶600100100%0-cfu/mL[17DNA引發(fā)酶dnaG(MMs)(大分子合63×103<100100%7,18,19]成系統(tǒng)操縱fu/mL[7IaE20]α-葡萄糖苷114100%400cfu/mL[201atpD[211ATP合成酶180EC100%unknow亞基腸桿菌種屬鑒定常用靶點9基因名生理擴增片段靶微功能小(bp)生物特異性敏感性RNA區(qū)分rpobi23241Polymerase00各種Cssp100%subunitbeta分DNA促旋酶151l00%unknow亞基B各種(ES)鋅金屬Zpx26,27]350蛋白酶100%180fg/PCRI27I基因名10微生物之腸桿菌課件11微生物之腸桿菌課件12微生物之腸桿菌課件13微生物之腸桿菌課件14微生物之腸桿菌課件15微生物之腸桿菌課件16微生物之腸桿菌課件17微生物之腸桿菌課件18微生物之腸桿菌課件19微生物之腸桿菌課件20微生物之腸桿菌課件21微生物之腸桿菌課件22微生物之腸桿菌課件23微生物之腸桿菌課件24微生物之腸桿菌課件25微生物之腸桿菌課件26微生物之腸桿菌課件27微生物之腸桿菌課件28微生物之腸桿菌課件29微生物之腸桿菌課件30微生物之腸桿菌課件31微生物之腸桿菌課件32微生物之腸桿菌課件33微生物之腸桿菌課件34微生物之腸桿菌課件35微生物之腸桿菌課件36微生物之腸桿菌課件37微生物之腸桿菌課件38腸桿菌種屬鑒定靶點的選擇江蘇嘉語生物醫(yī)藥技術(shù)股份有限公司陳穎曦腸桿菌種屬鑒定靶點的選擇39內(nèi)容簡介腸桿菌簡介腸桿菌檢測常用靶點比對種屬縮寫與比對菌株數(shù)特異性靶點的選擇及序列比對文獻內(nèi)容簡介40腸桿菌屬簡介腸桿菌屬拉丁學(xué)名(EnterobacterHormaecheandEdwards,1960)直桿狀,寬0.6~10μm×12~3.0μm,符合腸桿菌科的一般定義。革蘭氏陰性,周生鞭毛(通常4~6根)運動。兼性厭氧,容易在普通培養(yǎng)基上生長。發(fā)酵葡萄糖,產(chǎn)酸產(chǎn)氣(通常co2:H2=2:1)。在44.5℃時不能由葡萄糖產(chǎn)氣。大多數(shù)菌株vP試驗陽性,MR試驗陰性。一般可利用檸檬酸鹽和丙二酸鹽作為惟的碳源和能源。不從硫代硫酸鹽產(chǎn)生H2S。多數(shù)菌株可將明膠緩慢液化,不產(chǎn)生脫氧核糖核酸酶。最適生長溫度為30℃,多數(shù)臨床菌株在37℃生長,有些環(huán)境菌株37℃時生化反應(yīng)不穩(wěn)定。廣泛分布于自然界,普遍存在于人和動物中。DNA的G+Cmol%為5260(Bd)。種間和相近屬的鑒別見表3-11。模式種;陰溝腸桿菌(Enterobactercloacea),臨床致病種為阪崎腸桿菌,陰溝腸桿菌和產(chǎn)氣腸桿菌腸桿菌屬簡介41腸桿菌分類腸桿菌科溝腸桿菌(Enterobactercloacea埃希氏屬愛德華氏菌屬產(chǎn)氣腸桿菌檸檬酸桿菌屬Enterobacteraerogenes沙門氏菌屬志賀氏菌屬克雷伯氏菌屬腸桿茵屬腸桿菌屬阪崎腸桿菌Enterobactersakazakii)哈夫尼菌屬Cronobactersakazakii)沙雷氏菌屬變形桿菌屬耶爾森氏菌屬其他6個種歐文氏菌屬克羅諾桿菌屬其他種腸桿菌分類42腸桿菌科cloacae腸桿菌屬克羅諾桿菌屬其他屬aeroagglomeransasburlaecancerogenoussakazakiicowanmalonaticusgergoviaemuytjensIdublinensisintermediusuniversalisludwigiigenospeciesprints腸桿菌科43阪崎腸桿菌(ES)簡介阪崎腸桿菌(又稱阪崎氏腸桿菌)是腸桿菌科的一種,1980年由黃色陰溝腸桿菌更名為阪崎腸桿菌。阪崎腸桿菌能引起嚴(yán)重的新生兒腦膜炎、小腸結(jié)腸炎和菌血癥死亡率高達(dá)50%以上。目前,微生物學(xué)家尚不清楚阪崎腸杄菌的污染來源,但許多「病例報告表明嬰兒配方粉是目前發(fā)現(xiàn)的主要感染渠道阪崎腸桿菌(ES)簡介44陰溝腸桿菌(EC)簡介陰溝腸桿菌(Enterobactercloacae)廣泛存在于自然界中,在人和動物的糞便水、泥土、植物中均可檢出,它是腸道正常菌種之一,但可作為條件致病菌隨著頭孢菌素的廣泛使用陰溝腸桿菌已成為醫(yī)院感染越來越重要的病原菌,其引起的疾病,常累及多個器官系統(tǒng),包括皮膚軟組織感染、泌尿道感染、呼吸道感染以及敗血癥等,由于陰溝腸桿菌能產(chǎn)生超廣譜β內(nèi)酰胺酶(extended-spectrumβ-1actamases,ESBLS)和AmpC,耐藥情況嚴(yán)重,給臨床治療帶來了新的挑戰(zhàn)。陰溝腸桿菌(EC)簡介45產(chǎn)氣腸桿菌(EA)簡介產(chǎn)氣腸桿菌(Enterobacteraerogenes),屬于腸桿菌科(Enterobacteriaceae),腸產(chǎn)氣桿菌屬(Enterobacter)。革蘭氏陰性菌,兼性厭氧生物。曾在1963年和一些現(xiàn)屬于Enterobacter的菌類被歸類為Paracolobactrumaerogenoides。在希臘字中,aer代表“空氣”,gennin代表“產(chǎn)生”,所以其種名aerogenes代表著“產(chǎn)氣”的意,產(chǎn)氣腸桿菌呈棒狀菌體大小約為長1.2-3.0μm、寬0.6-1.0μm,為革氏陰性的兼性厭氧桿菌。不產(chǎn)孢子且具有小的莢膜。其有周鞭毛,可以活動。主要生存于人類和動物的腸道,為人體內(nèi)的正常菌相,只有在人體虛弱的特殊情況下才偶爾引起疾病。亦生存于水、土壤及腐敗物中產(chǎn)氣腸桿菌(EA)簡介46腸桿菌種屬鑒定常用靶點基因名生理擴增片段大靶微功能小(bp)生物特異性敏感性2.3cfu/assay16S[1-7,28核糖體RNA100.950100%100fg/assay[]ES\EC102to10ITS[8-12核糖體RNA500-600假陽性[9]22cfu/mLI8InpA[9,11,13100-50015,29外膜蛋白A假陽性[9]103CFU/mL[15guA[9,16,17,18]葡萄糖苷酶600100100%0-cfu/mL[17DNA引發(fā)酶dnaG(MMs)(大分子合63×103<100100%7,18,19]成系統(tǒng)操縱fu/mL[7IaE20]α-葡萄糖苷114100%400cfu/mL[201atpD[211ATP合成酶180EC100%unknow亞基腸桿菌種屬鑒定常用靶點47基因名生理擴增片段靶微功能小(bp)生物特異性敏感性RNA區(qū)分rpobi23241Polymerase00各種Cssp100%subunitbeta分DNA促旋酶151l00%unknow亞基B各種(ES)鋅金屬Zpx26,27]350蛋白酶100%180fg/PCRI27I基因名48微生物之腸桿菌課件49微生物之腸桿菌課件50微生物之腸桿菌課件51微生物之腸桿菌課件52微生物之腸桿菌課件53微生物之腸桿菌課件54微生物之腸桿菌課件55微