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文檔簡介
Revman,Stata,Meta-disc在診斷試驗準確性(DTA)系統(tǒng)評價中的應(yīng)用文獻數(shù)據(jù)摘自《ProGRP與NSE對小細胞肺癌診斷價值的meta分析》文中提取數(shù)據(jù)作者國家研究方法盲法研究對象金標準病例數(shù)陽性界值(pg/ml)TPFPFNTNabababababSchneider德國前瞻--連續(xù)病理29829.19.6353818351613229212Stieber德國回顧----病理31438.311.941399444648218183Molina西班牙前瞻--連續(xù)病理802502513411479504161548577Nissan以色列前瞻--連續(xù)病理16248222918612819119113Shibayama日本----連續(xù)病理359497.5744911104065234235Lamy法國回顧是--病理24553171171102429369795Takada日本回顧是連續(xù)病理32633.810.6736322432838203182Yamaguchi日本--是連續(xù)--602508,180796264748469449Sun中國------病理1005016.32519689156058Yang中國------病理1444616.3464091617237265注:表中10個原始研究均使用酶聯(lián)免疫吸附測定法檢測陽性界值;TP=真陽性數(shù);FP=假陽性數(shù);FN=假陰性數(shù);TN=真陰性數(shù)a:ProGRP,b:NSERevman5.2新建診斷試驗準確性(DTA)系統(tǒng)評價模板添加所有納入研究此處對每篇文獻QUADAS2質(zhì)量特征進行描述,以便探討異質(zhì)性來源及作表圖數(shù)據(jù)分析里面添加所要研究的待評價診斷試驗可計算相關(guān)指標(似然比及診斷比值比和單獨在干預(yù)系統(tǒng)評價里面作森林圖)添加分析里面制作SEN和SPE森林圖及SROC曲線,可對數(shù)據(jù)進行重新制定設(shè)置參數(shù)若用戶對上圖窗口中的統(tǒng)計分析顯示的結(jié)果不滿意,可點擊右上角的屬性按鈕);或依次展開樹形目錄分支"DataandAnalyses→Analyses→ProGRP",選中"ProGRP"并單擊右鍵,選擇"Properties…",彈出屬性設(shè)置對話框。在圖對話框中,可對統(tǒng)計指標(General)、SROC圖、森林圖和異質(zhì)性來源的參數(shù)進行設(shè)置,并點擊"Apply"使其生效,見下圖。亞組分析(假如,原文沒做)QUADAS-2偏倚表(圖)制作異質(zhì)性來源在DTA系統(tǒng)評價里面不能直接進行似然比、診斷比值比的森林圖以及各指標漏斗圖制作,但可以改變四個表數(shù)據(jù)模式或直接計算相關(guān)指標,添加入干預(yù)性系統(tǒng)評價模板中進行制作及查看異質(zhì)性、發(fā)表偏倚(漏斗圖)。
Stata12一擬合雙變量混合效應(yīng)模型:midas命令1.計算所有診斷試驗統(tǒng)計學(xué)指標(敏感度、特異度、似然比、診斷比值比等)及異質(zhì)性檢驗統(tǒng)計量:2.繪制敏感度、特異度森林圖:3.繪制ROC曲線圖:4.繪制漏斗圖,識別發(fā)表偏倚:STATISTICALTESTSFORSMALL STUDYEFFECTS/PUBLICATION BIAS5.繪制似然比森林圖:6.繪制診斷比值比森林圖:7.繪制驗前概率、驗后概率圖:驗前概率=患病率,驗后概率=驗前概率*似然比二擬合HSROC模型:metandi命令1.合并統(tǒng)計量命令2.繪制SROC曲線
Meta-disc14表2Meta-Disc軟件的主要功能主要功能說明Describingprimaryresultsandexploringheterogeneity描述原始結(jié)果和探索異質(zhì)性Tabularresults將結(jié)果以表格形式列出Forestplots(sensitivity,specificity,LRs,dOR)以森林圖形式顯示靈敏度、特異度、似然比和診斷比值比ROCplanescatter-plotsROC平面散狀圖Cochran-Q,Chi-Square,Inconsistencyindex判斷研究間異質(zhì)性Filtering/subgroupingcapacities亞組分析ExporingThresholdeffect探討閾值效應(yīng)SpearmancorrelationcoefficientSpearman相關(guān)系數(shù)ROCplaneplotsROC平面圖SROCcurvefitting.Areaunderthecurve(AUC)andQ擬合SROC曲線、計算AUC和Q指數(shù)Meta-regressionanalysis回歸分析,探討異質(zhì)性來源UnivariateandmultivariateMosesandLitteenbergmodel(weightandunweight)(加權(quán)或未加權(quán))單變量及多變量MosesLitteenberg模型Statisticalpollingofindices合并統(tǒng)計量Fixedeffectmodel固定效應(yīng)模型Randomeffectmodel隨機效應(yīng)模型數(shù)據(jù)錄入Meta分析1.探索閾值效應(yīng)2.合并效應(yīng)量、探討異質(zhì)性SummarySpecificityStudy| Spe [95%Conf.Iterval.] TP/(TP+FN)TN/(TN+FP)--------------------------------------------------------------------------------------Schneider| 0.9270.887-0.956 35/51 229/247Stieber| 0.9600.926-0.982 41/87 218/227Molina| 0.8740.845-0.899 134/175 548/627Nissan| 0.9520.898-0.982 29/37 119/125Shibayama| 0.9550.921-0.977 74/114 234/245Lamy| 0.9800.929-0.998 117/146 97/99Takada| 0.9020.856-0.938 73/101 203/225Yamaguchi| 0.9870.973-0.995 80/127 469/475Sun| 0.9090.813-0.966 25/34 60/66Yang| 0.8890.800-0.948 46/63 72/81--------------------------------------------------------------------------------------PooledSpe| 0.9300.920-0.940--------------------------------------------------------------------------------------Heterogeneity
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