第五章(1) PUBMED外文醫(yī)學(xué)期刊文獻(xiàn)檢索

醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)檢索與利用南華大學(xué)圖書館龍穎TELMAIL：1642486074@第五章外文醫(yī)學(xué)期刊文獻(xiàn)檢索學(xué)習(xí)目標(biāo)1、掌握：PubMed、OVID、ElsevierScienceDirect及WebofScience數(shù)據(jù)庫的常用檢索途徑及檢索方法；WebofScience數(shù)據(jù)庫的基本檢索方法及檢索結(jié)果輸出與分析方法。2、熟悉：PubMed、OVID、ElsevierScienceDirect及WebofScience數(shù)據(jù)庫的進(jìn)入方式及檢索界面；PUBMED、OVID、ElsevierScienceDirect及WebofScience數(shù)據(jù)庫的檢索規(guī)則及WebofScience的個(gè)性化服務(wù)。3、了解：PubMed、OVID、ElsevierScienceDirect數(shù)據(jù)庫的檢索結(jié)果的顯示、下載及個(gè)性化服務(wù)等；WebofScience收錄的數(shù)據(jù)庫資源及特色。PubMed概況PubMed功能欄介紹認(rèn)識(shí)PubMed文獻(xiàn)PubMed基本檢索PubMed高級(jí)檢索主題詞MeSH檢索循證及臨床查詢檢索PubMed全文獲取第一節(jié)PubMed一、概述：由美國國立醫(yī)學(xué)圖書館下屬的國家生物技術(shù)信息中心于2000年4月研制開發(fā)的免費(fèi)數(shù)據(jù)庫檢索系統(tǒng)，主要用于生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域研究文獻(xiàn)的檢索。與NCBI所提供的其他數(shù)據(jù)庫，如分子生物學(xué)數(shù)據(jù)庫、PubMedCentral、圖書庫等一樣，PubMed也使用Entrez作為其檢索系統(tǒng)。網(wǎng)址/pubmed/PubMed收錄了超過2400萬篇有關(guān)生物醫(yī)學(xué)的文摘及題錄數(shù)據(jù)，部分文獻(xiàn)可獲取全文。這些記錄絕大部分可回溯至1984年，部分早期文獻(xiàn)可回溯至1865年。主要來自于MEDLINE、生命科學(xué)類期刊及在線電子圖書等，主要涉及生物醫(yī)學(xué)及健康領(lǐng)域，也包含部分生命科學(xué)、行為科學(xué)、化學(xué)科學(xué)及生物工程的內(nèi)容。此外，PubMed還提供進(jìn)入其他相關(guān)網(wǎng)站的鏈接。概況網(wǎng)址：/pubmed或/pubmed或(com;org;net)由美國國立醫(yī)學(xué)圖書館（NationalLibraryofMedicine-NLM）國家生物技術(shù)信息中心（NationalCenterforBiotechnologyInformation-NCBI）向因特網(wǎng)用戶提供免費(fèi)MEDLINE檢索服務(wù)(1997-6-26)收錄70余個(gè)國家4900多種生物醫(yī)學(xué)期刊的題錄與文摘，是世界上最權(quán)威的醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫現(xiàn)有1950年以來的1650多萬篇文獻(xiàn)的記錄(其中MEDLINE記錄1400多萬條)目前每年增加60余萬條文獻(xiàn)記錄在全部記錄中有76%的文獻(xiàn)為英文；在2000年以來的記錄中90%的文獻(xiàn)為英文；收錄中文刊60余種概況/pubmed/使用幫助常用工具更多服務(wù)檢索詞輸入框PubMed記錄唯一識(shí)別號(hào)PMIDPubMed記錄的四種來源1.MEDLINE是PubMed記錄的主要來源，標(biāo)注為[PubMed-indexedforMEDLINE]。2.In-processcitations是系統(tǒng)為加快文獻(xiàn)的報(bào)道速度，將尚未標(biāo)引MeSH主題詞、文獻(xiàn)類型的最新文獻(xiàn)記錄先存入臨時(shí)庫中，待完成加工處理后再轉(zhuǎn)入MEDLINE的記錄，標(biāo)注為[PubMed-inProcess]。3.Publishersuppliedcitation是PubMed接受出版商提供的非生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)（MEDLINE不收錄）的電子期刊文獻(xiàn)記錄，標(biāo)注為[PubMed-assuppliedbypublisher]。4.OLDMEDLINE是PubMed中部分1966年以前出版且未被MEDLINE收錄的文獻(xiàn)記錄，標(biāo)注為[PubMed-OLDMEDLINE]。

近年來，越來越多的出版社通過電子期刊平臺(tái)發(fā)布最新的文獻(xiàn)信息，先于印刷版期刊發(fā)表的電子期刊文獻(xiàn)標(biāo)注為[Epubaheadofprint]。MEDLINE與PubMed的區(qū)別PubMed是一個(gè)免費(fèi)的搜索引擎，由NLM所屬的國家生物技術(shù)信息中心（NCBI）于2000年4月開發(fā).基于WEB的生物醫(yī)學(xué)信息檢索系統(tǒng)（http:///pubmed/），提供生物醫(yī)學(xué)方面的論文搜尋以及摘要。它的數(shù)據(jù)庫來源有：MEDLINE、OLDMEDLINE、Recordinprocess、Recordsuppliedbypublisher等，數(shù)據(jù)類型：期刊論文、綜述以及與其他數(shù)據(jù)庫鏈接。PubMed的資訊并不包括期刊論文的全文，但可能提供指向全文提供者（付費(fèi)或免費(fèi)）的連結(jié)。MEDLINE是一個(gè)數(shù)據(jù)庫，是美國國立醫(yī)學(xué)圖書館（TheNationalLibraryofMedicine，NLM）創(chuàng)建的國際性綜合生物醫(yī)學(xué)信息書目數(shù)據(jù)庫，是當(dāng)前國際上最權(quán)威的生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫。內(nèi)容包括美國《醫(yī)學(xué)索引》（IndexMedicus，IM）的全部內(nèi)容和《牙科文獻(xiàn)索引》（IndextoDentalLiterature）、《國際護(hù)理索引》（InternationalNursingIndex）的部分內(nèi)容，涉及基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、臨床醫(yī)學(xué)、環(huán)境醫(yī)學(xué)、營養(yǎng)衛(wèi)生、職業(yè)病學(xué)、衛(wèi)生管理、醫(yī)療保健、微生物、藥學(xué)、社會(huì)醫(yī)學(xué)等領(lǐng)域。MEDLINE收錄1966年以來世界70多個(gè)國家和地區(qū)出版的4000余種生物醫(yī)學(xué)期刊的文獻(xiàn)，近1400萬條記錄。目前每年遞增30-35萬條記錄，以題錄和文摘形式進(jìn)行報(bào)道，其中75%是英文文獻(xiàn)，70%-80%文獻(xiàn)有英文文摘。[PubMed-assuppliedbypublisher][PubMed-inProcess][PubMed-indexedforMEDLINE]另：[PubMed]認(rèn)識(shí)PubMed文獻(xiàn)出處SO篇名TI作者AU文獻(xiàn)類型(狀態(tài))Summary認(rèn)識(shí)PubMed文獻(xiàn)調(diào)整顯示設(shè)置可改變顯示模式，顯示數(shù)量及檢索結(jié)果排序顯示設(shè)置顯示摘要顯示數(shù)量排序模式認(rèn)識(shí)PubMed文獻(xiàn)在摘要顯示模式下可以看到詳細(xì)的文獻(xiàn)信息作者地址文獻(xiàn)摘要文獻(xiàn)作者文獻(xiàn)篇名全文鏈接文獻(xiàn)類型文獻(xiàn)主題詞認(rèn)識(shí)PubMed文獻(xiàn)出版社上傳PreMedlinePubMedMedlinePubMed數(shù)據(jù)庫收錄的文獻(xiàn)的狀態(tài)，主要為Medline認(rèn)識(shí)PubMed文獻(xiàn)非英文的文獻(xiàn)篇名上有中括號(hào)[]且注明有語種英文文獻(xiàn)土耳其語[篇名]英文文獻(xiàn)認(rèn)識(shí)PubMed文獻(xiàn)電子優(yōu)先即最新文獻(xiàn)，一般比印刷出版提前三個(gè)月以上電子優(yōu)先2009年5月2008年9月（一）PubMed基本檢索

1.自動(dòng)詞語匹配檢索

在檢索框中鍵入一個(gè)或多個(gè)英文單詞（大寫或小寫均可），點(diǎn)擊GO按鈕，PubMed系統(tǒng)會(huì)自動(dòng)在主題詞表，期刊名表，短語表及作者索引中查詢與輸入的詞相匹配的形式，這就是它特有的“自動(dòng)詞匯匹配功能”。例如：檢索腫瘤(cancer)方面的文章。在檢索框中輸入：“cancer”，再點(diǎn)擊“Go”按鈕。PubMed將自動(dòng)地利用它的“自動(dòng)詞匯匹配”功能將重要的詞語結(jié)合在一起，并將不規(guī)范的詞語轉(zhuǎn)換成MeSH詞表中規(guī)范的用詞進(jìn)行檢索，比如，檢索“cancer”將自動(dòng)轉(zhuǎn)換為："neoplasms"[MeSHTerms]OR"neoplasms"[AllFields]OR"cancer"[AllFields]自由詞檢索時(shí)PubMed自動(dòng)將不規(guī)范的詞轉(zhuǎn)換成規(guī)范的詞進(jìn)行檢索自動(dòng)詞匯轉(zhuǎn)換PubMed基本檢索PubMed基本檢索布爾邏輯組合檢索，常用的邏輯關(guān)系詞有AND，OR，NOT等ABAB

邏輯與（AND）--檢出記錄中同時(shí)含有檢索詞A和檢索詞B.如：AANDB

邏輯非（NOT）--在含檢索詞A的記錄中，去掉含檢索詞B的記錄。如：ANOTB

邏輯或（OR）--檢出記錄中含有檢索詞A或檢索詞B或同時(shí)含有檢索詞A和B的文獻(xiàn)。如：AORBAB布爾邏輯檢索PubMed基本檢索

2.

著者檢索按照姓+名縮寫（不用標(biāo)點(diǎn)）的格式鍵入作者姓名，如：smithja或jonesk,系統(tǒng)會(huì)自動(dòng)在作者字段內(nèi)進(jìn)行檢索。姓名第一個(gè)字母可用大寫也可用小寫，姓前名后,姓用全稱，名字一般用縮寫。考慮到作者姓名的不同形式，PubMed采用自動(dòng)轉(zhuǎn)換功能進(jìn)行作者姓名檢索，如：smithj將檢索成smithja,smithjb,smithjr等。精確檢索：可以用雙引號(hào)將作者名引起來，再加作者字段限定[AU]，如："smithj"[au]，這樣可避免PubMed自動(dòng)轉(zhuǎn)換，實(shí)現(xiàn)精確查找。PubMed基本檢索作者姓名檢索按照姓(全寫)+名(縮寫)，之間不用標(biāo)點(diǎn)鍵入作者姓名smithjPubMed基本檢索精確檢索避免PubMed自動(dòng)詞匯轉(zhuǎn)換，實(shí)現(xiàn)精確查找"smithj"[au]PubMed基本檢索3.期刊檢索在檢索框中鍵入期刊名，如：molecularbiologyofthecell，系統(tǒng)的“自動(dòng)詞語匹配”功能會(huì)將它轉(zhuǎn)換成molbiolcell[journal]進(jìn)行檢索。也可以直接輸入Medline的期刊標(biāo)準(zhǔn)縮寫形式，如：molbiolcell，或者是輸入刊物的ISSN（國際標(biāo)準(zhǔn)出版物代碼）進(jìn)行檢索，如：1059-1524。如果一個(gè)雜志名恰好是主題詞或關(guān)鍵詞，如：cancer，science，cell等，PubMed會(huì)首先將這些詞轉(zhuǎn)換成MeSH詞表中的主題詞進(jìn)行檢索。因此，需要將檢索請求進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化處理，即在雜志名后面加[TA]。如："cell"[ta]PubMed基本檢索期刊的一般檢索，是在檢索輸入框中鍵入期刊名或期刊的ISSN號(hào)EurJImmunolPubMed基本檢索期刊的標(biāo)準(zhǔn)檢索，是在期刊名后面加字段限定[TA].比如:"cell"[ta]"cell"[ta]PubMed基本檢索

期刊數(shù)據(jù)庫（journaldatabase)期刊數(shù)據(jù)庫的作用：1、可以查看期刊的詳細(xì)信息，包括出版國家，出版社，出版語言，期刊類目等等；2、可以根據(jù)期刊的主題分類，查看medline收錄的各學(xué)科的期刊，比如查看medline收錄的關(guān)于麻醉學(xué)(Anesthesiology)方面的期刊；2、方便檢索某本期刊上被PubMed收錄的所有文章。比如：我們想知道期刊AcadPediatr的全稱以及具體的出版社，以方便投稿，如何查？操作方法：點(diǎn)擊導(dǎo)航欄上的Journaldatabase，打開期刊數(shù)據(jù)庫檢索界面，在檢索框中輸入AcadPediatr，再點(diǎn)擊Go按鈕即可。PubMed基本檢索期刊數(shù)據(jù)庫在PubMed首頁導(dǎo)航欄的右下角部分期刊數(shù)據(jù)庫AcadPediatrJournaldatabase:AcadPediatrPubMed基本檢索期刊數(shù)據(jù)庫可以查看指定期刊的詳細(xì)信息Elsevier出版期刊數(shù)據(jù)庫PubMed基本檢索按期刊主題瀏覽medline收錄的各學(xué)科的期刊期刊主題期刊數(shù)據(jù)庫PubMed基本檢索按字母順序?yàn)g覽medline收錄的各學(xué)科期刊麻醉學(xué)方面PubMed基本檢索期刊數(shù)據(jù)庫可以方便的查看medline收錄的各學(xué)科方面的期刊medline收錄的麻醉學(xué)方面的期刊PubMed基本檢索4.短語精確檢索PubMed允許使用雙引號(hào)來強(qiáng)制系統(tǒng)進(jìn)行短語檢索。如：在PubMed主頁的檢索提問框中鍵入“singlecell”，并用雙引號(hào)引起來。點(diǎn)擊“GO”按鈕，系統(tǒng)會(huì)將其作為一個(gè)不可分割的詞組在數(shù)據(jù)庫的全部字段中進(jìn)行檢索。如果不使用雙引號(hào)進(jìn)行強(qiáng)制檢索，系統(tǒng)就會(huì)將其分成2個(gè)詞：single和cell檢索，其檢索表達(dá)式為：singleANDcell.很明顯這樣的檢索結(jié)果是不符號(hào)要求的。PubMed基本檢索強(qiáng)制檢索普通檢索"singlecell"singlecellPubMed基本檢索

5.截詞檢索截詞檢索的作用：擴(kuò)大檢索范圍，提高查全率。截詞符：用*表示，代表多個(gè)字符，將*加在檢索詞后可以表示對所有以該詞開頭的詞進(jìn)行檢索。如：bacter*，可以檢出bacter，bacteria，bacterium，bacteriophage，等最多600個(gè)單詞。PubMed基本檢索截詞檢索可以擴(kuò)大檢索范圍提高查全率。bacter*[TI]PubMed基本檢索

6.字段限定檢索采用字段限制方式進(jìn)行檢索，其規(guī)則是：檢索詞1[字段標(biāo)識(shí)]邏輯運(yùn)算符檢索詞2[字段標(biāo)識(shí)]如：查找作者為crick在1993年發(fā)表的有關(guān)DNA方面的文獻(xiàn).檢索式：DNA[mh]ANDcrick[au]AND1993[dp]PubMed基本檢索字段限制檢索其規(guī)則是：檢索詞+[字段標(biāo)識(shí)]

DNA[mh]ANDcrick[au]AND1993[dp]PubMed基本檢索常用檢索字段描述和標(biāo)識(shí)Title[ti]：篇名字段Abstract[ab]：摘要字段Affiliation[ad]：著者地址字段。Authorname[au]：文章的作者，檢索格式：姓+名。如："smithja"[au]Journaltitle[ta]：期刊名稱。如：cell[ta]Language[la]：論文出版語種。語種檢索時(shí)可只輸入前3個(gè)字母，如：chi[la]=chinese[la]；English[lang]=eng[la]比如：檢索文章題目中含有高血壓的中文文獻(xiàn)檢索式:hypertension[ti]ANDchi[la]PubMed基本檢索hypertension[ti]ANDchi[la]檢索文章題目中含有高血壓的中文文獻(xiàn)PubMed基本檢索常用檢索字段描述和標(biāo)識(shí)Publicationdate[dp]:出版日期指論文所在期刊的出版日期日期檢索的形式為：YYYY/MM/DD[DP]要檢索一段時(shí)期內(nèi)的文章，日期之間可以加冒號(hào)，如：1993/01:1995/06[DP]Publicationtype[pt]:出版類型。有綜述，新聞，傳記，臨床試驗(yàn)等。如：review[pt]MeSHterms[mh]：主題詞字段。如：hypertension[mh]Subheadings[sh]:副主題詞。與主題詞組配檢索.比如：檢索1995年到1996年出版的關(guān)于高血壓方面的綜述性文獻(xiàn)。hypertension[mh]AND1995/01:1996/12[DP]ANDreview[pt]PubMed基本檢索檢索1995年到1996年出版的關(guān)于高血壓方面的綜述性文獻(xiàn)hypertension[mh]AND1995/01:1996/12[DP]ANDreview[pt]（二）PubMed高級(jí)檢索高級(jí)檢索PubMed高級(jí)檢索預(yù)覽明細(xì)欄檢索史高級(jí)檢索界面下可以看到明細(xì)欄，預(yù)覽，檢索史，限定和組合檢索等姚開泰院士2001年以來被Medline收錄的文獻(xiàn)PubMed高級(jí)檢索限定檢索范圍為發(fā)表在臨床核心期刊上的有全文鏈接的英文文獻(xiàn)有全文鏈接臨床核心期刊限定為英文Limit限定檢索范圍限定為循證文獻(xiàn)及被Medline正式收錄的中老年病例PubMed高級(jí)檢索Limit限定限定為循證等文獻(xiàn)限定為中老年限定為medline最新版本：showadditionalfilters主題詞MeSH檢索

《醫(yī)學(xué)主題詞表》數(shù)據(jù)庫(MeSHDatabase)

《醫(yī)學(xué)主題詞表》是對生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)進(jìn)行主題分析、標(biāo)引和檢索的權(quán)威性詞表，它的作用是使醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)的主題標(biāo)引和檢索達(dá)到統(tǒng)一和一致，并指導(dǎo)用戶高質(zhì)量地檢索醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)。它可以指導(dǎo)用戶從同義詞發(fā)現(xiàn)主題詞，告訴用戶主題詞如何使用，顯示主題詞之間的相互關(guān)系。主題詞MeSH檢索

《醫(yī)學(xué)主題詞表》數(shù)據(jù)庫(MeSHDatabase)利用主題詞進(jìn)行檢索方法:1、點(diǎn)擊主頁右下角的MeSHDatabase進(jìn)入主題詞檢索界面；2、輸入檢索詞后，點(diǎn)擊go按鈕，系統(tǒng)將顯示與該詞有關(guān)主題詞；3、點(diǎn)擊該主題詞進(jìn)一步顯示該主題詞的定義、樹狀結(jié)構(gòu)、組配的副主題詞；4、選擇合適的主題詞與副主題詞后，點(diǎn)擊sendto按鈕，進(jìn)入檢索表達(dá)式瀏覽窗口；5、點(diǎn)擊SearchPubMed將顯示檢索結(jié)果。主題詞MeSH檢索主題詞數(shù)據(jù)庫在PubMed首頁導(dǎo)航欄的右下角主題詞數(shù)據(jù)庫主題詞MeSH檢索輸入普通詞查找對應(yīng)主題詞MeSH主題詞檢索可以指導(dǎo)用戶高質(zhì)量地檢索醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)主題詞MeSH檢索一般一個(gè)主題詞還要配合一個(gè)副主題詞進(jìn)行組合檢索選擇副主題詞SearchBoxwithAND主題詞MeSH檢索點(diǎn)Sentto將檢索詞添加到檢索表達(dá)式瀏覽窗口主題詞MeSH檢索SearchPubMed主題詞檢索可以達(dá)到比較滿意的查全率和查準(zhǔn)率主題詞MeSH檢索主題詞檢索是在有主題標(biāo)引的Medline數(shù)據(jù)庫中檢索主題詞檢索結(jié)果主題詞MeSH檢索普通詞不是規(guī)范化的主題詞檢索結(jié)果相關(guān)度低普通詞檢索結(jié)果臨床查詢檢索

“Clinicalqueries”是專門為臨床醫(yī)生研究設(shè)計(jì)的內(nèi)置的臨床方法學(xué)“過濾器”（ClinicalMethodologyFilters），這組檢索策略模型是由加拿大臨床流行病學(xué)和生物統(tǒng)計(jì)學(xué)研究人員HaynesRB等人在1994年提出來的，并進(jìn)行了查全率和查準(zhǔn)率分析。用戶通過這一臨床方法學(xué)檢索過濾器，不需掌握復(fù)雜的檢索策略，即可檢索所需的臨床研究文獻(xiàn)。臨床查詢檢索

使用方法:1、點(diǎn)擊主頁左側(cè)導(dǎo)