數(shù)量遺傳學(xué)基礎(chǔ)精品ppt課件

2023/3/11第一節(jié)數(shù)量性狀的遺傳特征2023/3/12動物性狀的分類質(zhì)量性狀：可心明確區(qū)分為若干類。如毛色，角的有無數(shù)量性狀：變異是連續(xù)的，無法用形容詞描述，只能通過度量。如產(chǎn)奶量，生長速度，體重，羊毛的粗細(xì)等。多基因：限制某個(gè)數(shù)量性狀一組基因的一個(gè)基因。多基因性狀：由很多基因相互作用限制的性狀，其表型變異為連續(xù)數(shù)量。2023/3/13Shull(1908)玉米：純系的變異比遠(yuǎn)交群小得多。利用今日的遺傳學(xué)說明：一般玉米的基因型很困難，自交可以產(chǎn)生純合基因型個(gè)體，因此，近交系的變異很低2023/3/14Nilsson-Ehle(1909)探討谷類作物F2多數(shù)性狀符合3:1個(gè)別64:1，AaBbCc,(1/2)6=1/64結(jié)論：有性繁殖可以產(chǎn)生大量的基因型。10個(gè)座位可以產(chǎn)生31060,000種基因型新的類型不是新的突變，而是由于稀有基因分別造成的（返祖）。2023/3/15Johannsen和PayneJohannsen(1903,1909)，純系的變異不行遺傳環(huán)境因素可引起數(shù)量性狀的變異提出基因型和表型的概念Payne(1918)：果蠅剛毛數(shù)可以超過基礎(chǔ)群最極端的表型很多動物和植物也有這樣的現(xiàn)象選擇可以使有利等位基因頻率提高2023/3/16數(shù)量性狀的多基因假說假定數(shù)量性狀是由很多（effectivelyinfinite）效應(yīng)無限小（infinitesimalsmall）的基因（多基因multiplegenesorpolygenes）限制，這些基因每個(gè)在不同的染色體上，每個(gè)基因產(chǎn)生一個(gè)單獨(dú)的作用。2023/3/17數(shù)量性狀表型值的剖分P=G+E，E=0P=A+D+I+ER=D+I+E，P=A+R2023/3/18其次節(jié)通徑分析PathAnalysisWright(1921)2023/3/19通徑分析利用兩者之間的緣由，分析兩種變量相互關(guān)系的方法。起初只是應(yīng)用于分析影響小型哺乳動物骨骼變異的一般因素和特定生長因子。后來推廣到很多方面：遺傳學(xué)，農(nóng)業(yè)經(jīng)濟(jì)學(xué)，生理學(xué)，生態(tài)學(xué)等。動物育種主要用來估計(jì)相關(guān)程度和計(jì)算近交系數(shù)。目的：變量之間相互因果關(guān)系確定下來后，就可以估計(jì)引起方差協(xié)方差來源（緣由）的相對大小。2023/3/110概念兩個(gè)變量間的關(guān)系:因果關(guān)系:單箭頭線，方向由因到果，稱為通徑線平行關(guān)系:雙箭頭線，稱為相關(guān)線每條線的相對重要性稱為系數(shù)通徑線的系數(shù)稱為通徑系數(shù)相關(guān)線的系數(shù)稱為相關(guān)系數(shù)2023/3/111概念豬的屠宰體重（Y），由一長速度（X1）和4月齡體重（X2）確定，而它們又是由飼養(yǎng)條件（X3）確定。右圖省略X32023/3/112概念通徑系數(shù)就是標(biāo)準(zhǔn)化的回來系數(shù)，多數(shù)狀況下，為標(biāo)準(zhǔn)化的偏回來系數(shù)。通徑系數(shù)下標(biāo)中依變量在前，自變量在后，二者用點(diǎn)分開。留意通徑系數(shù)沒有單位。只有兩個(gè)變量時(shí)，通徑系數(shù)等于相關(guān)系數(shù)。2023/3/113通徑系數(shù)的性質(zhì)（一）性質(zhì)一（獨(dú)立緣由）dy.x1+dy.x2=1Py.x1=ry.x1,Py.x2=ry.x2假如緣由不完全，則確定系數(shù)之和小于１2023/3/114通徑系數(shù)的性質(zhì)（一）第13張幻燈片2023/3/115通徑系數(shù)的性質(zhì)（一）2023/3/116通徑系數(shù)的性質(zhì)（一）依據(jù)方差剖分原理：2023/3/117通徑系數(shù)的性質(zhì)（二）性質(zhì)二（間接緣由）Py.X3=Py.x1Px1.x3,Py.x4=Py.x1Px1.x4dy.x1=dy.x3+dy.x42023/3/118通徑系數(shù)的性質(zhì)（二）由性質(zhì)1（II）:2023/3/119通徑系數(shù)的性質(zhì)（三）2023/3/120通徑系數(shù)的性質(zhì)（三）共同緣由ry1y2=P2P2（左）ry1y2=rx2x3P2P3（中）ry1y2=P2P2+P3P3（右）2023/3/121通徑系數(shù)的性質(zhì)（四）ryx1=P1+r12P2+r13P3dy.x1+dy.x2+dy.x3=12023/3/122通徑系數(shù)的性質(zhì)（五）ry1y2=P2

P2+P3

P3+P2

r23

P3+P3

r23

P22023/3/123三、通徑鏈的追溯規(guī)則通徑方向，只能“先退后進(jìn)”一條通徑鏈最多只能變更一次方向通過一條相關(guān)線等于一次方向變更鄰近通徑必需以尾端與相關(guān)線相接一條通徑鏈內(nèi)至多只能有一條相關(guān)線不同的通徑鏈可以重復(fù)通過同一條相關(guān)線在追溯兩個(gè)結(jié)果的通徑鏈時(shí)要避開重復(fù)和遺漏。2023/3/124第三節(jié)重復(fù)力2023/3/125概念重復(fù)力指的是家畜個(gè)體由一性狀多次度量值之間相關(guān)程度的度量。時(shí)間上：豬產(chǎn)仔數(shù)，奶牛的產(chǎn)奶量，綿羊的產(chǎn)毛量，蛋雞的產(chǎn)蛋數(shù)?？臻g上：果蠅翅長，作物種子的蛋白質(zhì)含量。2023/3/126概念度量次數(shù)一般不只2次，因此可以用組內(nèi)相關(guān)系數(shù)來度量。個(gè)體間變異越大，個(gè)體內(nèi)變異越小，說明重復(fù)力越高2023/3/127概念一般環(huán)境方差：指的是時(shí)間上許久的或者空間上非局部的條件所造成的環(huán)境方差，它是個(gè)體方差的一部分。母畜泌乳量的凹凸對仔畜生長的影響特殊環(huán)境方差：短暫的或者局部條件所造成的環(huán)境方差，也就是個(gè)體內(nèi)度量間的方差。某一年草地的好壞對羊毛生長的影響VE=VEg+VEs,VB=VG+VEg,VW=VEs2023/3/128重復(fù)力的估計(jì)方法以個(gè)體分組，以個(gè)體的各次度量值為組內(nèi)視察值，接受單因素方差分析法，所得的組內(nèi)相關(guān)系數(shù)即是重復(fù)力。2023/3/129例題母豬號胎次Kxx21234567891011621211211618857412062252101517132021231716201017230984584111431111915774874372066212722412617123192123192091402570241081112131314181881071511240241618191917196199137236543649521815365266851981319201481313710015282408715161416111720239139232124415181517241715211786111732983358151420151216218961013620682226121919182411151581332337合計(jì)101144923601小梅山母豬產(chǎn)仔數(shù)記錄2023/3/130例題2023/3/131例題2023/3/132例題變異來源自由度平方和均方期望均方母豬間12621.663351.8053母豬內(nèi)882191.208024.9001總和1012812.7813小梅山母豬產(chǎn)仔數(shù)方差分析表2023/3/133例題2023/3/134重復(fù)力的用途推斷遺傳力估計(jì)是否正確重復(fù)力為遺傳力的上限確定須要重復(fù)度量的次數(shù)2023/3/135重復(fù)力的用途度量n次所能達(dá)到的精確度2023/3/136重復(fù)力的用途畜禽可能生產(chǎn)力(MPPA)2023/3/137重復(fù)力的用途多次度量育種值的估計(jì)2023/3/138第四節(jié)遺傳力2023/3/139概念廣義遺傳力：H2=VG/VP狹義遺傳力：h2=VA/VP實(shí)現(xiàn)遺傳力：子代平均值種畜平均值全群平均值2023/3/140概念：遺傳力的幾種表述遺傳力是育種值對表型值的確定系數(shù)h2=dP.A=VA/VP遺傳力是育種值對表型值的回來系數(shù)遺傳力是育種值和表型值的相關(guān)系數(shù)2023/3/141遺傳力估計(jì)的原理和方法遺傳力估計(jì)的原理2023/3/142遺傳力估計(jì)的原理和方法一、公畜內(nèi)女母回來或相關(guān)法:2023/3/143遺傳力估計(jì)的原理和方法公畜內(nèi)女母回來整理資料，以女兒的成果為y，母親的成果為x；分別計(jì)算各公畜組的SSX,SSY,SPXY；將各公畜組的平方和及乘積和分別相加，得到公畜內(nèi)平方和及乘積和SSX(S)=SSX,SSY(S)=SSY,SPXY(S)=SPXY計(jì)算公畜內(nèi)女母回來和遺傳力bDM(S)=bYX(S)=SPXY(S)/SSX(S),h2=2bDM(S)2023/3/144遺傳力估計(jì)的原理和方法二、半同胞相關(guān)組內(nèi)相關(guān)系數(shù):單因素方差分析；系統(tǒng)分組留意當(dāng)各組半同胞數(shù)量不同時(shí)的計(jì)算2023/3/145遺傳力估計(jì)的原理和方法留意當(dāng)各組半同胞數(shù)量不同時(shí)的計(jì)算2023/3/146遺傳力估計(jì)的原理和方法三、全同胞相關(guān)（系統(tǒng)分組方差分析）理論上相等，事實(shí)上不相等。當(dāng)這三個(gè)估計(jì)值相差太大時(shí)，應(yīng)當(dāng)補(bǔ)充資料，重新估計(jì)2023/3/147遺傳力估計(jì)的原理和方法三、全同胞相關(guān)（系統(tǒng)分組方差分析）2023/3/148遺傳力估計(jì)的原理和方法三、全同胞相關(guān)（系統(tǒng)分組方差分析）2023/3/149遺傳力的顯著性檢驗(yàn)當(dāng)接受公畜內(nèi)女母回來當(dāng)接受半同胞相關(guān)2023/3/150遺傳力的顯著性檢驗(yàn)當(dāng)接受全同胞相關(guān)2023/3/151提高遺傳力估計(jì)精確度的方法女母回來法:半同胞相關(guān)法:n＝最宜家經(jīng)含量，Ｓ＝公畜數(shù)，dfS=最小公畜自由度2023/3/152第五節(jié)遺傳相關(guān)2023/3/153概念表型相關(guān)：表型值間的相關(guān)環(huán)境相關(guān)：家畜在發(fā)育過程中受共同環(huán)境影響而產(chǎn)生的相關(guān)遺傳相關(guān)：性狀育種值間的相關(guān)基因的多效基因座位之間的連鎖選擇造成的基因座位之間的連鎖不平衡2023/3/154性狀間的相關(guān)及其剖分2023/3/155遺傳相關(guān)估計(jì)（一）親子協(xié)方差法2023/3/1