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關(guān)于分子遺傳學(xué)常見試題第1頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋1.AP位點(diǎn)各種細(xì)胞中都有一種核酸內(nèi)切酶,它附著在自發(fā)丟失了單個(gè)嘌呤或嘧啶的位點(diǎn)上,這個(gè)無(wú)嘌呤(apurinic)和無(wú)嘧啶(apyrimidinic)位點(diǎn)就叫做AP位點(diǎn)2.互補(bǔ)作用是指若兩個(gè)突變位點(diǎn)分別位于兩個(gè)基因,它們可相互補(bǔ)充,表現(xiàn)野生型,若兩個(gè)突變位點(diǎn)在一個(gè)基因內(nèi),不能互補(bǔ)。3.Contig構(gòu)建目的基因區(qū)域跨疊克隆群(contig)。以陽(yáng)性克隆的末端作為探針基因組文庫(kù),并進(jìn)行染色體步行,直到獲得具有目標(biāo)基因兩側(cè)分子標(biāo)記的大片段跨疊群。4.Cot1/2(半變Cot值):反應(yīng)完成一半時(shí)所需的Cot值,它直接與復(fù)性DNA成正比。5.C值悖理生物基因組的大小同生物在進(jìn)化上所處的地位及復(fù)雜性之間無(wú)嚴(yán)格的對(duì)應(yīng)關(guān)系,這種現(xiàn)象稱為C值悖理。2第2頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋6.D-loop線粒體DNA上的一個(gè)區(qū)域,其上一小段RNA與DNA的一條鏈配對(duì),使DNA原始配對(duì)鏈在此區(qū)域閑置。也用來(lái)描述在RecA蛋白質(zhì)催化的反應(yīng)中單鏈“入侵者”的進(jìn)入,使雙鏈DNA中的一條被閑置。7.DNA指紋圖FingerprintofDNA(DNA指紋圖譜):指不同基因組間的不同多形態(tài)限制性片段模式。通過(guò)用限制性內(nèi)切酶消化和與特異的核酸探針雜交取得不同大小的DNA片段的多點(diǎn)區(qū)帶圖譜,并經(jīng)與另一個(gè)體的DNA圖譜比較以評(píng)價(jià)其相似性的技術(shù)。對(duì)多點(diǎn)帶圖譜中個(gè)體的特異性進(jìn)行評(píng)價(jià)的方法被稱為“DNA指紋圖譜法”。該法是根據(jù)沒有兩個(gè)無(wú)親緣關(guān)系的個(gè)體在同一位置上共有同相同的區(qū)帶圖譜的機(jī)率極低,所以DNA指紋圖被認(rèn)為對(duì)某一個(gè)體是獨(dú)特的。這種技術(shù)已廣泛地應(yīng)用與法醫(yī)和親子鑒定。3第3頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋8.FootprintingDNA足跡法:是確定DNA分子中與蛋白質(zhì)結(jié)合的核苷酸序列的一種方法。DNA與蛋白質(zhì)結(jié)合的部位不能被內(nèi)切酶作用,故而DNA分子經(jīng)酶切作用后遺留下該片斷(亦稱“足跡”),進(jìn)而可以確定它的序列。9.exonshuffling外顯子改組:來(lái)源于不同基因的兩個(gè)或多個(gè)外顯子異位性地被組合在一起,或是一個(gè)相同的外顯子通過(guò)復(fù)制創(chuàng)造了一個(gè)新的外顯子-內(nèi)含子結(jié)構(gòu)。目前已知有兩種機(jī)制可以導(dǎo)致外顯子的異位重組(ectopicrecombination):非常規(guī)重組(illegitimaterecombination)和逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座的外顯子插入。有基因組的數(shù)據(jù)表明,外顯子洗牌,也就是通常說(shuō)的結(jié)構(gòu)域洗牌,經(jīng)常重組編碼各種蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域的序列從而創(chuàng)造新的嵌合蛋白質(zhì)(chimericprotein)。)4第4頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋10.Fish熒光原位雜交技術(shù),是一種利用非放射性的熒光信號(hào)對(duì)原位雜交樣本進(jìn)行檢測(cè)的技術(shù)。它將熒光信號(hào)的高靈敏度、安全性,熒光信號(hào)的直觀性和原位雜交的高準(zhǔn)確性結(jié)合起來(lái),通過(guò)熒光標(biāo)記的DNA探針與待測(cè)樣本的DNA進(jìn)行原位雜交,在熒光顯微鏡下對(duì)熒光信號(hào)進(jìn)行辨別和計(jì)數(shù),從而對(duì)染色體或基因異常的細(xì)胞、組織樣本進(jìn)行檢測(cè)和診斷,為各種基因相關(guān)疾病的分型、預(yù)前和預(yù)后提供準(zhǔn)確的依據(jù)。11.Genecluster:(基因簇)一組相同或者相似的基因。12.Geneknockout基因敲除,是指對(duì)一個(gè)結(jié)構(gòu)已知但功能未知的基因,從分子水平上設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn),將該基因去除,或用其它順序相近基因取代,然后從整體觀察實(shí)驗(yàn)動(dòng)物,推測(cè)相應(yīng)基因的功能。這與早期生理學(xué)研究中常用的切除部分-觀察整體-推測(cè)功能的三部曲思想相似?;蚯贸芍兄鼓骋换虻谋磉_(dá)外,還包括引入新基因及引入定點(diǎn)突變。既可以是用突變基因或其它基因敲除相應(yīng)的正?;?,也可以用正常基因敲除相應(yīng)的突變基因。5第5頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋13.Genomeimprinting:基因組印跡,是指在配子或合子發(fā)生期間,來(lái)自親本的等位基因或染色體在發(fā)育過(guò)程中產(chǎn)生專一性的加工修飾,導(dǎo)致后代體細(xì)胞中兩個(gè)親本來(lái)源的等位基因有不同的表達(dá)活性,為一種后生論修飾。目前在人類和小鼠中鑒定的印跡基因已超過(guò)25個(gè),它們具有一些共同的特點(diǎn),如印跡基因分布的群集性、復(fù)制的不同步性、表達(dá)的時(shí)空特異性、遺傳的保守性及編碼RNAs等?;蚪M印跡的分子機(jī)理與印跡基因的甲基化尤其是CpG島甲基化密切相關(guān),特異性甲基化區(qū)域在印跡基因的表達(dá)中具有重要作用?;蚪M印跡基因與胎兒和胎盤的生長(zhǎng)發(fā)育及細(xì)胞增殖有關(guān),正常印跡的改變可引起包括腫瘤在內(nèi)的多種遺傳性疾病。14.GT-AG規(guī)律指在核基因內(nèi)含子開始和結(jié)束出現(xiàn)的兩個(gè)固定的脫氧核苷酸。6第6頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋15.miRNA和hnRNAmicroRNA(miRNA)是一類長(zhǎng)度很短的非編碼單鏈小分子RNA,約20-25nt(少數(shù)小于20nt的),由一段具有發(fā)夾環(huán)結(jié)構(gòu)的長(zhǎng)度為70-80nt的單鏈RNA前體(pre-miRNA)剪切后生成。miRNA在各個(gè)物種間具有高度的進(jìn)化保守性,并且在莖部的保守性更強(qiáng),但在環(huán)部可以容許更多的突變位點(diǎn)存在。已經(jīng)找到了數(shù)百種miRNA。大多數(shù)植物miRNA還呈現(xiàn)出組織特異性表達(dá)和發(fā)育階段特異性表達(dá)的特點(diǎn),這種特異性對(duì)miRNA調(diào)控功能的作用有重要意義。microRNA的特點(diǎn)(1)miRNA基因以單拷貝、多拷貝或基因簇(cluster)的形式廣泛存在于真核生物基因組中;(2)大部分位于基因間隔區(qū)(intergenicregion,IGR),也有相當(dāng)一部分位于編碼蛋白基因的內(nèi)含子中;(3)miRNA本身不編碼任何蛋白質(zhì),不具有開放閱讀框架(openreadframe,ORF),具有序列保守性、表達(dá)時(shí)序性和組織特異性,由含有發(fā)夾結(jié)構(gòu)的前體剪切加工而來(lái)。(4)成熟的miRNA5'端帶有磷酸基團(tuán)且多為尿嘧啶核苷酸,3'端帶有羥基,因而miRNA能與大多數(shù)寡核苷酸和功能RNA的降解片段區(qū)分開來(lái)。7第7頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋hnRNA(heterogeneousnuclearRNA系heterogeneousnuclear之縮寫)。核內(nèi)不均一RNA為存在于真核生物細(xì)胞核中的不穩(wěn)定、大小不均的一組高分子RNA(分子量約為105~2×107,沉降系數(shù)約為30~100S)之總稱。占細(xì)胞全部RNA之百分之幾,在核內(nèi)主要存在于核仁的外側(cè)。認(rèn)為hnRNA多屬信使RNA(messengerribonucleicacid,mRNA)之先驅(qū)體,包括各種基因的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物及其成為mRNA前的各中間階段的分子,在5’末端多附有間隙結(jié)構(gòu),而3’的末端附有多聚腺苷酸聚合酶分子。這些hnRNA在受到加工之后,移至細(xì)胞質(zhì),作為mRNA而發(fā)揮其功能。大部分的hnRNA在核內(nèi)與各種特異的蛋白質(zhì)形成復(fù)合體而存在著8第8頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋16.Oncogenes,Proto-oncogenes癌基因原癌基因:一種能夠?qū)е掳┌Y的基因。許多致癌基因都直接或間接地控制細(xì)胞的成長(zhǎng)速度癌基因作為細(xì)胞增殖和腫瘤形成的加速器起作用.編碼的蛋白能夠促進(jìn)細(xì)胞生長(zhǎng)的失控和細(xì)胞向惡性狀態(tài)轉(zhuǎn)化.沒有激活之前,稱之為原癌基因(proto-oncogenes),它們只具有破壞細(xì)胞自身活動(dòng)和將細(xì)胞轉(zhuǎn)變?yōu)閻盒誀顟B(tài)的潛能.腫瘤抑制基因(Tumorsuppressorgenes,TSG)作為細(xì)胞生長(zhǎng)的剎車起作用;編碼蛋白可抑制細(xì)胞的生長(zhǎng),阻止細(xì)胞轉(zhuǎn)變?yōu)閻盒约?xì)胞癌基因可以分成兩大類:一類是病毒癌基因,指反轉(zhuǎn)錄病毒的基因組里帶有可使受病毒感染的宿主細(xì)胞發(fā)生癌變的基因,簡(jiǎn)寫成V-onc;另一類是細(xì)胞癌基因,簡(jiǎn)寫成c-onc,又稱原癌基因(proto-oncogene),這是指正常細(xì)胞基因組中,一旦發(fā)生突變或被異常激活后可使細(xì)胞發(fā)生惡性轉(zhuǎn)化的基因。換言之,在每一個(gè)正常細(xì)胞基因組里都帶有原癌基因,但它不出現(xiàn)致癌活性,只是在發(fā)生突變或被異常激活后才變成具有致癌能力的癌基因。癌基因有時(shí)又被稱為轉(zhuǎn)化基因(transforminggene),因?yàn)橐鸦罨陌┗蚧蚴菑哪[瘤細(xì)胞里分離出來(lái)的癌基因,可將已建株的NIH3T3小鼠成纖維細(xì)胞或其他體外培養(yǎng)的哺乳類細(xì)胞,轉(zhuǎn)化成為具有癌變特征的腫瘤細(xì)胞。癌基因的形成是反映一種功能的獲得(gainoffunction),即細(xì)胞的原癌基因被不適當(dāng)?shù)丶せ詈?,?huì)造成蛋白質(zhì)產(chǎn)物的結(jié)構(gòu)改變,原癌基因出現(xiàn)組成型激活,以及過(guò)量表達(dá)或不能在適當(dāng)?shù)臅r(shí)刻關(guān)閉基因的表達(dá)等。目前已識(shí)別的原癌基因有100多個(gè)。9第9頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋17.Orphangene孤獨(dú)基因:成串重復(fù)序列衍生的單個(gè)分立基因,或是在成簇的基因家族中通過(guò)染色體重排而分散到其他位置上的成員,被稱為孤獨(dú)基因Palindrome回文序列:雙鏈DNA中的一段倒置重復(fù)序列,當(dāng)該序列的雙鏈被打開后,可形成局部“十”字形結(jié)構(gòu)。這段序列被稱為回文序列。Phagedisplay:噬菌體表面展示技術(shù):是一種對(duì)多肽功能非常有效的篩選技術(shù),即將外源蛋白分子或多肽的基因克隆到絲狀噬菌體基因組中,與噬菌體外膜蛋白融合表達(dá),展示在噬菌體顆粒的表面,因此,通過(guò)表型篩選就可以獲得它的編碼基因。應(yīng)用噬菌體表面展示技術(shù)可以從多肽庫(kù)中進(jìn)行快速篩選,從而成為藥物開發(fā)的強(qiáng)有力工具。10第10頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋18.RibozymeandDNAzyme脫氧核酶脫氧核酶(deoxyribozyme)是利用體外分子進(jìn)化技術(shù)合成的一種具有催化功能的單鏈DNA片段,具有高效的催化活性和結(jié)構(gòu)識(shí)別能力。核酶Ribozyme:是一種可以催化RNA切割和RNA剪接反應(yīng)的由RNA組成的酶,可以作為基因表達(dá)和病毒復(fù)制的抑制劑。19.RNA飽和雜交實(shí)驗(yàn)在DNA和RNA雜交時(shí),以少量的單鏈DNA,與大量的RNA進(jìn)行雜交,可以使二者充分結(jié)合,該過(guò)程即叫做~。目的是找到雜交區(qū)段,進(jìn)而確定DNA轉(zhuǎn)錄的位置。20.RNA編輯RNAediting:某些mRNA的核苷酸序列,在生成轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物后還需插入、刪除或取代一些核苷酸殘基,方能生成具有正確翻譯功能的模板,遺傳信息在mRNA水平上的改變過(guò)程,稱為RNA編輯。11第11頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋21.RNA干擾RNAinterference,RNAi:是指在進(jìn)化過(guò)程中高度保守的、由雙鏈RNA(double-strandedRNA,dsRNA)誘發(fā)的、同源mRNA高效特異性降解的現(xiàn)象。RNA干擾是基因轉(zhuǎn)錄后沉默的一種方式,是生物界古老而且進(jìn)化的高度保守的現(xiàn)象之一。22.SAGE基因表達(dá)序列分析(SAGE):是通過(guò)快速和詳細(xì)分析成千上萬(wàn)個(gè)EST(expresssequencedtags)來(lái)尋找出表達(dá)豐富度不同的SAGE標(biāo)簽序列。在此方法中,通過(guò)限制性酶切可以產(chǎn)生非常短的cDNA(10-14bp)標(biāo)簽,并通過(guò)PCR擴(kuò)增和連接,隨后對(duì)連接體進(jìn)行測(cè)序。SAGE大大簡(jiǎn)化和加快了3’端表達(dá)序列標(biāo)簽的收集和測(cè)序。同DD一樣,SAGE是一個(gè)“開放”的系統(tǒng),可以發(fā)現(xiàn)新的未知的序列。在進(jìn)行標(biāo)本的比較之前,SAGE在cDNA的產(chǎn)生和處理上需要較多個(gè)步驟。由于SAGE是一個(gè)依賴DNA測(cè)序的基因計(jì)量方法,它對(duì)基因表達(dá)的測(cè)定比DD更加量化。由于需要進(jìn)行大量的測(cè)序反應(yīng),所以費(fèi)用因素使大多數(shù)研究機(jī)構(gòu)對(duì)其廣泛應(yīng)用的主要限制。

12第12頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋23.SD序列“AGGA”核糖體的識(shí)別位點(diǎn):轉(zhuǎn)錄出的mRNA要進(jìn)入核糖體上進(jìn)行翻譯,需要一段富含嘌呤的核苷酸序列與大腸桿菌16SrRNA3,末端富含嘧啶的序列互補(bǔ),是核糖體的識(shí)別位點(diǎn)?!癆GGA”位于AUG前7~12Nt,與16SrRNA識(shí)別互補(bǔ)。24.shRNA短發(fā)夾RNA,shRNA包括兩個(gè)短反向重復(fù)序列,中間由一莖環(huán)(loop)序列分隔的,組成發(fā)夾結(jié)構(gòu),由polⅢ啟動(dòng)子控制。隨后在連上5-6個(gè)T作為RNA聚合酶Ⅲ的轉(zhuǎn)錄終止子。25.Silencer靜默子:由于有密碼子兼并現(xiàn)象,當(dāng)堿基對(duì)替換后發(fā)生了基因突變,在原位上仍放置同一種氨基酸,表型上未發(fā)生改變。26.SnRNP小分子(核仁)核蛋白體(也可稱核糖核蛋白體或者核糖體)。是在核仁中對(duì)剛轉(zhuǎn)錄出來(lái)的RNA進(jìn)行編輯的核蛋白體。13第13頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋26.Southern-WesternblotDNA和DNA雜交及蛋白質(zhì)分子的定位,從而研究遺傳結(jié)構(gòu)的大小及產(chǎn)生的蛋白質(zhì)分子的作用。27.Super-repressed超阻礙:當(dāng)調(diào)節(jié)基因R突變?yōu)镽S時(shí)產(chǎn)生的阻遏蛋白不被任何物質(zhì)所誘導(dǎo),永遠(yuǎn)結(jié)合在操縱基因上,關(guān)閉了操縱子。28.Derepressedandsuper-repressed操縱子的活性狀態(tài)稱為去阻遏或被誘導(dǎo);若操縱子發(fā)生突變而不能去阻遏的話有時(shí)被稱為超阻礙或不可誘導(dǎo)29.YAC載體酵母菌人工合成染色體。在基因工程中可探討真核生物調(diào)控的方式和機(jī)理。30.半不連續(xù)DNA復(fù)制DNA的復(fù)制過(guò)程:通過(guò)解旋酶的作用,讓分成兩條鏈,分別以每條鏈為母鏈,通過(guò)堿基互補(bǔ)配對(duì)原則,形成新鏈,再與母鏈行成雙螺旋結(jié)構(gòu)。由于復(fù)制有一半是母鏈,所以是半保留復(fù)制。14第14頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋31.Epigenetics表觀遺傳學(xué):是與遺傳學(xué)(genetic)相對(duì)應(yīng)的概念。遺傳學(xué)是指基于基因序列改變所致基因表達(dá)水平變化,如基因突變、基因雜合丟失和微衛(wèi)星不穩(wěn)定等;表觀遺傳學(xué)則是指基于非基因序列改變所致基因表達(dá)水平變化,如DNA甲基化和染色質(zhì)構(gòu)象變化等;32.Epigenomics表觀基因組學(xué):是在基因組水平上對(duì)表觀遺傳學(xué)改變的研究。33.DNA甲基化是指在DNA甲基化轉(zhuǎn)移酶的作用下,在基因組CpG二核苷酸的胞嘧啶5'碳位共價(jià)鍵結(jié)合一個(gè)甲基基團(tuán)。正常情況下,人類基因組“垃圾”序列的CpG二核苷酸相對(duì)稀少,并且總是處于甲基化狀態(tài),與之相反,人類基因組中大小為100~1000bp左右且富含CpG二核苷酸的CpG島則總是處于未甲基化狀態(tài),并且與56%的人類基因組編碼基因相關(guān)。人類基因組序列草圖分析結(jié)果表明,人類基因組CpG島約為28890個(gè),大部分染色體每1Mb就有5~15個(gè)CpG島,平均值為每Mb含10.5個(gè)CpG島,CpG島的數(shù)目與基因密度有良好的對(duì)應(yīng)關(guān)系。由于DNA甲基化與人類發(fā)育和腫瘤疾病的密切關(guān)系,特別是CpG島甲基化所致抑癌基因轉(zhuǎn)錄失活問題,DNA甲基化已經(jīng)成為表觀遺傳學(xué)和表觀基因組學(xué)的重要研究?jī)?nèi)容。15第15頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋34.LTR長(zhǎng)末端重復(fù):用mRNA反轉(zhuǎn)錄出cDNA后,人工在3’端添加多個(gè)末端重復(fù)序列。避免被相關(guān)酶所降解,保證該序列的穩(wěn)定性。35.代謝物激活蛋白(CAP)又稱分解代謝基因活化蛋白,在分解代謝阻遏中調(diào)節(jié)基因的產(chǎn)物是降解物基因活化蛋白(CAP),它能與環(huán)腺苷酸(cAMP)結(jié)合而被活化,幫助RNA聚合酶與啟動(dòng)子結(jié)合,促進(jìn)轉(zhuǎn)錄進(jìn)行。(由cAMP激活的正調(diào)控蛋白質(zhì),對(duì)RNA聚合酶起始E.coli中的一些操縱子是必須的)。36.調(diào)控密碼位于操縱子前端的一個(gè)密碼子控制著整個(gè)操縱子的轉(zhuǎn)錄,當(dāng)該密碼子發(fā)生突變后,操縱子的失去功能。(真核生物在起始密碼上游100bp內(nèi)有TATA框、CAAT框和GC框,調(diào)控基因表達(dá),原核生物在起始密碼上游-10區(qū)有Pribnow/TATA序列和-35區(qū)的TTGACA序列)16第16頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋37.動(dòng)態(tài)突變?cè)谘芯颗c人類神經(jīng)系統(tǒng)遺傳性疾病相關(guān)的基因時(shí),在患者基因的編碼序列中,或是編碼序列兩側(cè)的序列中發(fā)現(xiàn)某個(gè)密碼子的拷貝數(shù)目遠(yuǎn)遠(yuǎn)多于正常個(gè)體的拷貝數(shù)。換句話說(shuō),患者基因中某種三核苷酸的重復(fù)拷貝數(shù)急劇增加,這種突變導(dǎo)致了疾病的發(fā)生。這種三核苷酸重復(fù)拷貝數(shù)增加,不僅可發(fā)生在上代的生殖細(xì)胞中而遺傳給下一代,而且在當(dāng)代的體細(xì)胞中也可發(fā)生,并同樣具有表型效應(yīng)。除此之外,一個(gè)個(gè)體的不同類型細(xì)胞或同一類型的不同細(xì)胞中,三核苷酸重復(fù)拷貝數(shù)也可以是不同的。重復(fù)拷貝數(shù)改變后的基因的可突變性(mutability),將不同于拷貝數(shù)改變前的基因。這不同于以往發(fā)現(xiàn)的基因突變。過(guò)去觀察到的基因突變體仍然有著與其上代相同的突變率,突變率是很低的,而且變動(dòng)是很小的。比如,編碼血纖維原肽400個(gè)氨基酸組成)的基因的突變率,估計(jì)是每20萬(wàn)年改變一個(gè)氨基酸,這些突變可說(shuō)是“靜止的”。由于三核苷酸擴(kuò)增突變不同于此,所以稱之為動(dòng)態(tài)突變(dynamicmutation)。動(dòng)態(tài)突變也可稱為基因組不穩(wěn)定性(genomicinstability)。17第17頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋38.Telomerase端粒酶是基本的核蛋白逆轉(zhuǎn)錄酶,可將端粒DNA加至真核細(xì)胞染色體末端。端粒在不同物種細(xì)胞中對(duì)于保持染色體穩(wěn)定性和細(xì)胞活性有重要作用,端粒酶能延長(zhǎng)縮短的端粒(縮短的端粒其細(xì)胞復(fù)制能力受限),從而增強(qiáng)體外細(xì)胞的增殖能力。端粒酶在正常人體組織中的活性被抑制,在腫瘤中被重新激活,端粒酶可能參與惡性轉(zhuǎn)化。端粒酶在保持端粒穩(wěn)定、基因組完整、細(xì)胞長(zhǎng)期的活性和潛在的繼續(xù)增殖能力等方面有重要作用。39.multigenefamily多基因家族超基因家則真核基因組的特點(diǎn)之一就是存在多基因家族。多基因家族是指由某一祖先基因經(jīng)過(guò)重復(fù)和變異所產(chǎn)生的一組基因。多基因家族大致可分為兩類:一類是基因家族成簇地分布在某一條染色體上,它們可同時(shí)發(fā)揮作用,合成某些蛋白質(zhì),如組蛋白基因家族就成簇地集中在第7號(hào)染色體長(zhǎng)臂3區(qū)2帶到3區(qū)6帶區(qū)域內(nèi);另一類是一個(gè)基因家族的不同成員成簇地分布不同染色體上,這些不同成員編碼一組功能上緊密相關(guān)的蛋白質(zhì),如珠蛋白基因家族。18第18頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋40.pseudogene在多基因家族中,某些成員并不產(chǎn)生有功能的基因產(chǎn)物,這些基因稱為假基因。假基因與有功能的基因同源,原來(lái)可能也是有功能的基因,但由于缺失,倒位或點(diǎn)突變等,使這一基因失去活性,成為無(wú)功能基因。與相應(yīng)的正?;蛳啾?,假基因往往缺少正常基因的內(nèi)含子,兩側(cè)有順向重復(fù)序列。人們推測(cè),假基因的來(lái)源之一,可能是基因經(jīng)過(guò)轉(zhuǎn)錄后生成的RNA前體通過(guò)剪接失去內(nèi)含子形成mRNA,如果mRNA經(jīng)反復(fù)轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生cDNA,再整合到染色體DNA中去,便有可能成為假基因,因此該假基因是沒有內(nèi)含子的,在這個(gè)過(guò)程中,可能同時(shí)會(huì)發(fā)生缺失,倒位或點(diǎn)突變等變化,從而使假基因不能表達(dá)。41.reversegenetics反求遺傳學(xué)反向遺傳學(xué)、反求遺傳學(xué):是從所謂“正向遺傳學(xué)篩查”的相反方向來(lái)研究基因功能的一種途徑。只不過(guò),正向遺傳學(xué)研究一個(gè)表性或性狀的遺傳基礎(chǔ),而反求遺傳學(xué)研究從DNA測(cè)序中計(jì)算出的一個(gè)特定基因序列的可能表型。在已知DNA克隆片段或蛋白質(zhì)序列上引導(dǎo)程序性的變異(通過(guò)直接誘變)并返回到基因組,來(lái)研究基因和蛋白質(zhì)功能的實(shí)驗(yàn)方法19第19頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋42.CpG島在某些區(qū)段,若CpG二核苷酸成串出現(xiàn)在DNA上,這段序列常被稱為43.cis-actingelement順式作用元件指的是在同一條核苷酸鏈上起調(diào)控基因作用的核酸序列,常不編碼蛋白質(zhì)合成?;蚴峭籇NA分子中具有轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)功能的特異DNA序列真核基因順式作用元件包括啟動(dòng)子、增強(qiáng)子及沉默子等。附加:順式作用元件(cis-actingelement)

順式作用元件在分子遺傳學(xué)領(lǐng)域,相對(duì)同一染色體或DNA分子而言為“順式”(cis);對(duì)不同染色體或DNA分子而言為“反式”(trans)。順式作用元件是同一DNA分子中具有轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)功能的特異DNA序列(圖15-5)。按功能特性,真核基因順式作用元件分為啟動(dòng)子、增強(qiáng)子及沉默子。20第20頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋44.trans-actingfactor反式作用因子則指的是對(duì)不同核酸鏈上的基因表達(dá)起到調(diào)控作用的蛋白,編碼該蛋白的基因與其識(shí)別結(jié)合作用的核酸鏈不是同一鏈。是指能直接或間接地識(shí)別或結(jié)合在各類順式作用元件核心序列上參與調(diào)控靶基因轉(zhuǎn)錄效率的蛋白質(zhì)。主要包括:DNA結(jié)合域如α螺旋-轉(zhuǎn)角-螺旋、鋅指結(jié)構(gòu)、亮氨酸拉鏈、螺旋-突環(huán)-螺旋;轉(zhuǎn)錄激活域,與其他轉(zhuǎn)錄因子相互作用的結(jié)構(gòu)成分順式作用元件和反式作用因子中的“順”和“反”是不能夠單獨(dú)解釋的,它是一個(gè)整體概念。21第21頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋45.Assistantcodon副密碼子tRNA分子中很多稀有堿基,可進(jìn)行AU、CG、UG、IU、IC、IA等配對(duì),體現(xiàn)了密碼子的兼并性(多種密碼子可決定同一種氨基酸)。tRNA分子上決定其攜帶氨基酸的區(qū)域叫做副密碼子,稀有堿基不是組成副密碼子的必要條件。tRNA分子上決定其攜帶氨基酸的區(qū)域叫做副密碼子。一種氨基酰tRNA合成酶可以識(shí)別以一組同功tRNA,這說(shuō)明它們具有共同特征。

46.internalribosomeentrysite,IERS細(xì)胞內(nèi)部核糖體進(jìn)入位點(diǎn):(IRES)是mRNA5'端非編碼區(qū)的一段特殊的序列,它允許核糖體不從mRNA的5'到3'端閱讀而直接在此序列處結(jié)合mRNA并起始翻譯。47.Genesilence基因沉默:是指轉(zhuǎn)基因植物和轉(zhuǎn)基因動(dòng)物中往往會(huì)遇到這樣的情況,外源基因存在于生物體內(nèi),并未丟失或損傷,但該基因不表達(dá)或表達(dá)量極低的現(xiàn)象。22第22頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋48.Genetarget基因打靶是指通過(guò)DNA定點(diǎn)同源重組,改變基因組中的某一特定基因,從而在生物活體內(nèi)研究此基因的功能。基因打靶技術(shù)是一種定向改變生物活體遺傳信息的實(shí)驗(yàn)手段,它的產(chǎn)生和發(fā)展建立在胚胎干細(xì)胞(ES)技術(shù)和同源重組技術(shù)成就的基礎(chǔ)之上,并促進(jìn)了相關(guān)技術(shù)的進(jìn)一步發(fā)展。基因打靶技術(shù)將廣泛應(yīng)用于基因功能研究、人類疾病動(dòng)物模型的研制以及經(jīng)濟(jì)動(dòng)物遺傳物質(zhì)的改良等方面。49.Genemagnifying基因放大一種以前不知道的機(jī)制,已在釀酒酵母(Saccharomyces

cerevisiae)中被發(fā)現(xiàn),它涉及基因組中包含組蛋白基因、一個(gè)端粒和DNA復(fù)制起源的一個(gè)區(qū)域兩側(cè)的轉(zhuǎn)位子之間的重組。轉(zhuǎn)座子序列物理上交聯(lián)、重組為一個(gè)穩(wěn)定的環(huán)形染色體,含有被放大的基因。這一特定的重組事件在組蛋白H2A

H2B水平下降的細(xì)胞中得到加強(qiáng)。類似機(jī)制人類可能也有,因?yàn)槿祟惢蚪M45%由轉(zhuǎn)座子組成。23第23頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋50.Genefamily基因家族:因組進(jìn)化中,一個(gè)基因通過(guò)基因重復(fù)產(chǎn)生了兩個(gè)或更多的拷貝,這些基因即構(gòu)成一個(gè)基因家族。是具有顯著相似性的一組基因,編碼相似的蛋白質(zhì)產(chǎn)物24第24頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋51.Genomics基因組學(xué):指對(duì)所有基因進(jìn)行基因組作圖(包括遺傳圖譜、物理圖譜、轉(zhuǎn)錄本圖譜),核苷酸序列分析,基因定位和基因功能分析的一門科學(xué)。因此,基因組研究應(yīng)該包括兩方面的內(nèi)容:以全基因組測(cè)序?yàn)槟繕?biāo)的結(jié)構(gòu)基因組學(xué)(structuralgenomics)和以基因功能鑒定為目標(biāo)的功能基因組學(xué)(functionalgenomics),又被稱為后基因組(postgenome)研究。功能基因組學(xué)又往往被稱為后基因組學(xué)(Postgenomics),它利用結(jié)構(gòu)基因組所提供的信息和產(chǎn)物,發(fā)展和應(yīng)用新的實(shí)驗(yàn)手段,通過(guò)在基因組或系統(tǒng)水平上全面分析基因的功能,使得生物學(xué)研究從對(duì)單一基因或蛋白質(zhì)得研究轉(zhuǎn)向多個(gè)基因或蛋白質(zhì)同時(shí)進(jìn)行系統(tǒng)的研究。這是在基因組靜態(tài)的堿基序列弄清楚之后轉(zhuǎn)入對(duì)基因組動(dòng)態(tài)的生物學(xué)功能學(xué)研究。研究?jī)?nèi)容包括基因功能發(fā)現(xiàn)、基因表達(dá)分析及突變檢測(cè)。基因的功能包括:生物學(xué)功能,如作為蛋白質(zhì)激酶對(duì)特異蛋白質(zhì)進(jìn)行磷酸化修飾;細(xì)胞學(xué)功能,如參與細(xì)胞間和細(xì)胞內(nèi)信號(hào)傳遞途徑;發(fā)育上功能,如參與形態(tài)建成等。采用的手段包括經(jīng)典的減法雜交,差示篩選,cDNA代表差異分析以及mRNA差異顯示等,但這些技術(shù)不能對(duì)基因進(jìn)行全面系統(tǒng)的分析,新的技術(shù)應(yīng)運(yùn)而生,包括基因表達(dá)的系統(tǒng)分析(serialanalysisofgeneexpression,SAGE),cDNA微陣列(cDNAmicroarray),DNA芯片(DNAchip)等。25第25頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋52.genomicimprinting基因組印跡:是指在配子或合子發(fā)生期間,來(lái)自親本的等位基因或染色體在發(fā)育過(guò)程中產(chǎn)生專一性的加工修飾,導(dǎo)致后代體細(xì)胞中兩個(gè)親本來(lái)源的等位基因有不同的表達(dá)活性,為一種后生論修飾。53.Pseudogene假基因具有與功能基因相似的序列,但由于有許多突變以致失去了原有的功能,所以假基因是沒有功能的基因,常用ψ表示。54.Splicesome剪接體:進(jìn)行RNA剪接時(shí)形成的多組分復(fù)合物,其大小為60S,主要是由小分子的核RNA和蛋白質(zhì)組成。剪接體本身需要一些小核RNA參與。這些小RNA不會(huì)翻譯出任何蛋白,但對(duì)于調(diào)控遺傳活動(dòng)起到重要作用。55.simplesequencelengthpolymorphism,SSLP簡(jiǎn)單序列長(zhǎng)度多態(tài)性是據(jù)串聯(lián)重復(fù)排列微衛(wèi)星基序兩側(cè)的單一序列設(shè)計(jì)引物,對(duì)微衛(wèi)星序列(microsatelliteDNA或simplesequencerepeats,SSR)進(jìn)行擴(kuò)增,由微衛(wèi)星基序重復(fù)數(shù)目的變異而產(chǎn)生多態(tài)性。26第26頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋56.Viroid類病毒:是目前已知最小的可傳染的致病因子,比普通病毒簡(jiǎn)單。類病毒是無(wú)蛋白質(zhì)外殼保護(hù)的游離的共價(jià)閉合環(huán)狀單鏈RNA分子,侵入宿主細(xì)胞后自我復(fù)制,并使宿主致病或死亡。57.magicspot魔斑:當(dāng)細(xì)菌生長(zhǎng)過(guò)程中,遇到氨基酸全面缺乏時(shí),細(xì)菌將會(huì)產(chǎn)生一個(gè)應(yīng)急反應(yīng),停止全部基因的表達(dá)。產(chǎn)生這一應(yīng)急反應(yīng)的信號(hào)是鳥苷四磷酸(ppGpp)和鳥苷五磷酸(pppGpp)。PpGpp與pppGpp的作用不只是一個(gè)或幾個(gè)操縱子,而是影響一大批,所以稱他們是超級(jí)調(diào)控子或稱為魔斑。58.Terminalredundancy末端冗余:指噬菌體基因組兩端同一個(gè)序列的重復(fù)。27第27頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋59.Intronhoming內(nèi)含子歸巢:在I類II類的某些內(nèi)含子中含有開放續(xù)框,可產(chǎn)生具有三種功能的蛋白。這些蛋白可使內(nèi)含子(或以其原來(lái)的DNA形式,或作為RNA的DNA拷貝)移動(dòng)(mobile),使內(nèi)含子可插到一個(gè)新的靶位點(diǎn),這個(gè)現(xiàn)象叫做歸巢(homing)I組和II組內(nèi)含子分布很廣,在真核和原核細(xì)胞中都有發(fā)現(xiàn)。60.Reversetransposonmolecular逆轉(zhuǎn)座子分子:生物學(xué)中最驚人的發(fā)現(xiàn)之一,是在基因組內(nèi)存在著通過(guò)DNA轉(zhuǎn)錄為RNA后,再經(jīng)逆轉(zhuǎn)錄成為cDNA并插入到基因組的新位點(diǎn)上的因子,被稱為逆轉(zhuǎn)座子。61.prions朊病毒:是一種無(wú)免疫原性但能在細(xì)胞內(nèi)復(fù)制、并能侵染動(dòng)物的疏水性蛋白質(zhì)。致病途徑具有自發(fā)性、遺傳性和傳染性三個(gè)特征。28第28頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋62.leakymutation滲漏突變:不完全抑制的一個(gè)基因作用而能允許有些有關(guān)功能的表達(dá)的突變,例如某種維生素缺陷型,在不加某種維生素的培養(yǎng)基中本應(yīng)不能生長(zhǎng),但結(jié)果卻能慢慢生長(zhǎng),這種突變稱為滲漏突變。這種突變可以理解為基因的堿基被替換了的點(diǎn)突變,即蛋白質(zhì)中某一氨基酸發(fā)生變化,多少引起立體結(jié)構(gòu)的變異,但依然顯示出活性的情況?;蛉笔б话悴环Q為滲漏(leaky)。63.Homotypeotherlocationmutation同型異位突變:在一條染色體的不同部位或不同染色體上發(fā)生了兩次或兩次以上的基因突變,導(dǎo)致該生物產(chǎn)生同樣或類似的表現(xiàn)型。29第29頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋64.homeoticmutation同源異型盒:同源異型基因的探索就是在微觀基因?qū)哟紊纤妓魍葱?。首先,遺傳學(xué)者貝特森(WilliamBateson)於1894年發(fā)現(xiàn)同源病變(homeosis)現(xiàn)象:即果蠅的某個(gè)基因突變后,肢體各部位的同源器官的生長(zhǎng)會(huì)發(fā)生特定的錯(cuò)位,例如,果蠅的觸角基因(antennepadiagene)突變,使果蠅第二胸節(jié)的腿長(zhǎng)在頭部,雙胸基因(biothraxgene)突變,會(huì)使果蠅后胸發(fā)育成前胸。貝特森首先將導(dǎo)致同源病變現(xiàn)象的基因稱為同源異型基因(homeoticgenes),於是同源性的概念,首度進(jìn)入微觀的基因?qū)哟巍?duì)當(dāng)代學(xué)界而言,同源異型基因決定動(dòng)物體節(jié)發(fā)生的順序、部位,使器官發(fā)生在正確的位置上,是屬於一種調(diào)控基因(regulatorygene)。30第30頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋65.Map-based-cloning圖位克?。河址Q定位克?。╬ositionalcloning),1986年首先由劍橋大學(xué)的Alancoulson提出,用該方法分離基因,是根據(jù)目的基因在染色體上的位置進(jìn)行的,無(wú)需預(yù)先知道基因的DNA順序,也無(wú)需預(yù)先知道其表達(dá)產(chǎn)物的有關(guān)信息,但應(yīng)有以下兩方面的基本情況:一是有一個(gè)根據(jù)目的基因的有無(wú)建立起來(lái)的遺傳分離群體,如F、DH、BC、RI等。二是開展以下幾項(xiàng)工作:1)首先找到與目標(biāo)基因緊密連鎖的分子標(biāo)記;2)用遺傳作圖和物理作圖將目標(biāo)基因定位在染色體的特定位置;3)構(gòu)建含有大插入片段的基因組文庫(kù)(BAC庫(kù)或YAC);4)以與目標(biāo)基因連鎖的分子標(biāo)記為探針篩選基因組文庫(kù);5)用獲得陽(yáng)性克隆構(gòu)建目的基因區(qū)域的跨疊群;6)通過(guò)染色體步行、登陸或跳躍獲得含有目標(biāo)基因的大片段克?。?)通過(guò)亞克隆獲得含有目的基因的小片段克??;8)通過(guò)遺傳轉(zhuǎn)化和功能互補(bǔ)驗(yàn)證最終確定目標(biāo)基因的堿基序列。31第31頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋66.Restrictmodifysystem限制性修飾系統(tǒng):所有的細(xì)胞中都有多種限制性內(nèi)切酶,能將外來(lái)的入侵者DNA切斷。每一種內(nèi)切酶在DNA上都有特定的識(shí)別位點(diǎn)。當(dāng)細(xì)胞本身的DNA也含有這樣的識(shí)別位點(diǎn)時(shí),該細(xì)胞的甲基化酶就在這些識(shí)別位點(diǎn)上將堿基甲基化,使限制性內(nèi)切酶對(duì)自身DNA不起作用。而進(jìn)入受體的外源DNA很快被限制酶所切割,失去結(jié)構(gòu)和功能;若迅速被甲基化予以保護(hù),就不被限制性酶切割,能很快復(fù)制,長(zhǎng)期在寄主中存活。32第32頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋67.residentDNA居民DNA:在同一個(gè)細(xì)胞內(nèi)的不同類型的DNA(包括核DNA、質(zhì)粒DNA、細(xì)胞質(zhì)DNA、噬菌體DNA等),都具有同樣限制-修飾模式。這些同一細(xì)胞中的不同DNA統(tǒng)稱之。68.Stringentresponse嚴(yán)謹(jǐn)反應(yīng):(應(yīng)急控制):細(xì)菌在氨基酸饑餓時(shí)發(fā)生的rDNA,tRNA基因及核糖體蛋白基因停止轉(zhuǎn)錄反應(yīng),細(xì)菌質(zhì)??截惪刂圃趲讉€(gè)拷貝的反應(yīng)。69.Wobblehypothesis搖擺假說(shuō):解釋遺傳密碼簡(jiǎn)并性的假說(shuō),克里克(F.H.C.Crick)于1966年提出。對(duì)氨基酸專一的密碼子的頭兩個(gè)堿基與相應(yīng)轉(zhuǎn)移RNA上反密碼子的第2個(gè)和第3個(gè)堿基互補(bǔ)配對(duì),而密碼子的第3個(gè)堿基(3'端)與反密碼子5'端堿基的配對(duì)專一性相對(duì)較差,被稱為擺動(dòng)配對(duì)(wobblepairing)。在反密碼子的5'位置上常發(fā)現(xiàn)次黃嘌呤(Ⅰ)或與之相似,僅能形成2個(gè)氫鍵的嘧啶。33第33頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋71.mutatorgenes增變基因:基因組中某些基因的突變可使整個(gè)基因組的突變率明顯上升,這類基因稱為增變基因72.Orthologuegeen直系同源基因:不同種間的兩組基因組但是卻有相同功能像是人和老鼠有部分的酵素是相同的我們稱這兩種蛋白質(zhì)的基因組為直系同源基因73.majorhistocompatibilitycomplexMHC組織相容性復(fù)合體(MHC):在機(jī)體內(nèi)存在與免疫排斥反應(yīng)相關(guān)的抗原系統(tǒng)多達(dá)20種以上,其中能引起強(qiáng)而迅速排斥反應(yīng)者稱為主要組織相容性抗原,其編碼基因是一組緊密連鎖的基因群,稱為主要組織相容性復(fù)合體。34第34頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋75.snRNA它是真核生物轉(zhuǎn)錄后加工過(guò)程中RNA剪接體(spilceosome)的主要成分?,F(xiàn)在發(fā)現(xiàn)有五種snRNA,其長(zhǎng)度在哺乳動(dòng)物中約為100-215個(gè)核苷酸。snRNA一直存在于細(xì)胞核中,與40種左右的核內(nèi)蛋白質(zhì)共同組成RNA剪接體,在RNA轉(zhuǎn)錄后加工中起重要作用。76.反義RNA:反義RNA是指與mRNA互補(bǔ)的RNA分子,也包括與其它RNA互補(bǔ)的RNA分子。由于核糖體不能翻譯雙鏈的RNA,所以反義RNA與mRNA特異性的互補(bǔ)結(jié)合,即抑制了該mRNA的翻譯。通過(guò)反義RNA控制mRNA的翻譯是原核生物基因表達(dá)調(diào)控的一種方式,最早是在E.coli的產(chǎn)腸桿菌素的ColE1質(zhì)粒中發(fā)現(xiàn)的,許多實(shí)驗(yàn)證明在真核生物中也存在反義RNA。近幾年來(lái)通過(guò)人工合成反義RNA的基因,并將其導(dǎo)入細(xì)胞內(nèi)轉(zhuǎn)錄成反義RNA,即能抑制某特定基因的表達(dá),阻斷該基因的功能,有助于了解該基因?qū)?xì)胞生長(zhǎng)和分化的作用35第35頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋77.SRAP簡(jiǎn)單序列重復(fù)(Inter-simplesequencerepeat)(sequence-specificamplificationpolymorphism)相關(guān)序列擴(kuò)增多態(tài)性(Sequence—relatedamplifiedpolymorphism,SRAP)是一種新型的基于PCR的標(biāo)記系統(tǒng),是由美國(guó)加州大學(xué)蔬菜系Li與Quiros博士于2001年在蕓薹屬作物開發(fā)出來(lái)。該標(biāo)記通過(guò)獨(dú)特的雙引物設(shè)計(jì)對(duì)基因的ORFs(Openreadingframes)的特定區(qū)域進(jìn)行擴(kuò)增,上游引物長(zhǎng)17bp,對(duì)外顯子區(qū)域進(jìn)行特異擴(kuò)增。下游引物長(zhǎng)18bp,對(duì)內(nèi)含子區(qū)域、啟動(dòng)子區(qū)域進(jìn)行特異擴(kuò)增。因不同個(gè)體以及物種的內(nèi)含子、啟動(dòng)子與間隔區(qū)長(zhǎng)度不同而產(chǎn)生多態(tài)性。該標(biāo)記具有簡(jiǎn)便、高效、產(chǎn)率高、高共顯性、重復(fù)性好、易測(cè)序、便于克隆目標(biāo)片段的特點(diǎn)。目前已成功地應(yīng)用于作物遺傳多樣性分析、遺傳圖譜的構(gòu)建、重要性狀的標(biāo)記以及相關(guān)基因的克隆等方面.36第36頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋78.ISSR簡(jiǎn)單序列重復(fù)(Inter-SimpleSequenceRepeat,簡(jiǎn)稱ISSR)。ISSR是一種基于微衛(wèi)星序列發(fā)展起來(lái)的新的分子標(biāo)記,具有簡(jiǎn)便、穩(wěn)定、DNA多態(tài)性高等優(yōu)點(diǎn).ISSR標(biāo)記呈孟德爾式遺傳,大部分ISSR標(biāo)記為顯性標(biāo)記.綜合有關(guān)文獻(xiàn)就ISSR的原理、操作及其在果樹種質(zhì)鑒定、遺傳多樣性檢測(cè)、親緣關(guān)系分析和遺傳圖譜構(gòu)建等方面的應(yīng)用和進(jìn)展進(jìn)行簡(jiǎn)要的闡述。37第37頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋79.SSRSSR簡(jiǎn)單序列重復(fù)標(biāo)記(Simplesequencerepeat,簡(jiǎn)稱SSR標(biāo)記),也叫微衛(wèi)星序列重復(fù),是由一類由幾個(gè)核苷酸(1~5個(gè))為重復(fù)單位組成的長(zhǎng)達(dá)幾十個(gè)核苷。生物的基因組中,特別是高等生物的基因組中含有大量的重復(fù)序列〔14〕,根據(jù)重復(fù)序列在基因組中的分布形式可將其分為串聯(lián)重復(fù)序列和散布重復(fù)序列。其中,串聯(lián)重復(fù)序列是由相關(guān)的重復(fù)單位首位相連、成串排列而成的。目前發(fā)現(xiàn)的串聯(lián)重復(fù)序列主要有兩類:一類是由功能基因組成的(如rRNA和組蛋白基因);另一類是由無(wú)功能的序列組成的。根據(jù)重復(fù)序列的重復(fù)單位的長(zhǎng)度,可將串聯(lián)重復(fù)序列分為衛(wèi)星DNA、微衛(wèi)星DNA、小衛(wèi)星DNA等。微衛(wèi)星DNA又叫簡(jiǎn)單重復(fù)序列,指的是基因組中由1~6個(gè)核苷酸組成的基本單位重復(fù)多次構(gòu)成的一段DNA,廣泛分布于基因組的不同位置,長(zhǎng)度一般在200bp以下。研究表明,微衛(wèi)星在真核生物的基因組中的含量非常豐富,而且常常是隨機(jī)分布于核DNA中。38第38頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋80.ESTs

(ExpressedSequencetags)是從已建好的cDNA庫(kù)中隨機(jī)取出一個(gè)克隆,從5’末端或3’末端對(duì)插入的cDNA進(jìn)行一輪單向自動(dòng)測(cè)序,所獲得的約60-500bp的一段cDNA序列。ESTs的產(chǎn)生:從特定的狀態(tài)的組織或細(xì)胞中分離mRNA,將mRNA逆轉(zhuǎn)錄成cDNA亞克隆到載體中,利用載體上的引物對(duì)插入片段測(cè)序測(cè)序出來(lái)的片段結(jié)果即稱為ESTs(expressedsequencetags)。

EST的產(chǎn)生過(guò)程注定其具有以下特性:(1)由于是單次測(cè)序結(jié)果,序列的精確度較低,存在較多錯(cuò)誤。(大約2%error,HGP錯(cuò)誤率標(biāo)準(zhǔn)是<0.01%);(2)重復(fù)結(jié)果多,不同EST‘st往往來(lái)自同一個(gè)基因;(3)大部分EST序列來(lái)IMAGEconsortium39第39頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋81.QTLQTL是quantitativetraitlocus的縮寫,中文可以翻譯成數(shù)量性狀座位或者數(shù)量性狀基因座,它指的是控制數(shù)量性狀的基因在基因組中的位置。對(duì)QTL的定位必須使用遺傳標(biāo)記,人們通過(guò)尋找遺傳標(biāo)記和感興趣的數(shù)量性狀之間的聯(lián)系,將一個(gè)或多個(gè)QTL定位到位于同一染色體的遺傳標(biāo)記旁,換句話說(shuō),標(biāo)記和QTL是連鎖的。QTL定位的作圖方法QTL定位就是采用類似單基因定位的方法將QTL定位在遺傳圖譜上,確定QTL與遺傳標(biāo)記間的距離(以重組率表示)。根據(jù)標(biāo)記數(shù)目的不同,可分為單標(biāo)記、雙標(biāo)記和多標(biāo)記幾種方法。根據(jù)統(tǒng)計(jì)分析方法的不同,可分為方差與均值分析法、回歸及相關(guān)分析法、矩估計(jì)及最大似然法等。根據(jù)標(biāo)記區(qū)間數(shù)可分為零區(qū)間作圖、單區(qū)間作圖和多區(qū)間作圖。此外,還有將不同方法結(jié)合起來(lái)的綜合分析方法,如QTL復(fù)合區(qū)間作圖(CIM)多區(qū)間作圖(MIM)、多QTL作圖、多性狀作圖(MTM)等。40第40頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋82.重復(fù)序列類型?重復(fù)序列按其在基因組中的分布形式可分為分兩大類:一類為串聯(lián)重復(fù)序列(Tandemlyrepeatedsequences),其重復(fù)單位首尾相連,成串排列,如衛(wèi)星DNA(satelliteDNA)、微衛(wèi)星DNA(microsatelliteDNA)、核糖體RNA基因(rDNA)、端粒重復(fù)序列(telomericrepeats);另一類為散布重復(fù)序列(Interspersedrepeatedsequences),其重復(fù)單位與其它無(wú)關(guān)重復(fù)序列或單拷貝序列相間排列,如轉(zhuǎn)座子(transposons)。41第41頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋83.Geneticdiversity(GD)?物種多樣性(speciesdiversity)、生態(tài)系統(tǒng)多樣性(ecosystemdiversity)?遺傳多樣性是指存在于生物個(gè)體內(nèi)、單個(gè)物種內(nèi)以及物種之間的基因多樣性。一個(gè)物種的遺傳組成決定著它的特點(diǎn),這包括它對(duì)特定環(huán)境的適應(yīng)性,以及它被人類的可利用性等特點(diǎn)。任何一個(gè)特定的個(gè)體和物種都保持著大量的遺傳類型,就此意義而言,它們可以被看作單獨(dú)的基因庫(kù)?;蚨鄻有裕ǚ肿?、細(xì)胞和個(gè)體三個(gè)水平上的遺傳變異度,因而成為生命進(jìn)化和物種分化的基礎(chǔ)。一個(gè)物種的遺傳變異愈豐富,它對(duì)生存環(huán)境的適應(yīng)能力便愈強(qiáng);而一個(gè)物種的適應(yīng)能力愈強(qiáng),則它的進(jìn)化潛力也愈大。

物種多樣性是指動(dòng)植物及微生物種類的豐富性,它是人類生存和發(fā)展的基礎(chǔ)。物種資源為人類提供了必要的生活物質(zhì),特別是在醫(yī)學(xué)方面,許多野外生物種屬的醫(yī)藥價(jià)值對(duì)人類健康具有重大意義。隨著醫(yī)學(xué)科學(xué)的發(fā)展,許多目前人類未知的物種其醫(yī)藥價(jià)值也將不斷被發(fā)現(xiàn)。

生態(tài)系統(tǒng)多樣性是指生態(tài)系統(tǒng)類型的多種多樣。地球上的生態(tài)類型極其繁多,但是所有生態(tài)系統(tǒng)都保持著各自的生態(tài)過(guò)程,這包括生命所必需的化學(xué)元素的循環(huán)和生態(tài)系統(tǒng)組成部分之間能量流動(dòng)的維持。不論是對(duì)一個(gè)小的生態(tài)系統(tǒng)而言或是從全球范圍來(lái)看,這些生態(tài)過(guò)程對(duì)于所有生物的生存、進(jìn)化和持續(xù)發(fā)展都是至關(guān)重要的。維持生態(tài)系統(tǒng)多樣性對(duì)于維持物種和基因多樣性也是必不可少的。42第42頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋84.plasmid-like高等植物與其他生物相比,其線粒體基因組大(200~2400kb)且復(fù)雜,在玉米、水稻等多種植物的線粒體中除了主DNA外,還有環(huán)形或線形的線粒體DNA類質(zhì)粒(mitochondrialplasmid-likeDNA),環(huán)形類質(zhì)粒與線粒體DNA不同源,多數(shù)與核基因組同源,絕大部分的類質(zhì)粒有轉(zhuǎn)錄,但其來(lái)源與功能不清,僅玉米中的線形類質(zhì)粒的分布與細(xì)胞質(zhì)雄性不育有一定關(guān)系。目前國(guó)內(nèi)尚未有對(duì)高等植物線粒體類質(zhì)粒較系統(tǒng)詳細(xì)的研究。85.GISHGenomicInSituHybridization,基因組原位雜交43第43頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋86.SNPSingleNucleotidePolymorphism,單核苷酸多態(tài)性。單核苷酸多態(tài)性(singlenucleotidepolymorphism,SNP)是指同一物種不同個(gè)體間染色體上遺傳密碼單個(gè)堿基的變化,主要表現(xiàn)為基因組核苷酸水平上的變異引起的DNA序列多態(tài)性。人類基因組計(jì)劃持續(xù)產(chǎn)生大量序列數(shù)據(jù),清楚表明不同個(gè)體在整個(gè)基因組有許多點(diǎn)存在DNA序列的基本變異。最常見的變異發(fā)生在分散的單個(gè)核苷酸位置,即單核苷酸多態(tài)性(SNPs),估計(jì)發(fā)生頻率大約每1000個(gè)核苷酸有1個(gè)。那么,沒每1000個(gè)核苷酸,具有一個(gè)群體的基本頻率的任何一個(gè)雙拷貝染色體之間的在任一個(gè)位置平均核苷酸的一致性是不同的。SNPs是雙等位基因多態(tài)性,即多原則上態(tài)性位點(diǎn)的核苷酸一致性通常在人類中傾向于二分之一的機(jī)率,而不是四核苷酸機(jī)率。44第44頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋87.snRNA小核RNA(smallnuclearRNA,snRNA)。它是真核生物轉(zhuǎn)錄后加工過(guò)程中RNA剪接體(spilceosome)的主要成分?,F(xiàn)在發(fā)現(xiàn)有五種snRNA,其長(zhǎng)度在哺乳動(dòng)物中約為100-215個(gè)核苷酸。snRNA一直存在于細(xì)胞核中,與40種左右的核內(nèi)蛋白質(zhì)共同組成RNA剪接體,在RNA轉(zhuǎn)錄后加工中起重要作用。另外,還有端體酶RNA(telomeraseRNA),它與染色體末端的復(fù)制有關(guān);以及反義RNA(antisenseRNA),它參與基因表達(dá)的調(diào)控。88.單倍型(haplotype)在基因組中,相鄰近的SNPs等位位點(diǎn)傾向于以一個(gè)整體的形式遺傳給后代。位于一條染色體上或某一區(qū)域的一組相關(guān)聯(lián)的SNP等位位點(diǎn)被稱作單倍型。45第45頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋89.CTAB法這種方法是由Murray和Thompson(1980)修改而成的簡(jiǎn)便方法。CTAB(十六烷基三乙基溴化銨)是一種去污劑,可溶解細(xì)胞膜,它能與核酸形成復(fù)合物,在高鹽溶液中((0.7mol/LNaCl)是可溶的,當(dāng)降低溶液鹽濃度到一定程度(0.3mol/LNaCl)時(shí),從溶液中沉淀,通過(guò)離心就可將CTAB-核酸的復(fù)合物與蛋白,多糖類物質(zhì)分開。最后通過(guò)乙醇或異丙醇沉淀DNA,而CTAB溶于乙醇或異丙醇而除去。46第46頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋90.SSHSSH即抑制消減雜交技術(shù)是由Diatchenko等于1996年以mRNA差別顯示技術(shù)為基礎(chǔ)建立起來(lái)的篩選未知差異表達(dá)基因的新技術(shù)。它主要基于最近出現(xiàn)的抑制PCR,并結(jié)合標(biāo)準(zhǔn)化(normalization或equalization)和消減雜交(substractivehybridization)。抑制PCR通過(guò)利用含引物序列的雙鏈接頭(adaptor)充當(dāng)引物模板,使兩端接上同一接頭的非目的雙鏈片段具有反向末端重復(fù)序列,PCR中不能擴(kuò)增,從而達(dá)到抑制非目的片段而選擇性擴(kuò)增目的片段的目的。標(biāo)準(zhǔn)化步驟平衡了目的基因群中cDNA的豐度,即低豐度差異表達(dá)的基因不會(huì)丟失,而高豐度差異表達(dá)的基因又不會(huì)被過(guò)量分離。消減雜交則扣除了目的基因群(tester)與驅(qū)趕基因群(driver)間的同源序列。47第47頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋91.MAS分子標(biāo)記輔助選擇(Marker-assistedselection):DNA分子標(biāo)記輔助育種技術(shù),是通過(guò)利用與目標(biāo)性狀緊密連鎖的DNA分子標(biāo)記對(duì)目標(biāo)性狀進(jìn)行間接選擇的現(xiàn)代育種技術(shù)。該技術(shù)對(duì)目標(biāo)基因的轉(zhuǎn)移,不僅可在早代進(jìn)行準(zhǔn)確、穩(wěn)定的選擇,而且可克服再度利用隱性基因時(shí)識(shí)別難的問題,從而加速育種進(jìn)程,提高育種效率。與常規(guī)育種相比,該技術(shù)可提高育種效率2-3倍。由于其明顯的優(yōu)越性,該技術(shù)已引起了發(fā)達(dá)國(guó)家的高度重視。技術(shù)的關(guān)鍵是與重要農(nóng)藝性狀緊密連鎖的DNA分子標(biāo)記的鑒定。美國(guó)、日本、西歐各國(guó)等國(guó)家近年都投入巨資開展這方面的工作。已經(jīng)鑒定到了水稻、小麥、玉米、棉花、大豆等重要作物的一些農(nóng)藝性狀的分子標(biāo)記。利用鑒定到的分子標(biāo)記進(jìn)行輔助選擇育種也取得了一定的進(jìn)展。設(shè)在菲律賓的國(guó)際水稻研究所已經(jīng)獲得了分別聚合多個(gè)抗稻瘟病和抗白葉枯病基因的水稻株系;美國(guó)已經(jīng)把在玉米上鑒定到的與產(chǎn)量有關(guān)的數(shù)量性狀基因座位轉(zhuǎn)移到了不同的自交系中,由這些自交系組配的雜交種的產(chǎn)量比對(duì)照雜交種提高15%以上。在我國(guó),中科院、中國(guó)農(nóng)科院和一些高等院校已經(jīng)掌握了這方面的技術(shù),并經(jīng)過(guò)近幾年的研究,取得了一批重要成果,在水稻、小麥、大豆、油菜等重要作物上已鑒定了一些與重要農(nóng)藝性狀連鎖的分子標(biāo)記;通過(guò)分子標(biāo)記輔助選擇,已選育出高抗白葉枯病的水稻品種。進(jìn)一步加快分子標(biāo)記輔助育種的研究,將為大幅度提高農(nóng)作物產(chǎn)量和品質(zhì)提供有效途徑。48第48頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋92.DNA復(fù)制系統(tǒng)所需系統(tǒng)(1)基本概念:DNA復(fù)制、復(fù)制子、復(fù)制體、復(fù)制時(shí)期、半保留復(fù)制(2)復(fù)制起點(diǎn)、復(fù)制方向:復(fù)制叉、單雙向復(fù)制的決定條件、復(fù)制的多模式(3)復(fù)制方式:復(fù)制叉式(從頭起始)、D環(huán)復(fù)制(置換式)、σ復(fù)制(滾環(huán)復(fù)制)(4)復(fù)制酶:3種DNApol(特別是DNApolШ)、DNA連接酶、螺旋酶、旋轉(zhuǎn)酶(5)DNA復(fù)制的半不連續(xù)性:先導(dǎo)鏈、后隨鏈(6)DNA復(fù)制時(shí)的引物是RNA49第49頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋原核和真核生物DNA復(fù)制的相同點(diǎn):(1)Semi-conservativereplication(2)Semi-discontinuousreplication(3)DNAhelicase,SSB(4)RNApriming(5)校正閱讀(Proofreading)原核和真核生物DNA復(fù)制的不同點(diǎn):(1)復(fù)制起點(diǎn)(單、多)(2)復(fù)制子(大小、多少)(3)復(fù)制起始的許可因子的控制(復(fù)制周期的重疊與否)(4)復(fù)制叉移動(dòng)的速度(900/50nt/S)(5)岡崎片段的大?。?)端粒和端粒酶(7)DNA聚合酶Polymerases50第50頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋93.ARS元件在真核生物(如啤酒酵母)中復(fù)制起始區(qū)已鑒別出特殊順序,將它作為一個(gè)部件來(lái)構(gòu)建一個(gè)環(huán)狀的DNA分子,這個(gè)核外DNA分子在酵母中是可以自主復(fù)制的。這個(gè)順序稱為自主復(fù)制順序(autonomouslyreplicatingsequences)或叫ARS元件,在其它的真核生物中也發(fā)現(xiàn)類似于酵母ARS元件的順序。比較一下酵母中多種ARS元件可發(fā)現(xiàn)有11bp的保守順序:

5′ATTTATPuTTTA3′3′TAAAYAPyAAAT5′這個(gè)A-T豐富區(qū)順序是和復(fù)制起點(diǎn)的功能相適應(yīng)的,因?yàn)檫@段順序的雙鏈易于變性。ARS序列可結(jié)合起始點(diǎn)識(shí)別復(fù)合體(ORC),被CDK激活后引導(dǎo)DNA解鏈以進(jìn)行復(fù)制。

51第51頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋94.沉默子(silencer)沉默子(silencer)是參與基因表達(dá)負(fù)調(diào)控的一種元件,可使某些結(jié)構(gòu)基因處于沉默狀態(tài),不再表達(dá)。是在研究T淋巴細(xì)胞的T抗原受體(TCR)基因表達(dá)調(diào)控時(shí)發(fā)現(xiàn)的。TCR有α/β、γ/δ兩種,編碼α鏈和δ鏈?zhǔn)峭换蜃膬蓚€(gè)等位基因,α鏈恒定區(qū)Ca基因3’端下游的。已知有3個(gè)負(fù)調(diào)控元件,一個(gè)緊接在Ca基因的3’下游,另一個(gè)則在Co增強(qiáng)子的上游。對(duì)α基因?qū)R坏某聊拥淖饔檬亲柚筳a基因在γ/δ型T細(xì)胞中參與重排,使ja基因只參與α/β型T細(xì)胞中的重排。這說(shuō)明α沉默子對(duì)在α和δ兩個(gè)等位基因中選擇。等位基因的轉(zhuǎn)錄和重排時(shí)起作用,而使δ等位基因沉默。這些負(fù)調(diào)控元件不受距離和取向的限制。52第52頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋95.Indel插入缺失在染色體的某一區(qū)段可有部分堿基序列的插入和缺失,它可引起周圍更多的基因發(fā)生突變。遺傳突變新機(jī)制:第一,基因組各區(qū)域的突變率很不相同,自發(fā)突變的數(shù)量是由Indel的數(shù)量和密度所決定,自發(fā)突變的數(shù)量在Indel附近并不稀有。第二,Indel本身是一種點(diǎn)突變,其發(fā)生有一定的隨機(jī)性,因而其誘發(fā)的突變也有一定的隨機(jī)性;第三,生物多樣性的最初變異來(lái)源,主要是由Indel誘導(dǎo)產(chǎn)生;第四,自然選擇在很大程度上是通過(guò)對(duì)Indel的選擇而實(shí)現(xiàn),而自發(fā)突變率的高低很大程度上也是自然選擇的結(jié)果;第五,生物通過(guò)調(diào)節(jié)自身變異能力而適應(yīng)環(huán)境,即突變?cè)谶M(jìn)化中的作用相當(dāng)巨大。53第53頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋96.衛(wèi)星DNA是一類高度重復(fù)序列的DNA,在CsCl2密度梯度離心,小的分子處于上層,大的分子處于下層;DNA形成了不同的條帶??梢钥吹皆谝粭l主帶以外還有一個(gè)或多個(gè)小的衛(wèi)星帶。這些在衛(wèi)星帶中的DNA即被稱為衛(wèi)星DNA,這種DNA的GC含量一般少于主帶中的DNA,浮力密度也低。各類衛(wèi)星DNA都是由各種不同的重復(fù)序列家族所組成。衛(wèi)星DNA通常是串聯(lián)重復(fù)序列。衛(wèi)星DNA分為兩類。一類是小衛(wèi)星DNA(minisatelliteDNA),由幾百個(gè)核苷酸對(duì)的單元重復(fù)組成。另一類是微衛(wèi)星DNA(microsatelliteDNA),由2個(gè)到20個(gè)左右的核苷酸對(duì)的單元重復(fù)成百上千次所組成。

54第54頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋97.Promotor啟動(dòng)子是操縱子的一個(gè)組成部分,控制基因表達(dá)(轉(zhuǎn)錄)的起始時(shí)間和表達(dá)的程度,決定結(jié)構(gòu)基因的活動(dòng)。原核生物啟動(dòng)子區(qū):Pribnowbox,位于-10序列(TATA框),主要作用是使轉(zhuǎn)錄精確地起始;在-35bp有一個(gè)共同序列(TTGACA),CAAT框則主要是控制轉(zhuǎn)錄起始的頻率,特別是CAAT框?qū)D(zhuǎn)錄起始頻率的作用更大。真核生物啟動(dòng)子區(qū):位于-25~-30bp處的TATAAAAG,也稱TATA框(TATAbox),也是轉(zhuǎn)錄精確起始區(qū);在-70~-78bp處還有一段共同序列CCAAT,稱為CAAT框(CAATbox),是RNA聚合酶緊密結(jié)合區(qū);GC框位于-80~-110bp處,是RNA聚合酶識(shí)別區(qū)。55第55頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋97.負(fù)反饋調(diào)節(jié)和正反饋?zhàn)饔梅答佌{(diào)節(jié)系統(tǒng)分負(fù)反饋調(diào)節(jié)和正反饋調(diào)節(jié),前者指反饋信息與控制信息作用性質(zhì)相反的反饋,起糾正、減弱控制信息的作用;后者起加強(qiáng)控制信息的作用。前反饋?zhàn)饔眉礊榻?jīng)過(guò)一系列生化代謝反應(yīng)產(chǎn)生的最終產(chǎn)物可作為反饋物作用在代謝過(guò)程的第一酶上,從而抑制或阻礙以后的反應(yīng)過(guò)程。56第56頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋98.snoRNA核仁小RNA,是近來(lái)生物學(xué)研究的熱點(diǎn),由內(nèi)含子編碼。已證明有多種功能,反義snoRNA指導(dǎo)rRNA核糖甲基化。snoRNA與其它RNA的處理和修飾有關(guān),如核糖體和剪接體核小RNA、gRNA等。snoRNA是一個(gè)與特性化的非編碼RNA相關(guān)的大家族。57第57頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋99.RACE技術(shù)RACE(rapid-amplificationofcDNAends)是通過(guò)PCR進(jìn)行cDNA末端快速克隆的技術(shù),通過(guò)PCR技術(shù)實(shí)現(xiàn)的,無(wú)須建立cDNA文庫(kù),可以在很短的時(shí)間內(nèi)獲得有利用價(jià)值的信息。RACE是基于PCR技術(shù)基礎(chǔ)上由已知的一段cDNA片段,通過(guò)往兩端延伸擴(kuò)增從而獲得完整的3'端和5'端的方法。58第58頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋100.泛素化和去泛素化泛素是一類低分量的蛋白質(zhì),泛素化是指泛素分子在一系列酶作用下,對(duì)靶蛋白進(jìn)行特異性修飾的過(guò)程。這些酶包括泛素激活酶,結(jié)合酶、連結(jié)酶和降解酶等系列的修飾過(guò)程。它在蛋白質(zhì)的定位、代謝、功能、調(diào)節(jié)和降解中都起著十分重要的作用。參與細(xì)胞周期、增殖、凋亡、分化、轉(zhuǎn)移、基因表達(dá)、轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)、信號(hào)傳遞、損傷修復(fù)、炎癥免疫等幾乎一切生命活動(dòng)的調(diào)控。在腫瘤、心血管等疾病發(fā)病中起著十分重要作用。去泛素化功能則相反。59第59頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三一、名詞解釋60第60頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三二、簡(jiǎn)答題1.DDRD-PCR和phagedisplay的原理是什么?定量PCR,即實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù),不僅實(shí)現(xiàn)了PCR從定性到定量的飛躍,而且與常規(guī)PCR相比,它具有特異性更強(qiáng)、有效解決PCR污染問題、自動(dòng)化程度高等特點(diǎn)。實(shí)時(shí)定量PCR(real-timequantitativePCR)是指在PCR指數(shù)擴(kuò)增期間通過(guò)連續(xù)監(jiān)測(cè)熒光信號(hào)強(qiáng)弱的變化來(lái)即時(shí)測(cè)定特異性產(chǎn)物的量,并據(jù)此推斷目的基因的初始量,不需要取出PCR產(chǎn)物進(jìn)行分離。目前實(shí)時(shí)定量PCR作為一個(gè)極有效的實(shí)驗(yàn)方法,已被廣泛地應(yīng)用于分子生物學(xué)研究的各個(gè)領(lǐng)域。Phagedisplay噬菌體表面展示技術(shù):

噬菌體表面展示技術(shù)是一種對(duì)多肽功能非常有效的篩選技術(shù),即將外源蛋白分子或多肽的基因克隆到絲狀噬菌體基因組中,與噬菌體外膜蛋白融合表達(dá),展示在噬菌體顆粒的表面,因此,通過(guò)表型篩選就可以獲得它的編碼基因。應(yīng)用噬菌體表面展示技術(shù)可以從多肽庫(kù)中進(jìn)行快速篩選,從而成為藥物開發(fā)的強(qiáng)有力工具。61第61頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三二、簡(jiǎn)答題2.DNA復(fù)制涉及許多種酶,其主要作用是什么?(1)大腸桿菌DNA聚合酶(3種)①polI:催化5'→3'的聚合作用,合成20個(gè)核苷酸即離開模板,填充空隙。3'→5'外切酶活性,去除錯(cuò)誤堿基,有校對(duì)作用。5'→3'外切酶活性,去除RNA引物及修正錯(cuò)誤堿基。②polII:催化5'→3'DNA合成并具有3'→5'外切酶活性,體內(nèi)功能不清楚。③polⅢ:DNA鏈延長(zhǎng)起主要作用,細(xì)菌中以1000dNTP/秒進(jìn)行聚合反應(yīng)。3'→5'外切酶活性,校對(duì)作用,與polI配合使錯(cuò)誤率降至10-6。如圖所示DNA復(fù)制的保真性:遵守嚴(yán)格的堿基配對(duì)規(guī)律。聚合酶對(duì)堿基的選擇功能。聚合酶對(duì)錯(cuò)誤堿基的校讀作用。以上三種作用確保了DNA復(fù)制的準(zhǔn)確性。(2)真核生物DNA聚合酶特性與大腸桿菌相似,共五種:α、β、γ、δ、ε①polδ:催化前導(dǎo)鏈及隨從鏈的合成,需增殖細(xì)胞核抗原蛋白的參與。②polα:與引發(fā)酶配合,參與隨從鏈的合成。③RFA(replicationfactorA):DNA延長(zhǎng)中RNA與單鏈結(jié)合起到SSB的作用。62第62頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三二、簡(jiǎn)答題3.DNA復(fù)制與蛋白質(zhì)合成各用什么機(jī)制維持合成的忠實(shí)性?DNA復(fù)制的保真性:遵守嚴(yán)格的堿基配對(duì)規(guī)律。α-聚合酶對(duì)堿基的選擇功能。聚合酶對(duì)錯(cuò)誤堿基的校讀作用。以上三種作用確保了DNA復(fù)制的準(zhǔn)確性。63第63頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三二、簡(jiǎn)答題4.DNA甲基化作用的意義何在?答:DNA甲基化(DNAmethylation):能引起染色質(zhì)結(jié)構(gòu)、DNA構(gòu)象、DNA穩(wěn)定性及DNA與蛋白質(zhì)相互作用方式的改變,從而控制基因表達(dá)。在甲基轉(zhuǎn)移酶的催化下,DNA的CG兩個(gè)核苷酸的胞嘧啶被選擇性地添加甲基,形成5-甲基胞嘧啶,這常見于基因的5'-CG-3'序列。(1)DNA甲基化可引起基因組中相應(yīng)區(qū)域染色質(zhì)結(jié)構(gòu)變化,使DNA失去核酶;(2)限制性內(nèi)切酶的切割位點(diǎn),以及DNA酶的敏感位點(diǎn),使染色質(zhì)高度螺旋化,凝縮成團(tuán),失去轉(zhuǎn)錄活性。(3)5位C甲基化的胞嘧啶脫氨基生成胸腺嘧啶,由此可能導(dǎo)致基因置換突變,發(fā)生堿基錯(cuò)配。DNA甲基轉(zhuǎn)移酶有兩種

DNA去甲基化有兩種方式:1)被動(dòng)途徑:由于核因子NF粘附甲基化的DNA,使粘附點(diǎn)附近的DNA不能被完全甲基化,從而阻斷DNMT1的作用;2)主動(dòng)途徑:是由去甲基酶的作用,將甲基集團(tuán)移去的過(guò)程。64第64頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三二、簡(jiǎn)答題5.Lac+大腸桿菌轉(zhuǎn)入含Lac的培養(yǎng)基中,Lac操縱子如何開啟?加入葡萄糖后,情況又如何?答:(1)阻遏蛋白的負(fù)性調(diào)節(jié):沒有乳糖存在時(shí),I基因編碼的阻遏蛋白結(jié)合于操縱序列O處,乳糖操縱子處于阻遏狀態(tài),不能合成分解乳糖的3種酶;有乳糖存在時(shí),乳糖作為誘導(dǎo)物誘導(dǎo)阻遏蛋白變構(gòu),不能結(jié)合于操縱序列,乳糖操縱子被誘導(dǎo)開放合成分解乳糖的3種酶。所以,乳糖操縱子的這種調(diào)控機(jī)制為可誘導(dǎo)的負(fù)調(diào)控。(2)CAP的正性調(diào)節(jié):在啟動(dòng)子上游有CAP結(jié)合位點(diǎn),當(dāng)大腸桿菌從以葡萄糖為碳源的環(huán)境轉(zhuǎn)變?yōu)橐匀樘菫樘荚吹沫h(huán)境時(shí),cAMP濃度升高,與CAP結(jié)合,使CAP發(fā)生變構(gòu),CAP結(jié)合于乳糖操縱子啟動(dòng)序列附近的CAP結(jié)合位點(diǎn),激活RNA聚合酶活性,促進(jìn)結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄,調(diào)節(jié)蛋白結(jié)合于操縱子后促進(jìn)結(jié)構(gòu)基因的轉(zhuǎn)錄,對(duì)乳糖操縱子實(shí)行正調(diào)控,加速合成分解乳糖的3種酶。(3)協(xié)調(diào)調(diào)節(jié):乳糖操縱子中的I基因編碼的阻遏蛋白的負(fù)調(diào)控與CAP的正調(diào)控兩種機(jī)制,互相協(xié)調(diào)、互相制約。65第65頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三二、簡(jiǎn)答題6.PCR反應(yīng)也是一種DNA復(fù)制過(guò)程,為什么會(huì)有很多差錯(cuò)?如何克服?答:原因(1)聚合酶聚合錯(cuò)誤;(2)在合成新鏈后,DNA聚合酶I出現(xiàn)校正失誤;(3)在連接酶連接時(shí),岡崎片段連接失誤;(4)去掉RNA引物時(shí),去掉堿基的多和少出現(xiàn)的錯(cuò)誤??朔海?)確保樣本DNA的純度;(2)選擇正規(guī)廠家的DNA聚合酶、連接酶、RNA聚合酶和RNA酶;(3)保證各種溫度和時(shí)間的準(zhǔn)確性66第66頁(yè),共80頁(yè),2023年,2月20日,星期三二、簡(jiǎn)答題7.RFLP和RAPD的原理是什么?限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性(restrictionfragmentlengthpolymorphism,縮寫RFLP)技術(shù)的原理是檢測(cè)DNA在限制性內(nèi)切酶酶切后形成的特定DNA片段的大小。因此,凡是可以引起酶切位點(diǎn)變異的突變?nèi)琰c(diǎn)突變(新產(chǎn)生和去除酶切位點(diǎn))和一段DNA的重新組織(如插入和缺失造成酶切位點(diǎn)間的長(zhǎng)度發(fā)生變化)等均可導(dǎo)致RFLP的產(chǎn)生。RAPD技術(shù)的全稱是隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性DNA(RandomAmplifiedPolymorphicDNA),此技術(shù)建立于PCR基礎(chǔ)之上,使用一系列具有10個(gè)左右堿基的單鏈隨機(jī)引物,對(duì)基因組的DNA全部進(jìn)行PCR擴(kuò)增,以檢測(cè)多態(tài)性。

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