臨床微生物學概述要

臨床微生物學概述要第一頁，共三十四頁，編輯于2023年，星期四彩色字及講義的楷體字為考試內容第二頁，共三十四頁，編輯于2023年，星期四臨床常見微生物分類

類科屬種G+球菌細球菌科葡萄球菌屬金黃色葡萄球菌（金葡菌）凝固酶陰性葡萄球菌（CNS）

表皮葡萄球菌（表葡菌）腐生/溶血葡萄球菌等鏈球菌科鏈球菌屬

α溶血性鏈球菌:草綠色鏈球菌β溶血性鏈球菌:化膿鏈球菌（A組）無乳鏈球菌（B組）肺炎鏈球菌、牛鏈球菌等腸球菌屬糞腸球菌、屎腸球菌G+桿菌芽胞桿菌科芽胞桿菌屬炭疽芽胞桿菌、枯草芽胞桿菌蠟樣芽胞桿菌等乳桿菌科李斯特菌屬產(chǎn)單核細胞李斯特菌棒狀桿菌科棒狀桿菌屬白喉棒狀桿菌、棒狀桿菌JK等第三頁，共三十四頁，編輯于2023年，星期四臨床常見微生物分類草綠色鏈球菌（甲型溶血性鏈球菌）血鏈球菌米勒鏈球菌輕型鏈球菌（緩癥鏈球菌）唾液鏈球菌變異鏈球菌豬鏈球菌第四頁，共三十四頁，編輯于2023年，星期四臨床常見微生物分類____G+桿菌

分枝桿菌科分枝桿菌屬

結核分枝桿菌、麻風分枝桿菌

非典型分枝桿菌（鳥分枝桿菌等）諾卡菌科諾卡菌屬星型諾卡菌、巴西諾卡菌等第五頁，共三十四頁，編輯于2023年，星期四

G-桿菌___腸桿菌科埃希菌屬大腸埃希菌檸檬酸菌屬

弗勞地檸檬酸桿菌（枸櫞酸桿菌）、（枸櫞酸菌屬）異型檸檬酸桿菌（枸櫞酸桿菌）等沙門菌屬

傷寒沙門菌、副傷寒甲/乙/丙沙門菌

豬霍亂沙門菌、鼠傷寒沙門菌、腸炎沙門菌第六頁，共三十四頁，編輯于2023年，星期四

G-桿菌___腸桿菌科志賀菌屬痢疾志賀菌、福氏志賀菌鮑氏志賀菌、宋氏志賀菌克雷伯菌屬

肺炎克雷伯菌、產(chǎn)酸克雷伯菌等腸桿菌屬

陰溝腸桿菌、產(chǎn)氣腸桿菌

聚團腸桿菌、坂畸腸桿菌第七頁，共三十四頁，編輯于2023年，星期四臨床常見微生物分類

類科屬種G-桿菌腸桿菌科

愛德華菌屬遲鈍愛德華菌摩根菌屬摩根桿菌哈夫尼亞菌屬蜂窩哈夫尼亞菌沙雷菌屬粘質沙雷菌等變形桿菌屬普通變形桿菌、奇異變形桿菌耶爾森菌屬鼠疫耶爾森菌、假結核耶爾森菌等普羅威登菌屬產(chǎn)鹼/雷極/司徒普羅威登菌G-球菌奈瑟球菌科奈瑟球菌屬腦膜炎奈瑟球菌（A/C）淋病奈瑟球菌等

第八頁，共三十四頁，編輯于2023年，星期四臨床常見微生物分類

類科屬種發(fā)酵G-桿菌弧菌科弧菌屬霍亂弧菌、ElTor弧菌副溶血弧菌等鄰單胞菌屬類志賀鄰單胞菌氣單胞菌屬親水氣單胞菌巴斯德菌科巴斯德菌屬多殺桿菌、溶血巴斯德菌非發(fā)酵G－桿菌假單胞菌科伯克霍德爾菌屬洋蔥伯克霍德爾菌類鼻疽伯克霍德爾菌假單胞菌屬不動桿菌屬

窄食單胞菌屬銅綠假單胞菌/熒光假單胞菌惡臭/馬鼻疽假單胞菌

鮑曼/洛菲不動桿菌乙酸/溶血不動桿菌嗜麥芽窄食單胞菌第九頁，共三十四頁，編輯于2023年，星期四臨床常見微生物分類___非發(fā)酵G-桿菌

黃桿菌屬

腦膜敗血性黃桿菌等

產(chǎn)堿桿菌屬

糞產(chǎn)堿桿菌莫拉菌屬

卡他莫拉菌等第十頁，共三十四頁，編輯于2023年，星期四臨床常見微生物分類

類科屬種G+球桿菌

軍團菌科軍團菌屬嗜肺軍團菌巴爾通體科巴爾通體屬桿狀巴爾通體

布魯菌屬牛/羊/豬布魯桿菌鮑特菌屬百日咳/副百日咳桿菌彎曲桿菌科彎曲桿菌屬大腸彎曲桿菌等埃里希體科嗜血桿菌屬流感/杜克嗜血桿菌螺桿菌屬幽門螺桿菌G+厭氧球菌消化球菌科消化球菌屬消化球菌消化鏈球菌屬厭氧消化鏈球菌費氏球菌科費氏球菌屬小費氏球菌G－厭氧球菌韋榮球菌科韋榮球菌屬小韋榮球菌第十一頁，共三十四頁，編輯于2023年，星期四

臨床常見微生物分類

類

科屬種G-厭氧桿菌擬桿菌科擬桿菌屬脆弱擬桿菌等梭桿菌屬核梭桿菌、產(chǎn)壞死梭桿菌G+厭氧芽胞桿菌梭菌科梭菌屬破傷風桿菌、產(chǎn)氣莢膜桿菌肉毒桿菌、難辨梭菌G+厭氧無芽胞桿菌放線菌科放線菌屬雙歧桿菌屬

牛型放線菌、伊氏放線菌兩歧雙歧桿菌、牙雙歧桿菌乳桿菌屬鏈狀乳桿菌丙酸桿菌屬痤瘡丙酸桿菌立克次體立克次體科無形體科立克次體屬無形體屬斑疹傷寒立克次體人粒細胞無形體第十二頁，共三十四頁，編輯于2023年，星期四臨床常見微生物分類

類科屬種衣原體衣原體科衣原體屬沙眼衣原體、肺炎衣原體鸚鵡熱衣原體

支原體支原體科支原體屬肺炎支原體、人型支原體脲原體屬溶脲脲原體螺旋體螺旋體科密螺旋體屬梅毒螺旋體

鉤端螺旋體科鉤端螺旋體屬鉤端螺旋體深部真菌隱球酵母科念珠菌屬（假絲酵母菌）白色念珠菌/熱帶/近平滑念珠菌/克柔/光滑念珠菌隱球菌屬新形隱球菌叢梗孢子科曲霉屬煙曲霉、黃曲霉組織胞漿菌屬

莢膜組織胞漿菌等第十三頁，共三十四頁，編輯于2023年，星期四臨床常見微生物分類___深部真菌

叢梗孢科

芽生菌屬

皮炎芽生菌

毛霉屬總狀/分枝毛霉等

肺孢子蟲（菌）伊氏肺孢子蟲（人）、卡氏肺孢子蟲（鼠）第十四頁，共三十四頁，編輯于2023年，星期四2003-2005年銅陵地區(qū)監(jiān)測.類別菌株數(shù)%總菌株3448100革蘭陽性菌125336腸桿菌科102230非發(fā)酵菌100229第十五頁，共三十四頁，編輯于2023年，星期四2003-2005年銅陵地區(qū)監(jiān)測.類別菌株數(shù)%所有革蘭陽性菌1253100葡萄球菌90472

凝固酶陰性葡萄球菌63551

金葡菌26922腸球菌屬15413其他革蘭陽性菌19516第十六頁，共三十四頁，編輯于2023年，星期四2003-2005年銅陵地區(qū)監(jiān)測.類別菌株數(shù)%腸桿菌科1022100大腸埃希菌43743克雷伯菌屬24224腸桿菌屬18718其他腸桿菌科15616第十七頁，共三十四頁，編輯于2023年，星期四2003-2005年銅陵地區(qū)監(jiān)測.類別菌株數(shù)%非發(fā)酵G-桿菌1002100銅綠假單胞菌43644不動桿菌屬33834嗜麥芽窄食單胞菌10611其他非發(fā)酵G-桿菌12212第十八頁，共三十四頁，編輯于2023年，星期四人體正常菌群部位主要微生物（條件致病菌）皮膚葡萄球菌屬、厭氧球菌、銅綠假單胞菌（綠膿桿菌）JK群棒狀桿菌口腔表葡菌、α溶血/非溶血性鏈球菌、肺炎鏈球菌、腸球菌屬、奈瑟球菌屬、卡他莫拉菌、嗜血桿菌屬、大腸埃希菌、類白喉桿菌、乳桿菌、厭氧球菌、擬桿菌屬(如產(chǎn)黑色素擬桿菌)、梭桿菌屬、念珠菌鼻咽腔葡萄球菌屬、α和β溶血性鏈球菌、肺炎鏈球菌、奈瑟球菌屬、嗜血桿菌屬、大腸埃希菌、變形桿菌屬、厭氧球菌、白色念珠菌等

眼結膜表葡菌、JK群棒狀桿菌、丙酸桿菌等腸道大腸桿菌、產(chǎn)氣桿菌、變形桿菌屬、銅綠假單胞菌、葡萄球菌屬、腸球菌屬、產(chǎn)氣莢膜桿菌、雙岐桿菌、消化球菌、消化鏈球菌、擬桿菌屬（如脆弱擬桿菌）、梭桿菌屬、白色念珠菌（假絲酵母菌）

前尿道表葡菌、腸球菌屬、JK群棒狀桿菌等陰道乳桿菌、大腸埃希菌、JK群棒狀桿菌腸球菌屬、奈瑟球菌、擬桿菌屬、厭氧球菌第十九頁，共三十四頁，編輯于2023年，星期四臨床細菌學標本的采集與檢查標本采集的注意事項血標本的采集與檢查痰標本的采集與檢查尿標本的采集與檢查糞培養(yǎng)標本感染傷口或膿腫標本腦脊液標本其他體液標本（胸水、腹水、心包液、滑膜腔液）

第二十頁，共三十四頁，編輯于2023年，星期四臨床標本采集的注意事項盡可能在應用抗菌藥物之前采集。清晨的痰、尿含菌量較多，是采集標本的最佳時間。成人一次采血10-20ml平均注入兩個培養(yǎng)瓶中。成人同時在不同部位采集2-3（需氧、厭氧瓶各一瓶為一套）血培養(yǎng)標本培養(yǎng)。對于成年患者的血培養(yǎng)，只采集一瓶的血培養(yǎng)標本是不允許的，因為一套標本的培養(yǎng)結果很難解釋是致病菌還是污染菌。嬰兒、兒童血標本菌量較多，一般1～5ml即可。骨髓培養(yǎng)需2ml。棉試子標本置培養(yǎng)基內送檢。

厭氧菌的標本應在厭氧環(huán)境下運送。解釋培養(yǎng)結果時應考慮到抗菌藥物使用史。

除血、糞標本外，均應同時行常規(guī)的涂片、染色鏡檢。第二十一頁，共三十四頁，編輯于2023年，星期四臨床血標本的采集與檢查

采集時間多數(shù)情況下如血流感染其菌血癥可能為間歇性，宜在畏寒初起1h內或發(fā)熱前采血。感染性心內膜炎、動脈內膜炎、早期傷寒及布魯菌病等菌血癥常持續(xù)存在，可予24h內每小時采血一次，連續(xù)2～3次。瘧疾不應在發(fā)熱時或熱退后立即采血，宜于兩次熱峰間采集。第二十二頁，共三十四頁，編輯于2023年，星期四臨床血標本的采集與檢查采血量與培養(yǎng)基之比以1:5～1:10(v/v)為宜，血過多不能中和血液中正常殺菌活性。按上述要求采血1次血培養(yǎng)檢出大約80%病原菌；2次培養(yǎng)約為90%；3次培養(yǎng)約為99%。培養(yǎng)基：除普通增菌培養(yǎng)基外最好同時接種高滲培養(yǎng)基以檢出可能存在的L型菌。此外，若作厭氧菌、結核桿菌、真菌培養(yǎng)均應選擇相應培養(yǎng)基。檢查程序：一般細菌標本35～36℃常規(guī)培養(yǎng)7天。每天觀察，若有菌生長則予涂片革蘭染色鏡檢并作口頭報告。同時移種鑒定并做藥敏，結果書面報告。

第二十三頁，共三十四頁，編輯于2023年，星期四臨床血標本的采集與檢查2、采血方法(1)不要與血氣和血沉標本一起采血；(2)不宜在靜脈導管或靜脈留置口采血;(3)不推薦靜脈血直接入瓶；(4)不推薦血入瓶前更換針頭。3、標本盡早送細菌室,延遲送的標本放常溫,不能放冰箱。第二十四頁，共三十四頁，編輯于2023年，星期四臨床痰標本的采集與檢查

痰標本的采集1、痰標本的采集(1)晨起予生理鹽水3次漱口后深咳，3min內咳出的痰予以滅菌容器收集并立即送檢。(2)無痰或痰量極少時可用3%-5%的NaCl溶液5ml先霧化吸入5min，進行導痰。當NaCl濃度過高時，患者常常不能耐受，所以氣道高反應的患者如哮喘患者不宜用此法。(3)嬰幼兒可予清晨胃管內抽吸胃液采集痰標本，小兒可用壓舌板刺激咳出痰液，用滅菌拭子采集痰標本。第二十五頁，共三十四頁，編輯于2023年，星期四痰標本的采集與檢查—痰標本的處理痰標本應及時處理接種。方法是先予生理鹽水洗滌痰表面3次，然后加等量N-乙酰半胱氨酸研磨消化粘稠痰，再將痰涂片染色鏡檢。如鱗狀上皮細胞每低倍視野<10個，膿細胞及中性粒細胞>20個則為合格痰標本，予以接種培養(yǎng)并作菌落計數(shù)。反之則為唾液污染之痰，需重新采集送檢。對環(huán)甲膜下穿刺、纖支鏡刷洗液或灌洗液、纖支鏡活檢、經(jīng)皮肺活檢標本無需作上述處理。這類標本的檢查對分枝桿菌、真菌、軍團病、卡氏肺孢子蟲感染的診斷尤有價值。第二十六頁，共三十四頁，編輯于2023年，星期四臨床尿標本的采集與檢查尿標本的采集(1)尿路感染治療前應送培養(yǎng)以作對比。有癥狀病人用抗菌藥物前至少送檢1次；無癥狀者用藥前需2～3次尿培養(yǎng)。(2)應采集晨起第一次小便。更換導尿管之后即應采集尿標本。(3)成人留取清潔中段尿，小兒可行恥骨上穿刺采集標本。膀胱鏡及逆行腎盂造影時取尿均可。第二十七頁，共三十四頁，編輯于2023年，星期四臨床尿標本的采集與檢查尿標本的保潔保鮮尿標本需用可靠無菌容器，及時送檢，1h內接種。尿標本檢查

首先離心后沉渣涂片鏡檢，了解是否有膿細胞、紅細胞及管型。

然后將尿沉渣涂片革蘭染色找細菌，若每高倍視野>2個則每毫升尿細菌≥105CFU，臨床多有意義。

最后將尿標本接種培養(yǎng)并作菌落計數(shù)。

第二十八頁，共三十四頁，編輯于2023年，星期四尿標本的采集與檢查—結果解釋菌落≥105CFU/ml有臨床意義。有尿感癥狀但菌落≤104/ml其原因有

飲水過多尿被稀釋、

尿PH<5、

尿比重<1.003、

尿中有抗菌藥物、

輸尿管有堵塞或慢性腎盂腎炎等，應進一步查明。第二十九頁，共三十四頁，編輯于2023年，星期四臨床糞培養(yǎng)標本

盡可能在用抗菌藥物之前采集標本。標本勿混有尿液。新鮮糞便應盡快接種，放置不超過1h。盡可能送膿血粘液部分。培養(yǎng)陽性率為膿血便>粘便>稀便>成形便。對于癥狀明顯而培養(yǎng)陰性者至少連送