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分子檢測(cè)技術(shù)在腫瘤中的應(yīng)用演示文稿當(dāng)前第1頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期四\20點(diǎn)分子檢測(cè)技術(shù)在腫瘤中的應(yīng)用當(dāng)前第2頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期四\20點(diǎn)熒光原位雜交(Fluorescenceinsituhybridization,F(xiàn)ISH
)技術(shù)
當(dāng)前第3頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期四\20點(diǎn)簡(jiǎn)介FISH=FluorescenceInSituHybridization利用熒光標(biāo)記的DNA探針檢測(cè)組織或細(xì)胞內(nèi)與其互補(bǔ)的DNA片段應(yīng)用:遺傳病診斷血液腫瘤實(shí)體瘤樣本:羊水、絨毛、流產(chǎn)組織、外周血、骨髓、體液及各種腫瘤組織等當(dāng)前第4頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期四\20點(diǎn)用已知的標(biāo)記單鏈核酸為探針,按照堿基互補(bǔ)的原則,與待檢材料中未知的單鏈核酸進(jìn)行異性結(jié)合,形成可被檢測(cè)的雜交雙鏈核酸。由于DNA分子在染色體上是沿著染色體縱軸呈線性排列,因而可以探針直接與染色體進(jìn)行雜交從而將特定的基因在染色體上定位熒光標(biāo)記探針探針變性樣本DNA變性雜交工作原理當(dāng)前第5頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期四\20點(diǎn)FISH檢測(cè)染色體易位(Translocation)在淋巴瘤分型中的應(yīng)用FISH技術(shù)在淋巴造血系統(tǒng)腫瘤中的應(yīng)用當(dāng)前第6頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期四\20點(diǎn)檢測(cè)技術(shù)特點(diǎn)不同類(lèi)型的淋巴瘤染色體易位類(lèi)型不同優(yōu)點(diǎn)適用于形態(tài)學(xué)上難以診斷且IHC結(jié)果不理想的標(biāo)本;適用于細(xì)胞數(shù)量少,形態(tài)不典型的活檢及穿刺組織。必須結(jié)合組織形態(tài)學(xué)和免疫組化結(jié)果作最后診斷?。?!當(dāng)前第7頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期四\20點(diǎn)FISH基因檢測(cè)在淋巴瘤的應(yīng)用淋巴瘤FISH檢測(cè)基因臨床應(yīng)用套細(xì)胞淋巴瘤IGH/CCND1融合基因輔助診斷濾泡性淋巴瘤BCL2/IGH融合基因輔助診斷、判斷預(yù)后彌漫性大B細(xì)胞淋巴瘤BCL6基因斷裂重組輔助診斷、判斷預(yù)后伯基特淋巴瘤C-MYC基因斷裂重組輔助診斷粘膜相關(guān)淋巴組織淋巴瘤MALTI基因斷裂輔助診斷胃粘膜相關(guān)淋巴組織淋巴瘤API2-MALTI融合基因指導(dǎo)治療當(dāng)前第8頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期四\20點(diǎn)彌漫大B細(xì)胞淋巴瘤(DLBCL)
按免疫組化亞型分為
CD5陽(yáng)性DLBCL
生發(fā)中心B細(xì)胞樣變型(GCB)、非生發(fā)中心B細(xì)胞樣變型(non-GCB)3類(lèi)可根據(jù)CD10、BCL6、MUM1的表達(dá)區(qū)分生發(fā)中心B細(xì)胞樣變型、非生發(fā)中心B細(xì)胞樣變型。>30%瘤細(xì)胞表達(dá)CD10或CD10(-)、BCL-6(+)、MUM-1(-)診斷為GCB;其他病例則為non-GCB。
當(dāng)前第9頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期四\20點(diǎn)◆BCL6基因斷裂---輔助診斷彌漫性大B細(xì)胞淋巴瘤◆BCL6基因斷裂重排----判斷預(yù)后目前研究確定至少40%的DLBCL涉及BCL6基因重排。
一項(xiàng)針對(duì)102名DLBCL患者的BCL6重排情況及其與預(yù)后關(guān)系的研究顯示,BCL6陽(yáng)性患者診斷治療36個(gè)月后,疾病停止發(fā)展的比率為82%,攜帶有BCL6重排的病例預(yù)后較好。BCL6基因斷裂與彌漫性大B細(xì)胞淋巴瘤當(dāng)前第10頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期四\20點(diǎn)當(dāng)前第11頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期四\20點(diǎn)Offit,K.NEnglJMed,1994.331(2):p.74-80.結(jié)果判讀當(dāng)前第12頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期四\20點(diǎn)IGH/CCND1融合基因可見(jiàn)于95%的套細(xì)胞淋巴瘤,是套細(xì)胞淋巴瘤與其他淋巴瘤鑒別的重要指標(biāo)。IGH/CCND1融合基因--輔助診斷套細(xì)胞淋巴瘤。IGH/CCND1融合基因與套細(xì)胞淋巴瘤當(dāng)前第13頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期四\20點(diǎn)l正常細(xì)胞:兩個(gè)紅色信號(hào),兩個(gè)綠色信號(hào)。l異常細(xì)胞:一個(gè)紅色信號(hào),一個(gè)綠色信號(hào),兩個(gè)融合信號(hào)。當(dāng)前第14頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期四\20點(diǎn)API2/MALT1基因檢測(cè)試劑盒
探針:GLPAPI2/GLPMALT1凋亡抑制因子2基因(apoptosisinhibitor-2,API2),位于11號(hào)染色體;粘膜相關(guān)淋巴組織基因(Mucosa-associatedlymphoidtissue1,MALT1
),位于18號(hào)染色體。
API2基因與MALT1基因的融合導(dǎo)致凋亡抑制的增加,引起細(xì)胞不依賴(lài)于抗原刺激的生存優(yōu)勢(shì)。
當(dāng)前第15頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期四\20點(diǎn)
API2/MALT1融合基因的檢測(cè)可以指導(dǎo)抗HP治療胃MALT淋巴瘤與幽門(mén)螺旋桿菌(HP)感染導(dǎo)致的慢性胃炎有關(guān),MALT1/API2融合基因陰性的患者抗HP治療有效,陽(yáng)性患者抗HP治療無(wú)效。API2/MALT1融合基因檢測(cè)意義
當(dāng)前第16頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期四\20點(diǎn)l正常細(xì)胞:兩個(gè)紅色信號(hào),兩個(gè)綠色信號(hào)。l異常細(xì)胞:一個(gè)紅色信號(hào),一個(gè)綠色信號(hào),兩個(gè)融合信號(hào)。當(dāng)前第17頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期四\20點(diǎn)BCL2/IGH重排發(fā)生在約80%-85%的FL患者中,檢測(cè)BCL2/IGH基因重排可以輔助診斷FL。
BCL2/IGH陰性的FL患者3年生存率為100%,而陽(yáng)性者只有54%;陰性者3年疾病無(wú)進(jìn)展為87.5%,而陽(yáng)性者只有13%。BCL2/IGH融合基因與濾泡性淋巴瘤
BCL2/IGH融合基因-----輔助診斷濾泡性淋巴瘤
BCL2/IGH融合基因-----判斷預(yù)后當(dāng)前第18頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期四\20點(diǎn)l正常細(xì)胞:兩個(gè)紅色信號(hào),兩個(gè)綠色信號(hào)。l異常細(xì)胞:一個(gè)紅色信號(hào),一個(gè)綠色信號(hào),兩個(gè)融合信號(hào)。當(dāng)前第19頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期四\20點(diǎn)結(jié)果判讀-陽(yáng)性結(jié)果當(dāng)前第20頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期四\20點(diǎn)結(jié)果判讀-陽(yáng)性結(jié)果當(dāng)前第21頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期四\20點(diǎn)
約80%的伯基特淋巴瘤病例發(fā)生t(8;14)(q24;q32);約15%的伯基特淋巴瘤病例發(fā)生t(2;8)(p11;q24);約5%發(fā)生t(8;22)(q24;q11)。
染色體易位導(dǎo)致C-MYC基因斷裂重組可能是伯基特淋巴瘤的一個(gè)標(biāo)志,可以應(yīng)用于臨床上伯基特淋巴瘤的輔助診斷。C-MYC基因斷裂與伯基特淋巴瘤輔助診斷伯基特淋巴瘤
當(dāng)前第22頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期四\20點(diǎn)當(dāng)前第23頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期四\20點(diǎn)結(jié)果判讀-陽(yáng)性結(jié)果當(dāng)前第24頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期四\20點(diǎn)FISH技術(shù)在乳腺癌靶向治療應(yīng)用當(dāng)前第25頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期四\20點(diǎn)乳腺癌
Her-2基因
致癌基因:Her-2基因;位點(diǎn):17q11.2-q12;編碼蛋白:跨膜蛋白(與表皮生長(zhǎng)因子受體部分同源);
25-30%乳腺癌病人都有HER-2的擴(kuò)增;
HER-2基因擴(kuò)增是決定Herceptin治療是否有效的關(guān)鍵性指標(biāo)。HER2擴(kuò)增的乳腺癌更具有侵襲性生長(zhǎng)能力。當(dāng)前第26頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期四\20點(diǎn)乳腺癌Her-2基因及蛋白檢測(cè)Cerb-B-2:3+
完全強(qiáng)膜陽(yáng)性細(xì)胞>30%
2+,1+,-
FISH檢測(cè)是否有基因擴(kuò)增當(dāng)前第27頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期四\20點(diǎn)Her2基因檢測(cè)流程石蠟組織標(biāo)本IHC檢測(cè)再用FISH方法檢測(cè)—1+3+2+—+Herceptin治療+再用FISH方法檢測(cè)Herceptin治療FISH檢測(cè)+—再用FISH方法檢測(cè)+當(dāng)前第28頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期四\20點(diǎn)A.無(wú)須計(jì)數(shù)的大簇團(tuán)信號(hào)(高度擴(kuò)增)B.顆粒狀信號(hào)(R>10,高度擴(kuò)增)C.須計(jì)數(shù)的顆粒狀信號(hào)(R=3.5,低度擴(kuò)增)ACBHer-2基因擴(kuò)增狀況當(dāng)前第29頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期四\20點(diǎn)>30%的腫瘤細(xì)胞全部的細(xì)胞膜高強(qiáng)度著色免疫組化(3+)與FISH對(duì)比×40×100浸潤(rùn)性導(dǎo)管癌Ⅱ級(jí)IHC:+++FISH:呈簇團(tuán)狀高度擴(kuò)增×100當(dāng)前第30頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期四\20點(diǎn)免疫組化(-)與FISH擴(kuò)增陽(yáng)性浸潤(rùn)性導(dǎo)管癌Ⅱ級(jí)IHC:-FISH:呈簇狀擴(kuò)增腫瘤細(xì)胞不著色×40×100當(dāng)前第31頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期四\20點(diǎn)基因突變檢測(cè)方法當(dāng)前第32頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期四\20點(diǎn)1.RNA酶A切割(RnaseAcleavage)2.變性梯度凝膠電泳(DGGE)3.雜合雙鏈分析法(HA)4.化學(xué)切割錯(cuò)配(CCM)5.碳化二亞胺檢測(cè)(Carbodiimide,CDI)6.酶促切割錯(cuò)配(EnzymeMismatchCleavage,EMC)7.單鏈構(gòu)象多態(tài)性(Single-StrandConformation)8.切割片段長(zhǎng)度多態(tài)性9.DNA測(cè)序(Sequencing)10.雙脫氧指紋圖譜法(DideoxyFinger-printing,ddF)11.錯(cuò)配接合蛋白檢測(cè)12.蛋白截短測(cè)試(proteintruncationtest)方法當(dāng)前第33頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期四\20點(diǎn)13.變性的高效液相色譜檢測(cè)(DenaturingHighPerformanceLiguldChromatographyDHPLC)14.DNA芯片技術(shù)(DNAchip)15.等位基因特異性擴(kuò)增16.等位基因特異性寡核苷酸片段分析(Allele-SpecificOligonucleotide,ASO)17.引物延伸檢測(cè)(PrimerExtension,PEX)18.寡核苷酸連接檢測(cè)(OligonucleotideLigationAssay,OLA)19.限制性片段分析(RestrictionFragmentAnalysis)20.突變體富集PCR法(mutant-enrichedPCR)21.蝎形探針擴(kuò)增阻滯突變系統(tǒng)(Scorpionsamplificationrefractorymutationsystem)當(dāng)前第34頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期四\20點(diǎn)肺癌組織EGFR基因擴(kuò)增和
突變檢測(cè)及其臨床意義當(dāng)前第35頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期四\20點(diǎn)研究背景研究顯示吉非替尼對(duì)部分晚期NSCLC患者的治療效果非常顯著。存在EGFR基因突變的患者更有可能對(duì)吉非替尼的治療敏感。存在EGFR基因擴(kuò)增的肺癌、腸癌病人對(duì)分子靶點(diǎn)藥物更為敏感。檢測(cè)大腸癌有無(wú)EGFR過(guò)度表達(dá),只要>1%的癌細(xì)胞的胞膜強(qiáng)陽(yáng)性染色即判斷為3+,可作為應(yīng)用西妥昔單抗的指征。當(dāng)前第36頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期四\20點(diǎn)
FISH檢測(cè)EGFR基因擴(kuò)增標(biāo)本類(lèi)型:石蠟包埋組織(手術(shù)、活檢、穿刺)冰凍組織胸、腹水沉渣細(xì)胞探針類(lèi)型:GLPEGFR/CSP7
定量PCR檢測(cè)EGFR基因突變分型突變類(lèi)型:19exon(2235-2249位點(diǎn))15bp缺失突變
19exon(2240-2257位點(diǎn))18bp缺失突變
19exon(2240-2251位點(diǎn))12bp缺失突變
21exon2573位點(diǎn)T>G堿基置換突變
21exon2582位點(diǎn)T>G堿基置換突變
EGFR基因變異檢測(cè)當(dāng)前第37頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期四\20點(diǎn)當(dāng)前第38頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期四\20點(diǎn)雙體性三體性多體性擴(kuò)增EGFR基因FISH檢測(cè)狀況肺癌石蠟當(dāng)前第39頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期四\20點(diǎn)當(dāng)前第40頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期四\20點(diǎn)
FQ-PCR分型技術(shù)檢測(cè)EGFR突變當(dāng)前第41頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期四\20點(diǎn)存在EGFR突變肺癌樣本的瓊脂糖凝膠電泳圖71例肺癌組織中檢測(cè)出6例突變樣本當(dāng)前第42頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期四\20點(diǎn)FQ-PCR檢測(cè)15bp缺失陽(yáng)性病例結(jié)果
紅色閾值線以上的擴(kuò)增曲線即為陽(yáng)性標(biāo)本的擴(kuò)增曲線,按熒光信號(hào)值的高低依次為9號(hào)、12號(hào)、13號(hào)、55號(hào)、38號(hào)和33號(hào)標(biāo)本
當(dāng)前第43頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期四\20點(diǎn)15bp缺失突變型DNA的測(cè)序圖
senseantisense當(dāng)前第44頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期四\20點(diǎn)紅色閾值線以上的擴(kuò)增曲線即為陽(yáng)性標(biāo)本的擴(kuò)增曲線,按熒光信號(hào)值的高低依次為2號(hào)、36號(hào)、和40號(hào)標(biāo)本FQ-PCR檢測(cè)18bp缺失陽(yáng)性病例結(jié)果當(dāng)前第45頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期四\20點(diǎn)目前K-RAS突變檢測(cè)常用技術(shù)當(dāng)前第46頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期四\20點(diǎn)方法直接測(cè)序焦磷酸測(cè)序高分辨率熔解曲線PCR-RFLP芯片雜交Real-TimePCR當(dāng)前第47頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期四\20點(diǎn)腫瘤組織的確認(rèn)和篩選顯微切割腫瘤提取DNA相應(yīng)的PCR反應(yīng)或雜交相關(guān)的分析和檢測(cè)K-ras突變檢測(cè)基本流程圖當(dāng)前第48頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期四\20點(diǎn)直接測(cè)序(DirectSequencing)PCR擴(kuò)增后產(chǎn)物直接測(cè)序雙脫氧核苷酸鏈終止法(Sanger法)DNA片段是熒光標(biāo)記的,這些片段經(jīng)過(guò)平板膠電泳或毛細(xì)管電泳得到分離,熒光分子被激發(fā)而發(fā)光,發(fā)出的光信號(hào)被檢測(cè)系統(tǒng)檢測(cè)當(dāng)前第49頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期四\20點(diǎn)當(dāng)前第50頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期四\20點(diǎn)K-ras突變檢測(cè)結(jié)果當(dāng)前第51頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期四\20點(diǎn)療效預(yù)測(cè)標(biāo)志物與預(yù)后判斷標(biāo)志物療效預(yù)測(cè)標(biāo)志物:
能夠預(yù)測(cè)某種特定治療方式療效的標(biāo)記物KRAS基因突變導(dǎo)致腫瘤對(duì)EGFR抑制劑抵抗預(yù)后判斷標(biāo)志物:
在不考慮治療因素的情況下能夠判斷患者結(jié)局的標(biāo)記物18號(hào)染色體長(zhǎng)臂(18q)缺失
某些分子標(biāo)志物兼具兩種作用胸腺嘧啶合成酶(Thymidylatesynthase)當(dāng)前第52頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期四\20點(diǎn)EGFR作為預(yù)后因子的價(jià)值EGFRexpressioncorrelateswithpoorprognosisDFS=Disease-freesurvival;OS=overallsurvivalTumortypePrognosisSurvivalRiskofmetastasisReferencesColorectalPoorPoor-DecreasedOSIncreased-Hemming(1992)Mayer,DeJong(1992)Head&Neck(SCCHN)PoorPoorDecreasedDFSDecreasedOS--Grandis(1998)
Maurizi(1996)Lung(NSCLC)PoorPoorDecreasedOS
--
IncreasedOhsaki(2000)
Pavelic(1993)當(dāng)前第53頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期四\20點(diǎn)Cetuxamab(西妥昔單抗)人源化嵌合單抗(IgG1)靶向作用于表皮生長(zhǎng)因子受體(EGFR)阻斷EGF和TGFα與EGFR的結(jié)合,抑制酪氨酸激酶活性和其后的腫瘤生長(zhǎng)2004年獲得FDA審批資格治療結(jié)直腸癌Panitumumab(帕尼單抗)完全人源化單克隆抗體(IgG2)靶向作用于表皮生長(zhǎng)因子受體(EGFR)2005年7月獲得FDA快速通道審批資格治療結(jié)直腸癌結(jié)直腸癌分子靶向治療藥物
當(dāng)前第54頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期四\20點(diǎn)KRAS突變KRAS突變可不依賴(lài)EGFR受體途徑,自行激活RAS/MAPK通路導(dǎo)致ERBITUX耐藥KRAS突變與Erbitux療效及患者生存相關(guān)KRAS突變并非孤立事件KRAS突變常伴隨BRAF突變,并與CpG島甲基化表型(CIMP)1,2相關(guān)KRAS突變常伴隨PI3K突變3
LièvreA,etal.JClinOncol2008;26:374–379MAPK=mitogen-activatedproteinkinase當(dāng)前第55頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期四\20點(diǎn)K-ras基因野生型患者能從這類(lèi)藥物治療中獲益。K-ras基因突變型患者并不能從抗EGFR治療中獲益,反而徒增不良反應(yīng)危險(xiǎn)和治療費(fèi)用;抗EGFR治療和K-ras突變相互排斥K-ras基因抗EGFR治療關(guān)系密切當(dāng)前第56頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期四\20點(diǎn)2009年7月FDA批準(zhǔn)了對(duì)西妥昔單抗和帕尼單抗說(shuō)明書(shū)標(biāo)簽的修改:
結(jié)直腸癌分子靶向治療藥物
注明KRAS基因突變的結(jié)直腸癌患者不推薦這使用這兩種用藥物。
當(dāng)前第57頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期四\20點(diǎn)
K-ras基因突變:20-60%結(jié)直腸癌
K-ras基因突變發(fā)生在腫瘤惡變的早期,原發(fā)灶和轉(zhuǎn)移灶的K-
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