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文檔簡介

一、DNA的復制1、DNA聚合酶原核生物中的DNA聚合酶,目前已發(fā)現(xiàn)的有3種,即DNA聚合酶Ⅰ、Ⅱ、Ш。實際在DNA復制中起主要作用的是DNA聚合酶Ш;DNA聚合酶Ⅰ主要與DNA的損傷修復有關;DNA聚合酶Ⅱ的作用還不十分清楚。真核生物的DNA聚合酶也有3種,分別為α、β、γ,其中,DNA聚合酶α在DNA復制中起作用,DNA聚合酶β在DNA損傷修復中起作用,DNA聚合酶γ的作用不詳。第十二章遺傳信息的復制和表達2、DNA復制過程DNA的復制,首先要解開雙鏈,形成局部單鏈,然后才能以單鏈為模板,以細胞核中游離的核苷酸為原料,復制新的DNA。復制方式為半保留復制。DNA的半保留復制:在DNA復制過程中,各以雙螺旋DNA的其中一條鏈為模板,新生的互補鏈和母鏈構成子代DNA分子,這種復制方式叫半保留復制。(1)原核生物的DNA復制(環(huán)狀DNA)①

DNA解旋主要需要:單鏈結合蛋白(SSB蛋白):使單鏈比較穩(wěn)定,便于復制進行DNA解鏈酶:水解ATP,使DNA雙鏈解開解旋過程:雙鏈DNA拓樸異構酶Ⅰ超螺旋DNA解鏈酶局部解開雙鏈較穩(wěn)定的單鏈SSB蛋白②

岡崎片段和半不連續(xù)復制這種復制方式叫半不連續(xù)復制,簡單地說,它是指先導鏈的連續(xù)復制和滯后鏈的不連續(xù)復制。DNA聚合酶Ш只能從5′3′方向合成核苷酸鏈。DNA雙鏈解開后,一條鏈是3′5′方向,以這條鏈為模板,可以從5′3′連續(xù)合成新的DNA鏈,這條先合成的鏈叫先導鏈。但以另一條5′3′方向的鏈為模板的話,DNA聚合酶Ш就無法從3′5′方向連續(xù)合成新鏈。實際上,DNA聚合酶Ш是先從5′3′方向合成許多小片段,稱岡崎片段,然后再由DNA連接酶把這些片段連成一條完整的鏈。這條新合成的鏈叫滯后鏈。③

復制的引發(fā)和終止先導鏈和滯后鏈的復制,都不能直接由DNA聚合酶來合成,而需要RNA引物。先導鏈的RNA引物由RNA聚合酶合成,然后在DNA聚合酶Ш的作用下,通過堿基互補配對,合成新的DNA鏈。而滯后鏈的RNA引物由引發(fā)體形成,然后由DNA聚合酶Ш合成岡崎片段。岡崎片段形成后,RNA酶H切除RNA引物,并由DNA聚合酶Ⅰ填補缺口,再由DNA連接酶將岡崎片段連成一條完整的鏈。復制的總過程:雙鏈DNA拓樸異構酶Ⅰ超螺旋DNA解鏈酶單鏈DNA(與SSB蛋白結合)RNA聚合酶RNA引物DNA聚合酶ШDNA新鏈(先導鏈)引發(fā)體RNA引物DNA聚合酶Ш岡崎片段RNA酶HRNA引物降解DNA聚合酶Ⅰ補齊缺口DNA新鏈(滯后鏈)DNA連接酶(2)真核生物和原核生物DNA復制的區(qū)別與聯(lián)系聯(lián)系:均為半保留復制和半不連續(xù)復制,復制過程及復制過程中所需要的酶都相似。區(qū)別:①真核生物的DNA有多個復制起點,而原核生物只有一個復制起點。(真核生物)(原核生物)

②真核生物的DNA只有在第一次復制完成后才能開始第二次復制,而原核生物在第一次復制尚未完成時即可進行第二次復制。二、DNA與Pr合成DNA指導Pr的合成,要經(jīng)過轉錄和翻譯2個階段,即DNA先指導合成mRNA,然后再由mRNA指導Pr合成。1、轉錄概念:以DNA中的一條鏈為模板,根據(jù)堿基互補配對原則,合成mRNA,并把DNA上的遺傳信息傳給mRNA,這個過程叫轉錄。在轉錄時,雙鏈DNA中只有1條鏈用來指導mRNA的合成,因此就有了編碼鏈和反義鏈之分。堿基序列除U變成T外,其余和mRNA相同的DNA鏈。堿基序列與mRNA互補的DNA鏈,它是mRNA合成的模板。編碼鏈:反義鏈:(1)RNA聚合酶(RNApol)①原核生物的RNApol識別模板鏈和轉錄起始位點2個α亞基1個β亞基1個β′亞基催化轉錄過程全酶σ因子:核心酶②真核生物的RNApolⅠ:合成rRNAⅡ:合成hnRNA(mRNA前體)Ш:合成tRNA、5SrRNA(2)啟動子原核生物的啟動子包括3個部分:①

Pribnow框(-10序列)一般為TATAAT,是RNApol的牢固結合位點。②Sextama框(-35序列)一般為TTGACA,是RNApol的初始結合位點,決定啟動子的強弱。③

CAP位點位于-35序列的上游,是啟動子上與CAP-cAMP復合物結合的位點。(CAP是指cAMP的受體Pr)當CAP-cAMP復合物結合到CAP位點上之后,可使附近的G-C堿基對穩(wěn)定性降低,并促進-10序列解開雙鏈,有利于轉錄的進行。CAP位點-35-10+1+20mRNA真核生物RNApolⅡ的啟動子包括4個部分:①帽子位點:是轉錄的起始位點,一般為A②

TATA框:-25序列(相當于原核生物的-10序列),一般為TATAATAAT功能與DNA雙鏈的解開有關決定轉錄起始位置(缺乏時,轉錄從多個位點開始)③

CAAT框:-75序列(相當于原核生物的-35序列),一般為GGGTCAATCT功能與RNApol的結合有關控制著起始的頻率④增強子(促進轉錄進行)特點:具有遠距離效應,無方向性;具有組織特異性和細胞特異性(3)轉錄的起始和延伸(以原核生物為例)σ因子識別起始位點全酶與-35序列結合封閉的啟動子復合物(二元復合物,含RNApol、DNA)復合物由-35向-10移動,使-10序列成為單鏈開放的啟動子復合物(二元復合物,含RNApol、DNA)復合物移到+1,β亞基催化2個核苷酸形成一個3′-5′磷酸二酯鍵形成三元復合物(含RNApol、DNA、mRNA)σ因子脫離復合物繼續(xù)移動,mRNA延伸階段開始CAP位點-35-10+1+20(4)轉錄的終止所有原核生物轉錄的終止子之前,都會形成一個回文結構,其堿基序列對稱排列(如AAGCGCTT),此處合成的mRNA會形成一個發(fā)夾結構:轉錄的終止子有2類:依賴ρ因子的終止子回文結構下游序列G/C含量低無固定特征不依賴ρ因子的終止子G/C含量高含6~8個A①依賴ρ因子的終止ρ因子是一種NTP酶,在三元復合物的移動過程中會結合到mRNA的5′端,ρ因子水解NTP,并利用水解釋放的能量,逐漸向mRNA的3′端移動。當三元復合物到達終止子后,由于mRNA形成發(fā)夾結構,因此復合物停止前進,等待ρ因子結合到mRNA的3′-OH上,使三元復合物解體,mRNA和RNApol就與DNA分離開來。三元復合物mRNAρ因子5′RNApolDNA3′②不依賴ρ因子的終止這種終止方式是因為mRNA到達終止位點后,形成了發(fā)夾結構和多聚U,使mRNA和DNA之間的結合力減弱(A-U之間的作用力較弱),從而使mRNA從DNA上脫離下來。2、翻譯以mRNA為模板的Pr合成過程叫做翻譯或轉譯,其場所是核糖體,原料是aa,能量來源是ATP、GTP。(1)遺傳密碼mRNA上的遺傳信息存在于遺傳密碼中。經(jīng)過大量研究發(fā)現(xiàn),遺傳密碼是三聯(lián)體密碼,即三個核苷酸決定一個aa。遺傳密碼的特點主要有:①

連續(xù)性2個密碼子之間沒有任何其它核苷酸相隔。②簡并性A、U、G、C四種核苷酸,每3個組成一個密碼,總共可以有64個密碼,但組成生物體的aa只有20種,因此,必然會出現(xiàn)幾個密碼共同決定一個aa的情況。(遺傳密碼表)③通用性遺傳密碼在所有生物中幾乎都是通用的,只有個別例外,如:UGA一般是個終止密碼子,但在人的線粒體中可編碼Try。注意:起始密碼子一般為AUG,少數(shù)細菌中為GUG;終止密碼子為UAA、UAG、UGA。遺傳密碼中決定aa的主要是前2個堿基,第三個堿基的改變,在很多時候往往不改變aa的種類。(2)Pr的生物合成(以原核生物為例)包括肽鏈的起始、延伸和終止3個過程。①起始核糖體30S小亞基附著到mRNA的起始密碼子處GTP起始因子IF1、IF2、IF3與fMet-tRNA(N-甲酰甲硫氨酰tRNA)結合30S起始復合物50S大亞基GTP水解;IF1、IF2、IF3釋放70S核糖體②

延伸核糖體大亞基上有2個tRNA結合位點,即P位點和A位點,起始tRNA,即fMet-tRNA首先與P位點結合,然后:aa-tRNA延伸因子EF-TuGTPaa-tRNA-EF-Tu-GTP復合物aa-tRNA進入A位點GTP水解EF-Tu-GDP釋放mRNA肽酰轉移酶P位點的aa或肽基與A位點的aa之間形成肽鍵,同時P位點的tRNA卸載,脫離移位酶GTP核糖體沿mRNA的5′3′方向移動1個密碼子的距離,使原來A位點的肽酰tRNA進入P位點,空出A位點準備下一個aa-tRNA的進入。上述過程不斷重復,肽鏈延伸。mRNA肽鏈5′3′PAPA③

終止當肽鏈延伸到終止密碼子處時,由終止因子RF識別終止密碼子,并使肽酰轉移酶的活性轉變成水解酶活性,使P位點上的肽鏈不再連接到A位點上的aa上,同時還水解P位點上的肽鏈與tRNA之間的化學鍵,使肽鏈釋放。肽鏈一旦釋放,核糖體就從mRNA上脫離,解離成50S和30

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