佛手種質資源遺傳

佛手種質資源遺傳

1器材和方法

材料佛手的葉片，經廣州中醫(yī)藥大學鑒定教研室張丹雁教授鑒定。樣品來源見表1。

儀器與試劑Beckman-15CSR冷凍高速離心機；PCR儀；UVPGDS7600型凝膠成像儀；ECANSpectraFLUORplus多功能酶標儀。大連寶生物DR001AMPCR擴增試劑盒；上海生工隨機引物；上海生工進口分裝瓊脂糖；上海申能博彩3s柱離心式植物基因組DNA試劑盒；天為時代DNAMarker；其他試劑均為國產分析純試劑。

表1樣品來源

方法

佛手總DNA的提取和檢測采用上海申能博彩公司的3s柱離心式植物基因組DNA試劑盒提取。將提取到的DNA用純水稀釋10倍后，用酶標儀分別測定其在260，280nm處的吸收值，計算出OD260與OD280的比值及DNA濃度，并以%瓊脂糖凝膠電泳觀察提取結果的優(yōu)劣。

佛手RAPD反應體系和擴增程序在對佛手PCR擴增體系優(yōu)化后，確定反應的總體積為25μl，包括：MgCl22μl，引物μl，dNTPs2μl，10×buffer緩沖液3μl，μlTaq酶，60ngDNA樣品。

PCR擴增程序為：94℃預變性4min，94℃變性1min,35℃退火lmin,72℃延伸，40次循環(huán)，最后72℃延伸10min，－20℃保存。

引物篩選選取德慶、青衣童子兩種地理位置差異較大的DNA樣品做模板，用110個引物對其進行PCR擴增篩選。

擴增與產物檢測13個佛手DNA樣品作為擴增模板，用篩選的引物及條件進行RAPD反應，擴增產物經電泳、染色后在凝膠分子成像儀上檢測并拍照記錄。

數據分析將電泳圖譜上清晰且可重復出現的條帶記為“1”，同一位置沒有出現條帶的記為“0”，從而生成由“1”和“0”組成RAPD表型數據矩陣。統(tǒng)計每條引物擴增出的總帶數和多態(tài)性帶數，計算多態(tài)性位點百分率p=×100%。利用求出Nei-Li相似系數矩陣，用UPGMA法對其進行聚類分析。

2結果

引物篩選110個引物中有51條引物擴增出條帶，每條引物擴增帶數1～15條，平均6條，擴增的譜帶分子量大小在300～2200bp，16條引物擴增的多態(tài)性帶相對較多，且條帶清晰、重復性好。

擴增產物的多態(tài)性分析以16個10mer引物對供試的13份材料進行PCR擴增，統(tǒng)計結果見表2。16個引物共擴增出185條帶，其中多態(tài)性帶有168條，占%；平均每個引物可擴增出條帶，平均每份材料可擴增出條帶，擴增的譜帶分子量大小在300～2200bp；各個引物間擴增的位點數相差較大，不同引物的擴增帶數變幅從6～15條不等，其中擴增帶數最多的引物為S23，具15條擴增帶，最少的為引物S6，僅具6條擴增帶，說明不同引物與供試材料總基因組DNA部分區(qū)域的同源性具有較大的差異。部分引物的擴增結果見圖1。

表216個引物的擴增結果

聚類分析13份供試材料的Nei遺傳相似系數矩陣如表3所示，經聚類分析構建親緣關系樹狀圖。相似系數分布在～之間，說明佛手種質的遺傳多樣性較為豐富。供試材料在相似系數為處分為3個類群，第1類群包括Sn1，Sn2，Sn3和Sn4，第2類群包括Sn5，Sn6，Sn7和Sn8，第3類群包括Sn9，Sn10，Sn11，Sn12和Sn13。

表313份佛手種質資源的相似系數矩陣

圖中對應的各個泳道的品種順序相同，從左到右依次為Sn1～Sn8，DNAMarker，Sn9～Sn13，陰性對照

圖1引物S24，S31，S80，S220的RAPD擴增圖譜

3討論

本研究應用RAPD技術對佛手種間親緣關系進行了闡明，來源不同的13份種質的遺傳多樣性高達%，表明佛手現有的種質遺傳變異較大，從而構成了較為豐富的種質資源基因庫，說明佛手遺傳基礎廣，具有較大的育種潛力和較強的進化能力，這與佛手栽培歷史悠久和種植范圍較廣有關。

圖2基于RAPD分析產生的佛手種質資源聚類圖

供試材料在相似系數為處分為3個類群，這與按照產地的不同將佛手分為廣佛手、浙佛手和川佛手的劃分一致。第1類群和第3類群中各種質之間的親緣較近，這與它們在植物學形態(tài)上差異不大的情況相吻合。第2類群中4個栽培品種雖然在植物學形態(tài)上差異較大，但由于生長環(huán)境相同，在相似系數處聚為一類，親緣關系也較近，可能是遺傳基因和環(huán)境相互作用的結果；其中，Sn8為Sn5的芽變選育品種，兩者在形態(tài)上有較大的差異，但分子水平上證明其遺傳關系較近；Sn6和Sn7兩者在葉片、花、果等植物學形態(tài)上差異較大，但其相似系數為，表明其親緣關系較近，形態(tài)上的差異并未在分子水平上反映。第3類群中，Sn9與Sn10代表佛手的兩種不同果型，以前通常按果型將佛手分為兩種農家品種，但筆者在實地調查中