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生化生物技術(shù)王旭東.前言二十一世紀(jì)----------生命科學(xué)的時(shí)代5年內(nèi)國(guó)家對(duì)生命技術(shù)的投入將超過100億元醫(yī)學(xué)的發(fā)展.生化生物實(shí)驗(yàn)技術(shù)發(fā)展簡(jiǎn)史20年代:微量分析技術(shù)導(dǎo)致了維生素、激素和輔酶等的發(fā)現(xiàn)。瑞典著名的化學(xué)家T.Svedberg奠基了“超離心技術(shù)的理論基礎(chǔ),1924年制成了第一臺(tái)5000RCF的離心機(jī)(5000r/min-8000r/min,相對(duì)離心力“RCF”的單位可表示為“×g”),并準(zhǔn)確測(cè)定了血紅蛋白等復(fù)雜蛋白質(zhì)的分子量,獲得了1926年的諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)。。.離心機(jī).超速離心機(jī).30年代:
電子顯微鏡技術(shù)打開了微觀世界,使我們能夠看到細(xì)胞內(nèi)的結(jié)構(gòu)和某些生物大分子的大致結(jié)構(gòu)。美國(guó)哈佛大學(xué)的Folin教授和中國(guó)的吳憲教授建立了不少生物化學(xué)常用的分析方法如血糖分析、蛋白質(zhì)含量分析、氨基酸測(cè)定等。英藉德裔生物化學(xué)家Krebs,在1937年發(fā)現(xiàn)了三羧酸循環(huán),對(duì)細(xì)胞代謝及分子生物學(xué)的研究作出了重要貢獻(xiàn),他與美藉德裔生物化學(xué)家Lipmann共獲1953年諾貝爾生理醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)。.電子顯微鏡..40年代:兩位英國(guó)科學(xué)家Martin和Synge發(fā)明了分配色譜(層析),他們獲得了1952年的諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)。由此,層析技術(shù)成為分離生化物質(zhì)的關(guān)鍵技術(shù)。
電泳技術(shù)由瑞典的著名科學(xué)家Tisellius奠基,從而開創(chuàng)了電泳技術(shù)的新時(shí)代,他因此獲得了1948年的諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)。層析技術(shù)和電泳技術(shù)用于分析生物大分子的組成和代謝的中間產(chǎn)物,示蹤技術(shù)的應(yīng)用推動(dòng)了代謝的研究。美國(guó)化學(xué)家Pauling確認(rèn)氫鍵在蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)中以及生物大分子間相互作用的重要性等,并因此而獲得了諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)。.50年代:自1935年Schoenheimer和Rittenberg首次將放射性同位素示蹤用于碳水化合物及類脂物質(zhì)的中間代謝的研究以后,射性同位素示蹤技術(shù)50年代有了大的發(fā)展,為各種生物化學(xué)代謝過程的闡明起了決定性的作用。1953年美國(guó)科學(xué)家Watson和英國(guó)科學(xué)家Crick提出DNA分子反向平行雙螺旋模型,1962年與英國(guó)科學(xué)家Wilkins分享諾貝爾生理醫(yī)學(xué)獎(jiǎng),Wilkins和Franklin通過對(duì)DNA分子的X-射線衍射研究為Watson和Crick的DNA模型提供了有力的實(shí)驗(yàn)證據(jù),DNA雙螺旋模型的提出開創(chuàng)了生物科學(xué)的歷史新紀(jì)元。.DNA模型.Watson和Crick.在X-射線衍射技術(shù)方面,英國(guó)物理學(xué)家Perutz對(duì)血紅蛋白的結(jié)構(gòu)進(jìn)行X-射線結(jié)構(gòu)分析,Kendrew測(cè)定了肌紅蛋白的結(jié)構(gòu),成為研究生物大分子立體結(jié)構(gòu)的先驅(qū),他們同獲1962年諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)。英國(guó)生物化學(xué)家Sanger還于1953年確定了牛胰島素中氨基酸的順序而獲得1958年的諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)。Kornberg發(fā)現(xiàn)了DNA聚合酶Ⅰ,美藉西班牙裔科學(xué)家Uchoa發(fā)現(xiàn)了細(xì)菌的多核苷酸磷酸化酶,研究并重建了將基因內(nèi)的遺傳信息通過RNA中間體翻譯成蛋白質(zhì)的過程。兩人分享了1959年諾貝爾生理醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)。.60年代:各種儀器分析方法用于生物化學(xué)研究,取得了很大的發(fā)展,如HPLC技術(shù)、紅外、紫外、圓二色等光譜技術(shù)、NMR核磁共振技術(shù)等。自1958年Stem,Moore和Spackman設(shè)計(jì)出氨基酸自動(dòng)分析儀,大大加快了蛋白質(zhì)的分析工作。1967年Edman和Begg制成了氨基酸序列分析儀,到1973年Moore和Stein設(shè)計(jì)出氨基酸序列自動(dòng)分析儀,又大大加快了對(duì)多肽一級(jí)結(jié)構(gòu)的測(cè)定,十多年間氨基酸的自動(dòng)測(cè)定工作得到了很大的發(fā)展和完善。.在60年代,層析和電泳技術(shù)又有了重大的進(jìn)展,在1968-1972年Anfinsen創(chuàng)建了親和層析技術(shù),開辟了層析技術(shù)的新領(lǐng)域。1969年Weber應(yīng)用SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳技術(shù)測(cè)定了蛋白質(zhì)的相對(duì)分子質(zhì)量,使電泳技術(shù)取得了重大進(jìn)展。美國(guó)生物化學(xué)家Nirenberg在破譯遺傳密碼方面作出了重要貢獻(xiàn),Holly闡明了酵母丙氨酸t(yī)RNA的核苷酸排列順序,后來證明所有tRNA的結(jié)構(gòu)均相似。美藉印度裔生物化學(xué)家Khorana提出按預(yù)定的序列合成核酸分子的方法。他們3人共獲1969年諾貝爾生理醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)。法國(guó)生物學(xué)家Lwoff、JAcob和生物化學(xué)家Monod由于在病毒DNA和mRNA等方面出色的大量研究工作而共獲1965年諾貝爾生理醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)。.70年代:
基因工程技術(shù)取得了突破性的進(jìn)展,Arber,Smith和Nathans三個(gè)小組發(fā)現(xiàn)并純化了限制性內(nèi)切酶,1972年,美國(guó)斯坦福大學(xué)的Berg等人首次用限制性內(nèi)切酶切割了DNA分子,并實(shí)現(xiàn)了DNA分子的重組。1973年,又由美國(guó)斯坦福大學(xué)的Cohen等人第一次完成了DNA重組體的轉(zhuǎn)化技術(shù),這一年被定為基因工程的誕生年,Cohen成為基因工程的創(chuàng)始人,從此,生物化學(xué)進(jìn)入了一個(gè)新的大發(fā)展時(shí)期。與此同時(shí),各種儀器分析手段進(jìn)一步發(fā)展,制成了DNA序列測(cè)定儀、DNA合成儀等。
.80年代基因工程技術(shù)進(jìn)入輝煌發(fā)展的時(shí)期,1980年,英國(guó)劍橋大學(xué)的生物化學(xué)家Sanger和美國(guó)哈佛大學(xué)的Gilbert分別設(shè)計(jì)出兩種測(cè)定DNA核苷酸序列的方法,而與Berg共獲諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng),從此,DNA序列分析法成為生物化學(xué)與分子生物學(xué)最重要的研究手段之一。他們3人在DNA重組和RNA結(jié)構(gòu)研究方面都作出了杰出的貢獻(xiàn)。1981年由Jorgenson和Lukacs首先提出的高效毛細(xì)管電泳技術(shù)(HPCE),由于其高效、快速、經(jīng)濟(jì),尤其適用于生物大分子的分析,因此受到生命科學(xué)、醫(yī)學(xué)和化學(xué)等學(xué)科的科學(xué)工作者的極大重視,發(fā)展極為迅速,是生化實(shí)驗(yàn)技術(shù)和儀器分析領(lǐng)域的重大突破,意義深遠(yuǎn)。現(xiàn)今,由于HPCE技術(shù)的異軍突起,HPLC技術(shù)的發(fā)展重點(diǎn)己轉(zhuǎn)到制備和下游技術(shù)。.1984年德國(guó)科學(xué)家Kohler、美國(guó)科學(xué)家Milstein和丹麥科學(xué)家Jerne由于發(fā)展了單克隆抗體技術(shù),完善了極微量蛋白質(zhì)的檢測(cè)技術(shù)而共享了諾貝爾生理醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)。1985年美國(guó)加利福尼亞州Cetus公司的Mullis等發(fā)明了用PCR技術(shù)(PolymeraseChainReaction)即聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)擴(kuò)增DNA的技術(shù),對(duì)于生物化學(xué)和分子生物學(xué)的研究工作具有劃時(shí)代的意義,因而與第一個(gè)設(shè)計(jì)基因定點(diǎn)突變的Smith共享1993年的諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)1988年,美國(guó)遺傳學(xué)家McClintock由于在二十世紀(jì)五十年代提出并發(fā)現(xiàn)了可移動(dòng)的遺傳因子而獲得諾貝爾生理醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)。1989年,美國(guó)科學(xué)家Altman和Cech由于發(fā)現(xiàn)某些RNA具有酶的功能(稱為核酶)而共享諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)。.PCR技術(shù).90年代:1993年,美國(guó)科學(xué)家Roberts和Sharp由于在斷裂基因方面的工作而榮獲諾貝爾生理醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)。1994年,美國(guó)科學(xué)家Gilman和Rodbell由于發(fā)現(xiàn)了G蛋白在細(xì)胞內(nèi)信息傳導(dǎo)中的作用而分享諾貝爾生理醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)。1995年,美國(guó)科學(xué)家Lewis、德國(guó)科學(xué)家Nusslein-Volhard和美國(guó)科學(xué)家Wieschaus由于在20世紀(jì)40-70年代先后獨(dú)立鑒定了控制果蠅體節(jié)發(fā)育基因而共享諾貝爾生理醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)。進(jìn)入21世紀(jì)以來,PCR技術(shù)、生物芯片技術(shù)不斷完善,基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、生物信息學(xué)發(fā)展迅速。.我國(guó)生物化學(xué)界的主要成就我國(guó)生物化學(xué)界的先驅(qū)吳憲教授在20年代初由美回國(guó)后,在協(xié)和醫(yī)科大學(xué)生化系與汪猷、張昌穎等人一道完成了蛋白質(zhì)變性理論、血液生化檢測(cè)和免疫化學(xué)等一系列有重大影響的研究。1965年我國(guó)化學(xué)和生物化學(xué)家用化學(xué)方法在世界上首次人工合成了具有生物活性的結(jié)晶牛胰島素,1983年又通過大協(xié)作完成了酵母丙氨酸轉(zhuǎn)移核糖核酸的人工合成。近年來,在酶學(xué)研究、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)及生物膜的結(jié)構(gòu)與功能等方面都有舉世矚目的研究成果。90年代以來,我國(guó)參與了人類基因組計(jì)劃,在水稻基因組研究中處于國(guó)際領(lǐng)先水平,在功能基因組學(xué)研究中取得不少成績(jī)。.結(jié)晶牛胰島素.第一節(jié)蛋白質(zhì)純化的基本知識(shí).一、蛋白質(zhì)純化的設(shè)計(jì)(一)基本原則1.原則純化蛋白質(zhì)通常是為了獲得純蛋白質(zhì)以便深人研究蛋白質(zhì)的活性、結(jié)構(gòu)、結(jié)構(gòu)與功能之間的關(guān)系。.首先,必須了解待純化樣品中目的蛋白及主要雜質(zhì)的性質(zhì),盡可能多收集有關(guān)蛋白質(zhì)的來源、性質(zhì)(分子大小、等電點(diǎn))和穩(wěn)定性(蛋白質(zhì)對(duì)溫度、極端pH、蛋白酶、氧和金屬離子等的耐受性)等信息,這有助于設(shè)計(jì)蛋白質(zhì)純化。.比如目的蛋白是糖蛋白或脂蛋白,它們就明顯區(qū)別于大多數(shù)的雜蛋白;蛋白質(zhì)是細(xì)胞內(nèi)還是細(xì)胞外,可溶還是不可溶等都將影響到蛋白質(zhì)提取方法和緩沖液組成,對(duì)于細(xì)胞外蛋白質(zhì),除去細(xì)胞可以有助于純化過程,與膜結(jié)合的蛋白質(zhì)需要用有機(jī)溶劑先溶解。.其次,純化開始之前必須了解最終產(chǎn)品的用途,從而設(shè)計(jì)蛋白質(zhì)純化過程,同時(shí)要綜合考慮純化產(chǎn)品的質(zhì)量、數(shù)量和經(jīng)濟(jì)性等三個(gè)方面的要求。純化后的蛋白質(zhì)純度要多高,純化過程中能允許損失多少活性以及純化過程需多少時(shí)間和成本等都受到目的蛋白用途的影響。目的蛋白純度如果要求越高,往往所需要的操作時(shí)間越長(zhǎng),成本越高。
.最后,充分了解各分離純化技術(shù)操作單元的大量信息也很重要,比如在細(xì)胞破碎時(shí),需要了解包括流速、攪拌器類型、操作壓力、細(xì)胞濃度和種類、產(chǎn)品釋放的碎片和大小等;設(shè)計(jì)分析吸附色譜時(shí),要了解包括色譜柱特征、凝膠或其他吸附劑的性能(結(jié)合能力、解離常數(shù)、流速等)。.2蛋白質(zhì)的純度對(duì)目的蛋白純度的要求取決于純蛋白質(zhì)的用途,如果是工業(yè)化應(yīng)用(在食品工業(yè)或日用化學(xué)工業(yè)),則需要大量的產(chǎn)品,此時(shí)純度是次要的。如果純蛋白質(zhì)被用于研究,所需數(shù)量比較少,在酶學(xué)研究中,80%~90%的純度就足夠了,蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)研究中,純度要在95%以上,而用于醫(yī)療的蛋白質(zhì),必須考慮到所有的雜質(zhì),對(duì)最終產(chǎn)物必須分析污染蛋白質(zhì)、DNA和在純化過程中的添加物。.可以采取一些特別的步驟除去這些雜質(zhì),但是額外的純化步驟雖然可以提高純度,卻由于除掉最終的百分之幾雜質(zhì)比最初的純化要困難得多,會(huì)導(dǎo)致收率下降,增加成本,延長(zhǎng)了操作時(shí)間。為應(yīng)用于研究而純化蛋白質(zhì),規(guī)模小,額外的純化步驟所需要的花費(fèi)并不重要,但工業(yè)化純化蛋白質(zhì)則需要綜合考慮純化的經(jīng)濟(jì)性..3蛋白質(zhì)活性的保持在大多數(shù)情況下,純化后蛋白質(zhì)應(yīng)盡可能保持活性,要采取盡可能少的純化步驟以減少蛋白質(zhì)變性和蛋白質(zhì)水解。盡量避免比較粗放的條件(如極端pH、有機(jī)溶劑等),選用合適的緩沖液,在純化的整個(gè)過程中,需要控制pH,以減少蛋白質(zhì)變性,通常采用20~50mmol/L的緩沖液濃度。.蛋白質(zhì)樣品的貯存溫度宜在4℃或更低,如果貯存時(shí)間長(zhǎng)或蛋白質(zhì)易水解,可采用冷凍方法,用液氮、干冰或甲醇進(jìn)行快速冷凍比較好,但是冷凍法對(duì)有些酶也不適用。在低溫(4℃)操作,加快純化過程而縮短操作時(shí)間,或加人蛋白酶抑制劑,都可以降低蛋白質(zhì)水解程度。.溶酶體是蛋白酶主要來源,盡量避免其受到破壞而釋放出蛋白酶,在酶提取液中加人蔗糖或麥芽糖可降低破壞程度。然而,即使是微量蛋白酶,也能水解大量蛋白質(zhì),因此在純化后期也要仔細(xì)操作。由于許多蛋白酶分子量在20000~30000之間,凝膠過濾可用于蛋白質(zhì)初步純化,以分離大多數(shù)蛋白酶污染物。選擇簡(jiǎn)單、快速、高專一性的酶分析方法,可以縮短樣品在純化各步驟間的貯存時(shí)間,也可降低蛋白質(zhì)水解程度。.4蛋白質(zhì)的數(shù)量純蛋白質(zhì)的數(shù)量不僅僅受原材料數(shù)量的影響,還受到蛋白質(zhì)純化收率的影響。在有不同原料可供選擇時(shí),一般選用目的蛋白最穩(wěn)定、含量最豐富的,同時(shí)也考慮獲得原料是否容易,數(shù)量是否足夠多,成本是否比較低。在純化過程,每一步驟中都會(huì)損失蛋白質(zhì),所以純化步驟應(yīng)盡量少,以得到高蛋白質(zhì)收率,但是純化步驟的減少會(huì)降低目的蛋白的最終純度,需要恰當(dāng)選擇各種純化方法以提高蛋白質(zhì)收率。.(二)過程優(yōu)化蛋白質(zhì)純化的過程優(yōu)化就是使蛋白質(zhì)純化后收率、純度最高,成本最低。在有純化方案可供實(shí)施時(shí),需要對(duì)純化過程進(jìn)行優(yōu)化,此時(shí)已經(jīng)了解了純化過程條件和目的蛋白產(chǎn)品的特性。過程優(yōu)化必須解決兩類問題:一是在可替換的操作中作出選擇(如離心或超濾等);二是設(shè)計(jì)理想的色譜順序,以最少的步驟(—、二或三步)獲得最大的產(chǎn)量。.每一分離純化方法都要諷估其處理樣品能力、蛋白質(zhì)收率和純化成本。在純化初期階段,高處理量和低成本十分重要,而在后期高分辨率很重要。純化分離初期要求減小樣品體積,常常使用高處理量的沉淀技術(shù),色譜中吸附法處理量最大,一般不采用凝膠過濾作為純化初期操作步驟,因?yàn)樗幚砹啃 ?使用高分辨率技術(shù)可以減少純化步驟,也使蛋白質(zhì)更純。沉淀步驟分辨率低,而色譜法高,親和色譜有很高分辨率。各純化技術(shù)都有一個(gè)平均收率范圍,硫酸鐵沉淀法和雙水相提取法的收率通常大于80%。親和色譜法收率較低(在60%以下),且成本高,因此一般用在純化的后期。通常先用低成本技術(shù)以除去大部分雜質(zhì),避免損壞價(jià)格高的色譜柱。.純化技術(shù)頗序的選擇上,一般先使用沉淀技術(shù),然后依次是離子交換、親和色譜,最后是凝膠過濾,這樣,每一種技術(shù)利用了蛋白質(zhì)的不同性質(zhì),沉淀技術(shù)能處理大量的高濃度蛋白質(zhì)溶液,離子交換除去大部分雜蛋白以便進(jìn)人價(jià)格高的親和色譜柱,凝膠過濾用于最后純化環(huán)節(jié),這時(shí)處理量已不是問題。總之,純化方案的確定,除考慮利用蛋白質(zhì)不同的特性外,步驟應(yīng)盡可能少,盡量使分離產(chǎn)物不需進(jìn)一步處理就可以直接進(jìn)行下一步操作。.對(duì)所有蛋白質(zhì)適用的純化方案是不存在的,因?yàn)樵蟻碓春透鞣N蛋白質(zhì)純化的要求不同??梢酝ㄟ^試用多種方法先找出大致途徑,或使用專家系統(tǒng),以計(jì)算機(jī)為基礎(chǔ)的專家系統(tǒng)在人工智能領(lǐng)域已經(jīng)成了非常重要的工具,現(xiàn)有的人工智能可以通過相互作用的邏輯推理來找出蛋白質(zhì)純化的最理想方案。對(duì)100種純化過程進(jìn)行分析,平均分離純化步驟是四步,總收率28%,平均每一步純化倍數(shù)為8。.(三)經(jīng)濟(jì)性.(四)規(guī)?;鞍踪|(zhì)純化商業(yè)化的多肽和蛋白質(zhì)生產(chǎn)至今還僅僅限于一些由微生物產(chǎn)生的或是從動(dòng)植物組織中提取出的酶。重組DNA和組織培養(yǎng)技術(shù)的進(jìn)展使得規(guī)?;a(chǎn)蛋白質(zhì)和多肽成為可能,其中不少產(chǎn)品都是和人類健康有關(guān)的,比如干擾素、抗生素和疫苗等。
.規(guī)?;兓鞍踪|(zhì),目的是盡可能提高產(chǎn)量,并降低成本,同時(shí)也盡可能避免人為因素干擾,純化過程還應(yīng)盡可能精簡(jiǎn)。進(jìn)行規(guī)模化純化蛋白質(zhì)時(shí),已經(jīng)基本了解目的蛋白、原料、生產(chǎn)方法、產(chǎn)品純度要求和最終數(shù)量等,但是純化過程中很多方面可能要重新評(píng)估并作出適當(dāng)?shù)母淖儭膶?shí)驗(yàn)室規(guī)模純化蛋白質(zhì)向工業(yè)化規(guī)模純化生產(chǎn)蛋白質(zhì)的擴(kuò)大,屬于工程學(xué)的范疇。工廠規(guī)模是一次性的,它必須成功。.二、生物分離純化的一般工藝過程.主要操作過程(一)細(xì)胞分離分離微生物細(xì)胞的主要措施為離心、傳統(tǒng)過濾和膜過濾。傳統(tǒng)過濾用于生物懸浮物的分離是困難的,選擇離心或膜過濾,需要綜合考慮資金、操作維修費(fèi)用、回收率和過程時(shí)間等因素。影響分離過程經(jīng)濟(jì)效益的一個(gè)主要因素是被分離顆粒的大小。.工業(yè)用離心機(jī)通常設(shè)計(jì)成連續(xù)進(jìn)料。細(xì)胞在離心機(jī)中沉淀越快,在轉(zhuǎn)子中的保留時(shí)間就越短,相應(yīng)地,離心處理量越大。決定離心機(jī)容量的一個(gè)主要因素是相關(guān)粒子的大小。通過離心操作回收酵母已有很多年,而動(dòng)物細(xì)胞的處理更加復(fù)雜,因?yàn)樗鼈兒苋菀灼屏?,?dāng)通過離心系統(tǒng)時(shí),可能會(huì)分解產(chǎn)生微小的碎片。大規(guī)模分離細(xì)菌和細(xì)胞碎片最常用的離心機(jī)是多層轉(zhuǎn)盤離心機(jī)。在低流速(300~500L/h)時(shí),可以將零。0.5um以上的顆粒分離,而在高流速(3000~5000L/h)時(shí),可以將整個(gè)細(xì)胞分離出來。但是,離心操作費(fèi)用高,也難于無菌操作,產(chǎn)生熱量,形成噪聲。.過濾技術(shù)(深層過濾,微孔過濾,超濾)常用于固液分離。旋轉(zhuǎn)式真空過濾機(jī)是比較常見的一種,已應(yīng)用于大規(guī)模生產(chǎn)酶制劑過程,從發(fā)酵液中除去細(xì)菌菌體或絲狀微生物。膜過濾系統(tǒng)越來越多應(yīng)用于規(guī)?;瘡陌l(fā)酵液中分離細(xì)胞和細(xì)胞碎片,在無菌分離的效果方面遠(yuǎn)好于價(jià)格昂貴的離心機(jī)。然而,膜過濾的主要缺點(diǎn)是不能處理高濃度細(xì)胞,高濃度細(xì)胞會(huì)明顯降低過濾速度。微濾能夠截留溶液中非蛋白質(zhì)的微小物質(zhì),而超濾能夠截留溶液中的蛋白質(zhì)。.(二)細(xì)胞破碎和碎片分離對(duì)于細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)的分離,需要先有效破碎細(xì)胞。通常先收集細(xì)胞,然后進(jìn)行洗滌以除去殘留的培養(yǎng)基,對(duì)于僅僅由細(xì)胞膜包圍著的細(xì)胞,比如哺乳動(dòng)物細(xì)胞,破碎比較容易,如果存在聚合細(xì)胞壁結(jié)構(gòu)(比如微生物細(xì)胞),破碎時(shí)就會(huì)困難些。.實(shí)驗(yàn)室中常用的超聲波法由于較難以將足夠能量輸送到大量體積的細(xì)胞懸浮液中,不適于大規(guī)模破碎。適用于規(guī)?;僮鞯募?xì)胞破碎方法主要有均質(zhì)法和高速玻璃珠研磨法,需要注意的是,應(yīng)盡量縮短操作時(shí)間。均質(zhì)法是當(dāng)前最廣泛使用的破碎技術(shù),產(chǎn)量可達(dá)6000L/h,但它不太適用于高等真菌。裝置如果沒有制冷,由于釋放大量的機(jī)械能,溫度上升比較高,有些蛋白質(zhì)會(huì)因此而變性,所以樣品溶液在進(jìn)入設(shè)備前及離開設(shè)備后都要盡量冷卻。..研磨法采用無鉛玻璃珠(0。4~1。5mm),細(xì)胞懸浮液在有小玻璃珠的情況下高速攪拌,最大處理量可以達(dá)到2000L/h。最佳玻璃珠尺寸的選擇取決于破碎對(duì)象的大小和所釋放產(chǎn)物所處的位置,小的玻璃珠對(duì)破碎細(xì)菌非常有效,而大的玻璃珠對(duì)酵母細(xì)胞很有效。該法的破碎效率受破碎對(duì)象、細(xì)胞濃度、攪拌速度、玻璃珠大小、溫度和進(jìn)料速度等因素的影響,細(xì)胞破碎效率隨攪拌速度增加而達(dá)到一最高值,然后隨速度增加而下降。.相對(duì)于均質(zhì)法,在攪拌速度不高時(shí),細(xì)胞濃度會(huì)影響到研磨法的破碎效率。最合適的細(xì)胞濃度隨微生物種類不同而變化,一般為細(xì)胞濕重的30%~60%。操作溫度通常限制在很窄的范圍內(nèi),通常在5~15℃,以免造成蛋白質(zhì)熱變性,一般需要采用夾套方式進(jìn)行冷卻。.由于細(xì)胞要徹底破碎以獲得較高的收率,細(xì)胞內(nèi)所有物質(zhì)都被釋放,因此,必須從復(fù)雜混合物(包括蛋白質(zhì)、核酸及細(xì)胞壁碎片)中分離出目的產(chǎn)物,目的蛋白可能會(huì)受到釋放出的蛋白酶的降解。另外,核酸不僅難以分離,而且大大提高了懸浮液的黏度。除去核酸的技術(shù)包括使用核酸酶和沉淀。核酸污染雖然含量很低,但是對(duì)于醫(yī)藥級(jí)蛋白質(zhì)還是有影響。.酶解法條件溫和,對(duì)降解細(xì)胞壁結(jié)構(gòu)有特異性,是比較理想的方法。但是不同細(xì)胞組織需要不同的酶,而且因所處的不同生理狀態(tài),細(xì)胞對(duì)酶解的敏感程度會(huì)有明顯變化,因而酶解法還沒有被廣泛用于規(guī)?;扑槲⑸锛?xì)胞,但對(duì)于價(jià)值較高、采用機(jī)械法會(huì)造成損失的產(chǎn)品,酶解法已經(jīng)顯示出了良好的應(yīng)用前景。.細(xì)胞破碎過程中產(chǎn)生的細(xì)胞碎片,必須除去,以免污染或者堵塞純化蛋白質(zhì)所用的色譜柱,可以先進(jìn)行絮凝,再通過離心法將其碎片分離出來,但對(duì)直徑小于0.5um顆粒的處理效果不太理想。雙水相提取法也常用于分離碎細(xì)胞和細(xì)胞碎片。.(三)濃縮早期純化階段需要將蛋白質(zhì)溶液濃縮10~50倍,以減小過程體積并使隨后的操作更容易處理,這在規(guī)模化純化蛋白質(zhì)時(shí)是個(gè)重要的必不可少的步驟,超濾是比較合適的技術(shù),一般采用錯(cuò)流系統(tǒng)。
.沉淀法在大規(guī)模工業(yè)生產(chǎn)中并不可取,因?yàn)檫@種方法處理量很??;引入的外來試劑必須在隨后去除或者回收;對(duì)于很稀濃度蛋白質(zhì)溶液,該方法處理效率不高,且收率很低;使用有機(jī)溶劑會(huì)造成維持設(shè)備的成本,生產(chǎn)區(qū)域的防火、防火花的成本較高。雙水相萃取技術(shù)可以用于實(shí)驗(yàn)室規(guī)?;蛑性囈?guī)模,但工業(yè)化規(guī)模還不多見。.(四)色譜分離采用色譜技術(shù)從粗產(chǎn)品中分離純化蛋白質(zhì),在生產(chǎn)中始終都要慎重操作。經(jīng)過濃縮后,得到了蛋白質(zhì)、其他成分(比如類脂物、細(xì)胞壁或其他多糖類)、鹽和水的混合液,隨后一般經(jīng)2~4步色譜純化才能達(dá)到所要求的蛋白質(zhì)純度??梢詮牟煌纳V方法中進(jìn)行選擇,實(shí)驗(yàn)室實(shí)驗(yàn)結(jié)果有參考作用,專家系統(tǒng)也有助于優(yōu)化蛋白質(zhì)純化的順序。.首先采用典型操作(如吸附、雙水相萃取或鹽析沉淀等)來提高收率,減少純化步驟,然后采用高效液相離子交換色譜或親和色譜純化蛋白質(zhì),得到99%(通常情況下95%~98%)純度的產(chǎn)品。經(jīng)過上述步驟之后,如果有需要,可進(jìn)一步采取其他方法以獲得超高純度。.新發(fā)展起來的適用于規(guī)?;氖强焖俚鞍踪|(zhì)液相色譜(fastproteinliquidchromatograph,F(xiàn)PLC)。FPLC在中等壓力條件下工作,比傳統(tǒng)色譜分離速度更快,分離效果更好。FPLC在實(shí)驗(yàn)室中被廣泛接受,在中試和大規(guī)模蛋白質(zhì)純化中也顯示出了強(qiáng)大的潛力。相比于高壓系統(tǒng)(如HPLC),它的一個(gè)優(yōu)點(diǎn)就是其設(shè)備用塑料而非不銹鋼制成,可耐任何緩沖液,因而適于分離純化蛋白質(zhì)。.第二節(jié)生物大分子的提取蛋白質(zhì)(包括酶),核酸,脂類,糖類等生物大分子的制備分四個(gè)階段:一.選擇材料和預(yù)處理二.細(xì)胞的破碎及細(xì)胞組分的分離三.提取和純化四.濃縮,干燥和保存
.一.選擇材料及預(yù)處理動(dòng)物,植物,微生物都可作為制備生物大分子的原材料,所選用的材料主要依據(jù)試驗(yàn)?zāi)康膩泶_定。
有效成份是指欲純化的某種單一的生命大分子物質(zhì)。而有效成分以外的其它物質(zhì)則統(tǒng)稱雜質(zhì)。在動(dòng)、植物和微生物材料中,有效成分的含量一般較少。如胰臟中胰島素的含量小于其鮮重的百萬(wàn)分之一;穩(wěn)定性較差,大多數(shù)對(duì)酸、堿、高溫和高濃度有機(jī)溶劑等因子較敏感;易被微生物分解變質(zhì)。
材料的采集會(huì)大大影響實(shí)驗(yàn)的成敗,選用的材料不同,有效成分的含量就不同;同一材料的部位或生長(zhǎng)期不同,有效成分的含量也不盡相同??偟膩碚f,材料選擇應(yīng)遵循的原則是,有效成分含量多、穩(wěn)定性好;來源豐富、保持新鮮;提取工藝簡(jiǎn)單、有綜合利用價(jià)值等。
.1.動(dòng)物組織:選材:必須選擇有效成分含量豐富且易分離的臟器組織為原材料。如磷酸單酯酶,從含量看,雖然在胰臟、肝臟和脾臟中較豐富,但是因其與磷酸二酯酶共存,進(jìn)行提純時(shí),這兩種酶很難分開。所以實(shí)踐中常選用含磷酸單酯酶少,但幾乎不含磷酸二酯酶的前列腺作材料。
脫脂:臟器中含量較高的脂肪,容易氧化酸敗,導(dǎo)致原料變質(zhì)影響純度操作和制品的率。常用的脫脂方法有:人工剝?nèi)ヅK器外的脂肪組織;浸泡在脂溶性的有機(jī)溶劑(丙酮,乙醚)中脫脂;采用快速加熱(50℃左右),快速冷卻的方法,使溶化的油滴冷卻后凝聚成油塊而被除去。
.
保存:對(duì)預(yù)處理好的材料,若不立即進(jìn)行實(shí)驗(yàn),應(yīng)冷凍保存。a.冰凍:剝?nèi)ブ竞徒钇さ冉Y(jié)締組織,短期保存:-10℃的冰箱內(nèi);長(zhǎng)期保存:-70℃低溫冰箱內(nèi)。b.干燥:對(duì)于像腦垂體一類小組織,可置丙酮液中脫水,干燥后磨粉儲(chǔ)存?zhèn)溆茫粚?duì)于含耐高溫有效成分(如:肝素)的腸粘膜,可在沸水蒸煮處理,烘干后能長(zhǎng)期保存。
冰箱的除霜循環(huán),可能對(duì)細(xì)胞造成傷害,要特別小心。解凍時(shí)要越快越好,但避免局部過熱。.2.植物材料:選材:注意植物品種和生長(zhǎng)發(fā)育狀況不同,其中所含生物大分子的量變化很大,另外與季節(jié)性關(guān)系密切。種子須泡脹或粉碎才可使用。含油脂較多的也要進(jìn)行脫脂處理。
a.提取核DNA:選用黃化苗(生長(zhǎng)7-10天小麥,水稻),防止葉綠體DNA的干擾b.提取RNA:根據(jù)實(shí)驗(yàn)?zāi)康倪x用生長(zhǎng)幼嫩組織為好。
保存:冷凍采樣后盡快放于-4℃――20℃冰箱內(nèi)。DNA,RNA采樣后,N2速凍,至-70℃冰箱。對(duì)RNA樣,如不立即使用,冷凍保存尤為重要。.3.微生物:選材:應(yīng)注意它的生長(zhǎng)期,在微生物的對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期,酶和核酸的含量較高,可以獲得高產(chǎn)量,以微生物為材料時(shí)有兩種情況:
a.利用微生物菌體分泌到培養(yǎng)基中的代謝產(chǎn)物和胞外酶等。一般用離心法收集上清液,上清液只能在低溫下短期保存
b.利用菌體含有的生化物質(zhì),如:蛋白質(zhì),核酸和胞內(nèi)酶等。需破碎菌體細(xì)胞分離,濕菌體可低溫短期保存,凍干粉可在4℃保存數(shù)月。3..二.確定測(cè)定方法在效成分在原材料中含量較低,純化是使其純度增高的過程,因此,提取和分離的每個(gè)步驟均要測(cè)定有效成分的含量。測(cè)定方法要專一、準(zhǔn)確、靈敏和簡(jiǎn)便。使用較多的測(cè)定方法有分光光度法、熒光分析法、生物活性(如酶活力、激素活性)測(cè)定、電泳分析等,有時(shí)可用電化學(xué)法和免疫分析法。.三.細(xì)胞的破碎1.機(jī)械破碎:(1)研磨法:剪碎的動(dòng)物組織如鼠肝、兔肝等置研缽中,用研磨棒研碎。為了提高研磨效果,可加入一定量的石英砂。用勻漿器處理,也能破碎動(dòng)物細(xì)胞。此法較溫和,適宜實(shí)驗(yàn)室使用。但加石英砂時(shí),要注意其對(duì)有效成分的吸附作用。如系大規(guī)模生產(chǎn)時(shí),可用電動(dòng)研磨法。細(xì)菌和植物組織的細(xì)胞破碎均可用此法。.(2)組織搗碎器法:用搗碎器(轉(zhuǎn)速8000-10000r/m)處理30-45s可將植物和動(dòng)物細(xì)胞完全破碎。如用其破碎酵母菌和細(xì)菌的細(xì)胞時(shí),須加入石英砂才有效。但是在搗碎期間必須保持低溫,搗碎的時(shí)間不易太長(zhǎng),以防溫度升高引起有效成分變性?,F(xiàn)在多用細(xì)胞破碎儀。(3)超聲波法:借助聲波的震動(dòng)力破碎細(xì)胞壁和細(xì)胞器的有效方法。多用于微生物細(xì)胞的破碎,一般輸出功率100-200W,破碎時(shí)間3—15min。如果在細(xì)胞懸浮液中加石英砂則可縮短時(shí)間。為了防止電器長(zhǎng)時(shí)間運(yùn)轉(zhuǎn)產(chǎn)生過多的熱量,常采用間歇處理和降低溫度的方法進(jìn)行。.(4)壓榨法:是一種溫和、徹底破碎細(xì)胞的方法。用30MPa左右的壓力迫使幾十毫升細(xì)胞懸液通過一個(gè)小孔(<細(xì)胞直徑的孔),致使其被擠破、壓碎。(5)凍融法:將細(xì)胞置低溫下冰凍一定時(shí)間,然后取出置室溫下(或40℃左右)迅速融化。如此反復(fù)凍融多次,細(xì)胞可在形成冰粒和增高剩余胞液鹽濃度的同時(shí),發(fā)生溶脹、破碎。.2.溶漲和自溶:
溶漲:細(xì)胞膜為天然的半透膜,在低滲溶液如低濃度的稀鹽溶液中,由于存在滲透壓差,溶劑分子大量進(jìn)入細(xì)胞,引起細(xì)胞膜發(fā)生脹破的現(xiàn)象稱溶脹。例如紅血球置清水中會(huì)迅速溶脹破裂并釋放出血紅素。自溶:細(xì)胞結(jié)構(gòu)在本身所具有的各種水解酶如蛋白酶和酯酶等作用下,發(fā)生溶解的現(xiàn)象稱自溶。應(yīng)用此法時(shí)要特別小心操作,因?yàn)樗饷覆粌H可使細(xì)胞壁、細(xì)胞膜破壞,同時(shí)也可將某些有效成分在自溶時(shí)分解。.
3.化學(xué)處理:
用脂溶性的溶劑(如丙酮、氯仿、甲苯)或表面活性劑(如十二烷基磺酸鈉、十二烷基硫酸鈉)處理細(xì)胞時(shí),可將細(xì)胞壁、細(xì)胞膜的結(jié)構(gòu)部分溶解,進(jìn)而使細(xì)胞釋放出各種酶類或DNA等物質(zhì),并導(dǎo)致整個(gè)細(xì)胞破碎。
.4.生物酶降解:生物酶(如溶菌酶)有降解細(xì)菌細(xì)胞壁的功能。在用此法處理細(xì)菌細(xì)胞時(shí),先是細(xì)胞壁消解,隨之而來的是因滲透壓差引起的細(xì)胞膜破裂,最后導(dǎo)致細(xì)胞完全破碎。例如從某些細(xì)菌細(xì)胞提取質(zhì)粒DNA時(shí),不少方法都采用了加溶菌酶(來自蛋清)破壞細(xì)胞壁的步驟。當(dāng)有些細(xì)菌對(duì)溶菌酶不敏感時(shí),可加巰基乙醇(ME)或者8mol/L的尿素,以促進(jìn)細(xì)胞壁的消化。另外,也可加入蛋白酶K來提高破壁效果。而在破壞酵母菌的細(xì)胞時(shí),可采用蝸牛酶進(jìn)行。一般對(duì)數(shù)期的酵母細(xì)胞對(duì)該酶較敏感。將酵母細(xì)胞懸于0.1mol/L檸檬酸/磷酸氫二鈉緩沖液(pH5.4)中,加入1%蝸牛酶,在30℃處理30分鐘,即可使大部分細(xì)胞壁破裂,如同時(shí)加入0.2%巰基乙醇效果更好。.四.抽提1.抽提的含義:
抽提通常是指用適當(dāng)?shù)娜軇┖头椒◤脑牧现邪延行С煞址蛛x出來的過程。經(jīng)過處理的原材料中的有效成分可用緩沖液、稀酸、稀堿、或有機(jī)溶劑(如丙酮、乙醇)等抽提,有時(shí)還可用蒸餾水抽提。一般理想的抽提液應(yīng)具備下述條件:對(duì)有效成分溶解度大,破壞作用小;對(duì)雜質(zhì)不溶解或溶解度很??;來源廣泛、價(jià)格低廉、操作安全等。.2.抽提的影響因子在抽提階段,pH值、金屬離子、溶劑的濃度和極性等因子,可明顯影響有效成分的性質(zhì)和數(shù)量。因此選擇抽提液必須考慮這些因素。(1)pH值:改變?nèi)苜|(zhì)解離狀態(tài)。對(duì)蛋白質(zhì)或酶等具有等電點(diǎn)的兩性電解質(zhì)物質(zhì),一般選擇抽提液的pH值應(yīng)在偏離等電點(diǎn)的穩(wěn)定范圍內(nèi)。通常堿性蛋白質(zhì)選用低pH值的溶液抽提,酸性蛋白質(zhì)選用高pH值的溶液抽提,或者用調(diào)至一定pH值的有機(jī)溶劑抽提。注意:當(dāng)用酸,堿控制溶液pH值時(shí),要邊加邊攪,防止局部出現(xiàn)過高的酸,堿濃度造成蛋白變性。
.(2)溶劑的極性和離子強(qiáng)度:有些生物大分子在極性大、離子強(qiáng)度高的溶液中穩(wěn)定;有些則在極性小、離子強(qiáng)度低的溶液中穩(wěn)定。例如提取刀豆球蛋白A時(shí),用0.15mol/L甚至更高濃度的NaCl溶液,都可使其從刀豆粉中溶解出來,穩(wěn)定存在。而抽提脾磷酸二酯酶時(shí),則需用0.2mol/L蔗糖水溶液。一種物質(zhì)溶解度大小與溶劑性質(zhì)密切相關(guān)(相似相溶原理);離子強(qiáng)度通過影響溶質(zhì)的帶電性也影響溶質(zhì)的溶解度。降低極性:在水溶液中加蔗糖,甘油,二甲亞砜,二甲基甲酰氨。.提高離子強(qiáng)度:在水溶液中加中性鹽(KCl,NaCl,NH4Cl,(NH4)2SO4)一般離子強(qiáng)度較低的中性鹽溶液可促進(jìn)蛋白溶解(鹽溶),高離子強(qiáng)度的中性鹽可引起蛋白質(zhì)沉淀,析出(鹽析)。高離子強(qiáng)度使DNA溶解度增加;低離子強(qiáng)度使RNA溶解度增加(核酸分離依據(jù))。常用的鹽溶液是NaCl溶液,濃度以0.15mol/L為宜。但是在提取核蛋白或細(xì)胞器中的蛋白質(zhì)時(shí),為促使蛋白質(zhì)與核酸、蛋白質(zhì)與細(xì)胞器分離,則宜用高濃度(0.5-2.0mol/L)的鹽溶液。.(3)水解酶:細(xì)胞破裂后,許多水解酶釋放出來。水解酶與欲抽提的蛋白質(zhì)或核酸接觸時(shí),一旦條件適宜,就會(huì)發(fā)生反應(yīng),導(dǎo)致蛋白質(zhì)或核酸分解,而使實(shí)驗(yàn)失敗。為此,必須采用加入抑制劑,調(diào)節(jié)抽提液的pH、離子濃度或極性等方法,使這些酶喪失活性。如:提取,純化胰島素時(shí),為阻止胰蛋白酶活化,采用68%的乙醇溶液(pH2.5-3.0,用草酸調(diào)節(jié)),在13-15℃抽提3h,可得到較高的回收率。因?yàn)?8%乙醇可使胰蛋白酶暫時(shí)失活,草酸可除去蛋白酶的激活劑Ca2+,酸性環(huán)境也抑制酶蛋白活性。RNA提取需防止RNase的水解作用,RNase活性很高,很容易使RNA降解,所以每一步都嚴(yán)格控制RNase,可采用DEPC(焦碳酸二乙脂)處理,帶手套操作,提取液中加強(qiáng)的變性劑異硫氰酸胍等措施。
.(4)溫度:一般認(rèn)為蛋白質(zhì)或酶制品在低溫(如0℃左右)時(shí)最穩(wěn)定。例如:在生產(chǎn)人絨毛膜促性腺激素(HCG,糖蛋白)制品時(shí),一定要在低溫下進(jìn)行。當(dāng)溫度低于8℃時(shí),從200公斤孕婦尿中可提取約100克HCG粗品(活力為160u/mg);當(dāng)溫度高于20℃時(shí),從400公斤孕婦尿中都提取不到100克粗品,而且活力很低。此外,高溫下制備的HCG粗品很難進(jìn)一步純化至3500u/mg,原因是高溫會(huì)使HCG受到微生物和/或糖苷酶的破壞。一般提高溫度,溶解度增加,但易使大分子物質(zhì)變性失活。小分子物質(zhì):50-70℃;生物大分子:0-10℃,最好控制在0-4℃.(5)攪拌:攪拌能促使欲抽提物與抽提液的接觸,并能增加溶解度。但是,一般宜采用溫和的攪拌方法,速度太快時(shí)容易產(chǎn)生泡沫,導(dǎo)致某些酶類變性失活。(6)氧化:一般蛋白質(zhì)都含相當(dāng)數(shù)量的巰基,該基團(tuán)常常是酶和蛋白質(zhì)的必須基團(tuán),若抽提液中存在氧化劑或氧分子時(shí),會(huì)使巰基形成分子內(nèi)或分子間的二硫鍵,導(dǎo)致酶(或蛋白質(zhì))失活(或變性)。在提取液中加入巰基乙醇,半胱氨酸。還原性谷胱甘肽等還原劑,可防止巰基發(fā)生氧化,使蛋白,酶失活。.(7)金屬離子:蛋白質(zhì)的巰基除易受氧化劑作用外,還能和金屬離子如鉛、鐵或銅作用,產(chǎn)生沉淀復(fù)合物。這些金屬離子主要來源于制備緩沖液的試劑中。解決的辦法:①用無離子水或重蒸水配制試劑;②在配制的試劑中加入1-3mmol/L的EDTA(金屬離子絡(luò)合劑)。(8)抽提液與抽提物的比例:在抽提時(shí),抽提液與抽提物的比例要適當(dāng),一般以5∶1為宜。如抽提液過多,則有利于有效成分的提取,但不利于純化工序的進(jìn)行。.第三節(jié)離心分離技術(shù)離心技術(shù)在生物科學(xué),特別是在生物化學(xué)和分子生物學(xué)研究領(lǐng)域,已得到十分廣泛的應(yīng)用,每個(gè)生物化學(xué)和分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室都要裝備多種形式的離心機(jī)。離心技術(shù)主要用于各種生物樣品的分離和制備,生物樣品懸浮液在高速旋轉(zhuǎn)下,由于巨大的離心力作用,使懸浮的微小顆粒(細(xì)胞器、生物大分子的沉淀等)以一定的速度沉降,從而與溶液得以分離,而沉降速度取決于顆粒的質(zhì)量、大小和密度。.一.基本原理:⒈離心力(centrifugalforce,F(xiàn)c):
當(dāng)一個(gè)粒子(生物大分子或細(xì)胞器)在高速旋轉(zhuǎn)下受到的離心作用力“Fc”由下式定義:
Fc=m·a=m·ω2r
a:粒子旋轉(zhuǎn)的加速度,m:沉降粒子的有效質(zhì)量,ω:粒子旋轉(zhuǎn)的角速度,r:粒子的旋轉(zhuǎn)半徑(cm)。
.⒉相對(duì)離心力(relativecentrifugalforce,RCF):
由于在轉(zhuǎn)速相同的情況下,離心力會(huì)隨離心機(jī)轉(zhuǎn)子的半徑或者離心管至旋轉(zhuǎn)軸中心的距離變化,因此在文獻(xiàn)中常用“相對(duì)離心力”或“數(shù)字×g”表示離心力,RCF就是實(shí)際離心場(chǎng)轉(zhuǎn)化為重力加速度的倍數(shù)。
X為離心轉(zhuǎn)子的半徑距離,以cm為單位;g為地球重力加速度(980cm/sec2);n為轉(zhuǎn)子每分鐘的轉(zhuǎn)數(shù)(revolutionsperminute,簡(jiǎn)寫成r/min,或rpm)。
22.一般在低速離心時(shí)(轉(zhuǎn)速小于5000r/min),離心力的大小常用r/min來表示,而超速離心時(shí)則用g或×g來表示。由于離心管中從管口到旋轉(zhuǎn)中心的距離是不同的,所以在同樣轉(zhuǎn)速時(shí),管口和管底所受到的離心力也有差別。例如:在某個(gè)角度轉(zhuǎn)頭中,離心管口到旋轉(zhuǎn)中心的距離為4.8cm,而離心管底到旋轉(zhuǎn)中心的距離是8.0cm,當(dāng)轉(zhuǎn)速為12000r/min是,離心管口和離心管底所受到的相對(duì)離心力RCF分別是:RCF(管口)=1.118×10-5×(12000)2×4.8=7734gRCF(管底)=1.118×10-5×(12000)2×8.0=12891g科技文獻(xiàn)中離心力的數(shù)據(jù)通常是指其平均值(RCFav),即離心管中點(diǎn)的離心力。旋轉(zhuǎn)軸340rminravrmax.為便于進(jìn)行轉(zhuǎn)速和相對(duì)離心力之間的換算,Dole和Cotzias利用RCF的計(jì)算公式,制作了轉(zhuǎn)速“rpm”、相對(duì)離心力“RCF”和旋轉(zhuǎn)半徑“r”三者關(guān)系的列線圖,圖式法比公式計(jì)算法方便。換算時(shí),先在r標(biāo)尺上取已知的半徑和在rpm標(biāo)尺上取已知的離心機(jī)轉(zhuǎn)數(shù),然后將這兩點(diǎn)間劃一條直線,與圖中RCF標(biāo)尺上的交叉點(diǎn)即為相應(yīng)的相對(duì)離心力數(shù)值。.⒊沉降系數(shù)(sedimentationcoefficient,s):根據(jù)1924年Svedberg對(duì)沉降系數(shù)下的定義為顆粒在單位離心力場(chǎng)中粒子移動(dòng)的速度。若ω用2πn/60表示,則X1:離心前粒子到旋轉(zhuǎn)軸的距離。X2:離心后粒子到旋轉(zhuǎn)軸的距離。S:一般在10-13秒左右,故把沉降系數(shù)10-13秒稱為一個(gè)Svedberg單位,簡(jiǎn)寫S,量綱為秒。例如,動(dòng)物細(xì)胞的核糖體沉降系數(shù)等于80S,它的含義就是:80×10-13s。細(xì)胞及細(xì)胞的各組分的沉降系數(shù)有很大的差異,所以可以利用生物樣品沉降系數(shù)的差異采用離心技術(shù)將他們彼此分開。
.5.沉降系數(shù)與物質(zhì)相對(duì)分子質(zhì)量:由沉降系數(shù)根據(jù)Svedberg公式可以計(jì)算出物質(zhì)的相對(duì)分子質(zhì)量:
Mr=RTS20,w/[D20,w(1-γρ)]Mr:相對(duì)分子質(zhì)量;D20,w:以20℃的水為介質(zhì)時(shí)顆粒的擴(kuò)散系數(shù);R:氣體常數(shù);T:絕對(duì)溫度;S20,w:以20℃的水為介質(zhì)時(shí)顆粒的沉降系數(shù);γ:偏比容,等于溶質(zhì)粒子密度的倒數(shù);ρ:溶劑密度。
.6.沉降時(shí)間(sedimentationtime,Ts):在實(shí)際工作中,常常需要在已有的離心機(jī)上把某一種溶質(zhì)從溶液中全部沉降分離出來,這就必須首先知道用多大轉(zhuǎn)速與多長(zhǎng)時(shí)間可達(dá)到目的。如果轉(zhuǎn)速已知,則需確定分離某粒子所需的時(shí)間。根據(jù)沉降系數(shù)(S)式可得積分得X2:離心轉(zhuǎn)軸至離心管底內(nèi)壁的距離;X1:離心轉(zhuǎn)軸至樣品溶液面之間的距離,將(t2-t1)用Ts表示:其中的(lnXmax?lnXmin)/ω2為一常數(shù),稱k常數(shù)或k值。.二.離心機(jī)的主要構(gòu)造和類型:離心機(jī)可分為工業(yè)用離心機(jī)和實(shí)驗(yàn)用離心機(jī)。實(shí)驗(yàn)用離心機(jī)又分為制備性離心機(jī)和分析性離心機(jī),制備性離心機(jī)主要用于分離各種生物材料,每次分離的樣品容量比較大,分析性離心機(jī)一般都帶有光學(xué)系統(tǒng),主要用于研究純的生物大分子和顆粒的理化性質(zhì),依據(jù)待測(cè)物質(zhì)在離心場(chǎng)中的行為(用離心機(jī)中的光學(xué)系統(tǒng)連續(xù)監(jiān)測(cè)),能推斷物質(zhì)的純度、形狀和相對(duì)分子質(zhì)量等。分析性離心機(jī)都是超速離心機(jī)。.1.制備性離心機(jī)可分為三類:
低速離心機(jī):最大轉(zhuǎn)速6000rpm左右,最大相對(duì)離心力近6000×g,容量為幾十毫升至幾升,分離形式是固液沉降分離??捎盟睫D(zhuǎn)頭,角度轉(zhuǎn)頭,其轉(zhuǎn)速不能嚴(yán)格控制,通常不帶冷凍系統(tǒng),于室溫下操作,用于收集易沉降的大顆粒物質(zhì),如紅血球、酵母細(xì)胞等。這種離心機(jī)多用交流整流子電動(dòng)機(jī)驅(qū)動(dòng),電機(jī)的碳刷易磨損,轉(zhuǎn)速是用電壓調(diào)壓器調(diào)節(jié),起動(dòng)電流大,速度升降不均勻,一般轉(zhuǎn)頭是置于一個(gè)硬質(zhì)鋼軸上,因此精確地平衡離心管及內(nèi)容物就極為重要,否則會(huì)損壞離心機(jī)。.
高速離心機(jī):最大轉(zhuǎn)速為20000-25000rpm(r/min),最大相對(duì)離心力為89000×g,最大容量可達(dá)3升,分離形式也是固液沉降分離,通常配有各種角式轉(zhuǎn)頭、蕩平式轉(zhuǎn)頭、區(qū)帶轉(zhuǎn)頭、垂直轉(zhuǎn)頭和大容量連續(xù)流動(dòng)式轉(zhuǎn)頭、一般都有制冷系統(tǒng),以消除高速旋轉(zhuǎn)轉(zhuǎn)頭與空氣之間摩擦而產(chǎn)生的熱量,離心室的溫度可以調(diào)節(jié)和維持在0-40oC,轉(zhuǎn)速、溫度和時(shí)間都可以嚴(yán)格準(zhǔn)確地控制,并有指針或數(shù)字顯示。通常用于微生物菌體、細(xì)胞碎片、大細(xì)胞器、蛋白質(zhì)的硫酸銨沉淀物和免疫沉淀物等的分離純化工作,但不能有效地沉降病毒、小細(xì)胞器(如核蛋白體)或單個(gè)分子。..
超速離心機(jī):大于30×103r/min,最大離心力600,000g,有驅(qū)動(dòng)和速度控制系統(tǒng),溫度控制系統(tǒng),真空系統(tǒng)(減少摩擦)。新式的有微處理機(jī)(按編定程序運(yùn)轉(zhuǎn),自動(dòng)計(jì)算速度和時(shí)間)。有40多種不同容量和性能的轉(zhuǎn)頭給用戶選擇。離心容量由幾十毫升至2升,分離的形式是差速沉降分離和密度梯度區(qū)帶分離,離心管平衡允許的誤差要小于0.1克。超速離心機(jī)的出現(xiàn),使生物科學(xué)的研究領(lǐng)域有了新的擴(kuò)展,它能使過去僅僅在電子顯微鏡觀察到的亞細(xì)胞器得到分級(jí)分離,還可以分離病毒、核酸、蛋白質(zhì)和多糖等。.
角式轉(zhuǎn)頭是指離心管腔與轉(zhuǎn)軸成一定傾角的轉(zhuǎn)頭。它是由一塊完整的金屬制成的,其上有4-12個(gè)裝離心管用的機(jī)制孔穴,即離心管腔,孔穴的中心軸與旋轉(zhuǎn)軸之間的角度在20-40度之間,角度越大分離效果越好。優(yōu)點(diǎn)是具有較大的容量,且重心低,運(yùn)轉(zhuǎn)平衡,壽命較長(zhǎng),顆粒在沉降時(shí)先沿離心力方向撞向離心管壁,然后再沿管壁滑向管底,因此管的一側(cè)就會(huì)出現(xiàn)顆粒沉積,此現(xiàn)象稱為“壁效應(yīng)”。壁效應(yīng)容易使沉降顆粒受突然變速所產(chǎn)生的對(duì)流擾亂,影響分離效果。.⑵蕩平式轉(zhuǎn)頭:這種轉(zhuǎn)頭有4或6個(gè)自由活動(dòng)的吊桶(離心套管),當(dāng)轉(zhuǎn)頭靜止時(shí),吊桶垂直懸掛,當(dāng)轉(zhuǎn)頭轉(zhuǎn)速達(dá)到每分鐘200到800轉(zhuǎn)時(shí),吊桶蕩至水平位置,這種轉(zhuǎn)頭最適合做密度梯度區(qū)帶離心優(yōu)點(diǎn)是梯度物質(zhì)可放在保持垂直的離心管中,離心時(shí)被分離的樣品帶垂直于離心管縱軸,而不像角式轉(zhuǎn)頭中樣品沉淀物的界面與離心管成一定角度,因而有利于離心結(jié)束后由管內(nèi)分層取出已分離的各樣品帶。其缺點(diǎn)是顆粒沉降距離長(zhǎng),離心所需時(shí)間也長(zhǎng)。..⑶區(qū)帶轉(zhuǎn)頭:區(qū)帶轉(zhuǎn)頭無離心管,主要由一個(gè)轉(zhuǎn)子桶和可旋開的頂蓋組成,轉(zhuǎn)子桶中裝有十字型隔板裝置,把桶內(nèi)分隔成四個(gè)或多個(gè)扇形小室,隔板內(nèi)有導(dǎo)管,梯度液或樣品液從轉(zhuǎn)頭中央的進(jìn)液管泵入,通過這些導(dǎo)管分布到轉(zhuǎn)子四周,轉(zhuǎn)頭內(nèi)的隔板可保持樣品帶和梯度介質(zhì)的穩(wěn)定。.沉降的樣品顆粒在區(qū)帶轉(zhuǎn)頭中的沉降情況不同于角式和外擺式轉(zhuǎn)頭,在徑向的散射離心力作用下,顆粒的沉降距離不變,因此區(qū)帶轉(zhuǎn)頭的“壁效應(yīng)”極小,可以避免區(qū)帶和沉降顆粒的紊亂,分離效果好,而且還有轉(zhuǎn)速高,容量大,回收梯度容易和不影響分辨率的優(yōu)點(diǎn),使超離心用于制備和工業(yè)生產(chǎn)成為可能。區(qū)帶轉(zhuǎn)頭的缺點(diǎn)是樣品和介質(zhì)直接接觸轉(zhuǎn)頭,耐腐蝕要求高,操作復(fù)雜。.⑷垂直轉(zhuǎn)頭:其離心管垂直放置,樣品顆粒的沉降距離短,離心所需時(shí)間也短,適用于密度梯度區(qū)帶離心,離心開始時(shí)和結(jié)束時(shí)液面和樣品區(qū)帶要作九十度轉(zhuǎn)向,因而降速要慢。.⑸連續(xù)流動(dòng)轉(zhuǎn)頭:可用于大量培養(yǎng)液或提取液的濃縮與分離,轉(zhuǎn)頭與區(qū)帶轉(zhuǎn)頭類似,由轉(zhuǎn)子桶和有入口和出口的轉(zhuǎn)頭蓋及附屬裝置組成,離心時(shí)樣品液由入口連續(xù)流入轉(zhuǎn)頭,在離心力作用下,懸浮顆粒沉降于轉(zhuǎn)子桶壁,上清液由出口流出。
.3.離心管離心管主要用塑料和不銹鋼制成:塑料離心管常用材料有聚乙烯(PE),聚碳酸酯(PC),聚丙烯(PP)等,其中PP管性能較好。塑料離心管的優(yōu)點(diǎn)是透明(或半透明),硬度小,可用穿刺法取出梯度。缺點(diǎn)是易變形,抗有機(jī)溶劑腐蝕性差,使用壽命短。不銹鋼管強(qiáng)度大,不變形,能抗熱,抗凍,抗化學(xué)腐蝕。但用時(shí)也應(yīng)避免接觸強(qiáng)腐蝕性的化學(xué)藥品,如強(qiáng)酸、強(qiáng)堿等。塑料離心管都有管蓋,離心前管蓋必須蓋嚴(yán),倒置不漏液。管蓋有三種作用:①防止樣品外泄。用于有放射性或強(qiáng)腐蝕性的樣品時(shí),這點(diǎn)尤其重要。②防止樣品揮發(fā)。③支持離心管,防止離心管變形。.4.分析性離心機(jī)分析性離心機(jī)使用了特殊設(shè)計(jì)的轉(zhuǎn)頭和光學(xué)檢測(cè)系統(tǒng),以便連續(xù)地監(jiān)視物質(zhì)在一個(gè)離心場(chǎng)中的沉降過程。從而確定其物理性質(zhì)。利用特殊配置的數(shù)據(jù)處理機(jī)自動(dòng)計(jì)算s(沉降系數(shù))和Mr。主要用于生物大分子的相對(duì)分子質(zhì)量測(cè)定,估價(jià)樣品純度和檢測(cè)生物大分子構(gòu)象的變化等。主要產(chǎn)品有美國(guó)Beckman公司的ModelE及日本日立公司的282型。..分析性超速離心機(jī)的轉(zhuǎn)頭是橢圓形的,以避免應(yīng)力集中于孔處。轉(zhuǎn)頭通過一個(gè)有柔性的軸聯(lián)接到高速的驅(qū)動(dòng)裝置上,轉(zhuǎn)頭在低溫和真空的腔室中旋轉(zhuǎn),轉(zhuǎn)頭上有2-6個(gè)裝離心杯的小室,離心杯是扇形石英的,可以上下透光,離心機(jī)中裝有光學(xué)系統(tǒng),在整個(gè)離心期間都能通過紫外吸收或折射率的變化監(jiān)測(cè)離心杯中沉降著的物質(zhì),在預(yù)定的期間可以拍攝沉降物質(zhì)的照片,在分析離心杯中物質(zhì)沉降情況時(shí),在重顆粒和輕顆粒之間形成的界面就像一個(gè)折射的透鏡,結(jié)果在檢測(cè)系統(tǒng)的照像底板上產(chǎn)生了一個(gè)“峰”,隨著沉降的不斷進(jìn)行,界面向前推進(jìn),因此峰也移動(dòng),從峰移動(dòng)的速度可以計(jì)算出樣品顆粒的沉降速度。分析性超速離心機(jī)的主要特點(diǎn)就是能在短時(shí)間內(nèi),用少量樣品就可以得到一些重要信息,能夠確定生物大分子是否存在,其大致的含量,計(jì)算生物大分子的沉降系數(shù),結(jié)合界面擴(kuò)散,估計(jì)分子的大小,檢測(cè)分子的不均一性及混合物中各組份的比例,測(cè)定生物大分子的分子量,還可以檢測(cè)生物大分子的構(gòu)象變化等。.三.離心分離方法的選擇1.差速離心法:
這是最普通的離心法。即采用逐漸增加離心速度或低速和高速交替進(jìn)行離心,使沉降速度不同的顆粒,在不同的離心速度及不同離心時(shí)間下分批分離的方法。此法一般用于分離沉降系數(shù)相差較大的顆粒。差速離心首先要選擇好顆粒沉降所需的離心力和離心時(shí)間。當(dāng)以一定的離心力在一定的離心時(shí)間內(nèi)進(jìn)行離心時(shí),在離心管底部就會(huì)得到最大和最重顆粒的沉淀,分出的上清液在加大轉(zhuǎn)速下再進(jìn)行離心,又得到第二部分較大較重顆粒的沉淀及含較小和較輕顆粒的上清液,如此多次離心處理,即能把液體中的不同顆粒較好地分離開。此法所得的沉淀是不均一的,仍雜有其它成分,需經(jīng)過2-3次的再懸浮和再離心,才能得到較純的顆粒。..
此法主要由于組織勻漿液中分離細(xì)胞器和病毒,其優(yōu)點(diǎn)是:操作簡(jiǎn)易,離心后用傾倒法即可將上清液與沉淀分開,并可使用容量較大的角式轉(zhuǎn)子。缺點(diǎn)是:須多次離心,沉淀中有夾帶,分離效果差,不能一次得到純顆粒,沉淀于管底的顆粒受擠壓,容易變性失活。.2.密度梯度離心:又稱速率區(qū)帶離心法。是在離心前于離心管內(nèi)先裝入密度梯度介質(zhì)(如蔗糖、甘油、KBr、CsCl等),待分離的樣品鋪在梯度液的頂部、離心管底部或梯度層中間,同梯度液一起離心。在一定的離心力下把顆粒分配到梯度中某些特定位置上,形成不同區(qū)帶的分離方法。離心后在近旋轉(zhuǎn)軸處(X1)的介質(zhì)密度最小,離旋轉(zhuǎn)軸最遠(yuǎn)處(X2)介質(zhì)的密度最大,但最大介質(zhì)密度必須小于樣品中粒子的最小密度,即ρP>ρm。這種方法是根據(jù)分離的粒子在梯度液中沉降速度的不同,使具有不同沉降速度的粒子處于不同的密度梯度層內(nèi)分成一系列區(qū)帶,達(dá)到彼此分離的目的。梯度液在離心過程中以及離心完畢后,取樣時(shí)起著支持介質(zhì)和穩(wěn)定劑的作用,避免因機(jī)械振動(dòng)而引起已分層的粒子再混合。此法僅用于分離有一定沉降系數(shù)差的顆粒(20%的沉降系數(shù)差或更大)或相對(duì)分子質(zhì)量相差3倍的蛋白質(zhì)。大小相同,密度不同的顆粒(如線粒體,溶酶體等)不能用此法分離。.離心管先裝在密度梯度介質(zhì)溶液,樣品液加在梯度介質(zhì)的液面上,離心時(shí),由于離心力的作用,顆粒離開原樣品層,按不同沉降速度向管底沉降,離心一定時(shí)間后,沉降的顆粒逐漸分開,最后形成一系列界面清楚的不連續(xù)區(qū)帶。沉降系數(shù)越大,往下沉降越快,所呈現(xiàn)的區(qū)帶會(huì)越靠近離心管底。.由ρP>ρm可知S>0,因此該離心法的離心時(shí)間要嚴(yán)格控制,既有足夠的時(shí)間使各種粒子在介質(zhì)梯度中形成區(qū)帶,又要控制在任一粒子達(dá)到離心管底之前。如果離心時(shí)間過長(zhǎng),所有的樣品可全部到達(dá)離心管底部;離心時(shí)間不足,樣品還沒有分離。離心必須在沉降最快的大顆粒到達(dá)管底前結(jié)束,樣品顆粒的密度要大于梯度介質(zhì)的密度。梯度介質(zhì)通常用蔗糖溶液,其最大密度和濃度可達(dá)1.28kg/cm3和60%。此法是一種不完全的沉降,沉降受物質(zhì)本身大小的影響較大,一般是用于分離大小相異而密度相似的物質(zhì)。.3.等密度離心:
密度梯度液包含了被
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