二代測(cè)序技術(shù)檢測(cè)地中海貧血多種突變的研究的開(kāi)題報(bào)告

二代測(cè)序技術(shù)檢測(cè)地中海貧血多種突變的研究的開(kāi)題報(bào)告一、選題背景地中海貧血（β-地中海貧血）是一種常見(jiàn)的遺傳性血液病，主要發(fā)生在地中海沿岸地區(qū)、中東和印度等地。該病通過(guò)遺傳方式傳遞，主要是由于HaemoglobinBeta基因的突變所導(dǎo)致的。當(dāng)兩個(gè)攜帶有突變基因的父母生育時(shí)，可能會(huì)產(chǎn)生攜帶雙倍突變基因的孩子，表現(xiàn)為血紅蛋白的合成障礙和貧血等癥狀，對(duì)患者身體健康造成較大危害。目前，早期診斷和治療是控制地中海貧血的有效措施。診斷地中海貧血所用的方法以往主要是采用血涂片、紅細(xì)胞計(jì)數(shù)和血紅蛋白電泳等傳統(tǒng)診斷方法，但這種診斷方法不夠準(zhǔn)確，而且有時(shí)病人可能攜帶多種突變基因，難以被及時(shí)發(fā)現(xiàn)。因此，二代測(cè)序技術(shù)成為一種新型的診斷方法，它可以實(shí)現(xiàn)對(duì)多個(gè)基因同時(shí)進(jìn)行檢測(cè)、分析和篩選，具有高通量、準(zhǔn)確性高等優(yōu)點(diǎn)。二、研究目的本研究旨在通過(guò)二代測(cè)序技術(shù)檢測(cè)地中海貧血常見(jiàn)突變，篩查患者中是否存在同源和異源復(fù)合突變，為地中海貧血的早期診斷和治療提供基礎(chǔ)研究數(shù)據(jù)，同時(shí)為地中海沿岸地區(qū)和中東地區(qū)地中海貧血的遺傳分析提供參考依據(jù)。三、研究?jī)?nèi)容和方法1.研究?jī)?nèi)容1）收集地中海貧血患者樣本，提取總DNA；2）構(gòu)建目標(biāo)區(qū)域文庫(kù)；3）進(jìn)行高通量二代測(cè)序；4）對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析和比對(duì)；5）篩查和鑒定患者的地中海貧血常見(jiàn)突變以及同源和異源復(fù)合突變；6）繪制突變分布圖。2.研究方法（1）樣本收集和總DNA提取收集地中海貧血患者的外周血樣本，并采用離體分離外周血白細(xì)胞的方法提取總DNA，作為二代測(cè)序的樣本。（2）目標(biāo)區(qū)域文庫(kù)構(gòu)建在已知地中海貧血常見(jiàn)突變的基礎(chǔ)上，設(shè)計(jì)引物擴(kuò)增出含這些突變位點(diǎn)的文庫(kù)，進(jìn)行二代測(cè)序。（3）高通量二代測(cè)序?qū)⑽膸?kù)進(jìn)行高通量二代測(cè)序，獲取原始序列數(shù)據(jù)。（4）數(shù)據(jù)分析和比對(duì)對(duì)原始數(shù)據(jù)進(jìn)行質(zhì)量控制，剔除低質(zhì)量序列，使用各種軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析、處理和比對(duì)，對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行基因型分析和基因變異分析，挖掘出地中海貧血的常見(jiàn)突變位點(diǎn)，并檢測(cè)同源和異源復(fù)合突變。（5）篩查患者的常見(jiàn)突變和同源或異源復(fù)合突變對(duì)研究檢測(cè)到的地中海貧血常見(jiàn)突變和同源或異源復(fù)合突變進(jìn)行人工驗(yàn)證。（6）繪制突變分布圖根據(jù)篩查和鑒定出的突變結(jié)果，繪制地中海貧血的突變分布圖。四、預(yù)期成果1.完成對(duì)地中海貧血患者常見(jiàn)突變檢測(cè)及地中海貧血的同源和異源復(fù)合突變檢測(cè)。2.繪制地中海貧血突變分布圖。3.