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文檔簡介
ICS07.080
B20/39
中華人民共和國國家標(biāo)準(zhǔn)
GB/TXXXXX—2017
核酸適體活性評價標(biāo)準(zhǔn)操作規(guī)范
Generaltechniquerulesforactivityevaluationofaptamer
點擊此處添加與國際標(biāo)準(zhǔn)一致性程度的標(biāo)識
(工作組討論稿)
-XX-XX發(fā)布XXXX-XX-XX實施
GB/TXXXXX—2017
核酸適體活性評價標(biāo)準(zhǔn)操作規(guī)范
1范圍
本標(biāo)準(zhǔn)規(guī)定了核酸適配體與靶標(biāo)結(jié)合的親和力和特異性的評價,確立核酸適配體與靶標(biāo)結(jié)合的專一
性和選擇性的方法驗證,建立性能評價的技術(shù)通則。
本標(biāo)準(zhǔn)適用于針對細(xì)胞,大分子,小分子,復(fù)雜靶標(biāo)等不同層次靶標(biāo)體系的核酸適配體。
2規(guī)范性引用文件
下列文件對于本文件的應(yīng)用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,僅所注日期的版本適用于本文
件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適用于本文件。
GB/T6682分析實驗室用水規(guī)格和試驗方法
SN/T1193基因檢驗實驗室技術(shù)要求
3術(shù)語和定義
3.1核酸適配體(Aptamer)
能夠與多種目標(biāo)物(蛋白、藥物、金屬離子、無機(jī)或有機(jī)分子、細(xì)胞、組織)發(fā)生高親和性和特異
性結(jié)合的一類單鏈核苷酸(DNA或RNA)分子。
3.2平衡解離常數(shù)(disocciationconstant,Kd)
是靶標(biāo)物質(zhì)被核酸配體結(jié)合一半時靶標(biāo)物質(zhì)的濃度常數(shù)。
4操作步驟
4.1核酸適配體與靶標(biāo)的結(jié)合能力分析方法
測定篩選獲得核酸適配體與靶標(biāo)結(jié)合的平衡解離常數(shù)(Kd),Kd值越小表明兩者相互作用越強(qiáng)。
Kd常用測定方法:
4.1.1熒光光譜法:適用于細(xì)胞,大分子,小分子,復(fù)雜靶標(biāo)等。對核酸適配體進(jìn)行熒光標(biāo)記,稀釋
到不同濃度,與相同濃度的靶標(biāo)共混并在合適的條件下孵育,將結(jié)合后的靶標(biāo)與未結(jié)合的核酸適配體分
離,使用熒光光譜儀測定核酸-靶標(biāo)復(fù)合物的熒光強(qiáng)度,繪制熒光強(qiáng)度與核酸適配體濃度的關(guān)系圖,擬
合η=Bmax/(1+Kd/[Aptamer]),獲得Kd值。
4.1.2流式細(xì)胞術(shù):適用于細(xì)胞、大分子、小分子等。對核酸適配體進(jìn)行熒光標(biāo)記,釋到不同濃度;
與相同濃度的靶標(biāo)共混并在合適的條件下孵育,將核酸-靶標(biāo)復(fù)合物通過流式細(xì)胞儀,測定帶有熒光標(biāo)
記的核酸-靶標(biāo)復(fù)合物的數(shù)量,繪制其與核酸適配體濃度的關(guān)系圖,擬合η=Bmax/(1+Kd/[Aptamer]),
獲得Kd值。
1
GB/TXXXXX—2017
4.1.3表面等離子共振法:適用于細(xì)胞、大分子、小分子等。將核酸適配體固定于芯片上,稀釋靶標(biāo)
到不同濃度,加入不同濃度梯度的靶標(biāo)在合適的條件下孵育后清洗,通過表面等離子共振法設(shè)備測定核
酸適配體結(jié)合的靶標(biāo)的數(shù)量,繪制其與靶標(biāo)濃度的關(guān)系圖,擬合η=Bmax/(1+Kd/[Target]),獲得Kd
值。
4.1.4等溫滴定微量熱法:適用于大分子、小分子等,將核酸適配體和靶標(biāo)進(jìn)行透析處理,選擇適宜
的樣品濃度,脫氣處理后,進(jìn)行核酸適配體-靶標(biāo)滴定試驗,同時進(jìn)行對照實驗(滴水試驗,樣品滴定
緩沖溶液試驗),所得數(shù)據(jù)經(jīng)過軟件分析即可得到Kd值。
4.1.5酶聯(lián)適配體分析法:適用于細(xì)胞等,將核酸適配體固定于基板上,洗脫后加入不同濃度梯度的
靶標(biāo),孵育后沖洗,再加入帶有熒光標(biāo)記的核酸適配體孵育后洗脫,通過熒光分析儀獲得熒光強(qiáng)度,繪
制熒光強(qiáng)度與靶標(biāo)濃度的關(guān)系圖,擬合η=Bmax/(1+Kd/[Target]),獲得Kd值。
4.1.6DNA捕獲元件法:適用于細(xì)胞、大分子、小分子等。將標(biāo)記熒光集團(tuán)和淬滅集團(tuán)的核酸適配體
與不同的濃度靶標(biāo)混合,孵育后,檢測熒光強(qiáng)度。繪制熒光強(qiáng)度與靶標(biāo)濃度的關(guān)系圖。擬合η
=Bmax/(1+Kd/[Target]),獲得Kd值。
4.1.7生物膜干涉法:適用于:細(xì)胞、大分子、小分子等。將核酸適配體固定于芯片上與不同的濃度
靶標(biāo)混合,孵育后清洗,利用生物膜干涉設(shè)備測定與核酸適配體結(jié)合的靶標(biāo)數(shù)量,繪制其與靶標(biāo)濃度的
關(guān)系圖,擬合η=Bmax/(1+Kd/[Target]),獲得Kd值。
4.1.8超濾法:適用于細(xì)胞、大分子等。對核酸適配體進(jìn)行熒光標(biāo)記,釋到不同濃度;與相同濃度的
靶標(biāo)共混并在合適的條件下孵育,使用超濾膜過濾,使用熒光光譜儀測定核酸-靶標(biāo)復(fù)合物的熒光強(qiáng)度,
繪制熒光強(qiáng)度與核酸適配體濃度的關(guān)系圖,擬合η=Bmax/(1+Kd/[Aptamer]),獲得Kd值。
4.2核酸適配體與靶標(biāo)結(jié)合特異性驗證
基于4.1的結(jié)果選擇親和力最高(即Kd值最低)的核酸適配體進(jìn)行特異性驗證。選擇靶標(biāo)和幾種靶
標(biāo)的結(jié)構(gòu)類似物進(jìn)行測試,使用4.1中介紹的方法分別測量核酸適配體與靶標(biāo)以及幾種結(jié)構(gòu)類似物的親
和力(即Kd值)并進(jìn)行比較,獲得特異性結(jié)果。
5防污染措施
檢測過程中防止交叉污染的措施按照GB/T27403中的規(guī)定執(zhí)行。
溫馨提示
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