計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)智慧樹(shù)知到期末考試答案章節(jié)答案2024年暨南大學(xué)

計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)智慧樹(shù)知到期末考試答案+章節(jié)答案2024年暨南大學(xué)反向折疊法的優(yōu)點(diǎn)在于它假設(shè)蛋白質(zhì)折疊類型是無(wú)限的。

答案:錯(cuò)分子對(duì)接在酶學(xué)研究以及藥物設(shè)計(jì)中具有十分重要的意義。

答案:對(duì)計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)是以量子力學(xué)和分子力學(xué)的分子模擬理論為基礎(chǔ)，通過(guò)模擬、計(jì)算或模型學(xué)習(xí)，預(yù)測(cè)藥物與靶標(biāo)分子之間的作用，篩選、設(shè)計(jì)和優(yōu)化先導(dǎo)化合物的方法。

答案:對(duì)在得到的藥效特征數(shù)目可能會(huì)非常龐大，要想得到合理的藥效團(tuán)，就需要對(duì)這些特征進(jìn)行簡(jiǎn)化，找出主要的藥效特征，實(shí)現(xiàn)藥效特征簡(jiǎn)化所采用的方法是聚類分析。

答案:對(duì)Y隨機(jī)檢驗(yàn)，將響應(yīng)值如生物活性隨機(jī)打亂順序，而保持描述符的順序不變，從而建立新的QSAR模型。

答案:對(duì)疏水基團(tuán)一般由極性原子組成，有疏水相互的片段很多，如甲基、乙基、苯環(huán)等。

答案:錯(cuò)Out-of-train（OOT法）和Bootstrapping的區(qū)別在于，在抽取M個(gè)化合物作為測(cè)試集后，OOT會(huì)隨機(jī)在N-M個(gè)化合物中選擇一些化合物進(jìn)行重復(fù)以保證訓(xùn)練集化合物數(shù)目保持不變，而不是用N-M個(gè)化合物直接建立QSAR模型并進(jìn)行活性預(yù)測(cè)。

答案:錯(cuò)在開(kāi)始構(gòu)建模型，第一步就是要選擇目標(biāo)化合物分子，構(gòu)建一個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)。

答案:對(duì)最小抑菌濃度（MIC）指在體外培養(yǎng)細(xì)菌8~12小時(shí)后能一直培養(yǎng)基內(nèi)病原菌生長(zhǎng)的最低藥物濃度。

答案:錯(cuò)當(dāng)涉及多個(gè)因變量時(shí)，對(duì)每個(gè)目標(biāo)屬性分別建立一個(gè)QSAR方程，系數(shù)可以不關(guān)聯(lián)。

答案:錯(cuò)廣義來(lái)講，任何帶有孤對(duì)電子的原子，如氮、氧、氟、硫等，都可以作為氫鍵受體。

答案:對(duì)下述哪些說(shuō)法不正確

答案:Hansch分析法是三維的計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)方法###CoMFA方法是用于受體結(jié)構(gòu)已知時(shí)的藥物設(shè)計(jì)方法藥效團(tuán)的構(gòu)建是基于訓(xùn)練集實(shí)施的，以下哪些方法適用于藥效團(tuán)構(gòu)建

答案:活性類似物法###假想受點(diǎn)點(diǎn)陣###基于藥效基團(tuán)模型的三維結(jié)構(gòu)搜尋方法###距離幾何法分子對(duì)接方法分子碎片法可分為以下哪兩種

答案:碎片連接法###碎片生長(zhǎng)法內(nèi)部檢驗(yàn)的方法有

答案:擬和相關(guān)系數(shù)###Y隨機(jī)###sample法###交互檢驗(yàn)分子對(duì)接計(jì)算的注意點(diǎn)

答案:小分子問(wèn)題###對(duì)接方式問(wèn)題###蛋白質(zhì)問(wèn)題QSAR模型的內(nèi)部驗(yàn)證交互檢驗(yàn)除了隨機(jī)模型檢驗(yàn)法，還有以下哪些方法

答案:Out-of-train(OOT)###leave-one-out###Leave-many(group)–out(LMO)###Bootstrapping下列哪些是QSAR常用的參數(shù)

答案:電性參數(shù)###指示變量###疏水性參數(shù)###立體參數(shù)基于受體結(jié)構(gòu)的藥效團(tuán)主要在配體-受體復(fù)合物的晶體結(jié)構(gòu)已經(jīng)清楚地條件下使用，其操作方法中，第一步是

答案:受體結(jié)構(gòu)的輸入及活性位點(diǎn)分子對(duì)接分類中適合處理大分子和小分子間對(duì)接的是

答案:半柔性對(duì)接藥效團(tuán)模型中，不同顏色的球代表不同的藥效特征元素，其中芳環(huán)中心的顏色是

答案:黃色以下屬于藥效團(tuán)中的特征元素的是

答案:氫鍵受體、氫鍵給體分子對(duì)接的基本類型除了整體分子對(duì)接法，還有

答案:片斷對(duì)接法同源模建的可行性在于：同源蛋白是由（）由同一祖先蛋白趨異進(jìn)化而產(chǎn)生的蛋白質(zhì)。

答案:兩個(gè)或兩個(gè)以上計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)的英文簡(jiǎn)稱是什么

答案:CADD阿司匹林可用于緩解

答案:牙痛分子對(duì)接屬于什么領(lǐng)域

答案:藥物設(shè)計(jì)Y隨機(jī)檢驗(yàn)中，

答案:平均R2和Q2等比較低，如果R2>0.5，那么這個(gè)模型有可能就有隨機(jī)相關(guān)的嫌疑，該QSAR模型的可靠性是值得懷疑的。把兩個(gè)以上字符序列對(duì)齊，逐列比較其字符的異同，使得每一列字符盡可能一致，以發(fā)現(xiàn)其共同的結(jié)構(gòu)特征的方法稱為（）。

答案:單序列比對(duì)測(cè)試集方法的代價(jià)是要減少一部分訓(xùn)練數(shù)據(jù)。

答案:對(duì)只有當(dāng)兩個(gè)蛋白質(zhì)在進(jìn)化關(guān)系上具有共同的祖先時(shí)，才可稱它們?yōu)橥吹摹?/p>

答案:對(duì)新藥的研究有三個(gè)決定階段中，計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)的主要任務(wù)就是新藥物的優(yōu)化研究。

答案:錯(cuò)Y隨機(jī)檢驗(yàn)是檢驗(yàn)?zāi)Ｐ褪欠翊嬖谂既幌嚓P(guān)的有力工具。

答案:對(duì)內(nèi)部驗(yàn)證首先是從研究的化合物中挑選出具有合理特征和數(shù)量的化合物組成訓(xùn)練集trainingset，用來(lái)建立模型。其次是確定內(nèi)部驗(yàn)證的方法學(xué)。

答案:對(duì)藥效團(tuán)的識(shí)別方法之一：在受體結(jié)構(gòu)未知或者在作用機(jī)制不明確的情況下，對(duì)一系列化合物進(jìn)行(結(jié)構(gòu)-活性)研究，得到一些對(duì)化合物活性至關(guān)重要的原子、基團(tuán)或化學(xué)功能結(jié)構(gòu)、以及其空間關(guān)系

答案:對(duì)期望值e描述搜索某一特定數(shù)據(jù)庫(kù)時(shí)，隨機(jī)出現(xiàn)的匹配序列數(shù)目。

答案:對(duì)序列比對(duì)的結(jié)果并不能作為兩者之間一定存在同源關(guān)系的依據(jù)。

答案:對(duì)建立一個(gè)QSAR模型包括以下幾個(gè)環(huán)節(jié)：準(zhǔn)備數(shù)據(jù)庫(kù)和參數(shù)----QSAR模型的內(nèi)部驗(yàn)證----建立QSAR模型----QSAR模型的外部驗(yàn)證---QSAR模型解釋

答案:對(duì)藥效特征元素是指活性化合物所特有的，對(duì)化合物的活性有重要影響的一組原子(團(tuán))。

答案:錯(cuò)均方根誤差是一種常用的測(cè)量數(shù)值之間差異的量度，其數(shù)值常為模型預(yù)測(cè)的量或是被觀察到的估計(jì)量。

答案:對(duì)非常相關(guān)的蛋白，其二級(jí)結(jié)構(gòu)單元，比如alpha-helix,beta-strand占據(jù)了整個(gè)蛋白家族的同樣的相對(duì)位置。

答案:對(duì)全局比對(duì)是指將參與比對(duì)的兩條序列里面的所有字符進(jìn)行比對(duì)。

答案:對(duì)基于受體結(jié)構(gòu)的藥效團(tuán)操作步驟有(受體結(jié)構(gòu)的輸入及活性位點(diǎn)),活性位點(diǎn)掃描和藥效特征的產(chǎn)生,(藥效特征的聚類),藥效團(tuán)的修正以及數(shù)據(jù)庫(kù)搜索

答案:對(duì)分子對(duì)接是基于受體結(jié)構(gòu)進(jìn)行的藥物設(shè)計(jì),其具體應(yīng)用有

答案:研究配體-受體復(fù)合物的結(jié)合模式###預(yù)測(cè)受體-配體的結(jié)合能力###尋找和發(fā)現(xiàn)新的先導(dǎo)化合物###指導(dǎo)先導(dǎo)化合物的合成改造和優(yōu)化計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)方法大體可分為

答案:基于小分子的藥物分子設(shè)計(jì)方法###基于受體結(jié)構(gòu)的藥物分子設(shè)計(jì)下面屬于藥效團(tuán)模型中正電荷中心的是

答案:帶正電荷的原子###伯、仲、叔脂肪胺中的氮原子###氮-氮雙取代的脒基中的亞氨氮原子或三氮取代的胍基中的亞氨氮原子等下列有關(guān)篩選模型的描述是正確的有：

答案:分為體內(nèi)和體外模型###整體動(dòng)物模型###組織器官###細(xì)胞分子水平4D-QSAR與5維、6維定量構(gòu)效關(guān)系的區(qū)別在于其沒(méi)有考慮：

答案:誘導(dǎo)契合模型###溶劑化AutoDock的優(yōu)點(diǎn)

答案:同時(shí)考慮配體的柔性和蛋白質(zhì)結(jié)合部位側(cè)鏈的柔性###網(wǎng)格計(jì)算，加快計(jì)算QSAR模型的內(nèi)部驗(yàn)證方法包括

答案:擬和相關(guān)系數(shù)判斷###交互檢驗(yàn)###sample法分子對(duì)接的基本步驟

答案:最佳受體－配體復(fù)合物構(gòu)象###調(diào)整受體或配體的構(gòu)象###計(jì)算復(fù)合物的結(jié)合能###確定活性位點(diǎn)CoMSIA分子場(chǎng)的計(jì)算采用哪幾種不同的相似性場(chǎng)計(jì)算

答案:靜電場(chǎng)###氫鍵場(chǎng)###立體場(chǎng)###疏水場(chǎng)在操作分子對(duì)接的過(guò)程中，活性位點(diǎn)的確定方法有：

答案:基于配體生成###基于關(guān)鍵氨基酸殘基生成###自動(dòng)生成分子對(duì)接的種類主要包括

答案:剛性對(duì)接###柔性對(duì)接###半柔性對(duì)接分子對(duì)接的主要問(wèn)題

答案:如何找到最佳的結(jié)合位置###如何評(píng)價(jià)對(duì)接分子之間的結(jié)合強(qiáng)度與藥物研究相關(guān)的主要有_____，這些信息最主要的組織和管理方式就是數(shù)據(jù)庫(kù)。

答案:軟件等相關(guān)知識(shí)###分子結(jié)構(gòu)的存儲(chǔ)格式###分子結(jié)構(gòu)的描述方法###分子性質(zhì)的計(jì)算方法序列比較時(shí)，兩個(gè)蛋白質(zhì)具有的性質(zhì)包括以下幾點(diǎn)

答案:一致性：兩個(gè)蛋白質(zhì)有一定數(shù)量的氨基酸在對(duì)比的位點(diǎn)上是相同的。###相似性：通常在某些位點(diǎn)上有一些氨基酸被另外一些化學(xué)物理特性相近的氨基酸所代替，這種突變可稱為保守突變。將保守突變的因素考慮在內(nèi)，就可以定義各種打分方案(scoringschemes))對(duì)兩序列的相似程度打分，所得分值即代表其相似的程度。###同源性：只有當(dāng)兩個(gè)蛋白質(zhì)在進(jìn)化關(guān)系上具有共同的祖先時(shí)，才可稱它們?yōu)橥吹摹Ｐ蛄斜葘?duì)實(shí)際上是根據(jù)特定數(shù)學(xué)模型找出序列之間最大匹配（）。

答案:殘基數(shù)地西泮不具有下列哪項(xiàng)作用

答案:抗焦慮作用在藥效團(tuán)模型方法中，芳環(huán)需要以下哪些參量來(lái)定義

答案:都是在一般的藥效團(tuán)模型方法中(DiscoveryStudio,Catalyst)，僅僅只考慮藥物分子中最常見(jiàn)的氫鍵受體形式，以下屬于氫鍵受體形式的是

答案:與碳原子以雙鍵或三鍵相連的氮原子下列哪項(xiàng)屬于交互檢驗(yàn)的方法

答案:留一法活性被抑制50%時(shí)抑制劑的濃度

答案:MIC關(guān)于藥效團(tuán)的描述以下哪個(gè)是正確的

答案:是能被受體識(shí)別和結(jié)合的三維結(jié)構(gòu)要素的組合以下可以用于藥效團(tuán)模型建立的生物活性單位的是

答案:半數(shù)抑制濃度（IC50）小分子藥效團(tuán)模建的基本操作順序是：

答案:配體分子的準(zhǔn)備、藥效特征元素的提取、藥效團(tuán)模型的構(gòu)建、模型的分析和驗(yàn)證在體外培養(yǎng)細(xì)菌18~24小時(shí)后能一直培養(yǎng)基內(nèi)病原菌生長(zhǎng)的最低藥物濃度,是

答案:MIC蛋白質(zhì)的（）在很大程度上決定了蛋白質(zhì)的功能，如果有了結(jié)構(gòu)，我們可以用來(lái)預(yù)測(cè)其功能，以及基于結(jié)構(gòu)的藥物設(shè)計(jì)。

答案:三維結(jié)構(gòu)實(shí)現(xiàn)藥效特征簡(jiǎn)化所采用的方法是

答案:聚類分析電荷中心：配體上的電荷中心是指配體上的非帶電基團(tuán)

答案:錯(cuò)Sample法，是指使用樣本距離偏最小二乘法(SAMPLS)來(lái)確定留一法的交叉驗(yàn)證r2。

答案:對(duì)地西泮4、5位開(kāi)環(huán)，影響藥物的生物利用度。

答案:錯(cuò)計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)的一般原理是,?首先通過(guò)X-單晶衍射技等技術(shù)獲得受體大分子結(jié)合部位的結(jié)構(gòu),?并且采用分子模擬軟件分析結(jié)合部位的結(jié)構(gòu)性質(zhì),?如靜電場(chǎng)、疏水場(chǎng)、氫鍵作用位點(diǎn)分布等信息。

答案:對(duì)用來(lái)建立藥效團(tuán)模型的分子需要和受體之間具有相似的作用機(jī)制，這樣才能保證所有分子具有相似的藥效模式。

答案:對(duì)如果未知蛋白質(zhì)是現(xiàn)在還沒(méi)有出現(xiàn)過(guò)的結(jié)構(gòu)類型，就不能用反向折疊法。

答案:對(duì)測(cè)試集是除去訓(xùn)練集以外的，同樣具有一定數(shù)量、結(jié)構(gòu)特征以及活性范圍分布的化合物，用于驗(yàn)證藥效團(tuán)模型的合理性。

答案:對(duì)多序列比對(duì)問(wèn)題其實(shí)是雙序列比對(duì)問(wèn)題的推廣。

答案:對(duì)現(xiàn)代藥物發(fā)現(xiàn)也有其局限性，其研究對(duì)象為“藥物-疾病”關(guān)系而非“靶點(diǎn)-藥物”關(guān)系。

答案:錯(cuò)三級(jí)結(jié)構(gòu)的保守性遠(yuǎn)遠(yuǎn)大于一級(jí)結(jié)構(gòu)的保守性。

答案:對(duì)同源模建第三步到第五步為序列比對(duì)、loop區(qū)和氨基酸側(cè)鏈。

答案:錯(cuò)屬于同一個(gè)蛋白家族的所有蛋白，存在三維結(jié)構(gòu)基本一樣的區(qū)域。

答案:對(duì)在標(biāo)準(zhǔn)的流程中，測(cè)試集的誤差評(píng)價(jià)結(jié)果是偏保守的，因?yàn)槟Ｐ偷膶?shí)際誤差要比報(bào)告的誤差低一些。

答案:對(duì)在得到每個(gè)小分子的多構(gòu)象以后，就需要對(duì)這些構(gòu)象進(jìn)行疊合以找到共同的藥效團(tuán)模型。

答案:對(duì)與其余藥效特征不同，排斥體積并不是對(duì)應(yīng)于配體上特殊的原子或者基團(tuán)，而是基于配體分子的空間特征。

答案:對(duì)CoMSIA方法的假定與CoMFA方法相似，即配基與受體間的共價(jià)相互作用是由分子場(chǎng)決定的。

答案:錯(cuò)體內(nèi)能與受體特異性結(jié)合的物質(zhì)，稱為配體或配基

答案:對(duì)基于片段裝配法(fragment-basedassembly)會(huì)去搜尋已知結(jié)構(gòu)蛋白中與目標(biāo)蛋白相似的那部分。

答案:對(duì)擬合相關(guān)系數(shù)中，有三個(gè)參數(shù)相關(guān)系數(shù)R、標(biāo)準(zhǔn)偏差S和F檢驗(yàn)值。R，F(xiàn)越大，s越小，表明模型的擬合能力越弱。

答案:錯(cuò)在搭建目標(biāo)蛋白模型之前，首先需找出與目標(biāo)蛋白序列同源且已知晶體結(jié)構(gòu)的模板蛋白。

答案:對(duì)SYBYL軟件中哪個(gè)模塊可用于構(gòu)建藥效團(tuán)模型

答案:GALAHAD###GASP藥效團(tuán)構(gòu)建中疊合方法主要有：

答案:剛性疊合###比較化合物結(jié)構(gòu)立場(chǎng)性質(zhì)來(lái)進(jìn)行疊合###比較化合物結(jié)構(gòu)形狀性質(zhì)來(lái)進(jìn)行疊合###柔性疊合對(duì)接過(guò)程的常用方法包括

答案:分子碎片法###模板定位法###原子生長(zhǎng)法下列有關(guān)虛擬篩選的描述是正確的有

答案:在化合物類藥性的虛擬判斷基礎(chǔ)上挑選化合物合成###其目的是為了提高命中率###適合在真實(shí)組合合成和高通量篩選之前計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)的作用

答案:闡明藥物的作用機(jī)理###為藥物的進(jìn)一步改造提供許多有價(jià)值的信息###高通量篩選先導(dǎo)物###擬藥物與受體相互作用受體都有其內(nèi)源性配體，如

答案:自體活性物質(zhì)###激素###神經(jīng)遞質(zhì)代表性對(duì)接軟件

答案:Glide###LigandFit（Cerius2）###Sybyl###AutoDock藥物和受體間屬于電性結(jié)合的形式有

答案:范德華力###氫鍵###疏水鍵蛋白與小分子的相互作用之一的靜電作用包括

答案:偶極-偶極相互作用###離子-誘導(dǎo)偶極相互作用###離子-偶極鍵###離子鍵下列屬于同源模建模型評(píng)價(jià)方法的有

答案:PROSA程序評(píng)價(jià)###碳骨架二面角###Veerify3D以下哪些屬于化學(xué)結(jié)構(gòu)式編輯程序

答案:Open?Babel###chemdraw###Isis?draw如何評(píng)價(jià)對(duì)接分子之間的結(jié)合強(qiáng)度

答案:團(tuán)基于分子表面的溶劑化計(jì)算###團(tuán)非鍵作用能分子對(duì)接的重要原則

答案:預(yù)組織性###互補(bǔ)性以下哪些屬于蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)查看軟件

答案:PyMol###Discovery?Studio###FreeMOL下面屬于藥效團(tuán)模型中負(fù)電荷中心的是

答案:磷酸二酯和磷酸酯中羥基###磷酸單酯和磷酸中兩個(gè)羥基氧###硫酸和磺酸中羥基氧###羧酸、亞磺酸或磷酸中羥基氧以下哪些軟件可用于構(gòu)建藥效團(tuán)模型

答案:DiscoveryStudio###MOE###Openeye中的ROCS###GALAHAD目前計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)存在的問(wèn)題

答案:藥物體內(nèi)轉(zhuǎn)運(yùn)、代謝和體內(nèi)毒副作用問(wèn)題###受體-配體相互作用的方式問(wèn)題###蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)三維結(jié)構(gòu)的真實(shí)性和可用性問(wèn)題###設(shè)計(jì)的分子能否進(jìn)行化學(xué)合成QSAR模型的內(nèi)部驗(yàn)證擬和相關(guān)系數(shù)包括

答案:相關(guān)系數(shù)（R）###標(biāo)準(zhǔn)偏差（S）###F檢驗(yàn)值常用序列比對(duì)程序通常給出一些統(tǒng)計(jì)值，用來(lái)表示結(jié)果的可信度。BLAST程序中使用的是

答案:p###e在藥物和受體之間的識(shí)別中起重要作用的非鍵相互作用的主要有：

答案:疏水場(chǎng)###包括離子-偶極作用在內(nèi)的靜電作用###立體相互作用分子對(duì)接分類中一般用于精確考慮分子間的識(shí)別情況的是

答案:柔性對(duì)接在配體和受體相互作用時(shí)，在配體的某些取代位置上存在某些原子或原子團(tuán)可能會(huì)和受體產(chǎn)生不利的原子碰撞，這些位置上的原子或原子團(tuán)占有的位置就構(gòu)成

答案:排斥體積主要同源建模方法包括剛體裝配法和

答案:加權(quán)平均法氫鍵給體：氫鍵給體主要包括氫原子以及與之相連的氧原子和氮原子，以下屬于氫鍵給體的是

答案:非酸性羥基；氨基；但不包括三氟甲基磺酰胺和四唑中的次氨基蛋白質(zhì)-配體相互作用的效果可以在一定程度上由（）表示

答案:配體效率（）是把結(jié)構(gòu)未知的蛋白質(zhì)序列與已知的結(jié)構(gòu)進(jìn)行匹配，找出一種或幾種匹配結(jié)構(gòu)好的結(jié)構(gòu)作為結(jié)構(gòu)未知的蛋白質(zhì)的預(yù)測(cè)結(jié)構(gòu)。

答案:反向折疊在得到初步的藥效團(tuán)模型后，對(duì)于這個(gè)初步模型，還需要依據(jù)受體-配體復(fù)合物的結(jié)構(gòu)，分析配體-受體相互作用關(guān)鍵位點(diǎn)，對(duì)藥效團(tuán)模型進(jìn)行

答案:驗(yàn)證和優(yōu)化分子對(duì)接最初思想起源于FisherE.的

答案:鎖和鑰匙模型基于知識(shí)的蛋白質(zhì)的建模的方法包括（）和基于片段裝配法，主要應(yīng)用于loop及氨基酸側(cè)鏈的建模。

答案:空間限制滿足法評(píng)價(jià)藥效團(tuán)模型的好壞有不同的方法，以下藥效團(tuán)模型的評(píng)價(jià)參數(shù)中正確的是：

答案:Specifity：特異性是每個(gè)藥效團(tuán)模型判斷能力的評(píng)價(jià)指標(biāo)，根據(jù)提問(wèn)分子結(jié)構(gòu)與藥效團(tuán)的匹配程度以及空間中分離的程度來(lái)計(jì)算，該值大于5較好。從頭預(yù)測(cè)法的細(xì)分不包括以下哪種

答案:詳細(xì)的三維結(jié)構(gòu)間接預(yù)測(cè)藥效團(tuán)的構(gòu)建是基于訓(xùn)練集實(shí)施的，以下屬于藥效團(tuán)的構(gòu)建的方法的是

答案:基于藥效團(tuán)模型的三維結(jié)構(gòu)搜尋方法和假想受點(diǎn)點(diǎn)陣電荷中心可以分為兩類：正電荷中心和負(fù)電荷中心，下列屬于正電荷中心的是：

答案:伯、仲、叔脂肪胺中的氮原子在基于配體的藥效團(tuán)模型構(gòu)建中，第二步就是

答案:小分子構(gòu)象分析.以下哪一個(gè)藥物不屬于非甾體類抗炎藥物。

答案:地塞米松序列比對(duì)是為確定兩個(gè)或多個(gè)序列之間的（），而將它們按照一定的規(guī)律排列。

答案:相似性以至于同源性同源模建是指如果發(fā)現(xiàn)一個(gè)序列與另一個(gè)三維結(jié)構(gòu)已知的序列具有（），那么，就可以選擇基于已知的蛋白用建模方法來(lái)預(yù)測(cè)該未知蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu)。

答案:同源性藥效團(tuán)模型中，不同顏色的球代表不同的藥效特征元素，其中疏水中心的顏色是

答案:紅色在基于配體的藥效團(tuán)模型中，從一系列小分子出發(fā)，構(gòu)建基于配體結(jié)構(gòu)共同特征的藥效團(tuán)，其中第一步是

答案:活性小分子的選取如果沒(méi)有蛋白質(zhì)的晶體結(jié)構(gòu)，需要同源模建，可以使用

答案:SybylQSAR擬合相關(guān)系數(shù)中，有三個(gè)參數(shù)相關(guān)系數(shù)R、標(biāo)準(zhǔn)偏差S和F檢驗(yàn)值。下列哪項(xiàng)正確

答案:R，F(xiàn)越大，s越小，表明模型的擬合能力越強(qiáng)基于受體結(jié)構(gòu)的藥效團(tuán)主要在(配體-受體復(fù)合物的晶體結(jié)構(gòu)已經(jīng)清楚地)條件下使用

答案:對(duì)柔性對(duì)接的方法

答案:基于分子模擬的方法###片段的方法###遺傳算法和進(jìn)化規(guī)劃###構(gòu)象的系綜方法同源模建其實(shí)屬于蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)技術(shù)的其中一個(gè)方法，另外還有從頭預(yù)測(cè)法和（）。

答案:反向折疊法蛋白質(zhì)需要正確折疊為特定構(gòu)型，才能發(fā)揮其正常功能。

答案:對(duì)SAMPLE法確定留一法的交叉驗(yàn)證r2是依據(jù)樣本距離偏最小二乘法

。

答案:對(duì)剛性的分子對(duì)接方法

答案:基于幾何哈希技術(shù)“geometrichashing”的方法###基于poseclustering的方法###基于最大團(tuán)搜索的方法結(jié)構(gòu)優(yōu)化是為了確定分子低能構(gòu)象、就需求解與其相對(duì)應(yīng)的分子勢(shì)能面上的極大值，這一過(guò)程稱為能量?jī)?yōu)化。

答案:錯(cuò)序列比對(duì)的結(jié)果可以作為兩者之間一定存在同源關(guān)系的依據(jù)

答案:錯(cuò)sp2

或sp3

雜化的氧原子都屬于氫鍵受體。

答案:錯(cuò)對(duì)接方法尚需解決的問(wèn)題

答案:打分函數(shù)###分子的柔性###溶劑化效應(yīng)藥物與受體的結(jié)合強(qiáng)度取決于結(jié)合的自由能變化

答案:對(duì)分子對(duì)接分類中適合考察比較大的體系是

答案:剛體對(duì)接一個(gè)蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)是由其_____唯一決定的，通過(guò)已知一級(jí)結(jié)構(gòu)，理論上足以獲取二級(jí)和三級(jí)結(jié)構(gòu)。