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關(guān)于蛋白質(zhì)理化性質(zhì)1.蛋白質(zhì)第一節(jié)蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)第二節(jié)蛋白質(zhì)的測(cè)定第2頁(yè),共49頁(yè),星期六,2024年,5月第3頁(yè),共49頁(yè),星期六,2024年,5月ProteinsProteinsarenotjustpolypeptides-Theyarepolypeptidesofdefinedsequence.Eachproteinhasadefinedorderofaminoacidresidues.Aswithnucleicacids,thissequenceisreferredtoasthePRIMARYSTRUCTUREoftheprotein.第4頁(yè),共49頁(yè),星期六,2024年,5月PrimaryStructureProteinsarelongpolypeptides.Proteinsequencescanvaryamongspeciesandstillperformthesamefunction.Proteinsevolve,andtheyevolvebychangesintheiraminoacidsequences.Conservativechanges,e.g.DforENonconservativechanges,e.g.DforA第5頁(yè),共49頁(yè),星期六,2024年,5月TheGeneticCodeEveryoneshouldatleastbefamiliarwithhowtoreadthefollowingtableandconvertagenesequencetoaproteinsequence.threenucleotidescodeforoneaminoacidinaprotein(43=64),sothereisroomforredundancyinthegeneticcodemRNAcodonwritten5′to3′第6頁(yè),共49頁(yè),星期六,2024年,5月
蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)(一)蛋白質(zhì)的相對(duì)分子量蛋白質(zhì)是生命大分子物質(zhì),其分子量很大,從一萬(wàn)到幾百萬(wàn)或更大。利用測(cè)小分子法不可能。第7頁(yè),共49頁(yè),星期六,2024年,5月一、由化學(xué)組成測(cè)定最低分子量如血紅蛋白:55.84(Fe)×(100/0.34)(含量)×4(個(gè)數(shù))=67000第8頁(yè),共49頁(yè),星期六,2024年,5月二、物化法測(cè)定蛋白質(zhì)分子量:測(cè)擴(kuò)散系數(shù)、滲透壓、光散射、沉降超離心、凝膠過(guò)濾、聚丙烯酰胺凝膠電泳等。第9頁(yè),共49頁(yè),星期六,2024年,5月最準(zhǔn)確可靠的方法是超離心法(Svedberg于1940年設(shè)計(jì)):蛋白質(zhì)顆粒在25~50*104g離心力作用下從溶液中沉降下來(lái)。沉降系數(shù)(s):?jiǎn)挝唬╟m)離心場(chǎng)里的沉降速度。
s=————vω2xv=沉降速度(dx/dt)ω=離心機(jī)轉(zhuǎn)子角速度(弧度/s)
x=蛋白質(zhì)界面中點(diǎn)與轉(zhuǎn)子中心的距離(cm)沉降系數(shù)的單位常用S,1S=1×10-13(s)第10頁(yè),共49頁(yè),星期六,2024年,5月原理:--顆粒:沉降-擴(kuò)散,大顆粒沉降快,小顆粒慢,分離,檢測(cè)。第11頁(yè),共49頁(yè),星期六,2024年,5月蛋白質(zhì)分子量(M)與沉降系數(shù)(s)的關(guān)系M=——————RTsD(1-Vρ)R——?dú)怏w常數(shù)(8.314×107ergs·mol-1·度-1)T——絕對(duì)溫度D——擴(kuò)散常數(shù)(蛋白質(zhì)分子量很大,離心機(jī)轉(zhuǎn)速很快,則忽略不計(jì))V——蛋白質(zhì)的微分比容(m3·g-1)ρ——溶劑密度(20℃,g·ml-1)
s——沉降系數(shù)第12頁(yè),共49頁(yè),星期六,2024年,5月
由于蛋白質(zhì)分子中氨基酸殘基的側(cè)鏈上存在游離的氨基和游離的羧基,因此蛋白質(zhì)與氨基酸一樣具有兩性解離的性質(zhì),因而也具有特定的等電點(diǎn)。?等電點(diǎn)兩性解離比氨基酸復(fù)雜:可解離的側(cè)鏈R基;對(duì)結(jié)合蛋白質(zhì),輔基部分含可解離基團(tuán)。(二)蛋白質(zhì)的兩性電離及等電點(diǎn)蛋白質(zhì)在其等電點(diǎn)偏酸溶液中帶正電荷,在偏堿溶液中帶負(fù)電荷,在等電點(diǎn)pH時(shí)為兩性離子。第13頁(yè),共49頁(yè),星期六,2024年,5月第14頁(yè),共49頁(yè),星期六,2024年,5月膠體定義:質(zhì)點(diǎn)分散系統(tǒng)蛋白質(zhì)分子的顆粒直徑已達(dá)1-100nm,處于膠體顆粒的范圍。因此,蛋白質(zhì)具有親水溶膠的性質(zhì)。穩(wěn)定蛋白質(zhì)親水溶膠的兩個(gè)重要因素:-蛋白質(zhì)分子表面的水化膜(分子表面極性R基而結(jié)合的一層水分子)-表面電荷(同樣pH下,電荷相排斥)---蛋白質(zhì)不會(huì)聚集沉淀(三)蛋白質(zhì)的膠體性質(zhì)第15頁(yè),共49頁(yè),星期六,2024年,5月布郎運(yùn)動(dòng)、丁道爾現(xiàn)象、電泳現(xiàn)象,不能透過(guò)半透膜,具有吸附能力蛋白質(zhì)溶液穩(wěn)定的原因:1)表面形成水膜(水化層);
2)帶相同電荷。++++++第16頁(yè),共49頁(yè),星期六,2024年,5月(四)蛋白質(zhì)的沉淀反應(yīng)1.加高濃度鹽類(lèi)(鹽析):加鹽使蛋白質(zhì)沉淀析出。分段鹽析:調(diào)節(jié)鹽濃度,可使混合蛋白質(zhì)溶液中的幾種蛋白質(zhì)分段析出。血清球蛋白(50%(NH4)2SO4飽和度),清蛋白(飽和(NH4)2SO4)。2.加有機(jī)溶劑3.加重金屬鹽第17頁(yè),共49頁(yè),星期六,2024年,5月穩(wěn)定是暫時(shí)有條件的。在某些物理或化學(xué)因素的作用下,蛋白質(zhì)嚴(yán)格的空間結(jié)構(gòu)被破壞(不包括肽鍵的斷裂),從而引起蛋白質(zhì)若干理化性質(zhì)和生物學(xué)性質(zhì)的改變,稱(chēng)為蛋白質(zhì)的變性。(五)蛋白質(zhì)的變性和凝固第18頁(yè),共49頁(yè),星期六,2024年,5月第19頁(yè),共49頁(yè),星期六,2024年,5月
天然蛋白質(zhì)受物理或化學(xué)因素的影響,其共價(jià)鍵不變,但分子內(nèi)部原有的高度規(guī)律性的空間排列發(fā)生變化,致使其原有性質(zhì)發(fā)生部分或全部喪失,稱(chēng)為蛋白質(zhì)的變性。
變性蛋白質(zhì)主要標(biāo)志是生物學(xué)功能的喪失。溶解度降低,易形成沉淀析出,結(jié)晶能力喪失,分子形狀改變,肽鏈松散,反應(yīng)基團(tuán)增加,易被酶消化。第20頁(yè),共49頁(yè),星期六,2024年,5月第21頁(yè),共49頁(yè),星期六,2024年,5月
蛋白質(zhì)分子相互聚集而從溶液中析出的現(xiàn)象稱(chēng)為沉淀。變性后的蛋白質(zhì)由于疏水基團(tuán)的暴露而易于沉淀,但沉淀的蛋白質(zhì)不一定都是變性后的蛋白質(zhì)。加熱使蛋白質(zhì)變性并凝聚成塊狀稱(chēng)為凝固。(變性蛋白質(zhì)分子互相凝集為固體的現(xiàn)象稱(chēng)凝固。)因此,凡凝固的蛋白質(zhì)一定發(fā)生變性。沉淀和凝固第22頁(yè),共49頁(yè),星期六,2024年,5月引起蛋白質(zhì)變性的因素有:
①物理因素:高溫、高壓、紫外線(xiàn)、電離輻射、超聲波等;②化學(xué)因素:強(qiáng)酸、強(qiáng)堿、有機(jī)溶劑、重金屬鹽等。第23頁(yè),共49頁(yè),星期六,2024年,5月①物理性質(zhì):溶解度下降,沉降率升高,粘度升高,光吸收度增加等;②化學(xué)性質(zhì):官能團(tuán)反應(yīng)性增加,易被蛋白酶水解。③生物學(xué)性質(zhì):原有生物學(xué)活性喪失,抗原性改變。第24頁(yè),共49頁(yè),星期六,2024年,5月
蛋白質(zhì)變性的可逆性:--蛋白質(zhì)在體外變性后,絕大多數(shù)情況下是不能復(fù)性的;--如變性程度淺,蛋白質(zhì)分子的構(gòu)象未被嚴(yán)重破壞;或者蛋白質(zhì)具有特殊的分子結(jié)構(gòu),并經(jīng)特殊處理則可以復(fù)性。第25頁(yè),共49頁(yè),星期六,2024年,5月核糖核酸酶的變性與復(fù)性
第26頁(yè),共49頁(yè),星期六,2024年,5月(六)紫外吸收性質(zhì)可采用紫外分分光度法測(cè)定蛋白質(zhì)的含量。原理第27頁(yè),共49頁(yè),星期六,2024年,5月組成天然蛋白質(zhì)分子的20種氨基酸,色氨酸、酪氨酸和苯丙氨酸對(duì)紫外光有光吸收。其吸收峰在280nm左右。各種蛋白質(zhì)中這幾種氨基酸含量差別小。?含量特別,核酸干擾:280/260nm吸收差法第28頁(yè),共49頁(yè),星期六,2024年,5月(八)成鹽反應(yīng)R—CH—COOH+HClNH2R—CH—COOHNH2·HCl(九)?;蜔N基化反應(yīng)R—CH—COOH+RX′N(xiāo)H2R=?;驘N基′R—CH—COOH+HX′N(xiāo)HRX=鹵素(Cl、F)第29頁(yè),共49頁(yè),星期六,2024年,5月反應(yīng)名稱(chēng)試劑顏色反應(yīng)有關(guān)基團(tuán)有此反應(yīng)的蛋白質(zhì)或氨基酸雙縮脲反應(yīng)NaOH、CuSO2紫色或粉紅色二個(gè)以上肽鍵所有蛋白質(zhì)米倫反應(yīng)HgNO3、Hg(NO3)2及HNO3混合物紅色
Tyr黃色反應(yīng)濃HNO3及NH3黃色、橘色
Tyr、Phe乙醛酸反應(yīng)(Hopking-Cole反應(yīng))乙醛酸試劑及濃H2SO4紫色
Trp坂口反應(yīng)(Sakaguchi反應(yīng))α-萘酚、NaClO紅色胍基Arg酚試劑反應(yīng)(Folin-Cioculteu反應(yīng))堿性CuSO4及磷鎢酸-鉬酸藍(lán)色酚基、吲哚基Tyr茚三酮反應(yīng)茚三酮藍(lán)色自由氨基及羧基α-氨基酸
(七)蛋白質(zhì)的顏色反應(yīng)—OHN第30頁(yè),共49頁(yè),星期六,2024年,5月(十)成酯反應(yīng)R—CH—COOH+C2H5OHNH2R—CH—COOC2H5NH2HCl氣當(dāng)羧基變成乙酯后,羧基的化學(xué)性質(zhì)就被掩蔽了,而氨基的化學(xué)性質(zhì)就突出地顯示出來(lái)。(十一)酰氯化反應(yīng)Y—NH—CRH—COOH+PCl5?;被醂—NH—CRH—COCl?;被B仁拱被岬聂然罨?,易于另一氨基酸的氨基結(jié)合,在合成肽的工作上常用。第31頁(yè),共49頁(yè),星期六,2024年,5月(十二)成酰胺反應(yīng)H2N—CHR—COOC2H5+HNH2體外無(wú)水H2N—CHR—CONH2+C2H5OH氨基酸酰胺有機(jī)體內(nèi):Asp(Glu)+NH4+Asn(Gln)Asn(Gln)合成酶ATP(十三)脫羧反應(yīng)H2N—CHR—COOH脫羧酶CO2+RCH2NH2胺第32頁(yè),共49頁(yè),星期六,2024年,5月(十四)迭氮反應(yīng)H2N-CHR-COOHYHN-CHR-COOH?;被醂HN-CHR-COOCH3酰化氨基酸甲酯NH2NH2(-CH3OH)YHN—CHR—CO—NH—NH2?;被岬碾卵苌颒NO2YHN—CHR—CON3+2H2O酰化氨基酸迭氮第33頁(yè),共49頁(yè),星期六,2024年,5月
蛋白質(zhì)的分析測(cè)定目的蛋白質(zhì)含量蛋白質(zhì)純度分子量方法凱氏定氮法電泳電泳雙縮脲法質(zhì)譜凝膠色譜
Folin-phenol法色譜質(zhì)譜
UV吸收法
Coomassieblue法
第34頁(yè),共49頁(yè),星期六,2024年,5月第35頁(yè),共49頁(yè),星期六,2024年,5月第36頁(yè),共49頁(yè),星期六,2024年,5月原理:消化氮--無(wú)機(jī)氮—測(cè)氮—計(jì)算蛋白含量操作:蛋白質(zhì)+H2SO4
(消化)---
NH4
+加上OH-,蒸餾出NH3
收集到非揮發(fā)性的標(biāo)準(zhǔn)酸中,然后返滴定凱氏定氮法(1883)
第37頁(yè),共49頁(yè),星期六,2024年,5月優(yōu)點(diǎn):對(duì)所有蛋白質(zhì)的測(cè)量都是一致的(幾乎全部)消化樣品不要可溶缺點(diǎn):裝置需要大量的樣品.耗時(shí),繁瑣.不是檢測(cè)蛋白質(zhì)–而是檢測(cè)N(核酸和硫酸銨鹽是嚴(yán)重的污染物).由于缺乏專(zhuān)一性需要校正。
(假定蛋白質(zhì)含16%的氮,沒(méi)有其它NH4
+的主要來(lái)源物存在)第38頁(yè),共49頁(yè),星期六,2024年,5月雙縮脲法(1935)原理:
兩個(gè)或者以上的肽鍵(雙縮脲是一種兩個(gè)尿素分子共用一個(gè)氮原子形成的化合物–與二價(jià)銅離子形成紫紅色絡(luò)合物)
操作:肽+Cu2+(堿性條件下)
肽*Cu++-紅色.在A(yíng)540/560nm測(cè)量。繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn),計(jì)算。第39頁(yè),共49頁(yè),星期六,2024年,5月顏色反應(yīng)原理實(shí)例雙縮脲反應(yīng)是兩分子尿素經(jīng)加熱放出一分子NH3而得到的產(chǎn)物。凡含有兩個(gè)或以上肽鍵結(jié)構(gòu)的化合物都具有此反應(yīng)。第40頁(yè),共49頁(yè),星期六,2024年,5月優(yōu)點(diǎn):簡(jiǎn)便,快速專(zhuān)一不受蛋白質(zhì)特異性影響缺點(diǎn):靈敏度較低必須繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)所需樣品量大
(0.2—1.7mg/ml)第41頁(yè),共49頁(yè),星期六,2024年,5月Folin-phenol法(Lowry,1951)原理:
肽*Cu++---在堿性條件下被磷鎢酸/磷鉬酸催化氧化--變成藍(lán)色(鎢藍(lán)和鉬藍(lán)),藍(lán)色的深淺與蛋白質(zhì)的含量成正比。操作:配試劑
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