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文檔簡(jiǎn)介

生物醫(yī)藥基地westernblot技術(shù)手冊(cè)

1.westernblot主要試劑的配方

1.15義電泳緩沖液配方(IL)

Tris-Base15.1g

甘氨酸(Glycine)94g

SDS5g

留意事項(xiàng):

a.加水時(shí)應(yīng)盡量避開(kāi)氣泡的產(chǎn)生,否則會(huì)造成過(guò)多SDS的損耗。

b.配制好的溶液放于4度冰箱保存,使用時(shí)用純水稀釋至IX使用。

1.2IX轉(zhuǎn)膜液配方[1L)

甘氨酸(Glycine)2.9g

Tris-Base5.8g

SDS0.37g

甲醇200ml

留意事項(xiàng):

a.參加適量的純水,用磁力轉(zhuǎn)子將各組分溶解后參加甲醇溶液,最終

用純水定容至1L(甲醇?xì)馕洞?,通風(fēng)廚內(nèi)配制,并留意戴口罩)。

b.加水時(shí)應(yīng)盡量避開(kāi)氣泡的產(chǎn)生,否則會(huì)造成過(guò)多SDS的損耗。

1.310XTBS配方UL)

Tris-Base24.2g

NaCl80g

留意事項(xiàng):

參加適量的純水溶解各組分后,使用濃鹽酸或濃氫氧化鈉溶液調(diào)整

溶液的PH至7.6(一般溶解后溶液是偏堿的,所以選用濃鹽酸調(diào)整

PH至7.6即可)。

b.使用PH計(jì)調(diào)整溶液的PH前,要依據(jù)說(shuō)明書(shū)校準(zhǔn)PH計(jì)。

c.PH調(diào)整至7.6后,用純水定容至1L,使用時(shí)稀釋10倍至1義使用。

d.配制TBST時(shí),在1XTBS中依據(jù)1:1000的比例參加吐溫20充分

混勻即可。

1.430%丙烯酰胺單體儲(chǔ)存液配方(100ml)

丙烯酰胺(Acrylamide)29g

N,N、?亞甲雙丙烯酰胺

(N,N'-MethyleneBisacrylamide)1g

留意事項(xiàng):

a.將各組分溶于總體積為60ml的純水中,加熱至37C完全溶解,用

純水定容至100ml。

b.用裝0.45|im膜的濾器過(guò)濾,置于棕色瓶中保存于4℃冰箱保存。

c.丙烯酰胺有神經(jīng)毒性,操作時(shí)戴手套,并留意不要造成試驗(yàn)臺(tái)面

等的污染。

1.5上液(IMTris-HClPH=6.8)配方(50ml)

Tris-Base6.057g

三蒸水40ml

留意事項(xiàng):用濃鹽酸調(diào)整PH至6.8,再用三蒸水定容至50ml,4℃冰

箱保存。

1.6下液fIMTris-HCl,pH8.8)[50ml)

Tris-Base9.08g

三蒸水40ml

留意事項(xiàng):用濃鹽酸調(diào)整PH至8.8,再用三蒸水定容至50ml,4℃冰

箱保存。

2.WesternBlot主要流程

2.1蛋白樣品的提取

2.1.1常用裂解液及其特點(diǎn)

產(chǎn)品編號(hào)POO13P00J3BP00I3CP0013DP0013EP0013G

Western及IP

產(chǎn)品名稱RIPA裂解液(強(qiáng))RIPA裂解液(中)RIPA裂解液(弱)NPT0裂解液SDS裂解液

細(xì)胞裂解液

1%NP-40,

1%TritonX-1%TritonX-100,1%1%NP-4O,0.5%

有效裂解成分0.25%!%NP-401%SDS

100deoxycholate,0.1%SDSdeoxycholate,0.1%SDS

deoxycholate

裂解強(qiáng)度溫和強(qiáng)中溫和溫和強(qiáng)

對(duì)膜蛋白的提取一般很好較好一般一般很好

對(duì)胞漿蛋白的提取很好很好很好很好很好很好

對(duì)核蛋白的提取較好很好較好較好較好很好

胞漿磷酸化素門提取很好很好很好很好很好很好

細(xì)胞核轉(zhuǎn)錄因子提取很好很好很好很好很好很好

含蛋白酶抑制劑是是是是是是

含磷酸酯酶抑制劑是是是是是足

主要用途W(wǎng)B,IP.co-lPWB,IPWB.IPWB,IP,co-IPWB,IP.co-IPWB.ChIP

2.1.2醫(yī)藥基地常用蛋白質(zhì)提取方法

(1)RIPA強(qiáng)裂解法:

a.取適量胰酶消化細(xì)胞[針對(duì)對(duì)貼壁細(xì)胞,懸浮細(xì)胞可省略此步),

收取細(xì)胞,PBS洗兩遍,600g離心5min,盡量去除PBS,向細(xì)胞沉

淀中參加適量的預(yù)加了蛋白醐抑制劑PMSF的RIPA強(qiáng)裂解液(803

——200ul不等,依據(jù)自己細(xì)胞量的多少定)。

b.冰上裂解40min,每5min猛烈渦旋一次。

c.充分裂解后,14000rpm,4℃離心15min,將上清轉(zhuǎn)至另一預(yù)冷的

EP管中(不要吸到管底的沉淀)。

留意事項(xiàng):

a.整個(gè)過(guò)程盡量在冰上操作,由于蛋白在常溫降解速度很快,而在

冰上則能顯著的減慢這一過(guò)程。

b.PMSF有毒,留意戴手套,并留意不要造成試驗(yàn)臺(tái)面等的污染。

(2)SDS煮沸法(此方法對(duì)Caspase家族切割條帶具有特效):

a.收取細(xì)胞,PBS洗兩遍,600g離心5min,盡量去除PBS。

b.向細(xì)胞沉淀中參加適量的預(yù)加了蛋白酶抑制劑PMSF的SDS裂解

液(80ul—2003不等,依據(jù)自己細(xì)胞量的多少定)。

c.將EP管放在加熱器上95-100℃加熱20min以上,加熱至樣品中的

核酸粘稠物(細(xì)胞內(nèi)核酸)完全溶解為止。

d.充分裂解后,14000rpm,4℃離心15min,將上清轉(zhuǎn)至另一預(yù)冷的

EP管中(不要吸到管底的沉淀)。

留意事項(xiàng):

a.由于加熱的溫度很高為95℃,煮沸的全過(guò)程中,不要離開(kāi)蛋白樣

品,防止EP管炸開(kāi)而損失蛋白樣品,甚至蛋白樣品被蒸干。具體技

巧與方法:放物體壓住EP管,待加熱時(shí)間快完畢時(shí),停頓加熱,冷

卻到肯定時(shí)間,輕輕拿開(kāi)物體,輕輕拿出EP管。

b.盡快將核酸粘稠物煮化,縮短提取蛋白時(shí)間。具體技巧與方法:

加熱前適度渦旋,加熱過(guò)程中用剪去尖端的槍頭吹打樣品。

c.提取的蛋白樣品置于?20℃保存。

⑶細(xì)胞刮法(針對(duì)貼壁細(xì)胞)

a.倒掉培育基,PBS洗培育皿2次。

b.吸盡殘留的PBS,參加預(yù)加了PMSF的SDS裂解液50-500U1,快速

用細(xì)胞刮將細(xì)胞刮下,并將裂解后的細(xì)胞轉(zhuǎn)移到EP管中,其他步驟

同SDS煮沸法。

留意事項(xiàng):整個(gè)過(guò)程盡量在冰上操作以減慢蛋白的降解。

2.2蛋白樣品的定量

本試驗(yàn)室承受BCA法測(cè)定蛋白質(zhì)濃度,具體步驟:

a.將各蛋白樣品稀釋20倍(依據(jù)自己蛋白樣品的濃度可加大稀釋倍

數(shù))至總體積為40ul或以上,以供每個(gè)樣品3個(gè)復(fù)孔。

b.將蛋白樣品和蛋白標(biāo)準(zhǔn)品參加96孔板中,每孔10ul,每個(gè)樣品3

個(gè)復(fù)孔。

c.配制顯色液,充分混勻,參加96孔板,每孔lOOulo

d.37℃孵育30min,酶標(biāo)儀檢測(cè)吸光度。

留意事項(xiàng):

a.盡量將樣品加在96孔板的中間位置,避開(kāi)酶標(biāo)儀檢測(cè)時(shí)的邊緣效

應(yīng)。

b.參加樣品和顯色液的過(guò)程中盡量避開(kāi)氣泡的產(chǎn)生。

c.選用準(zhǔn)確度高的移液槍,盡量使用進(jìn)口的槍頭。

2.3SDS聚丙烯酰胺凝膠的配制

2.3.1不同濃度膠的最正確分別范圍

SDS-分別膠濃度最正確分別范

6類膠50-150kD

8用膠30-90kD

10%膠20-80kD

|12%膠

12-60kD

15%膠10-40kD

2.3.2不同濃度膠的配制

成分配制不同體積SDS-分別股所需各成分的體積(若升)

_________6%膠5ml10ml15ml201nl30ml50nli

蒸藤水2.04.06.08.012.020.0

30%Acr-Bis(29:l)1.02.03.04.06.010.0

IMTris,pH8.81.93.85.77.611.419.0

10%SDS0.050.10.150.20.30.5

10%過(guò)硫酸鉉0.050.10.150.20.30.5

TEMED0.0040.0080.0120.0160.0240.04

成分配制不同體積SDS-分別膠所需各成分的體積(圣升)

8%股5ml10ml15ml20ml30ml50ml

蒸飽水1.73.356.710.016.7

30%Aci-Bis(29:l)1.32.74.05.38.013.3

IMTris,pH8.81.93.85.77.611.419.0

10%SDS0.050.10.150.20.30.5

10%過(guò)硫酸鉞0.050.10.150.20.30.5

TEMED0.0030.0060.0090.0120.0180.03

成分配制不同體枳SDS-分別股所需各成分的體積(毫升)

10%股5ml10ml15ml20ml30ml50ml

蒸徽水1.32.74.05.38.013.3

30%Acr-Bis(29:l)1.73.35.06.710.016.7

IMTris,pH8.81.93.85.77.611.419.0

10%SDS0.050.10.150.20.30.5

10%過(guò)疏酸鉞0.050.10.150.20.30.5

TEMED0.0020.0040.0060.0080.0120.02

成分配制不同體積SDS-分別股所需各成分的體積(亮升)

12%股5ml10ml15ml20ml30ml50ml

蒸懦水1.02.03.04.06.010.0

30%Acr-Bis(29:l)2.04.06.08.012.020.0

IMTris,pH8.81.93.85.77.611.419.0

10%SDS0.050.10.150.20.30.5

10%過(guò)硫酸鐐0.050.10.150.20.30.5

TEMED0.0020.0040.0060.0080.0120.02

成分配制不同體積SDS-分別股所需各成分的體積(宅升)

15%股5ml10ml15ml20ml30ml50ml

蒸馀水0.51.01.52.03.05.0

30%Acr-Bis(29:l)2.55.07.510.015.025.0

IMTris,pll8.81.93.85.77.611.419.0

10%SDS0.050.10.150.20.30.5

10%過(guò)硫酸核0.05|0.1|0.150.2I0.30.5

TEMED0.0020.0040.0060.0080.0120.02

依據(jù)如下表格配制SDS-的濃縮膠(也稱為積存膠、上層

膠)

成分配制不同體積SDS-濃縮股所需各成分的體積(定升)

8|10|

5%股2346

5.5|

蒸飾水1.42.12.74.16.8

30%Acr-Bis(29:l)0.330.50.671.01.31.7

IMTris,pH6.80.250.380.5|0.751.01.25

10%SDS0.020.030.040.060.080.1

10%過(guò)硫酸筱0.020.030.040.060.080.1

TEMED0.0020.0030.0040.0060.0080.01

2.4WesternBlot主要步驟

(1)樣品制備(具體方法參見(jiàn)2.1.2)

進(jìn)展Western雜交時(shí)還需設(shè)置內(nèi)或外參照,通常用beta-actin和

GAPDHo

留意事項(xiàng):一般上樣20?30pg已足夠,如待檢蛋白為低豐度蛋白,

可加大上樣量至lOOgg,但電泳條帶易拖尾,可制備亞細(xì)胞組份濃縮

目的蛋白或承受更敏感的檢測(cè)方法。

(2)電泳分別(參照SDS-電泳方法)

留意事項(xiàng):

a.膠版都是周密的玻璃器材,使用時(shí)輕拿輕放,制止將膠板放到烘

箱烘烤。

b.電泳槽和膠槽中的電泳液要充分,可以避開(kāi)跑出“笑臉”和“哭

臉'。

C.依據(jù)試驗(yàn)者的樣品數(shù)選擇相應(yīng)的泳道數(shù),樣品的兩側(cè)需參加蛋白

marker,便于剪切目的蛋白條帶。剩余的泳道參加等體積的1XSDS

填充,以平衡鹽離子電壓,這樣可以防止蛋白條帶跑歪。兩側(cè)的蛋白

marker可選擇不同的用量,然后依據(jù)蛋白marker的深和淺區(qū)分點(diǎn)樣

的挨次。

d.WesternBlot中使用過(guò)的任何器材、試劑、儀器,全部要放歸原位

或恢復(fù)到使用前的狀態(tài)。

(3)轉(zhuǎn)膜

雜交膜的選擇是打算Westernblot成敗的重要環(huán)節(jié)°應(yīng)依據(jù)雜交

方案、被轉(zhuǎn)移蛋白的特性以及分子大小等因素,選擇適宜材質(zhì)、孔徑

和規(guī)格的雜交膜。用于Westernblot的膜主要有兩種:硝酸纖維素膜

(NC)和PVDF膜(基地目前使用)。NC膜是蛋白印跡試驗(yàn)的標(biāo)準(zhǔn)固

相支持物,在低離子轉(zhuǎn)移緩沖液的環(huán)境下,大多數(shù)帶負(fù)電荷的蛋白質(zhì)會(huì)

與膜發(fā)生疏水作用而高親和力的結(jié)合在一起,但在非離子型的去污劑

作用下,結(jié)合的蛋白還可以被洗脫下來(lái)。依據(jù)被轉(zhuǎn)移的蛋白分子量大

小,選擇不同孔徑的NC膜。由于隨著膜孔徑的不斷減小,膜對(duì)低分

子量蛋白的結(jié)合就越結(jié)實(shí)。通常用0.45摩和0.2即兩種規(guī)格的NC

膜。大于20kD的蛋白可用0.45pm的膜,小于20kD的蛋白就要用

0.2|im的膜了,如用0.45|xm的膜就會(huì)發(fā)生“Blowthrough”的現(xiàn)象。

PVDF膜靈敏度、區(qū)分率和蛋白親和力比常規(guī)的膜要高,格外適合于

低分子量蛋白的檢測(cè)。但PVDF膜在使用之前必需分別用純甲醇、純

水、轉(zhuǎn)膜液浸泡飽和5mino

蛋白質(zhì)常用的轉(zhuǎn)移方法主要有兩種:槽式濕轉(zhuǎn)(基地目前使用)

和半干轉(zhuǎn)移。前者操作簡(jiǎn)潔,轉(zhuǎn)移效率高;而后者適用于大膠的蛋白

轉(zhuǎn)移,所用緩沖液少。

操作步驟:

a.將膠浸于轉(zhuǎn)移緩沖液中平衡10mino如檢測(cè)小分子蛋白,可省略此

步,因小分子蛋白簡(jiǎn)潔集中出膠。

b.依據(jù)膠的大小剪取膜和濾紙6片,放入轉(zhuǎn)移緩沖液中平衡lOmino

c.裝配轉(zhuǎn)移三明治:海綿+3層濾紙+膠+膜+3層濾紙+海綿,每層放

好后,用試管趕去氣泡。切記:膠放于負(fù)極面(黑色面)。

d,將轉(zhuǎn)移槽置于冰浴中,放入三明治(黑色面對(duì)黑色面),加轉(zhuǎn)移緩

沖液,插上電極,選擇穩(wěn)流200mA,l-2h(依據(jù)分子量的大小打算電

泳時(shí)間)。留意:應(yīng)再次檢查“三明治”和電極是否裝配正確,電源

是否接通。

e.轉(zhuǎn)膜完畢后,切斷電源,取出雜交膜

留意事項(xiàng):

a.PVDF膜是比較貴重的試驗(yàn)用品,使用時(shí)要節(jié)約使用,依據(jù)膠的大

小來(lái)裁剪PVDF膜。

b.做“三明治”的過(guò)程中,膜與膠之間不能有氣泡。

c.活化PVDF膜要充分,假設(shè)消滅點(diǎn)點(diǎn)白斑,說(shuō)明活化不充分,需

要延長(zhǎng)活化時(shí)間。

d,轉(zhuǎn)膜液可回收4次使用,回收次數(shù)過(guò)多影響試驗(yàn)結(jié)果。

e.分子量大的蛋白需延長(zhǎng)轉(zhuǎn)膜時(shí)間,小分子量蛋白則可適當(dāng)增加轉(zhuǎn)

膜液中甲醇的比例。

f.轉(zhuǎn)膜完畢后,將膜與膠接觸的一面標(biāo)記為正面。

(4)免疫雜交與顯色

a.用25mlTBS洗膜5min,室溫,搖動(dòng)。

b.置膜于25ml封閉緩沖液中l(wèi)h,室溫,搖動(dòng)。

c.15mlTBS/T洗3次(5min/T)。

d.參加適宜稀釋度的一抗,室溫孵育l-2h(一抗無(wú)法回收)或4℃

過(guò)夜(一抗可回收屢次),緩慢搖動(dòng)。

留意事項(xiàng):

a.一抗為貴重的試驗(yàn)用品,使用前必讀:本試驗(yàn)室有比較齊全和充

分的抗體庫(kù),全部(或大局部)購(gòu)置的抗體在基地OA系統(tǒng)中均有具

體資料記錄,首先試驗(yàn)者需要在OA系統(tǒng)中確定基地購(gòu)置了目的蛋白

相關(guān)的抗體,然后確定所購(gòu)置的抗體的生產(chǎn)商以及貨號(hào),再依據(jù)這些

信息登陸相應(yīng)生產(chǎn)商的網(wǎng)頁(yè),具體查閱試驗(yàn)者馬上使用一抗的用途

(VCB、IP、Flow、IF等)、一抗來(lái)源(便于選擇適宜的二抗)、目的

條帶的分子量大小(便于依據(jù)蛋白marker剪切目的條帶)、一抗的特

異性、一抗使用的稀釋比例。把握這些資料前方能開(kāi)頭下一步的試驗(yàn)。

b

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