第三章 外文信息資源檢索-PUBMED課件

第三章

外文信息資源檢索-PUBMED第三章外文信息資源檢索-PUBMED第一節(jié)美國醫(yī)學索引與Medline一、美國醫(yī)學索引（IndexMedicus,IM）（一）美國醫(yī)學索引概況1.收錄范圍：世界上著名大型醫(yī)學文獻題錄型檢索期刊2.文獻類型：論文、社論、通信、綜述等3.IndexMedicus特色(1)歷史悠久(2)收錄范圍廣(3)質(zhì)量高(4)檢索簡便(5)回溯檢索能力強第三章外文信息資源檢索-PUBMED第一節(jié)美國醫(yī)學索引與Medline一、美國醫(yī)學索引（IndexMedicus,IM）（二）編排結構1.主題部分2.著者部分3.醫(yī)學綜述題錄4.醫(yī)學主題表(1)字順表(2)樹狀結構表(3)副主題詞表(4)收編期刊目錄第三章外文信息資源檢索-PUBMED第一節(jié)美國醫(yī)學索引與Medline一、美國醫(yī)學索引（IndexMedicus,IM）（三）檢索方法1.主題途徑檢索2.著者途徑檢索（四）檢索舉例第三章外文信息資源檢索-PUBMED第一節(jié)美國醫(yī)學索引與Medline二、Medline數(shù)據(jù)庫（一）Medline數(shù)據(jù)庫概況（二）Medline的收錄范圍1966年以來的70多個國家和地區(qū)，37種語言的近5600種期刊文獻（三）Medline數(shù)據(jù)庫的檢索方法第三章外文信息資源檢索-PUBMED第二節(jié)Pubmed與NCBINIH、NLM、NCBI與EntrezNIH(NationalInstituteofHealth)：美國國立衛(wèi)生研究院NLM(NatioanlLibraryofMedicine)：美國國立醫(yī)學圖書館NCBI(NationalCenterforBiotechnologyInformation，美國生物技術信息中心)Entrez第三章外文信息資源檢索-PUBMEDNCBI與EntrezNCBI創(chuàng)辦了生物技術和生命科學的優(yōu)秀網(wǎng)站——Entrez——基于多種數(shù)據(jù)庫的集成檢索系統(tǒng)，也是網(wǎng)上最大的免費檢索生物醫(yī)學資源的網(wǎng)站。通過該平臺可檢索到NCBI提供的28個數(shù)據(jù)庫，這些數(shù)據(jù)庫包含文獻數(shù)據(jù)庫、DNA和蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫、三維蛋白質(zhì)結構數(shù)據(jù)庫、種群研究庫、表達庫、完全人類基因組庫、分類信息庫。其中，Pubmed屬于文獻數(shù)據(jù)庫。文獻數(shù)據(jù)庫主要收藏生物醫(yī)學方面的期刊、圖書等。第三章外文信息資源檢索-PUBMED第三章外文信息資源檢索-PUBMED第三章外文信息資源檢索-PUBMED第三章外文信息資源檢索-PUBMED第二節(jié)Pubmed與NCBI一、Entrez資源整合系統(tǒng)NCBI，基于Web界面的綜合生物信息數(shù)據(jù)庫，網(wǎng)址為(1)GenBank和Nucletide(2)Genoma(3)OMIM(4)Protein(5)Structure(6)Pubmed(7)Taxonomy第三章外文信息資源檢索-PUBMED第二節(jié)Pubmed與NCBI二、Pubmed檢索系統(tǒng)（一）Pubmed收藏范圍：(1)Medline:標注為[Pubmed-indexedforMedline](2)OldMedline:標注為[Pubmed-OldMedline](3)InProgressCitations:標注為[Pubmed-inProcess](4)RecordSuppledbyPublisher:標注為[Pubmed-assuppliedbyPublisher]（二）Pubmed數(shù)據(jù)庫結構（P135）字段限定符：[]例如：Stem[ti]ANDneuroscience第三章外文信息資源檢索-PUBMED第二節(jié)Pubmed與NCBI二、Pubmed檢索系統(tǒng)（三）Pubmed基本檢索1.基本檢索第三章外文信息資源檢索-PUBMEDPubmed第三章外文信息資源檢索-PUBMED第二節(jié)Pubmed與NCBI二、Pubmed檢索系統(tǒng)（三）Pubmed基本檢索2.Pubmed的檢索規(guī)則1.邏輯運算符:AND

ORNOT如：commoncoldANDvitaminC

將檢索出同時包含感冒和維生素C兩個檢索詞的文獻。

第三章外文信息資源檢索-PUBMED第二節(jié)Pubmed與NCBI二、Pubmed檢索系統(tǒng)（三）Pubmed基本檢索2.Pubmed的檢索規(guī)則2.詞語自動轉(zhuǎn)換：自然語言轉(zhuǎn)換Mesh轉(zhuǎn)換表、刊名轉(zhuǎn)換表、短語表、著者索引對常用醫(yī)學名詞進行自動在MeSH轉(zhuǎn)換表、刊名轉(zhuǎn)換表、短語表、著者索引及所有記錄字段中轉(zhuǎn)換匹配。如：renalfailure（腎衰竭）轉(zhuǎn)換為"renalinsufficiency"[MeSHTerms]OR("renal"[AllFields]AND"insufficiency"[AllFields])OR"renalinsufficiency"[AllFields]OR("renal"[AllFields]AND"failure"[AllFields])OR"renalfailure"[AllFields]第三章外文信息資源檢索-PUBMED第二節(jié)Pubmed與NCBI二、Pubmed檢索系統(tǒng)（三）Pubmed基本檢索2.Pubmed的檢索規(guī)則3.截詞檢索功能：截詞符：”*”作為通配符進行截詞檢索。

例如：bacter*（系統(tǒng)會找到前一部分是bacter的單詞，如：bacteria、bacterium等）4.短語精確檢索用雙引號來強制系統(tǒng)進行短語檢索。例如：“oxygenfreeradicals”

（不再自動轉(zhuǎn)換匹配和擴展檢索）第三章外文信息資源檢索-PUBMED第二節(jié)Pubmed與NCBI二、Pubmed檢索系統(tǒng)（三）Pubmed基本檢索2.Pubmed的檢索規(guī)則其他著者檢索姓名,姓在前,名首字母在后限定加字段符如:genbacevo[AU]smithab[AU]第三章外文信息資源檢索-PUBMED第二節(jié)Pubmed與NCBI二、Pubmed檢索系統(tǒng)（四）Pubmed主題詞檢索主題詞概念與優(yōu)勢：統(tǒng)一概念，可擴展檢索方法例：欲查腎衰竭（renalfailure）飲食療法(diettherapy)的相關文獻？第三章外文信息資源檢索-PUBMEDMeshSearch第三章外文信息資源檢索-PUBMEDMeshSearch第三章外文信息資源檢索-PUBMED第三章外文信息資源檢索-PUBMEDSubheadings第三章外文信息資源檢索-PUBMED款目詞樹狀詞表第三章外文信息資源檢索-PUBMED檢索第三章外文信息資源檢索-PUBMED檢索結果第三章外文信息資源檢索-PUBMED第二節(jié)Pubmed與NCBI二、Pubmed檢索系統(tǒng)（五）Pubmed高級檢索1.檢索構建器searchbuilder2.檢索歷史第三章外文信息資源檢索-PUBMEDAdvancedSearch第三章外文信息資源檢索-PUBMED第二節(jié)Pubmed與NCBI二、Pubmed檢索系統(tǒng)（六）期刊數(shù)據(jù)庫檢索通過輸入刊名、縮寫名、ISSN等,瀏覽期刊文獻。提供電子原文的超鏈鍵。newenglandjournalofmedicineclinexpimmunol[so]1059-1524第三章外文信息資源檢索-PUBMED第三章外文信息資源檢索-PUBMEDJournal第三章外文信息資源檢索-PUBMED第三章外文信息資源檢索-PUBMED第三章外文信息資源檢索-PUBMED第二節(jié)Pubmed與NCBI二、Pubmed檢索系統(tǒng)（七）單篇引文匹配器輸入題錄信息，查找特定文獻進行補缺?？獪蚀_，縮寫要標準著者姓名大小寫不敏感如：已知：第一著者是ChallisDE，出處是PediatricResearch；2000，47（3）：309-15，要求寫出其他合著者第三章外文信息資源檢索-PUBMED輸入已知條件SingleCitationMatcher第三章外文信息資源檢索-PUBMED第二節(jié)Pubmed與NCBI二、Pubmed檢索系統(tǒng)（八）臨床查詢1.ClinicalStudyCategories2.SystematicReview3.MedicalGenetics第三章外文信息資源檢索-PUBMEDClinicalQueries第三章外文信息資源檢索-PUBMED第二節(jié)Pubmed與NCBI二、Pubmed檢索系統(tǒng)（九）檢索結果的顯示、評價、分析與管理1.結果顯示：2.檢索結果的保存及輸出3.檢索結果的記錄顯示4.檢索結果的限定和過濾第三章外文信息資源檢索-PUBMED檢索結果第三章外文信息資源檢索-PUBMED顯示方式保存方式第三章外文信息資源檢索-PUBMED詳細顯示第三章外文信息資源檢索-PUBMED結果限定第三章外文信息資源檢索-PUBMED第二節(jié)Pubmed與NCBI三、其他工具和鏈接（一）MyNCBI個性化功能1.保存檢索策略及E-mail發(fā)送功能2.保存檢索結果3.過濾檢索結果（二）Linkout：全文鏈接（三）批量引文匹配器（四）臨床試驗數(shù)據(jù)庫第三章外文信息資源檢索-PUBMEDMyNCBI第三章外文信息資源檢索-PUBMEDLinkOUT第三章外文信息資源檢索-PUBMEDNCBIBatchCitationMatcher第三章外文信息資源檢索-PUBMEDClinicalTrail第三章外文信息資源檢索-PUBMED第二節(jié)Pubmed與NCBI三、其他工具和鏈接（五）Gopubmed知識挖掘分析工具1.Gopubmed概述2.Gopubmed的分類統(tǒng)計功能(1)主題分布(2)作者分布(3)文獻來源分布(4)年度分布3.Gopubmed與SCI信息分析功能比較第三章外文信息資源檢索-PUBMEDGopubmed是一種Pubmed檢索工具，是對于Pubmed資源的另一種組合檢索方式，它比Pubmed的優(yōu)點集中在于對于某一方面的研究我們能夠直觀得知研究時間、研究者、地域、研究過程、研究動態(tài)和各種信息之間的相關性摘自上海交通大學-生命醫(yī)藥學科博客：第三章外文信息資源檢索-PUBMEDGoPummed第三章外文信息資源檢索-PUBMED第二節(jié)Pubmed與NCBI四、PubMedCentral：免費全文數(shù)據(jù)庫五、Entrez跨庫檢索第三章外文信息資源檢索-PUBMEDPubmedCentral第三章外文信息資源檢索-PUBMED第三章外文信息資源檢索-P