醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)管理_Epidata【稻香書屋】

1、醫(yī)學(xué)研究數(shù)據(jù)管理與統(tǒng)計分析Data management & analysis,1,高等課堂,搜集資料,整理與分析資料,調(diào)查（研究）項(xiàng)目,分析表（指標(biāo),研究目的,回答,統(tǒng)計分析步驟,調(diào)查研究步驟,研究設(shè)計思路與數(shù)據(jù)管理分析步驟,解釋、呈現(xiàn)結(jié)果,2,高等課堂,確定調(diào)查和研究的目的是選定研究指標(biāo)的依據(jù) 研究指標(biāo)又是研究目的的具體體現(xiàn),一、明確調(diào)查和研究的目的,了解參數(shù)，用以說明總體。 研究變量間的關(guān)系，通過確立統(tǒng)計學(xué)聯(lián)系來 探索病因或驗(yàn)證療效等。,3,高等課堂,二、確定研究對象和觀察單位,研究對象：對象來源總體是什么？ 抽樣方法：如何抽樣？代表性？ 觀察單位：個體？群體,4,高等課堂,三、研究設(shè)計

2、類型的選擇,根據(jù)研究目的選擇合適的設(shè)計類型： 描述疾病的或健康狀況的三間分布 探討病因 驗(yàn)證預(yù)防和控制措施的效果 評價疫苗的效果 新藥上市前臨床試驗(yàn),5,高等課堂,6,高等課堂,四、確定研究項(xiàng)目，擬定調(diào)查表（問卷,調(diào)查和研究項(xiàng)目的確定：分析項(xiàng)目、備選項(xiàng)目 調(diào)查表和原始數(shù)據(jù)記錄表的設(shè)計,7,高等課堂,根據(jù)研究設(shè)計類型確定所需樣本量計算公式。 相關(guān)參數(shù)： 一類錯誤的概率：即檢驗(yàn)水準(zhǔn)，越小所需樣本含量越多，對于相同的檢驗(yàn)水準(zhǔn)，雙側(cè)檢驗(yàn)比單側(cè)檢驗(yàn)所需的樣本含量更大，通常取0.05。 把握度(power) 1-,一般0.8-0.9 單側(cè)檢驗(yàn)還是雙側(cè)檢驗(yàn)，單側(cè)檢驗(yàn)所需樣本量小，雙側(cè)檢驗(yàn)所需樣本量大,五、樣

3、本含量的估計,8,高等課堂,常用樣本含量的估計軟件：EpiCalc 2000,9,高等課堂,常用軟件：EPI INFO,10,高等課堂,常用軟件：OPENEPI,11,高等課堂,直接觀察法 采訪法 包括面訪、調(diào)查會及信訪、電話訪問等,六、原始資料的收集,原始資料的收集方式,12,高等課堂,七、調(diào)查和研究的質(zhì)量控制,真實(shí)性（效度） 可靠性（信度,偏倚及其如何控制,如何評價,13,高等課堂,錄入前的核對 錄入計算機(jī)，建立數(shù)據(jù)庫（database） Excel、Access、EpiData、STATA、SPSS、SAS軟件等 錄入后的核對和整理 邏輯檢查、核對 排序（sorting） 建立新變量 數(shù)

4、據(jù)的編碼和轉(zhuǎn)換 缺失值的處理,八、 數(shù)據(jù)資料的整理,14,高等課堂,Dbase, FoxBase，Visual FoxPro，Lotus,數(shù)據(jù)錄入和管理軟件,15,高等課堂,用Epidata構(gòu)建調(diào)查表數(shù)據(jù)庫,16,高等課堂,用Epidata錄入調(diào)查表,17,高等課堂,統(tǒng)計分析常用軟件,18,高等課堂,讓我們從一個簡單的調(diào)查開始,研究目的：了解本班同學(xué)年齡、性別、身高等信息。 Step1: 建立調(diào)查表 文本編輯軟件：Word,19,高等課堂,Step 2:調(diào)查表數(shù)據(jù)錄入,20,高等課堂,EpiData軟件概述,一、EpiData的設(shè)計 設(shè)計者：丹麥的Jens M、Michael Bruus和英國

5、的Mark Myatt 編程者：丹麥的Michael Bruus 開發(fā)思路和原理：基于Epi Info 6.0 二、軟件下載和登記注冊 下載地址：http:/www.epidata.dk/ download.htm 三、版本信息 EpiData 1.5（2001年2月22日）；EpiData 2.1a（2002年） EpiData 3.02（2004）； EpiData 3.10（NOW） 四、安裝和系統(tǒng)要求 可在Windows 95/98/NT/2000/XP/7等操作系統(tǒng)下運(yùn)行,21,高等課堂,EpiData軟件概述,EpiData軟件安裝如同拷貝程序文檔一樣簡單。例如，它可以從U盤運(yùn)行，

6、并且占用內(nèi)存很小（2.5M）。 由于捐助和志愿者的工作，軟件免費(fèi)發(fā)布,22,高等課堂,EpiData程序下載與安裝,http:/www.epidata.dk,23,高等課堂,EpiData程序下載與安裝,數(shù)據(jù)錄入,24,高等課堂,EpiData 軟件,EpiData 軟件是在吸收 DOS版的Epi Info 6.0 軟件優(yōu)點(diǎn)基礎(chǔ)上開發(fā)研制的 Windows版軟件,25,高等課堂,EpiData 軟件,它一方面吸收了Epi Info軟件的長處，同時又極具自身特色。 與 視窗版Epi Info軟件相比，占用空間小，更加簡單易學(xué)，且界面友好，可以很方便的對數(shù)據(jù)進(jìn)行儲存、核對和管理等,26,高等課堂,

7、用EpiData軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)錄入和管理，將產(chǎn)生三種基本的文件； 每種文件具有固定的后綴，在數(shù)據(jù)錄入和管理中發(fā)揮不同作用。 （1）調(diào)查表文件：后綴為.QES。通過建立調(diào)查表文件，系統(tǒng)根據(jù)特定規(guī)則自動定義數(shù)據(jù)文件的結(jié)構(gòu)，包括變量名、變量類型和長度等，用于數(shù)據(jù)錄入。 （2）數(shù)據(jù)文件：后綴為.REC。數(shù)據(jù)文件包含錄入的數(shù)據(jù)信息以及已經(jīng)定義好的編碼，用于數(shù)據(jù)的統(tǒng)計分析。 （3）核對文件：后綴為.CHK。通過建立核對文件，系統(tǒng)將定義數(shù)據(jù)錄入的有效性規(guī)則,EpiData Entry 的文件組成,27,高等課堂,EpiData Entry 的特點(diǎn),調(diào)查表設(shè)計便捷 數(shù)據(jù)核查功能強(qiáng)大且實(shí)現(xiàn)簡便 與調(diào)查表形式一致的

8、可視數(shù)據(jù)錄入界面 數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換功能強(qiáng)大,28,高等課堂,講了半天， EpiData究竟長什么樣,29,高等課堂,請打開電腦上EpiData主程序,為何我的電腦上沒有歡迎使用EpiData,30,高等課堂,EpiData軟件的窗口介紹,31,高等課堂,編輯過程工具條,工具欄,數(shù)據(jù)表預(yù)覽,粘貼,字段編輯器,編碼編輯器,32,高等課堂,調(diào)查表文件的建立,數(shù)據(jù)文件： 原始數(shù)據(jù) 文件結(jié)構(gòu)（庫結(jié)構(gòu)） 字段名 字段類型 字段長度,調(diào)查表信息 數(shù)據(jù)文件,33,高等課堂,建立調(diào)查表文件,建立調(diào)查表文件是建立數(shù)據(jù)庫、實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)錄入和管理的第一步,34,高等課堂,建立調(diào)查表文件有以下幾種方法,第一種：在菜單中，點(diǎn)擊 “文

9、件”（File）“生成調(diào)查表文件QES文件” 第二種：在工作欄的工作流程中，點(diǎn)擊“1. 打開文件”（1.Define Data）“建立新QES文件” 第三種：在按鈕欄中，點(diǎn)擊 ,這時窗口中會在工作區(qū)顯示一個空白的文檔，你可以在此文檔中鍵入調(diào)查表內(nèi)容和框架，編輯完成后，將調(diào)查表文件保存，文件的擴(kuò)展名統(tǒng)一為.QES,35,高等課堂,假定現(xiàn)有一調(diào)查表如下，如何建立.QES文件,調(diào)查表 姓名：_ 性別：（1）男 （2）女 身高：_._ CM 出生日期：_年_月_日,36,高等課堂,如果按原調(diào)查表格式直接建立數(shù)據(jù)庫，結(jié)果會怎樣,37,高等課堂,必須定義字段名和字段類型,38,高等課堂,調(diào)用字段編輯器：

10、第一種方法：直接按CTRL-Q鍵。 第二種方法：在編輯器工具條上點(diǎn)擊字段編輯器圖標(biāo),手工輸入或使用字段編輯器,39,高等課堂,字段類型介紹,數(shù)值型字段：#，#.# ；僅接受數(shù)字和空格，不輸按空格處理，分析時作缺失值處理，以“.”顯示。數(shù)字位數(shù)由“#”個數(shù)決定，小數(shù)位數(shù)由小數(shù)點(diǎn)右邊的“#”個數(shù)確定。最長可達(dá)14位，小數(shù)點(diǎn)按1個字符計算,40,高等課堂,文本型字段：包括三種。一種是常用的文本（或下劃線、或底線）型字段：_；該型字段由連續(xù)下劃線來定義，長度由下劃線字符個數(shù)決定，最大值為80，空白字段（字段內(nèi)容空缺）時，數(shù)據(jù)管理時將按缺失值處理。另一種為大寫文本型字段,41,高等課堂,日期型字段：包括

11、兩種。一種為常用日期字段：、，分美式、英式兩種，輸入時即進(jìn)行合法性檢驗(yàn)；只需輸入日期，系統(tǒng)自動插入斜杠。另一種為自動日期型字段：、 ；儲存或修改數(shù)據(jù)時該字段自動輸入系統(tǒng)日期，如系統(tǒng)日期正確，也即當(dāng)天日期,42,高等課堂,自動ID號型字段：；這是一種專用字段，用作記錄識別號，文件的第一個記錄為1，以后記錄自動賦值順次較前增加1，并自動保證編號的唯一性。輸入數(shù)據(jù)時光標(biāo)跳過此字段。如需使第一個記錄號大于1，則可在“文件”菜單“選擇項(xiàng)”中的“高級設(shè)置”中設(shè)置。 邏輯型字段（即布爾函數(shù)型字段）：；只接受Y、N、空格或回車鍵。后兩者作缺失值處理。Y、N字符輸入后即轉(zhuǎn)為大寫字母,43,高等課堂,我們按照這些

12、要求重新建立數(shù)據(jù)庫，這次應(yīng)該成功了吧,先預(yù)覽一下,44,高等課堂,怎么會這樣,45,高等課堂,定義字段名（Field Names,以調(diào)查表中字段的第一個詞命名 （First word in question is field names） 使用 內(nèi)的內(nèi)容自動添加字段名（Automatic field names,46,高等課堂,定義字段名（Field Names,文件”（File）“選項(xiàng)”（Option）“生成REC文件”（Create data file） 在“如何生成字段名”（How to generate field names）中選擇字段的命名方式,47,高等課堂,更新問題為實(shí)際文件名

13、”如果未勾選,48,高等課堂,預(yù)覽顯示的并非真實(shí)的字段名,如“姓名”, 真實(shí)的字段名是Field1,49,高等課堂,50,高等課堂,按 命名規(guī)則修改調(diào)查表，然后預(yù)覽生成REC文件,51,高等課堂,別忘了修改“選項(xiàng),否則會是這樣的,52,高等課堂,制作調(diào)查表文件可用EpiData編輯器進(jìn)行。 也可用Word或其它文本編輯器編寫。注意，必須以純文本格式存盤，文件后綴名必須是“.qes”。 也可在其它文本編輯器編寫，再粘貼到EpiData編輯器窗口,如何編寫調(diào)查表文件,53,高等課堂,編寫調(diào)查表文件注意事項(xiàng)（一,編寫過程中及時保存文件，文件類型為.qes文件。 系統(tǒng)只會根據(jù)“特殊符號”來定義一個輸入

14、字段（包括類型和長度），并根據(jù)符號前的字符給字段命名。建議在編寫過程中利用“字段快速清單”插入“特殊符號”，即：選擇字段類型，定義好長度后，按“插入”圖標(biāo)，可避免由于“特殊符號”輸入錯誤而不能產(chǎn)生有效的輸入字段。 調(diào)查表用中文編寫時，可用定界符（“”）將字段名定義為英文字符（英文字母或英文字母阿拉伯?dāng)?shù)字），有利于數(shù)據(jù)庫的管理和其他軟件的統(tǒng)計分析。注意：“”必須為半角型，而不能是全角型(“”,54,高等課堂,盡可能把字段定義數(shù)值型，有利于統(tǒng)計分析。如糖尿病史“dmhis”可定義為數(shù)值型字段，“1”表示“有”，“0”表示“無”。 調(diào)查表文件格式盡可能和原調(diào)查表一致，有利于直觀錄入數(shù)據(jù)。 如果用其他

15、文本編輯器編寫.qes文件，在運(yùn)行EpiData后，打開該.qes文件即可編輯。 調(diào)查表文件的編寫是否符合要求，可通過“數(shù)據(jù)表預(yù)覽”來查看,編寫調(diào)查表文件注意事項(xiàng)（二,55,高等課堂,數(shù)據(jù)文件的產(chǎn)生和修改,主菜單選擇數(shù)據(jù)導(dǎo)入/導(dǎo)出菜單“根據(jù)QES文件生成REC文件” 在工作過程工具條按第二個按鈕“生成REC文件” 在編輯器菜單REC文件菜單選擇“生成REC文件,56,高等課堂,生成REC文件,57,高等課堂,58,高等課堂,請大家根據(jù)EPIDATA建立調(diào)查表庫data.qes,生成數(shù)據(jù)庫，保存為data.rec,調(diào)查表 姓名：_ 性別：（1）男 （2）女 身高：_._ CM 出生日期：_年_月

16、_日,59,高等課堂,現(xiàn)在我們已經(jīng)有了兩個文件： *.QES 調(diào)查表文件 *.REC 數(shù)據(jù)文件 *.REC文件是根據(jù)QES文件生成的，用于數(shù)據(jù)錄入,萬一我的QES文件丟了怎么辦,60,高等課堂,數(shù)據(jù)文件結(jié)構(gòu)的修改,61,高等課堂,調(diào)查表結(jié)構(gòu)重新修改后怎么辦,數(shù)據(jù)庫建立后，錄入了一部分分?jǐn)?shù)據(jù)，發(fā)現(xiàn)漏掉了一個字段，于是重新修改調(diào)查表，這里可以根據(jù)修改后的QES文件更新REC文件,62,高等課堂,我一邊QQ聊天，一邊錄入數(shù)據(jù)，萬一錄錯了，軟件會通知我嗎,嗨！有第3種人嗎,63,高等課堂,核對文件的建立,核對文件：CHECK文件或 .CHK文件,范圍/合法值（Range/Legal） 跳轉(zhuǎn)（Jumps

17、） 必須輸入（MustEnter） 重復(fù)輸入（Repeat,64,高等課堂,65,高等課堂,光標(biāo)懸停，會提示你命令格式,66,高等課堂,錄入錯誤時，軟件會彈出警告,67,高等課堂,試試，如果將1改為20會怎樣？改為15會怎樣,關(guān)鍵字段的定義,以編號code2為例，這個編號具有唯一性，為避免重復(fù)輸入，可在CHK文件中定義： code2 KEY UNIQUE 1 MUSTENTER END,68,高等課堂,練習(xí),請大家根據(jù)下列調(diào)查表內(nèi)容，利用EPIDATA建立調(diào)查表數(shù)據(jù)庫,保存為data1.qes，并生成data1.rec用于錄入資料,69,高等課堂,調(diào)查表 1.地區(qū)號： N J 2.調(diào)查表編號：

18、 3. 錄入ID號： 4.姓名：_ 5.性別：（1）男 （2）女 6.你吸煙嗎？ （1）否跳問7 （2）是 續(xù)問6.1 6.1 你多在年齡開始吸煙的？ _ 歲 6.2 平均每天吸煙支數(shù)？ _ 支 7.身高：_._ CM 8.血壓值(收縮壓/舒張壓)： _ /_mmHg 9.出生日期：_月_日_年 10. 你是否具有下列癥狀？如有請在相應(yīng)癥狀前打勾。 咳嗽 咳痰 發(fā)熱 胸痛 呼吸困難 咯血 11.調(diào)查表錄入日期： _月_日_年,錄入時自動編碼,70,高等課堂,請大家根據(jù)data1.rec數(shù)據(jù)庫，建立CHK文件，保存為data1.chk 要求： （1）地區(qū)號自動錄入 （2）編號、姓名必須錄入 （3

19、）性別只能填1或2 （4）是否吸煙只能填1、2或9 （5）是否吸煙能夠?qū)崿F(xiàn)跳轉(zhuǎn) （6）平均每天吸煙支數(shù)的范圍在1-40之間或填99 并請嘗試錄入35份調(diào)查表，存盤,71,高等課堂,記錄刪除,此處僅是在記錄加上刪除標(biāo)記， 徹底刪除需至“工具”清理REC文件,點(diǎn)擊,72,高等課堂,如果研究對象是（1）男性，而我卻錄成了（2）女性，軟件好象不會彈出警告嘛,73,高等課堂,雙錄入核對 double entry,為了確保錄入質(zhì)量，可以采用雙人錄入法進(jìn)行核對。 首先利用工具-復(fù)制REC文件結(jié)構(gòu)，復(fù)制已建立好的數(shù)據(jù)庫（包括CHK文件），另存為一新庫，但已錄入的數(shù)據(jù)不會被復(fù)制,74,高等課堂,雙錄入核對 do

20、uble entry,如需要，可不復(fù)制字符型變量 因?yàn)榧彝プ≈?、工作單位等很少有人愿意錄入兩?75,高等課堂,兩次錄入的一致性檢驗(yàn),雙軌錄入完成后可進(jìn)行一致檢驗(yàn) 比較兩次錄入不同的地方 注意選擇兩數(shù)據(jù)庫中的匹配字段用于比較,76,高等課堂,77,高等課堂,78,高等課堂,調(diào)查表錄入兩次，比較后發(fā)現(xiàn)錯誤再修改，好象太麻煩！ 有沒有邊錄入邊比較的方法,79,高等課堂,雙錄入實(shí)時校驗(yàn),先點(diǎn)擊工具-準(zhǔn)備雙錄入實(shí)時校驗(yàn),80,高等課堂,雙錄入實(shí)時校驗(yàn),指定第1 次已錄入的REC文件 創(chuàng)建1新的REC文件，用于雙錄入,81,高等課堂,雙錄入實(shí)時校驗(yàn),應(yīng)注意錄入調(diào)查表的順序,82,高等課堂,顯示數(shù)據(jù),瀏覽數(shù)據(jù)庫,83,高等課堂,其它一些常用功能,打印調(diào)查表