《動(dòng)物數(shù)量遺傳學(xué)》ppt課件

1、第十一章第十一章 多性狀選擇原理和方法概述多性狀選擇原理和方法概述 重點(diǎn)提示：本章重點(diǎn)論述了個(gè)體育種重點(diǎn)提示：本章重點(diǎn)論述了個(gè)體育種值估計(jì)原理和方法，多性狀選擇的根值估計(jì)原理和方法，多性狀選擇的根本方法，綜合選擇指數(shù)的運(yùn)用前提和本方法，綜合選擇指數(shù)的運(yùn)用前提和局限以及相對(duì)效率比較。局限以及相對(duì)效率比較。第一節(jié) 個(gè)體育種值估計(jì) 估計(jì)育種值估計(jì)育種值 estimated breeding valueestimated breeding value，EBVEBV：利用統(tǒng)計(jì)分析方法，經(jīng)過(guò)表型值和個(gè)體：利用統(tǒng)計(jì)分析方法，經(jīng)過(guò)表型值和個(gè)體間的親緣關(guān)系來(lái)對(duì)育種值進(jìn)展估計(jì)，由此得到間的親緣關(guān)系來(lái)對(duì)育種值進(jìn)展估

2、計(jì)，由此得到的估計(jì)值。的估計(jì)值。 估計(jì)傳送力估計(jì)傳送力 estimated transmitting estimated transmitting abilityability，ETAETA：估計(jì)育種值的一：估計(jì)育種值的一 半。半。 相對(duì)育種值相對(duì)育種值 relative breeding valuerelative breeding value，RBVRBV：個(gè)體育種值相對(duì)與所在群體均值的百分：個(gè)體育種值相對(duì)與所在群體均值的百分?jǐn)?shù)數(shù) 。 綜合育種值綜合育種值 total breeding valuetotal breeding value ：思：思索不同性狀在育種上和經(jīng)濟(jì)上的重要性差別，索不

3、同性狀在育種上和經(jīng)濟(jì)上的重要性差別，普通將這些差別用性狀的經(jīng)濟(jì)加權(quán)值表示。普通將這些差別用性狀的經(jīng)濟(jì)加權(quán)值表示。 單項(xiàng)資料估計(jì)個(gè)體育種值 1 1個(gè)體本身信息估計(jì)個(gè)體育種值個(gè)體本身信息估計(jì)個(gè)體育種值 2 2系譜信息估計(jì)個(gè)體育種值系譜信息估計(jì)個(gè)體育種值 3 3同胞信息估計(jì)個(gè)體育種值同胞信息估計(jì)個(gè)體育種值 4 4后裔信息估計(jì)個(gè)體育種值后裔信息估計(jì)個(gè)體育種值 5 5各種個(gè)體育種值估計(jì)方法的相對(duì)效率各種個(gè)體育種值估計(jì)方法的相對(duì)效率單項(xiàng)資料估計(jì)個(gè)體育種值的方法一覽表 kPPPPFSPHSPOFPOHP，單項(xiàng)資料15種估計(jì)個(gè)體育種值的方法1. 個(gè)體本身體料(1) 個(gè)體本身單次表型值P(2) 個(gè)體本身k次表型

4、值的均值2. 親本資料(3) 一個(gè)親本單次表型值PP(4) 一個(gè)親本k次表型值的均值(5) 雙親單次表型值的均值(6) 雙親各自度量kS，kD次的均值 ，3. 同胞資料包括全同胞Fs和半同胞Hs(7) 一個(gè)同胞單次表型值PFS或PHS(8) 一個(gè)同胞k次度量表型值的均值 或(9) n個(gè)同胞單次度量均值 或(10) n個(gè)同胞各有k次記錄均值4. 后裔資料包括Fs子女和Hs子女資料(11) 混合家系(12) 一個(gè)子女單次度量表型值PO(13) 一個(gè)子女k次度量表型均值(14) n個(gè)子女單次度量均值 或(15) n個(gè)子女各有k次記錄均值 或 個(gè)體本身單次表型值個(gè)體本身單次表型值P來(lái)估計(jì)個(gè)體育種值來(lái)估

5、計(jì)個(gè)體育種值 個(gè)體本身個(gè)體本身k次表型值的均值次表型值的均值 來(lái)估計(jì)個(gè)體育種來(lái)估計(jì)個(gè)體育種值值系譜信息估計(jì)個(gè)體育種值 一個(gè)親本單次表型值一個(gè)親本單次表型值PP來(lái)估計(jì)個(gè)體育種值來(lái)估計(jì)個(gè)體育種值 一個(gè)親本一個(gè)親本k次表型值的均值次表型值的均值 來(lái)估計(jì)個(gè)體育種來(lái)估計(jì)個(gè)體育種值值 雙親單次表型值的均值雙親單次表型值的均值 來(lái)估計(jì)個(gè)體育種值來(lái)估計(jì)個(gè)體育種值 雙親各自度量雙親各自度量kS、kD次的均值次的均值 、 來(lái)估來(lái)估計(jì)個(gè)體育種值計(jì)個(gè)體育種值同胞信息估計(jì)個(gè)體育種值 一個(gè)同胞單次表型值一個(gè)同胞單次表型值PFS或或PHS來(lái)估計(jì)個(gè)體來(lái)估計(jì)個(gè)體育種值育種值 一個(gè)同胞一個(gè)同胞k次度量表型值的均值次度量表型值的均

6、值 或或 來(lái)估來(lái)估計(jì)個(gè)體育種值計(jì)個(gè)體育種值 n個(gè)同胞單次度量均值個(gè)同胞單次度量均值 或或 來(lái)估計(jì)個(gè)體育來(lái)估計(jì)個(gè)體育種值種值 n個(gè)同胞各有個(gè)同胞各有k次記錄均值、來(lái)估計(jì)個(gè)體育種次記錄均值、來(lái)估計(jì)個(gè)體育種值值后裔信息估計(jì)個(gè)體育種值 一個(gè)子女單次度量表型值一個(gè)子女單次度量表型值PO來(lái)估計(jì)個(gè)體育種來(lái)估計(jì)個(gè)體育種值值 一個(gè)子女一個(gè)子女k次度量均值來(lái)估計(jì)個(gè)體育種值次度量均值來(lái)估計(jì)個(gè)體育種值 n個(gè)子女單次度量均值個(gè)子女單次度量均值 或或 來(lái)估計(jì)個(gè)體育來(lái)估計(jì)個(gè)體育種值種值 n個(gè)子女各有個(gè)子女各有k次記錄均值次記錄均值 或或 來(lái)估計(jì)個(gè)體來(lái)估計(jì)個(gè)體育種值育種值各單項(xiàng)資料不同信息估計(jì)個(gè)體育種值的bAP和rAP er

7、kkh) 1(12hrkke) 1(1erkkh) 1(15 . 02DeDDSeSSPrkhkPrkhk) 1(15 . 0) 1(15 . 022erkkh) 1(15 . 0h22eDDeSSrkkrkkh) 1(1) 1(15 . 0eArkhkr) 1(12SArnhnr) 1(122222) 1(1hzrnhznrSAAeArkkhr) 1(1SArnnhr) 1(122) 1(1hzrnnzhrSAAerkkh) 1(15 . 02Ornnh) 1(15 . 022222) 1(15 . 0hzrnhnzOAerkkh) 1(15 . 0Ornnh) 1(15 . 022) 1(

8、15 . 0hzrnnzhOA信息資料類型一個(gè)個(gè)體單次度量值一個(gè)個(gè)體k次度量均值N個(gè)同類個(gè)體單次度量均值n個(gè)同類個(gè)體k次度量均值個(gè)體bAPh2rAPh親本bAP0.5h2h2 1) 2)rAP0.5h 1) 2)同胞bAPrAh2rAPrAh后裔bAP0.5h2rAP0.5h多項(xiàng)資料合并估計(jì)個(gè)體育種值遵照的步驟 1) 1) 計(jì)算出各項(xiàng)資料的方差及相互間的協(xié)方差；計(jì)算出各項(xiàng)資料的方差及相互間的協(xié)方差； 2) 2) 計(jì)算出各項(xiàng)資料間的相關(guān)系數(shù)；計(jì)算出各項(xiàng)資料間的相關(guān)系數(shù)； 3) 3) 計(jì)算出以這些相關(guān)系數(shù)表示的各項(xiàng)資料對(duì)被計(jì)算出以這些相關(guān)系數(shù)表示的各項(xiàng)資料對(duì)被估計(jì)育種值的規(guī)范化偏回歸系數(shù)；估計(jì)育種

9、值的規(guī)范化偏回歸系數(shù)； 4) 4) 將這些規(guī)范化偏回歸系數(shù)轉(zhuǎn)化為偏回歸系數(shù)，將這些規(guī)范化偏回歸系數(shù)轉(zhuǎn)化為偏回歸系數(shù)，即得到各項(xiàng)資料的加權(quán)系數(shù)；即得到各項(xiàng)資料的加權(quán)系數(shù)； 5) 5) 計(jì)算合并指數(shù)與各項(xiàng)資料間的復(fù)相關(guān)系數(shù)，計(jì)算合并指數(shù)與各項(xiàng)資料間的復(fù)相關(guān)系數(shù)，并與其它育種值估計(jì)方法的復(fù)相關(guān)系數(shù)相比計(jì)并與其它育種值估計(jì)方法的復(fù)相關(guān)系數(shù)相比計(jì)算相對(duì)效率。算相對(duì)效率。 隨機(jī)交配群體中常用的親屬間親緣相關(guān)系數(shù) RASDSSSDDSDDFSHSFOHORHV個(gè)體I0.50.50.250.250.250.250.50.250.50.51父親S00.50.5000.50.50.250.250.5母親D000.

10、50.50.500.250.250.5祖父SS0000.250.250.1250.1250.25祖母SD000.250.250.1250.1250.25外祖父DS00.2500.1250.1250.25外祖母DD0.2500.1250.1250.25全同胞FS0.250.250.250.5父系半同胞HS0.1250.1250.25全同胞子女FO0.250.5半同胞子女HO0.5第二節(jié) 多性狀選擇的根本方法 1 1、順序選擇法、順序選擇法tandem selectiontandem selection/ /單項(xiàng)選單項(xiàng)選擇法擇法single trait selectionsingle trait

11、selection：對(duì)方案選：對(duì)方案選擇的多個(gè)性狀逐一選擇和改良，每個(gè)性狀選擇擇的多個(gè)性狀逐一選擇和改良，每個(gè)性狀選擇一個(gè)或數(shù)個(gè)世代，待這個(gè)性狀得到稱心的選擇一個(gè)或數(shù)個(gè)世代，待這個(gè)性狀得到稱心的選擇效果后，就停頓對(duì)這個(gè)性狀的選擇，再選擇第效果后，就停頓對(duì)這個(gè)性狀的選擇，再選擇第二個(gè)性狀，然后再選擇第三個(gè)性狀等等，順序二個(gè)性狀，然后再選擇第三個(gè)性狀等等，順序遞選。遞選。 2 2、獨(dú)立淘汰法、獨(dú)立淘汰法independent cullingindependent culling/ /獨(dú)立獨(dú)立程度法：將所要選擇的家畜消費(fèi)性狀各確定一程度法：將所要選擇的家畜消費(fèi)性狀各確定一個(gè)選擇界限，凡是要留種的家畜

12、個(gè)體，必需同個(gè)選擇界限，凡是要留種的家畜個(gè)體，必需同時(shí)超越各性狀的選擇規(guī)范。時(shí)超越各性狀的選擇規(guī)范。 3 3、綜合指數(shù)法、綜合指數(shù)法index selectionindex selection：利用對(duì)：利用對(duì)個(gè)體綜合育種值的估計(jì)值進(jìn)展選擇。個(gè)體綜合育種值的估計(jì)值進(jìn)展選擇。 制定選擇方案的步驟制定選擇方案的步驟 性狀各種表型參數(shù)和遺傳參數(shù)的估計(jì)；性狀經(jīng)濟(jì)加權(quán)值確實(shí)定；選擇強(qiáng)度估計(jì)；選擇指數(shù)制定和選擇效果估計(jì)；計(jì)算個(gè)體指數(shù)值，確定選擇決策。 第三節(jié)第三節(jié) 綜合選擇指數(shù)的運(yùn)用前提和局綜合選擇指數(shù)的運(yùn)用前提和局 限以及相對(duì)效率比較限以及相對(duì)效率比較 運(yùn)用選擇指數(shù)法需求滿足的條件運(yùn)用選擇指數(shù)法需求滿足的

13、條件 ： 1、 用于計(jì)算指數(shù)值的一切觀測(cè)值不存在系用于計(jì)算指數(shù)值的一切觀測(cè)值不存在系統(tǒng)環(huán)境效應(yīng)，或者在運(yùn)用前剔除了系統(tǒng)環(huán)境效統(tǒng)環(huán)境效應(yīng)，或者在運(yùn)用前剔除了系統(tǒng)環(huán)境效應(yīng)進(jìn)展校正；應(yīng)進(jìn)展校正； 2、 候選個(gè)體間不存在固定遺傳差別，換言候選個(gè)體間不存在固定遺傳差別，換言之，這些個(gè)體源于同一均數(shù)的群體；之，這些個(gè)體源于同一均數(shù)的群體； 3、所涉及到的各種群體參數(shù)，如誤差方差協(xié)、所涉及到的各種群體參數(shù)，如誤差方差協(xié)方差、育種值方差協(xié)方差等是知的。方差、育種值方差協(xié)方差等是知的。 制定選擇指數(shù)時(shí)應(yīng)留意的事項(xiàng)：制定選擇指數(shù)時(shí)應(yīng)留意的事項(xiàng)： 1突出育種目的性狀。突出育種目的性狀。 2用于遺傳評(píng)定的信息性狀應(yīng)該

14、是容易度量用于遺傳評(píng)定的信息性狀應(yīng)該是容易度量的性狀。的性狀。 3信息性狀盡能夠是家畜早期性狀。信息性狀盡能夠是家畜早期性狀。 4目的性狀中盡量防止有高的負(fù)遺傳相關(guān)性目的性狀中盡量防止有高的負(fù)遺傳相關(guān)性狀。狀。 小小 結(jié)結(jié) 在任何情況下，指數(shù)選擇法的效率不低于獨(dú)立在任何情況下，指數(shù)選擇法的效率不低于獨(dú)立淘汰法，獨(dú)立淘汰法的效率不低于順序選擇法；淘汰法，獨(dú)立淘汰法的效率不低于順序選擇法； 指數(shù)選擇法優(yōu)于其他方法的相對(duì)效率隨性狀添指數(shù)選擇法優(yōu)于其他方法的相對(duì)效率隨性狀添加而提高，但是隨各性狀的經(jīng)濟(jì)加權(quán)值差別添加加而提高，但是隨各性狀的經(jīng)濟(jì)加權(quán)值差別添加而下降，在經(jīng)濟(jì)加權(quán)值一樣時(shí)，其優(yōu)越性最大。而下降，在經(jīng)濟(jì)加權(quán)值一樣時(shí)，其優(yōu)越性最大。 獨(dú)立淘汰法優(yōu)于順序選擇法的相對(duì)效率隨性狀獨(dú)立淘汰法優(yōu)于順序選擇法的相對(duì)效率隨性狀數(shù)和選擇強(qiáng)度添加而提高，但是隨經(jīng)濟(jì)加權(quán)值差數(shù)和選擇強(qiáng)度添加而提高，但是隨經(jīng)濟(jì)加權(quán)值差別添加而下降；別添加而下降； 當(dāng)各性狀的經(jīng)濟(jì)加權(quán)值一樣時(shí)，指數(shù)選擇法優(yōu)當(dāng)各性狀的經(jīng)濟(jì)加權(quán)值一樣時(shí)，指數(shù)選擇法優(yōu)于其他方法的相對(duì)效率還受其表型相關(guān)的影響較于其他方法的相對(duì)效率還受其表型相關(guān)的影響較大，當(dāng)大，當(dāng)rPrP很低或?yàn)樨?fù)值時(shí)，其相對(duì)效率較高。很低或?yàn)樨?fù)值時(shí)，其相對(duì)效率較高。 思思 考考 題題1.什么是育種值，估計(jì)育種