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文檔簡介

1、實驗一、微生物學(xué)基礎(chǔ)實驗實驗1. 鞭毛染色法及活菌活動性暗視野顯微鏡觀察【目的要求】1了解細菌鞭毛染色的原理,掌握鞭毛染色的方法,并了解鞭毛的形態(tài)特征。2學(xué)習(xí)暗視野顯微鏡操作技術(shù)。 【實驗器材】 菌種:枯草芽孢桿菌12d牛肉膏蛋白胨瓊脂斜面培養(yǎng)物,銅綠假單細胞菌12d牛肉膏蛋白胨瓊脂斜面培養(yǎng)物。 溶液和試劑:硝酸銀染色液、香柏油、二甲苯、0.01美蘭水溶液。 儀器和其他用品:酒精燈,載玻片,蓋玻片,顯微鏡,雙層瓶(內(nèi)裝香柏油和二甲苯),擦鏡紙,接種環(huán),小試管,燒杯,試管架,鑷子等?!净驹怼?細菌的鞭毛極纖細,直徑一般為0.1-0.2um,只有用電子顯微鏡才能觀察到。但是,如采用特殊的染色法

2、,則在普通光學(xué)顯微鏡下也能看到它。 鞭毛染色的基本原理是:在染色前先用媒染劑處理,讓它沉積在鞭毛上,使鞭毛直徑加粗,然后再進行染色。常用的媒染劑由丹寧酸和氯化高鐵或鉀明礬等配制而成。 采用鞭毛染色法雖能觀察到鞭毛的形態(tài)、著生位置和數(shù)目,但此法既費時又麻煩。如果僅須了解某菌是否有鞭毛,可采用懸滴法或壓滴法直接在光學(xué)顯微鏡下檢查活細菌是否具有運動能力,以此來判斷細菌是否有鞭毛。此法較快速、簡便。壓滴法是將菌液滴在普通的載玻片上,然后蓋上蓋玻片,置于顯微鏡下觀察。暗視野顯微鏡又叫暗場顯微鏡,是一種通過觀察樣品受側(cè)向光照射時所產(chǎn)生的散射光來分辨樣品細節(jié)的特殊顯微鏡。暗視野顯微鏡和一般的明視野顯微鏡區(qū)別

3、在于二者的聚光器不同,暗視野顯微鏡裝有一個中央遮暗的聚光器,使光線不能通過聚光器,而只能從聚光器四周邊及未遮暗的部位斜射到載玻片的標本上。因光線是斜射的,不能進入物鏡,故觀察的視野是暗的,而聚光器斜射到菌體上的光線,因光散射作用而使菌體發(fā)出亮光,反射到物鏡內(nèi),這樣在顯微鏡中可見到暗視野中明亮的物像。暗視野顯微鏡主要用于檢查未染色標本的形態(tài)和運動能力。 【操作步驟】 1鞭毛染色(硝酸銀染色法) (1)載玻片制備:將載玻片用洗滌劑清洗干凈,置于95%乙醇中浸泡5min,使用時用鑷子取出在火焰上燒去乙醇及可能殘留的油跡。 (2)制片:在載玻片一端滴一滴清水,用接種環(huán)從斜面培養(yǎng)物種蘸一兩下,再在清水中

4、蘸一兩下,然后傾斜玻片,使液體緩慢流向載玻片另一端,用吸水紙洗去多余液體,自然干燥。 (3)染色:滴加硝酸銀染液A液覆蓋菌面35min后用蒸餾水充分洗去A液。用硝酸銀染液B液洗去殘留水分后,再滴加B液覆蓋菌面4050秒,其間可用微火加熱,當菌面出現(xiàn)明顯褐色時,立即用蒸餾水沖洗,自然干燥。2、運動觀察(1)使用研究用暗視野顯微鏡,或?qū)⑵胀ü鈱W(xué)顯微鏡上的聚光器取下,換上暗場聚光器。 (2)不論是使用干燥物鏡還是油浸物鏡,鏡檢時都應(yīng)在聚光器的上透鏡上加一大滴香柏油。 (3)將制作好的細菌懸滴標本片置于載物臺上,上升聚光器至頂部使油與載玻片接觸。 (4)放大光源 。 (4)進行聚光器光軸調(diào)節(jié)及調(diào)焦。用

5、10*物鏡找到被檢物像,關(guān)小聚光器虹彩光圈至可在視野中看到視場光闌的輪廓,再上下緩慢調(diào)整聚光器,這樣會使視場光闌的像變得清晰,如視場光闌不在場中央,利用聚光器外側(cè) 的兩個調(diào)節(jié)鈕進行調(diào)整,當亮光點調(diào)到場中央后,再將其開大,即可進行觀察。 實驗2. 熒光原位雜交技術(shù)【目的要求】 通過實驗了解熒光原位雜交技術(shù)的基本原理和在生物學(xué)、醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用。掌握原位雜交技術(shù)的操作方法,熟練掌握熒光顯微鏡的使用方法 【基本原理】 熒光原位雜交(Fluorescence in situ hybridization,F(xiàn)ISH)是一個很重要的生物學(xué)實驗技術(shù),它的特點是原位,無需經(jīng)過PCR,可以用于對環(huán)境樣品中特定的微生

6、物進行定量分析。下面是以活性污泥為例的FISH實驗步驟及方法。非生物學(xué)專業(yè)的同學(xué)請不要往下看了?!緦嶒炂鞑摹縔染色體探針、人外周血中期染色體細胞標本、恒溫水浴鍋、培養(yǎng)箱、染色缸、載玻片、Nikon E-400、熒光顯微鏡、蓋玻片、封口膜、200L移液器、20L移液器、暗盒、指甲油、甲酰胺、氯化鈉、檸檬酸鈉、氫氧化鈉、吐溫20。 【操作步驟】 1 載玻片涂層處理(1) 將載玻片置于鹽酸乙醇溶液(1%HCl in 70% Ethanol)中清洗(2) 晾干后放入poly-L-lysine(0.01%)溶液中5分鐘(3) 放入60烘箱60分鐘烘干或者放在室溫過夜晾干2樣品固定(Sample fixa

7、tion)(1) 在樣品(活性污泥)中加入3倍體積的4% 多聚甲醛,置于4冰箱固定3小時以上或者過夜(2) 離心,棄去多聚甲醛,加入相同體積的PBS(3) 離心,棄去PBS,加入相同體積的乙醇+PBS(w/w 1:1)(4) 固定后的樣品放入-20冰箱保存。3 脫水 (Dehydration)(1) 將適量固定后的樣品放在載玻片上,(2) 放入46烘箱烘干10分鐘(3) 依次浸入50%,80%,96%的乙醇溶液,各3分鐘(4) 在空氣中晾干4 雜交(1) 加10微升Hybridization buffer(配制方法見下面表格)到玻璃片的樣品上,盡量讓樣品全被覆蓋(2) 在Hybridizati

8、on buffer上加1微升探針(Probe)(3) 在50ml離心管中放一張潤濕的吸水紙,將玻璃片放入,然后一起放到46恒溫箱,雜交1.5小時(4) 將Washing buffer(配制方法見下面表格)預(yù)熱到48,準備下一步使用5沖洗(1) 雜交1.5小時之后,快速將玻璃片放入48Washing buffer(2) 在48恒溫箱中放置30min(3) 用超純水潤洗玻璃片,然后再空氣中晾干6鏡檢晾干后,將樣品用適量的antifading reagent 覆蓋,蓋上蓋玻片,然后就可以放到共聚焦顯微鏡(Confocal laser scanning microscopy)下觀察了。Hybridiz

9、ation buffer配制方法: Washing buffer配制方法:實驗3. 細菌化學(xué)趨向性測定【目的要求】 通過研究細菌運動方式,了解細菌的趨向性. 通過研究細菌的趨向性,了解細菌的生 活方式,有利于微生物的培養(yǎng)。 【實驗器材】 實驗儀器:基顯微鏡、培養(yǎng)皿、載玻片、鑷子、濾紙等。 試劑:瓊脂培養(yǎng)基、,細菌、NACL試劑等。 【基本原理】 某些細菌在一定的生長因子下快速生長繁殖;某些細菌在一定的特殊環(huán)境下,例如:光 照、一定的PH、一定的溫度下有利于生長.本實驗通過對照試驗對三種細菌進行在特殊因子下進行培養(yǎng),觀察細菌的運動趨勢,并作出明確判斷,細菌的化學(xué)趨向性。 【操作步驟】 1、取18

10、一24小時待檢菌培養(yǎng)物,用0.9%NaCL配成濁度達20麥氏單位的濃懸液。 2、將瓊脂溶化于0.9%的NACL溶液中,制成0.6%的瓊脂基。 3、將此半固休瓊脂溶化,冷卻,待冷至40一50時,在3ml瓊脂基中加入3 ml待檢菌懸液,混勻,注入小培養(yǎng)皿中。 4、冷凝后在驚脂表面滴一滴5不同濃度的化學(xué)趨向性試驗物質(zhì),并在另一部位滴加等量0.9%NaCI作為對照。 5、37孵育1小時,檢查滴加試驗物質(zhì)部分濁度變化。濁度增加為陽性趨化性,局部透亮為陰性趨化性。再用配有測微器的顯微鏡測是濁度變化區(qū)的直徑。 6、也可用直徑1mm的濾紙片,用試驗物溶液潤濕,并貼敷于驚脂基表面,觀察結(jié)果(標準同上)此類紙片于

11、37干燥后,在4可長期保存。 以類鼻疽桿菌,綠膿桿菌,霍亂弧菌各一株作為試驗菌。結(jié)果類鼻疽桿菌和綠膿桿菌對。.IML一精氨酸,。.IM DL一顆氨酸,0.IML一異亮氨酸等都有陽性趨化作用。類奧疽桿菌對。.IML一半朧氨酸有陽性趨化作用。 7、實驗結(jié)果及預(yù)測 通過實驗對照可以證明細菌的趨向性。實驗二、分子生物學(xué)技術(shù)在微生物學(xué)中的應(yīng)用實驗1. 土壤微生物總DNA提取【目的要求】 學(xué)習(xí)從土壤微生物中提取總DNA并純化的方法?!緦嶒炂鞑摹?TENP緩沖液(50 mmol/L Tris, 20 mmol/L EDTA, 100 mmol/L NaCl, 1% PVP, pH 10.0)、PBS緩沖液(

12、137 mmol/L NaCl, 2.7 mmol/L KCl, 10 mmol/L Na2HPO4, 2 mmol/L KH2PO4, pH 7.4)、DNA提取緩沖液(100 mmol/L Tris, 100 mmol/L EDTA, 100 mmol/L Na3PO4, 1.5 M NaCl, 1%CTAB, pH 8.0)、蛋白酶K(25 mg/mL)、溶菌酶(50 mg/mL, pH 8. 0)、20% SDS、氯仿、異戊醇、異丙醇、70%乙醇、RNAse 20 mg/mL、QIAX大片段凝膠回收試劑盒(Qiagen)50mL、1.5 mL離心管、搖床、高速離心機、水浴鍋、電泳槽、電

13、泳儀、渦旋儀、土壤樣品【操作步驟】 1. 總DNA提?。?1) 取2 g土樣,置于50mL滅菌的離心管中;(2) 加入10 mL TENP緩沖液(50 mmol/L Tris, 20 mmol/L EDTA, 100 mmol/L NaCl, 1% PVP, pH 10.0)懸浮土樣,200轉(zhuǎn)搖床振蕩10min充分混勻;(3) 10 000 r/min離心5 min,棄上清,重復(fù)洗滌多次至上清基本為無色;(4) 用5 mL PBS緩沖液(137 mmol/L NaCl, 2.7 mmol/L KCl, 10 mmol/L Na2HPO4, 2 mmol/L KH2PO4, pH 7.4)漂洗一

14、次;(5) 沉淀加入13.5 mL DNA提取緩沖液(100 mmol/L Tris, 100 mmol/L EDTA, 100 mmol/L Na3PO4, 1.5 M NaCl, 1%CTAB, pH 8.0),混勻后加入100 L蛋白酶K(25 mg/mL)和200 L溶菌酶(50 mg/mL, pH 8. 0),37水浴30 min,每隔10 min顛倒混勻;(6) 加入2 mL 20% SDS,65水浴2 h,每隔20 min顛倒混勻;(7) 8 000 r/min室溫離心15 min,取上清,用等體積氯仿:異戊醇(24:1)抽提一次;(8) 水相中加入0.6倍體積的異丙醇,4沉淀過

15、夜;(9) 11 000 r/min 4離心20 min收集DNA沉淀;(10) 70%乙醇漂洗兩次,干燥后用100 L ddH2O(含RNAse 20 mg/mL)溶解,轉(zhuǎn)入1.5 mL離心管。2. 總DNA純化:(1) 配制0.8%瓊脂糖凝膠;(2) 每個上樣孔加入50 L粗DNA,進行低電壓長時間電泳(4, 25 V, 8 h);(3) 電泳結(jié)束后,切下主帶所在的凝膠(膠的體積盡可能小);QIAX大片段凝膠回收試劑盒(Qiagen)回收:加入3倍體積的Buffer QX及適量的QIAX(Glassmilk),55溫浴10 min,每隔2 min輕輕用手指彈起沉淀(回收大片段時不要渦旋),

16、待凝膠完全溶解,12 000 g離心1 min,棄上清;再加入500 L Buffer QX洗滌沉淀1次以消除剩余凝膠;再用500 L Buffer PE洗滌沉淀2次,將沉淀晾干,加入適當體積的ddH2O,離心后收集上清,瓊脂糖凝膠電泳確定回收效率。實驗2. 菌落PCR【目的要求】學(xué)習(xí)菌落pcr方法,比較菌落PCR和常規(guī)PCR差別。 【基本原理】 菌落PCR可不必提取基因組DNA,不必酶切鑒定,而是直接以菌體熱解后暴露的DNA為模板進行PCR擴增,省時少力。建議使用載體上的通用引物。通常利用此方法進行重組體的篩選或者DNA測序分析。最后的PCR產(chǎn)物大小是載體通用引物之間的插入片斷大小。菌落PC

17、R與我們通常的普通DNA的PCR的不同在于,直接以單個菌作為模板。是一種可以快速鑒定菌落是否為含目的質(zhì)粒的陽性菌落。操作簡單,快捷,陽性率較高,在轉(zhuǎn)化鑒定中較常見。【操作步驟】 1、PCR混合液的制備Taq buffer(10×) 180uldNTP(2.5 mM) 2025 ulPrimer Forward(引物濃度在10Pmol) 5 ulPrimer Reverse(引物濃度在10Pmol) 5 ulddH2O 147 ulTaq(2U/ul) 1215 ul2、常溫下隨機挑選轉(zhuǎn)化板上的轉(zhuǎn)化子,用滅菌的牙簽或槍頭挑取單個菌落(強調(diào)單個,不能是雙克?。?,在LB瓊脂糖平板上輕點,做

18、一拷貝;然后將沾有菌體的牙簽或槍頭置于相應(yīng)的裝有PCR管中或者96空pcr反應(yīng)板(管子做好記號,如平板上點的是1#,則管子上也標1#,以便篩選到克隆后的擴到培養(yǎng)),挑好單克隆菌落后將之前配制好的PCR混合液加入體系是30ul。3、將混有菌體的PCR混合物置于PCR儀中,按常規(guī)條件擴增。4、將擴增出來的反應(yīng)液中加入溴酚藍或是其他染料,電泳檢測是否得到目的片斷。如有則為陽性克隆。5、將已經(jīng)接種有菌落的平板置37培養(yǎng)箱培養(yǎng)過夜,使菌落擴增;次日挑選陽性克隆做進一步篩選或培養(yǎng)。步驟2也可以不點板,直接接種搖菌,如果早上做PCR的話,下午就可以提質(zhì)粒,得到重組載體。注意事項:設(shè)計引物很關(guān)鍵。一般如果是定

19、向克隆,用載體上的通用引物即可;如pET系列可用T7通用引物。如果是非定向克?。ㄈ鐔蚊盖谢蚱侥┒诉B接),一條引物用載體,一條引物用目的基因上的,這樣就可以比較方便的鑒定了,而且錯誤概率很低。PCR條件的選擇接近最佳,同時挑取的菌體不宜太多,否則會有非特異性擴增。使用的引物濃度不能太高,濃度過高會導(dǎo)致非特異性擴增,反應(yīng)的循環(huán)數(shù)也不能太多,一般不超過25個。同時因為擴增的片段的GC含量問題,有的GC含量很低,有的又很高,導(dǎo)致菌落PCR不容易擴增出目的條帶,在此建議在設(shè)置PCR程序時以高GC的溫度為上限,每一循環(huán)降0.2度左右。實驗3. 16S rDNA序列分析鑒定【目的要求】1. 了解PCR 反應(yīng)

20、的基本原理和應(yīng)用2. 學(xué)習(xí)PCR的基本實驗方法【實驗器材】 【操作步驟】 1. 模板DNA的提取1)挑取單菌落接種至50 mL MRS液體培養(yǎng)基中,28、180 r/min搖床培養(yǎng)24 h; 2)取1.5 mL培養(yǎng)物離心,12000 r/min、1 min收集菌體,加入STE緩沖液,用吸管反復(fù)吹打使之重懸,再次離心,菌體重懸于1 mL STE溶液中; 3)加入100 mg/mL溶菌酶溶液1 L(終濃度為100 g/mL),37保溫1 h2 h; 4)加入1/10體積10% SDS溶液,混合均勻,靜置片刻,6065水浴,不超過10 min; 5)加入1/10體積5 mol/L NaCl,至終濃度

21、為1 mol/L,充分混勻; 6)加入等體積的Tris平衡酚,混勻,12000 r/min離心5 min,取上清于另一潔凈離心管中,重復(fù)操作一次; 7)上清液中加入等體積的氯仿,混勻,離心12000 r/min、5 min,取上清于另一個潔凈的離心管中; 8)加入2倍體積的無水乙醇沉淀,-20靜置30 min以上,離心,12000 r/min、 5 min; 9)70%乙醇洗滌2次,室溫晾干; 10)冷凍抽干,于-20保存?zhèn)溆谩?2. 16S rDNA的PCR擴增以提取的各菌株的DNA為模板,采用通用引物P0(5-GAGTTTGATCMTGGCTCAG -3)和PC3(5-CTAHAGGGTA

22、TCTAATCCT-3),擴增各菌株的16S rDNA序列,PCR 反應(yīng)體系見表9.1。表7-1 PCR反應(yīng)體系的配制 反應(yīng)物 加入體積(L) 終濃度 10×Buffer(含MgCl2) 2.5 1× dNTP(10 mmol/L) 2.5 1 mol/L P0 (100 mmol/L) 0.75 3 mol/L PC3(100 mmol/L) 0.75 3 mol/L 模板DNA 1.0 1 g Taq酶 0.25 ddH2O 補加到總體積25 L PCR程序為:94預(yù)變性3 min,94變性1 min,45復(fù)性1 min,72延伸1 min,循環(huán)30次,72延伸8 mi

23、n,4保溫3 min。PCR擴增結(jié)果,用1%瓊脂糖凝膠電泳檢測。3. PCR產(chǎn)物的純化及序列分析PCR產(chǎn)物按Omega Bio-Tek公司試劑盒操作方法純化后,寄給北京奧科生物技術(shù)有限公司或上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司完成測序,測序引物為P0、PC3。將序列結(jié)果提交到GenBank 數(shù)據(jù)庫(http://BLAST) 中搜索比對。實驗4. 酶切與連接技術(shù) 【目的要求】 1、 將成功擴增出所需基因片段的PCR產(chǎn)物純化回收,除去DNA以外的雜質(zhì),如蛋白(酶)、 RNA等,得到高質(zhì)量的DNA用于后續(xù)實驗。 2、 將純化好的DNA和表達型載體分別酶切后連接,

24、用于后續(xù)轉(zhuǎn)化感受態(tài)細胞。 【實驗器材】 選擇克隆載體多克隆位點上相應(yīng)的限制性內(nèi)切酶,識別特定位點并切割DNA產(chǎn)生粘性末端或平端的外源片段,經(jīng)DNA的純化處理后在連接酶的作用下將外源片段連接到載體上,實現(xiàn)外源片段的克隆。 粘性末端連接,DNA片段兩端的互補堿基順序稱之為粘性末端,用同一種限制性內(nèi)切酶消化DNA可產(chǎn)生相同的粘性末端。在連接酶的作用下可恢復(fù)原樣,有些限制性內(nèi)切酶雖然識別不同順序,卻能產(chǎn)生相同末端。平頭末端連接,用物理方法制備的DNA往往是平頭末端,有些酶也可產(chǎn)生平頭末端。平頭DNA片段可在某些DNA連接酶作用下連接起來,但連接效率不如粘性末端高。 【基本原理】 【操作步驟】 1、PC

25、R產(chǎn)物回收 (1)于PCR產(chǎn)物中加入其兩倍體積的Binding Buffer,即80ul。然后轉(zhuǎn)入2ml的收集管中(帶柱子),13000r,1min,離心,棄去收集管中濾液。 (2)加Binding Buffer 300ul,13000r,1min,離心,棄去收集管中濾液,此時DNA掛于柱子上。 (3)加Wash Solution 700ul,13000r,1min,離心,棄去收集管中濾液。 (4)重復(fù)步驟(3),此時已把DNA以外的雜質(zhì)洗脫完畢。 (5)將柱子裝入1.5ml的EP管中,加50ul,60的水洗脫DNA,13000r,1min,離心。 2、將回收所得產(chǎn)物酶切 (1)上游引物:Nc

26、ol 下游引物:Xhol 適應(yīng)溫度:37Buffer4 50ul體系: Ncol:0.5ul Xhol:0.5ul 10xBuffer4:5ul DNA片段:44ul 放入37水浴鍋酶切2.5小時。 (2)所得酶切產(chǎn)物按上述純化方法再次純化回收。 3、將DNA片段與載體連接 (1)20ul體系: 10xBuffer:2ul T4連接酶:2ul 載體:2ul DNA片段:14ul放入37溫箱過夜。 (2)回收所得連接產(chǎn)物。實驗5. 瓊脂糖凝膠電泳技術(shù) 【目的要求】 通過本實驗學(xué)習(xí)瓊脂糖凝膠電泳檢測DNA的方法和技術(shù)【基本原理】 瓊脂糖凝膠電泳是分離鑒定和純化DNA片段的常用方法。DNA分子在瓊脂

27、糖凝膠中泳動時有電荷效應(yīng)和分子篩效應(yīng),DNA分子在高于等電點的pH溶液中帶負電荷,在電場中向正極移動。由于糖磷酸骨架在結(jié)構(gòu)上的重復(fù)性質(zhì),相同數(shù)量的雙鏈DNA幾乎具有等量的凈電荷,因此它們能以同樣的速度向正極方向移動。不同濃度瓊脂糖凝膠可以分離從200bp至50kb的DNA片段。在瓊脂糖溶液中加入低濃度的溴化乙錠(ethidum bromide ,EB),在紫外光下可以檢出 10ng的DNA條帶,在電場中,pH8.0條件下,凝膠中帶負電荷的DNA向陽極遷移。瓊脂糖凝膠有如下特點:(1) DNA的分子大小 在凝膠基質(zhì)中其遷移速率與堿基對數(shù)目的常用對數(shù)值成反比,分子越大遷移得越慢。 (2) 瓊脂糖濃

28、度 一個特定大小的線形DNA分子,其遷移速度在不同濃度的瓊脂糖凝膠中各不相同。DNA電泳遷移率(u)的對數(shù)與凝膠濃度(t)成線性關(guān)系。 (3) 電壓 低電壓時,線狀DNA片段遷移速率與所加電壓成正比。但是隨著電場強度的增加,不同分子量DNA片段的遷移率將以不同的幅度增長,隨著電壓的增加,瓊脂糖凝膠的有效分離范圍將縮小。要使大于2kb的DNA片段的分辨率達到最大,所加電壓不得超過5v/cm。 (4) 電泳溫度 DNA在瓊脂糖凝膠電泳中的電泳行為受電泳時的溫度影響不明顯,不同大小的DNA片段其相對遷移速率在4與30之間不發(fā)生明顯改變,但濃度低于0.5%的凝膠或低熔點凝膠較為脆弱,最好在4條件下電泳

29、。 (5) 嵌入染料 熒光染料溴化乙錠用于檢測瓊脂糖凝膠中的DNA,染料嵌入到堆積的堿基對間并拉長線狀和帶缺口的環(huán)狀DNA,使其剛性更強,還會使線狀遷移率降低15%。 (6) 離子強度 電泳緩沖液的組成及其離子強度影響DNA電泳遷移率。在沒有離子存在時(如誤用蒸餾水配制凝膠,電導(dǎo)率最小,DNA幾乎不移動,在高離子強度的緩沖液中(如誤加10×電泳緩沖液),則電導(dǎo)很高并明顯產(chǎn)熱,嚴重時會引起凝膠熔化。對于天然的雙鏈,常用的幾種電泳緩沖液有TAE、TBE等,一般配制成濃縮母液,室溫保存,用時稀釋?!緦嶒炂鞑摹?1. 恒溫培養(yǎng)箱 2. 瓊脂糖凝膠電泳系統(tǒng) 3. 高壓滅菌鍋 4. 紫外線透射儀

30、 1.三羥甲基氨基甲烷(Tris) 2.硼酸 3.乙二胺四乙酸(EDTA)4.溴酚藍 5.蔗糖 6.瓊脂糖 7.溴化乙錠 8.DNA marker 9.DNA樣品【操作步驟】 1.緩沖液的配制 5×TBE(5倍體積的TBE貯存液) 配1000ml 5×TBE:Tris 54g硼酸 27.5g0.5mol/l EDTA20mlPh8.0 凝膠加樣緩沖液(6×)溴酚藍 0.25%蔗糖 40%溴化乙錠溶液(EB) 0.5g/ml2.制備瓊脂糖凝膠 按照被分離DNA的大小,決定凝膠中瓊脂糖的百分含量??蓞⒄障卤恚?瓊脂糖凝膠濃度線性DNA的有效分離范圍0.3%5-60 kb0.6%1-20 kb0.7%0.8-10 kb0.9%0.5-7kb1.2%0.4-6kb1.5%0.2-4kb2.0%0.1-3kb3.膠板的制備(1) 用高壓滅菌指示紙帶將洗靜、干燥的玻璃板的邊緣(或電泳裝置所皿備的塑料盤的開口)封住,形成一個膠膜(將膠膜放在工作臺的水平位置上,用水平儀校正)。(2) 配制足夠用于灌滿電泳

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