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1、無創(chuàng)產(chǎn)前篩查(NIPT)全球市場(chǎng)格局作者:生物360 來源:生物360 2014-5-27 16:49:06 隨著高通量測(cè)序市場(chǎng)持續(xù)火爆,其重要應(yīng)用無創(chuàng)產(chǎn)前篩查越來越受到市場(chǎng)的追捧。我國(guó)監(jiān)管部門也采用積極的舉措來規(guī)范整個(gè)市場(chǎng),今年2月份中國(guó)食品藥品監(jiān)督管理總局、國(guó)家衛(wèi)生計(jì)生委聯(lián)合發(fā)布關(guān)于加強(qiáng)臨床使用基因測(cè)序相關(guān)產(chǎn)品和技術(shù)管理的通知叫?;驕y(cè)序臨床應(yīng)用。然而,僅僅一個(gè)月后,國(guó)家衛(wèi)生計(jì)生委又發(fā)布了關(guān)于開展高通量基因測(cè)序技術(shù)臨床應(yīng)用試點(diǎn)單位申報(bào)工作的通知,希望通過試點(diǎn)的形式來規(guī)范和探索無創(chuàng)產(chǎn)前篩查在臨床上的應(yīng)用。回顧NIPT市場(chǎng)的歷史,我國(guó)NIPT市場(chǎng)經(jīng)歷了從民間火爆到政府叫停,再到試點(diǎn)規(guī)范的歷程,
2、展現(xiàn)出其越來越合理合法的發(fā)展軌跡。我國(guó)NIPT市場(chǎng)持續(xù)升溫,讓人不禁想問國(guó)外該領(lǐng)域的應(yīng)用及發(fā)展如何?下面我們將詳細(xì)介紹國(guó)外NIPT市場(chǎng)的一些情況。美國(guó)及歐洲NIPT市場(chǎng)情況在美國(guó),NIPT市場(chǎng)主要為4家公司所覆蓋,分別為Sequenom, Verinata Health (2013年被Illumina收購(gòu)), Ariosa Diagnostics 和Natera 其相應(yīng)NIPT產(chǎn)品登陸市場(chǎng)時(shí)間也集中在2011年底到2012年底1,在此期間NIPT商業(yè)化模式正式拉開帷幕。從檢測(cè)的技術(shù)來看,提供NIPT服務(wù)的公司主要分為兩類, 1)采用高通量全基因測(cè)序的方法對(duì)樣本進(jìn)行檢測(cè)的Sequenom和Ver
3、inata,2)采用靶向區(qū)域測(cè)序的方法對(duì)染色體多倍性進(jìn)行分析的Ariosa和Natera。由于進(jìn)行染色體多倍性分析 所選擇的區(qū)段大小不同,所需要的測(cè)序數(shù)據(jù)量也不盡相同。采用高通量全基因組測(cè)序方法的Sequenom和 Verinata公司所提供的檢測(cè)產(chǎn)品,需要的測(cè)序數(shù)據(jù)量相對(duì)較大,每個(gè)檢測(cè)樣本需要獲得的Reads數(shù)需要達(dá)到1300萬條以上 2,3。Christina Fan 在其研究中描述到“采用高通量全基因組測(cè)序進(jìn)行NIPT檢測(cè),檢測(cè)的靈敏度和準(zhǔn)確性直接和數(shù)據(jù)量相關(guān),推薦使用reads數(shù)大于10M的數(shù)據(jù)進(jìn)行檢測(cè)分析”4。而通過靶向區(qū)域信息獲得的染色體倍性信息的Ariosa及Natera公司,則
4、需要相對(duì)較少測(cè)序通量,其需要測(cè)序序列分別為1.1M及6.5M5,6。在測(cè)序平臺(tái)的選擇上,這些公司都選擇了通量高、測(cè)序成本低的HiSeq2000(Illumina)測(cè)序平臺(tái)2,7,8,9。不管采用何種技術(shù)路線,4家公司都已驗(yàn)證其檢驗(yàn)結(jié)果的可信性,并在相應(yīng)的學(xué)術(shù)雜志上報(bào)道了從幾百例到幾千例不等的高可信度的檢驗(yàn)結(jié)果(表1)2,3,7,8,10,11。檢測(cè)周期上,除Natera公司需要15天外,其他3家公司均需要8-10天完成檢測(cè)1。從監(jiān)管層面上來看,四家公司都獲得了CAP(美國(guó)病理學(xué)家學(xué)會(huì))和CLIA(臨床實(shí)驗(yàn)室改進(jìn)修正案) 的認(rèn)證,并且Sequenom和Verinata計(jì)劃提交IVD(體外診斷產(chǎn)品
5、),PMA(上市前批準(zhǔn)管理)的申請(qǐng)1。另外,illumina在獲得了MiSeqDx的FDA認(rèn)證后,計(jì)劃在今年年底向FDA提交HiSeq 2500 NIPT 檢測(cè)試劑盒的申請(qǐng)12,如果獲得審批將對(duì)整個(gè)行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)的建立和完善意義重大。在費(fèi)用支付上,美國(guó)的NIPT檢測(cè)公司大都采用兩種方式,個(gè)人自費(fèi)或個(gè)人及保險(xiǎn)共擔(dān)的形式。個(gè)人自費(fèi)所需要支付的費(fèi)用從295美金到1700美金不等。美國(guó)NIPT服務(wù)公司積極尋求與保險(xiǎn)公司合作1,Genomeweb 今年2月19日曽報(bào)道:Verinata在美國(guó)已拿到1.3億人次的保險(xiǎn)合同,而Sequenom也已拿到1.13億人次的保險(xiǎn)合同13。在歐洲,NIPT市場(chǎng)主要為一家公司
6、所占有,LifeCodexx14。該公司是唯一一家獲得歐洲NIPT IVDD(體外診斷指令)認(rèn)證的公司。公司與Sequenom合作,技術(shù)路線采納了Sequenom的高通量全基因組測(cè)序的方法,單個(gè)樣本的檢測(cè)數(shù)據(jù)量達(dá)到10-30M15,檢測(cè)費(fèi)用需要985歐元。注:CLIA, 臨床實(shí)驗(yàn)室改進(jìn)修正案; CAP, 美國(guó)病理學(xué)家學(xué)會(huì);IVD, 體外診斷產(chǎn)品; IVDD,體外診斷指令(歐洲) ;PMA, 上市前批準(zhǔn)管理; SNP, 單核苷酸多態(tài)性.我國(guó)NIPT市場(chǎng)狀況我國(guó)NIPT市場(chǎng)主要為兩家公司所壟斷,分別為華大基因(BGI)和貝瑞和康。檢測(cè)產(chǎn)品從2012年底陸續(xù)開始上市,其所采用的檢測(cè)技術(shù)路線為高通量全
7、基因組測(cè)序的方法, 相應(yīng)的文獻(xiàn)也對(duì)其技術(shù)路線進(jìn)行詳細(xì)報(bào)道。其中BGI對(duì)11263個(gè)樣本進(jìn)行檢測(cè),使用GAIIx和HiSeq2000完成檢測(cè)18,檢測(cè)過程中,HiSeq2000 一個(gè)Lane檢測(cè)12個(gè)樣本,單個(gè)樣本的數(shù)據(jù)量約為15M的reads。 貝瑞和康進(jìn)行兩期臨床實(shí)驗(yàn),第一期完成435個(gè)樣本的檢測(cè)19,第二期完成了1916個(gè)樣本的檢測(cè)20。其技術(shù)路線及測(cè)序數(shù)據(jù)量 與BGI類似,也采用高通量全基因組測(cè)序的方法,使用HiSeq2000平臺(tái)一個(gè)Lane完成12對(duì)樣本的檢測(cè)。今年年初,達(dá)安基因旗下的愛建生物采用Themo Fisher的Proton測(cè)序平臺(tái)完成前期樣本的測(cè)試,在其相應(yīng)的研究論文中提到
8、,已完成2275個(gè)樣本的檢測(cè)21,每個(gè)樣本的需要的數(shù)據(jù)量約為5.6M reads。關(guān)于檢測(cè)價(jià)格,國(guó)內(nèi)NIPT的樣本檢測(cè)終端價(jià)格為280-560美金22,不同公司及不同的區(qū)域也會(huì)略有不同。就監(jiān)管狀況來看,我國(guó)NIPT市場(chǎng)正處于市場(chǎng)規(guī)范化程度不斷提升的過程中,隨著正在申請(qǐng)的試點(diǎn)逐步開放,我國(guó)NIPT行業(yè)將迎來爆發(fā)性的增長(zhǎng)。也有媒體指出BGI正在使用Complete genomes和Ion Proton 平臺(tái)進(jìn)行國(guó)內(nèi)SFDA的申請(qǐng),希望通過收購(gòu)國(guó)外公司和貼牌的形式得到審批。另外兩家公司貝瑞和康及愛建生物則分別尋求與Illumina和Themo Fisher合作,來獲取監(jiān)管部門的審批23。*根據(jù)其正式
9、發(fā)表無創(chuàng)產(chǎn)前診斷論文時(shí)間及論文中所使用測(cè)序平臺(tái)我國(guó)NIPT企業(yè)與國(guó)外企業(yè)的差異與國(guó)外NIPT市場(chǎng)相同, 國(guó)內(nèi)企業(yè)幾乎都采用高通量全基因組測(cè)序的方法開展NIPT服務(wù), 檢測(cè)平臺(tái)選擇上主要以Illumina 測(cè)序平臺(tái)為主,Illumina基本處于市場(chǎng)壟斷的地位;但也有本土企業(yè)大膽嘗試不同的技術(shù)路線,如果愛建生物選擇Themo Fisher(前LIFE Technologies)的Ion Proton平臺(tái)開發(fā)其檢測(cè)產(chǎn)品,但由于儀器通量所限,目前只能采用大幅減少reads數(shù)的方法進(jìn)行檢測(cè),但由于其起步較晚,積累的臨床數(shù)據(jù)有限,在可靠性和成本上還有待市場(chǎng)的檢驗(yàn)。若該reads數(shù)的方法可行,由于illum
10、ina擁有通量以及通量所帶來的成本上的巨大優(yōu)勢(shì),那么NIPT的檢測(cè)成本還可能進(jìn)一步的降低,這無疑對(duì)受檢孕婦,對(duì)產(chǎn)業(yè)的發(fā)展更為有利。從產(chǎn)品上市時(shí)間來看,NIPT企業(yè)推出產(chǎn)品雖然較美國(guó)企業(yè)晚一年,但發(fā)展速度快,并且新的企業(yè)不斷涌現(xiàn),這也導(dǎo)致NIPT市場(chǎng)缺乏明確的行業(yè)標(biāo)準(zhǔn),如不同企業(yè)市場(chǎng)定價(jià)差別大,對(duì)企業(yè)無明確的準(zhǔn)入門檻,對(duì)該類企業(yè)監(jiān)管力度小等,這些問題都直接導(dǎo)致衛(wèi)計(jì)委對(duì)基因臨床服務(wù)檢測(cè)的叫停。后期,隨著試點(diǎn)的開放,行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)的不斷完善,以及新的法律、法規(guī)對(duì)NIPT行業(yè)的約束和管理,都將有助于整個(gè)NIPT行業(yè)在我國(guó)健康、穩(wěn)定、持續(xù)的發(fā)展。(生物谷B)參考文獻(xiàn):1 Agarwal A, Sayres L
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