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文檔簡(jiǎn)介

1、2010年赴中國(guó)科學(xué)院廣州生物醫(yī)藥與健康研究院暑期科研實(shí)踐報(bào)告XXX(XXX大學(xué)XXX學(xué)院 XXX班)引子很久前就想借學(xué)院舉辦的暑期科研實(shí)踐活動(dòng)走出校園,零距離去接觸真正的科研,看看科研的世界到底是怎么樣的。出于對(duì)醫(yī)學(xué)和生物學(xué)的熱愛(ài),我在列表中選擇了廣州生物醫(yī)藥與健康研究院。并開(kāi)始做聯(lián)系的準(zhǔn)備。一開(kāi)始了解到研究院不招收低年級(jí)本科實(shí)習(xí)生,我很失望和迷茫。但身為這個(gè)實(shí)習(xí)小組的組長(zhǎng),除了自己特別想去,還肩負(fù)著十余名同學(xué)的實(shí)習(xí)機(jī)會(huì)。我不放棄,通過(guò)郵件電話等方式,在研究院院長(zhǎng)和科教處老師的幫助下,終于獲得了這個(gè)機(jī)會(huì)。通過(guò)有限的資源了解了研究院后,我選擇了XX教授的實(shí)驗(yàn)組,主要研究干細(xì)胞與再生醫(yī)學(xué),而IP

2、S正是其中一項(xiàng)。并且了解到國(guó)內(nèi)iPS的研究在國(guó)際上不落人后,某些領(lǐng)域還處于領(lǐng)先地位,來(lái)自中科院廣州生物醫(yī)藥與健康研究院的裴端卿教授就是其中突出的耕耘者之一。第一次接觸可誘導(dǎo)的多能干細(xì)胞(IPS)是在XX老師的細(xì)胞生物學(xué)這門(mén)課上,課間五分鐘小演講中一位同學(xué)提到的。IPS是通過(guò)在分化的體細(xì)胞中表達(dá)特定的轉(zhuǎn)錄因子以誘導(dǎo)體細(xì)胞的重編程而獲得的可不斷自我更新且具有多向分化潛能的細(xì)胞。干細(xì)胞的培養(yǎng)與運(yùn)用在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域有著舉足輕重的作用,近年來(lái)iPS的發(fā)現(xiàn)與發(fā)展更是為人類(lèi)疾病的治療,也為胚胎干細(xì)胞應(yīng)用上的倫理道德問(wèn)題找到了一個(gè)出路。我對(duì)這個(gè)領(lǐng)域的研究很有興趣,想深入學(xué)習(xí)相關(guān)內(nèi)容,于是抓住了這個(gè)機(jī)會(huì)。初來(lái)乍到就這

3、樣,懷著興奮和好奇,7月21日,我跨進(jìn)了研究院的大門(mén)。第一印象:非常安靜和整潔,一切都那么井然有序,又仿佛能感覺(jué)到大腦急轉(zhuǎn)的步伐和思想碰撞的聲音。我知道,在這份安靜底下,其實(shí)很多人在緊鑼密鼓地忙碌著。辦完報(bào)到手續(xù)之后,在實(shí)驗(yàn)室小組長(zhǎng)陳捷凱師兄的帶領(lǐng)下,我來(lái)到了“體細(xì)胞重編程研究組”。邊聽(tīng)著師兄的介紹,我打量著這塊地盤(pán)。寬敞的分子實(shí)驗(yàn)平臺(tái)和看起來(lái)“機(jī)關(guān)重重”的細(xì)胞間,就在實(shí)驗(yàn)室對(duì)面的研究員辦公室,以及位于樓層另一邊的電子閱覽室,我那為期24天的暑期科研實(shí)踐就將在這三點(diǎn)一面鋪展開(kāi)來(lái)。到這工作不久的XX師兄很熱情地接待我們,在這個(gè)人生地不熟的地方,頓時(shí)感覺(jué)很親切。師兄簡(jiǎn)單地跟我們交流了生物學(xué)的一些話

4、題,介紹了IPS的概況,又教我們查閱文獻(xiàn)的方法和幾個(gè)很實(shí)用的網(wǎng)站,我如獲珍寶。實(shí)踐證明,這些基本的學(xué)習(xí)手段和知識(shí)在日后的實(shí)習(xí)過(guò)程中發(fā)揮了很大的作用。實(shí)習(xí)印記拾掇l 讀文獻(xiàn)開(kāi)始的兩三天,每天的任務(wù)就是看文獻(xiàn),包括全英的論文。很早就聽(tīng)不少師兄姐說(shuō)過(guò),去實(shí)習(xí)第一要培養(yǎng)的是讀文獻(xiàn)的能力,果然如此。每天都只是看論文,確實(shí)挺單調(diào),有個(gè)別同學(xué)動(dòng)搖了,甚至第二天就退出了。我覺(jué)得很可惜,同時(shí)也更堅(jiān)定了自己要堅(jiān)持努力的決心。我堅(jiān)信,無(wú)論做什么,用心了就總會(huì)有收獲,眼光也不能只放在當(dāng)下。面對(duì)一個(gè)對(duì)自己來(lái)說(shuō)幾乎是全新的東西,花時(shí)間先去了解它那是必須的,為以后更深入的學(xué)習(xí)和實(shí)踐打下基礎(chǔ),這很合理。否則剛開(kāi)始就動(dòng)手操作,

5、也不知從何做起,就算操作很正確也只是行尸走肉不知其意義何在。另一個(gè)也是因?yàn)樽约号d趣所在,讀得也津津有味。累了就時(shí)常想起自己的師兄曾用三天自學(xué)完一本全英教程,以此來(lái)激勵(lì)自己。但我能力有限沒(méi)能達(dá)到那個(gè)自學(xué)水平。這幾天的埋頭閱讀,雖說(shuō)不能百分百掌握所接觸的內(nèi)容,但對(duì)IPS這一領(lǐng)域,比起以前,總算有了個(gè)較清晰的輪廓,心里有底了。l 交流、取經(jīng)在學(xué)校學(xué)生工作中打拼了兩年,覺(jué)得自己適應(yīng)新的環(huán)境和新面孔的能力還可以。然而在研究院實(shí)踐開(kāi)始挺長(zhǎng)的一段時(shí)間后我才感覺(jué)適應(yīng)了那里的氛圍。一開(kāi)始,總覺(jué)得師兄姐們都好忙,在實(shí)驗(yàn)室做完實(shí)驗(yàn),又回到辦公室對(duì)著電腦分析實(shí)驗(yàn)或看文獻(xiàn),相互之間似乎很少有什么要交流,但也經(jīng)常看到XX

6、,XX師兄和XX師兄在一起討論。每個(gè)人在辦公室里那種專(zhuān)注和安靜竟然讓我有種想逃開(kāi)的沖動(dòng),我想這是一個(gè)滿是研究人員的房間里很正常的氛圍吧,是我還沒(méi)習(xí)慣罷了。加上因?yàn)檗k公室安排不下,開(kāi)始的幾天又只是看文獻(xiàn),大部分時(shí)間待在閱覽室,跟師兄姐接觸較少,想交流的時(shí)候又覺(jué)得不知從何問(wèn)起。后來(lái)慢慢發(fā)現(xiàn),其實(shí)是自己的主觀意識(shí)先入為主,產(chǎn)生了敬畏心理,把師兄姐們抬得太高太難以接觸了使自己把交流的主動(dòng)性給丟了。而且我也再次感受到,好的交流也需要先成為朋友。后來(lái)越來(lái)越喜歡在實(shí)驗(yàn)室那邊跟師兄姐們一起,發(fā)現(xiàn)其實(shí)師兄姐很愿意把自己知道的東西告訴我們,聽(tīng)多了就想得多,想多了就會(huì)問(wèn)得多,自然就學(xué)到了更多。你希望別人怎么對(duì)你,你

7、就怎么對(duì)別人,包括交流也是這樣。而這一切都需要我們做到:主動(dòng)。l 且行且思專(zhuān)業(yè)知識(shí)掌握得不多,對(duì)于很多常掛在嘴邊的專(zhuān)業(yè)知識(shí)都聽(tīng)不懂,看不明。電子閱覽室是待得最多的地方了,平時(shí)沒(méi)有實(shí)驗(yàn)的時(shí)候,大多數(shù)就去那查資料,把不懂的東西搜一遍,以后在接觸到相關(guān)內(nèi)容的時(shí)候就不會(huì)摸不著頭腦了,解決力所能及的問(wèn)題,也不用連一些看似很常識(shí)化的專(zhuān)業(yè)知識(shí)都去麻煩師兄姐,在這個(gè)閱覽室,確實(shí)學(xué)到了很多東西。在看和聽(tīng)的同時(shí),要不斷的思考,不要似懂非懂就放過(guò)去了。印象最深的就是學(xué)CHIP和甲基化檢測(cè)這兩個(gè)實(shí)驗(yàn)時(shí),原理用途步驟都弄清楚后以為都懂了,再一想,根本不知道這兩個(gè)技術(shù)是怎么服務(wù)于我們實(shí)驗(yàn)組現(xiàn)在IPS的研究中的。經(jīng)過(guò)和其他

8、師兄姐討論,整理思路,找到最終不明白的地方,然后請(qǐng)教XX師兄終于弄明白,當(dāng)時(shí)的感覺(jué)真是柳暗花明啊!失敗也是科研常遇之事。失敗不可怕,重要的是要懂得不要對(duì)自己擺架子,把心態(tài)放低去思考,尋找錯(cuò)根,這時(shí)候?qū)ψ约阂笠欢ㄒ獓?yán)格,每一個(gè)看似不可能出錯(cuò)的步驟都有可能。我們做的甲基化實(shí)驗(yàn)就失敗了兩次,從所制備的試劑到實(shí)驗(yàn)條件到最后PCR的引物一一懷疑,要一步一步把好關(guān)卡才能做好。并且無(wú)論多簡(jiǎn)單的步驟都不能偷工減料,否則事倍功半。關(guān)于做科研,感受最深的是,技術(shù)重要,但思維也很重要??蒲姓卟粌H知道怎么去做,最重要的是他知道為什么要這樣做,知道需要這樣做,他懂得怎樣運(yùn)用這些技術(shù)去達(dá)到自己的目的。所以在掌握操作技術(shù)

9、時(shí),最重要的還是要學(xué)會(huì)去想。另外,做科研要不斷地去追尋最新的動(dòng)態(tài),不能只圈在自己的小世界里,但是,在攝入別人的成果時(shí),要記住時(shí)刻保持質(zhì)疑,敢于去質(zhì)疑,全信則不如不信。師兄姐們?cè)谶\(yùn)用別人的成果之前,總要自己先驗(yàn)證,所謂實(shí)踐是檢驗(yàn)真理的唯一標(biāo)準(zhǔn),用在這里也不為過(guò)。l 學(xué)無(wú)止境每周一次的小組會(huì)議也是印象比較深刻的。除了討論各自的工作進(jìn)展外,還有論文的分享。我很欣賞這一點(diǎn),雖然實(shí)驗(yàn)組里的人都很經(jīng)??次墨I(xiàn),但就算看同一篇文章也會(huì)有不同的理解和想法。每周的組會(huì)讓一個(gè)人來(lái)分析一篇較新的課題組相關(guān)的論文,讓其他成員學(xué)到自己不知道的東西,也交流了大家的想法,學(xué)習(xí)別人的思維方式。據(jù)說(shuō)還會(huì)有相關(guān)的專(zhuān)業(yè)課題的講授,讓

10、我深深感受到學(xué)無(wú)止境啊。術(shù)業(yè)有專(zhuān)功,每個(gè)人總有自己專(zhuān)長(zhǎng)的,也就肯定有自己不懂的,只有不斷地學(xué)習(xí),才不會(huì)落后,懂得越多,也能更好的服務(wù)于自己的專(zhuān)長(zhǎng)。實(shí)習(xí)日程時(shí)間內(nèi)容摘要721l 報(bào)到l 了解實(shí)驗(yàn)室布局l 了解可誘導(dǎo)多功能干細(xì)胞(IPS)的概況l 了解基本的文獻(xiàn)查閱、檢索方法72223l 閱讀IPS相關(guān)文獻(xiàn)(體細(xì)胞重編程技術(shù),什么是IPS,IPS的發(fā)現(xiàn)過(guò)程和獲取方法,IPS的鑒定,IPS的研究方向)724l 查閱分子克隆相關(guān)內(nèi)容l 觀摩實(shí)驗(yàn)1、分子克隆的部分流程:菌落PCRDNA電泳陽(yáng)性菌落擴(kuò)增(保種,大提)2、質(zhì)粒試劑盒抽提(小提)725l 觀摩實(shí)驗(yàn):實(shí)時(shí)熒光定量PCR(Real Time PC

11、R)l XX師兄(實(shí)驗(yàn)室小組長(zhǎng),博士生)暢談IPS并進(jìn)行疑難解答726l 查閱染色質(zhì)免疫共沉淀(ChIP)相關(guān)內(nèi)容727l 開(kāi)組會(huì):實(shí)驗(yàn)室各成員工作匯報(bào)及討論,XX師兄分享論文epigenetic memory in induced pluripotent stem cellsl 進(jìn)一步學(xué)習(xí)實(shí)時(shí)定量PCR(Real Time PCR)相關(guān)內(nèi)容728l 觀摩實(shí)驗(yàn):1、zed1基因的克隆過(guò)程2、Real Time PCR3、染色質(zhì)免疫共沉淀(CHIP)部分流程:配制CHIP需用的試劑備用,加入一抗過(guò)夜72930l 查閱資料(以甲基化定量分析DNA為主)731l 操作實(shí)驗(yàn):菌落PCR(比較不同引物克

12、隆Oct4基因的效力)812l 查閱資料(以引物設(shè)計(jì)為主)l 閱讀文獻(xiàn)l 討論疑難點(diǎn)83l 開(kāi)組會(huì):實(shí)驗(yàn)室各成員工作匯報(bào)及討論84l 操作實(shí)驗(yàn):Gtl2基因的甲基化檢測(cè)流程:把提好的DNA酶切獲得目的片段制作珠子用焦亞硫酸鹽處理并過(guò)夜85l 繼續(xù)操作實(shí)驗(yàn):gtl2基因的甲基化檢測(cè)流程:洗昨天做好的珠子PCRDNA電泳實(shí)驗(yàn)結(jié)果:無(wú)目的條帶,失敗可能原因分析:低熔點(diǎn)瓊脂糖沒(méi)完全煮融(濃度不夠);珠子沒(méi)洗干凈;PCR引物特異性不高867l 重復(fù)操作實(shí)驗(yàn):gtl2基因的甲基化檢測(cè)實(shí)驗(yàn)結(jié)果:無(wú)目的條帶,失敗可能原因分析:瓊脂糖有問(wèn)題或是沒(méi)完全煮融; PCR引物特異性不高88l 查閱TRIzol提取法提取

13、RNA的相關(guān)內(nèi)容l 學(xué)習(xí)載體與目的片段連接的及其具體操作方法89l 觀摩實(shí)驗(yàn):1、TRIzol提取法提取RNA2、RT-PCRl 操作實(shí)驗(yàn):用試劑盒提取質(zhì)粒l 參觀研究生Poster展810l 開(kāi)組會(huì):實(shí)驗(yàn)室各成員工作匯報(bào)及討論論文分享l 操作實(shí)驗(yàn):流程:洗昨天師姐做好的珠子PCRDNA電泳結(jié)果:無(wú)目的條帶,失敗可能原因分析:焦亞硫酸鈉試劑有問(wèn)題;引物特異性不高811l 查閱資料l 觀摩實(shí)驗(yàn):轉(zhuǎn)化l 練習(xí)使用NCBI網(wǎng)站中的Entrez信息查詢系統(tǒng)檢索并提取人瘦素(leptin)的各種核酸序列812l 查閱資料l 體驗(yàn)細(xì)胞間工作環(huán)境l 觀摩實(shí)驗(yàn):轉(zhuǎn)導(dǎo)l 使用倒置熒光顯微鏡觀察IPS細(xì)胞及轉(zhuǎn)導(dǎo)過(guò)

14、程中的細(xì)胞813l 查閱資料,整理資料結(jié)束語(yǔ)整個(gè)暑期實(shí)踐,掌握了IPS研究中的基本知識(shí),了解了IPS最新的研究動(dòng)態(tài)。學(xué)習(xí)了一些先進(jìn)技術(shù)原理和要領(lǐng),例如分子克隆,CHIP,引物設(shè)計(jì),轉(zhuǎn)化轉(zhuǎn)導(dǎo)等。掌握了一些常用的技術(shù)及其操作,例如序列搜索等生物信息學(xué)內(nèi)容,菌落PCR,實(shí)時(shí)定量PCR,甲基化檢測(cè)等。熟練了一些基本實(shí)驗(yàn)操作,如PCR,DNA電泳等。實(shí)習(xí)給我最大的三點(diǎn)感觸,一是,我不再只是從別人口中聽(tīng),從別人文字中看,而是零距離接觸自己想知道的世界,親身經(jīng)歷想做的事情。二是,實(shí)習(xí)給了我主動(dòng)去學(xué)習(xí)新知識(shí)的動(dòng)力和毅力。三是給了我一段值得珍藏的回憶。我沒(méi)有像師兄XX,XX,同屆同學(xué)XX等人那樣,能在sience上發(fā)表文章,或者在實(shí)習(xí)單位做出了很驕人

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