微生物及其鑒定簡述

1、微生物及其鑒定簡述微生物及其分類 定義定義：個(gè)體難以用肉眼觀察的一切微小生物之統(tǒng)稱。 細(xì)胞機(jī)構(gòu)分類分為原核微生物和真核微生物 非細(xì)胞類：病毒和亞病毒。 特征：體小面大、吸多轉(zhuǎn)快、生長繁殖快 原核原核微生物微生物(prokaryotic microbe)：指核質(zhì)和細(xì)胞質(zhì)之間不存在明顯核膜，其染色體由單一核酸組成的一類微生物。 原核微生物包括古菌（即古細(xì)菌）、真細(xì)菌、放線菌、藍(lán)細(xì)菌、粘細(xì)菌、立克次氏體、支原體、衣原體和螺旋體。 真核微生物真核微生物：真菌球菌、藻類(部分)、原生動(dòng)物（部分）。原核生物與真核生物的區(qū)別比較項(xiàng)目原核生物真核生物實(shí)例細(xì)菌、藍(lán)藻、放線菌、衣原體、支原體（支原體細(xì)胞最小，且無

2、細(xì)胞壁）酵母菌等真菌、衣藻、高等植物、動(dòng)物細(xì)胞大小較小（110微米）較大（10100微米）細(xì)胞結(jié)構(gòu)細(xì)胞壁不含纖維素，主要成分是肽聚糖；細(xì)胞器只有一種，即核糖體；細(xì)胞核沒有核膜（這是最主要的特點(diǎn)）、沒有核仁、沒有染色質(zhì)（體），但有核物質(zhì)，叫擬核細(xì)胞壁的主要成分是纖維素和果膠；有核糖體、線粒體、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)、高爾基體等多種細(xì)胞器；細(xì)胞核有核膜、核仁、有染色質(zhì)（體）主要細(xì)胞增殖方式二分裂有絲分裂、無絲分裂、減數(shù)分裂代謝類型同化作用多為異養(yǎng)型、少數(shù)為自養(yǎng)型（包括光合作用和化能合成作用自養(yǎng)型），異化作用多為厭氧型、少數(shù)為需氧型。光合作用的部位不是葉綠體而是在光合片層上；有氧呼吸的主要部位不在線粒體而是在細(xì)胞膜

3、同化作用有的是異養(yǎng)型、有的為自養(yǎng)型，異化作用有的為厭氧型、有的為需氧型。光合作用的部位是葉綠體；有氧呼吸的主要部位是線粒體生殖方式無性生殖（多為分裂生殖）有性生殖、無性生殖遺傳方面遺傳物質(zhì)DNADNADNA分布擬核（控制主要性狀）；質(zhì)粒（控制抗藥性、固氮、抗生素生成等性狀）細(xì)胞核（控制細(xì)胞核遺傳），線粒體和葉綠體（控制細(xì)胞質(zhì)遺傳）基因結(jié)構(gòu)編碼區(qū)是連續(xù)的，無內(nèi)含子和外顯子編碼區(qū)是不連續(xù)的、間隔的，有內(nèi)含子和外顯子基因表達(dá)轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生的信使RNA不需要加工；轉(zhuǎn)錄和翻譯通常在同一時(shí)間同一地點(diǎn)進(jìn)行（在轉(zhuǎn)錄未完成之前翻譯便開始進(jìn)行）轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生的信使RNA需要加工（將內(nèi)含子轉(zhuǎn)錄出的部分切掉，將外顯子轉(zhuǎn)錄出的部分

4、拼接起來）；轉(zhuǎn)錄和翻譯不在同一時(shí)間同一地點(diǎn)進(jìn)行（轉(zhuǎn)錄在翻譯之前，轉(zhuǎn)錄在細(xì)胞核內(nèi)、翻譯在細(xì)胞質(zhì)的核糖體）遵循遺傳規(guī)律不遵循基因分離定律和自由組合定律細(xì)胞核遺傳遵循基因分離定律和自由組合定律，細(xì)胞質(zhì)遺傳不遵循基因分離定律和自由組合定律可遺傳變異的來源基因突變基因突變、基因重組、染色體變異進(jìn)化水平低高病毒定義定義:一類由核酸和蛋白質(zhì)等少數(shù)幾種成分組成的“非細(xì)胞生物”，但是它的生存必須依賴于活細(xì)胞。結(jié)構(gòu)結(jié)構(gòu)：蛋白質(zhì)衣殼和核酸病原微生物引起人和動(dòng)物致病的微生物叫病原微生物病原微生物，有八大類： 1,真菌：引起皮膚病，深部組織上感染。 2,放線菌：皮膚，傷口感染。 3,螺旋體：皮膚病，血液感染 如梅毒，鉤

5、端螺旋體病。 4,細(xì)菌：皮膚病化膿，上呼吸道感染，泌尿道感染，食物中毒，敗血壓癥，急性傳染病等。 5,立克次體：斑疹傷寒等。 6,衣原體：沙眼，泌尿生殖道感染。 7,病毒：肝炎，乙型腦炎，麻疹，艾滋病等。 8,支原體：肺炎，尿路感染。臨床微生物的意義結(jié)核、病毒性肝炎、齲齒和牙周病、性病等均由病原微生物病原微生物引起引起(1)感染是疾病死因的重要原因之一感染是疾病死因的重要原因之一腫瘤病人本身免疫力低，防止和控制感染是非常重要的，這類病人感染很容易造成死亡。呼吸系疾?。褐饕歉腥尽p傷包括創(chuàng)傷、燒傷等，感染的控制極為重要腦血管疾病、心臟疾病等，也很容易發(fā)生感染。(2)病原微生物與某些腫瘤密切相關(guān)

6、病原微生物與某些腫瘤密切相關(guān)HCV、TTV皆與肝癌有關(guān)幽門螺桿菌與胃癌有關(guān)HCMV與成神經(jīng)細(xì)胞癌、Wilm瘤、前列腺瘤、宮頸癌、睪丸癌、Kaposi肉瘤、結(jié)腸癌等有關(guān)，HSV-2與宮頸癌有關(guān)等(3)病原微生物與心臟病的關(guān)系病原微生物與心臟病的關(guān)系風(fēng)濕性心臟病溶血性鏈球菌病毒性心肌炎和心包炎柯薩奇病毒B組肺炎衣原體與冠狀動(dòng)脈硬化和心臟病的發(fā)生有關(guān)甲鏈和金葡菌等可引起急性和亞急性細(xì)菌性心內(nèi)膜炎臨床微生物 葡萄球菌屬 鏈球菌屬 腸球菌屬 奈瑟菌屬和卡他莫拉菌 腸桿菌科 非發(fā)酵革蘭氏陰性桿菌 臨床真菌感染金黃色葡萄球菌金黃色葡萄球菌 (Staphyloccocus aureus Rosenbach)

7、是人類的一種重要病原菌，隸屬于葡萄球菌屬（Staphylococcus）。有“嗜肉菌的別稱?？梢鹪S多嚴(yán)重感染。細(xì)菌按形態(tài)可分為：球菌，桿菌，和螺旋菌。金黃色葡萄球菌是人類化膿感染中最常見的病原菌，可引起局部化膿感染，也可引起肺炎、偽膜性腸炎、心包炎、金黃色葡萄球菌腸炎等，甚至敗血癥、膿毒癥等全身感染。金黃色葡萄球菌的致病力強(qiáng)弱主要取決于其產(chǎn)生的毒素和侵襲性酶。鏈球菌屬定義定義:細(xì)胞沿一個(gè)平面分裂，常排列成鏈狀的細(xì)菌。鏈球菌是化膿性球菌的另一類常見的細(xì)菌，廣泛存在于自然界和人及動(dòng)物糞便和健康人鼻咽部，大多數(shù)不致病。醫(yī)學(xué)上重要的鏈球菌主要有化膿性鏈球菌、草綠色鏈球菌、肺炎鏈球菌、無乳鏈球菌等。引

8、起人類的疾病主要有：化膿性炎癥、毒素性疾病和超敏反應(yīng)性疾病等。 腸球菌屬腸球菌屬拉丁學(xué)名(Enterococcus Thiercelin and Jouhaud,1984) 細(xì)胞球形或卵圓形，0.62.0m 0.62.5m，在液體培養(yǎng)基中呈成對(duì)或短鏈。廣泛出現(xiàn)于環(huán)境中，特別脊椎動(dòng)物的糞便；有時(shí)引起化膿感染。奈瑟菌屬瑟菌屬是一群革蘭陰性,有菌毛,大多成雙排列的需氧性球菌.對(duì)人致病的只有腦膜炎奈瑟菌腦膜炎奈瑟菌和淋病奈瑟菌淋病奈瑟菌.除淋病奈瑟菌寄居于尿道粘膜外,腦膜炎奈瑟菌及其他奈瑟菌均寄居于鼻咽腔粘膜.卡他莫拉菌卡他莫拉菌(Moraxella catarrhalis,MC)也有稱卡他布蘭漢菌(

9、Branhamellacatarrhalis，BC)是寄居于人類上呼吸道的莫拉菌屬的一種細(xì)菌。引起人類的疾病主要有：兒童和老年人的上呼吸道感染，成人下呼吸道感染，兒童上頜竇炎、中耳炎、肺炎以及成人的慢性下呼吸道感染。腸桿菌科常見菌屬埃希氏菌屬：包括5個(gè)種，即大腸埃希菌、蟑螂埃希菌、弗格森埃希菌、赫爾曼埃希菌和傷口埃希菌。臨床最常見的是大腸埃希菌。大腸埃希菌俗稱大腸桿菌，大多數(shù)菌株是人類和動(dòng)物腸道正常菌群。致病性：主要是侵襲力、內(nèi)毒素、腸毒素等致病因素引起各種炎癥（如膽囊炎、泌尿系感染、肺炎、新生兒腦膜炎、傷口感染、菌血癥及腹瀉等）。內(nèi)毒素還可引起發(fā)熱、休克、DIC等。沙門氏菌屬：通過動(dòng)物的消化

10、道傳染致病，統(tǒng)稱為沙門氏菌病。病型有傷寒與副傷寒（統(tǒng)稱腸熱癥）、食物中毒、敗血癥，還可引起慢性腸炎。志賀氏菌屬：該屬是人類細(xì)菌性痢疾的病原菌，通稱痢疾桿菌。克雷伯氏菌屬：存在于土壤、水、谷物等自然界以及人或動(dòng)物的呼吸道。當(dāng)肌體免疫力降低時(shí)，能引起多種感染。有肺炎克雷伯氏桿菌、臭鼻克雷伯氏桿菌和鼻硬結(jié)克雷伯氏桿菌3種。沙雷氏菌屬：一般存在于土壤、水、植物、動(dòng)物以及人類的腸道和呼吸道中，是引起醫(yī)院內(nèi)感染的重要條件致病菌。有粘質(zhì)沙雷氏菌、液化沙雷氏菌、深紅沙雷氏菌等。變形桿菌屬：水、泥土、陰溝及各種腐敗的動(dòng)、植物中最多，它們是條件致病菌，在特殊情況下能使人致病。耶爾森氏菌屬：該屬有鼠疫桿菌、假結(jié)核桿

11、菌和腸結(jié)腸炎桿菌3種。非發(fā)酵革蘭氏陰性桿菌定義：一群不發(fā)酵葡萄糖或僅以氧化形式利用葡萄糖的需氧或兼性厭氧、無芽孢的革蘭陰性桿菌種類：包括假單胞菌屬、不動(dòng)桿菌屬、寡養(yǎng)單胞菌屬、伯克霍爾德菌屬、黃桿菌屬和產(chǎn)堿桿菌屬細(xì)菌,多為條件致病菌，主要引起院內(nèi)感染。近半個(gè)世紀(jì)以來已成為醫(yī)院感染的重要病原菌。其儲(chǔ)菌庫和感染源主要是醫(yī)院環(huán)境和物件以及住院患者，主要傳播途徑為接觸傳播。臨床感染類型分為菌(敗)血癥、肺炎、泌尿道感染、燒傷和手術(shù)部位感染、腦膜炎和眼科術(shù)后感染。臨床真菌感染真菌感染引起的疾病稱為真菌病，發(fā)病率最高的念珠菌病和皮膚癬菌病。淺部真菌(癬菌)僅侵犯皮膚、毛發(fā)和指(趾)甲，而深部真菌能侵犯人體皮

12、膚、黏膜、深部組織和內(nèi)臟，甚至引起全身播散性感染。念珠菌：院內(nèi)血源感染第四位，死亡率第一曲霉：第二位最常見深部真菌病，死亡率高達(dá)60-90% 念珠菌+曲霉=90%侵襲性感染臨床標(biāo)本主要包括：無菌體液，有不引起疾病的正常菌群寄居無菌體液：血液及骨髓標(biāo)本、尿液標(biāo)本、穿刺液標(biāo)本、導(dǎo)管正常菌群寄居：糞便標(biāo)本、痰和上呼吸道標(biāo)本、燒傷標(biāo)本、生殖道標(biāo)本、組織標(biāo)本常規(guī)檢驗(yàn)常規(guī)檢驗(yàn)病毒檢驗(yàn) 直接檢測(cè)：快速診斷方法 間接檢測(cè)（病毒分離） 血清學(xué)檢測(cè)常規(guī)檢驗(yàn) 病毒檢驗(yàn)梅里埃VITEK全自動(dòng)微生物檢測(cè)系統(tǒng)原理及其應(yīng)用工作原理以每種細(xì)菌的微量生化反應(yīng)為基礎(chǔ)，不同種類的VITEK試卡（檢測(cè)卡）含有多種的生化反應(yīng)孔，可達(dá)3

13、0種。將手工分離的待檢菌的純菌落制成符合一定濁度要求的菌懸液，經(jīng)充填機(jī)將菌懸液注入試卡內(nèi)，封口后放入讀數(shù)器/恒溫培養(yǎng)箱，根據(jù)試卡各生化反應(yīng)孔中的生長變化情況，由讀數(shù)器按光學(xué)掃描原理，定時(shí)測(cè)定各生化介質(zhì)中指示劑的顯色并在打印機(jī)上自動(dòng)打印。 可鑒定500多種細(xì)菌Biolog公司全自動(dòng)微生物鑒定儀原理原理：利用微生物對(duì)不同碳源代謝率的差異，針對(duì)每一類微生物篩選95種不同碳源，配合四唑類顯色物質(zhì)（如TTC），固定于96孔板上（A1孔為陰性對(duì)照），接種菌懸液后培養(yǎng)一定時(shí)間，通過檢測(cè)微生物細(xì)胞利用不同碳源進(jìn)行新陳代謝過程中產(chǎn)生的氧化還原酶與顯色物質(zhì)發(fā)生反應(yīng)而導(dǎo)致的顏色變化（吸光度）以及由于微生物生長造成的

14、濁度差異（濁度），與標(biāo)準(zhǔn)菌株數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對(duì)，即可得出最終鑒定結(jié)果。Biolog微生物鑒定數(shù)據(jù)庫容量是目前世界上最大的，可鑒定包括細(xì)菌、酵母和絲狀真菌在內(nèi)超過2650種微生物，幾乎涵蓋了所有的人類、動(dòng)物、植物病原菌以及食品和環(huán)境微生物。Biolog全自動(dòng)微生物鑒定儀的優(yōu)點(diǎn) 可鑒定一些傳統(tǒng)鑒定系統(tǒng)無法鑒定的重要的革蘭氏陰性好氧菌，如不動(dòng)桿菌屬, 氣單胞菌屬、博代氏桿菌屬, 嗜血桿菌, 假單胞菌（70多種）, 弧菌（22種）、耶爾森氏鼠疫桿菌（11種）等 可鑒定一些傳統(tǒng)鑒定系統(tǒng)無法鑒定的重要的革蘭氏陽性好氧菌，如芽孢桿菌、棒狀桿菌、微球菌、葡萄球菌屬、鏈球菌等 與其它鑒定系統(tǒng)相比，新增了許多種類的厭

15、氧菌，如雙歧桿菌（30種）、梳狀菌、巨型鏈球菌、乳酸桿菌（70種）檢測(cè)微生物的質(zhì)譜主要是氣-質(zhì)聯(lián)用（GC-MS）、基質(zhì)輔助激光解吸飛行時(shí)間質(zhì)譜（MALDI-TOF MS）、電噴霧質(zhì)譜（ESI-MS）及熱裂解亞穩(wěn)態(tài)原子轟擊質(zhì)譜（Py-MAB-MS）等MALDI-TOF MS鑒定臨床微生物對(duì)于臨床中的不同標(biāo)本如鼻咽分泌物、咽拭子、腦脊液、胸腹水、肛拭子及尿液等進(jìn)行微生物培養(yǎng)后，將其菌落進(jìn)行質(zhì)譜鑒定，據(jù)統(tǒng)計(jì)MALDI-TOF MS能準(zhǔn)確鑒定大部分革蘭陽性菌和革蘭陰性菌如葡萄球菌屬、鏈球菌屬、放線菌屬、奴卡菌屬、棒狀桿菌屬、紅球菌屬、腸桿菌科細(xì)菌、變形桿菌、流感嗜血桿菌、副流感嗜血桿菌、卡他莫拉菌、不動(dòng)桿菌屬、耶爾森菌屬等難鑒定的菌株革蘭氏陽性菌：在鑒定-溶血性鏈球菌過程中有一定問題，緩癥鏈球菌和口腔鏈球菌較難區(qū)分，且其與肺炎鏈球菌也較難區(qū)分革蘭氏