創(chuàng)新藥物的研發(fā)過程與藥物發(fā)現(xiàn)的途徑

1、精選文檔 博士 基地班碩士碩博連讀爭(zhēng)辯生 獸醫(yī)碩士專業(yè)學(xué)位 學(xué)術(shù)型碩士 工程碩士專業(yè)學(xué)位 農(nóng)業(yè)推廣碩士專業(yè)學(xué)位 全日制專業(yè)學(xué)位碩士 同等學(xué)力在職申請(qǐng)學(xué)位 中職老師攻讀碩士學(xué)位 高校老師攻讀碩士學(xué)位 風(fēng)景園林碩士專業(yè)學(xué)位 西 北 農(nóng) 林 科 技 大 學(xué)研 究 生 課 程 考 試 試 卷 封 面（課程名稱： 分子模擬與計(jì)算機(jī)幫助藥物設(shè)計(jì) ）學(xué)位課 選修課 研 究 生 年 級(jí)、姓 名 8 研 究 生 學(xué) 號(hào) 6 所 在 學(xué) 院（系、部） 5 專 業(yè) 學(xué) 科 4 任 課 教 師 姓 名 3 考 試 日 期 考 試 成 績(jī) 評(píng) 卷 教 師 簽 字 處 創(chuàng)新藥物的研發(fā)過程與藥物發(fā)覺的途徑摘要：文中具體介紹

2、了新藥在研發(fā)過程中所需要經(jīng)受的必要步驟和流程，同時(shí)介紹了藥物的開發(fā)上市中需要的過程，呈現(xiàn)了創(chuàng)新藥物的研發(fā)是格外耗時(shí)耗資的，也體現(xiàn)了新藥開發(fā)的重要性。此外從模擬創(chuàng)新在新藥創(chuàng)新方面的應(yīng)用，以及提出并介紹了現(xiàn)代生物學(xué)對(duì)新藥研發(fā)的幾種重要途徑。關(guān)鍵詞：新藥研發(fā)上市，模擬創(chuàng)新，現(xiàn)代生物學(xué)創(chuàng)新藥物的窗體頂端Innovative Drug R & D Process and Drug Discovery Pathways窗體頂端窗體底端Innovative Drug RD Process and Drug Discovery PathwaysAbstract：In this paper, the n

3、ecessary steps and processes of the new drugs in the development process are introduced in detail. At the same time, the process of drug development and listing is introduced. It shows that the research and development of innovative drugs is very time consuming and costly. It also reflects the impor

4、tance of new drug development . In addition, from the application of analog innovation in the innovation of new drugs, and put forward and introduced the modern biology of new drug research and development of several important ways.Key：new drugs，analog innovation，modern biology1、 概述 創(chuàng)新藥物在國(guó)際上一般是指含有新化

5、學(xué)實(shí)體(NCE)的藥物。在我國(guó)，創(chuàng)新藥物具體是指“未在國(guó)內(nèi)上市銷售的來源于植物、動(dòng)物、礦物等藥用物質(zhì)制成的制劑和從中藥、自然藥物中提取的有效成份及其制劑”及“未在國(guó)內(nèi)外獲準(zhǔn)上市的化學(xué)原料藥及其制劑、生物制品”，同時(shí)還必需具有原創(chuàng)性，具有自主的學(xué)問產(chǎn)權(quán)。眾所周知，世界范圍內(nèi)的創(chuàng)新藥物研發(fā)形勢(shì)比較嚴(yán)峻，研發(fā)成本在持續(xù)增加，而總產(chǎn)量卻在削減。一項(xiàng)針對(duì)全球前十制藥企業(yè)的爭(zhēng)辯表明，與2010年相比，2011 年藥物研發(fā)上市成本增加約25%至10億美元左右，而研發(fā)總體回報(bào)率從11.8%下降到8.4%。由于近年來“重磅炸彈”級(jí)藥品專利紛紛到期，使得大型跨國(guó)制藥公司面臨巨大的研發(fā)壓力，迫切需要查找維持創(chuàng)新藥研

6、發(fā)項(xiàng)目的同時(shí)全面降低研發(fā)成本的藥物研發(fā)途徑。本文介紹了創(chuàng)新藥物研發(fā)、上市的基本流程；現(xiàn)代生物學(xué)對(duì)新藥發(fā)覺的重要影響；模擬創(chuàng)新在新藥研發(fā)中的重要作用，制藥公司內(nèi)部研發(fā)、外包研發(fā)和許可研發(fā)三種研發(fā)路徑的現(xiàn)狀及進(jìn)展趨勢(shì)，以及與制藥公司進(jìn)展相匹配的研發(fā)路徑。二、創(chuàng)新藥物研發(fā)及上市流程藥物從最初的試驗(yàn)室爭(zhēng)辯到最終擺放到藥柜銷售平均需要花費(fèi)12年的時(shí)間。進(jìn)行臨床前試驗(yàn)的5000種化合物中只有5種能進(jìn)入到后續(xù)的臨床試驗(yàn)，而僅其中的1種化合物可以得到最終的上市批準(zhǔn)。總的來說新藥的研發(fā)分為兩個(gè)階段：爭(zhēng)辯和開發(fā)。這兩個(gè)階段是相繼發(fā)生有相互聯(lián)系的。區(qū)分兩個(gè)階段的標(biāo)志是候選藥物的確定，即在確定候選藥物之前為爭(zhēng)辯階段，

7、爭(zhēng)辯階段包括四個(gè)重要環(huán)節(jié)，即靶標(biāo)的確定，模型的建立，先導(dǎo)化合物的發(fā)覺，先導(dǎo)化合物的優(yōu)化。確定之后的工作為開發(fā)階段。所謂候選藥物是指擬進(jìn)行系統(tǒng)的臨床前試驗(yàn)并進(jìn)入臨床爭(zhēng)辯的活性化合物。2.1 爭(zhēng)辯階段 2.1.1 靶標(biāo)的確立  確定治療的疾病目標(biāo)和作用的環(huán)節(jié)和靶標(biāo)，是創(chuàng)制新藥的動(dòng)身點(diǎn)，也是以后施行的各種操作的依據(jù)。藥物的靶標(biāo)包括酶、受體、離子通道等。作用于不同的靶標(biāo)的藥物在全部藥物中所占的比重是不同的。以2000年為例，在全世界藥物的銷售總額中，酶抑制劑占32.4%，轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白抑制劑占16.0%，受體感動(dòng)劑占9.1%，受體拮抗劑占10.7%，作用于離子通道的藥物占9.1%等等。目前，較為新

8、興的確認(rèn)靶標(biāo)的技術(shù)主要有兩個(gè)。一是利用基因重組技術(shù)建立轉(zhuǎn)基因動(dòng)物模型或進(jìn)行基因敲除以驗(yàn)證與特定代謝途徑相關(guān)或表型的靶標(biāo)。這種技術(shù)的缺陷在于，不能完全消退由敲除所帶來的其他效應(yīng)（例如因代償機(jī)制的啟動(dòng)而導(dǎo)致的表型的轉(zhuǎn)變等）。二是利用反義寡核苷酸技術(shù)通過抑制特定的信使RNA對(duì)蛋白質(zhì)的翻譯來確認(rèn)新的靶標(biāo)。例如嵌入小核核糖核酸（snRNA）把握基因的表達(dá)，對(duì)確證靶標(biāo)有重要作用。 2.1.2 模型的確立 靶標(biāo)選定以后，要建立生物學(xué)模型，以篩選和評(píng)價(jià)化合物的活性。通常要制訂出篩選標(biāo)準(zhǔn)，假如化合物符合這些標(biāo)準(zhǔn)，則爭(zhēng)辯項(xiàng)目連續(xù)進(jìn)行；若未能滿足標(biāo)準(zhǔn)，則應(yīng)盡早結(jié)束爭(zhēng)辯。一般試驗(yàn)?zāi)Ｐ蜆?biāo)準(zhǔn)大致上有：化合物體外試驗(yàn)的活性

9、強(qiáng)度；動(dòng)物模型是否能反映人體相應(yīng)的疾病狀態(tài)；藥物的劑量（濃度）效應(yīng)關(guān)系，等等?？啥恐貜?fù)的體外模型是評(píng)價(jià)化合物活性的前提。近幾年來，為了規(guī)避藥物開發(fā)的后期風(fēng)險(xiǎn)，一般同時(shí)進(jìn)行藥物的藥代動(dòng)力模型評(píng)價(jià)（ADME評(píng)價(jià)）、藥物穩(wěn)定性試驗(yàn)等。 2.1.3 先導(dǎo)化合物的發(fā)覺新藥研制的第三步是先導(dǎo)化合物的發(fā)覺。所謂先導(dǎo)化合物（leading compound），也稱新化學(xué)實(shí)體（new chemical entity，NCE），是指通過各種途徑和方法得到的具有某種生物活性或藥理活性的化合物。由于目前的學(xué)問還不足以淵博到以足夠的受體機(jī)制指導(dǎo)藥物設(shè)計(jì)以使藥物的合成不必使用預(yù)先已知的模型，所以，先

10、導(dǎo)化合物的發(fā)覺，一方面有賴于以上兩步所確定的受體和模型，另一方面也成為了整個(gè)藥物研發(fā)的關(guān)鍵步驟。一般來說，先導(dǎo)化合物主要有如下幾個(gè)來源：對(duì)自然活性物質(zhì)的挖掘、現(xiàn)有藥物不良作用的改進(jìn)以及藥物合成心中間體的篩選等。目前，主要有兩個(gè)獲得新的先導(dǎo)化合物的途徑。一是廣泛篩選，這種毫無依據(jù)的方法在實(shí)際操作上其實(shí)是比較有效的。過去半個(gè)多世紀(jì)以來，由于這個(gè)緣由，先導(dǎo)化合物的發(fā)覺隨機(jī)性很強(qiáng)，如從煤焦油中分別出的本份被發(fā)覺具有抗菌作用因而被開發(fā)成為一系列諸如薩羅的抗生素；又如對(duì)染料中間體的篩選發(fā)覺了苯胺以及乙酰苯胺具有解熱鎮(zhèn)痛作用，經(jīng)改造得到了非那西丁和乙酰氨基酚等。近二十年來，計(jì)算機(jī)預(yù)篩被用于這一過程，大大加快

11、了爭(zhēng)辯進(jìn)程。另外，先導(dǎo)化合物的合理設(shè)計(jì)近年來也越來越成為這一領(lǐng)域的熱點(diǎn)。所謂合理設(shè)計(jì)，是指依據(jù)已知的受體（或受體未知但有一系列配體的構(gòu)效關(guān)系數(shù)據(jù)）進(jìn)行有針對(duì)性的先導(dǎo)化合物設(shè)計(jì)，這種方法有別于一般普遍篩選的顯著特點(diǎn)在于目的性強(qiáng)，有利于各種構(gòu)效理論的進(jìn)一步進(jìn)展，因此前途格外寬敞。 2.1.4 先導(dǎo)化合物的優(yōu)化 由于發(fā)覺的先導(dǎo)化合物可能具有作用強(qiáng)度或特異性不高、藥代動(dòng)力性質(zhì)不適宜、毒副作用較強(qiáng)或是化學(xué)或代謝上不穩(wěn)定等缺陷，先導(dǎo)化合物一般不能直接成為藥物。因此有必要對(duì)先導(dǎo)化合物進(jìn)行優(yōu)化以確定候選藥物，這是新藥爭(zhēng)辯的最終一步。簡(jiǎn)要地說，先到化合物的優(yōu)化就是基于相像性原理制備一系列化合物，評(píng)價(jià)其全面的構(gòu)效

12、關(guān)系已對(duì)其物理化學(xué)及生物化學(xué)性質(zhì)進(jìn)行優(yōu)化。優(yōu)化后再進(jìn)行體內(nèi)外活性評(píng)價(jià)，循環(huán)反饋，最終獲得優(yōu)良的化合物候選藥物（drug candidate） 2.2 臨床前及臨床爭(zhēng)辯 2.2.1 臨床前爭(zhēng)辯 2.2.1.1 藥物靶點(diǎn)的確認(rèn) 這個(gè)是全部工作的開頭。藥物靶點(diǎn)是指藥物在體內(nèi)的作用結(jié)合位點(diǎn)，包括基因位點(diǎn)、受體、酶、離子通道、核酸等生物大分子?，F(xiàn)代新藥爭(zhēng)辯與開發(fā)的關(guān)鍵首先是查找、確定和制備藥物篩選靶分子藥靶。藥物靶點(diǎn)是指藥物在體內(nèi)的作用結(jié)合位點(diǎn)，包括基因位點(diǎn)、受體、酶、離子通道、核酸等生物大分子。選擇確定新穎的有效藥靶是新藥開發(fā)的首要任務(wù)。迄今已發(fā)覺作為治療藥物靶點(diǎn)的總數(shù)約500個(gè)，其中受體尤其是G-蛋

13、白偶聯(lián)的受體（GPCR）靶點(diǎn)占絕大多數(shù)，另還有酶、抗菌、抗病毒、抗寄生蟲藥的作用靶點(diǎn)。合理化藥物設(shè)計(jì)（rational drug design）可以依據(jù)生命科學(xué)爭(zhēng)辯中所揭示的包括酶、受體、離子通道、核酸等潛在的藥物作用靶位，或其內(nèi)源性配體以及自然底物的化學(xué)結(jié)構(gòu)特征來設(shè)計(jì)藥物分子，以發(fā)覺選擇性作用于靶點(diǎn)的新藥。只有確定了靶點(diǎn)，后續(xù)全部的工作才有開放的依據(jù)。 2.2.1.2 化合物的合成這個(gè)階段的工作主要負(fù)責(zé)新化合物的合成，大多數(shù)藥物的框架都是在現(xiàn)有化合物的結(jié)構(gòu)改造和優(yōu)化。除此之外還有從動(dòng)植物中獵取的自然活性物質(zhì)，在獲得大量潛在活性物質(zhì)之后可進(jìn)行下面的步驟。 2.2.1.3 活性化合物的篩選不是全

14、部合成出來的化合物都能有抱負(fù)的活性，在這個(gè)階段需要通過生物試驗(yàn)手段篩選出初步有活性的化合物用作備選。這些化合物叫先導(dǎo)化合物（lead）。得到的活性數(shù)據(jù)可以結(jié)合化合物結(jié)構(gòu)得到初步的構(gòu)效關(guān)系分析。構(gòu)效關(guān)系可以有效的指導(dǎo)后續(xù)的化合物結(jié)構(gòu)優(yōu)化。這一步工作主要在細(xì)胞試驗(yàn)層面開放。同時(shí)也存在一個(gè)化合物對(duì)目標(biāo)A靶點(diǎn)沒有作用，卻有可能對(duì)其他的B靶點(diǎn)C靶點(diǎn)有格外好的活性的狀況，暫且不表。 2.2.1.4 進(jìn)行下一步的化合物結(jié)構(gòu)修飾得到活性更好的化合物。2到4這是一個(gè)循環(huán)，直到我們得到了活性足夠抱負(fù)的化合物。上面的內(nèi)容也就是藥物化學(xué)領(lǐng)域的大致工作范圍了。 2.2.1.5 藥物評(píng)估評(píng)估藥物的藥理作用，平安性與毒性，

15、藥物的吸取、分布、代謝和排泄?fàn)顩r（ADME）。這部分的試驗(yàn)需要在動(dòng)物層面開放。細(xì)胞試驗(yàn)的結(jié)果和活體動(dòng)物試驗(yàn)的結(jié)果有時(shí)候會(huì)有很大的差異。這一步的目的是確定藥物的有效性與平安性。 2.2.1.6 制劑的開發(fā) 藥物的服用需要在肯定的媒介中，不能直接將藥物吞食服用，所以制劑開發(fā)是藥物應(yīng)用的一個(gè)重要環(huán)節(jié)。比如有的藥胃腸吸取很差，就需要開發(fā)為注射劑。有的藥對(duì)在胃酸里面會(huì)失去活性，就需要開發(fā)為腸溶制劑。有的化合物溶解性不好，這也可以通過制劑來部分解決這個(gè)問題。前面這些內(nèi)容都統(tǒng)稱為臨床前爭(zhēng)辯。是藥物研發(fā)的最開端的內(nèi)容。各個(gè)試驗(yàn)的步驟并不肯定嚴(yán)格依據(jù)這個(gè)挨次開放，也沒有1、2、3這樣一個(gè)明顯的分界線。各個(gè)步驟是

16、一個(gè)相互包涵協(xié)調(diào)的關(guān)系。2.3 臨床爭(zhēng)辯 2.3.1 臨床I期 在新藥開發(fā)過程中,將新藥第一次用于人體以爭(zhēng)辯新藥的性質(zhì)的試驗(yàn),稱之為期臨床試驗(yàn).即在嚴(yán)格把握的條件下,給少量試驗(yàn)藥物于少數(shù)經(jīng)過謹(jǐn)慎選擇和篩選出的健康志愿者(對(duì)腫瘤藥物而言通常為腫瘤病人),然后認(rèn)真監(jiān)測(cè)藥物的血液濃度排泄性質(zhì)和任何有益反應(yīng)或不良作用,以評(píng)價(jià)藥物在人體內(nèi)的性質(zhì).期臨床試驗(yàn)通常要求健康志愿者住院以進(jìn)行24小時(shí)的親密監(jiān)護(hù).隨著對(duì)新藥的平安性了解的增加,給藥的劑量可漸漸提高,并可以多劑量給藥.通過期臨床試驗(yàn),還可以得到一些藥物最高和最低劑量的信息,以便確定將來在病人身上使用的合適劑量.可見,期臨床試驗(yàn)是初步的臨床藥理學(xué)及人體

17、平安性評(píng)價(jià)試驗(yàn),目的在于觀測(cè)人體對(duì)新藥的耐受程度和藥代動(dòng)力學(xué),為制定給藥方案供應(yīng)依據(jù). 2.3.2 臨床II期 通過期臨床爭(zhēng)辯,在健康人身上得到了為達(dá)到合理的血藥濃度所需要的藥品的劑理的信息,即藥代動(dòng)力學(xué)數(shù)據(jù).但是,通常在健康的人體上是不行能證明藥品的治療作用的.在臨床爭(zhēng)辯的其次階段即期臨床試驗(yàn),將給藥于少數(shù)病人志愿者,然后重新評(píng)價(jià)藥物的藥代動(dòng)力學(xué)和排泄?fàn)顩r.這是由于藥物在患病狀態(tài)的人體內(nèi)的作用方式經(jīng)常是不同的,對(duì)那些影響腸、胃、肝、和腎的藥物尤其如此。以一個(gè)新的治療關(guān)節(jié)炎的止通藥的開發(fā)為例。期臨床爭(zhēng)辯將確定該藥緩解關(guān)節(jié)炎病人的疼通效果如何，還要確定在不同劑量時(shí)不良反應(yīng)的發(fā)生率的凹凸，以確定苦

18、痛得到充分緩解但不良反應(yīng)最小的劑量?？梢哉f，期臨床試驗(yàn)是對(duì)治療作用的初步評(píng)價(jià)階段。期臨床試驗(yàn)一般通過隨機(jī)盲法對(duì)比試驗(yàn)（依據(jù)具體目的也可以實(shí)行其他設(shè)計(jì)形式），對(duì)新藥的有效性和平安性作出初步評(píng)價(jià)，并為設(shè)計(jì)期臨床試驗(yàn)和確定給藥劑量方案供應(yīng)依據(jù)。 2.3.3 臨床III期 在，期臨床爭(zhēng)辯的基礎(chǔ)上，將試驗(yàn)藥物用于更大范圍的病人志愿者身上，進(jìn)行擴(kuò)大的多中心臨床試驗(yàn)，進(jìn)一步評(píng)價(jià)藥物的有效性和耐受性（或平安性），稱之為期臨床試驗(yàn)。期臨床試驗(yàn)可以說是治療作用的確證階段，也是為藥品注冊(cè)申請(qǐng)獲得批準(zhǔn)供應(yīng)依據(jù)的關(guān)鍵階段，該期試驗(yàn)一般為具有足夠樣本量的隨機(jī)化盲法對(duì)比試驗(yàn)。臨床試驗(yàn)將對(duì)試驗(yàn)藥物和勸慰劑（不含活性物質(zhì)）或已

19、上市藥品的有關(guān)參數(shù)進(jìn)行比較。試驗(yàn)結(jié)果應(yīng)當(dāng)具有可重復(fù)性?？梢哉f，該階段是臨床爭(zhēng)辯項(xiàng)目的最繁忙和任務(wù)最集中的部分。除了對(duì)成年病人爭(zhēng)辯外，還要特殊爭(zhēng)辯藥物對(duì)老年病人，有時(shí)還要包括兒童的平安性。一般來講，老年病人和危重病人所要求的劑量要低一些，由于他們的身體不能有產(chǎn)地清除藥物，使得他們對(duì)不良反應(yīng)的耐受性更差，所以應(yīng)當(dāng)進(jìn)行特殊的爭(zhēng)辯來確定劑量。而兒童人群具有突變敏感性、遲發(fā)毒性和不同的藥物代謝動(dòng)力學(xué)性質(zhì)等特點(diǎn)，因此在打算藥物應(yīng)用于兒童人群時(shí)，權(quán)衡療效和藥物不良反應(yīng)應(yīng)當(dāng)是一個(gè)需要特殊關(guān)注的問題。在國(guó)外，兒童參與的臨床試驗(yàn)一般放在成人試驗(yàn)的期臨床后才開頭。假如一種疾病主要發(fā)生在兒童，并且很嚴(yán)峻又沒有其他治療

20、方法，美國(guó)食品與藥品管理局允許期臨床試驗(yàn)真接從兒童開頭，即在不存在成人數(shù)據(jù)參照的狀況下，允許從兒童開頭藥理評(píng)價(jià)。我國(guó)對(duì)此尚無明確規(guī)定。 2.4 新藥上市階段 2.4.1 新藥申請(qǐng) 在完成全部三個(gè)階段的臨床試驗(yàn)并分析全部資料及數(shù)據(jù)，如證明該藥物的平安性和有效性，則可以向 FDA提交新藥申請(qǐng)。新藥申請(qǐng)需要供應(yīng)全部收集到的科學(xué)資料。通常一份新藥申請(qǐng)材料可多達(dá)100000 頁，甚至更多！依據(jù)法規(guī)，F(xiàn)DA應(yīng)在6個(gè)月內(nèi)審評(píng)完新藥申請(qǐng)。但是由于大部分申請(qǐng)材料過多，而且有很多不規(guī)范，因此往往不能在這么短的時(shí)間內(nèi)完成。1999年對(duì)于單個(gè)化學(xué)分子藥的審評(píng)時(shí)間平均為12.6個(gè)月。 2.4.2 藥物批準(zhǔn)上市 上述任何

21、一步反饋得到的結(jié)果不好，都有可能讓一個(gè)候選藥物胎死腹中。最凄慘的結(jié)果可能是這個(gè)項(xiàng)目就直接被取消了。能夠通過全部3期臨床評(píng)價(jià)而上市的新藥越來越少，部分緣由是開發(fā)出比市場(chǎng)上現(xiàn)有藥物綜合評(píng)價(jià)更好的新藥越來越難。假如能夠走到這一步，那么臨時(shí)可以說是大功告成了。從最開頭的備選化合物走到這一步的藥物寥寥無幾。但是批準(zhǔn)上市了并不代表這個(gè)藥物就高枕無憂了。由于還有后面一步。新藥研制成功率是很低的，大約5000種化合物中被評(píng)估的只有5種可以進(jìn)入臨床試驗(yàn)階段，而大約只有1種會(huì)被批準(zhǔn)。2.5 IV期臨床爭(zhēng)辯 藥物上市后監(jiān)測(cè)。主要關(guān)注藥物在大范圍人群應(yīng)用后的療效和不良反應(yīng)監(jiān)測(cè)。藥物使用知道（其實(shí)就是說明書的增補(bǔ)）需要

22、依據(jù)這一階段的結(jié)果來相應(yīng)修訂。這一階段還會(huì)涉及到的一些內(nèi)容有，藥物配伍使用的爭(zhēng)辯，藥物使用禁忌（比如有些藥物上市就發(fā)覺服藥期間服用西柚會(huì)影響藥物的代謝）。假如批準(zhǔn)上市的藥物在這一階段被發(fā)覺之前爭(zhēng)辯中沒有發(fā)覺的嚴(yán)峻不良反應(yīng)，比如顯著增加服藥人群心血管疾病發(fā)生率之類的，藥物還會(huì)被監(jiān)管部門強(qiáng)制要求下架。有的藥物甚至才上市一年，由于4期臨床評(píng)價(jià)不好而被迫下架。FDA要求的附加的上市后試驗(yàn)，包括試驗(yàn)室和動(dòng)物試驗(yàn)，試驗(yàn)人群：2080例健康志愿者、100300例病患志愿者、10003000例病患試驗(yàn)者。試驗(yàn)?zāi)康臑樵u(píng)定藥物平安性和生物活性，確定藥物平安性和劑量，評(píng)估藥物有效性，查找副作用，驗(yàn)證藥物有效性，監(jiān)控

23、長(zhǎng)期使用的不良反應(yīng)。三、模擬創(chuàng)新對(duì)新藥研發(fā)的作用 “十一五”方案的“重大新藥創(chuàng)制”科技重大專項(xiàng)已經(jīng)如火如荼地開放,與醫(yī)藥、生物學(xué)和化學(xué)相關(guān)的爭(zhēng)辯院所、高校和企業(yè)都以空前的熱忱樂觀投入到申請(qǐng)、答辯和即將實(shí)施的浪潮中。我國(guó)政府對(duì)新藥的創(chuàng)制從來沒有這樣大的投入。然而,我國(guó)的新藥研發(fā)剛剛由仿制轉(zhuǎn)向創(chuàng)制的道路,制藥企業(yè)的創(chuàng)新剛剛起步, 力量較弱,以致新藥的爭(zhēng)辯主要集中在爭(zhēng)辯院所和高校中。然而 ,作為技術(shù)創(chuàng)新的藥物研發(fā)應(yīng)以企業(yè)為核心,這種嚴(yán)峻的錯(cuò)位導(dǎo)致我國(guó)新藥爭(zhēng)辯與開發(fā)的脫節(jié)。爭(zhēng)辯院所和高校的目標(biāo)設(shè)定、價(jià)值取向和評(píng)價(jià)體系與企業(yè)有很大區(qū)分,事實(shí)表明高校和爭(zhēng)辯所的爭(zhēng)辯項(xiàng)目往往脫離企業(yè)和市場(chǎng)的需求,難以與開發(fā)接

24、軌。所以,盡管國(guó)家提倡甚至規(guī)定產(chǎn)學(xué)研相結(jié)合, 但難以克服由于體制問題所造成的沖突,這是我國(guó)研發(fā)新藥速度慢、成功率低以及藥物的質(zhì)量不高的主要緣由。所以,需要在“重大新藥創(chuàng)制”的專項(xiàng)行動(dòng)中調(diào)整思路,理順關(guān)系,切實(shí)落實(shí)創(chuàng)制新藥的目標(biāo)，而新藥創(chuàng)制應(yīng)以模擬創(chuàng)新為主。3.1 首創(chuàng)性藥物和模擬創(chuàng)新藥物依據(jù)藥物作用靶標(biāo)的新穎程度可將創(chuàng)新藥物分為兩類,即首創(chuàng)性藥物和模擬創(chuàng)新藥物。這兩類藥物的研發(fā)目標(biāo)雖然都是具有學(xué)問產(chǎn)權(quán)和有市場(chǎng)潛力,但起步點(diǎn)和涉及的技術(shù)方法有所不同。首創(chuàng)性藥物的作用靶標(biāo)是全新的、首次發(fā)覺的生物大分子,是從發(fā)覺新的靶標(biāo)并通過確證而起始的研發(fā)項(xiàng)目,是由生物學(xué)爭(zhēng)辯為原動(dòng)力,所以可認(rèn)為首創(chuàng)性藥物是生物學(xué)

25、驅(qū)動(dòng),目標(biāo)是創(chuàng)制作用于新的靶標(biāo)、新的作用環(huán)節(jié)和作用機(jī)制的新化學(xué)實(shí)體。由于發(fā)覺與疾病相關(guān)的基因及其表達(dá)產(chǎn)物, 并確證與病理過程相關(guān)、成為藥物干預(yù)的靶標(biāo),是格外困難的應(yīng)用基礎(chǔ)爭(zhēng)辯項(xiàng)目,投入巨大,持續(xù)時(shí)間長(zhǎng),風(fēng)險(xiǎn)大。模擬創(chuàng)新藥物是指研制藥物的作用靶標(biāo)是已知的,而且靶標(biāo)結(jié)構(gòu)也可能明確,還由于有已知的活性化合物或藥物作為參考,可進(jìn)行結(jié)構(gòu)模擬或依據(jù)藥效團(tuán)進(jìn)行設(shè)計(jì)。所以,模擬創(chuàng)新藥物是以化學(xué)作為驅(qū)動(dòng)爭(zhēng)辯的。研發(fā)的藥物可認(rèn)為是仿照性的跟進(jìn)(me-too),或是優(yōu)于已有的類似藥物(me-better)。這種研發(fā)模式的問題是當(dāng)一個(gè)新靶標(biāo)被披露,或相應(yīng)的藥物進(jìn)入臨床或上市后,往往有眾多的研發(fā)跟進(jìn),因此競(jìng)爭(zhēng)激烈,研制

26、的化學(xué)空間較小,新藥上市后的市場(chǎng)空間也比較擁擠。研制模擬創(chuàng)新藥物的關(guān)鍵是速度和對(duì)已有藥物的超越。表1比較了首創(chuàng)性藥物與模擬創(chuàng)新藥物的區(qū)分。3.2 分子骨架和藥效團(tuán)概念是藥物模擬創(chuàng)新的基礎(chǔ) 藥物分子可認(rèn)為是由藥效團(tuán)和結(jié)構(gòu)骨架構(gòu)成的,藥效團(tuán)是藥物呈現(xiàn)特定藥理作用所必需的物理化學(xué)特征及其在空間的分布,這些物化特征是由不連續(xù)的離散的原子、基團(tuán)或片斷所構(gòu)成,如正電荷、負(fù)電荷、氫鍵給體、氫鍵接受體、疏水中心和芳環(huán)質(zhì)心等。藥效團(tuán)需結(jié)合在分子骨架上,形成具體的分子。骨架可認(rèn)為是藥效團(tuán)的“賦形劑”,具有連續(xù)性的特征。相同的藥效團(tuán)附著在不同的分子骨架上,構(gòu)成了作用于同一靶標(biāo)而結(jié)構(gòu)多樣的化合物。受體的柔性和可塑性,

27、形成了 “雜亂性”空間,體現(xiàn)為受體結(jié)合部位的多重性,因而可容納結(jié)構(gòu)多樣的配體(藥物)分子。分析模擬創(chuàng)新藥物與首創(chuàng)藥物的結(jié)構(gòu)特征,可認(rèn)為是在保持藥效團(tuán)前提下,變換結(jié)構(gòu)骨架,或者不轉(zhuǎn)變骨架,只變換骨架上的某些原子或基團(tuán)。保持藥效團(tuán)不變,保障和維系了特定的藥理活性;變換分子骨架,賜予了分子新的性質(zhì),例如改善藥動(dòng)學(xué)性質(zhì)或物化性質(zhì),有利于發(fā)揮藥效,同時(shí),新的骨架體現(xiàn)了結(jié)構(gòu)的新穎性,具有自主學(xué)問產(chǎn)權(quán)。3.3 結(jié)構(gòu)骨架變換的方式模擬創(chuàng)新藥物的分子設(shè)計(jì),主要是骨架的變換,變換的方式很多,可歸納為3個(gè)層次:以電子等排原理變換骨架結(jié)構(gòu);以優(yōu)勢(shì)結(jié)構(gòu)為導(dǎo)向的變換骨架結(jié)構(gòu);以結(jié)構(gòu)-活性演化的方式進(jìn)行骨架遷越。電子等排置

28、換是藥物化學(xué)和分子設(shè)計(jì)的經(jīng)典方法,包括原子、基團(tuán)和環(huán)系之間的變環(huán)?？?jié)兯幬颒+/K+-ATP酶抑制劑奧美拉唑作為首創(chuàng)藥物上市后不久,模擬性藥物蘭索拉唑和泮妥拉唑相繼問世。變換的方式是用氟原子替換氫,避開了原創(chuàng)的專利。而且蘭索拉唑的藥動(dòng)學(xué)性質(zhì)強(qiáng)于奧美拉唑,泮妥拉唑用二氟甲氧基代替奧美拉唑的甲氧基,提高了代謝穩(wěn)定性。 組氨H2受體阻斷劑的首創(chuàng)藥物是西咪替丁,是以組胺為動(dòng)身點(diǎn),經(jīng)藥物化學(xué)的結(jié)構(gòu)衍變研發(fā)的卓越范例,其后繼的模擬創(chuàng)新藥物如雷尼替丁和法莫替丁等,分別是用呋喃和噻唑環(huán)代替了西咪替丁的咪唑環(huán),同時(shí)對(duì)側(cè)鏈的取代基作適當(dāng)?shù)淖儞Q以調(diào)整分子的堿性,使得模擬創(chuàng)新藥超越了首創(chuàng)分子。優(yōu)勢(shì)結(jié)構(gòu)是藥物化學(xué)的另

29、一個(gè)概念,其定義是“一個(gè)結(jié)構(gòu)骨架可構(gòu)成與多種受體相結(jié)合的配體分子”。治療男性勃起障礙的磷酸二酯酶5抑制劑西地那非是首創(chuàng)藥物,雖是偶然發(fā)覺的,卻具有劃時(shí)代的意義。伐地那非是將母核骨架異嘌呤的氮原子易位,成為新的骨架 ,烏地那非是韓國(guó)2005上市的模擬新藥,其藥效學(xué)強(qiáng)度和選擇性以及藥動(dòng)學(xué)性質(zhì)均優(yōu)于西地那非, 且研發(fā)的時(shí)間與成本也低于西地那非。骨架遷越最初是用計(jì)算技術(shù)在已知的數(shù)據(jù)庫中查找與苗頭化合物完全不同的拓?fù)涔羌?但仍舊保持有原來的生物活性。現(xiàn)今已不限于計(jì)算的方法,藥物化學(xué)家在用傳統(tǒng)的類似物設(shè)計(jì)方法設(shè)計(jì)全新骨架,實(shí)現(xiàn)骨架的遷越。鈉葡萄糖協(xié)同轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白2是治療2型糖尿病的藥物靶標(biāo),最初發(fā)覺SGLT抑

30、制劑是自然產(chǎn)物二氫查耳酮根皮苷,經(jīng)骨架遷越將苯酚環(huán)變成苯并呋喃得到T-1095,現(xiàn)處于II期臨床爭(zhēng)辯。Sergliflozin是將自然產(chǎn)物的2個(gè)苯環(huán)距離縮短成一個(gè)碳原子,為碳酸酯前藥,處于II期臨床爭(zhēng)辯。Dapagliflozin模擬Sergliflozin的二苯甲基骨架,但將O-葡萄糖苷變換成 C-糖苷,提高了穩(wěn)定性,現(xiàn)處于III期臨床爭(zhēng)辯階段?；衔?6是通過螺環(huán)將糖環(huán)固定,對(duì)構(gòu)象加以限制 ,并成為新結(jié)構(gòu)類型的SGLT抑制劑。右芬氟拉明為5HT2C受體感動(dòng)劑,最初批準(zhǔn)上市為減肥藥,但一年后(1997)被終止使用,系因使心臟瓣膜發(fā)生變形的嚴(yán)峻不良反應(yīng)。后來證明心臟瓣膜的不良反應(yīng)是由于右芬氟拉

31、明同時(shí)對(duì)5HT2B的感動(dòng)作用,所以,消退右芬氟拉明感動(dòng)5HT2B的作用,提高對(duì) 5HT2C亞型的選擇性活性,是研發(fā)減肥藥的途徑。為此,對(duì)右芬氟拉明加以構(gòu)象限制,得到苯并氮雜化合物lorcaserin ,它對(duì)5HT2C的選擇性作用強(qiáng)于5HT2B 100倍,每日口服10mg,bid ,連續(xù)1年可降低體重3.6kg ,未見心臟瓣膜的變化,目前處于III期臨床爭(zhēng)辯。4、 現(xiàn)代生物學(xué)帶動(dòng)新藥的研發(fā)4.1 現(xiàn)代“組學(xué)”與藥物發(fā)覺 20世紀(jì)下半葉以來,生命科學(xué)的爭(zhēng)辯成果日益 成為人們關(guān)注的科學(xué)焦點(diǎn)?；蚪M學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)和代謝組學(xué)等現(xiàn)代“組學(xué)”學(xué)科漸漸形成并快速進(jìn)展和完善,這些學(xué)科從分別基因(DNA

32、)、蛋白質(zhì)、RNA(mRNA)、代謝產(chǎn)物等多個(gè)層面對(duì)藥物發(fā)覺過程產(chǎn)生深遠(yuǎn)的影響。 4.1.1基因組學(xué)與藥物發(fā)覺人類基因組方案的實(shí)施和完成供應(yīng)了更多基因變異與藥物個(gè)體效應(yīng)差異之間的關(guān)聯(lián)證據(jù),特殊是人類基因組全序列物理圖譜的描繪,以及大量藥物作用相關(guān)基因的克隆與鑒定、單核苷酸多態(tài)性(SNP)的檢測(cè)與發(fā)覺,大規(guī)?；蚍中图夹g(shù)、DNA測(cè)序技術(shù)及生物信息學(xué)的快速進(jìn)展,為從基因水平爭(zhēng)辯藥物反應(yīng)的個(gè)體差異供應(yīng)了物質(zhì)基礎(chǔ)和技術(shù)支持。這些爭(zhēng)辯成果為藥物發(fā)覺提出了新的模式,即從基因功能到藥物?；虮磉_(dá)是大部分機(jī)體對(duì)異質(zhì)物反應(yīng)的樞紐。近年來通過聯(lián)合應(yīng)用基因組表達(dá)譜與信號(hào)網(wǎng)絡(luò)分析,爭(zhēng)辯比較基因組在疾病發(fā)生與進(jìn)展過程中

33、以及藥物干預(yù)前后基因組表達(dá)轉(zhuǎn)變,提示疾病相關(guān)的易感基因和藥物靶點(diǎn)共表達(dá)的新序列,極大地促進(jìn)了藥物作用新靶點(diǎn)的發(fā)覺。特殊是針對(duì)單基因疾病,基因組爭(zhēng)辯對(duì)發(fā)覺預(yù)防和治療疾病的靶標(biāo)格外有利并有助于治療藥物的分子設(shè)計(jì)。由于體內(nèi)單一基因變異的不行預(yù)見性經(jīng)常直接導(dǎo)致臨床藥物療效的不行猜測(cè)性。人類基因組序列的變異促使藥物基因組學(xué)(pharmacogenomics)的形成而成為基因組學(xué)爭(zhēng)辯的另一亮點(diǎn)。藥物基因組學(xué)以提高藥物療效及平安性為目標(biāo),爭(zhēng)辯個(gè)體遺傳學(xué)特性如何影響機(jī)體對(duì)藥物的反應(yīng),包括基因變異所致的不同患者對(duì)藥物的反應(yīng)性差異,以及導(dǎo)致藥物在不同人群中消滅吸取、轉(zhuǎn)運(yùn)、代謝和消退差異的基因特性,從而指導(dǎo)藥物開發(fā)

34、過程以及臨床合理用藥。藥物基因組學(xué)的主要爭(zhēng)辯策略是選擇與藥物代謝、活化以及排泄等過程相關(guān)的候選基因,分析基因序列的變異性對(duì)藥物作用的影響。藥物基因組學(xué)的進(jìn)展依靠于高度靈敏的基因變異檢測(cè)和分析技術(shù),包括以 DNA 芯片、生物統(tǒng)計(jì)分析技術(shù)和基于SNP爭(zhēng)辯的高通量篩選技術(shù)等。值得留意的是,在藥物發(fā) 現(xiàn)過程中,藥物基因組學(xué)爭(zhēng)辯也面臨以下挑戰(zhàn): (1) 受藥物調(diào)整或影響的候選基因的精確定義以及信號(hào)網(wǎng)絡(luò)途徑的合理分析;(2)疾病相關(guān)基因與藥物反應(yīng)基因的相關(guān)性; (3)藥物反應(yīng)表型的精確定義; (4)大規(guī)模藥物反應(yīng)數(shù)據(jù)及有關(guān)資料的分析方法的建立和相關(guān)技術(shù)與道德倫理問題。只有充分而妥當(dāng)處理好上述問題,才能合理

35、地將藥物基因組學(xué)爭(zhēng)辯運(yùn)用于藥物發(fā)覺過程,推動(dòng)個(gè)體化治療藥物的爭(zhēng)辯與開發(fā)。目前,基因組學(xué)爭(zhēng)辯已廣泛應(yīng)用于抗癌藥物、抗菌藥物、抗HIV藥物以及治療神經(jīng)系統(tǒng)和心血管系統(tǒng)疾病的藥物發(fā)覺過程。 4.1.2 蛋白質(zhì)組學(xué)與藥物發(fā)覺由于大多數(shù)核 酸具有同源性并與機(jī)體很多正常功能有著廣泛的聯(lián)系,因而作用于DNA的藥物往往選擇性差,且經(jīng)常伴有嚴(yán)峻的細(xì)胞毒性; 而且疾病的特征通常主要表現(xiàn)在蛋白層面,因此,單一的藥物基因組學(xué)爭(zhēng)辯很難獲得突破性進(jìn)展。蛋白質(zhì)是基因表達(dá)的終產(chǎn)物,只有完全注釋基因組序列所編碼的蛋白功能,才能真正實(shí)現(xiàn)基因組爭(zhēng)辯的價(jià)值。蛋白質(zhì)組學(xué)是爭(zhēng)辯生物機(jī)體、組織或細(xì)胞甚至亞細(xì)胞器基因編碼的全部蛋白,包括蛋白

36、組成、種類、分布、功能、代謝特征及其動(dòng)態(tài)變化規(guī)律等?；蚪M爭(zhēng)辯結(jié)果提示,人類至少包含數(shù)萬個(gè)基因表達(dá)數(shù)十萬蛋白。其中很多蛋白很可能是把握人類疾病發(fā)生與進(jìn)展的關(guān)鍵執(zhí)行體,因此很有可能成 為藥物作用的潛在靶點(diǎn)。而且,目前已知的約500個(gè)藥物作用靶點(diǎn)中(不包括抗菌、抗病毒、抗寄生蟲 藥的作用靶點(diǎn)) ,主要是受體、酶類、離子通道和核受體等,其中90%的靶點(diǎn)為蛋白質(zhì)。蛋白質(zhì)組學(xué)爭(zhēng)辯通過組織或細(xì)胞樣品抽提、兩維(2D)凝膠電泳分別、結(jié)合色譜與質(zhì)譜(MS)技術(shù)、圖象處理與數(shù)據(jù)分析技術(shù)以及生物信息技術(shù)等,全面檢測(cè)疾病發(fā)生與 進(jìn)展過程以及藥物干預(yù)過程中,蛋白質(zhì)表達(dá)譜和蛋白質(zhì)蛋白質(zhì)相互作用的變化,從而發(fā)覺影響疾病或

37、藥物作用的關(guān)鍵蛋白,并對(duì)這些蛋白進(jìn)行一級(jí)結(jié)構(gòu)和三維結(jié)構(gòu)測(cè)定, 綜合分析其生物學(xué)功能, 推想新的、潛在的藥物作用靶標(biāo)。蛋白質(zhì)組學(xué)爭(zhēng)辯不僅為發(fā)覺藥物作用潛在靶點(diǎn)供應(yīng)可能,同時(shí)也能提高已發(fā)覺的藥物作用下游大事的效率,并促進(jìn)人們依據(jù)蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)及其變化規(guī)律合理設(shè)計(jì)藥物或?qū)ζ溥M(jìn)行結(jié)構(gòu)改造。因此,蛋白質(zhì)組學(xué)是基因組和藥物發(fā)覺的橋梁和紐帶。近年來,人們依據(jù)蛋白質(zhì)組學(xué)在藥物爭(zhēng)辯中的應(yīng)用提出了藥物蛋白質(zhì)組學(xué)(pharmacoproteomics)或稱化學(xué)基因組學(xué)(chemogenom ics)。其爭(zhēng)辯內(nèi)容 包括基礎(chǔ)和臨床兩個(gè)方面:基礎(chǔ)爭(zhēng)辯主要包括藥物靶點(diǎn)的發(fā)覺與確認(rèn)、候選化合物的篩選、藥物臨床前評(píng)價(jià)以及藥物作

38、用機(jī)制的探討等;臨床爭(zhēng)辯主要包括將疾病特異性蛋白作為有效藥物選擇的依據(jù)和臨床疾病診斷的標(biāo)志物,以及臨床患者的個(gè)體化治療。此外,化學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)(chemoproteomics)和 結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)組學(xué)(structural proteomics)在藥物發(fā)覺過程中也有著重要的應(yīng)用價(jià)值。化學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)是利用特定的化學(xué)小分子探針爭(zhēng)辯靶蛋白的生物學(xué)功能,或通過篩選小分子配體與蛋白的結(jié)合驗(yàn)證可能的靶。結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)組學(xué)旨在為全部蛋白供應(yīng)三維結(jié)構(gòu)信息并為大量未注釋蛋白的功能爭(zhēng)辯供應(yīng)線索。化學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)組學(xué)能夠掛念生疏某種 蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu),預(yù)示其生物學(xué)功能,并評(píng)價(jià)其作用藥物靶標(biāo)的潛能,從而實(shí)現(xiàn)對(duì)藥靶的發(fā)覺和確認(rèn)

39、,并提 高藥物篩選的成功率。目前,蛋白質(zhì)組學(xué)已經(jīng)成功用于腫瘤、糖尿病、艾滋病、關(guān)節(jié)炎、心血管疾病等多種疾病相關(guān)蛋白的檢測(cè),為發(fā)覺和確認(rèn)治療這些 疾病的藥物靶標(biāo),以及篩選相關(guān)候選化合物供應(yīng)有力的工具。 4.1.3 轉(zhuǎn)錄組學(xué)與藥物發(fā)覺轉(zhuǎn)錄組(transcriptome)是指一個(gè)細(xì)胞內(nèi)的一整套mRNA轉(zhuǎn)錄物,包含在生理或病理狀態(tài)下,生命體的細(xì)胞或組織在某一環(huán)境條件、某一生命階段所表達(dá)的全部基因種類以及表達(dá)水平。轉(zhuǎn)錄組學(xué)(transcriptomics)爭(zhēng)辯可以精確反映基因表達(dá)的時(shí)空性,以及機(jī)體組織細(xì)胞對(duì)內(nèi)/外環(huán)境變化的反應(yīng)性和適應(yīng)性。轉(zhuǎn)錄組學(xué)通過分析轉(zhuǎn)錄譜中的共調(diào)整基因,闡明基因選擇性表達(dá)所依靠的簡(jiǎn)

40、單調(diào)控信號(hào)網(wǎng)絡(luò),提示基因組中與某一生命現(xiàn)象或病理狀態(tài)相關(guān)的基因;基于這些信號(hào)網(wǎng)絡(luò)查找和發(fā)覺調(diào)控基因的未知生物學(xué)功能,提示藥物潛在的作用靶點(diǎn)及其發(fā)揮作用的分子機(jī)制。轉(zhuǎn)錄組學(xué)爭(zhēng)辯的主要技術(shù)手段主要是基因芯片技術(shù),其主要分析方法包括隨機(jī) cDNA測(cè)序、mRNA呈現(xiàn)和差異雜交等。轉(zhuǎn)錄組學(xué)爭(zhēng)辯在藥物發(fā)覺過程中 也具有重要的應(yīng)用價(jià)值,包括藥物靶點(diǎn)的探究與發(fā)覺、指導(dǎo)新藥設(shè)計(jì)與合成、新藥篩選等。 4.1.4 代謝組學(xué)與藥物發(fā)覺機(jī)體代謝物的動(dòng)態(tài)變化可以敏感地反映機(jī)體對(duì)外源性化合物的反應(yīng)性,并提示機(jī)體的生理或病理狀態(tài)。代謝產(chǎn)物譜包含豐富的生物學(xué)信息,這些信息可以反映或提示機(jī)體對(duì)藥物的代謝途徑、代謝特點(diǎn)以及藥物對(duì)機(jī)

41、體整體的影響。1999年英國(guó)教授Nicholson等在NMR分析的基礎(chǔ)上首次正式提出代謝組(metabonom ics)學(xué)概念(Nicholson.2002)。代謝組學(xué)的主要爭(zhēng)辯對(duì)象是生物體液(包括尿液、血液、汗液、膽汁、腦脊液 等)細(xì)胞提取物以及組織提取物,動(dòng)態(tài)評(píng)價(jià)機(jī)體生物液體中內(nèi)源性和/或外源性代謝產(chǎn)物的濃度與功能,即代謝產(chǎn)物譜的變化,從而動(dòng)態(tài)評(píng)價(jià)藥物對(duì)機(jī)體產(chǎn)生的生物學(xué)作用及機(jī)體的反應(yīng)性。代謝組學(xué)通過分析機(jī)體生物液體和組織中代謝產(chǎn)物譜的變化,爭(zhēng)辯機(jī)體整體生物學(xué)狀況及其功能調(diào)整。代謝組學(xué)與其它“組學(xué)”相互聯(lián)系,共同提示生命現(xiàn)象的本質(zhì)。然而,盡管基因組學(xué) /轉(zhuǎn)錄組學(xué)或 蛋白質(zhì)組學(xué)爭(zhēng)辯可以直接或

42、間接反映外 /內(nèi)環(huán)境改 變對(duì)機(jī)體所產(chǎn)生的生物學(xué)效應(yīng),但這種效應(yīng)很難從 整體上反映機(jī)體的終點(diǎn)狀態(tài)。例如,有些藥物可以直接影響基因的表達(dá)與調(diào)控,但由于在基因多態(tài)性、 機(jī)體代償性機(jī)制等很多因素的影響下,有時(shí)候藥物對(duì)機(jī)體所產(chǎn)生的生物學(xué)效應(yīng)與基因和蛋白表達(dá)并沒 有明顯的相關(guān)性。在這種狀況下,基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)或蛋白質(zhì)組學(xué)爭(zhēng)辯就不能比較精確地反應(yīng)機(jī)體的最終反應(yīng)性。代謝產(chǎn)物是機(jī)體繼基因激活、轉(zhuǎn)錄、翻譯、翻譯后修飾等一系列生命活動(dòng)之后的最終信號(hào)載體之一。因此,代謝組學(xué)爭(zhēng)辯有可能更為精確而全面地揭示藥物對(duì)機(jī)體所產(chǎn)生的生物學(xué)效應(yīng)以及機(jī)體對(duì)藥物的作用。代謝組學(xué)通過分析與藥物作用親密相關(guān)的生物液體中內(nèi)源性代謝產(chǎn)物濃度

43、,比對(duì)藥物不同作用劑量以及不同作用時(shí)間機(jī)體代謝產(chǎn)物譜特征,從而為查找藥物的作用靶點(diǎn),探究藥物作用機(jī)制以及疾病早期診斷的生物標(biāo)志物供應(yīng)有力工具, 成為基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)爭(zhēng)辯的有力補(bǔ)充。此外,代謝組學(xué)技術(shù)還可以廣泛地參與藥物的早期藥理學(xué)活性及毒性篩選、先導(dǎo)化合物的選擇與優(yōu)化,以及藥物臨床前平安性評(píng)價(jià)。4.2 高通量篩選和高內(nèi)涵篩選與藥物發(fā)覺 隨著組合化學(xué)、計(jì)算機(jī)幫助藥物設(shè)計(jì)、自然產(chǎn)物分別純化等技術(shù)的快速進(jìn)展,后基因組時(shí)代消滅大量的候選化合物,而人類基因組方案和蛋白質(zhì)組爭(zhēng)辯不斷發(fā)覺大量新的潛在藥物靶標(biāo)。制藥工業(yè)迫切需要對(duì)這些新的候選物進(jìn)行藥效學(xué)、藥代動(dòng)力學(xué)、毒理學(xué)等多方面的快速規(guī)?；Y選

44、,同時(shí)對(duì)可能的藥物靶標(biāo)進(jìn)行驗(yàn)證和確認(rèn)。因此,構(gòu)建快速高效的藥物篩選體系和新的技術(shù)方法成為藥物發(fā)覺領(lǐng)域的爭(zhēng)辯熱點(diǎn)。近年來,高通量篩選(high throughput screening, HTS)、高內(nèi)涵篩選(high content screening, HCS)技術(shù)已經(jīng)成功應(yīng)用于藥物的發(fā)覺過程。 4.2.1 高通量篩選在藥物發(fā)覺中的應(yīng)用HTS是上世紀(jì)末開頭興起的藥物篩選新技術(shù)體系。HTS主要依靠于體外細(xì)胞和分子水平的篩選模型,可在短時(shí)間內(nèi)實(shí)現(xiàn)樣品的高度自動(dòng)化大規(guī)模篩選,這一 篩選過程又被稱為反向藥理學(xué)。HTS篩選的靶點(diǎn)包括受體、酶、離子通道等,其常用檢測(cè)技術(shù)有基于受體配體結(jié)合試驗(yàn)的同位素標(biāo)記

45、法、酶底物法、報(bào)告基因法、熒光探針標(biāo)記法等。與傳統(tǒng)藥物篩選方式相比,HTS具有明顯的優(yōu)勢(shì),主要體現(xiàn)在: (1)微量篩選,節(jié)省資源: HTS一般僅需微克(g)樣品便可對(duì)候選物進(jìn)行篩選,從而大量削減試驗(yàn)耗材;(2)有效利用藥用資源,提高藥物發(fā)覺機(jī)率: HTS實(shí)現(xiàn)了藥物 篩選的規(guī)?；?并可通過一藥多篩,充分挖掘藥物的 可能藥用價(jià)值; (3)高度自動(dòng)化,操作便捷: HTS主 要接受計(jì)算機(jī)進(jìn)行操作把握,削減人為操作誤差率 并提高試驗(yàn)結(jié)果的精確性。HTS通常包括候選化合 物和篩選模型(通常是單一的藥物靶標(biāo))的選擇;候選物對(duì)藥靶藥理學(xué)作用的初步篩選; 然后選擇具有活性的候選物對(duì)其進(jìn)行復(fù)篩,重點(diǎn)爭(zhēng)辯該候選物與

46、藥靶作用的強(qiáng)度、量效關(guān)系以及作用特征等; 此后,依據(jù)樣品初篩和復(fù)篩的結(jié)果,再選擇其中某個(gè)或某些特定候選物進(jìn)行深化篩選,包括候選物對(duì)藥物作用的基本細(xì)胞毒性、選擇性強(qiáng)弱、可能作用機(jī)制、與同類化合物的比較爭(zhēng)辯等。近幾年,HTS技術(shù)進(jìn)一步微量化和自動(dòng)化,形成超高通量篩選(ultra high throughput screening,uHTS)。uHTS接受微量化技術(shù)和更靈敏的檢測(cè)方法以及高度自動(dòng)化進(jìn)樣系統(tǒng)與 數(shù)據(jù)管理系統(tǒng),進(jìn)一步提高藥物篩選的效率并降低成本。檢測(cè)微量化和操作自動(dòng)化是 uHTS的關(guān)鍵技術(shù)。目前 uHTS檢測(cè)所需樣品體積為pL水平,每日篩樣量可高達(dá)10萬次以上。 4.2.2 高內(nèi)涵篩選在

47、藥物發(fā)覺中的應(yīng)用然而,經(jīng)典的HST僅基于孔的單一藥物靶標(biāo)檢測(cè),所獲得數(shù)據(jù)仍舊有限,而且初篩所獲得陽性結(jié)果還需進(jìn)一步確認(rèn),而陰性結(jié)果簡(jiǎn)潔忽視候選物的可能作用。 因此,高通量、多靶點(diǎn)地對(duì)候選物進(jìn)行活性評(píng)價(jià)成為藥物篩選的進(jìn)展方向。HCS是指在保持細(xì)胞結(jié)構(gòu)和功能完整的條件下,盡可能同時(shí)檢測(cè)被篩選樣品對(duì)細(xì)胞生長(zhǎng)、分化、遷移、凋亡、代謝途徑及信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)等多個(gè)環(huán)節(jié)的影響,涉及的靶點(diǎn)包括細(xì)胞的膜受體、胞內(nèi)成分、細(xì)胞器和離子通道等,即從單一試驗(yàn)中獲得大量與候選物藥理學(xué)活性相關(guān)的信息及其潛在的毒性作用。HCS是一種基于細(xì)胞層面的、多元的藥物篩選方法,它主要依靠于高辨別率的細(xì)胞成像系統(tǒng),充分整合樣品制備技術(shù)、自動(dòng)化設(shè)

48、備、數(shù)據(jù)管理系統(tǒng),檢測(cè)試劑,生物信息學(xué)等資源的綜合優(yōu)勢(shì),在細(xì)胞或分子水平上實(shí)現(xiàn)對(duì)候選物的多元化、快速化 和規(guī)?；Y選?；诩?xì)胞的篩選有如下優(yōu)點(diǎn):不需要純化靶蛋白;在細(xì)胞中靶蛋白的構(gòu)象、活性以及生物學(xué)功能更接近于自然生理狀態(tài);對(duì)于有細(xì)胞毒性的化合物,用細(xì)胞爭(zhēng)辯化合物的作用可以觀看到化合物的毒性;化合物可能不能夠跨過細(xì)胞膜到達(dá)細(xì)胞內(nèi)的靶,基于細(xì)胞的篩選將剔出這些藥物。因此,經(jīng)過HCS篩選得到的陽性化合物(hits)和先導(dǎo)化合物(leads)更牢靠,并能有效地克服HTS成功率低的缺陷,使?fàn)庌q人員可以在新藥發(fā)覺早期階段就獲得候選化合物對(duì)細(xì)胞多重效應(yīng)的具體數(shù)據(jù),包括細(xì)胞信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、細(xì)胞形態(tài)轉(zhuǎn)變和藥物毒性效

49、應(yīng)等。HCS的檢測(cè)載體和所需樣品體積與 HTS沒有明顯的差異,檢測(cè)儀器多接受熒光顯微鏡。目前,HCS已經(jīng)引起了國(guó)際制藥公司的高度重視。有科學(xué)家預(yù)言,在今后的藥物發(fā)覺中HCS將有可能起到關(guān)鍵性作用。 4.3 藥物分子設(shè)計(jì)和虛擬篩選與藥物發(fā)覺 后基因組時(shí)代的藥物分子設(shè)計(jì)進(jìn)展的顯著特點(diǎn)是:計(jì)算機(jī)科學(xué)、生物學(xué)、化學(xué)以及信息科學(xué)的結(jié)合日益緊密,共同推動(dòng)藥物分子設(shè)計(jì)的快速進(jìn)展。藥物分子設(shè)計(jì)主要包括分子模擬和計(jì)算機(jī)幫助藥物設(shè)計(jì)。就設(shè)計(jì)方法而言,藥物分子設(shè)計(jì)包括基于配體的藥物設(shè)計(jì)(ligandbased drug design, LBDD)和基于靶標(biāo)的藥物設(shè)計(jì) (targetsbased drug desig

50、n, TBDD)。LBDD主要依據(jù)現(xiàn)有藥物分子結(jié)構(gòu)、理化性質(zhì)與結(jié)構(gòu)活性關(guān)系(structureactivity relationship, SAR)的分析,聯(lián)合相關(guān)的生物學(xué)信息庫建立定量構(gòu)效關(guān)系(quantitative structureactivity relationship,QSAR)或其它數(shù)學(xué)模型,再依據(jù)這些模型對(duì)新分子結(jié)構(gòu)的化合物進(jìn)行活性猜測(cè),主要是針對(duì)小分子的藥物設(shè)計(jì); TBDD主要是針對(duì)潛在的藥靶(通常為生物大分子,包括受體、酶、核酸等)的空間結(jié)構(gòu),通過 應(yīng)用理論計(jì)算和分子模擬等方法建立小分子藥靶的相互作用,并據(jù)此設(shè)計(jì)與藥靶作用的新分子。組合化學(xué)與計(jì)算機(jī)幫助藥物設(shè)計(jì)是藥物分子設(shè)

51、計(jì)的重 要技術(shù)手段,兩者相互結(jié)合,相互促進(jìn),使人們有可能在短期內(nèi)獲得大量的具有新分子結(jié)構(gòu)的候選化合物。 隨著現(xiàn)代生物學(xué)和藥物分子設(shè)計(jì)的進(jìn)展人們將獲得越來越多的藥物新靶標(biāo)以及新的化合物,假如對(duì)全部靶標(biāo)和化合物都進(jìn)行篩選將是一項(xiàng)格外浩大的工程而耗費(fèi)巨大的人力、物力和財(cái)力。虛擬篩選 (virtual screening, VS)的消滅有可能成為有效解決這一問題的重要技術(shù)之一。虛擬篩選是指利用計(jì)算機(jī)強(qiáng)大的計(jì)算力量,針對(duì)重要疾病治療靶標(biāo)的生物大分子的三維結(jié)構(gòu)或 QSAR模型,接受三維藥效基 團(tuán)模型搜尋或分子對(duì)接(Docking)的方法,從現(xiàn)有化合物數(shù)據(jù)庫中,查找發(fā)覺與靶標(biāo)生物大分子結(jié)合或符合QSAR的化

52、合物。虛擬篩選的目的是從大量化合物中查找發(fā)覺有苗頭的化合物,集中目標(biāo),從而削減待篩選化合物的數(shù)量,縮短爭(zhēng)辯周期,降低爭(zhēng)辯成本。與藥物分子設(shè)計(jì)對(duì)應(yīng)的是,虛擬篩選分別包括基于配體的虛擬篩選(ligandbased virtual screening, LBVS)和基于靶標(biāo)的虛擬篩選(targetbased virtual screening, TBVS)。開展虛擬篩選的前提條件是已知靶標(biāo)的三維結(jié)構(gòu)并獲得配體的三維數(shù)據(jù)庫, 通過分子對(duì)接計(jì)算小分子化合物與大分子靶點(diǎn)的可能作用,再評(píng)分(Scoring)兩者之間的結(jié)合位點(diǎn)并猜測(cè)所選擇化合物與靶標(biāo)的結(jié)合模式以及配體與受體結(jié)合的親和力大小,從而實(shí)現(xiàn)靶標(biāo)的發(fā)覺

53、與確認(rèn),以及先導(dǎo)化合物的優(yōu)化篩選。目前,分子對(duì)接方法可每天虛擬篩選上百萬個(gè)分子,大大提高了化合物的篩選速度和效率。與HTS相比,虛擬篩選具有更為高效、快速和經(jīng)濟(jì)的優(yōu)勢(shì),越來越廣泛地參與藥物發(fā)覺過程中,形成了全新的藥物篩選模式(虛擬篩選-體外篩選-體內(nèi)篩選)。結(jié)構(gòu)生物學(xué)和計(jì)算機(jī)科學(xué)的進(jìn)展正使虛擬篩選成為一種極具吸引力和進(jìn)展前景的藥物篩選方法。4.4 生物芯片在藥物發(fā)覺中的應(yīng)用 生物芯片(biochip,microarray)是指通過在微小基片(硅片或玻璃)表面固定大量的分子識(shí)別探針,或構(gòu)建微分析單元或檢測(cè)系統(tǒng),對(duì)標(biāo)記化合物、核酸、蛋白質(zhì)、細(xì)胞或其他生物組分進(jìn)行精確規(guī)模化的快速篩選或檢測(cè)。目前生物

54、芯片主要包括基因芯片、蛋白質(zhì)芯片、細(xì)胞芯片和組織芯片等。生物芯片已滲入到藥物發(fā)覺的每個(gè)步驟,包括藥靶的發(fā)覺、大規(guī)模化合物生物活性及毒性篩選以及先導(dǎo)化合物的優(yōu)化等,同時(shí)也是基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、代謝組學(xué)爭(zhēng)辯的重要技術(shù)手段,對(duì)推動(dòng)創(chuàng)新藥物爭(zhēng)辯有著重要的影響。藥物靶點(diǎn)發(fā)覺可能是生物 芯片在藥物研發(fā)中應(yīng)用最為廣泛的一個(gè)領(lǐng)域,主要接受DNA芯片和蛋白質(zhì)芯片檢測(cè)某一特定基因或特定蛋白的表達(dá),也可檢測(cè)生物體整個(gè)基因組或蛋白質(zhì)組的表達(dá)狀況,為發(fā)覺可能的藥物靶標(biāo)供應(yīng)有力線索。生物芯片也是HTS的主要技術(shù)手段之一,通過在芯片上固定特定的寡核苷酸、cDNA、靶酶、受體蛋白,甚至還包括電信號(hào)等實(shí)現(xiàn)對(duì)候選化合

55、物的大規(guī)模篩選。目前已經(jīng)有抗體芯片、受體蛋白芯片、 毒理芯片、微流體芯片、芯片膜片鉗等在這一領(lǐng)域的應(yīng)用。生物芯片的顯著優(yōu)勢(shì)是快速靈敏、高通量、微型化和自動(dòng)化。國(guó)外幾乎全部的大型制藥公司和藥物爭(zhēng)辯機(jī)構(gòu)均已將生物芯片應(yīng)用于藥物的開發(fā)過程中,顯示其強(qiáng)大的進(jìn)展勢(shì)力。隨著芯片檢測(cè)特異性和靈敏度的提高、樣品制備和標(biāo)記操作的簡(jiǎn)化以及數(shù)據(jù)分析和處理技術(shù)的進(jìn)一步進(jìn)展,生物芯片必將在藥物發(fā)覺過程中發(fā)揮更重要的作用。表面等離子共振(surface plasmon resonance, SPR)技術(shù)是近年來進(jìn)展起來的一種以芯片為基礎(chǔ)的光同學(xué)物傳感器系統(tǒng),它不需要熒光或放射性標(biāo)記物。分子結(jié)合與分別時(shí)可產(chǎn)生光強(qiáng)度變化,分

56、子結(jié)合到一個(gè)固相化的生物靶分子上,當(dāng)分析物溶液通過傳感器芯片時(shí),結(jié)合到靶分子上的分子可被即時(shí)檢測(cè)?；谶@一原理SPR可廣泛用于微量蛋白的快速篩選或檢測(cè),也適合小于100Da的分子以及完整的細(xì)胞功能爭(zhēng)辯。由于SPR能檢測(cè)到結(jié)合到芯片表面的亞f摩爾的蛋白量,因此SPR技術(shù)的檢測(cè)靈敏度格外高。SPR整合了藥物發(fā)覺過程中陽性化合物先導(dǎo)化合物(hittolead)的信息資源并生成更為深化的生物學(xué)信息。SPR為爭(zhēng)辯蛋白蛋白以 及小分子化合物與蛋白的相互作用供應(yīng)了一項(xiàng)嶄新而有力的技術(shù)手段,從而有助于發(fā)覺和確認(rèn)藥物作用的新靶點(diǎn),并掛念人們深化生疏藥物的作用機(jī)制。同時(shí), SPR技術(shù)也可用于NCEs的高通量快速篩

57、選以及先導(dǎo)化合物的優(yōu)化,QSAR分析,猜測(cè)藥物的吸取、分布、代謝和排泄過程等。 4.5 轉(zhuǎn)基因和RNA干擾與藥物發(fā)覺 轉(zhuǎn)基因技術(shù)通常包括基因敲入(knock in)和基因敲除(knock out)兩種方式,其顯著特點(diǎn)是:分子及細(xì)胞水平操作,組織及動(dòng)物整體水平表達(dá)。轉(zhuǎn)基因技術(shù)的消滅為體內(nèi)爭(zhēng)辯藥物對(duì)機(jī)體整體的作用供應(yīng)了很好的技術(shù)手段,在藥物發(fā)覺過程中其主要應(yīng)用價(jià)值體現(xiàn)在: (1)建立基于特殊疾病的整體動(dòng)物模型,實(shí)現(xiàn)藥物的體內(nèi)活性篩選:轉(zhuǎn)基因技術(shù)可以針對(duì)某些人類疾病(特殊是遺傳性疾病)的病理生理 特點(diǎn),通過基因敲入使特定基因表達(dá)或過表達(dá),或通過基因敲除使特定基因不表達(dá)或表達(dá)很少,從而復(fù)制出與人類疾病類似的動(dòng)物模型。通過這些特殊動(dòng)物模型能夠真實(shí)地反映候選化合物的藥理學(xué)活性及其在體內(nèi)的作用特征;(