研究生課件graphpad prism7作圖教程

1、GraphPad Prism 7作圖科研技能 單元課 03n上海尤里卡信息科技所有特定科研技能的專項科研技能 單元課GraphPad Prism 7 作圖課程目錄1主要功能與界面2折線圖3單維度分組柱形/散點圖4二維度分組柱形圖5生存曲線解 螺 旋|陪 伴 醫(yī) 生 科 研 成 長科研技能 單元課GraphPad Prism 7 作圖主要功能與界面l GraphPad Prism主要功能 數(shù)據(jù)表格界面與Excel相似，可以將數(shù)據(jù)錄入后保存Ø 一個GraphPad Prism文件里可包含多個數(shù)據(jù)表和圖。即可以將同一文章或課題的數(shù)據(jù) 可作多種類型的數(shù)據(jù)圖，基本滿足科研需求一個文件里，方便管

2、理 線圖（XY） 單維度分組圖（Column） 二維度分組圖（Grouped） 生存曲線（Survival） 整體比例（Parts of whole） 提供數(shù)據(jù)分析功能Ø 基本統(tǒng)計：均值、標準差、標準誤等Ø 基本分析：t檢驗、正態(tài)分布、線相關分析等 01科研技能 單元課GraphPad Prism 7 作圖主要功能與界面12雙擊 GraphPad Prism圖標，打開軟件.彈出窗口中可選擇需要制作的圖表類型。主菜單欄快捷菜單欄 本是基于GraphPad Prism 7.0版本顯示所選圖類型的數(shù)據(jù)和圖樣式 選擇圖的主要類型選擇待輸入數(shù)據(jù)的形式 從已有數(shù)據(jù)/文件中打開示例數(shù)據(jù)。

3、可用于練習 創(chuàng)建按鈕 查看使用說明（）更新 取消按鈕 02科研技能 單元課GraphPad Prism 7 作圖課程目錄1主要功能與界面2折線圖3單維度分組柱形/散點圖4二維度分組柱形圖5生存曲線解 螺 旋|陪 伴 醫(yī) 生 科 研 成 長科研技能 單元課GraphPad Prism 7 作圖折線圖l 示例：文獻：PMID: 26565812；Fig 3Cl 模擬數(shù)據(jù) 示例解讀：Ø 4個組別，分別是MGC-803對照、MGC-803 CISD2過表達、SGC-7901對照、SGC-7901過表達；每個組別檢測了0、1、2、3、4、5天的數(shù)據(jù)，每個數(shù)據(jù)有3個重復。 03科研技能 單元課G

4、raphPad Prism 7 作圖折線圖均值，標準差，重復個數(shù)均值，標準誤，重復個數(shù)均值， %變異系數(shù)，重復個數(shù)均值，標準差均值，標準誤，均值，%變異系數(shù)均值（或中位數(shù)），+/-誤差均值（或中位數(shù)），上/下限1在開始頁面中選擇作圖類型。XY圖上，每一點一個X值和一個Y值定義的SD：Standard Deviation，標準差。SEM：Standard Error of Mean，樣本平均數(shù)的標準差。 CV：變異系數(shù)，相當于SD/Mean。如果輸入此項，prism會自動生成SD 誤差棒。 數(shù)字 數(shù)字和誤差值 日期 時間（hh:mm:ss）單值，無重復 有重復，需輸入重復個數(shù) 已統(tǒng)計好的值和誤差

5、選擇“XY”類型選擇數(shù)據(jù)輸入形式：ü X：X軸數(shù)據(jù)形式選擇numbersü Y： Y軸數(shù)據(jù)形式選擇輸入重復數(shù)據(jù)，示例數(shù)據(jù)中是3個重復， 這里填上重復數(shù)“3”點擊“Creat”按鈕，創(chuàng)建數(shù)據(jù)表 線性回歸斜率比較 非線性回歸，單相指數(shù)衰減 劑量反應X軸取劑量的對數(shù)值 計算標準曲線范圍內的未知值 X列輸入的數(shù)據(jù)可識別為日期 X列輸入的數(shù)據(jù)可識別為時間 其他實例數(shù)據(jù)，下拉列表選擇 相關性 04科研技能 單元課GraphPad Prism 7 作圖折線圖 第步選擇不同的數(shù)據(jù)輸入方式，建立的數(shù)據(jù)表格式也會不一樣。如Y的3種方式，數(shù)據(jù)表格式如下：Y軸數(shù)據(jù)區(qū)X軸數(shù)據(jù)區(qū)Y軸，每組僅有1列空格

6、Y軸，每組有3列空格，表示3個重復Y軸，每組有3列空格，分別用于填寫均值、SD值、重復個數(shù)N 05科研技能 單元課例如：選中表格，右鍵，可修改表格名稱， 方便區(qū)分不同的表格GraphPad Prism 7 作圖折線圖左方導航欄可連接至不同的表格，點擊加粗的“表格名稱”，可對應的表格。l 數(shù)據(jù)表和作圖界面 本工作簿里有效工作表列表，可建立多個數(shù)據(jù)表 數(shù)據(jù)表 數(shù)據(jù)表信息 分析結果表 圖 排版布局隱藏或顯示側方導航欄 當前鼠標指針的坐標 下方導航欄放大/縮小視圖 整體瀏覽所有圖/表 點擊可在當前類型的不同表切換 上一或下一表格 顯示有連接關系的表格，如數(shù)據(jù)表和對應的圖標 數(shù)據(jù)表，對應左方導航欄的“D

7、ata Tables”下的被選中表格 圖表，對應左方導航欄的“Graphs” 下被選中的表格 信息表，對應左方導航欄的“Info” 下被選中的表格 分析結果，對應左方導航欄的“Results”下被選中的表格 在當前和上一操作頁面間切換 組圖表，對應左方導航欄的“Layouts”下被選中的表格 06科研技能 單元課GraphPad Prism 7 作圖折線圖1 以中第步選擇第種方案為例，其他兩種操作大同小異，請學員們練習。2輸入數(shù)據(jù)。 X軸名稱Y軸各組名稱 X軸數(shù)據(jù)Y軸各組數(shù)據(jù) 07科研技能 單元課GraphPad Prism 7 作圖折線圖3點擊左方導航欄“Graphs”里跟數(shù)據(jù)表格同名稱的表

8、格，如數(shù)據(jù)表是“MTT”，則這里點擊“MTT”；在彈出窗口中選擇圖的樣式，點擊“OK”。 可以修改圖的大類 可以修改統(tǒng)計方式 95% CI：95%置信區(qū)間 range：范圍，即最大值-最小值。 geometric mean：幾何平均數(shù)。 Median：中位數(shù) 這兩種圖的區(qū)別在于，前者是用3次重復的均值作圖，后者是3次重復的每次重復，因此有3條線。 作圖預覽 08科研技能 單元課GraphPad Prism 7 作圖折線圖4圖例位置修改。 選中圖例 將圖例移動至作圖區(qū)空白處，覺得鼠標拖拽移動，還可以用上下左右按鍵進行微調 X軸標題默認為數(shù)據(jù)表里已填寫的X軸title， 也可以鼠標點擊一下，另行修

9、改生成的圖，標題默認為數(shù)據(jù)表格的“名稱”。數(shù)據(jù)表名稱和與之相連各表的名稱以及圖表的標題是動態(tài)相連的，當數(shù)據(jù)表名稱修改后，跟它相如Data Tables里“Data 1”改名為“MTT”，與之相連的Graphs里的“Data 1”自動跟著改名為“MTT”，圖表標題頁改為“MTT”。作圖的點是軟件自動計算出來的均值。默認上下標的方式，標記了每個點誤差棒（±SD值）。的圖表名稱和圖表標題也會自動改名。 09科研技能 單元課GraphPad Prism 7 作圖折線圖5標題修改。 鼠標點擊一下Y坐標軸標題，即可輸入或修改Y坐標軸標題。 鼠標點擊一下圖表標題，按delete刪掉輸入過的內容如果

10、是以前有輸入過，軟件會有記憶，再輸入的時候會浮出記憶列表，方便直接選擇輸入 10科研技能 單元課GraphPad Prism 7 作圖折線圖6曲線格式修改（1）。雙擊作圖區(qū)（除圖例外的任意位置），在彈出窗口中進行如下設置：下單菜單里選擇MGC-803-vector組Shape 改為黑色實心方形改為1/2 pt，即線條粗細改細一點版本不同，默認的設置可能會不一樣，按作圖設置一下即可 11 如果雙擊某條曲線，則彈出的窗口里，“Data set”里是這條曲線對應的組別科研技能 單元課GraphPad Prism 7 作圖折線圖7曲線格式修改（2）。下單菜單里選擇MGC-803-CISD2組Shape

11、 改為空心方形Color改為白色Border thickness改為1/2 pt Thickness改為1/2 pt下單菜單里選擇SGC-7901-vector組Thickness改為1/2 ptPattern改為虛線 12科研技能 單元課GraphPad Prism 7 作圖折線圖8曲線格式修改（3）。下單菜單里選擇SGC-7901-CISD2Shape改為空心三角形Color改為白色Border thickness改為1/2 pt Thickness改為1/2 pt Pattern改為虛線點擊“OK”按鈕 13科研技能 單元課GraphPad Prism 7 作圖折線圖9坐標軸修改（1）。

12、雙擊X坐標軸，在彈出窗口中進行如下設置： 點擊 Left Y axis 取消 取消 改為700 改為5.5 改為1 改為100點擊OK 14 各項設置的解釋請見下頁科研技能 單元課GraphPad Prism 7 作圖折線圖10文字格式修改。 按住Ctrl+A，選中所有文字；或單擊需要修改的文字 在上方的Text工具盒里可以對文字的大小、字體、加粗、斜體等進行設置 折線圖作圖完成 選中所有文字 選擇需要修改的文字 在實際應用時，圖的文字大小、字體等格式一般可以等組圖大小進行統(tǒng)一的設置， 15科研技能 單元課GraphPad Prism 7 作圖折線圖前面是根據(jù)模仿示例的格式設置的演示。下面一下

13、剛剛這些屬性框，都可以進行哪些方面的設置。11坐標軸格式修改：雙擊坐標軸，即會彈出坐標軸屬性框，可對各項屬性修改。 橫向菜單欄，依次為整體、X軸、Y軸、右方（次要）Y軸、標題與字體 自動決定坐標軸范圍和刻度間隔，默認。如果需要修改坐標軸范圍和刻度間隔，比例，如可選擇轉化為對數(shù)刻度 刻度樣式需要取消此項 坐標軸范圍，即坐標軸起點值和終點值 刻度屬性設置，可分別對刻度的方向、 刻度間隔位置和傾斜角度以及刻度的長度進行設置刻度最大值刻度最小值 可設置在特定的位置增加額外的刻度或在某刻度處畫水平線。如設置在Y=300的地方 刻度方向畫一水平線，顯示為“Tripling”：位置和傾斜角度 刻度長度數(shù)據(jù)顯

14、示方式 小數(shù)位數(shù) 主要刻度間隔 刻度起始位置 兩個主要刻度之間次要刻度點數(shù)這個功能一般在熱圖或IC50檢測實驗里用的比較多 16科研技能 單元課GraphPad Prism 7 作圖折線圖12坐標軸整體格式修改：點擊坐標軸屬性框上方菜單欄中的第一個選項，可對坐標軸的共同屬性進行修改，完成設置后點擊“OK”。 XY軸相交的位置 圖的形狀，如橫向長方形（默認），縱向長方形，正方形或自定義等（可通過在下方直接輸入坐標軸的長度進行設置）以及圖形在頁面中的位置 坐標軸的線條粗細、顏色以及作圖區(qū)顏色、頁面背景顏色設置 邊框設置：默認無邊框；坐標軸是否隱藏；大小網(wǎng)格設置 圖的位置設置在距離頁面左邊緣6.08

15、cm處 圖的位置設置在距離頁面底部邊緣11.85cm處 軟件的界面比較友好，各選項下拉菜單很容易理解, 因為內容太多，本說，大家可自行在軟件上試試無法一一細 17科研技能 單元課GraphPad Prism 7 作圖折線圖13標題與字體格式修改：點擊上方菜單欄中的“Titles & Fonts”選項，可對坐標軸的標題和字體等格式進行修改，完成設置后點擊“OK” 標題格式設置Ø Show Graph Title: 是否顯示標題Ø Font：字體格式設置，也可以從頂部快捷方式設置Ø Distance from top of graph: 標題的位置距離圖的頂部

16、的距離 圖坐標軸標題設置Ø Direction：Y坐標軸標題的方向設置 坐標軸字體和位置的設置 18科研技能 單元課GraphPad Prism 7 作圖折線圖14作圖區(qū)的修改：雙擊作圖區(qū)，彈出屬性窗口，完成設置后點擊“OK” 橫向菜單欄，這里只 選擇需要設置的組別第一個“Appearance”，其余兩項很少用到 數(shù)據(jù)作圖數(shù)據(jù)選擇。我們前面選擇了均值和SD，這里可以切換成其他 數(shù)據(jù)標志顏色、形狀、大小等設置 設置是否顯示數(shù)據(jù)點的垂直線，一般不顯示 設置是否顯示error bars，即± SD以及其顏色，線條粗細，線條類型等 是否顯示連線(數(shù)據(jù)點之間的連線) 是否顯示線下填充

17、 其他設置: 可設置數(shù)據(jù)線的樣式需要設置哪一項，前面的復選框，然后再進行該項設置 19科研技能 單元課GraphPad Prism 7 作圖課程目錄1主要功能與界面2折線圖3單維度分組柱形/散點圖4二維度分組柱形圖5生存曲線解 螺 旋|陪 伴 醫(yī) 生 科 研 成 長科研技能 單元課GraphPad Prism 7 作圖單維度分組柱形圖l 示例：文獻：PMID: 26565812；Fig 1Cl 模擬數(shù)據(jù) 單維度分組柱形圖適合于比較簡單分組的數(shù)據(jù)，各組間的變化或差異，每組可以有1到多個重復 只有Y軸方向上有數(shù)據(jù)，X軸方向沒有；或相反 示例解讀：Ø qPCR檢測了6株細胞里CISD2的m

18、RNA水平 20科研技能 單元課GraphPad Prism 7 作圖單維度分組柱形圖1選擇“File”“New”“New Data Table and Graph”，新建一個數(shù)據(jù)表 Prism里可以建立多個表格，方便把同一個項目里的不同實驗數(shù)據(jù)放在一起管理 “New Project File”是新建一個prism文件 21科研技能 單元課GraphPad Prism 7 作圖單維度分組柱形圖2在彈出窗口中進行如下設置： 選擇“Column”類型。 選擇重復數(shù)據(jù)項 點擊“Create”，創(chuàng)建表格 只能選擇一種類型 同一列的數(shù)據(jù)為重復值（即重復） 組別間為配對或有關聯(lián)的（如不同時間點等） 已統(tǒng)計

19、好的值和誤差 以列變量做頻數(shù)分析或柱狀圖 非配對t檢驗 配對t檢驗 單樣本t檢驗 單因素方差分析 重復測量單因素方差分析 感受性曲線 22科研技能 單元課GraphPad Prism 7 作圖單維度分組柱形圖3輸入數(shù)據(jù)5彈出窗口，默認設置即可，點擊“OK” 可以看到，新建的表，沒有“X軸”的數(shù)據(jù)，全是Y軸4點擊Graphs目錄下對應的圖表 可以給表格重新命名 23科研技能 單元課GraphPad Prism 7 作圖單維度分組柱形圖67點擊Y坐標軸標題，輸入標題點擊圖標標題，按delete鍵刪除；點擊X Title，按delete鍵刪除其實到這一步圖就可以用了，下面再根據(jù)示例的格式做一些個性化

20、偏好設置。 24科研技能 單元課GraphPad Prism 7 作圖單維度分組柱形圖8在作圖區(qū)雙擊鼠標，彈出的屬性框里選擇全部組別，進行統(tǒng)一格式設置“Data set”里選擇“Change ALLdata sets”Fill選擇黑色Border color，邊框顏色，選擇黑色誤差棒的線條粗細，選1 ptBorder，邊框線條粗細，這里不用設置，因為我們選擇了填充黑色，因此框線看不到ØFill pattern的話可以在DesighØ里選擇花式填充的樣式 25科研技能 單元課GraphPad Prism 7 作圖單維度分組柱形圖9點擊“Graph Settings”，可對柱子

21、間距進行調整 調整后，柱子的粗細和間隔都會有所變化 柱子間距，改為100% 第一根前/最后一根后柱子的空隙長度 26科研技能 單元課GraphPad Prism 7 作圖單維度分組柱形圖10調整柱子的寬度 單擊X坐標軸線 鼠標放在X坐標軸線末端，待鼠標變成雙向箭頭狀時，可通過左右拉動軸線，調節(jié)X軸線的長度 27科研技能 單元課GraphPad Prism 7 作圖單維度分組柱形圖11雙擊Y坐標軸，在彈出的屬性框里設置Y坐標軸刻度的方向 改為Right 默認是在左邊，示例里是在右邊。再“All ticks”的“Ticks direction”里選擇“right”，即可把刻度設置在Y軸線的右邊 2

22、8科研技能 單元課GraphPad Prism 7 作圖單維度分組柱形圖12點擊“Titles & Fonts”，在“Axes titlesNumbering and labeling”里設置Y坐標軸標題和距離坐標軸線的距離，點擊“OK”。 調節(jié)Y軸標題離軸線的距離 改成1 調節(jié)Y軸離軸線的距離 默認是0。改成0.15 柱形圖作圖完成 29科研技能 單元課GraphPad Prism 7 作圖單維度分組柱形圖13不連續(xù)坐標軸的設置和應用。l 當數(shù)據(jù)中有值相差比較大的時，需要設置不連續(xù)坐標軸，以清楚顯示各部分的數(shù)據(jù)情況。假設本例中的數(shù)據(jù)變?yōu)椋?有2組數(shù)據(jù)與其他組數(shù)據(jù)大小差距太大，導致值比

23、較小組別的能看不清楚 這種情況，可以通過將Y坐標軸設置為不連續(xù)坐標軸，分別顯示大小兩類數(shù)據(jù) 30科研技能 單元課GraphPad Prism 7 作圖單維度分組柱形圖14不連續(xù)坐標軸的設置步驟。 雙擊Y坐標軸，彈出窗口里，進行如下設置： 選擇二段（有需要時可選擇三段，中間雙豎線可以選垂直或傾斜） 設置下半坐標軸范圍 設置上半坐標軸范圍 31科研技能 單元課GraphPad Prism 7 作圖單維度分組散點圖l 示例：文獻：PMID: 26565812；Fig 1Al 模擬數(shù)據(jù) 單維度分組散點圖適合于簡單分組的數(shù)據(jù)，即數(shù)據(jù)組僅由一個方案定義，在數(shù)據(jù)表中每一列定義一個數(shù)據(jù)組，在行向量上沒有分組；

24、每組可以有多個相互間是或非的數(shù)據(jù)，作圖時用點來顯示每個數(shù)據(jù)的位置；可直觀的看到每組數(shù)據(jù)的分布情況和統(tǒng)計情況 示例解讀：Ø CISD2在37例癌旁組織和409例腫瘤組織中的表達差異 32科研技能 單元課GraphPad Prism 7 作圖單維度分組散點圖1選擇“File”“New”“New Data Table andGraph”，新建一個數(shù)據(jù)表。2彈出的窗口里選擇作圖類型。 選擇“Column”類型 選擇輸入的數(shù)據(jù)類型為重復類型 點擊“Create”，完成表格創(chuàng)建 可以根據(jù)需要給表格重新命名 33科研技能 單元課GraphPad Prism 7 作圖單維度分組散點圖3在表輸入數(shù)據(jù)后

25、，點擊下方導航欄中的Graph視圖按鈕，選擇散點圖，點擊“OK”。 34科研技能 單元課GraphPad Prism 7 作圖單維度分組散點圖4刪除標題、x坐標軸標題；將Y坐標軸標題改為“Expression of CISD2 in TCGA sets”。 坐標軸標題比較長時，可以用回車鍵換行 35科研技能 單元課GraphPad Prism 7 作圖單維度分組散點圖5雙擊作圖區(qū)任意空白位置，在彈出屬性框中對散點圖進行格式設置。 下單菜單里選擇Adjacent組 顏色選擇深 Size 改為2號大小 下單菜單里選擇Tumor組 Shape改選擇 顏色選擇紅色 點擊OK圓形； Size 改為2號大

26、小 當Symbols的Color修改后，Error bars的顏色自動變?yōu)橄嗤念伾?示例中由于數(shù)據(jù)比較多（腫瘤組織組別有407個），因此數(shù)據(jù)點的size設置更?。?號） 36科研技能 單元課GraphPad Prism 7 作圖單維度分組散點圖6雙擊X坐標軸，在彈出屬性框中將的傾斜度改為水平，點擊“OK”。 散點圖完成 37科研技能 單元課GraphPad Prism 7 作圖課程目錄1主要功能與界面2折線圖3單維度分組柱形/散點圖4二維度分組柱形圖5生存曲線解 螺 旋|陪 伴 醫(yī) 生 科 研 成 長科研技能 單元課GraphPad Prism 7 作圖二維度分組柱狀圖l 示例：文獻：PMI

27、D: 26565812；Fig 3Dl 模擬數(shù)據(jù) 簡單分組 二維度分組 二維度分組散點圖適合于二重分組的數(shù)據(jù)，即數(shù)據(jù)分組具有雙向變量，每一列定義一個組別，每一行也定義一個組別 示例解讀：Ø 兩個細胞株里，過表達CISD2前后，細胞克隆形成能力的變化 38科研技能 單元課GraphPad Prism 7 作圖二維度分組柱狀圖1新建一個數(shù)據(jù)表，選擇“Grouped” 類型，數(shù)據(jù)3次重復，點擊Create 建立數(shù)據(jù)表。 數(shù)據(jù)為單個重復 數(shù)據(jù)為多個重復 已統(tǒng)計好的值和誤差 39科研技能 單元課GraphPad Prism 7 作圖二維度分組柱狀圖2在表輸入數(shù)據(jù)后，點擊Graph視圖。 柱狀圖

28、 熱圖 三相圖 數(shù)據(jù)點作圖3彈出窗口里確認選擇了第一個樣式（“交錯并聯(lián)”式），點擊“OK”?？梢愿鶕?jù)需要給表格重新命名 40科研技能 單元課GraphPad Prism 7 作圖二維度分組柱狀圖4輸入Y坐標軸，刪除圖的標題和X坐標軸標題；將圖例移動至作圖區(qū)上方，圖例字體加粗。 基本完成，下面按照示例的格式進行個性化設置（這些設置可設可不設） 單擊Y坐標軸標題輸入“Colony number” 分別單擊或選中圖表標題“Colony”和“XTile”，按delete鍵刪除這兩個標題 選中兩個圖例，點擊頂部“Text”工具框里的加粗按鈕，將字體設置為粗體 分別選中兩個圖例，將其移動至作圖區(qū)上方 雙擊

29、X坐標軸，在彈出窗口中設置X軸為水平放置 41科研技能 單元課GraphPad Prism 7 作圖二維度分組柱狀圖5雙擊作圖區(qū)任意空白處，在彈出屬性框里對各組數(shù)據(jù)的圖形格式進行設置 Data set下單菜單里選擇Vector組 Fill改為白色 Pattern改為純色填充， Border改為1/2 pt Thickness改為1/2 pt Data set下單菜單里選擇CISD2組 Fill改為黑色 Border選擇1/2 pt（當Fill選擇純黑色時，這里Pattern可以不改） Thickness改為1/2 pt 點擊“OK” 42科研技能 單元課GraphPad Prism 7 作圖二

30、維度分組柱狀圖6設置柱子的粗細 鼠標單擊X坐標軸，指針移動到末端，待指針變成雙向箭頭時，拖動鼠標，將X坐標軸縮短一點 43科研技能 單元課GraphPad Prism 7 作圖二維度分組柱狀圖7設置柱子之間的間距，雙擊作圖區(qū)調出屬性窗口： 點擊圖形設置選項 設置組內柱子間距為柱子寬度的100%，組間距離為300%點擊“OK”設選擇子縱向或橫向 縱向基線設置 自動橫向（水平） 設置基線位于Y軸某個值的位置隱藏基線（本例中沒有設置基線，因此這里是否有差別） 出現(xiàn)空白值時處理方式組內柱子間距，如本例中這里的組內是指MGC-803的vecto組和CISD2組組間距離，即本例中MGC-803與SGC-7

31、901的間距 第一根柱子前留距 最后一根柱子前留距 圖例形狀 矩形正方形 44科研技能 單元課GraphPad Prism 7 作圖二維度分組柱狀圖8雙擊Y坐標軸，在屬性框里設置刻度方向向右，點擊“OK” 二維度分組柱狀圖完成 45科研技能 單元課GraphPad Prism 7 作圖二維度分組柱狀圖 疊加柱狀圖的制作3方法1：在選擇亞類時，選擇疊加柱狀圖即可方法2：在作圖的任意階段，可點擊頂部菜單欄中的的快捷鍵，改變圖形的亞類（彈出的窗口跟 3是一樣的） 46科研技能 單元課GraphPad Prism 7 作圖課程目錄1主要功能與界面2折線圖3單維度分組柱形/散點圖4二維度分組柱形圖5生存

32、曲線圖解 螺 旋|陪 伴 醫(yī) 生 科 研 成 長科研技能 單元課GraphPad Prism 7 作圖生存曲線對于生存曲線，隨訪時間、在隨訪時間上的生存狀態(tài)以及影響因子（如是必要因素表達）生存曲線不僅可以用于生存率的比較，也可以用于其他結局析，如是否復發(fā)，是否轉移等是二分類變量的分l 示例：文獻：PMID: 26565812；Fig 2Dl 模擬數(shù)據(jù) 示例解讀：Ø CISD2低表達和高表達患者生存率比較 47科研技能 單元課GraphPad Prism 7 作圖生存曲線1將表達數(shù)據(jù)按中位數(shù)區(qū)分高低表達： 用公式=MEDIAN(C2:C161)返回表達值的中位數(shù)。C2:C161即表達數(shù)

33、據(jù)的范圍。返回結果是-0.237 用公式=IF(C2<$H$1,“Low”,“High”)對表達數(shù)據(jù)進行高低分組。即當C2<H1單元格返回的中位數(shù)時，返回Low，否則，則返回High。這里H1單元格用了絕對，所謂絕對即當公式填充到其他單元格時，所的H1單元格發(fā)生變動。絕對的方法是在單元格的行號和/或列符前加上符號“$”。往下填充公式即可。PS：也有用平均值區(qū)分的，中位數(shù)用的比較多。還有一種做法是按表達高低，選高表達的1/3（或1/4）數(shù)據(jù)視為高表達，低表達的1/3（或1/4）數(shù)據(jù)視為低表達，中間的1/3（1/2）數(shù)據(jù)不作圖。ü2將生存狀態(tài)轉化為可讀數(shù)據(jù)0和1 可以用if函

34、數(shù)公式：=IF(D2=“Alive”,0,1)。“Alive”時，返回0，否則返回1ü Alive為0，Dead為1D2單元格的值為ü 也可用excel的列篩選功能，選擇Alive的數(shù)據(jù)，在新列“生存status”中，填充0，在Dead對應的行中，填充1 48科研技能 單元課GraphPad Prism 7 作圖生存曲線3數(shù)據(jù)輸入在excel中，用篩選功能篩選low的數(shù)據(jù)將篩選出來的數(shù)據(jù)，生存時間Overall Survival Follow upTime (Months)到GraphPad Prism中的X列；將篩選出來的數(shù)據(jù)，生存狀態(tài)（0和1數(shù)據(jù)）中的A列；到Graph

35、Pad PrismX列標題標記為Survival time (months)；A列標記為Lowexpression of CISD2；B列標記為High expression ofCISD2在excel中，用篩選功能篩選High的數(shù)據(jù)將篩選出來的數(shù)據(jù)，生存時間Overall Survival FollowupTime (Months)到GraphPad Prism中的X列；將篩選出來的數(shù)據(jù)，生存狀態(tài)（0和1數(shù)據(jù)）中的B列到GraphPad Prism 49科研技能 單元課GraphPad Prism 7 作圖生存曲線雙擊X軸在彈出的屬性窗口中取消45點擊數(shù)據(jù)視圖，選擇生存曲線樣式，點擊“OK”

36、坐標軸修改“Automaticallydetermine the range and interval”選項，設置X軸最大值為100（根據(jù)最大隨訪時間設置）設置X坐標軸刻度間隔值為20點擊“Left Y axis”選項卡設置Y坐標軸最大值為1設置Y坐標軸刻度間隔為0.2，點擊“OK”按鈕 圖例設置 誤差棒的格式 以小數(shù)顯示 以百分數(shù)顯示 50科研技能 單元課GraphPad Prism 7 作圖生存曲線6坐標軸修改雙擊作圖區(qū)，在彈出窗口的“Appearance”選項卡中，選擇Low expression組設置圖例顏色設置線條顏色組別改選擇為High expression組設置圖例顏色設置線條顏

37、色，點擊下方“OK”按鈕 51科研技能 單元課GraphPad Prism 7 作圖生存曲線7文字修改選中圖例，將圖例移動至作圖區(qū)的空白處點擊Y坐標軸標題，修改標題內容點擊圖標標題，修改圖標標題內容按Ctrl + A鍵，選中全部，將字體統(tǒng)一為12號字體 生存曲線作圖完成 52科研技能 單元課GraphPad Prism 7 作圖小結：GraphPad Prism可簡單便捷地實現(xiàn)科研數(shù)據(jù)處理和作圖折線圖數(shù)據(jù)的變化趨勢比較柱狀圖單維和二維的數(shù)據(jù)差異比較生存曲線表達）與預后的關系因素（如課程彩蛋利用GraphPad Prism 7 制作熱圖千聊配套語音教學內容n 通過高通量分析獲得的差異表達列表，熱圖是一種常見的文章數(shù)據(jù)展現(xiàn)形式n 作圖Prism的零基礎教學 53科研技能 單元課GraphPad Prism 7 作圖熱圖l 熱圖制作是Prism 7.0版本新增的功能l 示例：文獻：PMID: 26565812；Fig 1B 示例解讀：Ø 在16例配對的癌旁和腫瘤組織中，CISD2這個的表達差異比較Ø 不同的顏色