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文檔簡介
1、蛋白質(zhì)印跡是把電泳分離的蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)移到固定基質(zhì)上, 然后利用抗原抗體反 應(yīng)來檢測特異性的蛋白分子的技術(shù), 包括三個(gè)部分:SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳, 蛋白質(zhì)的電泳轉(zhuǎn)移,免疫印跡分析。SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳主要用于測定蛋白質(zhì)相對分子質(zhì)量,SDS是陰離子 去污劑,能斷裂蛋白質(zhì)分子內(nèi)和分子間的氫鍵, 使分子去折疊, 破壞其高級(jí)結(jié)構(gòu)。 SDS與大多數(shù)蛋白質(zhì)的結(jié)合比為:1,由于SDS帶有大量的負(fù)電荷,與蛋白質(zhì)結(jié)合 時(shí)掩蓋了不同種類蛋白質(zhì)間原有的電荷差別, 使各種蛋白質(zhì)帶有相同密度的負(fù)電 荷,形似長橢圓棒, 蛋白遷移率與蛋白質(zhì)相對分子質(zhì)量的對數(shù)呈線性關(guān)系。 因此, 利用相對分子質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)蛋白所作的標(biāo)準(zhǔn)曲線
2、,可以求得未知蛋白的相對分子質(zhì) 量。電泳后蛋白質(zhì)分子嵌在凝膠介質(zhì)中,探針分子很難通過凝膠孔,將蛋白質(zhì)從 凝膠轉(zhuǎn)移到固定基質(zhì)上可以對蛋白質(zhì)進(jìn)行免疫檢測分析。 方法有兩種: 水平半 干式轉(zhuǎn)移即將凝膠和固定基質(zhì)似三明治樣夾在緩沖液浸濕的濾紙中間,通電 1030min可完成垂直濕式轉(zhuǎn)移即將凝膠和固定基質(zhì)夾在濾紙中間,浸在轉(zhuǎn)移 裝置的緩沖液中,通電 24h 或過夜可完成。固定基質(zhì)通常有硝酸纖維素膜、聚 偏二氟乙烯膜和尼龍膜。蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)移到固定化膜上之后,通過蛋白質(zhì)染料如麗春紅S檢測膜上的總蛋 白,或用考馬斯亮藍(lán)檢測凝膠上的蛋白剩余量, 以驗(yàn)證轉(zhuǎn)移是否成功。 用抗體作 為探針進(jìn)行特異性的免疫反應(yīng)檢測抗原蛋白
3、,分為4步:用非特異性、非反應(yīng)活性分子封阻固定化膜上未吸附蛋白的自由結(jié)合區(qū), 以防止作為探針的抗體結(jié)合 到膜上,出現(xiàn)檢測時(shí)的高背景固定化膜用專一性的一抗溫育,使一抗與膜上的抗原蛋白分子特異性結(jié)合酶標(biāo)二抗與一抗特異結(jié)合加入酶底物,適當(dāng)保溫, 膜上便可見到顏色反應(yīng),檢測出抗原蛋白區(qū)帶。主要溶液10%分離膠水 、 30% 丙烯酰胺混合液 、 L Tris ()、 10% SDS、 10%過硫酸銨、 TEMED5%濃縮膠水、 30%丙烯酰胺混合液、 L 、 10%10%過硫酸銨、1X Tris -甘氨酸電泳緩沖液Tris 堿、甘氨酸、SDS 1g,用去離子水定容至1L2X SDS凝膠加樣緩沖液Tris
4、-HCI () 100mmol/L,B -巰基乙醇 10% 10%t油,溴酚藍(lán),10%SDS 轉(zhuǎn)移緩沖液Tris ,甘氨酸,甲醇100mL加去離子水至1LTBSTTris NaCI ,Tween-20 1 mL,加去離子水至 1LStrippingTris(pH ),4mL10%SDS140卩l(xiāng) B -巰基乙醇,用水定容到 20mL實(shí)驗(yàn)步驟1 SDS聚丙烯酰胺凝膠電泳凝膠配置 分離膠的配置: 將配置好的分離膠液混勻后迅速倒入膠槽中, 至距離短玻 璃板頂端約2cm處,停止灌膠。檢查是否有氣泡,若有用濾紙條吸出。然后在膠 液界面上加蒸餾水進(jìn)行水封。 1530min 后,凝膠和水封層界面清晰,說明膠
5、已 經(jīng)聚合完全,然后用濾紙吸取水封層,濾紙切勿接觸到凝膠面。 (使蛋白樣品分 離) 濃縮膠的配置: 將配置好的濃縮膠灌注在分離膠之上, 直至短玻璃板的頂 端,然后插入樣品槽梳子。室溫下濃縮膠聚合,約2030min。(使蛋白樣品濃縮) 蛋白樣品的處理將蛋白樣品溶于樣品溶解液,終濃度為 1mg/ml。然后轉(zhuǎn)移到小離心管中, 輕輕蓋上蓋子(不能塞緊,以免加熱時(shí)液體迸出),在100C沸水浴中加熱3min, 取出冷卻后備用, 使用前需要將樣品離心除去顆粒物質(zhì)。 暫時(shí)用不到的話, 可放 在-20C冰箱長期保存,使用時(shí)沸水浴中加熱3mi n,以除去亞穩(wěn)聚合態(tài)物質(zhì)。上樣前的樣品一定要均勻以防電泳時(shí)出現(xiàn)縱向條帶
6、。加樣 拔去樣品槽梳子,倒入電極緩沖液,沒過短板約以上,若樣品槽中有氣泡, 用槍頭挑除。 按順序向凝膠樣品槽中加入標(biāo)準(zhǔn)蛋白和未知蛋白樣品, 每孔的加樣 量要相同,一般加樣體積為 1030卩l(xiāng),加樣時(shí)槍頭深入到加樣槽內(nèi),盡量接近 底部,記錄加樣順序。電泳上槽接負(fù)極,下槽接正極,打開直流穩(wěn)壓電源,先 80V 過了濃縮膠后改為 120V,待溴酚藍(lán)指示劑遷移到凝膠下沿 1cm時(shí)停止電泳。2 蛋白質(zhì)的電轉(zhuǎn)移水平半干式電轉(zhuǎn)移 戴乳膠手套剪濾紙6張,濾紙長與寬比SDS-PAGE交各大1cm 裁剪與SDS-PAGE膠長寬相等的NC膜。 將3張濾紙和SDS-PAGE交浸在負(fù)極轉(zhuǎn)移液中待用。 將另3張濾紙和NC轉(zhuǎn)
7、移膜浸在正極轉(zhuǎn)移液中待用。 將浸在負(fù)極轉(zhuǎn)移液中的濾紙取出, 盡量少帶液體, 置于轉(zhuǎn)移槽負(fù)極上, 然 后在負(fù)極濾紙上依次鋪放SDS-PAGE交、NC膜、3張用正極轉(zhuǎn)移液飽和的濾紙。 注意排除氣泡,因?yàn)?氣泡會(huì)產(chǎn)生高阻抗點(diǎn), 形成低效印跡區(qū), 即所謂“禿斑”。 蓋上石墨陽極板,設(shè)定50mA恒流,轉(zhuǎn)移一定時(shí)間。垂直濕式轉(zhuǎn)移 凝膠片的平衡:把電泳后的凝膠從玻璃板上轉(zhuǎn)移至成有適量轉(zhuǎn)移緩沖液的 大培養(yǎng)皿中,浸泡3060min,以除去膠中的SDS使其pH及離子強(qiáng)度和印跡緩沖 液相一致,防止凝膠發(fā)生膨脹或皺縮。 將轉(zhuǎn)移緩沖液冷卻至4C 準(zhǔn)備NC膜和濾紙:戴乳膠手套裁剪與凝膠大小相同的NC膜和4張濾紙,用轉(zhuǎn)移緩
8、沖液浸潤膜和濾紙15mi n,直到?jīng)]有氣泡, 將海綿在轉(zhuǎn)移緩沖液中充分浸濕 打開蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)移槽的轉(zhuǎn)移夾, 依次放入: 浸濕的海綿, 兩張用轉(zhuǎn)移緩沖液飽和的濾紙,用轉(zhuǎn)移緩沖液浸過的膠,NC膜,兩張用轉(zhuǎn)移緩沖液飽和的濾紙,浸濕的海綿,然后合上轉(zhuǎn)移夾。 轉(zhuǎn)移槽中倒入轉(zhuǎn)移緩沖液,然后將轉(zhuǎn)移夾置于槽中,凝膠靠近負(fù)極NO!靠近正極將轉(zhuǎn)移槽放到4 °C冰箱內(nèi),電轉(zhuǎn)移,恒流80 mA 4 h。3 免疫印跡分析NC膜上總蛋白的染色和脫色:將電泳轉(zhuǎn)移完后的NCS取出,置于培養(yǎng)皿中。 麗春紅S染色3min后,用鉛筆輕輕標(biāo)出標(biāo)準(zhǔn)蛋白帶的位置以備計(jì)算特異性蛋白 質(zhì)相對分子質(zhì)量所需。然后,用麗春紅 S脫色液輕輕漂
9、洗數(shù)次至紅色消失。特異性抗體檢測 脫色后的NC膜置于培養(yǎng)皿中,加入封閉液,并在水平搖床上不斷振搖, 室溫下封閉2h以上。(將膜上未結(jié)合目的蛋白的區(qū)域封閉以防止一抗的結(jié)合) 倒出封閉液,加入漂洗液,水平搖床上不斷振搖,洗膜3次,每次5min。(除去封閉液) 漂洗完后,將膜轉(zhuǎn)移至雜交袋中,加入特異性一抗,4C搖床過夜或室溫放搖3h (一抗與目的抗原蛋白特異性結(jié)合) 利用水平搖床,用TBST洗膜3次,每次5min。(洗去未結(jié)合的一抗) 將膜轉(zhuǎn)移到稀釋的酶標(biāo)二抗中,在室溫下孵育30mi n 傾去二抗,用TBST洗膜,室溫?fù)u洗三次,每次5min,蛋白面朝上,置于 保鮮膜中,將ECL的A液和B液以1:1體
10、積混合,于暗室中,按的量滴加于膜表 面,孵育1mi n,濾紙吸去多余液體用保鮮膜包好,立即于暗室內(nèi)曝光數(shù)秒。在暗室中,將1 X顯影液和定影液分別到入塑料盤中; 在紅燈下取出X 光 片,剪裁適當(dāng)大?。ū饶さ拈L和寬均需大 1cm);打開X-光片夾,把X 光片放 在膜上,一旦放上,便不能移動(dòng),關(guān)上 X-光片夾,開始計(jì)時(shí);根據(jù)信號(hào)的強(qiáng)弱 適當(dāng)調(diào)整曝光時(shí)間,一般為1min或5min,曝光完成后,打開X-光片夾,取出 X-光片,迅速浸入顯影液中顯影,待出現(xiàn)明顯條帶后,即刻終止顯影。顯影時(shí)間 一般為12min (2025C),溫度過低時(shí)(低于16 C)需適當(dāng)延長顯影時(shí)間; 顯影結(jié)束后,馬上把X-光片浸入定影
11、液中,定影時(shí)間一般為510min,以膠片 透明為止;用自來水沖去殘留的定影液后,室溫下晾干。注意事項(xiàng) 在合適的鹽濃度下,應(yīng)保持蛋白質(zhì)的最大溶解性和可重復(fù)性; 不同濃度的凝膠用于分離不同相對分子質(zhì)量的蛋白 選擇合適的表面活性劑和還原劑, 破壞所有非共價(jià)結(jié)合的蛋白質(zhì)復(fù)合物和共價(jià)鍵、二硫鍵;對于多亞基蛋白或含多條肽鏈的蛋白,SDS- PAGER能測定它們的亞基或單條肽鏈的相對分子質(zhì)量。 盡量除去核酸、多糖、脂類等干擾分子; 蛋白質(zhì)樣品在處理過程中應(yīng)低溫下進(jìn)行, 以避免細(xì)胞破碎釋放出各種酶對 其進(jìn)行修飾 盡量使用新鮮的 loading buffer ,樣品要與 loading buffer 混合均勻,
12、 不可將蛋白質(zhì)反復(fù)凍融使用以防改變蛋白質(zhì)的抗原特性, Buffer 一定要漫過梳子孔,否則可能會(huì)發(fā)現(xiàn)蛋白跑不動(dòng); 電泳時(shí)先用低電壓跑過濃縮膠, 再換高電壓跑分離膠, 特別是對于高分子 量的目的蛋白, 硝酸纖維素(NC)膜:NC與蛋白質(zhì)靠疏水作用結(jié)合,無需預(yù)先活化,對蛋白質(zhì)的活性影響??; 非特異性本底顯色淺;價(jià)格低廉,使用方便。但結(jié)合在 NC 上的小分子蛋白質(zhì)在洗滌時(shí)易丟失;NC韌性較差,易損壞。聚偏二氟乙烯(PVDF)膜:與蛋白質(zhì)親和力高,用前需在甲醇中浸泡,以活化 膜上的正電基團(tuán),使其更容易與帶負(fù)電荷蛋白結(jié)合。但價(jià)格上稍貴。為了便于觀察電泳效果和轉(zhuǎn)膜效果,以及判斷蛋白分子量大小要先將膜晾干,
13、然后浸入20%勺甲醇,待完全浸濕后取出透光觀察即可看到蛋白條帶(適用 于PVDF膜)。傳統(tǒng)方法是將膜用1X麗春紅染液染5min (于脫色搖床上搖),然 后用水沖洗掉沒染上的染液就可看到膜上的蛋白。從轉(zhuǎn)膜完畢后所有的步驟,一定要注意膜的保濕,避免膜的干燥,否則極易 產(chǎn)生較高的背景。 高背景可能的原因:膜未均勻浸泡;膜或緩沖液污染;封閉 不充分;抗體與封閉液出現(xiàn)交叉反應(yīng);抗體濃度過高。解決方法有:轉(zhuǎn)膜前用 100%?醇將膜完全浸泡;雜交前檢測一抗、二抗;檢測一抗、二抗與封閉液是否 有交叉反應(yīng)。轉(zhuǎn)膜的效果可以觀察所使用的預(yù)染蛋白質(zhì)分子量標(biāo)準(zhǔn),通常分子量最大的 1-2條帶較難全部轉(zhuǎn)到膜上。轉(zhuǎn)膜的效果也
14、可以用麗春紅染色液對膜進(jìn)行染色, 以觀察實(shí)際的轉(zhuǎn)膜 效果。也 可以用考 馬斯亮藍(lán)快 速染色 液對完成轉(zhuǎn) 膜的 SDS-PAG膠進(jìn)行染色,以觀察蛋白的殘留情況。作用定性分析蛋白質(zhì),特別是用于蛋白質(zhì)純度檢測和測定蛋白質(zhì)分子量,分析目的蛋白表達(dá)的特異性。蛋白樣品的制備(1)單層貼壁細(xì)胞總蛋白的提?。?、倒掉培養(yǎng)液,并將瓶倒扣在吸水紙上使吸水紙吸干培養(yǎng)液(或?qū)⑵?直立放置一會(huì)兒使殘余培養(yǎng)液流到瓶底然后再用移液器將其吸走)。2、每瓶細(xì)胞加3ml 4 C預(yù)冷的PBS()。平放輕輕搖動(dòng) 1min洗滌 細(xì)胞,然后棄去洗液。重復(fù)以上操作兩次,共洗細(xì)胞三次以洗去培養(yǎng)液。將PBS棄凈后把培養(yǎng)瓶置于冰上。3、按1ml
15、裂解液加10卩l(xiāng) PMSF ( 100mM,搖勻置于冰上。( PMSF 要搖勻至無結(jié)晶時(shí)才可與裂解液混合。)4、每瓶細(xì)胞加400卩1含PMSF勺裂解液,于冰上裂解 30min,為使 細(xì)胞充分裂解培養(yǎng)瓶要經(jīng)常來回?fù)u動(dòng)。5、裂解完后,用干凈的刮棒將細(xì)胞刮于培養(yǎng)瓶的一側(cè)(動(dòng)作要快),然后用槍將細(xì)胞碎片和裂解液移至離心管中。(整個(gè)操作盡量在冰上進(jìn)行。)6、于4°C下12000rpm離心5min。(提前開離心機(jī)預(yù)冷)7、將離心后的上清分裝轉(zhuǎn)移到離心管中放于20 C保存。(2)組織中總蛋白的提取:1、將少量組織塊置于 12ml勻漿器中球狀部位,用干凈的剪刀將組 織塊盡量剪碎。2、加400卩1單去
16、污劑裂解液裂(含 PMSF于勻漿器中,進(jìn)行勻漿。 然后置于冰上。3、幾分鐘后再碾一會(huì)兒再置于冰上,要重復(fù)碾幾次使組織盡量碾碎。4、 裂解30 min后,即可用移液器將裂解液移至離心管中,然后在4C 下12000rpm離心5min,取上清分裝于離心管中并置于 20C保存。(3)加藥物處理的貼壁細(xì)胞總蛋白的提?。河捎谑芩幬锏挠绊?,一些細(xì)胞脫落下來,除了按(一)操作外還應(yīng)收 集培養(yǎng)液中的細(xì)胞。培養(yǎng)液中細(xì)胞總蛋白的提?。?、 將培養(yǎng)液倒至 15ml離心管中,于 2500rpm離心5min。2、 棄上清,加入 4ml PBS并用槍輕輕吹打洗滌,然后2500rpm離心 5min。棄上清后用 PBS重復(fù)洗滌
17、一次。3、 用槍洗干上清后,加 100 1裂解液(含 PMSF冰上裂解30min, 裂解過程中要經(jīng)常彈一彈以使細(xì)胞充分裂解。4、 將裂解液與培養(yǎng)瓶中裂解液混在一起4C、12000rpm離心5min,取 上清分裝于離心管中并置于20C保存。(三)蛋白含量的測定(1)制作標(biāo)準(zhǔn)曲線1、從一20C取出1mg/ml BSA,室溫融化后,備用。2、取18個(gè)離心管,3個(gè)一組,分別標(biāo)記為 0mg,。3、按下表在各管中加入各種試劑。0mg1mg/ml BSA100m L NaCIG250考馬斯亮藍(lán)溶 液1ml1ml1ml1ml 1ml 1ml4、混勻后,室溫放置 2min。在生物分光光度計(jì)上比色分析。(2)檢測
18、樣品蛋白含量1、 取若干離心管,每管加入4°C儲(chǔ)存的考馬斯亮藍(lán)溶液1ml。室溫放置30min后即可用于測蛋白。2、 取一管考馬斯亮藍(lán)加 L NaCl溶液100 ml,混勻放置2分鐘可做為 空白樣品,將空白倒入比色杯中在做好標(biāo)準(zhǔn)曲線的程序下按blank測空白 樣品。3、 棄空白樣品,用無水乙醇清洗比色杯2次(每次),再用無菌水 洗一次。4、 取一管考馬斯亮藍(lán)加95 L NaCl NaCl溶液和5ml待測蛋白樣品,混勻后靜置2min,倒入扣干的比色杯中按sample鍵測樣品。注意:每測一個(gè)樣品都要將比色杯用無水乙醇洗2次,無菌水洗一次??赏瑫r(shí)混合好多個(gè)樣品再一起測,這樣對測定大量的蛋白樣品可節(jié) 省很多時(shí)間。測得的結(jié)果是 5 ml樣品含的蛋白量。主要參考生物化學(xué)實(shí)驗(yàn)教程劉箭主編分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)指導(dǎo)魏群主編還有百度上搜的關(guān)于 wb的方法步驟及試驗(yàn)中出現(xiàn)的問題熱致相分離法的英文縮寫TIPS,是Thermally Induced PhaseSeparation的簡稱
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