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文檔簡介

1、第十三章第十三章 蛋白質(zhì)的合成蛋白質(zhì)的合成DNA: ATGCATGCATGCRNA: AUGCAUGCAUGCPROTEIN: aa1 aa2 aa3 aa4什么樣的堿基序列決定什么樣的氨基酸序列呢? 如何實現(xiàn)堿基序列到氨基酸序列的轉(zhuǎn)變? 第一節(jié)第一節(jié)遺傳密碼遺傳密碼p501Codon:密碼子是指mRNA上由三個相鄰的核苷酸組成一個密碼子,代表某種氨基酸或肽鏈合成的起始或終止信號。一、一、遺傳密碼的破譯遺傳密碼的破譯如果利用poly(UC),則得到多聚Ser-Leu-Ser-Leu,推測UCU編碼Ser,CUC編碼Leu.到1965年就全部破譯了64組密碼子,見表P503。二、二、遺傳密碼的基

2、本特性遺傳密碼的基本特性64個密碼子中有61個編碼氨基酸3個不編碼任何氨基酸而起肽鏈合成的終止作用,為終止密碼子,是UAG、UAA、UGA密碼子AUG(編碼Met)又稱起始密碼子。(1)方向性和連讀性 方向:從mRNA的5到3 編碼一個肽鏈的所有密碼子是一個接著一個地線形排列,密碼子之間既不重疊也不間隔,從起始密碼子到終止密碼子(不包括終止子)構(gòu)成一個完整的讀碼框架,又稱開放閱讀框架(ORF)。如果在閱讀框中插入或刪除一個堿基就會使其后的讀碼發(fā)生移位性錯誤(稱為移碼)。- (2)簡并性幾種密碼子編碼一種氨基酸的現(xiàn)象稱為密碼子的簡并性。如GGN(GGA、GGU、GGG、GGC)都編碼Gly,那么

3、這4種密碼子就稱為Gly的簡并密碼。只有Met和Trp沒有簡并密碼。一般情況下密碼子的簡并性只涉及第三位堿基。 簡并性的生物學意義?可以降低由于遺傳密碼突變造成的災難性后果 假如每種氨基酸只有一個密碼子,那么剩下的44個密碼子都成了終止子,如果一旦哪個氨基酸的密碼子發(fā)生了單堿基的點突變,那么極有可能造成肽鏈合成的過早終止。如GGN(GGA、GGU、GGG、GGC)都編碼Gly,由于簡并性的存在,不論第三位的U變成什么,都仍然編碼Aly.(3)變偶性(搖擺性) 密碼子中第三位堿基與反密碼子第一位堿基的配對有時不一定完全遵循A-U、G-C的原則,Crick把這種情況稱為wobble,有人也稱擺動配

4、對或不穩(wěn)定配對。密碼子的第三位和反密碼子的第一位是變偶位點。反密碼子第一位的G可以與密碼子第三位的C、U配對,U可以與A、G配對,I可以和密碼子的U、C、A配對,這使得該類反密碼子的閱讀能力更強。(4)通用性和變異性:密碼子在不同物種間幾乎是完全通用的。目前只發(fā)現(xiàn)線粒體和葉綠體內(nèi)有例外情況,這也是如火如荼的轉(zhuǎn)基因的前提。但要注意的是不同生物往往偏愛某一種密碼子。 (5) 密碼的防錯系統(tǒng):密碼子中一個堿基被置換,其結(jié)果或是仍然編碼相同的AA;或是以物理化學性質(zhì)最接近的AA相取代。第二節(jié)第二節(jié)參與蛋白質(zhì)生物合成的參與蛋白質(zhì)生物合成的RNA和有和有關(guān)裝置關(guān)裝置一、 核糖體是蛋白質(zhì)合成的場所核糖體又稱

5、核蛋白體。標記各種a.a,注入大鼠體內(nèi),在不同時間取出肝臟,勻漿,離心分離各種亞細胞器,分析放射性蛋白的分布,證實蛋白質(zhì)的合成是在核糖體上進行的。游離核糖體:合成細胞質(zhì)蛋白。內(nèi)質(zhì)網(wǎng)核糖體:合成分泌蛋白和細胞器蛋白。不論原核細胞還是真核細胞,一條mRNA可以被同時幾個核糖體閱讀,把同時結(jié)合并翻譯同一條mRNA的多個核糖體稱為多核糖體。核糖體的結(jié)構(gòu)與組成核糖體的結(jié)構(gòu)與組成核糖體是由核糖核酸(rRNA)和幾十種蛋白質(zhì)分子(核糖體蛋白)組成的一個巨大的復合體。不同生物的核糖體中,盡管其rRNA和核糖體蛋白的一級結(jié)構(gòu)有所不同,但核糖體的結(jié)構(gòu)高度保守 。每個核糖體是由大小兩個亞基組成,每個亞基都有自己不同

6、的rRNA和蛋白質(zhì)分子,表P522核糖體的大亞基上有兩個重要的位點:P位點是結(jié)合肽酰tRNA的肽?;奈稽c,A位點是結(jié)合氨酰tRNA的氨酰基的位點。 二、tRNA轉(zhuǎn)運活化的AA至mRNA 模板上每一種游離氨基酸在摻入肽鏈以前必須活化并與專一的與tRNA相連(裝載,LOAD),然后由tRNA負責將它帶到核糖體上的特定位點(A位點上)并添加到新生肽鏈的C末端。氨基酸的活化和氨酰氨基酸的活化和氨酰tRNA的合成的合成氨基酸的活化和氨酰tRNA的合成是蛋白質(zhì)生物合成的第一步,由氨酰tRNA合成酶催化。每一種氨酰tRNA合成酶既能識別自己的配體氨基酸,又能識別對應(yīng)的tRNA。1.活化活化氨基酸 + AT

7、P酶/ Mg2+氨酰AMP-酶 + PPI氨酰AMP-酶tRNA 氨酰tRNA + AMP + 酶2.連接連接氨基酸一旦與tRNA形成氨酰tRNA后,進一步的去向就由tRNA來決定了。tRNA憑借自身的反密碼子與mRNA上的密碼子相識別,從而把所攜帶的氨基酸送到肽鏈的一定位置上。氨酰tRNA合成酶:每一種氨基酸都有至少一種專一的氨酰tRNA合成酶,它即能識別氨基酸,又能識別tRNA,從而把特定的氨基酸連到對應(yīng)的tRNA上。遺傳密碼第二??梢哉f可以說tRNA是一個萬能接頭:是一個萬能接頭:(1)對氨酰- tRNA合成酶的識別位點(接頭合成酶)(2)3端-CCA上的氨基酸運載位點(接頭氨基酸,裝載

8、)(3)對核糖體的識別位點(將氨基酸運送到目的地)(4)反密碼子位點(接頭MRNA,驗貨并卸載) 三、三、原核生物原核生物mRNA的結(jié)構(gòu)的結(jié)構(gòu) (1) 5端SD序列 在起始密碼子AUG上游9-13個核苷酸處,有一段可與核糖體16S rRNA配對結(jié)合的、富含嘌呤的3-9個核苷酸的共同序列,一般為AGGA,此序列稱SD序列。它與核糖體小亞基內(nèi)16S rRNA的3端一段富含嘧啶的序列 GAUCACCUCCUUA-OH互補,使得結(jié)合于30S亞基上的起始tRNA能正確地定位于mRNA的起始密碼子AUG。(2)許多原核mRNA是多順反子。轉(zhuǎn)譯時,各個基因都有自己的SD序列、起始密碼子、終止密碼子,分別控制

9、其合成的起始與終止,也就是說,每個基因的翻譯都是相對獨立的。如E.coli,一個7000bp的mRNA編碼5種與Trp合成有關(guān)的酶(二)(二)真核生物真核生物mRNA的結(jié)構(gòu)的結(jié)構(gòu)(1) 真核mRNA5端具有m7GpppN帽子結(jié)構(gòu),無SD序列(P518),與翻譯的起始核糖體進入部位的識別有關(guān)。 3具有PolyA,增加mRNA的穩(wěn)定性。原二、二、蛋白質(zhì)合成的一般過程蛋白質(zhì)合成的一般過程P528肽鏈方向從肽鏈方向從N三個階段:起始、延伸、終止(課本為五個階段)。分別由不同的起始因子、延伸因子和終止因子(釋放因子)參與。三、三、原核生物的蛋白質(zhì)合成原核生物的蛋白質(zhì)合成原核生物(大腸桿菌)每秒鐘可翻譯2

10、0個氨基酸,真核生物每分鐘才大約50個氨基酸。氨基酸 + ATP酶/ Mg2+氨酰AMP-酶 + PPi氨酰AMP-酶tRNA 氨酰tRNA + AMP + 酶(一) 氨酰tRNA的合成 N10-甲酰四氫葉酸+Met-tRNAf fMet-tRNAf +四氫葉酸兩種tRNA: tRNA iMet 和 tRNAmMet (二二)翻譯起始翻譯起始翻譯是從形成起始復合物開始的,在原核生物中該過程需要三個起始因子參與:IF1,IF2,和IF3。(IF1的功能尚不清楚)。(1)IF3首先結(jié)合在30S亞基上,防止它過早地與50S亞基結(jié)合。(2)mRNA結(jié)合到30S亞基上。mRNA通過其SD序列與16S r

11、RNA的配對結(jié)合而使它處于核糖體上的恰當?shù)奈恢?,并使起始密碼子AUG處于P位點。SD序列與16S rRNA的配對還為識別起始密碼子和Met密碼子提供了一種機制。(3)IF2 、fMet-tRNAfmet結(jié)合到30S亞基上IF2是一個GTP結(jié)合蛋白,它先與30S亞基結(jié)合并促使起始氨酰tRNA( N甲酰甲硫氨酰tRNA,fMet-tRNAfmet )的密碼子與mRNA 上的AUG結(jié)合(P位點)。(4)50S大亞基結(jié)合到30S小亞基上,形成起始復合物。GTP水解成GDP釋放的能量引起30S亞基構(gòu)象變化,50S亞基結(jié)合到30S亞基上,同時IF2和IF3釋放。因此,原核生物肽鏈合成的起始復合體由mRNA

12、、70S核糖體、fMet-tRNAfMet組成。(三三)延伸延伸肽鏈延伸分三步進行:進位、轉(zhuǎn)肽、移位)(1)新的氨酰tRNA進入核糖體的A位點;(2)肽鍵形成(轉(zhuǎn)肽);(3)核糖體移位。這三步構(gòu)成了肽鏈延伸的一個循環(huán)。1、新氨酰新氨酰tRNA入位入位 在進入A位點之前,新氨酰tRNA首先必須與延伸因子EFTUGTP結(jié)合。 延伸因子EFTU是一個GTP結(jié)合蛋白,參與氨酰RNA的就位。 氨酰RNA入位后,EFTUGTP水解,EFTUGDP從核糖體上釋放下來,在第二個延伸因子EFTs幫助下EFTuGDP釋放掉GDP并重新結(jié)合一分子GTP再生成EFTuGTP。2、肽鍵形成(轉(zhuǎn)肽)肽鍵形成(轉(zhuǎn)肽)肽鍵是

13、在肽酰轉(zhuǎn)移酶催化下形成的?,F(xiàn)在認為肽酰轉(zhuǎn)移酶活性存在于50S亞基23S rRNA上。驅(qū)動肽鍵形成的能量由P位點上的氨基酸與它的tRNA的高能肽酰酯鍵提供。新肽鍵形成后P位點卸載的tRNA就離開核糖體。嘌呤霉素抑制肽鍵形成!3、核糖體移位。、核糖體移位。移位需要另一個GTP結(jié)合蛋白EFG(延伸因子,又叫移位酶)的參與。現(xiàn)在認為,GTP水解成GDP時釋放出的能量促使核糖體構(gòu)象發(fā)生變化,驅(qū)動肽酰tRNA從位點移動到位點。移位后造成核糖體位點空下,等待接納下一個氨酰tRNA 。(四四)終止終止當終止密碼子(UAA, UAG,UGA)進入位點時肽鏈合成就進入終止期。原核生物有三個釋放因子(RF-1, R

14、F-2, RF-3)參與終止。RF1識別UAA和UAG,RF2識別UAA與UGA,RF3作用尚不清楚,可能促進RF1與RF2結(jié)合。識別過程需要GTP,并改變了核糖體的構(gòu)象,使肽酰轉(zhuǎn)移酶的功能發(fā)生瞬時變化,轉(zhuǎn)變成酯酶功能,將連接肽鏈與P位點tRNA的肽酰酯鍵水解開,肽鏈從核糖體上釋放,mRNA與tRNA解離,核糖體解體。原核生物蛋白質(zhì)合成中的能量計算(合成一個二肽)合成二肽需8個高能鍵,其后每加一個a.a需4個高能鍵。例:合成200個a.a殘基的多肽:8+1984=8004n=4200=800 ATPA(GTP)高能鍵甲酰-甲硫氨酰-tRNA合成ATP-AMP2起始(IF-2)GTP-GDP1第

15、二個a.a-tRNA合成ATP-AMP2第二個a.a-tRNA進入核糖體(EF-TU)GTP-GDP1核糖體移位(EF-G)GTP-GDP1終止(?)GTP-GDP1真核的翻譯起始比原核更復雜,因為:真核的翻譯起始比原核更復雜,因為:(1)真核mRNA的二級結(jié)構(gòu)更為多樣和復雜。(2)核糖體需要掃描mRNA以尋找翻譯起始位點真核mRNA沒有SD序列來幫助識別翻譯起點,因此核糖體要掃描每一個mRNA。核糖體結(jié)合到mRNA的5端的帽子結(jié)構(gòu)并向3端移動以尋找起始位點。這種掃描過程很復雜,知之甚少。(3)真核的翻譯起始用到的起始因子(eIF)至少有9種 ,多數(shù)的功能仍需進步研究。(4)起始需要ATP。(

16、五)(五)多肽鏈的折疊與加工多肽鏈的折疊與加工1.多肽鏈的折疊多肽鏈的折疊 蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)和它的三維構(gòu)象以及生物功能的直接關(guān)系一直是現(xiàn)代生物化學研究的重點。這方面的一個重要的經(jīng)典的范例是Christuian Anfinsen 在1950年后期做的一系列實驗(1972年獲得諾貝爾化學獎)。 細胞中蛋白質(zhì)的折疊和轉(zhuǎn)運是在分子伴侶的幫助下進行的。它存在于所有的生物中,從細菌到高等動植物已發(fā)現(xiàn)了幾種類型的分子伴侶。分子伴侶在蛋白折疊方面的作用表現(xiàn)在兩方面:(1)從多肽開始合成到折疊的這段時間里,分子伴侶可以保護多肽鏈不受其他蛋白的攻擊,一些線粒體和葉綠體蛋白在插入細胞器膜之前必須保持未折疊狀態(tài)。(2

17、)幫助蛋白質(zhì)正確快速地折疊或組裝成多亞基蛋白。2.翻譯后加工翻譯后加工 不論原核生物還是真核生物,翻譯完成后,一些肽鏈能直接折疊成最終的活性形式,不需要加工修飾,然而經(jīng)常的情況是新生肽鏈需要加工修飾(稱為翻譯后加工或修飾)翻譯后加工有兩方面目的:(1)功能需要(2)定向轉(zhuǎn)運的需要(這在真核生物中尤為復雜,合成的蛋白要定向運輸?shù)郊毎|(zhì)、質(zhì)膜、各種細胞器如葉綠體、線粒體、溶酶體、過氧化物酶體等)。1、切除加工切除加工包括去掉N端的甲酰甲硫氨酸和信號肽序列。2、糖基化糖基化N-糖苷鍵型寡糖鏈修飾;O-糖苷鍵型糖基化修飾(與Ser和Thr殘基連接)。溶酶體蛋白添加一個6-磷酸甘露糖殘基后被運往溶酶體。

18、3、甲基化、甲基化甲基轉(zhuǎn)移酶利用硫酰苷甲硫氨酸對特定蛋白進行甲基化修飾。4、磷酸化磷酸化近年來,已經(jīng)發(fā)現(xiàn)由蛋白激酶和蛋白磷酸化酶催化的蛋白質(zhì)磷酸化/去磷酸化在原核生物中十分普遍。5、插入輔因子6、形成鏈間二硫鍵7、還有些單肽要聚合成多亞基蛋白。四、蛋白質(zhì)合成后的定向轉(zhuǎn)運四、蛋白質(zhì)合成后的定向轉(zhuǎn)運蛋 白 質(zhì) 合 成 后 的 定 向 轉(zhuǎn) 運 ( t a r g e t i n g , translocation)的機制很復雜,尤其是真核細胞。信號肽信號肽(Signal sequence),也叫引導肽(leader peptide),指位于新生肽鏈N端的一段肽段,起引導新生肽段進入內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的作用。其特

19、點有:通常含有1530個氨基酸殘基 中間多含疏水性殘基 C端有信號肽酶的作用位點。信號肽是Gunter Blobel1975年提出的,用以解釋多肽向內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的跨膜轉(zhuǎn)運。含信號肽的多肽進入內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的過程:當包含信號肽的多肽被合成一部分時,信號肽識別體(SRP)就識別信號肽并結(jié)合到核糖體上,翻譯暫時停止,SRP與內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜上的受體(停泊蛋白,docking protein)結(jié)合,核糖體與內(nèi)質(zhì)網(wǎng)結(jié)合,SRP離開,延伸的肽鏈通過內(nèi)質(zhì)網(wǎng)上的肽移位裝置(translocon)進入內(nèi)質(zhì)網(wǎng),信號肽被切除。新生肽的命運就取決于信號肽和其他的信號序列。對于分泌蛋白來說,跨膜轉(zhuǎn)運后要切除N端信號肽,多肽進入內(nèi)質(zhì)網(wǎng)腔,此后

20、還要在高爾基體進行下一步的修飾加工。被轉(zhuǎn)運到內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中的多肽多數(shù)還要運往它處。經(jīng)過初步的翻譯后修飾,可溶性蛋白和膜結(jié)合蛋白被運輸?shù)礁郀柣w,這種運輸是經(jīng)過運輸泡進行的。 、(1)氨基酸與tRNA的專一結(jié)合,使tRNA攜帶正確的氨基酸; (2)攜帶氨基酸的tRNA對mRNA的識別以及mRNA上的密碼子與tRNA上的反密碼子的相互識別,保證了遺傳信息準確無誤地轉(zhuǎn)譯; (3) 氨酰-tRNA合成酶和tRNA的校正作用;基因內(nèi)校對與基因間校對等可以保證翻譯的正確; (4)真核生物mRNA 5端的帽子結(jié)構(gòu)以及原核生物mRNA中的SD序列可引導翻譯從起始密碼開始; (5) 起始因子保證了只有起始氨酰-tRN

21、A能進入核糖體P位與起始密碼子結(jié)合; (6)核糖體構(gòu)象的正??蓪崿F(xiàn)正常的裝配功能。(3)40S起始復合物掃描起始復合物掃描mRNA尋找適當?shù)钠鹗济艽a尋找適當?shù)钠鹗济艽a子(通常是子(通常是5端附近的端附近的AUG)。)。(4)40S復合物與復合物與60S大亞基結(jié)合形成大亞基結(jié)合形成80S起始復合起始復合物。物。該過程另需1個GTP。此時,60S大亞基上的eIF-6已經(jīng)被釋放。在形成復合物過程中,在eIF-5參與下,eIF-2-GTP水解成eIF-2-GDP。eIF-2,eIF-3,eIF-4A,eIF-4B,eIF-4F,eIF-1從起始復合物上釋放。 真核生物肽鏈合成起始復合物由mRNA、80

22、S核糖體和Met-tRNAiMet組成。與原核相比,真核起始多消耗了1個ATP(形成40S起始復合物)、1個GTP(形成80S起始復合物)。(二二)延伸延伸與原核類似,也可分為aa-tRNA的進位、轉(zhuǎn)肽、移位三步反應(yīng)。1、進位進位50kD的延伸因子eEF-1-GTP與aa-tRNA結(jié)合,引導aa-tRNA進入A位點。aa-tRNA的反密碼子與mRNA的密碼子正確配對后eEF-1-GTP水解掉一個P,隨后eEF-1-GDP離開核糖體,留下aa-tRNA。在eEF-1、eEF-1的幫助下,eEF-1-GDP再生為eEF-1-GTP。在真菌(如酵母)中,需要另一個延伸因子eEF-3與eEF-1共同引

23、導aa-tRNA的入位。2、肽鍵形成(轉(zhuǎn)肽)肽鍵形成(轉(zhuǎn)肽)核糖體大亞基的肽酰轉(zhuǎn)移酶活性催化A位點-氨基親核攻擊P位點的aa的羧基,在A位點形成一個新的肽鍵。P位點上卸載的tRNA從核糖體上離開3、核糖體移位核糖體移位移位需要一個100kD的延伸因子eEF-2-GTP。eEF-2-GTP結(jié)合在核糖體未知的位置上,GTP水解成釋放的能量使核糖體沿mRNA移動一個密碼子的位置,然后eEF-2-GDP離開核糖體。(三三)終止終止真核細胞中有兩個釋放因子eRF-1和eRF-3(GTP結(jié)合蛋白)介導終止。當GTP結(jié)合到eRF-3后它的GTPase活性就被激活,eRF-1和eRF-3-GTP形成一個復合物

24、,當UAG,UGA,UAA進入A位點時,該復合物就結(jié)合到A位點上,接著GTP水解促使釋放因子離開核糖體,mRNA被釋放,核糖體解體成大小亞基,新生肽在肽酰轉(zhuǎn)移酶催化下被釋放。真核生物蛋白質(zhì)合成中的能量計算(合成一個二肽)合成二肽需10個高能鍵,其后每加一個a.a需4個高能鍵。例:合成200個a.a殘基的多肽: 10+1984=802(4n+2)=4200+2=802 ATP(GTP)高能鍵甲硫氨酰-tRNA合成ATP-AMP2起始(IF-2)2GTP-GDPATP-ADP3第二個a.a-tRNA合成ATP-AMP2第二個 a . a - t R N A 進 入 核 糖 體(eEF-1 -GTP

25、)GTP-GDP1核糖體移位(eEF-2-GTP)GTP-GDP1終止(eRF-3-GTP)GTP-GDP1(四四)真核生物的翻譯后加工真核生物的翻譯后加工許多真核生物的新生肽都要經(jīng)過翻譯后加工或修飾,這種加工修飾可以發(fā)生正延伸著的肽鏈中和翻譯后。一般情況下,翻譯后修飾一是為了功能上的需要,另一種情況是折疊成天然構(gòu)象的需要。1、切除加工切除加工典型的情況包括切除N-端甲硫氨酸、信號肽序列和切除部分肽段將無活性的前體轉(zhuǎn)變成活性形式。一些酶的前體(稱為前體酶proenzyme,或酶原zymegen)或無活性的多肽前體(稱為前體蛋白,proprotein)只有切除特定的肽段后才能從無活性形式轉(zhuǎn)變成活

26、性形式。包含信號肽的胰島素前體稱為前胰島素原(pre-proinsulin)。去掉信號肽的胰島素的前體稱為胰島素原(proinsulin)。進一步切除稱為C鏈的肽段后才能形成活性形式的胰島素(insulin)蛋白質(zhì)內(nèi)含子90年代初,發(fā)現(xiàn)了兩類新的內(nèi)含子。一類是蛋白質(zhì)內(nèi)含子,其DNA序列與外顯子一起轉(zhuǎn)錄和翻譯,產(chǎn)生一條多肽鏈,然后從肽鏈中切除與內(nèi)含子對應(yīng)的a.a序列,再把與外顯子對應(yīng)的氨基酸序列連接起來,成為有功能的蛋白質(zhì)。另一類是翻譯內(nèi)含子,mRNA中存在與內(nèi)含子對應(yīng)的核苷酸序列,在翻譯過程中這一序列被“跳躍”過去,因此產(chǎn)生的多肽鏈不含有內(nèi)含子對應(yīng)的氨基酸序列。2、糖基化糖基化真核生物中糖基化

27、修飾很普遍。通常情況下,分泌蛋白的寡糖鏈較復雜,而內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜蛋白含有較高的甘露糖。N-糖苷鍵型核心寡糖鏈的合成,是在磷酸多萜醇上組裝成的(多萜醇存在于所有細胞的細胞膜上,磷酸化多萜醇主要存在于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜)。3、羥基化羥基化在結(jié)締組織的膠原蛋白和彈性蛋白中pro和lys是經(jīng)過羥基化的。此外,在乙酰膽堿酯酶(降解神經(jīng)遞質(zhì)乙酰膽堿)和補體系統(tǒng)(參與免疫反應(yīng)的一系列血清蛋白)都發(fā)現(xiàn)有4-羥輔氨酸。位于粗糙內(nèi)質(zhì)網(wǎng)(RER)上的三種氧化酶(脯氨酰-4-羥化酶,prolyl-4-hydroxylase,脯氨酰-3-羥化酶和賴氨酰羥化酶,lysylhydroxylase)負責特定脯氨酸和賴氨酸殘基的羥化。脯氨酰-

28、4-羥化酶只羥化-Gly-x-pro-,脯氨酰-3-羥化酶羥化Gly-pro-4-Hyp(Hyp: hydroxyproline),賴氨酸羥化酶只作用于-Gly-X-lys-。膠原蛋的脯氨酸殘基和賴氨酸殘基羥化需要Vc,飲食中Vc不足時就易患壞血癥(血管脆弱,傷口難愈),原因就是膠原纖維的結(jié)構(gòu)不力(weak collagen fiber structure)。4、磷酸化磷酸化蛋白磷酸化參與代謝調(diào)控和信號轉(zhuǎn)導以及蛋白與蛋白之間的相互作用。例如,PDGF受體的酪氨酸殘基經(jīng)過自身磷酸化后才與細胞質(zhì)定位蛋白質(zhì)結(jié)合。5、親脂修飾親脂修飾最常見的親脂修飾是?;彤愇於┗?。豆蔻?;瘏s是最常見的?;问街?/p>

29、。N-豆蔻酰化(豆蔻酸以酰酰氨鍵形式共價連在肽鏈N端的殘基上)能增加特定G蛋白的 亞基對膜結(jié)合的、亞基的親和力。蛋白質(zhì)親脂修飾后可以改變膜結(jié)合能力和特定的蛋白與蛋白之間的相互作用。6、甲基化甲基化通過甲基轉(zhuǎn)移酶進行。天冬氨酸的甲基化能促進已破壞蛋白的修復或降解。在2,3-二磷酸核酮糖羧化酶(rihilose-2,3-biosphosphate carboxylase)、鈣調(diào)蛋白(calmodulin)、組氨酸(histone)、某些核糖體蛋白和細胞色素C中都有甲基化的賴氨酸殘基。其它可甲基化的氨基酸殘基還有His(如組蛋白、視紫紅質(zhì)、eEF-2)、Arg(如休克蛋白、核糖體蛋白)。7、二硫鍵形成二硫鍵形成二硫鍵通常只發(fā)現(xiàn)于分泌蛋白(如胰島素)和某些膜蛋白中,在細胞質(zhì)中由于有各種還原性物質(zhì)(如谷胱甘肽glutathione和硫氧還蛋白thioredoxin)所以細胞質(zhì)蛋白沒有二硫鍵。因為內(nèi)質(zhì)網(wǎng)腔是一個非還原性環(huán)境,所以粗糙內(nèi)質(zhì)網(wǎng)上的新生肽只暫時形成二硫鍵。當新生肽進入內(nèi)質(zhì)網(wǎng)腔時,一些肽鏈可能會按氨基酸次序依次暫時形成二硫鍵,但最終會通過交換二硫鍵位置的形式形成正確的結(jié)構(gòu),內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中可能還有一種二硫鍵異構(gòu)酶(disulfide isomerase)催化該過程。(五五)真核生物的翻譯調(diào)控真核生物的翻譯調(diào)控1、mRNA向細胞質(zhì)的運輸向細胞質(zhì)的運輸核膜創(chuàng)造的轉(zhuǎn)錄與翻譯的隔離為

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