第1章 蛋白質(zhì)化學(xué)-2014

1、SidechainAminogroupCarboxylic acid一）非極性中性一）非極性中性R基團(tuán)氨基酸基團(tuán)氨基酸(脂肪族脂肪族)甘氨酸，甘氨酸，Gly(G)Gly(G)唯一無手性碳原子的氨基酸唯一無手性碳原子的氨基酸 丙氨酸，丙氨酸，Alanine, Ala(A)Alanine, Ala(A) R R基團(tuán)為一個(gè)甲基基團(tuán)為一個(gè)甲基accounting for 7.8% of the primary structure in a sample of 1,150 proteins.脯氨酸，脯氨酸，proline，Pro（P)亞氨基酸亞氨基酸It is often found in turns

2、of proteins-吡咯烷基吡咯烷基-a-羧酸）羧酸） 纈氨酸，纈氨酸，Valine，Val（V）branched-chain amino acidEAA (essential amino acid) 亮氨酸，亮氨酸，Leucine，Leu（L）異丁基（異丁基（isobutylbranched-chain amino acidEAA 異亮氨酸，異亮氨酸，Isoleucine,IleIsoleucine,Ile（I I）有兩個(gè)手性碳原子有兩個(gè)手性碳原子branched-chain amino acidEAA 蛋氨酸（甲硫氨酸），蛋氨酸（甲硫氨酸），Methionine ,Met Methio

3、nine ,Met （M M）側(cè)鏈含甲硫基（甲基硫醚基側(cè)鏈含甲硫基（甲基硫醚基) ) ) EAAan intermediate in the biosynthesis 二）極性中性二）極性中性R基團(tuán)氨基酸基團(tuán)氨基酸(脂肪族）脂肪族）絲氨酸，絲氨酸，Serine，Ser（S）羥甲基羥甲基蘇氨酸，蘇氨酸，Threonine，Thr（T），），有兩個(gè)手性碳原子有兩個(gè)手性碳原子EAAIt is susceptible to numerous posttranslational modifications羥基為活性基團(tuán)羥基為活性基團(tuán)半胱氨酸，半胱氨酸，Cysteine,Cys(C)亞甲基連接一個(gè)巰基亞甲

4、基連接一個(gè)巰基強(qiáng)還原性強(qiáng)還原性天冬酰胺天冬酰胺Asparagine, Asn (N)Asparagine, Asn (N) 甲酰胺基（甲酰胺基（carboxamidecarboxamide谷氨酰胺，谷氨酰胺，Glutamine，Gln（Q)三）堿性氨基酸三）堿性氨基酸+賴氨酸，賴氨酸，Lysine，Lys（K)側(cè)鏈連接一個(gè)氨基側(cè)鏈連接一個(gè)氨基堿性氨基酸堿性氨基酸EAA精氨酸精氨酸 Argnine, Arg（R)含胍基含胍基堿性氨基酸堿性氨基酸組氨酸，組氨酸，His（H)含咪唑基含咪唑基堿性氨基酸堿性氨基酸 EAA+四）酸性氨基酸四）酸性氨基酸天冬氨酸，天冬氨酸，Asp(D)酸性氨基酸酸性氨基酸

5、谷氨酸，谷氨酸，Glu(E)酸性氨基酸酸性氨基酸五）芳香族五）芳香族R基團(tuán)氨基酸基團(tuán)氨基酸苯丙氨酸，苯丙氨酸，Phenylalanine,Phe(F)a-氨基氨基-苯丙酸苯丙酸 苯甲基（苯甲基（benzyl）色氨酸，色氨酸，TryptophanTrp（W),亞甲基連接吲哚環(huán)亞甲基連接吲哚環(huán)EAA酪氨酸酪氨酸t(yī)yrosineTyr（Y),EAAas a receiver of phosphate groupsa-氨基氨基-對(duì)羥基苯丙酸對(duì)羥基苯丙酸 羥基是活性基團(tuán)羥基是活性基團(tuán)- OH-as a receiver of phosphate groups疏水性氨基酸疏水性氨基酸親水性氨基酸親水性氨基

6、酸 硒代半胱氨酸，硒代半胱氨酸， Selenocysteine, Sec (U)(R)-2-胺基-3-氫硒基丙酸吡咯賴氨酸，吡咯賴氨酸，Pyrrolysine，Pyl膠原蛋白中膠原蛋白中膠原蛋白中膠原蛋白中肌球蛋白肌球蛋白凝血酶原凝血酶原弱酸（共熱）弱酸（共熱）谷胱甘肽谷胱甘肽(glutathione, GSH)(glutathione, GSH)l由由Glu、Cys和和Gly形成形成的三肽的三肽lGlu的的 -羧基羧基參與形成肽鍵參與形成肽鍵lSH為活性基團(tuán)為活性基團(tuán)GSH過氧過氧化物酶化物酶H2O2 2GSH 2H2O GSSG GSH還原酶還原酶NADPH+H+ NADP+ 主要功能主要

7、功能: :是體內(nèi)重要的是體內(nèi)重要的還原劑還原劑610771920* * 可逆地與未折疊肽段的疏水部分結(jié)合隨后松開，可逆地與未折疊肽段的疏水部分結(jié)合隨后松開，使新生肽鏈正確折疊。使新生肽鏈正確折疊。* * 與錯(cuò)誤聚集的肽段結(jié)合，誘導(dǎo)其正確折疊。與錯(cuò)誤聚集的肽段結(jié)合，誘導(dǎo)其正確折疊。 * * 對(duì)蛋白質(zhì)分子中二硫鍵的正確形成起重要的作用。對(duì)蛋白質(zhì)分子中二硫鍵的正確形成起重要的作用。 作用：作用：N-Val His Leu Thr Pro Glu Glu C(146) HbS 肽鏈肽鏈HbA 肽肽 鏈鏈N-Val His Leu Thr Pro Val Glu C(146) 這種由蛋白質(zhì)分子發(fā)生變異所

8、導(dǎo)致的疾病，稱為這種由蛋白質(zhì)分子發(fā)生變異所導(dǎo)致的疾病，稱為“分子病分子病”。肌紅蛋白肌紅蛋白(Mb)和血紅蛋白和血紅蛋白(Hb)的的氧解離曲線氧解離曲線瘋牛病瘋牛病是是朊病毒蛋白朊病毒蛋白(prion protein, PrP)構(gòu)象改變引起的構(gòu)象改變引起的神經(jīng)退行性病變。神經(jīng)退行性病變。正常的正常的PrP （PrPc ）富含）富含-螺旋（螺旋（ 42%， 片層片層僅占僅占3% ）。）。瘋牛病瘋牛病的的PrP PrPsc ）-片層占片層占45%， -螺旋螺旋30%。 PrPsc相互聚集，形成相互聚集，形成淀粉樣纖維沉淀淀粉樣纖維沉淀而致病。而致病。PrPc-螺旋螺旋PrPsc-折疊折疊正常正常瘋牛病瘋牛病朊病毒的復(fù)制朊病毒的復(fù)制模式A A：傳染型和散發(fā)型的朊病毒復(fù)制模式；：傳染型和散發(fā)型的朊病毒復(fù)制模式；B B：遺傳型的朊病毒復(fù)制模式。：遺傳型的朊病毒復(fù)制模式。 應(yīng)用舉例應(yīng)用舉例 消毒及滅菌消毒及滅菌 蛋白質(zhì)制劑（如疫苗等）的有效地保存蛋白質(zhì)制劑（如疫苗等）的有效地保存 透析1、凝膠過濾層析（分子篩）原理原理：分子大：分子大小和形狀不同小和形狀不同固定相：固定相：多多孔的凝膠珠孔的凝膠珠 2 2、離子交換層析、離子交換層析1、SDS-PAGE電泳 2 2、等電聚焦（、等電聚焦（Isoelectric foc