生物信息學(xué)課堂測驗

1、武漢生物工程學(xué)院課程考試試題武漢生物工程學(xué)院課程考試試題2012-2013學(xué)年第二學(xué)期課堂測驗學(xué)年第二學(xué)期課堂測驗課程名稱：生物信息學(xué)課程名稱：生物信息學(xué)使用班級：使用班級：10生工、生技錢班生工、生技錢班考試方式：開卷考試方式：開卷考試時間：考試時間：50分鐘分鐘一、填空題（每題1分，共30分）1. 生物信息學(xué)三大核酸序列網(wǎng)站是 、 和 ，基因組瀏覽器有 。2. 數(shù)據(jù)庫常用的數(shù)據(jù)檢索工具有 、 和 。3. 生物信息學(xué)常用的軟件有 、 和 ；常用引物設(shè)計軟件有 ；常用系統(tǒng)發(fā)育分析軟件有 ；常用多序列聯(lián)配的軟件有 。 4. 引物設(shè)計最常用的軟件有 和 。DNAMAN軟件的主要作用有 和 。5.

2、蛋白質(zhì)三級結(jié)構(gòu)預(yù)測的主要方法包括 、 和 。6. 系統(tǒng)發(fā)育樹根據(jù)樹的具體表達形式分為物種樹和 。系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建方法有 、 。7. 蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)是指 ，二級結(jié)構(gòu)基本單元包括 、 。8. 成熟的microRNA長度約 個堿基，其前體雙鏈RNA通常具有 結(jié)構(gòu)，在細胞核內(nèi)經(jīng) 切割，抑止基因的表達。9. 多序列比對的工具有 和 。二、選擇題（每題1分，共20分）1 以下哪一個是mRNA條目序列號： A. J01536 B. NM_15392C. NP_52280 D. AAB1345062 Refseq和GenBank有什么區(qū)別： A. Refseq包括了全世界各個實驗室和測序項目提交的DNA序列B

3、. GenBank提供的是非冗余序列C. Refseq源于GenBank，提供非冗余序列信息D. GenBank源于Refseq3如果你需要查詢文獻信息，下列哪個數(shù)據(jù)庫是你最佳選擇： A. OMIM B. Entrez C. PubMedD. PROSITE4直系同源定義為： A. 不同物種中具有共同祖先的同源序列B. 具有較小的氨基酸一致性但是有較大的結(jié)構(gòu)相似性的同源序列 C. 同一物種中由基因復(fù)制產(chǎn)生的同源序列D. 同一物種中具有相似的并且通常是冗余的功能的同源序列5如果有一段DNA序列，它可能編碼多少種蛋白質(zhì)序列： A. 1B. 2C. 3D. 66要在數(shù)據(jù)庫查詢一段與某DNA序列編碼蛋

4、白質(zhì)最相似的序列，應(yīng)選擇： A. blastn B. tblastn C. tblastp D. blastx7系統(tǒng)發(fā)生樹的兩個特征是： A. 進化分支和進化節(jié)點B. 樹的拓撲結(jié)構(gòu)和分支長度C. 進化分支和樹根 D. 序列比對和引導(dǎo)檢測方法8蛋白質(zhì)編碼區(qū)域占人類基因組百分比是： A. 1-5%B. 5-10%C. 10-20% D. 20-4-%9第一個被完整測定的基因組序列是： A. 啤酒酵母的3號染色體 B. 流感病毒 C. X174 D. 人類基因組10構(gòu)建進化樹最直接的錯誤來源是：A. 多序列比對錯誤 B. 采樣的算法差異C. 假設(shè)進化分支是單一起源 D. 嘗試推測基因的進化關(guān)系11下

5、列哪一個是基于字母特征的系統(tǒng)發(fā)生分析的算法： A. 鄰位連接法（NJ法） B. Kimura算法 C. 最大似然法（ML） D. 非加權(quán)平均法（UPGMA）12下列不能用做系統(tǒng)發(fā)育分析的軟件有（ ）A. Clustal X B. Oligo 6 C. MEGA D. AMOVA13從頭預(yù)測真核基因的原因有（ ）A. 外顯子/內(nèi)含子邊界難以確定 B. 內(nèi)含子長度可能只有幾個堿基對 C. 編碼區(qū)域的GC含量并不總是與非編碼區(qū)相同 D. 以上三個方面的原因14下列不屬于三大核酸序列數(shù)據(jù)庫的是（ ） A. GenBank B. EMBL C. DDBJ D. Swiss-Prot15向核酸數(shù)據(jù)庫Gen

6、Bank提交數(shù)據(jù)，應(yīng)使用下列哪個軟件（ ） A. BLAST B. Sequin C. SRS D. TreeBASE16 NCBI使用的搜索引擎是（ ） A. SRS B. Entrez C. getentry D. google17 GBFF的數(shù)據(jù)格式中結(jié)尾標(biāo)識是（ ） A. / B. ! C. * D. 18SnRNA的功能是 A. 參與RNA的剪接 B.激活RNA聚合酶 C. 形成核糖體 D.是rRNA的前體19AtPTR1-AtPTR6氨基酸序列相似度非常高，在構(gòu)建進化氨基酸序列相似度非常高，在構(gòu)建進化樹時，應(yīng)該優(yōu)先選擇什么方法？樹時，應(yīng)該優(yōu)先選擇什么方法？A. FM 法法 B. N

7、/J法法 C. MP 法法 D. ML法法20 miRNA的主要作用是（ ） A.蛋白質(zhì)的合成 B.參與rRNA的修飾 C. 參與mRNA的特異降解 D.參與小體RNA的拼接二、選擇題（每題1分，共20分）1 以下哪一個是mRNA條目序列號： A. J01536 . NM_15392C. NP_52280 D. AAB1345062 Refseq和GenBank有什么區(qū)別： A. Refseq包括了全世界各個實驗室和測序項目提交的DNA序列B. GenBank提供的是非冗余序列. Refseq源于GenBank，提供非冗余序列信息D. GenBank源于Refseq3如果你需要查詢文獻信息，下

8、列哪個數(shù)據(jù)庫是你最佳選擇： A. OMIM B. Entrez . PubMedD. PROSITE4直系同源定義為： . 不同物種中具有共同祖先的同源序列B. 具有較小的氨基酸一致性但是有較大的結(jié)構(gòu)相似性的同源序列 C. 同一物種中由基因復(fù)制產(chǎn)生的同源序列D. 同一物種中具有相似的并且通常是冗余的功能的同源序列5如果有一段DNA序列，它可能編碼多少種蛋白質(zhì)序列： A. 1B. 2C. 3. 66要在數(shù)據(jù)庫查詢一段與某DNA序列編碼蛋白質(zhì)最相似的序列，應(yīng)選擇： A. blastn B. tblastn C. tblastp . blastx7系統(tǒng)發(fā)生樹的兩個特征是： A. 進化分支和進化節(jié)點.

9、 樹的拓撲結(jié)構(gòu)和分支長度C. 進化分支和樹根 D. 序列比對和引導(dǎo)檢測方法8蛋白質(zhì)編碼區(qū)域占人類基因組百分比是： . 1-5%B. 5-10%C. 10-20%D. 20-4-%9第一個被完整測定的基因組序列是： A. 啤酒酵母的3號染色體 B. 流感病毒 . X174 D. 人類基因組10構(gòu)建進化樹最直接的錯誤來源是：. 多序列比對錯誤 B. 采樣的算法差異C. 假設(shè)進化分支是單一起源 D. 嘗試推測基因的進化關(guān)系11下列哪一個是基于字母特征的系統(tǒng)發(fā)生分析的算法： A. 鄰位連接法（NJ法） B. Kimura算法 . 最大似然法（ML） D. 非加權(quán)平均法（UPGMA）12下列不能用做系統(tǒng)

10、發(fā)育分析的軟件有（ ）A. Clustal X . Oligo 6 C. MEGA D. AMOVA13從頭預(yù)測真核基因的原因有（ ）A. 外顯子/內(nèi)含子邊界難以確定 B. 內(nèi)含子長度可能只有幾個堿基對 C. 編碼區(qū)域的GC含量并不總是與非編碼區(qū)相同 . 以上三個方面的原因14下列不屬于三大核酸序列數(shù)據(jù)庫的是（ ） A. GenBank B. EMBL C. DDBJ . Swiss-Prot15向核酸數(shù)據(jù)庫GenBank提交數(shù)據(jù)，應(yīng)使用下列哪個軟件（ ）A. BLAST . Sequin C. SRS D. TreeBASE16 NCBI使用的搜索引擎是（ ） A. SRS . Entrez C. getentry D. google17 GBFF的數(shù)據(jù)格式中結(jié)尾標(biāo)識是（ A） . / B. ! C. * D. 18SnRNA的功能是 .參與RNA的剪接 B.激活RNA聚合酶