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1、光合細菌分類、鑒定及保存1光合細菌應用中存在的問題光合細菌分類學進展寧波大學在光合細菌方面的研究第二屆分子微生物生態(tài)研討班2光合細菌應用中存在的問題菌種不純菌種鑒定不準實驗環(huán)境因子復雜,實驗數據缺乏統(tǒng)計學分析應用效果評價困難光合細菌分類學進展寧波大學在光合細菌方面的研究中國生態(tài)學會微生物生態(tài)專業(yè)委員會寧波大學培訓基地3光合細菌分類鑒定研究進展伯杰細菌鑒定手冊Bergeys Manual of Determinative Bacteriology1923年第1版1974年第8版1994年第9版都停留在對光合細菌的形態(tài)生理描述上,所有的光合細菌都被單獨放到紅螺菌目1個目中4紅螺菌目紅螺菌科外硫紅螺

2、菌科綠硫菌科綠色絲狀細菌5伯杰氏系統(tǒng)細菌學手冊近年的分子系統(tǒng)學研究表明,紫色非硫細菌的系統(tǒng)發(fā)育是多起源的,分散在變形菌門和兩個綱的多個科中,與非光合細菌的系統(tǒng)發(fā)育混雜在一起。現(xiàn)在認為,光合器官的性質對種的鑒定還是重要的,但對較高分類階元,如科、目等則沒有太大意義。伯杰氏系統(tǒng)細菌學手冊Bergeys Manual of Systematic Bacteriology1989年,第1版2001年,第1版以后的國際分類學權威書籍中,光合細菌的分類采用了完全不同的分類系統(tǒng)。 6 產氧光合細菌 藍細菌門 (產氧光養(yǎng)細菌)光合細菌 綠曲撓菌門:綠曲撓菌綱 綠菌門 不產氧光合細菌 厚壁菌門: 螺旋桿菌科 (

3、不產氧光養(yǎng)細菌) 著色桿菌科 紫色硫細菌 變形菌門 外硫紅螺科(紫色細菌) 好氧不產氧光養(yǎng)細菌 紫色非硫細菌 7所有的紫色非硫細菌分屬于變形菌門的、兩個綱的5個目8個科中,共21個屬:8紅假單胞菌屬(Rhodopseudomonas):沼澤紅假單胞菌 (Rps. palustris)莢膜紅假單胞菌 (Rps. capsulata)球形紅假單胞菌 (Rps. sphaeroides)膠質紅假單胞菌 (Rps. geletinosa)綠色紅假單胞菌 (Rps. viridis)嗜酸紅假單胞菌 (Rps. acidophila)糞紅假單胞菌 (Rps. faecalis)Rps. Rhenobace

4、nsis紅長命菌屬(Rubrivivax) 紅細菌屬(Rhodobacter) 紅芽生菌屬(Rhodoblastus)芽生綠菌屬 (Blastochloris)9紅螺菌屬 (Rhodospirillum)深紅紅螺菌 (Rsp. rubrum)度光紅螺菌 ( Rsp. photometricum)黃褐紅螺菌 ( Rsp. fulvum)莫氏紅螺菌 ( Rsp. molischianum)中鹽紅螺菌 (Rsp. mediosalina)Phaeospirillum(褐螺菌屬)Roseospira (玫瑰螺菌屬)101999.3.中國科學院微生物研究所博士論文:紫色非硫細菌資源分類學研究.2001.

5、 第一章,光合細菌. 東秀珠、蔡妙英主編。常見細菌鑒定手冊。2004.第一章,光合細菌的培養(yǎng). 成永旭主編,餌料培養(yǎng)學。2009. 楊素萍。微生物學報。11寧波大學在光合細菌方面的研究中國科學院微生物菌種保藏中心的絕大多數光合細菌菌種發(fā)表2個新種,有4個可能新種待發(fā)表應用DGGE跟蹤確定單菌落的純培養(yǎng)應用分子指紋技術標記重要光合細菌菌種應用分子指紋技術檢測養(yǎng)殖水體種光合細菌群落演替光合細菌菌種質量及應用效果評價體系環(huán)境細菌菌種資源庫養(yǎng)殖廢水和河道廢水處理菌劑開發(fā)12第二屆分子微生物生態(tài)研討班中國生態(tài)學會微生物生態(tài)專業(yè)委員會寧波大學培訓基地第二屆分子微生物生態(tài)研討班主要培訓研討內容:原位雜交(F

6、ISH)環(huán)境樣品DNA提取及其雜質去除定量PCR技術及其應用13變形菌綱紅螺菌目(Rhodospirillales) 該目有2科7屬。紅螺菌科(Rhodospirillaceae)6個屬醋酸桿菌科(Acetobacteraceae)1個屬紅細菌目(Rhodobacterales) 有1科4屬紅細菌科, ( Rhodobacteraceae)根瘤菌目(Rhizobiales) 有3科7屬慢生根瘤菌科(Bradyrhizobiaceae)2個屬生絲微菌科(Hyphomicrobiaceae)3個屬紅游動菌科(Rhodobiaceae)2個屬變形菌綱(Betaproteobacteria)伯克霍爾德

7、氏菌目(Burkholderiales) 1科叢毛單胞菌科Comamonadaceae2個屬紅環(huán)菌目(Rhodocyclales) 1科紅環(huán)菌科Rhodocyclaceae 14變形菌綱 3個目6個科(1)紅螺菌目(Rhodospirillales) 該目有2科7屬。紅螺菌科(Rhodospirillaceae)紅螺菌屬(Rhodospirillum)褐螺菌屬(Phaeospirillum)紅螺細菌屬(Rhodospira)紅弧菌屬(Rhodovibrio)玫瑰螺菌屬(Roseospira)紅簍菌屬(Rhodocista)醋酸桿菌科(Acetobacteraceae)只有紅球形菌屬(Rhodo

8、pila)1個屬。15(2) 紅細菌目(Rhodobacterales) 有1科(紅細菌科,Rhodobacteraceae)4屬: 紅細菌屬(Rhodobacter)、紅海菌屬(Rhodothalassium)、小紅卵菌屬(Rhodovulum)和最近才發(fā)現(xiàn)的Rhodobaca。16(3) 根瘤菌目(Rhizobiales) 有3科7屬。慢生根瘤菌科(Bradyrhizobiaceae)有紅假單胞菌屬(Rhodopseudomonas)、紅芽生菌屬(Rhodoblastus)2個屬。生絲微菌科(Hyphomicrobiaceae)有芽生綠菌屬(Blastochloris)、紅微菌屬(Rhodomicrobium)、紅菌屬(Rhodobium)3個屬。紅游動菌科(Rhodobiaceae)有紅游動菌屬(Rhodoplanes)和Roseospirillum 2個屬。172變形菌綱(Betaproteobacteria)(1)伯克霍爾德氏菌目(Burkholderiale

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