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1、關(guān)于單基因病致病基因的鑒定第一張,PPT共二十九頁,創(chuàng)作于2022年6月每一片代表一個基因,有規(guī)律的組合在一起形成一條染色體第二張,PPT共二十九頁,創(chuàng)作于2022年6月2第三張,PPT共二十九頁,創(chuàng)作于2022年6月3第四張,PPT共二十九頁,創(chuàng)作于2022年6月4第五張,PPT共二十九頁,創(chuàng)作于2022年6月5功能克?。簭牡鞍踪|(zhì)著手進(jìn)行基因克隆的策略。定位克隆:在蛋白質(zhì)產(chǎn)物未知的情況下進(jìn)行基因克隆的策略。蛋白酶消化、分離氨基酸序列測定設(shè)計(jì)合成寡核苷酸篩選cDNA文庫不同多肽片段家系資料連鎖分析獲得差異片段染色體異常篩選cDNA文庫 克隆全長基因精細(xì)定位消減克隆第六張,PPT共二十九頁,創(chuàng)作
2、于2022年6月6第七張,PPT共二十九頁,創(chuàng)作于2022年6月7第一節(jié) 功能克隆通過基因的功能(編碼蛋白)而不依賴定位的信息來分離基因的策略第一個疾病致病基因通過此策略發(fā)現(xiàn)范例:鐮狀細(xì)胞貧血的-珠蛋白基因 苯丙酮尿癥的苯丙氨酸羥化酶基因第八張,PPT共二十九頁,創(chuàng)作于2022年6月8流程示意圖第九張,PPT共二十九頁,創(chuàng)作于2022年6月9甲 型 血 友 病遺傳方式:XR發(fā)病率:1/10,000(男)病因:F基因遺傳性缺陷 (缺失、點(diǎn)突變、插入、重復(fù)、倒位) 基因定位:Xq28 基因全長186kb,含26個外顯子 臨床表現(xiàn):外傷后出血不止,關(guān)節(jié)血腫第十張,PPT共二十九頁,創(chuàng)作于2022年6
3、月10 F因子基因的功能克隆功能克隆是從蛋白質(zhì)著手進(jìn)行基因克隆的策略。因子 多肽 不同多肽片段蛋白酶消化分離氨基酸序列測定設(shè)計(jì)合成寡核苷酸篩選cDNA文庫第十一張,PPT共二十九頁,創(chuàng)作于2022年6月11通過動物模型鑒定疾病基因第十二張,PPT共二十九頁,創(chuàng)作于2022年6月12第十三張,PPT共二十九頁,創(chuàng)作于2022年6月13第十四張,PPT共二十九頁,創(chuàng)作于2022年6月14第二節(jié) 定位克隆基于染色體異常的基因定位連鎖分析確定致病基因第十五張,PPT共二十九頁,創(chuàng)作于2022年6月15基于染色體異常的基因定位第十六張,PPT共二十九頁,創(chuàng)作于2022年6月16連鎖分析第十七張,PPT共
4、二十九頁,創(chuàng)作于2022年6月17確定致病基因突變篩查:在家系中該突變與表型共分離是最主要的證據(jù)表型拯救:有些導(dǎo)致疾病的突變通常引起基因功能的喪失,而且其表型是可逆的。如果從一個患者的細(xì)胞中能夠發(fā)現(xiàn)基因突變的表型,我們就可以檢測轉(zhuǎn)染了候選基因野生型等位基因的表達(dá)載體是否能夠“拯救”突變并恢復(fù)正常的表型建立疾病的小鼠模型:如果能夠在某一家系中確定一個致病基因,但又無法利用更多的無關(guān)患者來驗(yàn)證,通過構(gòu)建小鼠模型來驗(yàn)證。對于功能喪失性突變導(dǎo)致的表型可以通過制作基因敲除(knock-out)小鼠。對于功能獲得性突變導(dǎo)致的表型或者突變效應(yīng)不清楚的表型,可以制作突變基因敲入(knock-in)模型第十八張
5、,PPT共二十九頁,創(chuàng)作于2022年6月18第十九張,PPT共二十九頁,創(chuàng)作于2022年6月19Duchenne型肌營養(yǎng)不良( Duchenne muscular dystrophy, DMD)遺傳方式: XR發(fā)病率:1/3400(男)臨床表現(xiàn):雙下肢肌無力、Gower征、腓腸肌假性肥大、進(jìn)行性肌萎縮(一般20歲)。病因:DMD基因突變,抗肌萎縮蛋白(dystrophin)?;蚨ㄎ唬篨p21.23,全長2,400kb,含79個外顯子,是已知最大的致病基因。第二十張,PPT共二十九頁,創(chuàng)作于2022年6月20Gower綜合征第二十一張,PPT共二十九頁,創(chuàng)作于2022年6月21 DMD基因的定
6、位克隆定位克隆是在蛋白質(zhì)產(chǎn)物未知的情況下進(jìn)行基因克隆的策略。家系資料 精細(xì)定位 消減克隆連鎖分析獲得差異片段染色體異常篩選cDNA文庫克隆全長第二十二張,PPT共二十九頁,創(chuàng)作于2022年6月22第三節(jié)基于高通量測序技術(shù)的致病基因的鑒定2005年問世的高通量測序技術(shù)是測序技術(shù)發(fā)展歷程的一個里程碑,使得疾病的研究策略發(fā)生了重大轉(zhuǎn)變。高通量測序技術(shù)的突出優(yōu)勢是測序速度快和測序成本大幅度降低。第二十三張,PPT共二十九頁,創(chuàng)作于2022年6月23NGS技術(shù)策略全基因組測序全外顯子組測序目標(biāo)區(qū)域測序疾病相關(guān)基因平行測序第二十四張,PPT共二十九頁,創(chuàng)作于2022年6月24NGS技術(shù)在單基因遺傳病致病基因鑒定中的策略基于序列捕獲技術(shù),研究者可以在全基因組篩選的基礎(chǔ)上對特定區(qū)域進(jìn)行更深層次的研究由于目標(biāo)區(qū)域縮小,在獲得足量目標(biāo)區(qū)域基因變異信息的前提下,樣品的測序成本也會大幅降低第二十五張,PPT共二十九頁,創(chuàng)作于2022年6月25單基因病家系致病基因鑒定第二十六張,PPT共二十九頁,創(chuàng)作于2022年6月26
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