DNA的復(fù)制、突變、損傷修復(fù)和重組_第1頁
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文檔簡介

1、 第五章DNA的復(fù)制、突變、損傷修復(fù)和重組 第一節(jié) DNA復(fù)制機(jī)制第二節(jié) 突變第三節(jié) DNA損傷修復(fù)系統(tǒng)第四節(jié) 遺傳重組 第一節(jié) DNA復(fù)制機(jī)制 一、DNA的半保留復(fù)制 DNA的半保留復(fù)制(semi-conservative replication):以親代DNA的每一股作模板完全相同的兩個(gè)雙鏈子代DNA(每個(gè)子代DNA中都含有一股親代DNA鏈)。 1.大腸桿菌在含15N的培養(yǎng)基中培養(yǎng)約十五代,使其DNA中的堿基氮均轉(zhuǎn)變?yōu)?5N。2.將大腸桿菌移至只含14N的培養(yǎng)基中同步培養(yǎng)一代、二代、三代。1958 Meselson-stahl 設(shè)計(jì)的CsCl超離心試驗(yàn)證實(shí)了 DNA復(fù)制的這一特性15N 標(biāo)

2、記實(shí)驗(yàn) 細(xì)胞生長在15N 標(biāo)記培養(yǎng)基中 轉(zhuǎn)入正常N源培養(yǎng)基中 分離各代DNA 分析各代DNA的浮力密度15N 標(biāo)記 DNA未標(biāo)記 DNA CsCL密度梯度離心 浮力密度 N15DNA 1.742g/ml N15N14DNA 1.717g/ml N14DNA 1.710g/ml二、復(fù)制的起始點(diǎn)和方向DNA在復(fù)制時(shí),需在特定的位點(diǎn)起始,這是一些具有特定核苷酸排列順序的片段,即復(fù)制起始點(diǎn)(復(fù)制子)。3個(gè)連續(xù)的13bp序列4個(gè)9bp序列在原核生物中,復(fù)制子通常為一個(gè);在真核生物中,復(fù)制子通常為多個(gè)。 復(fù)制子之間形成眼狀結(jié)構(gòu)原核生物:單復(fù)制起點(diǎn) 即整個(gè)染色體只有一個(gè)復(fù)制單位 真核生物 : 多復(fù)制起點(diǎn) 即

3、一個(gè)genome中有多個(gè)復(fù)制單位Replication fork復(fù)制叉:染色體中參與復(fù)制的活性區(qū)域,即復(fù)制正在發(fā)生的位點(diǎn)。(Replication fork)復(fù)制的方向復(fù)制眼:電子顯微鏡下觀察正在復(fù)制的DNA,復(fù)制的區(qū)域形如一只眼睛。 (replication eye)1.多數(shù)是雙向的(等速進(jìn)行或異速進(jìn)行),形成兩個(gè)復(fù)制叉;2.少數(shù)是單向復(fù)制,形成一個(gè)復(fù)制叉。 單雙向復(fù)制取決于起點(diǎn)處有一個(gè)還是兩個(gè)復(fù)制叉 單向復(fù)制 雙向復(fù)制真核生物的多復(fù)制子 多個(gè)復(fù)制眼復(fù)制的多模式 單起點(diǎn)、單方向 (原核)多起點(diǎn)、單方向 (真核)單起點(diǎn)、雙方向(原核)多起點(diǎn)、雙方向(真核) 單、雙向 復(fù)制模式圖單向復(fù)制雙向復(fù)制

4、 A replication eye forms a theta structure in circular DNA. D 環(huán)復(fù)制又稱置換式 線粒體和葉綠體 DNA的復(fù)制方式復(fù)制滾環(huán)式復(fù)制共價(jià)延伸復(fù)制時(shí)產(chǎn)生的環(huán)結(jié)構(gòu)形狀象病毒、細(xì)菌因子 DNA復(fù)制的酶學(xué) 一、DNA聚合反應(yīng)和聚合酶 1957 Arthur Kornberg 首次發(fā)現(xiàn) DNApol DNApol DNApol 二、 三種DNA聚合酶的結(jié)構(gòu)和功能35外切活性(3種DNA聚合酶共性) 這種酶活性的主要功能是從3 5方向識(shí)別并切除DNA生長鏈末端與模板DNA不配對的核苷酸,這種功能稱為校對功能(proofreading),對于維持DNA

5、復(fù)制的正確性至關(guān)重要。 Proofreading by DNA polymerase5 3外切活性(DNA聚合酶和的共性) 這種酶活性是從DNA鏈的5端向3末端水解已配對的核苷酸,本質(zhì)是切斷磷酸二酯鍵,每次能切除10個(gè)核苷酸在DNA損傷的修復(fù)中起重要作用,去除岡崎片段5端的RNA引物。 DNA聚合酶I1.DNA pol I由一條多肽鏈組成,分子量為110 KD。2.酶分子中含有一個(gè)Zn2,是聚合酶活性必需的。3.用枯草桿菌蛋白酶可將此酶水解成兩個(gè)片段,大片段的分子量為76 KD,通常稱為klenow片段,小片段為34KD。4.53聚合活性存在于klenow片段上。5.DNA聚合酶I的作用是去除

6、RNA引物,按DNA互補(bǔ)原則替換,每次與模板引物結(jié)合僅能添加20100個(gè)核苷酸。 DNApol的53外切活性有以下三個(gè)特點(diǎn): 必須有5磷酸末端 被除去的核苷酸必須是已經(jīng)配對的 被除去的可以是脫氧核糖核苷酸,也可以是核糖 核苷酸 (切刻平移)DNA pol的5 3聚合活性和5 3外切酶活性協(xié)同作用,可以使DNA一條鏈上的切口從5 3方向移動(dòng),這種反應(yīng)叫做缺刻平移(nick translation)。DNA Polymerase III (DNA聚合酶 III)DNA聚合酶III由10個(gè)不同的亞基構(gòu)成。其中、和亞基構(gòu)成核心酶。亞基具有53 聚合酶活性,亞基具有35外切活性,亞基功能是使和亞基裝配結(jié)

7、合。 兩個(gè)拷貝的亞基圍繞DNA雙螺旋形成一個(gè)環(huán)狀的二聚體。一旦亞基二聚體與DNA緊密結(jié)合,它的作用就像一個(gè)“滑動(dòng)夾子”(sliding clamp)攜帶著核心聚合酶沿著DNA鏈自由滑動(dòng)?;瑒?dòng)夾可以阻止聚合酶脫落,從而大大增加了DNA聚合酶的延伸能力。(Note: no beta subunits are shown; without beta, this form of the complex is called DNA pol III*)Beta forms a donut shaped ring around the DNA and helps to anchor the holoenzy

8、me to the DNA during replication . By acting as a sliding “clamp”, beta helps the holoenzyme to replicate long stretches of DNA without “falling off” the strand.The subunits of E. coli DNA polymerase IIISubunitFunctionaeqtbgddcy5 to 3 polymerizing activity3 to 5 exonuclease activitya and e assemblyA

9、ssembly of holoenzyme on DNASliding clamp = processivity factorClamp-loading complexClamp-loading complexClamp-loading complexClamp-loading complexClamp-loading complexCoreEnzymedimerHoloenzyme DNApol和 DNApol 的主要特性和功能DNA聚合酶活性:DNApol主要用于DNA的修復(fù)和RNA引物的替換DNApol DNA鏈的延長聚合方向:都是53子鏈DNA延伸方向只能是53已知的DNA聚合酶只能使

10、鏈按53方向生長5 OHT C AT C A C 5 OH 3ppp OH C+ ppi 三、 DNA連接酶 所需條件: a、 切刻的 3OH 和 5P 相鄰 b、 切刻各自堿基處于配對狀態(tài) c、 需要能量 原核(ATP、NAD) 真核(ATP) 用途: 復(fù)制過程中,5 端RNA引物被置換后切刻的連接 修復(fù)、重組 四、 與DNA幾何學(xué)性質(zhì)相關(guān)的酶 1、 解螺旋酶 (helicase):又稱解旋酶 單鏈結(jié)合蛋白(SSB single-strand binding protein) 2、 DNA旋轉(zhuǎn)酶 :消除復(fù)制叉前進(jìn)過程中產(chǎn)生的正超 螺旋,產(chǎn)生負(fù)超螺旋 二、DNA復(fù)制大腸桿菌的DNA復(fù)制噬菌體1

11、74 的復(fù)制腺病毒的復(fù)制4. 線性DNA的末端復(fù)制的問題5、復(fù)制忠實(shí)性的保證原核生物DNA的復(fù)制(一)復(fù)制的起始1. OriC in E. coli chromosomal DNA 三個(gè)13bp的重復(fù)序列9bp基序共有4個(gè)拷貝,分散于整個(gè)OriC的范圍內(nèi),它是DnaA蛋白的結(jié)合位點(diǎn)。通過DnaA蛋白+OriC捆綁了大約30個(gè)DnaA蛋白。DNA分子在DnaA蛋白復(fù)合體上的纏繞,導(dǎo)致雙螺旋在串連排列的3個(gè)富含AT的13bp基序處解開。 DnaB蛋白進(jìn)一步打開DNA雙螺旋。DnaB蛋白是解旋酶(Helicase)。兩個(gè)DnaB蛋白在復(fù)制起點(diǎn)處分別與兩條單鏈結(jié)合,并按53相向而行打開DNA雙鏈。雙鏈

12、打開以后,DnaA蛋白便會(huì)募集由6個(gè)DnaB和6個(gè)DnaC構(gòu)成的復(fù)合體與起始位點(diǎn)處的單鏈DNA結(jié)合。DnaC為DnaB蛋白裝載因子,依靠DnaC蛋白的單鏈DNA結(jié)合域以及與DnaA蛋白的相互作用,DnaB和DnaC蛋白復(fù)合體結(jié)合在復(fù)制起始位點(diǎn)。 Helicase (DnaB) continues to separate strands然后,DnaC催化DnaB蛋白解環(huán),并套在單鏈DNA上。在DnaB和DnaC蛋白復(fù)合體中,DNA解旋酶保持非活性狀態(tài)。DNA解旋酶的安裝導(dǎo)致裝載因子從復(fù)合體中釋放出來,并激活DNA解旋酶。DNA解旋酶向前運(yùn)動(dòng),在其身后留下單鏈DNA模板。接著單鏈結(jié)合蛋白(sing

13、le-stranded binding protein, SSB)與解旋酶解開的單鏈結(jié)合,其作用是防止單鏈降解,阻止單鏈退火。SSB蛋白與單鏈DNA的結(jié)合有協(xié)同效應(yīng)(cooperative),即一個(gè)SSB的結(jié)合會(huì)促進(jìn)另一個(gè)SSB與單鏈DNA的結(jié)合。這種協(xié)同結(jié)合使單鏈DNA被解旋酶釋放出后,很快被SSB所覆蓋。一旦被SSB覆蓋,單鏈DNA即處于伸直狀態(tài),有利于其作為模板進(jìn)行DNA合成或RNA引物的合成。在大腸桿菌細(xì)胞中,DNA解旋酶募集一個(gè)引物酶。引物酶負(fù)責(zé)合成一段短的RNA引物。新生鏈的合成由DNA聚合酶催化完成。從大腸桿菌細(xì)胞中分離出了5種DNA聚合酶。DNA聚合酶III是大腸桿菌DNA復(fù)制

14、中鏈延伸反應(yīng)的主要聚合酶。DNA聚合酶I專門用于RNA引物的去處。另外3種DNA聚合酶主要參與DNA修復(fù)及合成。(二)延伸 在復(fù)制叉處先導(dǎo)鏈和后隨鏈的合成同時(shí)進(jìn)行先導(dǎo)鏈被連續(xù)合成,而后隨鏈?zhǔn)遣贿B續(xù)合成的。在復(fù)制叉上,DNA解旋酶在后隨鏈模板上沿著53運(yùn)動(dòng)。DNA聚合酶III全酶通過亞基和解旋酶作用,一個(gè)核心酶復(fù)制前導(dǎo)鏈,另一個(gè)核心酶復(fù)制后隨鏈。 1.新合成的岡崎片段與上一個(gè)岡崎片段被一切口分開。2.岡崎片段的RNA引物長約5個(gè)核苷酸,而它的DNA部分長約10002000bp。3.DNA聚合酶I與切口結(jié)合,并利用其5 3外切酶活性切去下游岡崎片斷的RNA部分,這一過程相當(dāng)于切口平移。4.當(dāng)RNA

15、引物被切除后,由DNA連接酶催化磷酸二酯鍵的形成,把岡崎片斷連接起來。 復(fù)制起始與延伸的總結(jié)3+4Dna A-C(A被捆-復(fù)制叉+召集;6B主體;6C裝配)SSBDnaB召集引物酶-合成RNA引物延續(xù)1. DNA聚合酶(10,3,22)2.DNA聚合酶(去引物)缺刻平移DNA連接酶連接“岡崎片段” 捆-開-解-蓋-先導(dǎo)連續(xù)-后隨岡崎-去+缺刻-連(三) 終止和分離1.大腸桿菌的復(fù)制終止區(qū)域位于環(huán)狀染色體上,與復(fù)制起點(diǎn)相對的一側(cè)。2.在這一區(qū)域存在幾個(gè)終止位點(diǎn)(Ter)。Ter序列按照特定的方向排列在染色體上,制造 “陷阱”。 復(fù)制叉只進(jìn)該區(qū)域,不能出去。1.特異性DNA結(jié)合蛋白Tus與終止位點(diǎn)

16、結(jié)合阻斷一個(gè)方向上的復(fù)制叉前進(jìn)(而對向另一個(gè)方向前進(jìn)的復(fù)制叉不起作用)。2.機(jī)理:這樣安排可確保兩個(gè)從相反方向進(jìn)入ter區(qū)的復(fù)制叉總能相遇,當(dāng)一個(gè)復(fù)制叉遇到另一個(gè)復(fù)制叉時(shí),DNA復(fù)制就完成了。3.通過抑制DNA螺旋酶而發(fā)揮終止作用。4.每次復(fù)制時(shí)只使用一個(gè)終止位點(diǎn)。四、真核生物DNA的復(fù)制 1、 復(fù)制概況 a、多個(gè)復(fù)制子,雙向復(fù)制 b、復(fù)制子相對較小, c、復(fù)制速度較慢, d、復(fù)制叉相遇,復(fù)制 終止隨著復(fù)制叉沿著DNA分子向兩個(gè)方向移動(dòng),復(fù)制泡不斷變大,最終兩個(gè)相鄰復(fù)制泡的復(fù)制叉會(huì)相遇、融合,完成DNA的復(fù)制。 multiple replicon 2、 真核生物的DNA聚合酶 、五種 位置 核

17、內(nèi) 核內(nèi) 核內(nèi) 核內(nèi) 線粒體 合成 結(jié)合引發(fā)酶 修復(fù) 合成 合成,修復(fù) 復(fù)制功能 前導(dǎo)鏈35校 NO NO Yes Yes Yes正活性 3. 真核生物DNA復(fù)制的引發(fā)酶 DNApol + primase形成緊密的復(fù)合物 引發(fā)酶(primase): 50-60kD 作用方式為陣發(fā)性的,每次作用拷貝615個(gè)核苷酸 利用NTP 4、真核生物的復(fù)制起始受許可因子的控制真核生物DNA復(fù)制特點(diǎn)1.起點(diǎn)和速度真核生物起始點(diǎn)多 原核生物1個(gè)起始點(diǎn)完成全部復(fù)制,再開始新的復(fù)制 起始點(diǎn)可連續(xù)復(fù)制復(fù)制速度慢(1/20) 復(fù)制速度快 多點(diǎn)同時(shí),總耗時(shí)比真核生物少真核生物DNA復(fù)制特點(diǎn)2.DNA聚合酶: 、五種和主為

18、線粒體復(fù)制酶;為修復(fù)酶需要-增殖細(xì)胞核抗原(PCNA)-作為復(fù)合因子PCNA大腸桿菌中的DNA聚合酶的亞基,形成環(huán)狀卡子,增強(qiáng)酶的持續(xù)合成能力兩個(gè)蛋白因子:復(fù)制蛋白A和復(fù)制因子CRP-ASSB;RF-C夾子裝卸器 (PCNA在DNA鏈上的裝卸)真核生物DNA復(fù)制特點(diǎn)3.RNA引物和岡崎片段真核生物 原核生物引物10個(gè)核苷酸 引物幾十個(gè)核苷酸岡崎片段100-200個(gè)核苷酸 1000-2000個(gè)核苷酸真核生物DNA復(fù)制特點(diǎn)4.端粒和端粒酶原核生物:復(fù)制后可填補(bǔ)去除引物后的5末端的空缺真核生物:通過端粒和端粒酶解決此問題 Eukaryotic DNA replication.Step 1: prim

19、er synthesis by DNA polymerase; step 2: replication factor C (RFC) displacement of DNA polymerase and recruitment of proliferating cell nuclear antigen (PCNA); step 3: elongation by the newly recruited DNA polymerase-holoenzyme; step 4: strand displacement by Pol-; step 5: cutting of the 5 displaced

20、 flap by (Fen1); step 6: sealing by DNA ligase I .端粒和端粒酶染色體上有一個(gè)帽子,它的名字叫端粒-作用是保持染色體的完整性。Telomere:真核生物染色體線性DNA分子末端的結(jié)構(gòu)部分,通常龐大呈粒狀。(見圖)DNA每復(fù)制一次,端粒就縮短一點(diǎn)。當(dāng)端??s短至一定的長度時(shí),細(xì)胞就會(huì)停止分裂甚至發(fā)生細(xì)胞死亡,因而被稱作細(xì)胞壽命的“有絲分裂鐘”。在某些癌細(xì)胞中,端粒酶不斷修復(fù)延長受損的端粒,防止端粒因細(xì)胞分裂而有所損耗,從而使得細(xì)胞獲得無限增殖分裂的能力。 端粒酶簡介端粒酶主要依靠兩種成分:端粒酶逆轉(zhuǎn)錄酶+作為模板的一小段RNA序列。德克薩斯大學(xué)細(xì)胞生

21、物學(xué)系教授Jerry 聯(lián)合著名生物技術(shù)公司Geron合作開發(fā)了一種阻斷端粒酶作用的新型化合物,將其命名為GRN163L。端粒理論 端粒是位于染色體兩端的重復(fù)DNA序列,細(xì)胞分裂時(shí),部分端粒丟失,被細(xì)胞感知為DNA損傷。端粒酶可補(bǔ)充丟失的端粒。端粒的長度決定細(xì)胞的壽命,端粒的縮短導(dǎo)致細(xì)胞的衰老和死亡。 端粒學(xué)說 由Olovnikov提出,細(xì)胞在每次分裂過程中都會(huì)由于DNA聚合酶功能障礙而不能完全復(fù)制它們的染色體,因此最后復(fù)制DNA序列可能會(huì)丟失,最終造成細(xì)胞衰老死亡。 1.端粒具有維持染色體結(jié)構(gòu)完整性的作用。 2.端粒酶是一種逆轉(zhuǎn)錄酶,由RNA和蛋白質(zhì)組成,是以自身RNA為模板,合成端粒重復(fù)序列

22、,加到新合成DNA鏈末端。 3.在人體內(nèi)端粒酶出現(xiàn)在大多數(shù)的胚胎組織、生殖細(xì)胞、炎性細(xì)胞、更新組織的增生細(xì)胞以及腫瘤細(xì)胞中。但是許多問題用端粒學(xué)說還不能解釋。1.有人就不同年齡供體角膜內(nèi)皮細(xì)胞的端粒長度進(jìn)行研究發(fā)現(xiàn)角膜內(nèi)皮細(xì)胞內(nèi)端粒長度長期維持在一個(gè)較高的水平,而端粒酶卻不表達(dá)。2.Kippling發(fā)現(xiàn),鼠的端粒比人類長近5-10倍,壽命卻比人類短的多??磥矶肆5拈L度縮短是衰老的原因還是結(jié)果尚需進(jìn)一步研究。 真核生物染色體 DNA末端補(bǔ)齊模式 (1) 端粒DNA (Telomer) TTGGGG(T2G4)序列高度重復(fù)的末端(四膜蟲) 5 TTGGGGTTGGGGTTGGGGTTGGGG 3

23、(富含 G 鏈) 3 AACCCC AACCCC AACCCC 5 (富含 C 鏈) G基四重線(2) 端粒酶( Telomerase)1985. Carol Greider & Blackburn, 1986. Gottchling 端粒酶逆轉(zhuǎn)錄酶a、核蛋白(蛋白質(zhì)+核酸RNA)b、含約長150NT的RNA,其中含 15 拷貝的CxAy重復(fù)序列, 是合成端粒T2G4的模板c、延長的3-T2G4端作為5-端DNA合成的模板(3) 補(bǔ)齊過程 通過TG鏈的回折形成 發(fā)夾結(jié)構(gòu)(GG氫鍵) 尺蠖模型 實(shí)驗(yàn)表明人體細(xì)胞通過監(jiān)測失去的端粒的重復(fù)數(shù)而計(jì)數(shù)細(xì)胞分裂次數(shù),當(dāng)端粒長度下降到某一臨界值時(shí),細(xì)胞終止分

24、裂衰老、死亡“多莉”的衰老 研究端粒丟失的速率,預(yù)測人類的壽命 XX XY why?研究推測端粒酶與腫瘤的關(guān)系a、復(fù)制子的大?。⊿izes of replicon):酵母和果蠅平均 40 kb哺乳動(dòng)物 平均 100 kb原核生物的 DNA: 1000 kbb、岡崎片段(Okazaki fragments):原核生物的 DNA:1000-2000 nt真核生物的DNA:100-200 ntc、復(fù)制速度(Rate of replication):真核生物的DNA:3,000bp/min (50/sec)原核生物的DNA:50,000bp/min (900/sec)原核生物和真核生物DNA復(fù)制的比較

25、 1. Semi-conservative replication2. Semi-discontinuous repliction3. DNA helicase, Ssb4. RNA priming5. 校正閱讀(Proofreading)1. 復(fù)制起點(diǎn)(單、多)2. 復(fù)制子(大小、多少)3. 復(fù)制起始的許可因子的控制 (復(fù)制周期的重疊與否)4. 復(fù)制叉移動(dòng)的速度 (900/50 nt/S)5. 岡崎片段的大小6. 端粒和端粒酶7. DNA聚合酶Polymerases相同點(diǎn):不同點(diǎn):第二節(jié) 突變 1.DNA作為一種能決定生命狀態(tài)存在和延續(xù)的生物大分子,在遺傳過程中必需保持高度的精確性和完整性。

26、2.在DNA復(fù)制過程中,仍難免會(huì)存在少量未被校正的錯(cuò)誤。3.DNA還會(huì)受到各種物理和化學(xué)因素的損傷。 這些差錯(cuò)和損傷如果不被修復(fù),將會(huì)產(chǎn)生嚴(yán)重的細(xì)胞學(xué)后果,所以,維護(hù)DNA遺傳信息的穩(wěn)定性對生物細(xì)胞來說是極其重要的。一、突變的類型1、堿基對的置換(substitution) 轉(zhuǎn)換(Transition): 最普通的一種點(diǎn)突變,指一種嘧啶被另一種嘧啶代替,一種嘌呤被另一種嘌呤代替。使GC對被AT對替換,或者相反。 顛換(Transversion): 另一種不常見的點(diǎn)突變,嘌呤被嘧啶代替或者相反,如AT對變成了TA、CG對。2、移碼突變(frameshift mutation) 由堿基的缺失或插入

27、造成。 DNA突變的類型 -T-C-G-G-C-T-G-T-A-C-G- -A-G-C-C-G-A-C-A-T-G-C-轉(zhuǎn)換 -T-C-G-A-G-C-T-G-T-A-C-G- -A-G-C-T-C-G-A-C-A-T-G-C-插入A -T-C-G-C-T-G-T-A-C-G- -A-G-C-G-A-C-A-T-G-C-缺失T野生型基因 -T-C-G-A-C-T-G-T-A-C-G- -A-G-C-T-G-A-C-A-T-G-C- -T-C-G-T-C-T-G-T-A-C-G- -A-G-C-A-G-A-C-A-T-G-C-顛換堿基對的置換(substitution)移碼突變(framessh

28、ift mutation)二、突變的原因兩個(gè)概念:自發(fā)突變(spontaneous mutation):由于正常的細(xì)胞活動(dòng),或細(xì)胞與環(huán)境的隨機(jī)相互作用,這些過程所引起的生物DNA序列的改變。誘發(fā)突變(induced mutation): 特定的化學(xué)或物理因素引起的DNA序列改變。 Note: 所有突變都包含DNA序列的改變?。ㄒ唬〥NA分子的自發(fā)性損傷1、DNA復(fù)制中的錯(cuò)誤 以DNA為模板按堿基配對進(jìn)行DNA復(fù)制是一個(gè)嚴(yán)格而精確的事件,但也不是完全不發(fā)生錯(cuò)誤的。 2、DNA的自發(fā)性化學(xué)變化 生物體內(nèi)DNA分子可以由于各種原因發(fā)生變化,至少有: 堿基的異構(gòu)互變; 堿基的脫氨基作用; 脫嘌呤與脫嘧

29、啶; 堿基修飾與鏈斷裂 (二)物理因素引起的DNA損傷 1、紫外線引起的DNA損傷 當(dāng)DNA受到最易被其吸收波長(260 nm)的紫外線照射時(shí),主要是使同一條DNA鏈上相鄰的嘧啶以共價(jià)鍵連成二聚體。 2、 電離輻射引起的DNA損傷 電離輻射損傷DNA有直接和間接的效應(yīng),直接效應(yīng)是DNA直接吸收射線能量而遭損傷;間接效應(yīng)是指DNA周圍其他分子(主要是水分子)吸收射線能量產(chǎn)生具有很高反應(yīng)活性的自由基進(jìn)而損傷DNA。損傷包括: 堿基變化; 脫氧核糖變化; DNA鏈斷裂; 交聯(lián)。+光 照(三)化學(xué)因素引起的DNA損傷1、烷化劑對DNA的損傷 堿基烷基化; 堿基脫落; 斷鏈; 交聯(lián) 2、堿基類似物、修飾

30、劑對DNA的損傷 如:人工可以合成一些堿基類似物用作促突變劑或抗癌藥物,如5-溴尿嘧啶(5-BU)、5-氟尿嘧啶(5-FU)、2-氨基腺嘌呤(2-AP)等。 還有一些人工合成或環(huán)境中存在的化學(xué)物質(zhì)能專一修飾DNA鏈上的堿基或通過影響DNA復(fù)制而改變堿基序列,例如亞硝酸鹽能使C脫氨變成U,經(jīng)過復(fù)制就可使DNA上的G-C變成A-U對。DNA的損傷:由自發(fā)的或環(huán)境的因素引起DNA一級(jí)結(jié)構(gòu)的任何異常的改變稱為DNA的損傷。常見的DNA的損傷包括堿基脫落、堿基修飾、交聯(lián)、鏈的斷裂、重組等。第三節(jié) 損傷修復(fù)系統(tǒng)DNA損傷的修復(fù) 人們對DNA的修復(fù)機(jī)理進(jìn)行了深入研究,發(fā)現(xiàn)多種修復(fù)途徑。1. 能糾正復(fù)制錯(cuò)誤的

31、尿嘧啶N糖基修復(fù)酶系統(tǒng)和錯(cuò)配修復(fù)系統(tǒng)。2. 能修復(fù)環(huán)境因素和體內(nèi)化學(xué)物質(zhì)造成DNA分子損傷的光復(fù)活修復(fù)系統(tǒng)、切除修復(fù)系統(tǒng)、重組修復(fù)系統(tǒng)和SOS修復(fù)系統(tǒng)等。3.DNA分子的雙螺旋結(jié)構(gòu)是其損傷修復(fù)的重要基礎(chǔ),因?yàn)镈NA的互補(bǔ)雙鏈可保證其一股鏈上的損傷被切除后,能從另一股鏈上獲得修復(fù)所需要的信息。 一、錯(cuò)配修復(fù)(Mismatch repair) 原核細(xì)胞內(nèi)存在甲基化酶,能使位于5GATC序列中腺苷酸的N6位甲基化。 復(fù)制后DNA在短期內(nèi)(數(shù)分鐘)為半甲基化的GATC序列,一旦發(fā)現(xiàn)錯(cuò)配堿基,即將未甲基化鏈切除一段包含錯(cuò)誤堿基的序列,并以甲基化的鏈為模板進(jìn)行修復(fù)。據(jù)母鏈甲基化原則找出錯(cuò)配堿基的示意圖堿基

32、錯(cuò)配修復(fù)過程示意圖二、 核苷酸切除修復(fù)系統(tǒng) 當(dāng)DNA鏈上相應(yīng)位置的核苷酸發(fā)生損傷,導(dǎo)致雙鏈之間無法形成氫鍵,在一系列酶的作用下,將DNA分子中受損傷部分切除掉,并以完整的那一條鏈為模板,合成切去的部分,然后使DNA恢復(fù)正常結(jié)構(gòu)。 DNA的損傷和切除修復(fù)堿基丟失堿基缺陷或錯(cuò)配結(jié)構(gòu)缺陷切開核酸內(nèi)切酶核酸外切酶切除DNA聚合酶IDNA連接酶核酸內(nèi)切酶核酸外切酶切開切除修復(fù)連接糖苷酶三、堿基切除修復(fù)系統(tǒng) 糖苷水解酶: 細(xì)胞中能特異切除受損核苷酸上的N-糖苷鍵,在DNA鏈上形成AP位點(diǎn)(去嘌呤或去嘧啶位點(diǎn))。AP核酸內(nèi)切酶:能在AP位點(diǎn)附近(5或3位置)將DNA鏈切開;核酸外切酶:移去含AP位點(diǎn)核苷酸在內(nèi)的小片段DNA;DNA聚合酶I: 合成新片段;DNA連接酶: 連接切口而修復(fù)。第四節(jié)遺傳重組DNA重組(recombination)1、概念:不同DNA鏈的斷裂和連接-產(chǎn)生的DNA片段間的交換和重新組合,形成新的DNA。2、意義:重組是“遺傳學(xué)的靈魂”,生物的進(jìn)化、分子克隆技術(shù)都源于此。一 同源重組 一、概述1、定義:兩個(gè)同源DNA分子間的序列重組。2、條件:(1)兩個(gè)DNA分子有同源序列 (2)

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