西北農(nóng)林科技大學(xué)經(jīng)濟(jì)管理學(xué)院

西北農(nóng)林科技大學(xué)農(nóng)學(xué)院教案2015——2016學(xué)年第1學(xué)期教 研室 遺傳學(xué)課程名稱 生物信息學(xué)授課對(duì)象種科系2013級(jí)本科生授課教師 童維職稱職務(wù) 講師教材名稱 《生物信息學(xué)》2015年6月17日《生物信息學(xué)》課程教案章節(jié)名稱：第八章基因組測(cè)序與分析第一節(jié)基因組測(cè)號(hào)課堂講授(1),實(shí)踐課(1)I教學(xué)時(shí)數(shù)11教學(xué)目標(biāo)：.了解基因組測(cè)序的進(jìn)展.理解新一代測(cè)序(NextGenerationSequencing,NGS)技術(shù)的原理.理解新一代測(cè)序與Megabace測(cè)序技術(shù)的差異.了解基因組拼接的常用軟件授課內(nèi)容要點(diǎn)：.介紹各基因組測(cè)序項(xiàng)目，特別是農(nóng)學(xué)院學(xué)生更關(guān)注的植物基因組測(cè)序項(xiàng)目；.傳統(tǒng)的Sanger測(cè)序法，及基于毛細(xì)管電泳的Megabace測(cè)序技術(shù)；.展示NCBI統(tǒng)計(jì)的基因組測(cè)序增長統(tǒng)計(jì)、及測(cè)序成本變化圖形；請(qǐng)同學(xué)們關(guān)注在2008年前后，測(cè)序數(shù)目的突然激增、及測(cè)序成本的顯著下降，提問“這時(shí)期發(fā)生了什么重大事件，導(dǎo)致基因組測(cè)序如此大的變化”？.引入新一代測(cè)序(NextGenerationSequencing,NGS)技術(shù)；以Solexa測(cè)序儀為例，講述新一代測(cè)序的基因組測(cè)序原理。.引導(dǎo)同學(xué)們展開討論，“相比Megabace測(cè)序技術(shù)，為什么將Solexa測(cè)序稱為新一代測(cè)序技術(shù)(NextGenerationSequencing,NGS)?NGS的優(yōu)勢(shì)體現(xiàn)在哪？"；進(jìn)行解答：/反應(yīng)載體：96孔板-＞芯片；液相-＞固相/反應(yīng)控制方法：單個(gè)反應(yīng)控制-＞過程控制/測(cè)序通量：低-＞高/測(cè)序成本：昂貴-＞便宜.布置學(xué)生課后思考題(下節(jié)課解答)：新一代測(cè)序(NextGenerationSequencing,NGS)技術(shù)有哪些優(yōu)勢(shì)，又有哪些不足？教學(xué)重點(diǎn)：.基因組測(cè)序技術(shù)的總體分類；.新一代測(cè)序的基因組測(cè)序原理；.相比Megabace測(cè)序技術(shù)，NGS的優(yōu)勢(shì)。教學(xué)難點(diǎn)：1.以Solexa測(cè)序儀為例，講述新一代測(cè)序的基因組測(cè)序原理。教學(xué)方法：講授，多媒體+板書課堂討論題、思考題'作業(yè):.基于基因組測(cè)序增長統(tǒng)計(jì)圖、及測(cè)序成本變化圖；提問“2008年期間發(fā)生了什么重大事件，導(dǎo)致基因組測(cè)序如此劇烈的變化”？.“相比Megabace測(cè)序技術(shù)，為什么將Solexa測(cè)序稱為新一代測(cè)序技術(shù)(NextGenerationSequencing,NGS)?NGS的優(yōu)勢(shì)體現(xiàn)在哪？。展開討論。.課后作業(yè)思考題：新一代測(cè)序(NextGenerationSequencing,NGS)技術(shù)有哪些優(yōu)勢(shì)，又有哪些不足？參考資料(含參考書、文獻(xiàn)等)：《基礎(chǔ)生物信息學(xué)及應(yīng)用》，蔣彥等，清華大學(xué)出版社《生物信息學(xué)一基因和蛋白質(zhì)分析的使用指南》，李衍達(dá)，清華大學(xué)出版社《生物信息學(xué)》，趙國屏，科學(xué)出版社《生物信息學(xué)手冊(cè)》，郝柏林，上?？茖W(xué)技術(shù)出版社備注：.讓學(xué)生了解當(dāng)今基因組測(cè)序的進(jìn)展；.讓同學(xué)們觀察基因組測(cè)序增長統(tǒng)計(jì)圖、及測(cè)序成本變化圖；請(qǐng)同學(xué)們關(guān)注在2008年前后，測(cè)序數(shù)目的突然激增、及測(cè)序成本的顯著下降，提問“這時(shí)期發(fā)生了什么重大事件，導(dǎo)致基因組測(cè)序如此大的變化”？。培養(yǎng)、訓(xùn)練學(xué)生的敏銳觀察能力、及提出科學(xué)問題的能力。.引導(dǎo)同學(xué)們展開討論，“相比Megabace測(cè)序技