




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文檔簡(jiǎn)介
第七章
核酸代謝
第七章
核酸代謝
1一、核酸的酶促降解
細(xì)胞內(nèi)核酸在核酸酶的作用下逐步分解;
體內(nèi)DNA分解極為緩慢,RNA分解較快,二者終產(chǎn)物
一致。
磷酸
核酸→核苷酸戊糖(核糖或脫氧核糖)
核苷
堿基(嘌呤或嘧啶)
一、核酸的酶促降解
細(xì)胞內(nèi)核酸在核酸酶的作用下逐步分解2水解產(chǎn)物除部分作為新的核苷酸合成的原料外,大部
分被進(jìn)一步分解。
◆
戊糖――HMS氧化分解;
◆
磷酸――磷酸代謝;
◆
堿基――分別降解。
水解產(chǎn)物除部分作為新的核苷酸合成的原料外,大部
3二、嘌呤、嘧啶代謝
(一)嘌呤的分解
◆
反應(yīng)部位:主要肝、腎、小腸
◆
過(guò)程:①水解脫氨②氧化
◆
重要的酶:黃嘌呤氧化酶
◆
不同生物嘌呤分解終產(chǎn)物有差異。
人體嘌呤分解終產(chǎn)物為尿酸,尿酸微溶于水,如體內(nèi)
產(chǎn)生過(guò)多,不能及時(shí)排出,則沉積在體內(nèi)。
如:沉積在關(guān)節(jié)——痛風(fēng)癥
沉積在腎——腎結(jié)石二、嘌呤、嘧啶代謝
(一)嘌呤的分解
◆反應(yīng)部4第7章核酸代謝2013年最新《生物化學(xué)原理》課件王雅琴5(二)嘧啶的分解
終產(chǎn)物:
NH3,CO2,
β-脲基異丁酸。
β-丙AA
NH3,+CO2+乙酸
(二)嘧啶的分解
終產(chǎn)物:
NH3,CO2,
β-6三、核苷酸的合成
1.核酸降解產(chǎn)物:核苷酸、核苷、堿基,被吸收或重新利用。
2.生物體利用其它物質(zhì)合成核苷酸→核酸。
不一定需要膳食供給。
(一)嘌呤核苷酸的合成
用同位素示蹤實(shí)驗(yàn),證明嘌呤核苷酸中各原子的來(lái)源:
AMP
原料--→IMP
GMP
GTPATP三、核苷酸的合成
1.核酸降解產(chǎn)物:核苷酸、核苷、堿基,7(二)嘧啶核苷酸合成
同位素示蹤試驗(yàn)證明:嘧啶核苷酸元素來(lái)源:
從頭合成――主要途徑
原料:(Gln,CO2)
氨甲酰磷酸,Asp
方式:原料嘧啶環(huán)UMP
CMP
TMP核糖、PCO2,Gln組裝(二)嘧啶核苷酸合成
同位素示蹤試驗(yàn)證明:嘧啶核苷酸元素來(lái)源8四、核酸的生物合成
核酸是細(xì)胞基本成分,DNA是主要的遺傳物
質(zhì),是遺傳物質(zhì)的載體。
DNA功能:
①貯存遺傳信息。
②傳遞遺傳信息(復(fù)制、轉(zhuǎn)錄、翻譯)。
③接受遺傳信息(通過(guò)反轉(zhuǎn)錄)。四、核酸的生物合成
核酸是細(xì)胞基本成分,DN91953年,F(xiàn).Crick在總結(jié)DNA與RNA和蛋白質(zhì)的關(guān)系的基礎(chǔ)上,提出了分子生物學(xué)的中心法則,、1957年修改:
1953年,F(xiàn).Crick在總結(jié)DNA與RNA和蛋白質(zhì)10復(fù)制:以親代DNA分子為模板合成新的子代DNA分子
的過(guò)程,新合成的子代DNA分子與親代DNA分
子完全一樣。DNA→DNA
RNA也可以復(fù)制(病毒)RNA→RNA
轉(zhuǎn)錄:以DNA為模板,合成RNA的過(guò)程。DNA→RNA
反轉(zhuǎn)錄:在反轉(zhuǎn)錄酶作用下,以RNA為模板合成DNA
的過(guò)程。
翻譯:以RNA為模板,根據(jù)RNA鏈上的每三個(gè)核苷酸
(堿基)決定一種AA的規(guī)則,合成出具有特定
AA順序的蛋白質(zhì)肽鏈的過(guò)程。RNA→Pr復(fù)制:以親代DNA分子為模板合成新的子代DNA分子
11第7章核酸代謝2013年最新《生物化學(xué)原理》課件王雅琴12DNA的復(fù)制。
DNA生物合成方式DNA的反轉(zhuǎn)錄合成。(病毒)
DNA損傷的修復(fù)。
13(一)DNA的生物合成
A.DNA復(fù)制1.參與DNA復(fù)制的酶和蛋白質(zhì)(原核生物)
(1)DNA聚合酶(DNApolymerase,DNApol)
DNA聚合酶:以DNA為模板、dNTP為底物催化合成DNA的一類酶。
DNApolⅠ
原核生物有三種DNA聚合酶DNApolⅡ
DNApolⅢ(一)DNA的生物合成
A.DNA復(fù)制14
DNA聚合酶作用條件:
◆
需模板:DNA
◆
需引物:具3′-OH的DNAorRNA
◆
底物:4種dNTP
◆
需Mg2+,Mn2+
◆
使dNTP以3′,5′磷酸二酯鍵相連,按5′→3′方向
聚合成與模板互補(bǔ)的DNA鏈。
DNA聚合酶作用條件:
◆需模板:DNA
15DNA聚合酶Ⅰ(DNApolⅠ)催化特點(diǎn)
DNApolⅠ是一個(gè)多功能酶
◆5′→3′聚合催化特性:
使dNTP按模板的要求逐個(gè)加到具有3′-OH端的
多核苷酸的鏈上。
DNA聚合酶Ⅰ(DNApolⅠ)催化特點(diǎn)
DNAp16
◆
3′→5′外切酶活性:從3′-OH端水解DNA。
出現(xiàn)與模板錯(cuò)配的核苷酸時(shí),DNApolⅠ先切去錯(cuò)
配的堿基(核苷酸)然后再繼續(xù)進(jìn)行聚合。
功能:識(shí)別、消除錯(cuò)配堿基。對(duì)聚合起校正作用。
◆
3′→5′外切酶活性:從3′-OH端水解D17
◆
5′→3′外切酶的活性:從5′端水解DNA鏈,
也可距5′端12個(gè)左右堿基處水解DNA鏈。
(只作用于雙鏈DNA)。
功能:切除引物,切除變異損傷的核苷酸—修復(fù)
作用。
◆
5′→3′外切酶的活性:從5′端水解D18原核生物有三種DNA聚合酶比較:
原核生物有三種DNA聚合酶比較:
19(2)DNA連接酶(DNALigase)
雙鏈DNA一條鏈上有切口,3′-OH與5′-P相鄰;
不能連接兩條游離的單鏈。
(切口處的兩核苷酸必須相鄰不能缺少核苷酸。)
作用:在DNA不連續(xù)合成時(shí)起連接作用。
3′5′(2)DNA連接酶(DNALigase)
20(3)解鏈酶(Helicase解螺旋酶,復(fù)制蛋白——rep
蛋白)
作用:解開DNA雙螺旋,使其成單鏈。
(4)旋轉(zhuǎn)酶
作用:消除DNA超螺旋的酶。(3)解鏈酶(Helicase解螺旋酶,復(fù)制蛋白——re21(5)引發(fā)酶
引發(fā)酶:催化RNA引物合成的RNA聚合酶。
作用:合成引物
DNA聚合酶不能從頭起始DNA合成,需要引物
(primer),只能在引物(3′-OH)端逐漸加上
脫氧核苷酸,延長(zhǎng)DNA鏈。
DNA合成的引物有三種:RNA片段;
DNA片段;
tRNA片段。(5)引發(fā)酶
引發(fā)酶:催化RNA引物合成的R22
(6)單鏈結(jié)合蛋白
(Singlestrandbindingprotein——SSB蛋白)
作用:與單鏈DNA的特異結(jié)合的蛋白質(zhì)。
◆
SSB與解開的單股DNA結(jié)合,使兩條單鏈不再形
成雙鏈,保持單鏈區(qū)的穩(wěn)定。
◆
防止核酸酶降解DNA。
(6)單鏈結(jié)合蛋白
(Singlestr232.復(fù)制的方式和特點(diǎn)
(1)半保留復(fù)制:
Watson和Crick1953年提出,DNA的兩條鏈都能作為模板,分別合成出兩條互補(bǔ)的新鏈。2.復(fù)制的方式和特點(diǎn)
(1)半保留復(fù)制:
Wats24機(jī)制:DNA復(fù)制時(shí),兩條互補(bǔ)連解開;兩條鏈都可做模板,然后在每條模板鏈上按堿基配對(duì)的原則形成互補(bǔ)的新鏈,組成子代DNA分子。
新產(chǎn)生的兩子代DNA分子與親代DNA分子完全相同,且子代DNA中一條鏈來(lái)自親代,另一條鏈?zhǔn)切潞铣傻摹氡A魪?fù)制。
DNA半保留復(fù)制方式,保證了DNA在代謝上的穩(wěn)定性,從而保證了生物遺傳的穩(wěn)定性和準(zhǔn)確性。(穩(wěn)定是相對(duì)的)。機(jī)制:DNA復(fù)制時(shí),兩條互補(bǔ)連解開;兩條鏈都可做25(2)DNA的半不連續(xù)復(fù)制:
問(wèn)題的提出????:
DNA分子兩條鏈都能做模板,幾乎同時(shí)、齊頭并進(jìn)
合成為兩條新的互補(bǔ)鏈。
DNA模板的兩條鏈反向平行,一條5′→3′;
另一條3′→5′。
DNA聚合酶要求:模板方向3′→5′。
合成新鏈方向5′→3′。
如何解釋在同一個(gè)復(fù)制叉中兩條新鏈合成是同步,齊
頭并?
日本學(xué)者岡崎——DNA的半不連續(xù)復(fù)制模型:(2)DNA的半不連續(xù)復(fù)制:
問(wèn)題的提出????26DNA半不連續(xù)復(fù)制模型:
◆DNA復(fù)制時(shí)兩條親代單鏈DNA都做為模板。
◆復(fù)制叉:DNA復(fù)制時(shí),雙螺旋局部解開,在復(fù)制區(qū)
形成Y形結(jié)構(gòu)——復(fù)制叉;
隨著復(fù)制叉的移動(dòng)DNA雙螺旋逐漸解開。
DNA半不連續(xù)復(fù)制模型:
◆DNA復(fù)制時(shí)兩條親代單鏈27
◆
以復(fù)制叉移動(dòng)方向?yàn)闇?zhǔn);
3′→5′走向模板鏈,DNA新鏈合成方向5′→3′,與
復(fù)制叉方向一致,連續(xù)合成——前導(dǎo)鏈。
◆
5′→3′走向模板鏈,DNA新鏈合成方向也是5′→3′,
與復(fù)制叉移動(dòng)方向相反,先照模板按5′→3′合成若
干短的片斷——岡崎片斷,然后由連接酶將短片斷
連接,成一條完整的DNA鏈。不連續(xù)合成——滯后
鏈(后隨鏈)。
◆以復(fù)制叉移動(dòng)方向?yàn)闇?zhǔn);
3′→5′走28結(jié)論:
DNA的半不連續(xù)復(fù)制:一條新鏈連續(xù)合成;
另一條新鏈不連續(xù)合成。結(jié)論:
DNA的半不連續(xù)復(fù)制:一條新鏈連續(xù)合成;
29
岡崎片斷長(zhǎng)度:原核生物1000-2000個(gè)Nt。
真核生物200個(gè)左右Nt。
岡崎片斷長(zhǎng)度:原核生物1000-2303.DNA復(fù)制過(guò)程
合成的起始;
DNA鏈的延伸;
合成終止。
3.DNA復(fù)制過(guò)程
合成的起始;313.DNA復(fù)制過(guò)程
(1)合成的起始:
◆
引發(fā)酶識(shí)別、結(jié)合在模板DNA起始位點(diǎn);
◆DNA雙螺旋及超螺旋解開(邊合成邊解開);
◆RNA引物合成。3.DNA復(fù)制過(guò)程
(1)合成的起始:
◆引發(fā)酶32(2)DNA鏈的延伸
◆
在DNApolⅢ的催化下,按照模板鏈3′→5′順序
在RNA引物3′-OH末端逐個(gè)按上相應(yīng)的核苷酸,
合成互補(bǔ)新鏈。
◆前導(dǎo)鏈合成方向5′→3′,連續(xù)合成。
◆滯后鏈合成方向5′→3′,不連續(xù)合成。(2)DNA鏈的延伸
◆在DNApolⅢ的催化下,33(3)合成終止
DNA復(fù)制合成的終止包括:
①RNA引物的切除和缺口的填補(bǔ)。
通過(guò)DNApolⅠ5′→3′外切酶活性,或RNaseH
酶切除引物,然后由polⅠ5′→3′聚合活性補(bǔ)齊
缺口。
②DNA片段的連接——DNA連接酶。(3)合成終止
DNA復(fù)制合成的終止包括:
34第7章核酸代謝2013年最新《生物化學(xué)原理》課件王雅琴35第7章核酸代謝2013年最新《生物化學(xué)原理》課件王雅琴36第7章核酸代謝2013年最新《生物化學(xué)原理》課件王雅琴37B、DNA反(逆)轉(zhuǎn)錄合成——RNA指導(dǎo)的DNA合成
反轉(zhuǎn)錄:在反轉(zhuǎn)錄酶作用下,以RNA為模板合成DNA
的過(guò)程。
反轉(zhuǎn)錄的發(fā)現(xiàn):
◆1964年Temin提出反轉(zhuǎn)錄假設(shè)。
◆1970年Temin和Batimore,同時(shí)分別從致癌RNA
病毒中發(fā)現(xiàn)反轉(zhuǎn)錄酶。
后來(lái)在正常動(dòng)物胚胎細(xì)胞也發(fā)現(xiàn)反轉(zhuǎn)錄酶。
◆
反轉(zhuǎn)錄酶又稱為:依賴RNA的DNA聚合酶
RNA指導(dǎo)的DNA聚合酶B、DNA反(逆)轉(zhuǎn)錄合成——RNA指導(dǎo)的DNA合成
反轉(zhuǎn)錄38反轉(zhuǎn)錄條件:酶:反轉(zhuǎn)錄酶。
底物:4種dNTP為。
模板:病毒單鏈RNA為。
引物:宿主細(xì)胞的tRNA。
反轉(zhuǎn)錄條件:酶:反轉(zhuǎn)錄酶。
39合成方式:
致癌DNA
整合到宿主DNA
病毒RNA
cDNA
(模板)mRNA
蛋白質(zhì)(轉(zhuǎn)化蛋白)
以病毒RNA為模板合成的cDNA(complementaryDNA)通過(guò)復(fù)制合成致癌DNA,后者可整合到宿主DNA中,并隨宿主細(xì)胞分裂而遺傳下去,遇到合適的條件便進(jìn)行復(fù)制產(chǎn)生致癌DNA分子,引起癌變。
轉(zhuǎn)錄、翻譯產(chǎn)生的蛋白(轉(zhuǎn)化蛋白、病毒蛋白)也引起癌變。反轉(zhuǎn)錄酶轉(zhuǎn)錄翻譯復(fù)制合成方式:
40反轉(zhuǎn)錄酶具有三種酶活性:
①逆轉(zhuǎn)錄功能:利用病毒RNA為模板合成互補(bǔ)的
cDNA,形成RNA-DNA雜合子。
②復(fù)制功能:以新合成(逆轉(zhuǎn)錄)的cDNA為模板,
合成另一條DNA成DNA-DNA雙鏈。
③RNaseH活性:水解RNA-DNA雜交分子中RNA。反轉(zhuǎn)錄酶具有三種酶活性:
①逆轉(zhuǎn)錄功能:利用病毒RNA41第7章核酸代謝2013年最新《生物化學(xué)原理》課件王雅琴42逆轉(zhuǎn)錄病毒生活史逆轉(zhuǎn)錄病毒生活史43C、DNA損傷與修復(fù)
(1)DNA損傷
DNA分子不是絕對(duì)穩(wěn)定的,可受多種因素的作用而
改變或受破壞.
◆
生物因素:復(fù)制及基因重組過(guò)程出現(xiàn)差錯(cuò)而改變。
◆
物理因素:紫外線、電離輻射、X-射線等。
◆化學(xué)因素:烷化劑,氧化劑等化學(xué)誘變劑。C、DNA損傷與修復(fù)
(1)DNA損傷
DNA分44UV引起輻射損傷:形成嘧啶二聚體,C和C之間,
T和T之間形成共價(jià)鍵。UV引起輻射損傷:形成嘧啶二聚體,C和C之間,
45(2)DNA損傷的修復(fù)
◆
光復(fù)活作用
利用光能,光復(fù)活酶催化下切除由紫外線照射引起
的DNA嘧啶二聚體。
DNA復(fù)制、DNA轉(zhuǎn)錄時(shí),到嘧啶二聚體處,復(fù)制、
轉(zhuǎn)錄均受阻。
修復(fù)過(guò)程:(2)DNA損傷的修復(fù)
◆光復(fù)活作用
利用光46◆
光復(fù)活酶能在暗處識(shí)別損傷的DNA部位,并結(jié)合在受
損部位。
◆
可見光激活光復(fù)活酶,分解由UV照射而形成的DNA中
的嘧啶二聚體。
◆
光復(fù)活作用高度專一,只能修復(fù)UV照射引起的DNA嘧
啶二聚體。
光復(fù)活酶只存在于低等單細(xì)胞(如微生物)→鳥類;
高等哺乳動(dòng)物無(wú)此酶。
◆
光復(fù)活酶能在暗處識(shí)別損傷的DNA部位,并結(jié)合在受
損472.切除修復(fù)——(復(fù)制前修復(fù))
在幾種酶作用下,將DNA分子中錯(cuò)配的或受損的部位切除,然后以完好鏈為模板合成出切除的部位。
該機(jī)制普遍存在,作用于各種損傷。
三種:堿基切除修復(fù):修復(fù)DNA中改變的堿基。
核苷酸切除修復(fù):修復(fù)DNA中巨大損傷。
堿基錯(cuò)配修復(fù)(前述)。2.切除修復(fù)——(復(fù)制前修復(fù))
在幾種酶作用下,將DNA48◆
堿基切除修復(fù)◆
堿基切除修復(fù)49◆
核苷酸切除修復(fù):
過(guò)程:識(shí)別、切斷→修復(fù)→切除→連接(原核生物)
◆
核苷酸切除修復(fù):
過(guò)程:識(shí)別、切斷→修復(fù)→切除→連接(原50◆
識(shí)別及切斷:UvrA,UvrB識(shí)別并結(jié)合在DNA損傷處,
UvrC(相當(dāng)于核酸內(nèi)切酶)在損傷處
靠近5′→3′一側(cè)切斷,產(chǎn)生切口。
◆
修復(fù):以另一條完好單鏈為模板,由DNApolⅠ在切
口處修復(fù)合成,補(bǔ)齊缺口;方向5′→3′。
◆
切除:UvrC在受損傷部位3′一側(cè)切斷,去除受損
傷片段。
◆
連接:連接酶將新合成的DNA片斷與原鏈連接。
此修復(fù)發(fā)生在DNA復(fù)制前——復(fù)制前修復(fù)。◆
識(shí)別及切斷:UvrA,UvrB識(shí)別并結(jié)合在DNA損傷處,513.重組修復(fù)——(復(fù)制后修復(fù))
先復(fù)制再修復(fù):含有錯(cuò)誤或損傷的DNA仍可進(jìn)行復(fù)制,但子代DNA鏈在對(duì)應(yīng)于損傷的部位出現(xiàn)缺口,通過(guò)分子間重組使缺口補(bǔ)齊。
3.重組修復(fù)——(復(fù)制后修復(fù))
先復(fù)制再修復(fù):含有錯(cuò)誤或損傷52重組修復(fù)中,二聚體(或其他損傷)并未除去,第二輪復(fù)制時(shí),留在母鏈中的損傷仍會(huì)給復(fù)制造成困難,仍須以重組修復(fù)來(lái)彌補(bǔ)。
隨著復(fù)制不斷進(jìn)行,若干代以后,損傷部分雖未從分子中除去,但損傷的DNA鏈卻逐漸稀釋,以至無(wú)礙DNA正常的生理功能。
重組修復(fù)中,二聚體(或其他損傷)并未除去,第二輪復(fù)制時(shí),留在53(二)RNA的合成
兩種方式:轉(zhuǎn)錄(主要):以DNA為模板合成RNA
復(fù)制:以RNA為模板合成RNA。
1.轉(zhuǎn)錄
轉(zhuǎn)錄:以DNA為模板合成RNA的過(guò)程。
(1)轉(zhuǎn)錄的基本特征
◆
底物:4種NTP。
◆
模板:DNA
◆
不需引物:合成RNA時(shí)第一個(gè)NTP一般是嘌呤核苷
酸,大多是G(80%)。(二)RNA的合成
兩種方式:轉(zhuǎn)錄(主要):以DNA為模板合54
◆
通常為不對(duì)稱轉(zhuǎn)錄:
體內(nèi)轉(zhuǎn)錄通常只以DNA分子雙鏈的一條鏈為模板;
體外轉(zhuǎn)錄失去鏈選擇性。
作為模板的鏈稱——模板鏈,
反義鏈,
轉(zhuǎn)錄鏈。
◆
通常為不對(duì)稱轉(zhuǎn)錄:
體內(nèi)轉(zhuǎn)錄通常只以55
不作為模板的鏈稱——編碼鏈,
正義鏈,
非轉(zhuǎn)錄鏈,
信息鏈。
(或某些區(qū)域以這條鏈為模板轉(zhuǎn)錄,
另一些區(qū)域以另一條鏈為模板)不作為模板的鏈稱——編碼鏈,
56
◆
RNA聚合酶與DNA模板結(jié)合,沿DNA反義鏈
3′→5′方向移動(dòng)。
轉(zhuǎn)錄方向:RNA鏈由5′→3′延伸。
◆
RNA聚合酶——依賴DNA的RNA聚合酶
以DNA為模板;
以四種核苷三磷酸(NTP)為底物;
在Mn2+或Mg2+參與下催化RNA合成?!?/p>
RNA聚合酶與DNA模板結(jié)合,沿DNA反義鏈
57
組成:(E.ColiRNA聚合酶)
全酶由5個(gè)亞基組成,有時(shí)含有ω鏈;
表示為:α2ββ′σ(ω)
核心酶:α2ββ′
起始因子:σ亞基。
組成:(E.ColiRNA聚合酶)
全酶由5個(gè)亞基58功能:
σ亞基:識(shí)別DNA模板上特殊的轉(zhuǎn)錄起始信號(hào),在
RNA合成中起發(fā)動(dòng)作用;
核心酶:具有催化RNA聚合的活性,但不能啟動(dòng)一條
新鏈的合成。
ω鏈:功能不詳。
◆
新鏈RNA與模板DNA鏈堿基配對(duì):
dT-A,dG-C,
dC-G,dA-U。功能:
σ亞基:識(shí)別DNA模板上特殊的轉(zhuǎn)錄起始信號(hào),在59(2)轉(zhuǎn)錄過(guò)程
四步:RNA聚合酶與模板DNA起始部位識(shí)別、結(jié)合;
轉(zhuǎn)錄的起始;
RNA鏈的延長(zhǎng);
RNA鏈合成的終止。(2)轉(zhuǎn)錄過(guò)程
四步:RNA聚合酶與模板DNA起始部位識(shí)別、60
61◆
RNA聚合酶與模板的識(shí)別與結(jié)合
RNA聚合酶首先識(shí)別DNA模板上特異的起始部位
——啟動(dòng)子,并與之結(jié)合。
啟動(dòng)子(promoter):
DNA上能被RNA聚合酶識(shí)別、結(jié)合,與轉(zhuǎn)錄起始有
關(guān)的一段DNA序列?!?/p>
RNA聚合酶與模板的識(shí)別與結(jié)合
RNA聚合酶62RNA聚合酶的σ因子能識(shí)別啟動(dòng)子,使全酶與啟動(dòng)
子結(jié)合,并使雙螺旋局部解鏈。
核心酶也能與DNA模板結(jié)合,但對(duì)DNA各部位親和
力相同。RNA聚合酶的σ因子能識(shí)別啟動(dòng)子,使全酶與啟動(dòng)
63◆
轉(zhuǎn)錄的起始
第1個(gè)NTP(多為GTP)引入,產(chǎn)生新生RNA5′端。
形成穩(wěn)定的E-啟動(dòng)子-NTP
三元復(fù)合物。
σ因子從復(fù)合物釋放。◆
轉(zhuǎn)錄的起始
第1個(gè)NTP(多為GTP)引入64◆
鏈的延伸
#σ因子脫去,核心酶在DNA模板上沿3′→5′方向滑
動(dòng),按模板DNA信息,不斷加入互補(bǔ)NTP,使RNA
鏈由5′→3′方向延伸。
#
底物NTP的α-P與新生RNA鏈的3′-OH縮合,形成
3′,5′-磷酸二脂鍵。
#
隨著核心酶在模板DNA上滑行,模板DNA不斷解鏈,
原來(lái)解開的部位完成轉(zhuǎn)錄又重新形成雙螺旋。
#
E.ColiRNA聚合酶37℃時(shí)轉(zhuǎn)錄速度:20-50Nt/sec。
◆
鏈的延伸
#σ因子脫去,核心酶在DNA模板65
◆
RNA鏈合成的終止
終止包括:RNA鏈延伸停止;
新生RNA鏈從模板上釋放;
RNA聚合酶(核心酶)脫離模板。
DNA模板上有終止信號(hào)——終止子
終止子:模板DNA上提供轉(zhuǎn)錄終止信號(hào)的一段DNA
序列。◆
RNA鏈合成的終止
終止包括:RNA鏈延伸66兩種終止機(jī)制:
①不需蛋白質(zhì)因子
由RNA聚合酶識(shí)別DNA模板上的終止信號(hào)
——終止子。
②需蛋白質(zhì)因子(ρ)引起終止
DNA模板上的終止信號(hào)有ρ因子結(jié)合位點(diǎn)
——ρ位點(diǎn),
ρ因子可識(shí)別該位點(diǎn)并與之結(jié)合,當(dāng)ρ與ρ位點(diǎn)結(jié)
合后,合成即終止。兩種終止機(jī)制:
①不需蛋白質(zhì)因子
由RN67第7章核酸代謝2013年最新《生物化學(xué)原理》課件王雅琴682.RNA復(fù)制
RNA復(fù)制:以RNA為模板合成RNA的過(guò)程。
有些病毒只含RNA:遺傳信息的載體,
遺傳信息的信使。
RNA復(fù)制是病毒RNA合成的一種方式。
一些被RNA病毒感染的高等動(dòng)植物細(xì)胞也有RNA復(fù)制作用。2.RNA復(fù)制
RNA復(fù)制:以RNA為模板合成RNA的過(guò)69RNA復(fù)制合成的作用特征:
①需RNA復(fù)制酶,RNA復(fù)制酶特異性高;
②模板:RNA(病毒);
③底物:4種NTP;
④RNA鏈合成方向:5′→3′。
RNA復(fù)制合成的作用特征:
①需RNA復(fù)制酶,RNA70第七章
核酸代謝
第七章
核酸代謝
71一、核酸的酶促降解
細(xì)胞內(nèi)核酸在核酸酶的作用下逐步分解;
體內(nèi)DNA分解極為緩慢,RNA分解較快,二者終產(chǎn)物
一致。
磷酸
核酸→核苷酸戊糖(核糖或脫氧核糖)
核苷
堿基(嘌呤或嘧啶)
一、核酸的酶促降解
細(xì)胞內(nèi)核酸在核酸酶的作用下逐步分解72水解產(chǎn)物除部分作為新的核苷酸合成的原料外,大部
分被進(jìn)一步分解。
◆
戊糖――HMS氧化分解;
◆
磷酸――磷酸代謝;
◆
堿基――分別降解。
水解產(chǎn)物除部分作為新的核苷酸合成的原料外,大部
73二、嘌呤、嘧啶代謝
(一)嘌呤的分解
◆
反應(yīng)部位:主要肝、腎、小腸
◆
過(guò)程:①水解脫氨②氧化
◆
重要的酶:黃嘌呤氧化酶
◆
不同生物嘌呤分解終產(chǎn)物有差異。
人體嘌呤分解終產(chǎn)物為尿酸,尿酸微溶于水,如體內(nèi)
產(chǎn)生過(guò)多,不能及時(shí)排出,則沉積在體內(nèi)。
如:沉積在關(guān)節(jié)——痛風(fēng)癥
沉積在腎——腎結(jié)石二、嘌呤、嘧啶代謝
(一)嘌呤的分解
◆反應(yīng)部74第7章核酸代謝2013年最新《生物化學(xué)原理》課件王雅琴75(二)嘧啶的分解
終產(chǎn)物:
NH3,CO2,
β-脲基異丁酸。
β-丙AA
NH3,+CO2+乙酸
(二)嘧啶的分解
終產(chǎn)物:
NH3,CO2,
β-76三、核苷酸的合成
1.核酸降解產(chǎn)物:核苷酸、核苷、堿基,被吸收或重新利用。
2.生物體利用其它物質(zhì)合成核苷酸→核酸。
不一定需要膳食供給。
(一)嘌呤核苷酸的合成
用同位素示蹤實(shí)驗(yàn),證明嘌呤核苷酸中各原子的來(lái)源:
AMP
原料--→IMP
GMP
GTPATP三、核苷酸的合成
1.核酸降解產(chǎn)物:核苷酸、核苷、堿基,77(二)嘧啶核苷酸合成
同位素示蹤試驗(yàn)證明:嘧啶核苷酸元素來(lái)源:
從頭合成――主要途徑
原料:(Gln,CO2)
氨甲酰磷酸,Asp
方式:原料嘧啶環(huán)UMP
CMP
TMP核糖、PCO2,Gln組裝(二)嘧啶核苷酸合成
同位素示蹤試驗(yàn)證明:嘧啶核苷酸元素來(lái)源78四、核酸的生物合成
核酸是細(xì)胞基本成分,DNA是主要的遺傳物
質(zhì),是遺傳物質(zhì)的載體。
DNA功能:
①貯存遺傳信息。
②傳遞遺傳信息(復(fù)制、轉(zhuǎn)錄、翻譯)。
③接受遺傳信息(通過(guò)反轉(zhuǎn)錄)。四、核酸的生物合成
核酸是細(xì)胞基本成分,DN791953年,F(xiàn).Crick在總結(jié)DNA與RNA和蛋白質(zhì)的關(guān)系的基礎(chǔ)上,提出了分子生物學(xué)的中心法則,、1957年修改:
1953年,F(xiàn).Crick在總結(jié)DNA與RNA和蛋白質(zhì)80復(fù)制:以親代DNA分子為模板合成新的子代DNA分子
的過(guò)程,新合成的子代DNA分子與親代DNA分
子完全一樣。DNA→DNA
RNA也可以復(fù)制(病毒)RNA→RNA
轉(zhuǎn)錄:以DNA為模板,合成RNA的過(guò)程。DNA→RNA
反轉(zhuǎn)錄:在反轉(zhuǎn)錄酶作用下,以RNA為模板合成DNA
的過(guò)程。
翻譯:以RNA為模板,根據(jù)RNA鏈上的每三個(gè)核苷酸
(堿基)決定一種AA的規(guī)則,合成出具有特定
AA順序的蛋白質(zhì)肽鏈的過(guò)程。RNA→Pr復(fù)制:以親代DNA分子為模板合成新的子代DNA分子
81第7章核酸代謝2013年最新《生物化學(xué)原理》課件王雅琴82DNA的復(fù)制。
DNA生物合成方式DNA的反轉(zhuǎn)錄合成。(病毒)
DNA損傷的修復(fù)。
83(一)DNA的生物合成
A.DNA復(fù)制1.參與DNA復(fù)制的酶和蛋白質(zhì)(原核生物)
(1)DNA聚合酶(DNApolymerase,DNApol)
DNA聚合酶:以DNA為模板、dNTP為底物催化合成DNA的一類酶。
DNApolⅠ
原核生物有三種DNA聚合酶DNApolⅡ
DNApolⅢ(一)DNA的生物合成
A.DNA復(fù)制84
DNA聚合酶作用條件:
◆
需模板:DNA
◆
需引物:具3′-OH的DNAorRNA
◆
底物:4種dNTP
◆
需Mg2+,Mn2+
◆
使dNTP以3′,5′磷酸二酯鍵相連,按5′→3′方向
聚合成與模板互補(bǔ)的DNA鏈。
DNA聚合酶作用條件:
◆需模板:DNA
85DNA聚合酶Ⅰ(DNApolⅠ)催化特點(diǎn)
DNApolⅠ是一個(gè)多功能酶
◆5′→3′聚合催化特性:
使dNTP按模板的要求逐個(gè)加到具有3′-OH端的
多核苷酸的鏈上。
DNA聚合酶Ⅰ(DNApolⅠ)催化特點(diǎn)
DNAp86
◆
3′→5′外切酶活性:從3′-OH端水解DNA。
出現(xiàn)與模板錯(cuò)配的核苷酸時(shí),DNApolⅠ先切去錯(cuò)
配的堿基(核苷酸)然后再繼續(xù)進(jìn)行聚合。
功能:識(shí)別、消除錯(cuò)配堿基。對(duì)聚合起校正作用。
◆
3′→5′外切酶活性:從3′-OH端水解D87
◆
5′→3′外切酶的活性:從5′端水解DNA鏈,
也可距5′端12個(gè)左右堿基處水解DNA鏈。
(只作用于雙鏈DNA)。
功能:切除引物,切除變異損傷的核苷酸—修復(fù)
作用。
◆
5′→3′外切酶的活性:從5′端水解D88原核生物有三種DNA聚合酶比較:
原核生物有三種DNA聚合酶比較:
89(2)DNA連接酶(DNALigase)
雙鏈DNA一條鏈上有切口,3′-OH與5′-P相鄰;
不能連接兩條游離的單鏈。
(切口處的兩核苷酸必須相鄰不能缺少核苷酸。)
作用:在DNA不連續(xù)合成時(shí)起連接作用。
3′5′(2)DNA連接酶(DNALigase)
90(3)解鏈酶(Helicase解螺旋酶,復(fù)制蛋白——rep
蛋白)
作用:解開DNA雙螺旋,使其成單鏈。
(4)旋轉(zhuǎn)酶
作用:消除DNA超螺旋的酶。(3)解鏈酶(Helicase解螺旋酶,復(fù)制蛋白——re91(5)引發(fā)酶
引發(fā)酶:催化RNA引物合成的RNA聚合酶。
作用:合成引物
DNA聚合酶不能從頭起始DNA合成,需要引物
(primer),只能在引物(3′-OH)端逐漸加上
脫氧核苷酸,延長(zhǎng)DNA鏈。
DNA合成的引物有三種:RNA片段;
DNA片段;
tRNA片段。(5)引發(fā)酶
引發(fā)酶:催化RNA引物合成的R92
(6)單鏈結(jié)合蛋白
(Singlestrandbindingprotein——SSB蛋白)
作用:與單鏈DNA的特異結(jié)合的蛋白質(zhì)。
◆
SSB與解開的單股DNA結(jié)合,使兩條單鏈不再形
成雙鏈,保持單鏈區(qū)的穩(wěn)定。
◆
防止核酸酶降解DNA。
(6)單鏈結(jié)合蛋白
(Singlestr932.復(fù)制的方式和特點(diǎn)
(1)半保留復(fù)制:
Watson和Crick1953年提出,DNA的兩條鏈都能作為模板,分別合成出兩條互補(bǔ)的新鏈。2.復(fù)制的方式和特點(diǎn)
(1)半保留復(fù)制:
Wats94機(jī)制:DNA復(fù)制時(shí),兩條互補(bǔ)連解開;兩條鏈都可做模板,然后在每條模板鏈上按堿基配對(duì)的原則形成互補(bǔ)的新鏈,組成子代DNA分子。
新產(chǎn)生的兩子代DNA分子與親代DNA分子完全相同,且子代DNA中一條鏈來(lái)自親代,另一條鏈?zhǔn)切潞铣傻摹氡A魪?fù)制。
DNA半保留復(fù)制方式,保證了DNA在代謝上的穩(wěn)定性,從而保證了生物遺傳的穩(wěn)定性和準(zhǔn)確性。(穩(wěn)定是相對(duì)的)。機(jī)制:DNA復(fù)制時(shí),兩條互補(bǔ)連解開;兩條鏈都可做95(2)DNA的半不連續(xù)復(fù)制:
問(wèn)題的提出????:
DNA分子兩條鏈都能做模板,幾乎同時(shí)、齊頭并進(jìn)
合成為兩條新的互補(bǔ)鏈。
DNA模板的兩條鏈反向平行,一條5′→3′;
另一條3′→5′。
DNA聚合酶要求:模板方向3′→5′。
合成新鏈方向5′→3′。
如何解釋在同一個(gè)復(fù)制叉中兩條新鏈合成是同步,齊
頭并?
日本學(xué)者岡崎——DNA的半不連續(xù)復(fù)制模型:(2)DNA的半不連續(xù)復(fù)制:
問(wèn)題的提出????96DNA半不連續(xù)復(fù)制模型:
◆DNA復(fù)制時(shí)兩條親代單鏈DNA都做為模板。
◆復(fù)制叉:DNA復(fù)制時(shí),雙螺旋局部解開,在復(fù)制區(qū)
形成Y形結(jié)構(gòu)——復(fù)制叉;
隨著復(fù)制叉的移動(dòng)DNA雙螺旋逐漸解開。
DNA半不連續(xù)復(fù)制模型:
◆DNA復(fù)制時(shí)兩條親代單鏈97
◆
以復(fù)制叉移動(dòng)方向?yàn)闇?zhǔn);
3′→5′走向模板鏈,DNA新鏈合成方向5′→3′,與
復(fù)制叉方向一致,連續(xù)合成——前導(dǎo)鏈。
◆
5′→3′走向模板鏈,DNA新鏈合成方向也是5′→3′,
與復(fù)制叉移動(dòng)方向相反,先照模板按5′→3′合成若
干短的片斷——岡崎片斷,然后由連接酶將短片斷
連接,成一條完整的DNA鏈。不連續(xù)合成——滯后
鏈(后隨鏈)。
◆以復(fù)制叉移動(dòng)方向?yàn)闇?zhǔn);
3′→5′走98結(jié)論:
DNA的半不連續(xù)復(fù)制:一條新鏈連續(xù)合成;
另一條新鏈不連續(xù)合成。結(jié)論:
DNA的半不連續(xù)復(fù)制:一條新鏈連續(xù)合成;
99
岡崎片斷長(zhǎng)度:原核生物1000-2000個(gè)Nt。
真核生物200個(gè)左右Nt。
岡崎片斷長(zhǎng)度:原核生物1000-21003.DNA復(fù)制過(guò)程
合成的起始;
DNA鏈的延伸;
合成終止。
3.DNA復(fù)制過(guò)程
合成的起始;1013.DNA復(fù)制過(guò)程
(1)合成的起始:
◆
引發(fā)酶識(shí)別、結(jié)合在模板DNA起始位點(diǎn);
◆DNA雙螺旋及超螺旋解開(邊合成邊解開);
◆RNA引物合成。3.DNA復(fù)制過(guò)程
(1)合成的起始:
◆引發(fā)酶102(2)DNA鏈的延伸
◆
在DNApolⅢ的催化下,按照模板鏈3′→5′順序
在RNA引物3′-OH末端逐個(gè)按上相應(yīng)的核苷酸,
合成互補(bǔ)新鏈。
◆前導(dǎo)鏈合成方向5′→3′,連續(xù)合成。
◆滯后鏈合成方向5′→3′,不連續(xù)合成。(2)DNA鏈的延伸
◆在DNApolⅢ的催化下,103(3)合成終止
DNA復(fù)制合成的終止包括:
①RNA引物的切除和缺口的填補(bǔ)。
通過(guò)DNApolⅠ5′→3′外切酶活性,或RNaseH
酶切除引物,然后由polⅠ5′→3′聚合活性補(bǔ)齊
缺口。
②DNA片段的連接——DNA連接酶。(3)合成終止
DNA復(fù)制合成的終止包括:
104第7章核酸代謝2013年最新《生物化學(xué)原理》課件王雅琴105第7章核酸代謝2013年最新《生物化學(xué)原理》課件王雅琴106第7章核酸代謝2013年最新《生物化學(xué)原理》課件王雅琴107B、DNA反(逆)轉(zhuǎn)錄合成——RNA指導(dǎo)的DNA合成
反轉(zhuǎn)錄:在反轉(zhuǎn)錄酶作用下,以RNA為模板合成DNA
的過(guò)程。
反轉(zhuǎn)錄的發(fā)現(xiàn):
◆1964年Temin提出反轉(zhuǎn)錄假設(shè)。
◆1970年Temin和Batimore,同時(shí)分別從致癌RNA
病毒中發(fā)現(xiàn)反轉(zhuǎn)錄酶。
后來(lái)在正常動(dòng)物胚胎細(xì)胞也發(fā)現(xiàn)反轉(zhuǎn)錄酶。
◆
反轉(zhuǎn)錄酶又稱為:依賴RNA的DNA聚合酶
RNA指導(dǎo)的DNA聚合酶B、DNA反(逆)轉(zhuǎn)錄合成——RNA指導(dǎo)的DNA合成
反轉(zhuǎn)錄108反轉(zhuǎn)錄條件:酶:反轉(zhuǎn)錄酶。
底物:4種dNTP為。
模板:病毒單鏈RNA為。
引物:宿主細(xì)胞的tRNA。
反轉(zhuǎn)錄條件:酶:反轉(zhuǎn)錄酶。
109合成方式:
致癌DNA
整合到宿主DNA
病毒RNA
cDNA
(模板)mRNA
蛋白質(zhì)(轉(zhuǎn)化蛋白)
以病毒RNA為模板合成的cDNA(complementaryDNA)通過(guò)復(fù)制合成致癌DNA,后者可整合到宿主DNA中,并隨宿主細(xì)胞分裂而遺傳下去,遇到合適的條件便進(jìn)行復(fù)制產(chǎn)生致癌DNA分子,引起癌變。
轉(zhuǎn)錄、翻譯產(chǎn)生的蛋白(轉(zhuǎn)化蛋白、病毒蛋白)也引起癌變。反轉(zhuǎn)錄酶轉(zhuǎn)錄翻譯復(fù)制合成方式:
110反轉(zhuǎn)錄酶具有三種酶活性:
①逆轉(zhuǎn)錄功能:利用病毒RNA為模板合成互補(bǔ)的
cDNA,形成RNA-DNA雜合子。
②復(fù)制功能:以新合成(逆轉(zhuǎn)錄)的cDNA為模板,
合成另一條DNA成DNA-DNA雙鏈。
③RNaseH活性:水解RNA-DNA雜交分子中RNA。反轉(zhuǎn)錄酶具有三種酶活性:
①逆轉(zhuǎn)錄功能:利用病毒RNA111第7章核酸代謝2013年最新《生物化學(xué)原理》課件王雅琴112逆轉(zhuǎn)錄病毒生活史逆轉(zhuǎn)錄病毒生活史113C、DNA損傷與修復(fù)
(1)DNA損傷
DNA分子不是絕對(duì)穩(wěn)定的,可受多種因素的作用而
改變或受破壞.
◆
生物因素:復(fù)制及基因重組過(guò)程出現(xiàn)差錯(cuò)而改變。
◆
物理因素:紫外線、電離輻射、X-射線等。
◆化學(xué)因素:烷化劑,氧化劑等化學(xué)誘變劑。C、DNA損傷與修復(fù)
(1)DNA損傷
DNA分114UV引起輻射損傷:形成嘧啶二聚體,C和C之間,
T和T之間形成共價(jià)鍵。UV引起輻射損傷:形成嘧啶二聚體,C和C之間,
115(2)DNA損傷的修復(fù)
◆
光復(fù)活作用
利用光能,光復(fù)活酶催化下切除由紫外線照射引起
的DNA嘧啶二聚體。
DNA復(fù)制、DNA轉(zhuǎn)錄時(shí),到嘧啶二聚體處,復(fù)制、
轉(zhuǎn)錄均受阻。
修復(fù)過(guò)程:(2)DNA損傷的修復(fù)
◆光復(fù)活作用
利用光116◆
光復(fù)活酶能在暗處識(shí)別損傷的DNA部位,并結(jié)合在受
損部位。
◆
可見光激活光復(fù)活酶,分解由UV照射而形成的DNA中
的嘧啶二聚體。
◆
光復(fù)活作用高度專一,只能修復(fù)UV照射引起的DNA嘧
啶二聚體。
光復(fù)活酶只存在于低等單細(xì)胞(如微生物)→鳥類;
高等哺乳動(dòng)物無(wú)此酶。
◆
光復(fù)活酶能在暗處識(shí)別損傷的DNA部位,并結(jié)合在受
損1172.切除修復(fù)——(復(fù)制前修復(fù))
在幾種酶作用下,將DNA分子中錯(cuò)配的或受損的部位切除,然后以完好鏈為模板合成出切除的部位。
該機(jī)制普遍存在,作用于各種損傷。
三種:堿基切除修復(fù):修復(fù)DNA中改變的堿基。
核苷酸切除修復(fù):修復(fù)DNA中巨大損傷。
堿基錯(cuò)配修復(fù)(前述)。2.切除修復(fù)——(復(fù)制前修復(fù))
在幾種酶作用下,將DNA118◆
堿基切除修復(fù)◆
堿基切除修復(fù)119◆
核苷酸切除修復(fù):
過(guò)程:識(shí)別、切斷→修復(fù)→切除→連接(原核生物)
◆
核苷酸切除修復(fù):
過(guò)程:識(shí)別、切斷→修復(fù)→切除→連接(原120◆
識(shí)別及切斷:UvrA,UvrB識(shí)別并結(jié)合在DNA損傷處,
UvrC(相當(dāng)于核酸內(nèi)切酶)在損傷處
靠近5′→3′一側(cè)切斷,產(chǎn)生切口。
◆
修復(fù):以另一條完好單鏈為模板,由DNApolⅠ在切
口處修復(fù)合成,補(bǔ)齊缺口;方向5′→3′。
◆
切除:UvrC在受損傷部位3′一側(cè)切斷,去除受損
傷片段。
◆
連接:連接酶將新合成的DNA片斷與原鏈連接。
此修復(fù)發(fā)生在DNA復(fù)制前——復(fù)制前修復(fù)?!?/p>
識(shí)別及切斷:UvrA,UvrB識(shí)別并結(jié)合在DNA損傷處,1213.重組修復(fù)——(復(fù)制后修復(fù))
先復(fù)制再修復(fù):含有錯(cuò)誤或損傷的DNA仍可進(jìn)行復(fù)制,但子代DNA鏈在對(duì)應(yīng)于損傷的部位出現(xiàn)缺口,通過(guò)分子間重組使缺口補(bǔ)齊。
3.重組修復(fù)——(復(fù)制后修復(fù))
先復(fù)制再修復(fù):含有錯(cuò)誤或損傷122重組修復(fù)中,二聚體(或其他損傷)并未除去,第二輪復(fù)制時(shí),留在母鏈中的損傷仍會(huì)給復(fù)制造成困難,仍須以重組修復(fù)來(lái)彌補(bǔ)。
隨著復(fù)制不斷進(jìn)行,若干代以后,損傷部分雖未從分子中除去,但損傷的DNA鏈卻逐漸稀釋,以至無(wú)礙DNA正常的生理功能。
重組修復(fù)中,二聚體(或其他損傷)并未除去,第二輪復(fù)制時(shí),留在123(二)RNA的合成
兩種方式:轉(zhuǎn)錄(主要):以DNA為模板合成RNA
復(fù)制:以RNA為模板合成RNA。
1.轉(zhuǎn)錄
轉(zhuǎn)錄:以DNA為模板合成RNA的過(guò)程。
(1)轉(zhuǎn)錄的基本特征
◆
底物:4種NTP。
◆
模板:DNA
◆
不需引物:合成RNA時(shí)第一個(gè)NTP一般是嘌呤核苷
酸,大多是G(80%)。(二)RNA的合成
兩種方式:轉(zhuǎn)錄(主要):以DNA為模板合124
◆
通常為不對(duì)稱轉(zhuǎn)錄:
體內(nèi)轉(zhuǎn)錄通常只以DNA分子雙鏈的一條鏈為模板;
體外轉(zhuǎn)錄失去鏈選擇性。
作為模板的鏈稱——模板鏈,
反義鏈,
轉(zhuǎn)錄鏈。
◆
通常為不對(duì)稱轉(zhuǎn)錄:
體內(nèi)轉(zhuǎn)錄通常只以125
不作為模板的鏈稱——編碼鏈,
正義鏈,
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