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文檔簡介
第2章組成細(xì)胞的分子第4節(jié)
蛋白質(zhì)相關(guān)計算主講教師:周慧慧目錄1數(shù)量關(guān)系分析2蛋白質(zhì)相對分子質(zhì)量計算3蛋白質(zhì)中C、H、O、N原子數(shù)目計算1數(shù)量關(guān)系分析1.1水分子數(shù)與蛋白質(zhì)中肽鍵數(shù)及氨基酸數(shù)目的關(guān)系多肽鏈形成蛋白質(zhì)肽鍵數(shù)=氨基酸數(shù)-1脫去的水分子數(shù)
=H2OH2OH2OH2OH2OH2OH2OH2OH2O公式:脫去水分子數(shù)
=
肽鍵數(shù)
=
氨基酸數(shù)
-
肽鏈數(shù)肽鍵數(shù)=氨基酸數(shù)-2脫去的水分子數(shù)
=1.1水分子數(shù)與蛋白質(zhì)中肽鍵數(shù)及氨基酸數(shù)目的關(guān)系環(huán)狀多肽形成蛋白質(zhì)公式:脫去水分子數(shù)
=
肽鍵數(shù)
=
氨基酸數(shù)1.2蛋白質(zhì)中游離氨基、羧基數(shù)目與肽鏈的關(guān)系多肽鏈形成蛋白質(zhì)H2NCOOH游離羧基數(shù)=1游離氨基數(shù)=H2NH2NCOOHCOOH游離羧基數(shù)=2游離氨基數(shù)=R1R2R3R4R5R6R7R8R9R10公式:蛋白質(zhì)中至少含有的游離的氨基或羧基數(shù)
=
肽鏈的條數(shù)公式:蛋白質(zhì)中含有游離氨基/羧基數(shù)=肽鏈的條數(shù)+R基中游離氨/羧基1.2蛋白質(zhì)中游離氨基、羧基數(shù)目與肽鏈的關(guān)系環(huán)狀多肽形成蛋白質(zhì)公式:蛋白質(zhì)中至少含有的游離的氨基或羧基數(shù)=0公式:蛋白質(zhì)中含有游離氨基/羧基數(shù)
=
R基中游離氨/羧基2蛋白質(zhì)相對分子質(zhì)量計算CHCOOHR2HN二肽CHR1H2NOHCOH肽鍵H2O2.蛋白質(zhì)相對分子質(zhì)量計算脫水縮合CHCOOHR2HNOHHCCHR1H2NCOCHR2HNOH2OH2O肽鍵肽鍵三肽2.蛋白質(zhì)相對分子質(zhì)量計算公式:蛋白質(zhì)相對分子質(zhì)量
=
氨基酸數(shù)×氨基酸平均相對分子質(zhì)量
-脫去的水分子數(shù)×182.蛋白質(zhì)相對分子質(zhì)量計算公式:蛋白質(zhì)相對分子質(zhì)量
=
氨基酸數(shù)×氨基酸平均相對分子質(zhì)量
-脫去的水分子數(shù)×18-二硫鍵數(shù)×2圖2-1某胰島素通過二硫鍵連接蛋白質(zhì)中存在二硫鍵S二硫鍵HHH2S3蛋白質(zhì)中原子數(shù)目計算N原子數(shù)=各氨基酸中的N原子總數(shù)=氨基酸數(shù)+R基上的N原子數(shù)=肽鍵數(shù)+肽鏈數(shù)+R基上的N原子數(shù)CHCR1H2NONHCHCR2ONHCHCR3ONHCHCR4ONHCHCR5ONHCHCR6ONHCHCOOHR73.1N原子數(shù)O原子數(shù)=各氨基酸中O原子總數(shù)-脫水?dāng)?shù)=肽鍵數(shù)+肽鏈數(shù)×2+R基上的O原子數(shù)CHCR1H2NONHCHCR2ONHCHCR3ONHCHCR4ONHCHCR5ONHCHCR6ONHCHCOOHR73.2O原子數(shù)=氨基酸數(shù)×2+R基上的C原子數(shù)C原子數(shù)=氨基酸中的C原子數(shù)CHCR1H2NONHCHCR2ONHCHCR3ONHCHCR4ONHCHCR5ONHCHCR6ONHCHCOOHR73.3C原子數(shù)H原子數(shù)=各氨基酸中的H總數(shù)-脫水?dāng)?shù)×2CHCR1H2NONHCHCR2ONHCHCR3ONHCHCR4ONHCHCR5ONHCHCR6ONHCHCOOHR73.4H原子數(shù)-2×二硫鍵數(shù)計算原子數(shù)量時,由于R基上的C原子數(shù)不好確定,且H原子數(shù)較多,經(jīng)常以N原子數(shù)或O原子數(shù)或者S原子為突破口,計算氨基酸的分子式或氨基酸個數(shù)最為簡便。計算蛋白質(zhì)的相對分子質(zhì)量時,肽鏈上出現(xiàn)二硫鍵(—S—S—)時(二硫鍵由—SH和—SH脫去2個H形成),要再減去2(即兩個氫原子),若無特殊說明,則不考慮二硫鍵。3.5原子數(shù)計算注意事項(xiàng)4練習(xí)與應(yīng)用1965年,中國科學(xué)家在世界上第一次用人工方法合成了具有活性的結(jié)晶牛胰島素。該胰島素有17種、51個氨基酸形成兩條肽鏈而組成的。其中A鏈含有21個氨基酸、B鏈含有30個氨基酸。脫水?dāng)?shù)
=
肽鍵數(shù)=氨基酸數(shù)-肽鏈數(shù)=51-2=494.練習(xí)與應(yīng)用含有21個氨基酸含有30個氨基酸該胰島素中至少含有_____個游離的氨基;_______個游離的羧基224.練習(xí)與應(yīng)用該胰島素的相對分子質(zhì)量=氨基酸的數(shù)量×氨基酸的平均相對分子質(zhì)量-脫水?dāng)?shù)×18-二硫鍵數(shù)×2=51×氨基酸的平均相對分子質(zhì)量-49×18-3×24.練習(xí)與應(yīng)用下圖為某蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)示意圖,該蛋白質(zhì)分子共由m個氨基酸組成,則形成
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