GB/T 40226-2021環(huán)境微生物宏基因組檢測高通量測序法

ICS07080

CCSA.40

中華人民共和國國家標準

GB/T40226—2021

環(huán)境微生物宏基因組檢測高通量測序法

Detectionofenvironmentalmicrobialmetagenome—Highthroughputsequencing

2021-05-21發(fā)布2021-12-01實施

國家市場監(jiān)督管理總局發(fā)布

國家標準化管理委員會

GB/T40226—2021

目次

前言

…………………………Ⅲ

范圍

1………………………1

規(guī)范性引用文件

2…………………………1

術(shù)語和定義

3………………1

縮略語

4……………………2

原理

5………………………2

試驗條件

6…………………2

試劑

7………………………2

儀器設(shè)備

8…………………2

樣品

9………………………3

試驗步驟

10…………………3

試驗報告

11…………………4

質(zhì)量控制

12…………………5

附錄規(guī)范性糞便樣品采集保存運輸方法

A()、、………6

附錄規(guī)范性土壤樣品采集保存運輸方法

B()、、………7

附錄規(guī)范性水體樣品采集保存運輸方法

C()、、………8

附錄資料性樣品信息單

D()……………9

附錄資料性樣品的完整性圖譜和質(zhì)量級別分類

E()DNA…………10

附錄資料性參考數(shù)據(jù)庫

F()……………11

參考文獻

……………………12

Ⅰ

GB/T40226—2021

前言

本文件按照標準化工作導(dǎo)則第部分標準化文件的結(jié)構(gòu)和起草規(guī)則的規(guī)定

GB/T1.1—2020《1:》

起草

。

請注意本文件的某些內(nèi)容可能涉及專利本文件的發(fā)布機構(gòu)不承擔識別專利的責(zé)任

。。

本文件由全國生化檢測標準化技術(shù)委員會提出并歸口

(SAC/TC387)。

本文件起草單位深圳華大生命科學(xué)研究院深圳華大基因科技有限公司深圳市生命科技產(chǎn)學(xué)研

:、、

資聯(lián)盟中國測試技術(shù)研究院生物研究所深圳華大臨床檢驗中心

、、。

本文件主要起草人陳冰肖亮鐘煥姿李俊樺李倩一賈慧玨姜華艷周李華唐美芳吳昊

:、、、、、、、、、、

李陶莎周媛鐘宏彬

、、。

Ⅲ

GB/T40226—2021

環(huán)境微生物宏基因組檢測高通量測序法

1范圍

本文件描述了采用高通量測序技術(shù)進行環(huán)境微生物宏基因組檢測的術(shù)語和定義原理試驗條件

、、、

試劑儀器設(shè)備樣品試驗步驟試驗報告和質(zhì)量控制要求

、、、、。

本文件適用于運用高通量測序法進行環(huán)境微生物宏基因組的檢測

。

2規(guī)范性引用文件

下列文件中的內(nèi)容通過文中的規(guī)范性引用而構(gòu)成本文件必不可少的條款其中注日期的引用文

。,

件僅該日期對應(yīng)的版本適用于本文件不注日期的引用文件其最新版本包括所有的修改單適用于

,;,()

本文件

。

分析試驗室用水規(guī)格和試驗方法

GB/T6682

實驗室生物安全通用要求

GB19489

高通量基因測序結(jié)果評價要求

GB/T35537—2017

3術(shù)語和定義

下列術(shù)語和定義適用于本文件

。

31

.

環(huán)境environment

相對某項中心事物的周圍世界

。

注在本文件中特指人體動物環(huán)境與自然環(huán)境人體動物環(huán)境包括但不限于口腔皮膚生殖道腸道等自然

:()。()、、、;

環(huán)境包括但不限于空氣水體土壤沉積物等

、、、。

32

.

相對豐度relativeabundance

某一特定種類微生物在環(huán)境微生物群落中所占的相對比例

。

注通常以百分比表示

:。

33

.

微生物宏基因組microbialmetagenome

以特定環(huán)境中整個微生物群落作為研究