微生物的分類與鑒定微生物學(xué)_第1頁
微生物的分類與鑒定微生物學(xué)_第2頁
微生物的分類與鑒定微生物學(xué)_第3頁
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微生物的分類與鑒定微生物學(xué)第一頁,共四十四頁,2022年,8月28日微生物橫跨整個生物界的四個界,有十幾萬個種。第二頁,共四十四頁,2022年,8月28日所謂分類,是指對大量的微生物進行逐一的觀察、分析與描述的基礎(chǔ)上,按照它們的個體形態(tài)、培養(yǎng)特征、生理生化特性和細胞化學(xué)組份等一系列性狀的異同和主次,并根據(jù)它們的親緣關(guān)系和應(yīng)用的方便,加以分門別類。第三頁,共四十四頁,2022年,8月28日所謂鑒定,是對某一具體的微生物的性狀進行細致的觀察和測試,參照一定的,用對比的方法來確定該微生物的分類地位。第四頁,共四十四頁,2022年,8月28日第一節(jié)通用分類單元第五頁,共四十四頁,2022年,8月28日微生物橫跨整個生物界的四個界,有十幾萬個種。第六頁,共四十四頁,2022年,8月28日一、分類單元界門綱目科屬種第七頁,共四十四頁,2022年,8月28日二、種(species)微生物的種(species,又譯物種)是一個基本分類單元,它是一大群表型特征高度相似、親緣關(guān)系極其接近、與同屬內(nèi)的其他物種有著明顯差異的一大群菌株的總稱。第八頁,共四十四頁,2022年,8月28日三、種以下的分類單元亞種(subspecies,subsp.,ssp.)變種(variety,var.)型(form)類群(group)菌株(strain)小種(race)相(phase)態(tài)(state)第九頁,共四十四頁,2022年,8月28日(一)亞種(subspecies,subsp.,ssp.)是種的進一步細分單元,一般指其某一明顯而穩(wěn)定的特征與模式種不同的種。第十頁,共四十四頁,2022年,8月28日(二)變種(variety,var.)變種是亞種的同義詞,因易引起混亂,故《國際細菌命名法規(guī)》(1975)已規(guī)定它在命名法中沒有地位,且不主張使用。第十一頁,共四十四頁,2022年,8月28日在亞種以下的“型”(form)曾用于表示細菌菌株,但目前已廢除。目前尚在使用的是以“型”作后綴使用,例如生物變異型(biovar)、化學(xué)型(chemoform)等。(三)型(form)第十二頁,共四十四頁,2022年,8月28日是一個在分類上沒有地位的普通名詞,它可非正式地指定一組具有某些共同性狀的生物。(四)類群(group)第十三頁,共四十四頁,2022年,8月28日菌株又稱品系(在病毒中則稱毒株或株),表示任何由一個獨立分離的單細胞(或單個病毒粒子)繁殖而成的純種群體及其一切后代。(五)菌株(strain)第十四頁,共四十四頁,2022年,8月28日又稱品種、宗或生產(chǎn)小系等,它的涵義很亂,在真菌學(xué)中常相當(dāng)于生理型,在動物學(xué)中常指生態(tài)型,而在發(fā)酵工業(yè)中,則常指自生產(chǎn)中選育出來的自發(fā)突變菌株。(六)小種(race)第十五頁,共四十四頁,2022年,8月28日一般指自然存在的微生物交互變異中的一定階段。(七)相(phase)第十六頁,共四十四頁,2022年,8月28日通常指微生物的菌落變異狀態(tài),如粗糙、光滑或粘液狀等。(八)態(tài)(state)第十七頁,共四十四頁,2022年,8月28日第二節(jié)微生物的命名第十八頁,共四十四頁,2022年,8月28日

每一種微生物都有一個自己的名字,名字有俗名(commonname)和學(xué)名(scientificname)兩種。第十九頁,共四十四頁,2022年,8月28日俗名(commonname)指普通的、通俗的、地區(qū)性的名字,具有簡明和大眾化的優(yōu)點,但往往涵義不夠確切,易于重復(fù),使用范圍局限。第二十頁,共四十四頁,2022年,8月28日俗名學(xué)名結(jié)核桿菌結(jié)核分枝桿菌(Mycobacteriumtuberculosis)綠膿桿菌銅綠假單胞菌(Pseudomonasaeruginosa)金葡菌金黃色葡萄球菌(Staphylococcusaureus)紅色面包霉粗糙脈孢菌(Neurosporacrassa)白念菌白色假絲酵母(Candidaalbicans)第二十一頁,共四十四頁,2022年,8月28日學(xué)名(scientificname)指一個菌種的科學(xué)名稱,它是按照《國際細菌命名法規(guī)》命名的、國際學(xué)術(shù)界公認并通用的正式名字。第二十二頁,共四十四頁,2022年,8月28日一、雙名法(binominalnomenclature)雙名法指一個物種的學(xué)名由前面一個屬名(genericname)和后面一個種名加詞(specificepithet)兩部分組成。第二十三頁,共四十四頁,2022年,8月28日屬名的詞首須大寫,種名加詞的字首須小寫(包括由人名或地名等專用名詞衍生的)。若所分離的菌株只鑒定到屬,而未鑒定到種,可用sp來表示。例如,Bacillussp第二十四頁,共四十四頁,2022年,8月28日例1:大腸埃希氏菌(簡稱大腸桿菌)Escherichiacoli(Migula)CastellanietChalmers1919例2:枯草芽孢桿(簡稱枯草桿菌)Bacillussubtilis(Ehrenberg)Cohn1872第二十五頁,共四十四頁,2022年,8月28日例1:蘇云金芽孢桿菌蠟螟亞種Bacillusthuringiensis

(subsp)galleria例2:橢圓釀酒酵母(或釀酒酵母橢圓變種)Saccharomycescerevisiae

(var)ellipsoideus第二十六頁,共四十四頁,2022年,8月28日由于細菌分類單元的劃分缺乏一個易于操作的統(tǒng)一標(biāo)準,為了減少因采用不同標(biāo)準界定分類單元所造成的混亂,細菌系統(tǒng)分類也像其他生物分類一樣采用“模式概念”種和亞種指定模式菌株(typestrain);亞屬和屬指定模式種(typespecies);屬以上至目級分類單元指定模式屬(typegenus);模式菌株應(yīng)送交菌種保藏機構(gòu)保藏,以便備查考和索取。第二十七頁,共四十四頁,2022年,8月28日第三節(jié)各大類微生物的分類系統(tǒng)綱要第二十八頁,共四十四頁,2022年,8月28日微生物橫跨整個生物界的四個界,有十幾萬個種。第二十九頁,共四十四頁,2022年,8月28日一、細菌的分類

1.細菌分類的依據(jù)(1)形態(tài)特征在顯微鏡下觀察的個體形態(tài)特征在各種培養(yǎng)基上表現(xiàn)的的群體形態(tài)特征第三十頁,共四十四頁,2022年,8月28日(2)生理生化特性(3)生態(tài)特征(4)血清學(xué)反應(yīng)第三十一頁,共四十四頁,2022年,8月28日美國賓夕法尼亞大學(xué)的細菌學(xué)教授伯杰(D.Bergey,1860-1937)2.《伯杰氏鑒定細菌學(xué)手冊》

(Bergey’sManualofDeterminativeBacteriology)第三十二頁,共四十四頁,2022年,8月28日

1957年第七版后,由于越來越廣泛地吸收了國際上細菌分類學(xué)家參加編寫(如1974年第八版,撰稿人多達130多位,涉及15個國家;現(xiàn)行版本撰稿人多達300多人,涉及近20個國家),所以它的近代版本反映了出版年代細菌分類學(xué)的最新成果,因而逐漸確立了在國際上對細菌進行全面分類的權(quán)威地位。第三十三頁,共四十四頁,2022年,8月28日《伯杰氏系統(tǒng)細菌學(xué)手冊》(Bergey’sManualofSystematicBacteriology)伯杰氏手冊是目前進行細菌分類、鑒定的最重要依據(jù),其特點是描述非常詳細,包括對細菌各個屬種的特征及進行鑒定所需做的實驗的具體方法。(20世紀80年代末期)第三十四頁,共四十四頁,2022年,8月28日新版手冊分4卷:第一卷:一般醫(yī)學(xué)和工業(yè)方面重要的革蘭氏陰性細菌。第二卷:放線菌以外的革蘭氏陽性細菌。第三卷:故細菌、藍細菌及其他革蘭氏陰性細菌。第四卷:放線菌。第三十五頁,共四十四頁,2022年,8月28日《伯杰氏系統(tǒng)細菌學(xué)手冊》(Bergey’sManualofSystematicBacteriology)第八版有中文版,把細菌分十九個部分。第三十六頁,共四十四頁,2022年,8月28日二、霉菌的分類

1.霉菌的分類原則絲狀真菌劃分各級分類單位的基本原則:以形態(tài)特征為主,生理生化、細胞化學(xué)和生態(tài)特征為輔。第三十七頁,共四十四頁,2022年,8月28日2.真菌的分類系統(tǒng)1950年Martin的4綱分類系統(tǒng)1973年Ainsworth的分類系統(tǒng)第三十八頁,共四十四頁,2022年,8月28日

Martin是根據(jù)真菌營養(yǎng)體的形態(tài)特征和繁殖方式的不同將之分為4個綱。藻狀菌綱:菌絲體無分隔,或者不形成真正的菌絲體。子囊菌綱:菌絲體有分隔,有性階段形成子囊孢子。擔(dān)子菌綱:菌絲體有分隔,有性階段形成擔(dān)孢子。半知菌綱:菌絲體有分隔,未發(fā)現(xiàn)有性階段。第三十九頁,共四十四頁,2022年,8月28日

Ainsworth從1966年起,就把真菌界分為兩大門(粘菌門和真菌門),并把真菌門再分成五個亞門。目前,該系統(tǒng)已為各國廣大真菌分類學(xué)者所普遍采用,影響較大。第四十頁,共四十四頁,2022年,8月28日第四十一頁,共四十四頁,2022年,8月28日三、

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