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文檔簡介
生化學習要點第一頁,共八十二頁,2022年,8月28日題型一、名詞解釋(共5題,3分/題,共15分二、單項選擇題(共20題,1分/題,共20分)三、填空題(共20空,0.5分/空,共10分)四、簡答題(共5題,35分)五、生化術語中英對譯(共10題,0.5分/題,共5分)六、問答題(共1題,共15分)第二頁,共八十二頁,2022年,8月28日◆緒論◆第一章蛋白質◆第二章酶◆第三章核酸◆第四章維生素◆第五章生物氧化◆第六章糖代謝◆第七章脂代謝◆第八章蛋白質的酶促降解和氨基酸代謝◆第九章核酸的酶促降解及核苷酸代謝◆第十章物質代謝的聯(lián)系與調節(jié)學習要點提示及思考題第三頁,共八十二頁,2022年,8月28日
第一章蛋白質化學要點提示
第四頁,共八十二頁,2022年,8月28日重點1、蛋白質的化學組成——各種AA代號、蛋白質一級結構測定方法(酶法及化學法切割位點)2、
氨基酸的性質——兩性性質及等電點計算、化學反應及顏色反應3、肽平面、蛋白質的結構——鍵及概念、特點等4、蛋白質的性質——膠體性質、沉淀、變性與復性等5、蛋白質的分離提純第五頁,共八十二頁,2022年,8月28日一、組成1、蛋白質是由20種氨基酸組成的。氨基酸性質方面的差別反映了它們側鏈的不同。除了Gly沒有手性碳以外,其他19種氨基酸都至少含有一個手性碳。第六頁,共八十二頁,2022年,8月28日非極性
Ala
ValLeuIleMetPheTrpPro極性不帶電GlySerThrAsnGlnTyrCys 極性帶正電
LysArgHis極性帶負電
GluAsp必需氨基酸與非必需氨基酸的概念第七頁,共八十二頁,2022年,8月28日2、氨基酸的構型與旋光性構型(Configuration)是指一個分子由于其中各原子特有的固定的空間排列,而使該分子所具有的特定的立體化學形式。由一種構型轉變?yōu)榱硪环N構型時,將涉及共價鍵的斷裂和重新形成。注意:構型與構象的概念差別構象(Conformation):指取代基團圍繞單鍵旋轉時可形成不同的立體結構。其空間位置的改變不涉及共價鍵的破裂。第八頁,共八十二頁,2022年,8月28日3、氨基酸和多肽的酸性和堿性基團的離子狀態(tài)取決于pH兩性離子:同一個氨基酸分子上帶有能放出質子的-NH3+正離子和能接受質子的-COO-負離子。pI:溶液中AA分子所含的-NH3+和-COO-數(shù)目正好相等,凈電荷為0時的pH值即為氨基酸的等電點。第九頁,共八十二頁,2022年,8月28日中性氨基酸:pI=(pK`-COO+pK`-NH2)/2酸性氨基酸:pI=(pK`-COO+pK`R-COO-
)/2堿性氨基酸:pI=(pK`-NH2+pK`R-NH2)/2第十頁,共八十二頁,2022年,8月28日4、氨基酸的化學性質注意:反應的機理、涉及的化學術語簡稱第十一頁,共八十二頁,2022年,8月28日二、蛋白質的三維結構第十二頁,共八十二頁,2022年,8月28日1、多肽鏈中相鄰氨基酸殘基通過肽鍵連接。
肽鍵具有部分雙鍵特性,所以整個肽單位是一個極性的平面結構。由于立體上的限制,肽鍵的構型大都是反式構型。繞N-Cα和Cα-C鍵的旋轉賦予了多肽鏈構象上的柔性。
第十三頁,共八十二頁,2022年,8月28日2、蛋白質的分子結構包括一級結構(primarystructure)二級結構(secondarystructure)三級結構(tertiarystructure)四級結構(quaternarystructure)高級結構超二級結構與結構域注意維系各個結構的作用力第十四頁,共八十二頁,2022年,8月28日3、蛋白質二級結構的主要形式
-螺旋(-helix)
-折疊(-pleatedsheet)
-轉角(-turn)
無規(guī)卷曲(randomcoil)
掌握各種結構的特點。第十五頁,共八十二頁,2022年,8月28日4、蛋白質一級結構測序
1)注意二硫鍵的斷裂方法(氧化法、還原法)
2)分析N端和C端的方法
3)肽鏈的部分裂解(注意內肽酶切位置和化學裂解)
4)一級結構序列的分析第十六頁,共八十二頁,2022年,8月28日三、蛋白質的性質第十七頁,共八十二頁,2022年,8月28日1、蛋白質的兩性離解和電泳現(xiàn)象(概念)2、蛋白質的膠體性質(兩個因素)3、蛋白質的沉淀作用(兩種方式)4、蛋白質的變性5、蛋白質的紫外吸收6、蛋白質的顏色反應第十八頁,共八十二頁,2022年,8月28日四、蛋白質的分離純化第十九頁,共八十二頁,2022年,8月28日蛋白質的分離純化
(一)根據(jù)分子大小不同的分離方法(二)利用溶解度差別的分離(三)根據(jù)電荷大小進行分離(四)蛋白質的選擇吸附分離(五)利用生物親和力蛋白質含量的測定蛋白質純度等的測定注意幾種電泳概念、原理;能判斷電泳的方向、速度等注意離子交換、分子層析的原理第二十頁,共八十二頁,2022年,8月28日五、蛋白質的結構和功能的關系第二十一頁,共八十二頁,2022年,8月28日1、蛋白質功能的多樣性2、蛋白質一級結構與功能的關系3、蛋白質的高級結構與功能的關系第二十二頁,共八十二頁,2022年,8月28日注意:肌紅蛋白的氧飽和曲線為雙曲線型,而血紅蛋白的氧飽和曲線是S型的。概念:波爾效應;協(xié)同效應第二十三頁,共八十二頁,2022年,8月28日第二章酶一、要點提示第二十四頁,共八十二頁,2022年,8月28日1、酶和一般催化劑的共性
2、酶催化作用特性
一、酶是生物催化劑1.高效性2、酶的專一性3、反應條件溫和4、可調節(jié)5、易失活第二十五頁,共八十二頁,2022年,8月28日二、酶的化學本質
除了某些RNA之外,絕大部分酶是蛋白質,或是帶有輔助因子的蛋白質。酶的反應類型分為六大類:脫氫酶、轉移酶、水解酶、裂解酶、異構酶和合成酶。第二十六頁,共八十二頁,2022年,8月28日三、酶活性部位:結合部位、催化部位與酶功能的聯(lián)系第二十七頁,共八十二頁,2022年,8月28日四、酶的催化作用機理(一).酶作用專一性機理(誘導契合學說)(二).酶作用高效性機理
中間產(chǎn)物學說(三).影響酶高效性的因素
1.鄰近定向效應
2.底物的形變和誘導契合
3.親核催化/親電催化(共價催化)
4.酸堿催化
5.微環(huán)境的影響第二十八頁,共八十二頁,2022年,8月28日五、酶促反應動力學(一).底物濃度(米氏常數(shù))(二).溫度、pH值、酶濃度、激活劑(三).抑制劑
1.類型
2.特點
3.差異
第二十九頁,共八十二頁,2022年,8月28日抑制劑類型公式VmaxKm無抑制劑競爭性抑制劑非競爭性抑制劑反競爭性VmaxKm不變增加減小不變減小減小第三十頁,共八十二頁,2022年,8月28日六、酶活力的測定方法(一).酶活力(二).比活力(三).總活力
(四).轉換數(shù)
第三十一頁,共八十二頁,2022年,8月28日第三章核酸
一、要點提示
第三十二頁,共八十二頁,2022年,8月28日重點核酸的概念和重要性(種類、在細胞中的分布、功能等)核苷酸(組成、DNA與RNA區(qū)別)DNA的結構
RNA的結構(各種RNA)
核酸的理化性質(變性、復性、Tm值等)
第三十三頁,共八十二頁,2022年,8月28日二、DNA的結構DNA的一級結構就是指DNA分子中脫氧核糖核苷酸的排列順序及連接方式。生物界物種的多樣性即取決于DNA分子中四種核苷酸千變萬化的不同排列組合。1、DNA的一級結構第三十四頁,共八十二頁,2022年,8月28日2、DNA的二級結構1953年J.Watson和F.Crick提出了著名的DNA雙螺旋結構模型。注意DNA雙螺旋結構模型的結構要點第三十五頁,共八十二頁,2022年,8月28日三
RNA的結構
mRNArRNAtRNA三種RNA的一級結構和高級結構特點。第三十六頁,共八十二頁,2022年,8月28日兩性性質紫外吸收核酸的水解變性、復性與分子雜交沉降電泳核酸序列測定四、核酸的理化性質涉及增色效應、減色效應涉及兩種方法的原理第三十七頁,共八十二頁,2022年,8月28日(一)
雙脫氧終止法(末端終止法)英國Sanger
1955
確定牛胰島素結構,1958獲諾貝爾化學獎
1975設計出DNA測序法,1980獲諾貝爾化學獎合成一段與待測DNA序列互補的DNA片段群。第三十八頁,共八十二頁,2022年,8月28日雙脫氧終止法原理1、DNA的復制需要:DNA聚合酶,單鏈DNA模板,帶有3‘-OH末端的單鏈寡核苷酸引物,4種dNTP(dATP、dGTP、dTTP和dCTP)。2、聚合酶用模板作指導,不斷地將dNTP加到引物的3‘-OH末端,使引物延伸,合成出新的互補DNA鏈。3、如果加入雙脫氧核苷三磷酸(ddNTP)---在脫氧核糖的3’位置缺少一個羥基---故不能同后續(xù)的dNTP形成磷酸二酯鍵。4、采用聚丙烯酰胺凝膠電泳區(qū)分長度差一個核苷酸的單鏈DNA,從而讀取DNA的核苷酸序列。第三十九頁,共八十二頁,2022年,8月28日(二)化學裂解法
Maxam-Gilbert,1977原理:利用特異性的化學裂解法,制備出長度只差一個核苷酸的片段群,然后將此片段群經(jīng)測序膠電泳和放射自顯影得到測序圖譜。WalterGilbert第四十頁,共八十二頁,2022年,8月28日DNA化學裂解反應體系反應體系修飾試劑修飾反應鏈斷裂試劑斷裂點G硫酸二甲酯(DMS)G甲基化六氫吡啶GG+A甲酸/哌啶脫嘌呤作用六氫吡啶G和AC+T肼/哌啶嘧啶開環(huán)六氫吡啶C和TC肼/2mol/LNaClC六氫吡啶C第四十一頁,共八十二頁,2022年,8月28日基本步驟
第一步,對特定堿基(或特定類型的堿基)進行化學修飾;第二步,修飾堿基從糖環(huán)上脫落,修飾堿基5和3的磷酸二酯鍵斷裂;第三步,比較G、A+G、C+T、C和A>C各個泳道,可從測序凝膠的放射自顯影片上讀取DNA序列。第四十二頁,共八十二頁,2022年,8月28日第四章維生素和輔酶
一、要點提示第四十三頁,共八十二頁,2022年,8月28日維生素脂溶性水溶性ADEK在體內直接參與代謝的調節(jié)作用B1、B2、PP、B6、泛酸、生物素、葉酸、B12和VC等通過轉變成輔酶對代謝起調節(jié)作用第四十四頁,共八十二頁,2022年,8月28日1)維生素的種類→組成特點及性質;2)水溶性維生素與輔酶的關系→輔酶在酶催化作用中起何種作用;3)注意維生素缺乏時所引起的后果。第四十五頁,共八十二頁,2022年,8月28日第五章生物氧化第四十六頁,共八十二頁,2022年,8月28日一、生物氧化的概念有機物質(糖、脂肪和蛋白質)在生物細胞內進行氧化分解而生成CO2和H2O并釋放出能量的過程稱為生物氧化。生物氧化通常需要消耗氧→又稱為呼吸作用。區(qū)別體內氧化與體外氧化的差異第四十七頁,共八十二頁,2022年,8月28日二、呼吸鏈的概念和電子傳遞系統(tǒng)的組成、電子傳遞的方向等
按照它們的還原電勢的大?。河傻碗娢灰来蜗蚋唠娢慌帕?。第四十八頁,共八十二頁,2022年,8月28日三、ATP產(chǎn)生的方式化學滲透學說氧化磷酸化與底物水平磷酸化區(qū)別第四十九頁,共八十二頁,2022年,8月28日四、氧化磷酸化抑制劑注意:原理第五十頁,共八十二頁,2022年,8月28日第六章糖代謝第五十一頁,共八十二頁,2022年,8月28日糖代謝分解代謝合成代謝無氧分解有氧分解糖原異生光合作用糖的生物合成糖酵解三羧酸循環(huán)磷酸戊糖途徑其他途徑第五十二頁,共八十二頁,2022年,8月28日1)糖酵解是基礎2)
三羧酸循環(huán)的核心;3)磷酸戊糖途徑是衍生;4)糖原合成與分解(糖基載體)5)糖異生注意各代謝途徑的亞細胞定位、步驟、能量的消耗與產(chǎn)生、關鍵酶及調節(jié)、生理意義第五十三頁,共八十二頁,2022年,8月28日糖
酵
解
總
過
程2394568101G-6-PGF-6-PF-1,6-2PDHAPG-3-P3-磷酸甘油酸×22-磷酸甘油酸×2PEP丙酮酸×21,3-二磷酸甘油酸×27-ATP-ATP+2ATP+2ATP+2NADH1.葡萄糖激酶3.磷酸果糖激酶6.3-磷酸甘油醛脫氫酶7.3-磷酸甘油酸激酶10.丙酮酸激酶消耗2ATP產(chǎn)生4ATP2NADH第五十四頁,共八十二頁,2022年,8月28日NADH+H++CO2丙酮酸脫氫酶系NAD++HSCoA*H3C-C~S-CoAOH3C-C-COOHOTCA過程第五十五頁,共八十二頁,2022年,8月28日1丙酮酸脫氫酶系酶丙酮酸脫羧酶E1二氫硫辛酸乙酰轉移酶E2二氫硫辛酸脫氫酶E3輔助因子TPP硫辛酸FADNAD+CoAMg2+第五十六頁,共八十二頁,2022年,8月28日檸檬酸草酰乙酸1乙酰CoA3`草酰琥珀酸-酮戊二酸3琥珀酰-CoA4延胡索酸6蘋果酸785琥珀酸CO2CO2NADH+H+FADH2GTPNADH+H+NADH+H+二次脫羧異檸檬酸2四次脫氫一次GTP注意:乙醛酸循環(huán)第五十七頁,共八十二頁,2022年,8月28日注意TCA中催化兩次CO2
脫羧的關鍵酶第五十八頁,共八十二頁,2022年,8月28日5-磷酸核糖5-磷酸木酮糖糖酵解G-6-P6-磷酸葡萄糖酸NADP+NADPH+H+5-磷酸核酮糖NADP+NADPH+H+CO27-磷酸景天酮糖3-磷酸甘油醛F-6-P4-磷酸赤蘚糖G-3-P+F-6-PA.過程
氧化階段(脫碳產(chǎn)能)非氧化階段(重組)G→G-6-PPPP過程第五十九頁,共八十二頁,2022年,8月28日第七章脂類代謝主要內容:
脂肪的分解代謝(包括甘油和脂肪酸)
脂肪的合成代謝(重點是脂肪酸的合成)第六十頁,共八十二頁,2022年,8月28日1)脂肪酸的氧化分解——β氧化2)甘油的氧化分解3)脂肪酸的合成——循環(huán)4)酮體的組成、合成與分解部位等5)甘油磷酯的生物合成(兩條途徑、載體)第六十一頁,共八十二頁,2022年,8月28日脂肪脂肪酸甘油+3-磷酸甘油磷酸二羥丙酮脂酰CoA乙酰CoA丙酮酸EMP糖異生GTCA乙酰CoA細胞質線粒體脂酰CoA-氧化清蛋白運輸自由運輸?shù)诹?,共八十二頁?022年,8月28日甘油3-磷酸甘油DHAPNADH+H+丙酮酸NADH+H+-ATP2ATPCO2TCA4NADH+H+FADH21GTP甘油徹底氧化的總能量16.5或18.5ATP第六十三頁,共八十二頁,2022年,8月28日脂肪酸脂酰CoA脂酰CoA2反式烯脂酰CoA加水-羥脂酰CoA-酮脂酰CoA脫氫脫氫硫解脂酰CoA(少2個C)乙酰CoA+TCA乙酰CoA細胞質線粒體-氧化FADH2NADH+H+-ATP(AMP)16C的軟脂酰CoAβ-氧化次數(shù)和產(chǎn)物?7次β-氧化產(chǎn)物:8分子乙酰CoA7×(FADH2+NADH)第六十四頁,共八十二頁,2022年,8月28日偶數(shù)碳原子的脂肪酸,凈生成的ATP數(shù)目公式循環(huán)一次產(chǎn)生的ATP數(shù)TCA產(chǎn)生的ATP數(shù)β-氧化的循環(huán)次數(shù)產(chǎn)生的乙酰CoA的個數(shù)第六十五頁,共八十二頁,2022年,8月28日縮合乙酰CoA線粒體細胞質乙酰CoA穿梭體系丙二酸單酰CoA還原D--羥丁酰ACP巴豆酰ACP脫水乙酰乙酰ACP丁酰ACP還原乙酰-S-ACP丙二酸單酰ACP進入下一輪循環(huán)-NADPH+H+-ATP-NADPH+H+軟脂酸的合成第六十六頁,共八十二頁,2022年,8月28日軟脂酸分解與合成代謝的區(qū)別p264區(qū)別合成氧化1、部位2、?;d體3、參與的二碳單位4、電子供體或受體5、羥脂酰中間體立體異構6、轉運機制7、酶系8、方向9、循環(huán)10、能量變化細胞質ACP丙二酸單酰ACPNADPHD型三羧酸(檸檬酸)7種酶蛋白組成復合體甲基端羧基縮合、還原、脫水、還原-7ATP-14NADPH線粒體CoA乙酰CoAFAD,NADL型肉堿載體4種酶羧基甲基端脫氫、加水、脫氫、硫解+106ATP第六十七頁,共八十二頁,2022年,8月28日四、甘油的生物合成3-磷酸甘油脫氫酶NAD+NADH+H+來自脂肪水解
來自EMP途徑3-磷酸甘油
甘油ADP合成脂肪的原料磷酸激酶ATP第六十八頁,共八十二頁,2022年,8月28日p243酮體:脂肪酸在肝臟線粒體中氧化分解生成的乙酰乙酸、β-羥丁酸和丙酮三種中間代謝產(chǎn)物
CH3COCH2COOH乙酰乙酸CH3CH(OH)CH2COOHβ-羥丁酸CH3COCH3丙酮酮體在肝外組織代謝。第六十九頁,共八十二頁,2022年,8月28日第八章蛋白質及氨基酸代謝第七十頁,共八十二頁,2022年,8月28日重點與難點:1)氨基酸的脫氨基作用
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