第章蛋白質(zhì)的構(gòu)件氨基酸_第1頁
第章蛋白質(zhì)的構(gòu)件氨基酸_第2頁
第章蛋白質(zhì)的構(gòu)件氨基酸_第3頁
第章蛋白質(zhì)的構(gòu)件氨基酸_第4頁
第章蛋白質(zhì)的構(gòu)件氨基酸_第5頁
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文檔簡介

蛋白質(zhì)(Protein)1838年,J.J.Berzelius提出,源自希臘文προτο——第一重要,首要的物質(zhì)蛋白質(zhì)存在于所有生物細胞中,是構(gòu)成生物體最基本的結(jié)構(gòu)物質(zhì)和功能物質(zhì)(結(jié)構(gòu)大分子、功能大分子)。蛋白質(zhì)是生命活動的物質(zhì)基礎(chǔ),參與了幾乎所有的生命活動過程。當(dāng)前1頁,總共77頁。一、蛋白質(zhì)的化學(xué)組成和分類1、元素組成當(dāng)前2頁,總共77頁。2、蛋白質(zhì)的含氮量蛋白氮占生物組織所有含氮物質(zhì)的絕大部分。大多數(shù)蛋白質(zhì)含氮量接近于16%蛋白質(zhì)含量=蛋白氮含量6.25凱氏定氮法當(dāng)前3頁,總共77頁。3、蛋白質(zhì)的分類(1)依據(jù)外形分類球狀蛋白質(zhì):globularprotein:形狀接近球形,水溶性較好,種類很多,可行使多種多樣的生物學(xué)功能。如:轉(zhuǎn)運氧的血紅蛋白

纖維狀蛋白質(zhì):fibrousprotein:外形呈棒狀或纖維狀,大多數(shù)不溶于水,是生物體重要的結(jié)構(gòu)成分,或?qū)ι矬w起保護作用。如毛發(fā)里的角蛋白。

膜蛋白質(zhì):membraneprotein:折疊成近球形,插入生物膜,也有一些通過非共價鍵或共價鍵結(jié)合在生物膜的表面

當(dāng)前4頁,總共77頁。(2)依據(jù)蛋白質(zhì)的組成分類簡單蛋白simpleprotein單純蛋白,僅由氨基酸組成結(jié)合蛋白conjugatedprotein由簡單蛋白與其它非蛋白成分結(jié)合而成輔基(配體、配基)當(dāng)前5頁,總共77頁。簡

白清蛋白和球蛋白albuminandglobulin廣泛存在于動物組織谷蛋白和醇溶谷蛋白glutelinandprolamin植物蛋白,不溶于水,易溶于稀酸/堿精蛋白和組蛋白堿性蛋白存在于細胞核硬蛋白根據(jù)溶解性分當(dāng)前6頁,總共77頁。結(jié)

白色蛋白:簡單蛋白+色素物質(zhì)糖蛋白:簡單蛋白+糖類物質(zhì)脂蛋白:簡單蛋白+脂類結(jié)合核蛋白:簡單蛋白+核酸根據(jù)輔基種類分當(dāng)前7頁,總共77頁。二、蛋白質(zhì)水解蛋白質(zhì)和多肽的肽鍵可被催化水解酸/堿能將蛋白完全水解

得到各種AA的混合物(即水解徹底),但部分AA受到破壞酶水解一般是部分水解

得到多肽片段和AA的混合物(即水解不徹底)AA不受到破壞氨基酸是蛋白質(zhì)的基本結(jié)構(gòu)單元當(dāng)前8頁,總共77頁。三、氨基酸的一般結(jié)構(gòu)地球上天然形成的AA有300種以上。構(gòu)成蛋白質(zhì)的AA只有20余種,且都是α-氨基酸(除脯氨酸,是亞氨基酸)當(dāng)前9頁,總共77頁。α碳原子R基羧基α氨基左右特點:大多數(shù)AA在中性pH時呈兼性離子狀態(tài):除甘氨酸外,19種AA都具有旋光性,是L型。除胱氨酸和酪氨酸外,其余AA都能溶于水。能形成肽鍵COO-NH3+當(dāng)前10頁,總共77頁。當(dāng)前11頁,總共77頁。四、氨基酸的分類天然氨基酸:300多種:蛋白質(zhì)氨基酸:20多種基本氨基酸(常見氨基酸):20種(含1種亞氨基酸)非蛋白氨基酸當(dāng)前12頁,總共77頁。按R基的化學(xué)結(jié)構(gòu)分類:1、脂肪族aa(15種)(1)中性aa(5種)(一)常見的蛋白質(zhì)氨基酸甘氨酸丙氨酸纈氨酸亮氨酸異亮氨酸當(dāng)前13頁,總共77頁。(2)含羥基或硫aa絲氨酸半胱氨酸蘇氨酸甲硫氨酸(蛋氨酸)當(dāng)前14頁,總共77頁。胱氨酸當(dāng)前15頁,總共77頁。(3)酸性aa及其酰胺天冬氨酸天冬酰胺谷氨酸谷氨酰胺當(dāng)前16頁,總共77頁。(4)堿性aa賴氨酸精氨酸當(dāng)前17頁,總共77頁。2、芳香族aa(3種)苯丙氨酸酪氨酸色氨酸當(dāng)前18頁,總共77頁。3、雜環(huán)aa(2種)組氨酸脯氨酸當(dāng)前19頁,總共77頁。按R基的極性性質(zhì)分類:1、非極性R基aa苯丙氨酸纈氨酸亮氨酸異亮氨酸丙氨酸酪氨酸蛋氨酸脯氨酸當(dāng)前20頁,總共77頁。2、不帶電荷的極性R基aa絲氨酸蘇氨酸谷氨酰胺天冬酰胺半胱氨酸甘氨酸酪氨酸當(dāng)前21頁,總共77頁。3、帶正電荷的R基aa組氨酸賴氨酸精氨酸當(dāng)前22頁,總共77頁。4、帶負電荷的R基aa天冬氨酸谷氨酸當(dāng)前23頁,總共77頁。(二)不常見的蛋白質(zhì)氨基酸由常見aa經(jīng)修飾而來。脯氨酸4-羥脯氨酸結(jié)締組織的膠原蛋白當(dāng)前24頁,總共77頁。賴氨酸5-羥賴氨酸結(jié)締組織的膠原蛋白當(dāng)前25頁,總共77頁。ε-N-甲基賴氨酸γ-羧基谷氨酸肌球蛋白凝血酶原當(dāng)前26頁,總共77頁。(三)非蛋白質(zhì)氨基酸200多種多是蛋白質(zhì)中L型α-AA衍生物有一些是β-,γ-,δ-AA有些是D-型AA

當(dāng)前27頁,總共77頁。鳥氨酸瓜氨酸當(dāng)前28頁,總共77頁。五、氨基酸的酸堿性質(zhì)兼性離子中性分子(極少數(shù))當(dāng)前29頁,總共77頁。(一)氨基酸的解離當(dāng)前30頁,總共77頁。(一)氨基酸的解離氨基酸的解離順序賴氨酸精氨酸先解離羧基,再解離氨基教材上沒有、重要哦當(dāng)前31頁,總共77頁。+H3N—CH—COOHR(A+)(一)氨基酸的解離+H3N—CH—COO-R(A0)H2N—CH—COO-R(A-)K1K2CH2CH—NH3+COOHCOOH(Asp+)CH2CH—NH3+COOHCOO-CH2CH—NH3+COO-COO-CH2CH—NH2COO-COO-(Asp0)(Asp-)(Asp--)K1K2K3當(dāng)前32頁,總共77頁。(一)氨基酸的解離(CH2)4CH—NH3+NH3+COOH(Lys++)K1(CH2)4CH—NH3+NH3+COO-(Lys+)K2(CH2)4CH—NH2NH3+COO-(Lys0)K3(CH2)4CH—NH2NH2COO-(Lys-)K值可以用測定滴定曲線的實驗方法獲得在計算題中,一般直接給出當(dāng)前33頁,總共77頁。甘氨酸滴定曲線當(dāng)前34頁,總共77頁。當(dāng)前35頁,總共77頁。當(dāng)前36頁,總共77頁。當(dāng)前37頁,總共77頁。(三)氨基酸的等電點定義:當(dāng)溶液為某一pH值時,AA主要以兼性離子的形式存在,分子中所含的正負電荷數(shù)目相等,凈電荷為0。這時的pH值即為AA的等電點(pI)。在pI時,AA在電場中既不向正極也不向負極移動,即處于兩性離子狀態(tài)。當(dāng)前38頁,總共77頁。等電點的計算:pI=(pK1+pK2)/2當(dāng)前39頁,總共77頁。六、氨基酸的化學(xué)反應(yīng)當(dāng)前40頁,總共77頁。(一)α-羧基參加的反應(yīng)成鹽或成酯反應(yīng)成酰氯反應(yīng)脫羧基反應(yīng)疊氮反應(yīng)當(dāng)前41頁,總共77頁。(2)成酯

NH2

干燥,HCl

RCHCOOH+C2H5OH

回流

RCHCOOC2H5+H2ONH3·Cl

保護羧基(1)與NaOH等形成鹽成鹽或成酯反應(yīng)當(dāng)前42頁,總共77頁。HN-保護基R—CH-COOH+PCl5

HN-保護基R—CH-COOCl+POCl3+HCl保護氨基活化羧基成酰氯反應(yīng)當(dāng)前43頁,總共77頁。

NH2脫羧酶R—CH-COOHR-CH2-NH2+CO2脫羧基反應(yīng)當(dāng)前44頁,總共77頁。

YNHONH2NH2

R—CH—C—OCH3

YNHOHNO2

R—CH—C—NHNH2

YNHO

R—CH—C—N-—N+N+2H2O

酰化氨基酸甲酯肼?;被k迈;被/B氮疊氮反應(yīng)當(dāng)前45頁,總共77頁。(二)α-氨基參加的反應(yīng)與亞硝酸反應(yīng)與?;噭┓磻?yīng)烴基化反應(yīng)形成Schiff’s堿反應(yīng)脫氨基反應(yīng)當(dāng)前46頁,總共77頁。

NH2OHRCHCOOH+HNO2RCHCOOH+H2O+N2VanSlyke(范斯來克氨基氮測定法)法測氨基氮(體積)的基礎(chǔ)。N2中的1/2為氨基氮。

氨基酸定量和蛋白質(zhì)水解程度的測定。與亞硝酸反應(yīng)當(dāng)前47頁,總共77頁。NO2FO2N+H2N—CH—COOHRNO2O2NHN—CH—COOHR+HF弱堿性DNP-氨基酸(黃色)DNFBSanger法測定N末端氨基酸基礎(chǔ)與酰化試劑反應(yīng)當(dāng)前48頁,總共77頁?!狽=C=S+N—CH—COOHHHRPITC—N—C—N—CH—COOHHHRSPTC-氨基酸—N—CHRSNCCOPTH-氨基酸pH8.3無水HF苯異硫氰酸酯PITC苯氨基硫甲酰衍生物苯乙內(nèi)硫脲衍生物Edman降解法基礎(chǔ)烴基化反應(yīng)當(dāng)前49頁,總共77頁。

R’COOHR’COOC=O+H2NCHC=NCHHRHR醛氨基酸Schiff’s堿-H20+H20形成Schiff’s堿反應(yīng)當(dāng)前50頁,總共77頁。在生物體內(nèi)經(jīng)AA氧化酶催化即脫去α-氨基而轉(zhuǎn)變?yōu)橥?。脫氨基反?yīng)當(dāng)前51頁,總共77頁。(三)α-羧基和α-氨基都參加的反應(yīng)與茚三酮反應(yīng)成肽反應(yīng)當(dāng)前52頁,總共77頁。弱酸加熱當(dāng)前53頁,總共77頁。(四)側(cè)鏈R基參加的反應(yīng)Tyr2、堿性AA堿性AA帶硫AA當(dāng)前54頁,總共77頁。Cys與二硫硝基苯甲酸發(fā)生硫醇-二硫化物交換pH8.0時412nm最大光吸收—分光光度法測定-SH當(dāng)前55頁,總共77頁。Cys的巰基不穩(wěn)定,易被氧化成二硫鍵巰基在有痕量的金屬離子如:Cu2+,F(xiàn)e2+,Co2+或Mn2+時,易被氧化當(dāng)前56頁,總共77頁。Cys中的二硫鍵可被氧化劑(過甲酸)以及還原劑(巰基化合物)打開。磺基丙氨酸當(dāng)前57頁,總共77頁。Tyr(酪氨酸)酚基在3和5位上易發(fā)生親電取代反應(yīng),如碘化和硝化黃色反應(yīng)當(dāng)前58頁,總共77頁。His側(cè)鏈咪唑基與重氮苯磺酸生成棕紅色化合物Pauly反應(yīng)當(dāng)前59頁,總共77頁。Arg側(cè)鏈胍基與環(huán)己二酮生成縮合物當(dāng)前60頁,總共77頁。Trp(色氨酸)側(cè)鏈吲哚基能被N-溴代琥珀酰亞胺氧化——分光光度法測定Trp含量當(dāng)前61頁,總共77頁。Met側(cè)鏈上甲硫基:強親核基團與烴化試劑成锍鹽保護巰基當(dāng)前62頁,總共77頁。七、AA的光學(xué)活性和光譜性質(zhì)(一)AA的光學(xué)活性和立體化學(xué)當(dāng)前63頁,總共77頁。當(dāng)前64頁,總共77頁。當(dāng)前65頁,總共77頁。當(dāng)前66頁,總共77頁。當(dāng)前67頁,總共77頁。(二)氨基酸的光譜性質(zhì)可見光區(qū):無吸收遠紫外和紅外區(qū):都吸收近紫外區(qū)(200—400nm):Tyr/Trp/Phe原因:-C=C-C=C-C=C-C=C-1、紫外吸收光譜當(dāng)前68頁,總共77頁。Trp(色)280nmTyr(酪)275nmPhe(苯丙)257nm蛋白質(zhì)含量測定280nm當(dāng)前69

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