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文檔簡介
關于原核基因的表達調(diào)控第一頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日(一)基因表達調(diào)控概念(二)基因表達的方式(三)基因表達的規(guī)律——時間性和空間性(四)基因表達調(diào)控的生物學意義一、基因表達調(diào)控總論第二頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日geneexpression
:基因轉(zhuǎn)錄及翻譯的過程。對這個過程的調(diào)節(jié)就稱為generegulation
。rRNA、tRNA編碼基因轉(zhuǎn)錄合成RNA的過程也屬于基因表達(一)基因表達調(diào)控概念第三頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日
組成性表達(constitutiveexpression)
適應性表達(adaptiveexpression)(二)基因表達的方式第四頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日1、組成性表達
指不大受環(huán)境變動而變化的一類基因表達。某些基因在一個個體的幾乎所有細胞中持續(xù)表達,通常被稱為管家基因(housekeepinggene)。第五頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日
2、適應性表達指環(huán)境的變化容易使其表達水平變動的一類基因表達。應環(huán)境條件變化基因表達水平增高的現(xiàn)象稱為誘導(induction),這類基因被稱為可誘導的基因(induciblegene);相反,隨環(huán)境條件變化而基因表達水平降低的現(xiàn)象稱為阻遏(repression),相應的基因被稱為可阻遏的基因(repressiblegene)。第六頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日(三)基因表達的規(guī)律——時間性和空間性1、時間特異性(temporalspecificity)2、空間特異性(spatialspecificity)按功能需要,某一特定基因的表達嚴格按特定的時間順序發(fā)生,稱之為基因表達的時間特異性。多細胞生物基因表達的時間特異性又稱階段特異性(stagespecificity)?;虮磉_伴隨時間順序所表現(xiàn)出的這種分布差異,實際上是由細胞在器官的分布決定的,所以空間特異性又稱細胞或組織特異性(cellortissuespecificity)。在個體生長全過程,某種基因產(chǎn)物在個體按不同組織空間順序出現(xiàn),稱之為基因表達的空間特異性。第七頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日(四)基因表達調(diào)控的生物學意義
適應環(huán)境、維持生長和增殖(原核、真核)
維持個體發(fā)育與分化(真核)第八頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日二、原核基因調(diào)控機制(一)原核基因表達調(diào)控環(huán)節(jié)(二)操縱子學說(三)原核基因調(diào)控機制的類型與特點(四)轉(zhuǎn)錄水平上調(diào)控的其他形式
第九頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日(一)原核基因表達調(diào)控環(huán)節(jié)1、轉(zhuǎn)錄水平上的調(diào)控(transcriptionalregulation)2、轉(zhuǎn)錄后水平上的調(diào)控(post-transcriptionalregulation)①
mRNA加工成熟水平上的調(diào)控②
翻譯水平上的調(diào)控第十頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日第十一頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日(二)操縱子學說1、操縱子模型的提出
1961年,Monod和Jacob提出獲1965年諾貝爾生理學和醫(yī)學獎JacobandMonod第十二頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日2、操縱子的定義操縱子:是基因表達的協(xié)調(diào)單位,由啟動子、操縱基因及其所控制的一組功能上相關的結構基因所組成。操縱基因受調(diào)節(jié)基因產(chǎn)物的控制。第十三頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日結構基因(structuralgene):操縱子中被調(diào)控的編碼蛋白質(zhì)的基因。一個操縱子中含有2個以上的結構基因,多的可達十幾個。每個結構基因是一個連續(xù)的開放閱讀框(ORF),5’端有翻譯起始密碼,3’端有翻譯終止碼各結構基因頭尾銜接、串連排列,組成結構基因群至少在第一個結構基因5’側具有SD序列,因而當這段含多個結構基因的DNA被轉(zhuǎn)錄成多順反子mRNA,就能被核糖體所識別結合、并起始翻譯第十四頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日調(diào)節(jié)基因(regulatorgene)調(diào)節(jié)基因:編碼與操縱子結合的調(diào)控蛋白的基因第十五頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日操縱基因凡能與調(diào)控蛋白特異性結合、從而影響基因轉(zhuǎn)錄強弱的序列,不論其對基因轉(zhuǎn)錄的作用是減弱、阻止或增強、開放,都可稱為操縱基因第十六頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日第十七頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日
1、根據(jù)操縱子對調(diào)節(jié)蛋白(阻遏蛋白或激活蛋白)的應答,可分為:
(1)正轉(zhuǎn)錄調(diào)控
(2)負轉(zhuǎn)錄調(diào)控
(三)原核基因調(diào)控機制的類型與特點第十八頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日調(diào)節(jié)基因操縱基因結構基因阻遏蛋白激活蛋白正轉(zhuǎn)錄調(diào)控負轉(zhuǎn)錄調(diào)控正轉(zhuǎn)錄調(diào)控如果在沒有調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)存在時基因是關閉的,加入這種調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)后基因活性就被開啟,這樣的調(diào)控正轉(zhuǎn)錄調(diào)控。負轉(zhuǎn)錄調(diào)控在沒有調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)存在時基因是表達的,加入這種調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)后基因表達活性便被關閉,這樣的調(diào)控負轉(zhuǎn)錄調(diào)控。第十九頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日(1)可誘導調(diào)節(jié):指一些基因在特殊的代謝物或化合物的作用下,由原來關閉的狀態(tài)轉(zhuǎn)變?yōu)楣ぷ鳡顟B(tài),即在某些物質(zhì)的誘導下使基因活化。例:大腸桿菌的乳糖操縱子分解代謝蛋白的基因2、根據(jù)操縱子對某些能調(diào)節(jié)它們的小分子的應答,可分為可誘導調(diào)節(jié)和可阻遏調(diào)節(jié)兩大類:第二十頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日調(diào)節(jié)基因操縱基因結構基因阻遏蛋白調(diào)節(jié)基因操縱基因結構基因阻遏蛋白誘導物mRNA酶蛋白酶合成的誘導操縱子模型誘導物如果某種物質(zhì)能夠促使細菌產(chǎn)生酶來分解它,這種物質(zhì)就是誘導物。第二十一頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日(2)可阻遏調(diào)節(jié):基因平時是開啟的,處在產(chǎn)生蛋白質(zhì)或酶的工作過程中,由于一些特殊代謝物或化合物的積累而將其關閉,阻遏了基因的表達。例:色氨酸操縱子
合成代謝蛋白的基因第二十二頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日酶合成的阻遏操縱子模型調(diào)節(jié)基因操縱基因結構基因mRNA酶蛋白調(diào)節(jié)基因操縱基因結構基因輔阻遏物輔阻遏物如果某種物質(zhì)能夠阻止細菌產(chǎn)生合成這種物質(zhì)的酶,這種物質(zhì)就是輔阻遏物。第二十三頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日3、在負轉(zhuǎn)錄調(diào)控系統(tǒng)中,調(diào)節(jié)基因的產(chǎn)物是阻遏蛋白(repressor),起著阻止結構基因轉(zhuǎn)錄的作用。
根據(jù)其作用特征又可分為負控誘導和負控阻遏:在負控誘導系統(tǒng)中,阻遏蛋白與效應物(誘導物)結合時,結構基因轉(zhuǎn)錄在負控阻遏系統(tǒng)中,阻遏蛋白與效應物(輔阻遏物)結合時,結構基因不轉(zhuǎn)錄第二十四頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日第二十五頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日4、在正轉(zhuǎn)錄調(diào)控系統(tǒng)中,調(diào)節(jié)基因的產(chǎn)物是激活蛋白(activator)。根據(jù)激活蛋白的作用性質(zhì)分為正控誘導和正控阻遏在正控誘導系統(tǒng)中,效應物分子(誘導物)的存在使激活蛋白處于活性狀態(tài)在正控阻遏系統(tǒng)中,效應物分子(輔阻遏物)的存在使激活蛋白處于非活性狀態(tài)第二十六頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日第二十七頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日順式作用基因活性的調(diào)控主要通過反式作用因子(通常是蛋白質(zhì))與順式作用元件(通常在DNA上)相互作用而實現(xiàn)順式作用元件(cis-actingelement)是指對基因表達有調(diào)節(jié)活性的DNA序列,其活性只影響與其自身同處在一個DNA分子上的基因;同時,DNA序列通常不編碼蛋白質(zhì),多位于基因旁側或內(nèi)含子中,如啟動子、操縱子、終止子第二十八頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日反式作用反式作用因子(trans-actingfactor)是能調(diào)節(jié)與它們接觸的基因的表達的各種擴散分子(RNA或蛋白質(zhì)),如轉(zhuǎn)錄因子;其編碼基因與其識別或結合的靶核苷酸序列不在同一個DNA分子上調(diào)控基因則屬于反式作用元件(trans-actingelement),其編碼產(chǎn)生的調(diào)控蛋白為反式作用因子(trans-actingfactor)第二十九頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日(四)轉(zhuǎn)錄水平上調(diào)控的其他形式1、σ因子的更換
在E.coli中,當細胞從基本的轉(zhuǎn)錄機制轉(zhuǎn)入各種特定基因表達時,需要不同的因子指導RNA聚合酶與各種啟動子結合。2、降解物對基因活性的調(diào)節(jié)3、弱化子對基因活性的影響4、細菌的應急反應第三十頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日大腸桿菌中的各種σ因子比較σ因子編碼基因主要功能σ70rpoD參與對數(shù)生長期和大多數(shù)碳代謝過程基因的調(diào)控σ54rpoN參與多數(shù)氮源利用基因的調(diào)控σ38rpoH分裂間期特異基因的表達調(diào)控σ32rpoS熱休克基因的表達調(diào)控σ28rpoF鞭毛趨化相關基因的表達調(diào)控σ24rpoE過度熱休克基因的表達調(diào)控第三十一頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日溫度較高,誘導產(chǎn)生各種熱休克蛋白由σ32參與構成的RNA聚合酶與熱休克應答基因啟動子結合,誘導產(chǎn)生大量的熱休克蛋白,適應環(huán)境需要枯草芽孢桿菌芽孢形成
有序的σ因子的替換,RNA聚合酶識別不同基因的啟動子,使芽孢形成有關的基因有序地表達第三十二頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日三、乳糖操縱子(lacoperon)(一)乳糖操縱子的結構(二)酶的誘導——lac體系受調(diào)控的證據(jù)(三)乳糖操縱子調(diào)控模型(四)乳糖操縱子影響因子(五)Lac操縱子中的其他問題第三十三頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日一、乳糖操縱子的結構第三十四頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日Z編碼β-半乳糖苷酶:將乳糖水解成葡萄糖和半乳糖Y編碼β-半乳糖苷透過酶:使外界的β-半乳糖苷(如乳糖)能透過大腸桿菌細胞壁和原生質(zhì)膜進入細胞內(nèi)A編碼β-半乳糖苷乙?;D(zhuǎn)移酶:乙酰輔酶A上的乙酰基轉(zhuǎn)到β-半乳糖苷上,形成乙酰半乳糖第三十五頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日二、酶的誘導——lac體系受調(diào)控的證據(jù)第三十六頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日安慰誘導物:如果某種物質(zhì)能夠促使細菌產(chǎn)生酶而本身又不被分解,這種物質(zhì)被稱為安慰誘導物,如IPTG(異丙基-β–D-硫代半乳糖苷)。第三十七頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日三、乳糖操縱子調(diào)控模型1、主要內(nèi)容:①Z、Y、A基因的產(chǎn)物由同一條多順反子的mRNA分子所編碼。②這個mRNA分子的啟動子緊接著O區(qū),而位于I與O之間的啟動子區(qū)(P),不能單獨起動合成β-半乳糖苷酶和透過酶的生理過程。③操縱基因是DNA上的一小段序列(僅為26bp),是阻遏物的結合位點。④當阻遏物與操縱基因結合時,lacmRNA的轉(zhuǎn)錄起始受到抑制。⑤誘導物通過與阻遏物結合,改變它的三維構象,使之不能與操縱基因結合,從而激發(fā)lacmRNA的合成。當有誘導物存在時,操縱基因區(qū)沒有被阻遏物占據(jù),所以啟動子能夠順利起始mRNA的合成。
RNA聚合酶結合部位阻遏物結合部位
操縱位點的回文序列第三十八頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日2、突變類型組成型突變:lacOc
組成型突變:lacI-不可誘導突變(超阻遏)第三十九頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日組成型突變:lacOc
第四十頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日組成型突變:
lacI-
第四十一頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日不可誘導突變(超阻遏)第四十二頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日阻遏蛋白:
N端:
1~59aa-頭部片段:為HTH,與操縱基因DNA的大溝結合;
核心區(qū):有6個折疊,誘導物就結合在兩個核心區(qū)之間的裂縫中;
C端:
為兩組亮氨酸拉鏈,形成四聚體。第四十三頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日1、lac操縱子的本底水平表達2、大腸桿菌對乳糖的反應3、阻遏物lacI基因產(chǎn)物及功能4、葡萄糖對lac操縱子的影響5、cAMP與代謝物激活蛋白四、影響因子第四十四頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日1、lac操縱子的本底水平表達
有兩個矛盾是操縱子理論所不能解釋的:①誘導物需要穿過細胞膜才能與阻遏物結合,而轉(zhuǎn)運誘導物需要透過酶,后者的合成又需要誘導。解釋:一些誘導物可以在透過酶不存在時進入細胞?一些透過酶可以在沒有誘導物的情況下合成?√第四十五頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日②真正的誘導物是異構乳糖而非乳糖,前者是在β-半乳糖苷酶的催化下由乳糖形成的,因此,需要有β-半乳糖苷酶的預先存在。解釋:本底水平的組成型合成:非誘導狀態(tài)下有少量的lacmRNA合成。第四十六頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日2、大腸桿菌對乳糖的反應培養(yǎng)基:甘油按照lac操縱子本底水平的表達,每個細胞內(nèi)有幾個分子的β-半乳糖苷酶和β-半乳糖苷透過酶;第四十七頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日透過酶進入細胞β-半乳糖苷酶異構乳糖誘導物誘導lacmRNA的生物合成大量乳糖進入細胞多數(shù)被降解為葡萄糖和半乳糖(碳源和能源)異構乳糖培養(yǎng)基:加入乳糖少量乳糖第四十八頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日乳糖第四十九頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日誘導物的加入和去除對lacmRNA的影響第五十頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日3、阻遏物lacI基因產(chǎn)物及功能
Lac操縱子阻遏物mRNA是由弱啟動子控制下組成型合成的,每個細胞中有5-10個阻遏物分子。當I基因由弱啟動子突變成強啟動子,細胞內(nèi)就不可能產(chǎn)生足夠的誘導物來克服阻遏狀態(tài),整個lac操縱子在這些突變體中就不可誘導。第五十一頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日葡萄糖和乳糖同時加入培養(yǎng)基lac操縱子阻遏狀態(tài)不能被誘導4、葡萄糖對lac操縱子的影響耗盡外源葡萄糖lac操縱子啟動代謝物阻遏效應第五十二頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日5、cAMP與代謝物激活蛋白(1)代謝物激活蛋白(CAP)/環(huán)腺苷酸受體蛋白(CRP)
CAP結合位點啟動序列操縱序列ZYAOPDNA
調(diào)控區(qū)
結構基因Z:β-半乳糖苷酶Y:透酶A:乙?;D(zhuǎn)移酶cAMP—CAP復合物第五十三頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日第五十四頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日ATP腺苷酸環(huán)化酶cAMP(環(huán)腺苷酸)
大腸桿菌中:無葡萄糖,有葡萄糖,(2)CAP的正調(diào)控cAMP濃度高cAMP濃度低第五十五頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日++++轉(zhuǎn)錄無葡萄糖,cAMP濃度高時促進轉(zhuǎn)錄有葡萄糖,cAMP濃度低時不促進轉(zhuǎn)錄ZYAOPDNACAPCAPCAPCAPCAPCAP第五十六頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日(3)協(xié)調(diào)調(diào)節(jié)
當阻遏蛋白封閉轉(zhuǎn)錄時,CAP對該系統(tǒng)不能發(fā)揮作用如無CAP存在,即使沒有阻遏蛋白與操縱序列結合,操縱子仍無轉(zhuǎn)錄活性。cAMP—CAP復合物與啟動子區(qū)的結合是轉(zhuǎn)錄起始所必需的。第五十七頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日第五十八頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日TheLacOperon:
WhenGlucoseIsPresentButNotLactoseRepressorPromoterLacYLacALacZOperatorCAPBindingRNAPol.RepressorRepressorRepressormRNAHeyman,I’mconstitutiveComeon,letmethroughNowayJose!CAP第五十九頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日TheLacOperon:
WhenLactoseIsPresentButNotGlucoseRepressorPromoterLacYLacALacZOperatorCAPBindingRepressorRepressormRNAHeyman,I’mconstitutiveCAPcAMPLacRepressorRepressorXThislactosehasbentmeoutofshapeCAPcAMPCAPcAMPBindtomePolymeraseRNAPol.RNAPol.Yipee…!第六十頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日TheLacOperon:
WhenNeitherLactoseNorGlucoseIsPresentRepressorPromoterLacYLacALacZOperatorCAPBindingCAPcAMPCAPcAMPCAPcAMPBindtomePolymeraseRNAPol.RepressorRepressormRNAHeyman,I’mconstitutiveRepressorSTOPRighttherePolymeraseAlright,I’mofftotheraces...Comeon,letmethrough!第六十一頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日五、Lac操縱子中的其他問題(一)A基因及其生理功能半乳糖苷分子(IPTG)β-半乳糖苷酶
分解產(chǎn)物(體內(nèi)積累)β-半乳糖苷乙酰基轉(zhuǎn)移酶半乳糖苷分子(IPTG)乙?;诹摚惨话僖皇?,編輯于2023年,星期日(二)lac基因產(chǎn)物數(shù)量上的比較
β-半乳糖苷酶:透過酶:乙?;D(zhuǎn)移酶=1:0.5:0.2
翻譯水平上受到調(diào)節(jié):(1)lacmRNA可能與翻譯過程中的核糖體相脫離,從而終止蛋白質(zhì)鏈的翻譯;(2)在lacmRNA分子內(nèi)部,A基因比Z基因更容易受內(nèi)切酶作用發(fā)生降解。第六十三頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日(三)操縱子的融合與基因工程POZYAtsxPOpur結構基因缺失lacoperonpuroperon第六十四頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日四、色氨酸操縱子(trpoperon)(一)色氨酸操縱子的結構(二)色氨酸操縱子的阻遏系統(tǒng)(三)色氨酸操縱子的弱化機制第六十五頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日(一)色氨酸操縱子的結構
調(diào)控基因
結構基因
催化分枝酸轉(zhuǎn)變?yōu)樯彼岬拿?/p>
trpRtrp第六十六頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日第六十七頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日特點:
(1)trpR和trpABCDE不連鎖;(2)操縱基因在啟動子內(nèi)(3)有衰減子(attenuator)/弱化子(4)啟動子和結構基因不直接相連,二者被前導序列(Leader)所隔開第六十八頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日(二)trp操縱子的阻遏系統(tǒng)低Trp時:阻遏物不結合操縱基因;高Trp時:阻遏物+Trp
結合操縱基因第六十九頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日(三)trp操縱子的弱化機制1、衰減子(attenuator)/弱化子2、前導序列(leadersequence)3、弱化機制第七十頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日1、弱化子:
DNA中可導致轉(zhuǎn)錄過早終止的一段核苷酸序列(123-150區(qū))。123~150第七十一頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日
研究引起終止的mRNA堿基序列,發(fā)現(xiàn)該區(qū)mRNA通過自我配對可以形成莖-環(huán)結構,有典型的終止子特點。第七十二頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日2、前導序列:在trpmRNA5'端trpE基因的起始密碼前一個長162bp的mRNA片段。第七十三頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日第七十四頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日UUUU……UUUU……調(diào)節(jié)區(qū)
結構基因
trpROP前導序列衰減子區(qū)域
UUUU……前導mRNA1234衰減子結構
第10、11密碼子為trp密碼子
終止密碼子14aa前導肽編碼區(qū):
包含序列1
形成發(fā)夾結構能力強弱:序列1/2>序列2/3>序列3/4trp密碼子
UUUU……第七十五頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日3、弱化機制第七十六頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日第七十七頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日
前導肽轉(zhuǎn)錄終止結構第七十八頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日高Trp時:Trp-tRNATrp存在
核糖體通過片段1(2個Trp密碼子)
封閉片段2
片段3,4形成發(fā)夾結構類似于不依賴ρ因子的轉(zhuǎn)錄終止序列
RNA聚合酶停止轉(zhuǎn)錄,產(chǎn)生衰減子轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物轉(zhuǎn)錄、翻譯偶聯(lián),產(chǎn)生前導肽第七十九頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日高Trp時:Trp-tRNATrp存在
核糖體通過片段1(2個Trp密碼子)
封閉片段2
片段3,4形成發(fā)夾結構類似于不依賴ρ因子的轉(zhuǎn)錄終止序列RNA聚合酶停止轉(zhuǎn)錄,產(chǎn)生衰減子轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物轉(zhuǎn)錄、翻譯偶聯(lián),產(chǎn)生前導肽第八十頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日UUUU……34UUUU3’34核糖體前導肽
前導mRNA1.當色氨酸濃度高時轉(zhuǎn)錄衰減機制
125’trp密碼子衰減子結構就是終止子可使轉(zhuǎn)錄前導DNA
UUUU3’
RNA聚合酶終止第八十一頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日低Trp時:Trp-tRNATrp沒有供應
核糖體翻譯停止在片段1
(2個Trp密碼子)片段2,3
形成發(fā)夾結構
轉(zhuǎn)錄不終止RNA聚合酶繼續(xù)轉(zhuǎn)錄第八十二頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日UUUU……342423UUUU……核糖體
前導肽
前導mRNA
15’trp密碼子
結構基因前導DNA
RNA聚合酶2.當色氨酸濃度低時
Trp合成酶系相關結構基因被轉(zhuǎn)錄序列3、4不能形成衰減子結構第八十三頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日協(xié)調(diào)阻遏作用:粗調(diào)開關
阻遏物的作用是當有大量外源色氨酸存在時,阻止非必需的先導mRNA的合成,它使這個合成系統(tǒng)更加經(jīng)濟阻遏作用的信號是細胞內(nèi)色氨酸的多少弱化作用:細調(diào)開關弱化作用的信號是Trp-tRNAtrp的多少,通過控制前導肽的翻譯來控制轉(zhuǎn)錄的進行第八十四頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日Negative—repressibleoperon可以被最終合成產(chǎn)物所阻遏RPOleadingseq.EDCBAtrp+為什么需要阻遏體系?當大量Trp存在時,阻遏系統(tǒng)起作用。阻遏物與之結合,阻止先導mRNA合成。
經(jīng)濟第八十五頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日僅有少量trp時,RNApol啟動,但在L.S.處脫落,轉(zhuǎn)錄中斷RPOleadingseq.EDCBA少量trp+不足以結合
O
位點為什么需要弱化系統(tǒng)?當trp濃度低時,阻遏物從有活性變?yōu)闊o活性,速度極慢,不能很快引發(fā)trp合成。因此需要一個能快速作出反應的系統(tǒng),以保持培養(yǎng)基中適當?shù)腡rp水平。第八十六頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日
細菌通過弱化作用彌補阻遏作用的不足,因為阻遏作用只能使轉(zhuǎn)錄不起始,對于已經(jīng)起始的轉(zhuǎn)錄,只能通過弱化作用使之中途停下來。阻遏作用的信號是細胞內(nèi)色氨酸的多少;弱化作用的信號則是細胞內(nèi)載有色氨酸的tRNA的多少。它通過前導肽的翻譯來控制轉(zhuǎn)錄的進行,在細菌細胞內(nèi)這兩種作用相輔相成,體現(xiàn)著生物體內(nèi)周密的調(diào)控作用。第八十七頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日原核生物衰減作用的普遍性第八十八頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日(一)半乳糖操縱子(galactoseoperon)(二)阿拉伯糖操縱子(arabinoseoperon)(三)阻遏蛋白LexA的降解與細菌中的SOS應答五、其他操縱子第八十九頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日(一)半乳糖操縱子(galactoseoperon)異構酶(galE)乳糖-磷酸尿嘧啶核苷轉(zhuǎn)移酶(galT)
半乳糖激酶(galk)第九十頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日gal操縱子的特點:它有兩個啟動子,其mRNA可從兩個不同的起始點開始轉(zhuǎn)錄;它有兩個O區(qū),一個在P區(qū)上游,另一個在結構基因galE內(nèi)部。第九十一頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日
分析gal操縱子P-O區(qū)的DNA序列發(fā)現(xiàn),該操縱子確實存在兩個相距僅5bp的啟動子,可以分別起始mRNA的合成。每個啟動子擁有各自的RNA聚合酶結合位點S1和S2。從S1起始的轉(zhuǎn)錄只有在培養(yǎng)基中無葡萄糖時,才能順利進行,RNA聚合酶與S1的結合需要半乳糖、CRP和較高濃度的cAMP。從S2起始的轉(zhuǎn)錄則完全依賴于葡萄糖,高水平的cAMP-CRP能抑制由這個啟動子起始的轉(zhuǎn)錄。當有cAMP-CRP時,轉(zhuǎn)錄從S1開始,當無cAMP-CRP時,轉(zhuǎn)錄從S2開始。
第九十二頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日
半乳糖不僅可以作為唯一碳源供細胞生長,而且與之相關的物質(zhì)--尿苷二磷酸半乳糖(UDPgal)是大腸桿菌細胞壁合成的前體。在沒有外源半乳糖的情況下,UDP-gal是通過半乳糖差向異構酶的作用由UDP-葡萄糖合成的,該酶是galE基因的產(chǎn)物。生長過程中的所有時間里細胞必須能夠合成差向異構酶?,F(xiàn)在設想只有S1一個啟動子,那么由于這個啟動子的活性依賴于cAMP-CRP,當培養(yǎng)基中有葡萄糖存在時就不能合成異構酶。假如唯一的啟動子是S2,那么,即使在葡萄糖存在的情況下,半乳糖也將使操縱子處于充分誘導狀態(tài),這無疑是一種浪費。無論從必要性或經(jīng)濟性考慮,都需要一個依賴于cAMP-CAP的啟動子(S1)對高水平合成進行調(diào)節(jié)。
雙啟動子的生理功能第九十三頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日(二)阿拉伯糖操縱子(arabinoseoperon)araB基因、araA基因和araD,形成一個基因簇,簡寫為araBAD三個基因的表達受到ara操縱子中araC基因產(chǎn)物AraC蛋白的調(diào)控。
第九十四頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日ara操縱子的調(diào)控有兩個特點:第一,araC表達受到AraC的自身調(diào)控。第二,AraC既是ara操縱子的正調(diào)節(jié)蛋白(需cAMP-CRP的共同參與,起始轉(zhuǎn)錄),又是其負調(diào)節(jié)蛋白。這種雙重功能是通過AraC蛋白的兩種異構體來實現(xiàn)的(Pi和Pr)。第九十五頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日營養(yǎng)狀況對ara操縱子活性的影響
●有葡萄糖時,不轉(zhuǎn)錄
●無葡萄糖,也無阿拉伯糖時,不轉(zhuǎn)錄
●無葡葡糖,有阿拉伯糖時,araBAD
基因表達第九十六頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日第九十七頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日第九十八頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日第九十九頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日(三)阻遏蛋白LexA的降解與細菌中的SOS應答SOS反應的機理:由RecA蛋白和LexA阻遏物的相互作用引起的。LexA阻遏物:是SOSDNA修復系統(tǒng)所有基因的阻遏物RecA蛋白:是SOS反應的最初的發(fā)動因子。在單鏈DNA和ATP存在時,RecA蛋白被激活,表現(xiàn)出水解酶活性,分解LexA阻遏物。當RecA水解LexA阻遏物后,導致SOS體系(包括recA基因)高效表達,DNA得到修復第一百頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日(一)翻譯起始的調(diào)控(二)稀有密碼子對翻譯的影響(三)重疊基因?qū)Ψg的影響(四)魔斑核苷酸水平對翻譯的影響-應急調(diào)控(五)小分子RNA的翻譯調(diào)節(jié)六轉(zhuǎn)錄后水平上的調(diào)控第一百零一頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日(一)翻譯起始的調(diào)控
起始密碼子:AUGGUGUUGAUURBS(核糖體結合位點):mRNA鏈上起始密碼子AUG上游的一段非翻譯區(qū)。
RBS的結合強度取決于SD序列的結構及其與起始密碼子AUG之間的距離。
SD-
4-10(9)-AUG第一百零二頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日(二)稀有密碼子對翻譯的影響dnaG(引物酶)RNA引物dnaG、rpoD和rpsU屬于大腸桿菌基因組上的同一個操縱子50個拷貝的dnaG蛋白、2800個拷貝的rpoD和40000個拷貝的rpsU第一百零三頁,共一百一十二頁,編輯于2023年,星期日幾種蛋白質(zhì)中異亮氨酸密碼子使用頻率比較蛋
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