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本文格式為Word版,下載可任意編輯——VASP自旋軌道耦合計算錯誤匯總
VASP自旋軌道耦合計算錯誤匯總
靜態(tài)計算時,報錯:
VERYBADNEWS!Internal內(nèi)部errorinsubroutine子程序IBZKPT:
Reciprocal倒數(shù)的latticeandk-latticebelongtodifferentclassoflattices.Oftenresultsarestilluseful(48)
INCAR參數(shù)設(shè)置:
對策:根據(jù)所用集群,修改INCAR中NPAR。將NPAR=4變成NPAR=1,已解決!
錯誤:subspacematrix類錯誤
報錯:靜態(tài)和能帶計算中出現(xiàn)警告:WARNING:Sub-Space-Matrixisnothermitian共軛inDAV
結(jié)構(gòu)優(yōu)化出現(xiàn)錯誤:
WARNING:Sub-Space-MatrixisnothermitianinDAV4-4.681828688433112E-002
對策:通過將默認(rèn)AMIX=0.4,修改成AMIX=0.2(或0.3),問題得以解決。
以下是類似的錯誤:
WARNING:Sub-Space-Matrixisnothermitianinrmm-3.00000000000000
RMM:22-0.167633596124E+02-0.57393E+00-0.44312E-0113260.221E+00BRMIX:
veryseriousproblemstheoldandthenewchargedensitydifferoldchargedensity:28.00003new28.060930.111E+00
錯誤:
WARNING:Sub-Space-Matrixisnothermitianinrmm-42.5000000000000
ERRORFEXCP:suppliedExchange-correletiontableistoosmall,maximalindex:4794
錯誤:結(jié)構(gòu)優(yōu)化Bi2Te3時,log文件:
WARNINGinEDDIAG:subspacematrixisnothermitian1-0.199E+01
RMM:2000.179366581305E+01-0.10588E-01-0.14220E+007180.261E-01
BRMIX:veryseriousproblemstheoldandthenewchargedensitydifferoldchargedensity:56.00230new124.7039466F=0.17936658E+01E0=0.18295246E+01dE=0.557217E-02
curvature:0.00expectdE=0.000E+00dEforcontlinesearch0.000E+00
ZBRENT:fatalerrorinbracketing
pleasererunwithsmallerEDIFF,orcopyCONTCARtoPOSCARandcontinue
但是,將CONTCAR拷貝成POSCAR,接著算靜態(tài)沒有報錯,這樣算出來的結(jié)果有問題嗎?
對策1:用這個CONTCAR拷貝成POSCAR重新做一次結(jié)構(gòu)優(yōu)化,看是否達(dá)到優(yōu)化精度!
對策2:用這個CONTCAR拷貝成POSCAR,并且修改EDIFF(目前參數(shù)EDIFF=1E-6),默認(rèn)為10-4
錯誤:
WARNING:Sub-Space-MatrixisnothermitianinDAV1-7.626640664998020E-003
網(wǎng)上參考解決方案:
對策1:減小POTIM:IBRION=0,標(biāo)準(zhǔn)分子動力學(xué)模擬。通過POTIM控制步長。
POTIM:當(dāng)IBRION=1,2或3時,是力的一個縮放常數(shù)(相當(dāng)于確定原子每步移動的大?。?,默認(rèn)值為0.5。
對策2:改IBRION=1,采用準(zhǔn)牛頓算法來優(yōu)化原子的位置。
原IBRION=2,采用共軛梯度算法來優(yōu)化原子的位置
對策3:修改ISMEAR
對策4:換成CG弛豫(共軛梯度算法)IBRION=2(決定結(jié)構(gòu)優(yōu)化過程中,原子如何移動或弛豫)
IBRION=2離子是否運動,1不運動但做NSW外循環(huán)。0動力學(xué)模擬,1準(zhǔn)牛頓法離子弛豫
2CG法離子弛豫,3采用衰減二階運動方程離子弛豫,
INCARrelax中設(shè)置IBRION=2,未解決!
對策5:用的CG算符,出現(xiàn)的錯誤是CG算符不能算,在INCAR中加上IALG=Fast(電子優(yōu)化采用blockedDavidson方法[IALGO=38:IALG=Normal]和RMM-DIIS算法[IALGO=48:IALG=Very_Fast]混合)試一試
設(shè)置:
初始值收斂值結(jié)果
AMIX=0.0100;BMIX=0.0001AMIX=0.01;BMIX=0.00計算無誤
AMIX=0.1000;BMIX=0.0010AMIX=0.10;BMIX=0.00計算無誤
AMIX=0.20;BMIX=0.01AMIX=0.20;BMIX=0.01計算無誤
AMIX=0.2、BMIX=0.001AMIX=0.2、BMIX=0.001計算無誤
AMIX=0.3、BMIX=0.1AMIX=0.3、BMIX=0.1計算無誤
AMIX=0.4AMIX=0.40;BMIX=1.00靜態(tài)log:WARNINGinEDDRMM:callto
ZHEGVfailed,returncode=63**,能帶
一樣
AMIX=0.02AMIX=0.02;BMIX=1.00計算無誤
AMIX=0.1AMIX=0.10;BMIX=1.00靜態(tài)log:WARNINGinEDDRMM:callto
ZHEGVfailed,returncode=63**,能帶
一樣
AMIX=0.3AMIX=0.30;BMIX=1.00靜態(tài)log:WARNINGinEDDRMM:callto
ZHEGVfailed,returncode=63**,能帶
一樣
BMIX=0.0001AMIX=0.40;BMIX=0.00計算無誤
以上參數(shù)設(shè)置,得到的能帶圖都一樣,如下圖:
綜上:設(shè)置AMIX=0.2(或0.3),BMIX默認(rèn)(省事,等于1.0),可以保證計算過程無誤。還需進(jìn)一步調(diào)整其他參數(shù),算出正確的能帶。
警告:算1QL弛豫、靜態(tài)、能帶時,都有這個提醒:
ADVICETOTHISUSERRUNNINGVASP/VAMP(HEARYOURMASTERSVOICE...):Youhavea(moreorless)
smallsupercellandforsmallercellsitisrecommendedtousethereciprocal-spaceprojectionscheme!Therealspaceoptimizationisnotefficientforsmallcellsanditisalsolessaccurate...ThereforesetLREAL=.FALSE.intheINCARfile
對策:對于較小的晶胞(原子數(shù)小于20),設(shè)置LREAL=.FALSE.,計算結(jié)果比較確切。而對于較大的晶胞,設(shè)置LREAL=Auto,這樣計算速度比較快。本體系含原子5個,INCAR中LREAL=Auto。設(shè)置所有INCAR中的
LREAL=.FALSE.,重新算一遍。
對于1QL2QL3QL原子數(shù)分別為5、10、15,LREAL=.False.
對于4QL5QL6QL原子數(shù)分別為20、25、30,LREAL=Auto
自旋軌道耦合計算時,靜態(tài)和能帶計算中出現(xiàn)的錯誤:
ERROR:noncollinearcalculationsrequirethatVASPiscompiledwithouttheflag-DNGXhalfand-DNGZhalf
分析:VASP手冊中關(guān)于自旋軌道耦合計算的描述(翻譯版):
非線性計算和自旋軌道耦合:旋量是由GeorgKresse在VASP代碼中引入的。這個代碼是由DavidHobbs編寫,用于處理非線性磁結(jié)構(gòu)。自旋軌道耦合計算是由OlivierLebacqandGeorgKresse共同實現(xiàn)的。只有VASP4.5以上的版本才支持旋量的計算。
在INCAR中設(shè)置LNONCOLLINEAR=.TRUE.允許執(zhí)行完全非線性磁結(jié)構(gòu)的計算。VASP有能力讀入之前非磁或非線性計算得到的WAVECAR和CHGCAR文件,然而它不可能扭轉(zhuǎn)局域在指定原子處的磁場。
因此在實際操作中,我們推薦分兩步執(zhí)行非線性計算:
第一步,計算計算非磁性基態(tài),產(chǎn)生WAVECAR和CHGCAR文件。
其次步,讀入WAVECAR和CHGCAR文件,通過設(shè)置MAGMOM參數(shù),提供初始的磁矩。對于非線性設(shè)置,在MAGMOM這一行,每個離子必需設(shè)置三個值。這三項分別對應(yīng)每個離子在x,y,z方向的初始局域磁矩值。
MAGMOM=100010
這一行,給第一個原子賦予的初始磁矩值沿x方向,其次個原子的初始磁矩值沿y方向。
注意:只有在ICHARG=2(即不讀入之前CHGCAR的狀況)或者CHGCAR文件中只包含電荷但是不包括磁密度數(shù)據(jù)的狀況(即之前那一步進(jìn)行了非磁的計算)下,才需要通過MAGMOM設(shè)定初始磁矩值。
LSORBIT-tagSupportedasofVASP.4.5.
LSORBIT=.TRUE.只能用于PAW贗勢,不能用于超軟贗勢。假使不考慮自選軌道耦合,則能量不依靠磁矩的方向,也就是說,旋轉(zhuǎn)所有的磁矩以同一個角度,讓它們擁有相等的能量。不考慮自選軌道耦合的時候,不需要定義自旋量子化坐標(biāo)。開啟自旋軌道耦合設(shè)置以下參數(shù):
LSORBIT=.TRUE.
SAXIS=s_xs_ys_z(自旋量子化軸,默認(rèn)值SAXIS=(0+,0,1))
GGA_COMPAT=.FALSE.!應(yīng)用球面截斷能到梯度場
其中SAXIS默認(rèn)=(0+,0,1)(0+表示沿x軸方向一個無窮小的正數(shù))。當(dāng)需要計算亞meV能量尺度的微小能量差異(一般指磁各向異性計算的狀況)時,需要設(shè)置GGA_COMPAT這個參數(shù)?,F(xiàn)在所有關(guān)于坐標(biāo)軸(Sx,Sy,Sz)的磁矩都給出來了,我們采用VASP中給出關(guān)于這個坐標(biāo)軸所有磁矩和自旋狀量子讀寫慣例。
這包括INCAR文件中的MAGMOM行,OUTCAR和PROCAR文件中的總和局域磁矩,WAVECAR文件中的類自旋軌道,CHGCAR文件中的磁密度。笛卡爾坐標(biāo)系中的磁分量由以下等式得到:
axis
zaxisxzaxis
zaxisyxyaxis
zaxisyaxisxxmmmmmmmmmmm)cos()sin()sin()sin()cos()sin()cos()cos(*)sin()sin()cos()cos(ββαβααβαβααβ+-=++=+-=其中,maxis是外部可見的磁矩值,此處的α是SAXIS矢量(sx,sy,sz)和笛卡爾坐標(biāo)x軸的夾角,β是SAXIS矢量和笛卡
爾坐標(biāo)z軸的夾角,zyxxysssassa||tan,tan
22+==βα,以下等式得到逆變化:
zyxaxisyxaxiszyxaxismmmmmmmmmmmz
y
x
)cos()sin()sin()cos()sin()cos()sin()sin()sin()cos()cos()cos(βαβαβααβαβαβ++=+-=++=不難看出,默認(rèn)值(sx,sy,sz)=(0+,0,1),兩個角度都是0,即β=0和α=0。在這種狀況下,內(nèi)部轉(zhuǎn)換簡單地等于外部地轉(zhuǎn)換:axis
zzaxisyyaxisxxmmmmmm===,,,其次種重要的狀況,是0=axisxm和0=axisym,在這種狀況下:
222222/)(cos/)cos(*)sin(zyxzaxiszaxisxzyz
yzaxiszaxiszxssssmmmmssssmmmx++===
++==βαβ
因此現(xiàn)在磁矩是平行于SAXIS矢量。這樣有兩種方式去旋轉(zhuǎn)自旋到任意方向,即通過改變初始的磁矩MAGMOM或改變SAXIS。為了給計算賦予平行于一個選定的矢量(x,y,z)的初始磁矩,可以通過設(shè)定(假定是單原子原胞):MAGMOM=xyz!局域磁矩xyz
SAXIS=001!量子軸平行于z軸
或者
MAGMOM=00total_magnetic_moment!局域磁矩平行于SAXIS
SAXIS=xyz!量子軸平行于矢量(x,y,z)
兩種設(shè)置都必需在一致能量的標(biāo)準(zhǔn)/輻射(原則、根源)場,但是要實現(xiàn)其次種方法,尋常更加確切。其次種方法,也允許讀入之前存在的WAVECAR文件(由線性計算還是非線性計算產(chǎn)生的都可以),然后繼續(xù)用一個不同的自旋方向計算。當(dāng)讀入一個非線性WAVECAR文件,自旋假定平行于SAXIS(因此VASP將僅僅輸出一個z軸方向的磁矩)。推薦計算磁各項異性的步驟如下:
先做線性計算,得到一個WAVECAR和CHGCAR文件。
參與以下參數(shù):
LSORBIT=.TRUE.
ICHARG=11!非自洽計算,讀入CHGCAR
LMAXMIX=4!對于d電子元素設(shè)置LMAXMIX=4,f電子元素設(shè)置LMAXMIX=6
!在線性計算中,需要設(shè)置LMAXMIX
SAXIS=xyz!磁場的方向
NBANDS=2*線性計算能帶數(shù)
GGA_COMPAT=.FALSE.!在梯度場中應(yīng)用球面截斷能
VASP讀入WAVECAR和CHGCAR文件,將自旋量子軸對齊SAXIS矢量,這意味著現(xiàn)在磁場平行于SAXIS矢量,執(zhí)行非線性計算。通過比較不同方向的能量,可以確定磁各向異性。請記住,原則上,在VASP中一個完全地自洽計算(ICHARG=1)也是有可能的,但是這種狀況將會允許自旋波函數(shù)從它們的初始值旋轉(zhuǎn)到平行于SAXIS矢量,直到獲得正確的基態(tài),也就是,直到磁矩平行于易磁化軸。實際操作中,這種旋轉(zhuǎn)十分緩慢,直到自旋獲得少量能量重新定位。因此,假使收斂標(biāo)準(zhǔn)太確切,完全地自洽計算可以得到一個比較合理的結(jié)果(我們試驗過的幾種自洽計算都沒有問題。)要十分防備對稱性。我們建議選擇計算自旋軌道耦合時,完全關(guān)掉對稱性(ISYM=0)。尋常會從一個自旋方向到另一個自旋方向k點的設(shè)置會發(fā)生改變,進(jìn)而惡化轉(zhuǎn)換的結(jié)果(假使k點改變WAVECAR將不會被正確地重新讀?。?。GGA_COMPAT尋常需要,應(yīng)當(dāng)被設(shè)置,由于磁各向異性能量尋常需要確切到亞meV數(shù)量級。
當(dāng)計算自旋軌道耦合,特別是磁各向異性時尋常需要十分防備:能量差異十分小,k點的收斂冗長而且緩慢,需要花費大量的計算時間。此外,這一特征--盡管長期存在于VASP中--在最新的版本中仍舊存在,你可以嘗試頻繁地升級發(fā)現(xiàn)這一點。不敢保證,你的結(jié)果是有用的!此處根據(jù)README文件做了一個小小的總結(jié):
20.11.2023:提出的GGA程序微弱的破壞了非正交體系晶胞的對稱型。球面截斷能應(yīng)用于梯度及互逆空間中的所有中間結(jié)果。GGA引起的微弱的改變(尋常每個原子0.1meV),卻對磁各項異性很重要。
05.12.2023:繼續(xù)...現(xiàn)在VASP.4.6默認(rèn)舊的行為GGA_COMPAT=.TRUE.,新的行為將可以通過在INACR中設(shè)置GGA_COMPAT=.FALSE.得到。
12.08.2023:主要的錯誤出現(xiàn)在symmetry.F和paw.F:非線性計算的對稱性例程沒有正確的執(zhí)行。
假使你閱讀了以上內(nèi)容,就會意識到在VASP.4.6和VASP.5.2版本中進(jìn)行非線性計算推薦設(shè)置GGA_COMPAT=.FALSE.,這樣可以提升GGA計算的數(shù)值精度。
VASP:Non-collinearcalculationsandspinorbitcoupling:Spinors旋量wereincludedbyGeorgKresseintheVASPcode.Thecoderequiredforthetreatment處理ofnon-collinearmagneticstructureswaswrittenbyDavidHobbs,andspin-orbitcouplingwasimplemented實施、執(zhí)行byOlivierLebacqandGeorgKresse.SpinorsareonlysupportedasofVASP.4.5.Subsections:分段、子章節(jié)、下一級欄目
LNONCOLLINEAR-tag
Supported支持asofVASP.4.5.
grepIBRIONOUTCAR
IBRION=2ionicrelax:0-MD1-quasi-New2-CG
設(shè)置ADDGRID=.True.InINCAR
設(shè)置IBRION=1inINCAR
錯誤:
internalERRORRSPHER:runningoutofbuffer00
1310
nonlr.F:OutofbufferRSPHER
得到的CONTCAR是空的!
結(jié)構(gòu)優(yōu)化出現(xiàn)錯誤:
Internal內(nèi)部的、內(nèi)在的ERRORRSPHER:runningoutofbuffer緩沖00
1310
nonlr.F:OutofbufferRSPHER
解決:將NPAR=1修改成4(或者2),問題得以解決。
分兩步(scf非磁線性計算,bands讀取CHGCAR、WAVECAR做非線性自旋軌道耦合計算),能帶計算出錯:ERROR:whilereadingWAVECAR,planewavecoefficients系數(shù)changed5728628837
Solution:Youhavetocontinuewiththeconverged收斂CHGCAR,becausemostprobably,youwillincrease增加/change改變thek-meshtogetadenser密集的、濃重的k-gridtocalculatetheDOSaccurately.Then,WAVECARwillnotbereadcorrectlybecausethewavefunction-coefficients波函數(shù)-系數(shù)arestored存儲k-pointwise明智的concerning涉及theREADerrorofCHGCAR:pleasecheckwhethertheFFTmesheshavechanged.pleasemakesurethat
1)theCHGCARreallyisintheworkingdirectory目錄atruntime運行時間
2)thefftmeshesofCHGCARarecompatible兼容的
Themainpointsisinthissentenceplanewavecoefficientschanged,IthinktheISMEARyouusedinscfandnoscfprocessisdifferent,therefore,theplanewavecoefficientschangedinthesetwoprocessisnotidentical完全一致的.YoucanfindthevaluesofNGXF,NGYFandNGZFintheCHGCARorOUTCARofthescf,andthenaddthesethreeparametersintheINCARofthenonscf.OK,theproblemisresolved.
在靜態(tài)計算的CHGCAR或者OUTCAR中找到NGXF,NGYF和NGZF,將這些參數(shù)加到非靜態(tài)計算的INCAR中:grepNGXFOUTCAR
dimensionx,y,zNGXF=64NGYF=64NGZF=840
supportgridNGXF=64NGYF=64NGZF=840
NGXF,Y,Zisequivalenttoacutoffof25.43,25.43,25.05a.u.
對策:在能帶計算INCAR中參與NGXF=64NGYF=64NGZF=840
修改之后,bands中出現(xiàn)錯誤:
ERROR:noncollinearcalculationsrequirethatVASPiscompiledwithouttheflag-DNGXhalfand-DNGZhalf
解決:待解決!
網(wǎng)上經(jīng)驗:
noncollinearcalculationsrequirethatVASPiscompiledwithouttheflag-DNGXhalfand-DNGZhalf.
一、請參與SOC
1)INCAR中參與
LNONCOLLINEAR=.True.
LSORBIT=.True.
LORBMOM=.True.
ISYM=-1(?不對,ISYM取值0,1,2,3)
program.
IncreasingtheSYMPRECtagmeans,thatthepositionsinthePOSCARfilecanbelessaccurate.
Duringthesymmetryanalysis,VASPdetermines
?theBravaislatticetypeofthesupercell,
?thepointgroupsymmetryandthespacegroupofthesupercellwithbasis(staticanddynamic)-andprintsthenames
ofthegroup(spacegroup:only’family’),
?thetypeofthegeneratingelementary(primitive)cellifthesupercellisanon-primitivecell,
?all’trivialnon-trivial’translations(=trivialtranslationsofthegeneratingelementarycellwithinthesupercell)—neededforsymmetrisationofthecharge,
?thesymmetry-irreduciblesetofk-pointsifautomatick-meshgenerationwasused
andadditionallythesymmetryirreduciblesetoftetrahedraifthetetrahedronmethodwaschosentogetherwiththeautomatick-meshgenerationandofcoursealsothecorrespondingweights(’symmetrydegeneracy’),
?andtablesmarkingandconnectingsymmetryequivalentions.Thesymmetryanalysesisdoneinfoursteps:
?Firstthepointgroupsymmetryofthelattice(assuppliedbytheuser)isdetermined.
?Thentestsareperformed,whetherthebasisbreakssymmetry.Accordinglythesesymmetryoperationsareremoved.
?Theinitialvelocitiesarecheckedforsymmetrybreaking.
?Finally,itischeckedwheterMAGMOMbreaksthesymmetry.Correspondinglythemagneticsymmetrygroupisdetermined(VASP.4.4.4andnewerreleasesonly;ifyouuseolderversionpleasealsoseesection6.12).Theprogramsymmetrisesautomatically:
?Thetotalchargedensityaccordingtothedeterminedspacegroup
?Theforcesontheionsaccordingtothedeterminedspacegroup.
?Thestresstensoraccordingtothedeterminedspacegroup
Whyissymmetrisationnecessary:WithinLDAthesymmetryofthesupercellandthechargedensityarealwaysthesame.
Thissymmetryisbroken,becauseasymmetry-irreduciblesetofk-pointsisusedforthecalculation.
Torestorethecorrectchargedensityandthecorrectforcesitisnecessarytosymmetrisethesequantities.
It
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