基因檢測案例6

基因檢測案例6|3。「綜合征疾病簡介Usher綜合征是一種以耳聾和進展性視力喪失為特征的常染色體隱性遺傳病，是最常見的引起耳聾伴眼盲的疾病，人群患病率是1/5000~1/16000。Usher綜合征分為3型：Usher綜合征I型、II型和III型°USHI型在幼年時即出現(xiàn)近乎全聾和前庭功能障礙，通常在成年前出現(xiàn)RP癥狀；I型患者聽力損害呈中到重度，沒有前庭功能障礙，成年后出現(xiàn)RP癥狀；I型患者出生時聽力正常，逐漸出現(xiàn)RP和聽力喪失。USH2A基因簡介及遺傳方式USH2A基因位于染色體的1q41，具有長短兩個剪切轉(zhuǎn)錄本，一種是由21個外顯子編碼的Usherin蛋白亞型a，共有1546個氨基酸，另一種是在USH2A基因3’發(fā)現(xiàn)的51個外顯子，即共含有72個外顯子編碼的Usherin蛋白亞型b，編碼5202個氨基酸。USH2A基因編碼Usherin蛋白，主要在耳蝸和視網(wǎng)膜中表達。USH2A基因突變常引起Usher綜合征或非綜合征型視網(wǎng)膜色素變性，以常染色體隱性的方式遺傳。

USH2A基因變異類型MutationtypeTotalnumberofmutationsMissense/non^ense791SplicingsubEtituton^125Regulatorysubstitutions1Smalldeletions203Smallinsertion^duplicat□ns72Smallindete14GroESdeletions91Grossinsertons/duplications10Camplewrearrangements5Repeatvariations0TOTAL1312HGMD數(shù)據(jù)庫中收錄的USH2A基因變異有1300余種，90%以上為點突變或小片段缺失/插入，10%為大片段插入缺失,USH2A基因被認為是引起USH2型最常見的致病基因，大約70%USH2型患者是由USH2A基因突變引起的。目前，已知的大部分突變位于USH2A基因的1-21外顯子，即Usherin蛋白亞型a。USH2A基因突變引起的疾病表型除了引起Usher綜合征以外，USH2A基因突變還能引起視網(wǎng)膜色素變性等疾病，以下表格是HGMD數(shù)據(jù)庫中收錄的相關文章報道的疾病表型。DiseaEe/phenolypeNumberofmutationsUshersyndrome2615Retiinitispigmentosa208Ushersyndrome2a12bUshersyndrome110RetiinitispigmentDsa;autosomalrecessive75Retiinaldystrophy27Hearingloss22Deafness18Retiinaldisease15Retiinitispigmentosa,non^/ndramic10Retiinitispigmentosa9Retiinitispigmentosa,recessive,nohearingloss9Deafness,non-syndromic6Hearinglos^autosomalrecessive6Cone-roddystrophy5Highmyopia5Retiinaldegeneration5案例分享臨床癥狀先證者，女，32歲，臨床診斷為Usher綜合征，先證者親屬無相關癥狀，為散發(fā)病例。檢測項目眼科遺傳病基因檢測（441個基因）。檢測方法從受檢者外周血中提取基因組DNA，構建基因組文庫，通過探針雜交捕獲相關的目的基因外顯子及相鄰內(nèi)含子部分區(qū)域，進行富集。富集的目的基因片段通過高通量測序平臺測序，對明確的致病性變異，采用Sanger測序進行驗證。檢測結(jié)果檢出一個與受檢者臨床表型匹配的致病性基因變異?；蛎Q參考序列核昔酸改變氨基酸改變純合/雜合致病性分析遺傳方式變異來源USH2AKXI_206933c.LOOOOTp.Arg334Trzki=iPathogenic母源USH2AKXI_206933C.1876OT:p.Arg626*zki=iPathogenic未知備注：按照美國醫(yī)學遺傳學與基因組學學會ACCMG）制定的遺傳變異分類標準，變異分為以下5種類型，Pathogenic表示致病的變異Likelypathogenic表示可能致病的變異Benign表示良性的變異；Likelybenign表示可能良性的變異；Uncertainsignificance表示意義不明確的變異。AD表示常染色體顯性遺傳;AR表示常染色體隱性遺傳；X-linked表示X連鎖遺傳。遺傳解析USH2A(OMIM608400)基因突變常引起Usher綜合征或視網(wǎng)膜色素變性，以常染色體隱性的方式遺傳。被檢先證者攜帶以下雜合突變：.USH2Ac.1000C>T;p.Arg334Trp,此突變已被HGMD數(shù)據(jù)庫收錄，已有文獻報道【見參考文獻1-2】為致病突變；.USH2Ac.1876C>T;p.Arg626*,此突變已被HGMD數(shù)據(jù)庫收錄，已有文獻報道【見參考文獻3-4】為致病突變。受檢者基因診斷與臨床表型相符，為致病變異。遺傳咨詢建議受檢父親未進行該變異位點的驗證。建議家系遺傳咨詢。受檢者及家系內(nèi)其他患者將來生育，與攜帶USH2A基因變異的配偶與不攜帶USH2A基因變異的配偶進行婚配，后代攜帶該基因的情況不一致，建議進行遺傳咨詢。金標準驗證

USH2Ac.l87?C>T;p.R626*參考文獻Adato(2000)HumMutat15,388Bravo-Gil(2016)SciRep6:23910[Additionalphenoty