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文檔簡(jiǎn)介
分子生物學(xué)第四章復(fù)制第一頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五第一節(jié)基本概念第二節(jié)復(fù)制概況第三節(jié)DNA復(fù)制的酶學(xué)
第四節(jié)DNA復(fù)制的半不連續(xù)性第五節(jié)原核生物DNA復(fù)制(E.coli)
第六節(jié)真核生物DNA復(fù)制第二頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五
第一節(jié)基本概念
(BasicConcept)第三頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五DNA復(fù)制
親代雙鏈DNA分子在DNA聚合酶的作用下,分別以各單鏈DNA分子為模板,聚合與自身堿基可以互補(bǔ)配對(duì)的游離的dNTP,
合成出兩條與親代DNA分子完全相同的子代DNA分子的過(guò)程?!?/p>
復(fù)制子(Replicon);又稱(chēng)復(fù)制單位或復(fù)制元AunitofthegenomeinwhichDNAcontainaregionfromorigintoterminator
DNA中含有一定復(fù)制起點(diǎn)和復(fù)制終點(diǎn)的復(fù)制單位
1.3萬(wàn)~90萬(wàn)不等第四頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五●復(fù)制體(Replisome)Themultiprotein(30±)structurethatassemblesatreplicatingforktoundertakesynthesisofDNA復(fù)制叉處的許多酶和蛋白組成的復(fù)合體,協(xié)同動(dòng)作合成DNA第五頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五DNA復(fù)制在細(xì)胞周期的S期E.coli37℃0.5h105bp/minmammaliancell500-5000bp/min第六頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五第二節(jié)復(fù)制概況
(SurveysofReplication)第七頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五一、DNA的半保留復(fù)制(Semi-ConservationReplication)1958Meselson-stahl設(shè)計(jì)的CsCl超離心試驗(yàn)證實(shí)了
DNA復(fù)制的這一特性概念:復(fù)制過(guò)程中各以雙螺旋DNA的其中一條鏈為模
板合成其互補(bǔ)鏈,新生的互補(bǔ)鏈與母鏈構(gòu)成子
代DNA分子第八頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五15N標(biāo)記實(shí)驗(yàn)·細(xì)胞生長(zhǎng)在15N標(biāo)記培養(yǎng)基中·轉(zhuǎn)入正常N源培養(yǎng)基中·分離各代DNA·分析各代DNA的浮力密度15N標(biāo)記DNA未標(biāo)記DNACsCL密度梯度離心浮力密度
N15-DNA1.742g/mlN15-N14-DNA1.717g/mlN14-DNA1.710g/ml第九頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五第十頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五
二、復(fù)制起點(diǎn)、方式和方向1、復(fù)制起點(diǎn)(originori或o復(fù)制原點(diǎn))復(fù)制開(kāi)始處DNA分子的特定位置原核生物(Prokaryote):?jiǎn)螐?fù)制起點(diǎn)即--整個(gè)染色體只有一個(gè)復(fù)制單位
第十一頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五
真核生物(Eukaryote):多復(fù)制起點(diǎn)即--一個(gè)genome中有多個(gè)復(fù)制單位第十二頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五Replicationfork第十三頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五
富含AT&發(fā)夾結(jié)構(gòu)“呼吸作用”十分明顯許多酶的結(jié)合位點(diǎn)300bp±
真核生物的復(fù)制原點(diǎn)ATrich第十四頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五
復(fù)制叉(Replicationfork):染色體中參與復(fù)制的活性區(qū)域,即復(fù)制正在發(fā)生的位點(diǎn)
2、復(fù)制方向(復(fù)制過(guò)程的順序性)
復(fù)制眼(replicationeye):電子顯微鏡下觀察正在復(fù)制的DNA,復(fù)制的區(qū)域形如一只眼睛第十五頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五真核生物的多復(fù)制子多個(gè)復(fù)制眼第十六頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五第十七頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五
(1)單雙向復(fù)制取決于起點(diǎn)處有一個(gè)還是兩個(gè)復(fù)制叉
單向復(fù)制
雙向復(fù)制第十八頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五(2)復(fù)制的多模式單起點(diǎn)、單方向(原核)多起點(diǎn)、單方向(真核)單起點(diǎn)、雙方向(原核)多起點(diǎn)、雙方向(真核)第十九頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五3、復(fù)制方式大多數(shù)以對(duì)稱(chēng)方式進(jìn)行--即兩條鏈同時(shí)復(fù)制也有一定時(shí)期內(nèi)DNA只復(fù)制一條鏈的情況
(1)從新起始(denovoinitiation
)或復(fù)制叉式(replicationfork)
比較形象的--θ
復(fù)制雙鏈環(huán)狀DNA的復(fù)制眼可以形成一種θ結(jié)構(gòu),形狀像希臘字母θ,因而叫….第二十頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五AreplicationeyeformsathetastructureincircularDNA.第二十一頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五
單、雙向θ
復(fù)制模式圖單向復(fù)制雙向復(fù)制第二十二頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五
(2)置換式(Displacementform
)又稱(chēng)D環(huán)復(fù)制
兩條鏈的合成高度不對(duì)稱(chēng),一條鏈迅速合成出互補(bǔ)鏈,另一條則形成游離的單鏈環(huán)(D-環(huán))
線(xiàn)粒體和葉綠體
DNA的復(fù)制方式第二十三頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五(3)共價(jià)延伸方式(covalenceelongation)或滾環(huán)式復(fù)制(rollingcirclereplication)由于復(fù)制時(shí)產(chǎn)生的滾環(huán)結(jié)構(gòu)形狀象σ,又稱(chēng)σ復(fù)制
病毒、細(xì)菌因子第二十四頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五第三節(jié)DNA復(fù)制的酶學(xué)
(EnzymologyofDNAReplication)第二十五頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五
一、DNA聚合反應(yīng)和聚合酶1957ArthurKornberg首次發(fā)現(xiàn)DNApolⅠ
DNApolⅡ
DNApolⅢ
(E.coli)
聚合反應(yīng):底物--dNTPPoly(核苷酸)n-3’-OH+dNTP→
Poly(核苷酸)n+1-3’-OH
+2Pi
第二十六頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五
二、三種DNA聚合酶的結(jié)構(gòu)和功能(P112)第二十七頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五
其中DNApolⅢ
全酶有十種共22個(gè)亞基β二聚體--滑動(dòng)鉗第二十八頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五DNApolⅢ全酶的非對(duì)稱(chēng)二聚體第二十九頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五第三十頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五DNApolⅠ和DNApolⅢ的主要特性和功能
1、DNA聚合酶活性:兩者都有條件--模板、引物
DNApolⅠ--主要用于DNA
的修復(fù)和RNA引物的替換
DNApolⅢ--DNA鏈的延長(zhǎng)聚合方向:5’-3’第三十一頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五
2、3’-5’外切核酸酶活性
校對(duì)功能(proofreading)第三十二頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五第三十三頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五3、5’-3’外切核酸酶活性
DNApolⅠ的5’-3’外切活性有以下三個(gè)特點(diǎn):
?必須有5’-磷酸末端?被除去的核苷酸必須是已經(jīng)配對(duì)的?被除去的可以是脫氧核糖核苷酸,也可以是核糖核苷酸(切刻平移,Nicktranslation)第三十四頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五該反應(yīng)具有巨大的實(shí)用價(jià)值,切口平移是體外在DNA分子上引入放射性標(biāo)記核苷酸的主要技術(shù)。第三十五頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五4、子鏈DNA延伸方向只能是5’-3’已知的DNA聚合酶只能使鏈按5’-3’方向生長(zhǎng)5’OHTCATCA
C5’OH3’pppOHC++ppi
P123頁(yè)第三十六頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五如果DNA的延伸方向是3’→5’
ATCG
+
5’pppOH3’
G
pppOH
G
ATCG
5’pppOH3’第三十七頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五ATCG
+
5’pppOH3’
G
pppOH
G
5’pppa、因能量的需要,
DNA的5’端必須帶有PPP游離dNTP具有ppppppOH3’ATCG在0.2MNaCl的生理環(huán)境中,使dNTP難以聚合到DNA的5’端需要其他機(jī)制以解脫第三十八頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五b、堿基發(fā)生錯(cuò)配后的校正……費(fèi)時(shí)、費(fèi)能、增加脫磷酸、加磷酸的能量消耗
ATCGpppOH+pppApOHTCGpppOHTCGTCGpp
pOH第三十九頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五
三、DNA連接酶(DNALigase)
所需條件:
a、
切刻的3’-OH和5’-P相鄰
b、
切刻各自堿基處于配對(duì)狀態(tài)
c、需要能量原核(ATP、NAD)真核(ATP)
用途:復(fù)制過(guò)程中,5’端RNA引物被置換后切刻的連接
修復(fù)、重組NAD——煙酰胺腺嘌呤二核苷酸第四十頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五酶-AMP復(fù)合物形成
酶復(fù)合物的AMP和缺口的5‘-磷酸相連,隨后與此缺口的3’-OH形成磷酸二酯鍵,并放出酶和AMP第四十一頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五
四、與DNA幾何學(xué)性質(zhì)相關(guān)的酶1、解螺旋酶(helicase):又稱(chēng)解旋酶是使DNA兩條鏈分開(kāi)的酶,通常利用ATP水解提供必需的能量。單鏈結(jié)合蛋白(SSBsingle-strandbindingprotein)
與單鏈DNA結(jié)合,阻止其再形成雙鏈狀態(tài)
2、
DNA旋轉(zhuǎn)酶(gyrase):消除復(fù)制叉前進(jìn)過(guò)程中產(chǎn)生的正超螺旋,產(chǎn)生負(fù)超螺旋第四十二頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五第四十三頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五第四十四頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五第四節(jié)DNA復(fù)制的半不連續(xù)性(Semi-DiscontinuousReplication)
第四十五頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五3‘5‘3‘5‘OK!How?5‘3‘5‘3‘
一、DNA復(fù)制的半不連續(xù)性
事實(shí)上沒(méi)有發(fā)現(xiàn)DNA能按3‘→5’合成的證據(jù)第四十六頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五
崗奇片段(Okazakifragment)1968
用dT-H3
短時(shí)間來(lái)標(biāo)記大腸桿菌D.S.DNAS.S.DNA
蔗糖密度梯度離心測(cè)定H3-T
放射強(qiáng)度得到許多長(zhǎng)度為1kb左右的DNA片段第四十七頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五先導(dǎo)鏈?zhǔn)沁B續(xù)復(fù)制的后隨鏈按Okazaki片段不連續(xù)復(fù)制
先導(dǎo)鏈(leadingstrand):DNA復(fù)制時(shí),與復(fù)制叉向前移動(dòng)的方向一致,以3’→5’鏈為模板,按
5’→3’方向連續(xù)合成的一條鏈
后隨鏈(laggingstrand):岡崎片段(Okazakifragment):DNA復(fù)制不連續(xù)合成鏈中形成的短DNA片段第四十八頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五后隨鏈的片段合成需要一個(gè)周期性的起始信號(hào)
二、引物(Primer)和引發(fā)酶(Primase)DNApolymerase只能使DNA從引物的3’端延伸DNA復(fù)制如何起始???
RNA可能提供了DNA復(fù)制的3’端1、實(shí)驗(yàn)證據(jù)Ⅰ:M13phage的DNA復(fù)制顯示出對(duì)轉(zhuǎn)錄抑制劑
的敏感性第四十九頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五E.coli[Rifs]
RNApol[RifS]+M13E.coliM13+S.S.DNAvirus+RF無(wú)M13RFRifalmpinM13Rifalmpin有M13RFRifalmpin
是E.coliRNApolymerase
的抑制劑
第五十頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五M13RF的形成需要RNApolymerase發(fā)動(dòng)合成一段RNA分子作為引物(RNA提供復(fù)制的3‘端)RF啟動(dòng)后,Rifalmpin
的抑制無(wú)效結(jié)論(Conclusion):第五十一頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五2、實(shí)驗(yàn)證據(jù)Ⅱ:Reiji等的實(shí)驗(yàn)證據(jù)--每一岡崎片段都產(chǎn)生一個(gè)RNA-DNA接頭第五十二頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五3、后續(xù)研究發(fā)現(xiàn):
?細(xì)菌中先導(dǎo)鏈的合成受Rifalmpin的抑制
?后隨鏈的合成不受Rifalmpin限制(1)原因:?先導(dǎo)鏈的起始需要RNApol的轉(zhuǎn)錄激活?而后隨鏈的起始由引發(fā)酶合成引物,而引發(fā)酶不受Rifalmpin的抑制第五十三頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五(2)DNA復(fù)制的轉(zhuǎn)錄激活
(transcriptionalactivation):
DNA復(fù)制起始時(shí)通過(guò)RNApolymerse的轉(zhuǎn)錄過(guò)程而解開(kāi)局部的雙鏈
轉(zhuǎn)錄激活時(shí)產(chǎn)生的RNA能否作為引物目前尚未得出普遍結(jié)論P(yáng)119頁(yè)第五十四頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五第五十五頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五(1)RNApol(RNApolymerase)[RifS](2)dnaG(primase)[RifR]
組裝成引發(fā)體
完成對(duì)后隨鏈(先導(dǎo)鏈)引物的合成
(3)完成10±NtRNA引物合成后
DNApolII進(jìn)行DNA鏈的延伸
DNApolⅠLigase主要實(shí)現(xiàn)DNA復(fù)制的轉(zhuǎn)錄激活起始較先導(dǎo)鏈的啟動(dòng)落后一個(gè)Okazaki片斷4、總結(jié):第五十六頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五RNAprimedDNAreplication第五十七頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五RemovalofRNAprimersandfillingofgaps第五十八頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五復(fù)制叉如何誕生?有機(jī)體選擇RNA作為引物的可能原因
最終避免由于最初幾個(gè)核苷酸的復(fù)制錯(cuò)誤導(dǎo)致的致死突變!!第五十九頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五后隨鏈上所包含的事件?
三、后隨鏈的合成及前體片段的連接第六十頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五
引發(fā)體(包括引發(fā)酶)pppRNA引物DNApolymeraseIIIpppDNApolymeraseIDNApolymeraseIDNAligase第六十一頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五第五節(jié)原核生物DNA復(fù)制
(DNAreplicationinProkaryote)
第六十二頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五
一、DNA復(fù)制機(jī)構(gòu)的研究
利用突變表型來(lái)考察基因的功能
但只能利用條件型突變溫度敏感突變體
材料:E.coli或噬菌體第六十三頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五第六十四頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五第六十五頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五
二、DNA復(fù)制的起始
起始方式:
a、從頭起始(denovoinitiation):
θ復(fù)制、D環(huán)復(fù)制、線(xiàn)狀DNA的復(fù)制
b、共價(jià)延伸(covalentextesion)
滾環(huán)復(fù)制第六十六頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五(1)OriCinE.colichromosomalDNA
1、oriC與E.coli復(fù)制的起始(從頭起始)?四個(gè)9bp的重復(fù)序列
dnaA結(jié)合位點(diǎn)?三個(gè)13bp的重復(fù)序列第六十七頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五(2)簡(jiǎn)單起始過(guò)程a、涉及主要酶系:
DnaA(復(fù)制起始)、RNApol是必不可少的,此外涉及到DnaB(解旋酶)、DnaC(引發(fā)體組分)、Hu蛋白、
Gyrase、SSB、DnaG(引物酶)、Top?和DNApolШ全酶第六十八頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五b、簡(jiǎn)單步驟:
*轉(zhuǎn)錄激活*DnaA識(shí)別并結(jié)合復(fù)制起點(diǎn),DnaB-DnaC六聚體與oriC形成預(yù)引發(fā)體
*
DnaG加入形成引發(fā)體(oriC引發(fā)體),合成引物RNA*引物合成后,DNApol組裝到引發(fā)的RNA上,完成復(fù)制體的組裝第六十九頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五DnaASSB13bprepeats涉及轉(zhuǎn)錄激活第七十頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五(3)E.coli細(xì)胞加倍時(shí)間與復(fù)制起始加倍時(shí)間37℃<20min~10h復(fù)制時(shí)間:40min左右(850核苷酸/秒)分裂過(guò)程中其它事件約需20min(組分、隔膜)因此--加倍時(shí)間少于60min的細(xì)胞兩輪復(fù)制有共用時(shí)間第七十一頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五2、共價(jià)延伸方式(covalenceelongation)
ФX174的若干正鏈的合成起始--滾環(huán)復(fù)制過(guò)程第七十二頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五第七十三頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五
三、延伸過(guò)程
進(jìn)入的標(biāo)志:DNApolШ把第一個(gè)核苷酸加到引物的3’-OH端
(一)后隨鏈合成的起始(前體片段的起始)后隨鏈的第一個(gè)岡崎片段起始于先導(dǎo)鏈進(jìn)入延伸之后
Φx174phage后隨鏈的起始(負(fù)鏈合成、不連續(xù)合成)P117頁(yè)
第七十四頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五
Φx型引發(fā)體的組裝以PriA識(shí)別引發(fā)體組裝位點(diǎn)(primosomeassemblysitepas)開(kāi)始,首先形成預(yù)引發(fā)體預(yù)引發(fā)體與引物酶結(jié)合形成了引發(fā)體Φx型引發(fā)體或其部分組分可沿單鏈
DNA移動(dòng)到每一個(gè)岡崎片段的起點(diǎn)PriA提供引發(fā)體移動(dòng)的動(dòng)力第七十五頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五
位于復(fù)制叉處的多酶復(fù)合體(引發(fā)體)必須快速?gòu)囊粋€(gè)岡崎片段移到另一岡崎片段InlaggingStrand上多酶系統(tǒng)必須完成多次反復(fù)的啟動(dòng)與擴(kuò)展
E.coli
啟動(dòng)2000—4000次的岡崎片段復(fù)制第七十六頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五
(二)Φx174DNA的復(fù)制
a、SS→RF,
即以(+)鏈為模板(-)鏈的合成
Φx型引發(fā)體起始后,由DNApolⅢ、Ⅰ和連接酶等協(xié)同合成(后隨鏈的起始過(guò)程)b、多拷貝RF的合成(滾環(huán)復(fù)制)
(先導(dǎo)鏈的合成過(guò)程、后隨鏈合成)c、后代單鏈(SS)DNA的合成,即以RF的(-)鏈為模板,合成(+)鏈,先導(dǎo)鏈的合成(DNA復(fù)制過(guò)程是上一過(guò)程的一部分)第七十七頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五第七十八頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五
A蛋白(gpA):
?
Φx174基因A的產(chǎn)物
?結(jié)合到RFⅠDNA的復(fù)制原點(diǎn)的結(jié)合位點(diǎn)(引發(fā)體的幫助)
?誘導(dǎo)相鄰的識(shí)別位點(diǎn)的熔解(富含A/T)?其核酸內(nèi)切酶活力切割(+)鏈的4305與4306堿基的酯鍵,并共價(jià)連接于5’端(A),另一端為自由的
3’-OH(G)Rep蛋白--解旋酶
第七十九頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五第八十頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五復(fù)制體第八十一頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五復(fù)制叉處的復(fù)制體
(三)前導(dǎo)鏈和后隨鏈的協(xié)同合成聚合酶Ш全酶前導(dǎo)鏈后隨鏈螺旋酶引發(fā)體引物引發(fā)酶活性中心一活性中心二PriA清除SSB提供引發(fā)體移動(dòng)動(dòng)力極性3‘→5’第八十二頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五一分子的DNApolIII.協(xié)同合成前導(dǎo)鏈和后隨鏈第八十三頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五
四、復(fù)制終止
1、環(huán)形DNA復(fù)制的終止
a、終止序列
E.coli有兩個(gè)終止區(qū)域,分別結(jié)合專(zhuān)一性的終止蛋白
序列一:terEterDterA
序列二:terFterBterC
每個(gè)區(qū)域只對(duì)一個(gè)方向的復(fù)制叉起作用第八十四頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五第八十五頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五
b、專(zhuān)一性終止蛋白
E.coli中由tusgene
編碼
(terminusutilizationsubstance)
通過(guò)抑制DNA解旋酶而發(fā)揮終止作用每次復(fù)制時(shí)只使用一個(gè)終止位點(diǎn)ter第八十六頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五第八十七頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五2、細(xì)菌(E.coli)DNA每個(gè)細(xì)胞周期只復(fù)制一次第八十八頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五
3、線(xiàn)性DNA的末端復(fù)制的問(wèn)題第八十九頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五?環(huán)狀DNA復(fù)制是否存在這樣的問(wèn)題,為什么?第九十頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五(1)線(xiàn)狀DNA的復(fù)制5’末端短縮的解決模式
a、從開(kāi)始就采取環(huán)化的形式---λ噬菌體
b、象T7噬菌體一樣采取連環(huán)分子的形式
利用自身線(xiàn)性DNA末端的重復(fù)序列--通過(guò)末端互補(bǔ)形成連環(huán)分子
c、最直接的辦法---引入蛋白質(zhì)直接從末端起始復(fù)制如---腺病毒-2、phageΦ29、脊髓灰質(zhì)炎病毒
d、痘病病毒的末端由發(fā)夾結(jié)構(gòu)連接
復(fù)制完成后錯(cuò)切連接第九十一頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五??二聚體3‘-OHATCGTAGCATCGTAGC3‘-OHT7噬菌體的末端復(fù)制專(zhuān)一性核酸內(nèi)切酶第九十二頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五
腺病毒(Adnovirus-2)DNA的復(fù)制
35937bp
TP
C
G
IR103-162
IR;包括50bp的復(fù)制原點(diǎn)、富含A/T、有一個(gè)高度保守的G/C對(duì)pTP;末端蛋白的前體
80kd→
TP55kdSSB;單鏈DNA結(jié)合蛋白
72kdAd2DNApolymerase;
140kd
第九十三頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五復(fù)制起始復(fù)合體引發(fā)復(fù)制(不需引物)
避免5’-endshortentpTp-Ser-dCMP
CG●過(guò)程
SSB+ATPDNA末端解鏈
TPpTP-Ser+
dCTP
pTP-Ser-dCMP
3‘OH第九十四頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五腺病毒DNA復(fù)制起始G第九十五頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五IRIR長(zhǎng)的發(fā)夾結(jié)構(gòu)
痘病病毒末端復(fù)制的解決方式----P122第九十六頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五
五、復(fù)制忠實(shí)性的保證
1、DNApol的3’5’外切酶活性
(exonucleaseactivity)
2、DNApol只能從引物的3’
端延伸DNA
(需要RNA引物)
a、堿基配對(duì)協(xié)同性導(dǎo)致最初幾個(gè)堿基錯(cuò)配率高,且不易校正
b、RNA引物最終被降解而避免錯(cuò)誤
3、后隨鏈的不連續(xù)合成因其有利于錯(cuò)配堿基的校正第九十七頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五
3.6.真核生物DNA的復(fù)制(DNAreplicationinEukaryote)
第九十八頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五
1、復(fù)制概況
a、多個(gè)復(fù)制元(multiplereplicon
),雙向復(fù)制
b、復(fù)制元相對(duì)較小(13-900kb),
復(fù)制速度較慢,大約
500~5000bp/min
(3000bp/min)
岡崎片段100~200NTc、復(fù)制終止通過(guò)復(fù)制叉的相遇而終止第九十九頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五multiplereplicon
例;果蠅5000replicons平均40Kb(酵母)哺乳動(dòng)物平均100Kb第一百頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五
2、真核生物的DNA聚合酶
α、β、δ、ε、γ五種
位置核內(nèi)核內(nèi)核內(nèi)核內(nèi)線(xiàn)粒體
合成
與引發(fā)修復(fù)合成合成,修復(fù)復(fù)制功能酶結(jié)合前導(dǎo)鏈
后隨鏈3’-5’校NONOYesYesYes正活性
α
β
δ
ε
γ第一百零一頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五
真核生物DNA復(fù)制的引發(fā)酶●DNApolα+primase形成緊密的復(fù)合物
6-9NtRNAasprimer
●引發(fā)酶(primase):50-60kd
●作用方式為陣發(fā)性的,每次作用拷貝6~15個(gè)核苷酸
●既能利用rNTP,又能利用dNTP
●SV40體外DNA復(fù)制情況分析
第一百零二頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五
ε
δ第一百零三頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五
3、真核生物的復(fù)制起始受許可因子的控制4、逆轉(zhuǎn)錄酶自學(xué)(P127)第一百零四頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五
5、真核生物染色體DNA末端補(bǔ)齊模式
(1)端粒DNA(Telomer)
TTGGGG(T2G4)序列高度重復(fù)的末端
5’TTGGGGTTGGGGTTGGGGTTGGGG3’(富含G鏈)
3’AACCCC
AACCCCAACCCC5’(富含C鏈)
第一百零五頁(yè),共一百一十三頁(yè),編輯于2023年,星期五(2)端粒酶(
Telomerase)1985.CarolGreider&Blackburn,1986.Gottchling四膜蟲(chóng)端粒酶
(telomerase)將T2G4
末端重復(fù)延伸游撲蟲(chóng)
Telomerase=RNACAAAACCCC
鏈+
末端結(jié)合蛋白(TBP)端粒酶---逆轉(zhuǎn)錄酶a、核蛋白(ribonucleoproteinRNP)b、含
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