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第八章基因表達(dá)與調(diào)控第一頁(yè),共二十八頁(yè),編輯于2023年,星期一第一節(jié)調(diào)控元件
第二頁(yè),共二十八頁(yè),編輯于2023年,星期一§1、啟動(dòng)子
核心酶δ
因子全酶啟動(dòng)子(promoter):位于基因轉(zhuǎn)錄起點(diǎn)上游、負(fù)責(zé)啟動(dòng)基因轉(zhuǎn)錄的DNA序列叫啟動(dòng)子。第三頁(yè),共二十八頁(yè),編輯于2023年,星期一
Promoterregionincluding
-35site:
RNApol.recognitionsite(Rsite)TTGAC(SextamaBox)looselybindingsite-10site:TATAAT(TATABox)firmlybindingsite(Bsite)起始位點(diǎn):
+1RNAtranscriptionalstartPoint(Isite)
A/G-35
(R)-10
(B)+1
(I)mRNA精確轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)距起始位點(diǎn)9bpδ因子結(jié)合區(qū)精確起始轉(zhuǎn)錄第四頁(yè),共二十八頁(yè),編輯于2023年,星期一終止子(terminator):位于基因轉(zhuǎn)錄結(jié)束位置上的DNA序列叫終止子。第五頁(yè),共二十八頁(yè),編輯于2023年,星期一§2、增強(qiáng)子和弱化子
增強(qiáng)子(enhance):指增加同它連鎖的基因轉(zhuǎn)錄頻率的DNA序列所謂強(qiáng)子就是遠(yuǎn)離轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)、決定基因的時(shí)間、空間特異性表達(dá)、增強(qiáng)啟動(dòng)子轉(zhuǎn)錄活性的DNA序列;其發(fā)揮作用的方式通常與方向、距離無(wú)關(guān),可位于轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)的上游或下游;從功能上講,增加轉(zhuǎn)錄效率10?200倍,沒(méi)有增強(qiáng)子存在,啟動(dòng)子通常不能表現(xiàn)活性;沒(méi)有啟動(dòng)子時(shí),增強(qiáng)子也無(wú)法發(fā)揮作用。分為組織和細(xì)胞專一性增強(qiáng)子、誘導(dǎo)性增強(qiáng)子兩類。第六頁(yè),共二十八頁(yè),編輯于2023年,星期一
弱化子(attenuator):在操縱區(qū)與結(jié)構(gòu)基因之間的一段可以終止轉(zhuǎn)錄作用的核苷酸序列。缺失突變?cè)黾愚D(zhuǎn)錄效率6倍第七頁(yè),共二十八頁(yè),編輯于2023年,星期一§3、絕緣子絕緣子(insulator):通常位于啟動(dòng)子同正調(diào)控元件(增強(qiáng)子)或負(fù)調(diào)控因子(為異染色質(zhì))之間的一種調(diào)控序列。絕緣子就是一類邊界序列,本身對(duì)基因的表達(dá)既沒(méi)有正效應(yīng)也沒(méi)有負(fù)效應(yīng),其作用只是阻止鄰近的調(diào)控元件對(duì)其所界定的基因的啟動(dòng)子起增強(qiáng)或抑制作用,不讓其他調(diào)控元件對(duì)基因的活化效應(yīng)或失活效應(yīng)發(fā)生作用。第八頁(yè),共二十八頁(yè),編輯于2023年,星期一§4、沉默子沉默子(silencer):
能夠?qū)蜣D(zhuǎn)錄起阻遏作用的DNA片段,屬于負(fù)性調(diào)控元件。最早在酵母中發(fā)現(xiàn),以后在T淋巴細(xì)胞的T抗原受體基因的轉(zhuǎn)錄和重排中證實(shí)這種負(fù)調(diào)控順式元件的存在。目前對(duì)這種在基因轉(zhuǎn)錄降低或關(guān)閉中起作用的序列研究還不多,但從已有的例子看到:沉寂子的作用可不受序列方向的影響,也能遠(yuǎn)距離發(fā)揮作用,并可對(duì)異源基因的表達(dá)起作用。第九頁(yè),共二十八頁(yè),編輯于2023年,星期一§5、應(yīng)答元件
應(yīng)答元件:現(xiàn)代分子生物學(xué)上把能與某個(gè)(類)專一蛋白因子結(jié)合,從而控制基因特異表達(dá)的DNA上游序列稱為應(yīng)答元件(responseelement)。它們與細(xì)胞內(nèi)高度專一的轉(zhuǎn)錄因子相互作用,協(xié)調(diào)相關(guān)基因的轉(zhuǎn)錄。最常見的應(yīng)答元件有:
熱激應(yīng)答元件(heatshockresponseelement,HSE),
糖皮質(zhì)應(yīng)答元件(glucocorticoidresponseelement,GRE),
金屬應(yīng)答元件(metalresponseelement,MRE)第十頁(yè),共二十八頁(yè),編輯于2023年,星期一受熱后,果蠅細(xì)胞內(nèi)Hsp70mRNA水平提高1000倍,就是因?yàn)闊峒ひ蜃樱╤eatshockfactor,HSF)與hsp70基因TATA區(qū)上游60bp處的HSE相結(jié)合,激發(fā)轉(zhuǎn)錄起始。合成一系列熱激蛋白(分子伴侶),恢復(fù)維持蛋白質(zhì)原有的三維構(gòu)象,保持其正常功能。熱激應(yīng)答元件生物處在最適溫度范圍以上時(shí),受到熱的誘導(dǎo),就會(huì)使許多熱激基因轉(zhuǎn)錄,合成一系列熱激蛋白。熱激蛋白是一種分子陪伴,可以使因溫度升高而構(gòu)型發(fā)生改變的蛋白質(zhì)恢復(fù)成維持原有的三維構(gòu)象,不致喪失功能而使機(jī)體得以存活。隨著熱激溫度消失,細(xì)胞內(nèi)出現(xiàn)大量游離的Hsp70蛋白,它們與HSF相結(jié)合,并使其脫離DNA序列,最終形成沒(méi)有DNA結(jié)合能力的單體。
第十一頁(yè),共二十八頁(yè),編輯于2023年,星期一§6、轉(zhuǎn)錄因子轉(zhuǎn)錄因子(transcriptionfactor):是起正調(diào)控作用的反式作用因子,是由基因編碼的一類蛋白質(zhì)。是轉(zhuǎn)錄起始中RNA聚合酶所需的輔助因子。第十二頁(yè),共二十八頁(yè),編輯于2023年,星期一1、“鋅指“DNA結(jié)合基序鋅指基因:其蛋白產(chǎn)物主要通過(guò)與DNA相互作用而起轉(zhuǎn)錄因子作用,調(diào)節(jié)靶基因的表達(dá)以適應(yīng)生物體發(fā)育、分化、成熟過(guò)程的需要。C2H2型(C半光氨酸、H組氨酸)第十三頁(yè),共二十八頁(yè),編輯于2023年,星期一2、其他轉(zhuǎn)錄因子同源域激活真核生物基因轉(zhuǎn)錄的一系列蛋白質(zhì)。
同源框基因編碼的蛋白質(zhì)是一類轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子,都具有由相應(yīng)同源框序列編碼的60個(gè)氨基酸組成的結(jié)構(gòu)域,即同源域(homeodomain),通過(guò)其與特異的DNA序列結(jié)合,調(diào)控下游基因的轉(zhuǎn)錄活性。同源框基因又稱同源異型盒基因(homeoboxgenes)是一類調(diào)節(jié)細(xì)胞正常分化、發(fā)育的主控基因。同源框基因的共同點(diǎn)是都具有180個(gè)核苷酸長(zhǎng)度的同源區(qū),即同源框(homeobox)。(1)亮氨酸拉鏈(2)螺旋-轉(zhuǎn)角-螺旋(3)螺旋-環(huán)-螺旋(4)同源域第十四頁(yè),共二十八頁(yè),編輯于2023年,星期一§1、轉(zhuǎn)錄調(diào)控類型(1)轉(zhuǎn)錄酶原核生物:RNApol全酶真核生物:RNApolIRNApolIIRNApolIIImRNA、tRNA、rRNArRNAmRNAtRNA第二節(jié)轉(zhuǎn)錄水平上的調(diào)控第十五頁(yè),共二十八頁(yè),編輯于2023年,星期一Promoterregionincluding
-35site:
RNApol.recognitionsite(Rsite)TTGAC(SextamaBox)-35siteRNApol.looselybindingsite-10site:TATAAT(pribnowBox)
-10siteRNApol.firmlybindingsite(Bsite)起始位點(diǎn):
+1RNAtranscriptionalstartpoint(Isite)
A/G-35
(R)-10
(B)+1
(I)mRNACCAAT
(CAAT盒)-80site:
CTF、CPTFIID、A、BTBP-80第十六頁(yè),共二十八頁(yè),編輯于2023年,星期一T4inE.coliandSPO1inB.SubtilisEarlygenemiddlegeneslategenes
hostδ
phageδ28
phageδ-late
RNApol全酶δ因子第十七頁(yè),共二十八頁(yè),編輯于2023年,星期一TFIIIBallowsRNApolIIItobindandinitiatetranscription
tRNA
RNApolIII
+1TFIIIB第十八頁(yè),共二十八頁(yè),編輯于2023年,星期一(2)調(diào)控元件的作用終止:RNA轉(zhuǎn)錄停止在終止信號(hào)上,RNA釋放。終止子結(jié)構(gòu)特征:基因3‘端的具有反向重復(fù)特殊序列,具有終止轉(zhuǎn)錄的作用。Rho因子:在轉(zhuǎn)錄中起到終止轉(zhuǎn)錄的作用的輔助蛋白。依賴Rho因子的終止子是弱終止子,不依賴Rho因子的終止子是強(qiáng)終止子。第十九頁(yè),共二十八頁(yè),編輯于2023年,星期一§2、轉(zhuǎn)錄后的調(diào)控(1)原核生物:毋需加工第二十頁(yè),共二十八頁(yè),編輯于2023年,星期一加帽:5‘甲基化G加尾:3’加多聚A甲基化RNA選擇性剪接RNA編輯(移碼)(2)真核生物:第二十一頁(yè),共二十八頁(yè),編輯于2023年,星期一第三節(jié)翻譯水平上的調(diào)控第二十二頁(yè),共二十八頁(yè),編輯于2023年,星期一§1、翻譯因子磷酸化調(diào)控蛋白質(zhì)可逆磷酸化的調(diào)節(jié)在信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)過(guò)程中有重要作用,是細(xì)胞生命活動(dòng)的調(diào)控中心。蛋白質(zhì)的磷酸化則是指由蛋白激酶催化的把ATP或GTPγ位的磷酸基傳移到底物蛋白質(zhì)氨基酸殘基上的過(guò)程,其逆轉(zhuǎn)過(guò)程是由蛋白磷酸酶催化的,稱為蛋白質(zhì)的脫磷酸化.第二十三頁(yè),共二十八頁(yè),編輯于2023年,星期一第二十四頁(yè),共二十八頁(yè),編輯于2023年,星期一§2、翻譯后的加工修飾(1)多肽的切割加工:
例如:脊椎動(dòng)物的胰島素加工過(guò)程:最初前胰島素原有105個(gè)氨基酸,加工中先將N端的24個(gè)氨基酸殘基切除,形成前體胰島素然后切除中間一段氨基酸序列,留下21個(gè)氨基酸殘基的A鏈和30個(gè)氨基酸殘基的B鏈由二硫鍵連接兩條肽鏈。第二十五頁(yè),共二十八頁(yè),編輯于2023年,星期一(2)多肽的化學(xué)修飾:b)蛋白質(zhì)的糖基化:蛋白質(zhì)的糖基化(glycosylation):一些大分子量碳水化合物加到多肽鏈上。糖分子連接在絲氨酸或蘇氨酸的羥基上,形成O-連糖基化(O-linkedglycosylation);與天門冬氨酸的氨基相連則形成N-連糖基化(N-linkedglycosylation)。a)蛋白質(zhì)的磷酸化:
提高或降低酶活性。第二十六頁(yè),共二十八頁(yè),編輯于2023年,星期一蛋白質(zhì)內(nèi)含子:同mRNA一樣,一些前體蛋白質(zhì)具有內(nèi)含子(intein)序列,位于多肽序列的中間經(jīng)加工切除后,兩端的蛋白質(zhì)外顯子(extein)連接為成熟蛋白質(zhì)分子。特點(diǎn):①
切割位點(diǎn)保守:②具有自動(dòng)切割加工能力:(3)多聚蛋白質(zhì)切割:第二十七頁(yè),共二
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