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第二章蛋白質(zhì)氨基酸(aminoacid)結(jié)構(gòu)、分類(lèi)、性質(zhì)肽(peptide)的概念蛋白質(zhì)(protein)結(jié)構(gòu)、性質(zhì)及結(jié)構(gòu)-功能關(guān)系
蛋白質(zhì)平均含N量為16%,這是凱氏定氮法測(cè)蛋白質(zhì)含量的理論依據(jù):
蛋白質(zhì)含量=蛋白質(zhì)含N量×6.25第一節(jié)蛋白質(zhì)的重要功能及元素組成一、蛋白質(zhì)主要元素組成
主要元素:
C、H、O、N、S碳-C:50%~55%,平均52%;氫-H:6.9%~7.7%,平均7%;
氧-O:21%~24%,平均23%;氮-N:15%~17.6%,平均16%;
硫-S:0.3%~2.3%,平均2%。微量元素:P、Fe、Cu、Zn、Mo、I、Se等。
二、蛋白質(zhì)的主要生理功能
蛋白質(zhì)(protein)——生物大分子
參與幾乎所有的生命活動(dòng)和生命過(guò)程,是生物體生命活動(dòng)的體現(xiàn)者與執(zhí)行者。
主要功能:(一)生物體的結(jié)構(gòu)組成分(二)催化功能(酶)(三)運(yùn)輸功能(血紅蛋白-O2)(四)儲(chǔ)藏功能(肌紅蛋白-O2
,鐵蛋白-Fe)(五)運(yùn)動(dòng)功能(肌肉收縮)(六)防御功能(免疫蛋白)(七)調(diào)節(jié)功能(激素:胰島素,生長(zhǎng)激素)(八)信息功能(接受與傳遞信息)(九)基因表達(dá)調(diào)控(操縱子-阻遏蛋白)第二節(jié)氨基酸(aminoacid,AA)一、結(jié)構(gòu)特點(diǎn)及通式二、20種AA分類(lèi)、結(jié)構(gòu)及三字符號(hào)三、必需氨基酸、稀有的氨基酸和
非蛋白質(zhì)氨基酸四、性質(zhì)五、生產(chǎn)和應(yīng)用一、-氨基酸的通式及結(jié)構(gòu)特點(diǎn)
氨基酸的C上:-COOH-NH2-H-R二、依據(jù)R-基團(tuán)的極性分類(lèi)
20種AA可分為4類(lèi):非極性極性不帶電荷(中性氨基酸)帶負(fù)電荷(酸性AA)帶正電荷(堿性AA)R-基團(tuán)非極性R基團(tuán)氨基酸(8種)(亞氨酸)FW極性不帶電荷R基團(tuán)氨基酸(7種)NQY極性帶電荷R基團(tuán)氨基酸(3+2)DREK三、必需氨基酸、稀有氨基酸和非蛋白氨基酸(一)必需氨基酸:(essentialaminoacids,EAA):人體和動(dòng)物通過(guò)自身代謝可以合成大部分氨基酸,但有一部分氨基酸自身不能合成,必須由外界食物供給,這些氨基酸稱(chēng)為必需氨基酸。人體所需的必需氨基酸有8種:
L-苯丙氨酸、L-色氨酸、L-亮氨酸、L-異亮氨酸、
L-賴(lài)氨酸、L-甲硫氨酸、L-纈氨酸、
L-蘇氨酸。完全蛋白質(zhì)(含有全部EAA的Protein)限量AA(Protein中含量低于標(biāo)準(zhǔn)水平的EAA)(二)蛋白質(zhì)的稀有氨基酸(rareAA)特點(diǎn):在遺傳上,沒(méi)有密碼子,是蛋白質(zhì)合成后由化學(xué)修飾形成的
是正常氨基酸的衍生物:如彈性蛋白和膠原蛋白中的4-羥基脯氨酸;肌球蛋白和組蛋白中含有6-N-甲基賴(lài)氨酸;凝血酶原中存在γ-羧基谷氨酸等。(凝血酶原)(酪蛋白)(哺乳動(dòng)物肌肉中)(三)非蛋白氨基酸(nonproteinAA)
非蛋白質(zhì)氨基酸:生物體內(nèi)呈游離或結(jié)合態(tài)的氨基酸。這些氨基酸雖然不參與蛋白質(zhì)組成,但在生物體中往往具有一定的生理功能。
四、二十種氨基酸的分類(lèi)、結(jié)構(gòu)及三字符號(hào)
據(jù)營(yíng)養(yǎng)學(xué)分類(lèi)
必需AA非必需AA據(jù)R基團(tuán)化學(xué)結(jié)構(gòu)分類(lèi)
脂肪族AA(中性、含羥基或巰基、酸性、堿性)芳香族AA(Phe、Tyr、Trp)雜環(huán)AA(His、Pro)據(jù)R基團(tuán)極性分類(lèi)極性R基團(tuán)AA非極性R基團(tuán)AA(8種)不帶電荷(7種)帶電荷:正電荷(3種)負(fù)電荷(2種)據(jù)氨基、羧基數(shù)(酸堿性)分類(lèi)一氨基一羧基:中性AA一氨基二羧基:酸性AA(Glu、Asp)二氨基一羧基:堿性AA(Lys、His、Arg)
人的必需氨基酸LysTrpPheValMetLeuIleThr
Arg、His五、氨基酸的性質(zhì)
(一)光學(xué)性質(zhì)(二)兩性解離和等電點(diǎn)(三)重要化學(xué)反應(yīng)
1.茚三酮反應(yīng)
2.桑格爾(sanger)反應(yīng)
3.艾德曼(Edman)反應(yīng)(一)AA光學(xué)性質(zhì)1.旋光性:除甘氨酸外,天然α-AA因不對(duì)稱(chēng)C*原子具旋光性;2.L-構(gòu)型:L-構(gòu)型,D-構(gòu)型;3.紫外吸收性:最大光吸收(max)α-AA的-R基團(tuán)中色氨酸(Trp)
279nm含苯環(huán)共軛雙鍵酪氨酸(Tyr)
275nm
苯丙氨酸(Phe)
259nm多數(shù)Pr.含有Trp、Tyr
、
Phe
殘基(特加是酪氨酸Tyr),因此蛋白質(zhì)含量測(cè)定——可用紫外分光光度法。TrpTyrPhe的紫
外
吸
收
光
譜
摩爾吸收系數(shù)波長(zhǎng)(279nm)(275nm)(259nm)(二)AA酸堿兩性解離及等電點(diǎn)
pH=pI
凈電荷=0
pH<pI凈電荷為正pH>pI凈電荷為負(fù)CHRCOOHNH3+CHRCOONH2CHRCOONH3++H++
OH-+H++
OH-(pK′1)(pK′2)
當(dāng)氨基酸溶液在某一定pH值時(shí),使某特定氨基酸分子上所帶正負(fù)電荷相等,成為兩性離子(dipolarion),在電場(chǎng)中既不向陽(yáng)極也不向陰極移動(dòng),此時(shí)溶液的pH值即為該氨基酸的等電點(diǎn)(isoelectricpoint,pI)。
思考問(wèn)題:沉淀氨基酸原理?電泳、離子交換分離制備氨基酸的理論依據(jù)?
氨基酸等電點(diǎn)的計(jì)算
可見(jiàn),氨基酸的pI值等于該氨基酸的兩性離子狀態(tài)兩側(cè)的基團(tuán)pK′值之和的二分之一。而pK是某種解離基團(tuán)有一半解離時(shí)的pH。pI=2pK′1+pK′2一氨基一羧基AA的等電點(diǎn)計(jì)算:pI=2pK′2+pK′R二氨基一羧基AA的等電點(diǎn)計(jì)算:pI=2pK′1+pK′R一氨基二羧基AA的等電點(diǎn)計(jì)算:(三)AA化學(xué)反應(yīng)
1.茚三酮反應(yīng):+3H20水合茚三酮(無(wú)色)NH3CO2RCHO+還原性茚三酮紫色化合物(570nm).proline-yellow(弱酸)加熱水合茚三酮+2NH3+還原性茚三酮反應(yīng)試劑、條件、產(chǎn)物、應(yīng)用(定量、定性——薄層層析分離、鑒定)2.sanger反應(yīng)(測(cè)-NH2末端的AA種類(lèi))
AA與2,4-二硝基氟苯(DNFB)反應(yīng)DNFB(dinitrofluorobenzene)DNP-AA(黃色)++HF弱鹼中氨基酸反應(yīng)試劑、條件、產(chǎn)物、應(yīng)用3.Edman反應(yīng)(蛋白質(zhì)的AA序列測(cè)定)
AA與苯異硫氰酯(PITC)反應(yīng)PITC(phenylisothiocyanate)+苯乙內(nèi)酰硫脲衍生物(PTH-AA)(phenylisothiohydantoin-AA)弱鹼中(400
C)(硝基甲烷400
C)H+苯氨基硫甲酰氨基酸(PTC-AA)(phenylthiocarbanmoyl-AA)反應(yīng)試劑、條件、產(chǎn)物、應(yīng)用氨基酸分離層析法:(利用AA性質(zhì)差異)(1)溶解度:分配柱層析,紙層析,薄層層析(2)帶電荷:電泳,離子交換層析柱層析系統(tǒng)紙層析薄層層析第三節(jié)肽
一、肽和肽鍵的形成及命名肽單位肽鍵肽平面肽單位及命名二、肽單位-肽平面-肽鍵性質(zhì)(1)肽鍵具有部分雙鍵性質(zhì):
N-C:0.149nm N=C:0.127nm
肽鍵:0.132nm(2)肽平面為剛性平面(肽鍵的四個(gè)原子與相鄰的α-C原子共處一個(gè)平面)
N-H(3)在N-C上的成反式排列
C=O
酰胺平面與α-碳原子的二面角(φ和ψ)
二面角
兩相鄰酰胺平面之間,能以共同的Cα為定點(diǎn)而旋轉(zhuǎn),繞Cα-N鍵旋轉(zhuǎn)的角度稱(chēng)φ角,繞C-Cα鍵旋轉(zhuǎn)的角度稱(chēng)ψ角。φ和ψ稱(chēng)作二面角,亦稱(chēng)構(gòu)象角。多肽主鏈折疊的空間限制和
維持蛋白質(zhì)構(gòu)象的作用力三、肽功能
1.
-天冬氨酰-苯丙氨酸甲酯
(Aspartame,阿斯巴甜)CH2NH2
CHC
NH
CHCOOCH2COOHOCH3谷胱甘肽
谷胱甘肽在體內(nèi)參與氧化還原過(guò)程,作為某些氧化還原酶的輔因子,或保護(hù)巰基酶,或防止過(guò)氧化物積累。2.谷胱甘肽經(jīng)常不斷地學(xué)習(xí),你就什么都知道。你知道得
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