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文檔簡介
課題2土壤中分解尿素的細(xì)菌的分離與計(jì)數(shù)課題背景尿素的利用尿素是一種重要的農(nóng)業(yè)氮肥。但尿素不能直接被農(nóng)作物吸收。只有當(dāng)土壤中的細(xì)菌將尿素分解成氨后才能被植物利用。細(xì)菌能利用尿素的原因土壤中的細(xì)菌之所以能分解尿素是因?yàn)樗鼈兡芎铣呻迕窩O(NH2)2脲酶+H2O+CO22NH3NH3不能直接吸收,植物吸收其中的N是以NH4和NO3-形式吸收的。NH3的水溶性高,在水中形成NH4;土壤里的微生物如硝化細(xì)菌把NH3氧化為NO3-,然后以NO3-的形式被植物吸收。常見的分解尿素的微生物芽孢桿菌、小球菌、假單胞桿菌、克氏桿菌、棒狀桿菌、梭狀芽孢桿菌,某些真菌和放線菌也能分解尿素。課題目的①從土壤中分離出能夠分解尿素的細(xì)菌②統(tǒng)計(jì)每克土壤樣品中究竟含有多少這樣的細(xì)菌研究思路(一)篩選菌株(二)統(tǒng)計(jì)菌落數(shù)目(三)設(shè)置對照課題背景啟示:尋找目的菌種時(shí)要根據(jù)它對生存環(huán)境的要求,到相應(yīng)的環(huán)境中去尋找。PCR技術(shù)是一種常用的DNA擴(kuò)增技術(shù),此項(xiàng)技術(shù)的自動(dòng)化,需要使用耐高溫的DNA聚合酶,如果請你來找這種耐高溫的酶,你會(huì)去哪里找?熱泉70-80攝氏度的高溫條件淘汰了絕大多數(shù)微生物,而耐熱的Taq細(xì)菌脫穎而出。水生耐熱細(xì)菌Taq(一)篩選菌株4一、研究思路1、實(shí)驗(yàn)室微生物的篩選原理人為提供有利于目的菌株生長的條件(包括營養(yǎng)、溫度、pH等),同時(shí)抑制或阻止其他微生物生長。(一)篩選菌株2、選擇培養(yǎng)基在微生物學(xué)中,將允許特定種類的微生物生長,同時(shí)抑制或阻止其他種類微生物生長的培養(yǎng)基,稱做選擇培養(yǎng)基。加入青霉素的培養(yǎng)基——細(xì)菌不生長,酵母菌、霉菌等真菌能生長5一、研究思路(1)在培養(yǎng)基的配方中,為微生物的生長提供碳源和氮源的分別是是什么物質(zhì)?碳源是葡萄糖和尿素,氮源是尿素(2)分析該配方的培養(yǎng)基對微生物是否具有選擇作用?如果有,又是如何進(jìn)行選擇的?有篩選作用。尿素是培養(yǎng)基中的唯一氮源,因此,原則上只有能夠利用尿素的微生物才能夠生長。3、分離尿素分解菌的選擇培養(yǎng)基(一)篩選菌株6一、研究思路1mm(二)統(tǒng)計(jì)菌落數(shù)目1、顯微鏡直接計(jì)數(shù)法①不能區(qū)分死菌與活菌;②不適于對運(yùn)動(dòng)細(xì)菌的計(jì)數(shù);③個(gè)體小的細(xì)菌在顯微鏡下難以觀察缺點(diǎn)7一、研究思路利用血球計(jì)數(shù)板,在顯微鏡下計(jì)算一定容積里樣品中微生物的數(shù)量。a不能區(qū)分死菌與活菌;b不適于對運(yùn)動(dòng)細(xì)菌的計(jì)數(shù);c需要相對高的細(xì)菌濃度;d個(gè)體小的細(xì)菌在顯微鏡下難以觀察;缺點(diǎn)一、研究思路(二)統(tǒng)計(jì)菌落數(shù)目1、顯微鏡直接計(jì)數(shù)法一、研究思路2、活菌計(jì)數(shù)法——統(tǒng)計(jì)菌落數(shù)目(稀釋涂布平板法)(二)統(tǒng)計(jì)菌落數(shù)目9一、研究思路3稀釋涂布平板法在稀釋度足夠高時(shí),微生物在固體培養(yǎng)基上所形成的一個(gè)菌落是由一個(gè)單細(xì)胞繁殖而成的,即一個(gè)菌落代表原先的一個(gè)單細(xì)胞。原理:恰當(dāng)?shù)南♂尪仁浅晒Φ亟y(tǒng)計(jì)菌落數(shù)目的關(guān)鍵。為了保證結(jié)果準(zhǔn)確,通常將幾個(gè)稀釋度下的菌液都涂布在平板上,培養(yǎng)后再選擇菌落數(shù)在30~300的平板進(jìn)行計(jì)數(shù)。一、研究思路(二)統(tǒng)計(jì)菌落數(shù)目每克樣品中的菌落數(shù)=C÷V×MC代表某一稀釋度下平板上生長的平均菌落數(shù),V代表涂布平板時(shí)所用的稀釋液的體積ml,M代表稀釋倍數(shù)。2稀釋涂布平板法一、研究思路(二)統(tǒng)計(jì)菌落數(shù)目①為了保證結(jié)果準(zhǔn)確,一般選擇菌落數(shù)在30——300的平板上進(jìn)行計(jì)數(shù)。②為使結(jié)果接近真實(shí)值可將同一稀釋度加到三個(gè)或三個(gè)以上的平皿中,經(jīng)涂布,培養(yǎng)計(jì)算出菌落平均數(shù)。③統(tǒng)計(jì)的菌落往往比活菌的實(shí)際數(shù)目低?注意事項(xiàng)當(dāng)兩個(gè)或多個(gè)細(xì)胞連在一起時(shí),平板上觀察到的只是一個(gè)菌落。因此結(jié)果一般用菌落數(shù)而不是活菌數(shù)來表示。一、研究思路排除實(shí)驗(yàn)組中非測試因素對實(shí)驗(yàn)結(jié)果的影響,提高實(shí)驗(yàn)結(jié)果的可信度。二、研究思路設(shè)置對照的主要目的是:在做分解尿素的細(xì)菌的篩選與統(tǒng)計(jì)菌落數(shù)目的實(shí)驗(yàn)時(shí),A同學(xué)從對應(yīng)的106倍稀釋的培養(yǎng)基中篩選出大約150個(gè)菌落,但是其他同學(xué)在同樣的稀釋度下只選擇出大約50個(gè)菌落。分析其原因。原因:⑴土樣不同,⑵培養(yǎng)基污染或操作失誤或者是混入了其他的含氮物質(zhì)實(shí)例:一、研究思路(三)設(shè)置對照小結(jié):通過這個(gè)事例可以看出,實(shí)驗(yàn)結(jié)果要有說服力,對照的設(shè)置是必不可少的。方案一:由其他同學(xué)用與A同學(xué)相同土樣進(jìn)行實(shí)驗(yàn)方案二:將A同學(xué)配制的培養(yǎng)基在不加土樣的情況下進(jìn)行培養(yǎng),作為空白對照,以證明培養(yǎng)基是否受到污染。結(jié)果預(yù)測:如果結(jié)果與A同學(xué)一致,則證明A無誤;如果結(jié)果不同,則證明A同學(xué)存在操作失誤或培養(yǎng)基的配制有問題。一、研究思路(三)設(shè)置對照(一)土壤取樣從肥沃、濕潤的土壤中取樣。先鏟去表層土3cm左右,再取樣,將樣品裝入事先準(zhǔn)備好的信封中。◆取土樣用的小鐵鏟和盛土樣的的信封在使用前都要滅菌。(二)制備培養(yǎng)基:制備以尿素為唯一氮源的選擇培養(yǎng)基。二、實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)
由于初次實(shí)驗(yàn),對于稀釋的范圍沒有把握,因此選擇了一個(gè)較為寬泛的范圍:稀釋倍數(shù)為103~107。
準(zhǔn)備牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基和選擇培養(yǎng)基。每個(gè)稀釋度下需要3個(gè)選擇培養(yǎng)基,1個(gè)牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基(作對照)。還需要8個(gè)滅菌試管和1個(gè)滅菌移液管。
將稀釋相同倍數(shù)的菌液,在牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基上生長的菌落數(shù)目應(yīng)明顯多于選擇培養(yǎng)基上的數(shù)目,因此,牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基可以作為對照,用來判斷選擇培養(yǎng)基是否起到了選擇作用。(三)、樣品的稀釋二、實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)◆應(yīng)在火焰旁稱取土壤10g?!粼谙♂屚寥廊芤旱倪^程中,每一步都要在火焰旁進(jìn)行◆分離不同的微生物采用不同的稀釋度原因:不同微生物在土壤中含量不同目的:保證獲得菌落數(shù)在30~300之間適于計(jì)數(shù)的平板二、實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)(三)、樣品的稀釋注意:實(shí)驗(yàn)時(shí)要對培養(yǎng)皿作好標(biāo)記注明培養(yǎng)基類型、培養(yǎng)時(shí)間、稀釋度、培養(yǎng)物等。如果得到了2個(gè)或2個(gè)以上菌落數(shù)目在30—300的平板,則說明稀釋操作比較成功,并能夠進(jìn)行菌落的計(jì)數(shù),如果同一稀釋倍數(shù)的三個(gè)重復(fù)的菌落數(shù)相差較大表明試驗(yàn)不精確,需要重新實(shí)驗(yàn)。(四)、取樣涂布二、實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)注意事項(xiàng)——實(shí)驗(yàn)時(shí)要對培養(yǎng)皿作好標(biāo)記。注明培養(yǎng)基類型、培養(yǎng)日期、稀釋度等。三、實(shí)驗(yàn)操作注意事項(xiàng)(四)、取樣涂布高濃度→低濃度,換槍頭低濃度→高濃度,可不用換槍頭三、實(shí)驗(yàn)操作注意事項(xiàng)(四)、取樣涂布三、實(shí)驗(yàn)操作注意事項(xiàng)如果得到了2個(gè)或2個(gè)以上菌落數(shù)目在30—300的平板,則說明稀釋操作比較成功,可以對菌落進(jìn)行計(jì)數(shù)。記細(xì)菌:30~37℃;1~2d霉菌:25~28℃;3~4d放線菌:25~28℃;5~7d
1培養(yǎng):2觀察與計(jì)數(shù):一般來說,在一定的培養(yǎng)條件下相同的培養(yǎng)基、溫度及培養(yǎng)時(shí)間,同種微生物表現(xiàn)出穩(wěn)定的菌落特征。記(五)、培養(yǎng)和觀察在菌落計(jì)數(shù)時(shí),每隔24h統(tǒng)計(jì)一次菌落數(shù)目選取菌落數(shù)目穩(wěn)定時(shí)的記錄作為結(jié)果,以防止因培養(yǎng)時(shí)間不足而導(dǎo)致遺漏菌落的數(shù)目。微生物的培養(yǎng)與觀察1、結(jié)合對照,分析培養(yǎng)物中是否有雜菌污染以及選擇培養(yǎng)基是否篩選出一些菌落。2、是否獲得了某一稀釋度下,菌落數(shù)目在30——300的平板。在這稀釋度下,是否至少有兩個(gè)平板的菌落數(shù)相近?3、你統(tǒng)計(jì)的每克土壤中含有能分解尿素的細(xì)菌的菌落數(shù)是多少?與其他同學(xué)的結(jié)果接近嗎?如果差異很大,可能是什么原因引起的?24四、結(jié)果分析與評價(jià)土樣涂布在選擇培養(yǎng)基分解尿素的細(xì)菌菌落鑒別培養(yǎng)基分解尿素的細(xì)菌鑒定分解尿素的菌體能合成脲酶,可將尿素分解為氨。氨會(huì)使培養(yǎng)基的堿性增強(qiáng),PH升高。通過檢測培養(yǎng)基的PH變化來判斷。理解在以尿素為唯一氮源的培養(yǎng)基中加入酚紅指示劑。培養(yǎng)某種細(xì)菌后,如果PH升高,指示劑將變紅,說明該細(xì)菌能夠分解尿素。記五、課題延伸在以尿素為唯一氮源的培養(yǎng)基中加入酚紅指示劑。培養(yǎng)某種細(xì)菌后,如果pH升高,指示劑將變紅,說明該細(xì)菌能夠分解尿素本課題只是對能分解尿素的細(xì)菌進(jìn)行了初步的篩選,只是分離純化菌種的第一步。對分離的菌種作進(jìn)一步的鑒定,要借助生物化學(xué)的方法。CONH22H2OCO22NH3脲酶原理:脲酶催化尿素分解成氨→培養(yǎng)基堿性增強(qiáng)→酚紅變紅五、課題延伸大腸桿菌呈深紫色,中心有或無金屬光澤大腸桿菌在伊紅美藍(lán)瓊脂EMB上典型特征【課堂小結(jié)】一、分離--選擇培養(yǎng)基的:分解尿素細(xì)菌的分離與計(jì)數(shù)尿素作為唯一的氮源。二、鑒定方法:在培養(yǎng)基中加入酚紅指示劑,若指示劑變紅,pH升高,說明細(xì)菌能分解尿素。三、統(tǒng)計(jì)菌落數(shù)目的方法(1)顯微鏡直接計(jì)數(shù)法(2)間接計(jì)數(shù)法(稀釋涂布平板計(jì)數(shù)法)①計(jì)算公式每克樣品中的菌株數(shù)=C÷V×M②操作:設(shè)置重復(fù)組,選擇菌落數(shù)30~300的平板進(jìn)行計(jì)數(shù)。四、設(shè)置對照①證明培養(yǎng)基未被污染---用空白培養(yǎng)基作對照(選擇培養(yǎng)基不接種土壤樣品)。②證明選擇培養(yǎng)基的選擇作用--對照組(牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基接種等量同種菌液)1、下列能選擇出分解尿素細(xì)菌的培養(yǎng)基是AH2PO4、Na2HPO4、、葡萄糖、尿素、瓊脂、水BH2PO4、Na2HPO4、、葡萄糖、瓊脂、水CH2PO4、Na2HPO4、、尿素、瓊脂、水DH2PO4、Na2HPO4、、牛肉膏、蛋白胨、瓊脂、水1、下列能選擇出分解尿素細(xì)菌的培養(yǎng)基是AH2PO4、Na2HPO4、、葡萄糖、尿素、瓊脂、水BH2PO4、Na2HPO4、、葡萄糖、瓊脂、水CH2PO4、Na2HPO4、、尿素、瓊脂、水DH2PO4、Na2HPO4、、牛肉膏、蛋白胨、瓊脂、水A課后練習(xí):2、下列是關(guān)于“檢測土壤中細(xì)菌總數(shù)”實(shí)驗(yàn)操作的敘述,其中錯(cuò)誤的是()A用蒸餾水配制牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基,經(jīng)高溫、高壓滅菌后倒平板B取104、105、,分別涂布于各組平板上C將實(shí)驗(yàn)組和對照組平板倒置,37℃恒溫培養(yǎng)24-48小時(shí)D確定對照組無菌后,選擇菌落數(shù)在300以上的實(shí)驗(yàn)組平板進(jìn)行計(jì)數(shù)D2、下列是關(guān)于“檢測土壤中細(xì)菌總數(shù)”實(shí)驗(yàn)操作的敘述,其中錯(cuò)誤的是()A用蒸餾水配制牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基,經(jīng)高溫、高壓滅菌后倒平板B取104、105、,分別涂布于各組平板上C將實(shí)驗(yàn)組和對照組平板倒置,37℃恒溫培養(yǎng)24-48小時(shí)D確定對照組無菌后,選擇菌落數(shù)在300以上的實(shí)驗(yàn)組平板進(jìn)行計(jì)數(shù)3、用來判斷選擇培養(yǎng)基是否起到了選擇作用需要設(shè)置的對照是A未接種的選擇培養(yǎng)基B未接種的牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基C接種了的選擇培養(yǎng)基D接種了的牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基4、在本課題的實(shí)驗(yàn)中,下列關(guān)于土壤取樣的敘述,錯(cuò)誤的是()A土壤取樣時(shí)應(yīng)選取肥沃、濕潤的土壤左右,再取樣C取樣用的小鐵鏟和信封在使用前不用滅菌D應(yīng)在火焰旁邊稱取土壤DC課后練習(xí):4能夠測定樣品活菌數(shù)的方法是A稀釋涂布平板法B直接計(jì)數(shù)法C重量法D比濁法5下列關(guān)于微生物分離和培養(yǎng)的敘述,錯(cuò)誤的是A微生物培養(yǎng)前,需對培養(yǎng)基進(jìn)行消毒B測定土壤樣品中的細(xì)菌數(shù)目,常用菌落計(jì)數(shù)法C分離土壤中不同的微生物,要采用不同的稀釋度D分離能分解尿素的細(xì)菌,要以尿素作為培養(yǎng)基中唯一的氮源AA課后練習(xí):6、牛等牲畜的瘤胃中生活著許多以尿素作唯一氮源的微生物。某同學(xué)從剛宰殺的牛的瘤胃中取樣獲得菌液,并對能分解尿素的細(xì)菌進(jìn)行分離、計(jì)數(shù)和鑒定。回答下列問題:(1
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